The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
MGPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAYVKKLDSGTGKELVLALYDYQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Cytoskeleton
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| source organism |
Gallus gallus
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| publication title |
The order of secondary structure elements does not determine the structure of a protein but does affect its folding kinetics.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
ALPHA-SPECTRIN
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| total genus |
10
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| structure length |
61
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| sequence length |
61
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1996-02-29 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4LN2 A; 4Z88 A; 4A63 B; 5I11 A; 2AZS A; 2AZV A; 2A08 A; 2KRM A; 1K1Z A; 5IHK A; 2M0Y A; 1MV0 B; 4JZ4 A; 1W1F A; 2O9S A; 1UJ0 A; 4AFU C; 2ED1 A; 2LP5 A; 3CQT A; 2D8J A; 1ARK A; 2CUB A; 2JMA A; 2DX1 A; 1UUE A; 2D0N A; 3LH5 A; 1WXB A; 3NPF A; 2GNC A; 2X3W D; 1OPL A; 2A36 A; 3M0R A; 2J7I A; 4RTZ A; 2L0A A; 1GFD A; 1AOJ A; 1NYF A; 4JJD A; 3RBB B; 1UTI A; 3UA6 A; 2DM1 A; 4HVW A; 5IXB A; 3H0I A; 4HVU A; 4AFS C; 1RLQ C; 1VA7 A; 2KR3 A; 4Z89 A; 4J9C A; 3PE0 A; 4LNP A; 4J9G A; 2KT8 A; 2I0N A; 4HCK A; 4OMQ A; 1YWP A; 1A0N B; 2CUD A; 2HBW A; 1WDX A; 2ED0 A; 3VS4 A; 1H8K A; 2LJ1 A; 2J06 A; 3EG1 A; 2W0Z A; 2GGR A; 1SEM A; 1QWF A; 1T0J A; 1BB9 A; 2ECZ A; 1ZUK A; 3M0U A; 2LQW A; 1GBR A; 5HCK A; 2KRO A; 3I35 A; 2LJ3 A; 1E6H A; 2FRW A; 4F17 A; 1H3H A; 1AWJ A; 2D8H A; 3I5S A; 2L3P A; 3SHW A; 2FG0 A; 4RTV A; 1RI9 A; 1OPK A; 2KEA A; 2NUZ A; 4K11 A; 2LJ0 A; 2LZ6 B; 2MOX A; 3I9Q A; 4LUD A; 2K79 A; 1W70 A; 4OMM A; 4CC2 A; 2V1Q