The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
71
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structure length |
71
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Chain Sequence |
QGSRVLHVVQTLYPFSSVTEEELNFEKGETMEVIEKPENDPEWWKCKNARGQVGLVPKNYVVVLSDGPALH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of an ultraweak protein-protein complex and its crucial role in regulation of cell morphology and motility.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Cytoplasmic protein NCK2
|
| molecule tags |
Metal binding protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
5
|
| structure length |
71
|
| sequence length |
71
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-07-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2AZS A; 3VS4 A; 1K9A A; 2IIM A; 1SHG A; 1BK2 A; 2QDL A; 2LCS A; 2SEM A; 5GJW B; 2K6D A; 4HCK A; 2O9S A; 1N5Z A; 1GCP A; 1QWE A; 2FO0 A; 3M0Q A; 1YCS B; 4FSS A; 3QWY A; 4J9G A; 3NPF A; 2J7I A; 2BTT A; 2ENM A; 1JXO A; 1OEB A; 2EVR A; 1GCQ C; 5IXF A; 2DL8 A; 2AZV A; 2GQI A; 2F2V A; 1ZBJ A; 2DF6 A; 3SEM A; 1U5S A; 2ED1 A; 4QT7 A; 4ZNX A; 4A63 B; 2A36 A; 2DL3 A; 5IHI A; 1MUZ A; 1E6G A; 1M8M A; 2ED0 A; 2I0N A; 2HDA A; 2KNB B; 2C0O A; 2YUO A; 1QCF A; 1YWO A; 2HBW A; 2SRC A; 4R0K A; 1QKX A; 3GBQ A; 2J6K A; 1PRL C; 2X3X D; 4GLM A; 1QKW A; 3UAT A; 4IIM A; 1FYN A; 1JO8 A; 2JS0 A; 2K3B A; 2DL7 A; 5IH2 A; 2FRY A; 4OML A; 1YN8 A; 2GGR A; 2HEQ A; 3M0U A; 4Y92 A; 1QLY A; 4DEX A; 1UDL A; 1Y0M A; 1UHC A; 1WXB A; 4K11 A; 1SSH A; 2DMO A; 3I5R A; 1AZE A; 1K0X A; 3R6N A; 1HSQ A; 2RQV A; 3VRZ A; 2RQW A; 1UJ0 A; 2EW3 A; 4CC7 A; 2E5K A; 1NYF A; 4RTU A; 4F14 A; 1H92 A; 1PWT A; 2RQU A; 2DRM A; 1UJY A; 2CH4 A; 2X3W D; 1AWW A; 1AWX A; 3M0S A; 2CSQ A; 2K9G A; 2DYB A; 2KEA A; 2D0N A; 2ESW A; 2D8H A; 2DJQ A; 3U23 A; 2AKL A; 3EHR A; 2MCN A; 3EG0 A; 2OJ2 A; 2KT1 A; 4LUD A; 1NYG A; 1WLP B; 2KYM A; 1V1C A; 1RLQ C; 5IXB A; 2L3P A; 3O5Z A; 2DRK A; 5EC7 A; 4OMO A; 2NUZ A; 3VRY A; 1NLO C; 4AFS C; 1ZUU A; 2O88 A; 3VS7 A; 2YUP A; 1OPL A; 5HCK A; 2C0T A; 2KXC A; 4ESR A; 4X1V A; 2DNU A; 1K76 A; 5L23 A; 4JZ3 A; 3EGU A; 3JV3 A; 3TSZ A; 3ULR B; 1JXM A; 2LQN A; 5FWB A; 4AFQ C; 3H0H A; 2GBQ A; 2PNI A; 3VS3 A; 1B3Q A; 4CC2 A; 1M3A A; 1VYT A; 1KJW A; 1Z9Z A; 2ROT A; 4HVW A; 2L0A A; 3UF4 A; 2F2X A; 2DVJ A; 1K1Z A; 2G6F X; 1XOV A; 2LNH B; 2KGT A; 2FPF A; 1NEG A; 1CKA A; 1Z9Q A; 1X2K A; 2M0Y A; 1ABO A; 4D8K A; 2DL4 A; 2LP5 A; 1W6X A; 4Z89 A; 1WA7 A; 4M4Z A; 2ABL A; 2RQT A; 2CT3 A; 2KRS A; 1AWO A; 1AOJ A; 1OV3 A; 2O2O A; 1KFZ A; 1E6H A; 1MV0 B; 5IHN A; 1X27 A; 3I35 