A; 4D8D A; 1GCQ C; 2RQR A; 1YCS B; 3M0S A; 1AZE A; 4EIK A; 2M51 A; 2EGE A; 1UJY A; 4F14 A; 2C0T A; 2J05 A; 1M3B A; 1YWO A; 1RLP C; 2LX7 A; 2CT4 A; 1Z9Q A; 1HSQ A; 1JXM A; 1S1N A; 2EYZ A; 2LCS A; 3VS7 A; 2CT3 A; 2J6F A; 4JJC A; 2DA9 A; 4OMN A; 1UHF A; 1QKW A; 4AFQ C; 4JZ3 A; 2F2V A; 1G83 A; 2YUO A; 1W6X A; 2PTK A; 1PKT A; 1WX6 A; 2CSI A; 3VRY A; 1JXO A; 4IIM A; 2DVJ A; 2DF6 A; 2RN8 A; 1FMK A; 2ROT A; 1AZG B; 2DIL A; 1PRM C; 2LNH B; 3SEM A; 2CH4 W; 4J9I A; 2A37 A; 3EG2 A; 2EYX A; 2K3B A; 2J6K A; 2VKN A; 2CRE A; 1Y0M A; 2YUQ A; 1I07 A; 2DMO A; 3UA7 A; 3RNJ A; 4RTY A; 1QWE A; 3PVQ A; 4F16 A; 2L3S A; 1MV3 A; 2JM8 A; 2KRN A; 1ZBJ A; 2OAW A; 1E6G A; 2YUN A; 3M0T A; 1I0C A; 1EFN A; 4HXJ A; 3O5Z A; 2CSQ A; 3ULR B; 1K0X A; 1M8M A; 1TUD A; 1PKS A; 2FPD A; 2RQW A; 1T3S A; 2DRM A; 4HVV A; 1M27 C; 1SRM A; 1RUW A; 1ZSG A; 5IH2 A; 2BZX A; 2SRC A; 4E6R A; 4ORZ A; 2RF0 A; 2AK5 A; 2FPF A; 4RTT A; 1BBZ A; 2JMC A; 3UAT A; 1TUC A; 2NWM A; 2OI3 A; 4M4Z A; 2DL5 A; 2O9V A; 4R0K A; 2DLP A; 1UG1 A; 2LMJ A; 4JPB W; 2RQV A; 2A28 A; 4X1V A; 1JU5 C; 4JJB A; 2YUP A; 2FO0 A; 2AKL A; 1TG0 A; 3VS3 A; 1SRL A; 1VYU A; 2K6D A; 1KFZ A; 3M0P A; 5FW9 A; 4GBQ A; 1JEG A; 1M3A A; 1AVZ C; 1ABO A; 1WXT A; 2J6O A; 2DL8 A; 1I1J A; 3I5R A; 2K9G A; 2EBP A; 1UDL A; 2KXD A; 2KXC A; 2O31 A; 2O2O A; 2YSQ A; 1QCF A; 3A98 A; 3EG0 A; 3REB B; 1XOV A; 1OV3 A; 2KE9 A; 1BK2 A; 1X6B A; 2KNB B; 1ZUU A; 4ZNX A; 1KIK A; 2JW4 A; 1AEY A; 3H0H A; 4CC3 A; 2BZY A; 2ESW A; 2IIM A; 1X2K A; 2KGT A; 2K7A A; 2GTO A; 3R6N A; 1QKX A; 2AKK A; 2PZ1 A; 4QT7 A; 1UHC A; 4LUE A; 1K9A A; 2W10 A; 4AFZ C; 1U3O A; 5I22 A; 3VS6 A; 1JO8 A; 3VRZ A; 2HEQ A; 1U06 A; 3EHR A; 2V1R A; 5FWC A; 2DRK A; 4RUG A; 2CH4 A; 1OEB A; 5IHI A; 2KRS A; 1PRL C; 2C0I A; 1WFW A; 4RTX A; 3VS1 A; 1UFF A; 3TSW A; 1YN8 A; 5IHN A; 3PVL A; 1E7O A; 3VS0 A; 2C0O A; 2KYM A; 2EYW A; 1PNJ A; 2JT4 A; 2XMF A; 4J9B A; 1PWT A; 1T3L A; 1YP5 A; 5L23 A; 1WXU A; 3NHN A; 4J9H A; 2JS2 A; 3JV3 A; 2FEI A; 1VYV A; 1GCQ A; 1U5S A; 2JXB A; 2O88 A; 1NLP C; 5IXF A; 2L2P A; 4KRT A; 4J9E A; 2E5K A; 1GL5 A; 2DBK A; 3H0F A; 2DL4 A; 2DNU A; 4LE9 A; 1KJW A; 3VS2 A; 1M30 A; 3TVT A; 1GFC A; 2FPE A; 4Z8A A; 1OOT A; 1B3Q A; 4RTU A; 2YDL A; 2DJQ A; 1X69 A; 2D1X A; 4J9D A; 2X3X D; 1UGV A; 1VYT A; 1M3C A; 3H41 A; 1Z9Z A; 2GBQ A; 2HDA A; 2ABL A; 4Y92 A; 4OML A; 2VWF A; 2F2W A; 1V1C A; 3FJ5 A; 3REA B; 2G6F X; 1NM7 A; 2KBT A; 4J9F A; 2EYY A; 1K0S A; 3EG3 A; 1N5Z A; 1UE9 A; 2F2X A; 1LCK A; 2GTJ A; 2BZ8 A; 2DL7 A; 1AWX A; 4CC7 A; 3UF4 A; 2VVK A; 3IQL A; 4OMO A; 1ZX6 A; 2MIO A; 1UEC A; 4ESR A; 3NMZ C; 1WIE A; 1YNZ A; 1NYG A; 2JM9 A; 4AG2 C; 1QLY A; 1T0H A; 2JTE A; 2B86 A; 1HJD A; 1WLP B; 1ZUY A; 2DYB A; 1CKB A; 1ABQ A; 1SHF A; 1J3T A; 2EGC A; 1X2Q A; 5GJV B; 2RNA A; 4GLM A; 1PHT A; 1MUZ A; 4CC4 B; 1IO6 A; 2OJ2 A; 2MCN A; 2PNI A; 2P4R A; 1H92 A; 1NEG A; 1X6G A; 2BTT A; 2YT6 A; 1K4U S; 1NLO C; 2RQU A; 4RTW A; 5ECA A; 2KT1 A; 3U23 A; 1JQQ A; 3GBQ A; 1GRI A; 2CDT A; 2EVR A; 2RPN A; 2EQI A; 2K2M A; 4DEX A; 1GBQ A; 3M0Q A; 1X43 A; 2SEM A; 2ROL A; 4FSS A; 2JS0 A; 1AWO A; 2LQN A; 5FWB A; 4WCI A; 1SSH A; 1BU1 A; 2QDL A; 2DBM A; 2GQI A; 2H8H A; 4AG1 C; 3QWX X; 3VS5 A; 1SHG A; 1B07 A; 2DE0 X; 2RMO A; 1G2B A; 1K76 A; 2EKH A; 1HD3 A; 3QWY A; 2EGA A; 1GCP A; 3THK A; 1SPK A; 4IIO A; 2L3Q A; 4DEY A; 2HSP A; 1NEB A; 1ZLM A; 1X27 A; 1AD5 A; 4OMP A; 3EGU A; 3C0C A; 5GJW B; 2EPD A; 1CKA A; 3TSZ A; 3NGP A; 2DL3 A; 3ZL7 C; 2EW3 A; 2KYB A; 1CSK A; 1FYN A; 1WI7 A; 4D8K A; 1NG2 A; 1Y57 A; 1WA7 A; 3KFV A; 2HCK A; 2RQT A; 5EC7 A; 1AWW A; 1WYX A; 2FRY A; 1KSW A; 2ENM A; 3EHQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4LN2 A; 2O4X B; 4Y28 E; 3SWN A; 1MV0 B; 3JB9 J; 1Q7Y R; 4JZ4 A; 5GAM f; 4IUR A; 4M77 B; 4HCZ A; 4M75 E; 4C92 E; 2CP2 A; 3RKW A; 2K3X A; 4PJO C; 2GCX A; 2QDY B; 2J7I A; 3M0R A; 2D0Q B; 3CC2 A; 2L89 A; 3CC2 T; 4M7D G; 1YFN A; 4LDW A; 2OTL A; 4QQ6 A; 2OTL T; 4HVW A; 2HQX A; 1M2V B; 4M78 D; 4HVU A; 4AFS C; 1VQ9 A; 1VQ9 T; 4Z89 A; 4M7A C; 4DA4 A; 3PE0 A; 2E6Z A; 4J9G A; 1WJS A; 3DKM A; 1YWP A; 1V76 A; 3MCA B; 1TH7 A; 2XD0 A; 3OYF A; 1UEB A; 2CUD A; 2MWP A; 3VS4 A; 1H8K A; 3EG1 A; 1ACM B; 2GGR A; 4GY5 A; 2E64 A; 4ZTF A; 4IUV A; 4FYX B; 1D1C A; 2ECZ A; 1ZUK A; 2LQW A; 1GBR A; 2KRO A; 2A7Y A; 1E6H A; 3JCM e; 1KQS S; 5CQX A; 3LLR A; 4XU1 A; 5FU6 B; 2FHD A; 4LXC A; 1N9S A; 3FJP A; 3RDV A; 1RAG B; 2DTH A; 2BIV A; 2RK1 A; 3I5S A; 3SHW A; 4DBR A; 4AMC A; 4RTV A; 2COY A; 2NUZ A; 3L2Q A; 4K11 A; 2BKD N; 2MOX A; 1R77 A; 3OW2 S; 2K79 A; 1SSF A; 2RHX A; 3M0S A; 3SDZ A; 4MZM A; 4C92 G; 1NJI C; 5CK9 A; 3WVE B; 3E9G A; 4L6V 5; 5J3B A; 1YJN A; 1YJN T; 4KT0 E; 1NPR A; 4F14 A; 1SF9 A; 3LH0 A; 2QA4 A; 1Z9Q A; 2QA4 T; 1JXM A; 4KBM B; 3QJY A; 2MI6 A; 2EYZ A; 5L8R E; 3G4S Q; 4LDY A; 2Y90 A; 4XQ3 A; 1M9S A; 1YIT A; 1YIT T; 1VQ7 Q; 2CT3 A; 1NJI R; 4M75 A; 2MF2 A; 4JJC A; 2QG9 B; 1EIF A; 2F2V A; 2YUO A; 2RHI A; 3HHT B; 2X4Y A; 2DZ9 A; 3WVD B; 2DVJ A; 3BDU A; 4WTO B; 3I56 Q; 3P8H A; 2R5A A; 3EGD B; 2CH4 W; 2M16 A; 4A4H A; 2IPO B; 5CR2 A; 2EYX A; 2K3B A; 1OZ2 A; 2J6K A; 3EFO B; 3L1A A; 4EMH A; 5KYX A; 2YUQ A; 4PLI A; 2DMO A; 3CC4 Q; 3RNJ A; 3CPW A; 1N9R A; 3CBP A; 1MV3 A; 1LVK A; 1ZBJ A; 2QQA A; 1K8A U; 4M78 C; 2V8K A; 2JNG A; 4R55 A; 4JLG A; 2FYK A; 5IAY A; 3ULR B; 3MP6 A; 1TUD A; 1PKS A; 2CGH A; 2FPD A; 3CCQ A; 2RQW A; 3CCQ T; 2DRM A; 4HVV A; 1RUW A; 2BZX A; 2SRC A; 1UGP B; 2FZG B; 4ORZ A; 2RF0 A; 4LD6 A; 3DB4 A; 1XNI A; 2VUB A; 2JMC A; 3UAT A; 2HKQ B; 2DL5 A; 3CPF A; 5J39 A; 2RQV A; 2A28 A; 3GIB A; 2FO0 A; 2AKL A; 1TG0 A; 2PUO B; 2R5M A; 3VS3 A; 2DXC A; 1SRL A; 1W2B P; 2COW A; 1JEG A; 1WHM A; 1K8A C; 1WXT A; 2DL8 A; 1I1J A; 2EBP A; 2KXD A; 1SG5 A; 2KXC A; 2O31 A; 2IVW A; 4PJO A; 1XOV A; 2L5Q A; 2KE9 A; 3M53 A; 1G3S A; 1X6B A; 3OYH A; 4E7L A; 3CCS A; 3CCS T; 1X6O A; 1FMW A; 4XTX A; 2K7A A; 2HAX A; 1K8A R; 2AKK A; 3V8L A; 3FC3 A; 4JDS A; 1K9A A; 4M7A A; 3EG9 A; 4AFZ C; 1U3O A; 2FVU A; 5I22 A; 3MO8 A; 3OYN A; 2V1R A; 1BKB A; 1QQJ A; 1K9M R; 1WHG A; 1VQO A; 1OEB A; 4MMK A; 1KD1 U; 4X9D A; 2C0I A; 5LL6 S; 3QUI A; 2DXB A; 1UFF A; 1Y96 B; 4M75 F; 4C0D C; 1YN8 A; 3OS0 A; 3PVL A; 5DM7 R; 1IXD A; 3QHS A; 3VS0 A; 2C0O A; 2ZPH B; 4J7I A; 2DTI A; 2QAZ A; 2GFA A; 3GNF B; 1PNJ A; 2JT4 A; 2XMF A; 1BI2 A; 2C06 A; 2E70 A; 2RJC A; 2FL7 A; 3PGG A; 1I5O B; 3FLG A; 1PG5 B; 2JXB A; 1NLP C; 2L2P A; 4J9E A; 5CKB A; 2E5K A; 3AT1 B; 2DL4 A; 1KJW A; 3TVT A; 3L2V A; 1OU9 A; 1OOT A; 3JB9 F; 4RTU A; 2YDL A; 3L2U A; 5D6W A; 4RG2 A; 4J9D A; 2X3X D; 1UGV A; 1VYT A; 1M3C A; 3PIP A; 2XI9 A; 2EFI A; 1O9S A; 4TVR A; 1Z9Z A; 2HDA A; 4VUB A; 1V1C A; 4X34 A; 5CQY A; 3QDF A; 3H9N A; 4J9F A; 3CCJ Q; 2XDD A; 1VQ8 Q; 2DET A; 1MND A; 2KI7 A; 3LGL A; 1N5Z A; 1UE9 A; 2F2X A; 4RCB A; 4ZN3 A; 1VQM Q; 2VVK A; 1ZX6 A; 4MZT A; 1QVG A; 1WIE A; 1PSE A; 5GMK j; 2JM9 A; 1BIB A; 3M55 A; 3MP1 A; 1T0H A; 5D7U A; 1LJO A; 1KQ1 A; 4E47 A; 4NOY A; 5GAN h; 1WLP B; 3CCM Q; 3A5Z B; 1ZQ1 A; 2QTX A; 4LD9 K; 2AHJ B; 5M9O A; 1X2Q A; 3NTK A; 1D3B A; 4PFP A; 5GJV B; 2RNA A; 4OVA A; 1B7T A; 1IO6 A; 4PJO F; 3OB9 A; 2P4R A; 4M78 A; 2R58 A; 6AT1 B; 3TEE A; 4E7K A; 3N5B B; 1K4U S; 4HA8 A; 4O6J A; 1C1A A; 2NLU A; 2I2L A; 2LCC A; 1BYM A; 5ECA A; 1JQQ A; 4C92 D; 3MJX A; 3EFS A; 2CDT A; 4M7A F; 2EVR A; 4UC4 A; 3G4S A; 5CKD A; 3G4S T; 2RPN A; 2VXE A; 2K2M A; 4A4G A; 3F70 A; 5D6X A; 5GAN 8; 2SEM A; 1VQ7 A; 1VQ7 T; 3CME Q; 3V7C A; 1QCO A; 2KDS A; 1VQK Q; 1SSH A; 1BU1 A; 2XID A; 2E5Q A; 1M1G A; 2DBM A; 1SHG A; 2HBP A; 2EJ9 A; 4ZTJ A; 3I56 A; 2RMO A; 3I56 T; 1VQ5 Q; 1TTH B; 1BI0 A; 4C5H A; 3THK A; 1W2B S; 2ATC B; 4IIO A; 3OYD A; 2AIR B; 4KUD K; 1NEB A; 1ZLM A; 3QPH A; 5FRN A; 4RKU E; 4OMP A; 5IT9 E; 3CC4 A; 3CC4 T; 2PVD B; 2EW3 A; 3CXC A; 5LJ3 h; 1B34 A; 2LDM A; 3HRT A; 1FYN A; 4FM4 B; 2HCK A; 2RQT A; 1AWW A; 1WJR A; 1WYX A; 2FRY A; 1TWB A; 5GAM j; 2ENM A; 2M9U A; 4IUT A; 4FIB A; 2KQW A; 3QYG B; 4A63 B; 3C12 A; 2A08 A; 2V8J A; 4M7D C; 2HMA A; 3TCJ A; 4ZGJ B; 2OTJ Q; 1W1F A; 2O9S A; 4B9X A; 1UJ0 A; 3JCM f; 4AFU C; 2LP5 A; 4OB1 B; 4C8Q E; 1RAE B; 2D0N A; 1WXB A; 1XTD A; 3NPF A; 2GNC A; 1VOM A; 5GAN f; 4E2F B; 2CS7 A; 2X4J A; 3VKI A; 3UPU A; 1GFD A; 2YWW A; 4M75 B; 4JJD A; 4EMG A; 3JB9 I; 2HNI A; 2DM1 A; 4CI0 C; 3OYJ A; 2DER A; 3H0I A; 2ZPI B; 1RLQ C; 3GLX A; 4J9C A; 3FIF A; 4LNP A; 2KT8 A; 5KYW A; 3EFR A; 3LGF A; 5IN1 A; 3OS1 A; 4OMQ A; 4PLL A; 1A0N B; 2DD4 A; 4M78 F; 2LT1 A; 4JLI A; 4C92 C; 1IHV A; 4OB2 B; 2GQV A; 5C6S A; 1BB9 A; 3M0U A; 3PMI A; 2Y4Y A; 2LJ3 A; 4BY6 B; 3QXE B; 3OSV A; 4J8O A; 1AWJ A; 2P0P A; 2F5K A; 3QBY A; 2RJE A; 2FG0 A; 3RKY A; 3PMT A; 4N0A C; 1RI9 A; 3UDC A; 4FU6 A; 4EPC A; 3I9Q A; 3AHU A; 4LUD A; 1W70 A; 5CKF A; 2V1Q A; 2RQR A; 4M7D E; 4JJN K; 4C8Q G; 2HKN A; 3J80 E; 3EH1 A; 1ZA1 B; 3PTA A; 2EGE A; 1UJY A; 3V7S A; 1M3B A; 1YWO A; 2CT4 A; 2JTM A; 5LJ3 f; 1QMC A; 3GF5 A; 2LCL A; 3M54 A; 2KMT A; 3VS7 A; 2DA9 A; 1UHF A; 4C8Q A; 3EGX A; 1W6X A; 2YRV A; 3PIO A; 3C95 A; 2Y4X A; 4PJO B; 2CSI A; 1FMK A; 2ROT A; 3QO3 A; 1KQ2 A; 1IGU A; 3VV0 A; 2LNH B; 3QJ6 A; 3EG2 A; 1G8X A; 1XJW B; 4X9C A; 3MKD A; 2DEU A; 2NUT B; 5CVI A; 3CCJ A; 4M7A B; 3CCJ T; 1VQ8 A; 2XKO C; 1VQ8 T; 3UA7 A; 2EAY A; 4OGC A; 4LDX A; 3FEO A; 1VQM A; 2DAQ A; 3PVQ A; 1VQM T; 4F16 A; 3OYI A; 2DZC A; 2OAU A; 1E6G A; 3M0T A; 5CO7 A; 1I0C A; 5DLQ E; 4DOW A; 1WGS A; 2QK0 A; 5GMK m; 3JCM X; 1WHL A; 5GAM g; 3CCM A; 3KBG A; 3CCM T; 3E1S A; 4RG8 A; 2RJD A; 3JSC A; 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