A; 1WYX A; 2DX1 A; 2NWM A; 3FJ5 A; 1CKB A; 3VS0 A; 4DEY A; 2J06 A; 2PZ1 A; 2MOX A; 1UG1 A; 2DM1 A; 3I5S A; 2FRW A; 4GBQ A; 1FMK A; 1WDX A; 1T0J A; 1EFN A; 1Y57 A; 1AZG B; 2EYX A; 1ZLM A; 2VKN A; 2JT4 A; 3REB B; 1ABQ A; 4JJB A; 4JJD A; 3VS1 A; 1PKT A; 1X43 A; 2K79 A; 2HCK A; 2HSP A; 3M0T A; 3UA6 A; 4OMN A; 1NEB A; 4RUG A; 1HD3 A; 2LQW A; 1UUE A; 1YNZ A; 2EYY A; 2CDT A; 2EQI A; 4OMM A; 3M0P A; 2V1Q A; 2DA9 A; 3NMZ C; 3TVT A; 5FW9 A; 1RI9 A; 4CC3 A; 1GFD A; 4J9I A; 4HVV A; 4AG1 C; 1G2B A; 1QWF A; 1M3B A; 2XMF A; 1VA7 A; 1MV3 A; 1TG0 A; 4HXJ A; 4Z88 A; 2KRO A; 2JMA A; 3CQT A; 1OPK A; 1WXT A; 2KBT A; 2M51 A; 2EYW A; 3REA B; 4EIK A; 4RTV A; 1SEM A; 2H8H A; 1PKS A; 3RNJ A; 5ECA A; 1A0N B; 1AEY A; 2CUD A; 2EGC A; 1BU1 A; 2CRE A; 1YWP A; 3VS2 A; 1K4U S; 4F17 A; 3H0F A; 1HJD A; 2YUQ A; 2OI3 A; 1UGV A; 1BBZ A; 1ARK A; 1S1N A; 4LUE A; 2L3Q A; 3I9Q A; 1X2Q A; 2MIO A; 2K2M A; 2LX7 A; 2JMC A; 3EHQ A; 2JM8 A; 1I07 A; 3VS5 A; 1WFW A; 1KIK A; 2LMJ A; 4LNP A; 1I0C A; 5IHK A; 1CSK A; 4D8D A; 1SRL A; 2OAW A; 4RTZ A; 4AFU C; 2VVK A; 2PTK A; 3H41 A; 1NM7 A; 1T3S A; 1ZUY A; 1UTI A; 2BZX A; 2V1R A; 2YT6 A; 2JS2 A; 1X6G A; 4JPB W; 4WCI A; 2P4R A; 2FEI A; 2FG0 A; 1VYV A; 3UA7 A; 1M30 A; 2FPD A; 1NG2 A; 1RLP C; 1ZX6 A; 2BZ8 A; 4J9D A; 1GL5 A; 1BB9 A; 1AD5 A; 2C0I A; 2LJ1 A; 4J9B A; 2L3S A; 3EG2 A; 3TSW A; 4AG2 C; 2LJ3 A; 1OOT A; 3NHN A; 1K0S A; 1ZUK A; 3KFV A; 1JQQ A; 4OMP A; 1GBR A; 1TUD A; 1M3C A; 2DBK A; 2RMO A; 2KT8 A; 3ZL7 C; 4J9C A; 2VWF A; 2D8J A; 2YSQ A; 2LZ6 B; 2YUN A; 1SPK A; 3VS6 A; 2AK5 A; 1AVZ C; 1M27 C; 1X69 A; 2ROL A; 2RPN A; 4ORZ A; 1GCQ A; 2BZY A; 2ECZ A; 2KYB A; 2DBM A; 1WIE A; 1VYU A; 3A98 A; 4J9H A; 4Z8A A; 4JJC A; 4IIO A; 3LH5 A; 2J6F A; 1I1J A; 2KE9 A; 2GTJ A; 3NGP A; 1IO6 A; 4LE9 A; 1ZSG A; 3EG3 A; 5GJV B; 3THK A; 2D1X A; 2W0Z A; 2CUB A; 3PE0 A; 1PRM C; 3QWX X; 1KSW A; 4F16 A; 2JM9 A; 2GNC A; 1U3O A; 1GBQ A; 1NLP C; 4AFZ C; 2JW4 A; 1T0H A; 1GRI A; 2RQR A; 4LN2 A; 1GFC A; 1JU5 C; 2FPE A; 1J3T A; 2K7A A; 1SRM A; 1W1F A; 2EPD A; 1YP5 A; 2RN8 A; 5I22 A; 1UEC A; 4HVU A; 2JTE A; 2W10 A; 4OMQ A; 5I11 A; 2J6O A; 2F2W A; 3H0I A; 4E6R A; 4RTX A; 2DE0 X; 2A28 A; 2O9V A; 1UHF A; 3SHW A; 4JZ4 A; 2AKK A; 1H3H A; 2JXB A; 1PNJ A; 2EKH A; 3M0R A; 1UFF A; 1T3L A; 2RF0 A; 2KRN A; 2KR3 A; 5FWC A; 3PVQ A; 4KRT A; 4J9F A; 4RTY A; 1WX6 A; 2A37 A; 1U06 A; 1X6B A; 2EBP A; 1TUC A; 2J05 A; 1B07 A; 2RNA A; 4RTT A; 1H8K A; 1AWJ A; 1LCK A; 1WXU A; 4RTW A; 2DLP A; 2KXD A; 1RUW A; 1G83 A; 2L2P A; 1WI7 A; 4J9E A; 1UE9 A; 1E7O A; 2YDL A; 2CT4 A; 2EYZ A; 1SHF A; 2LJ0 A; 2CH4 W; 2O31 A; 2CSI A; 3RBB B; 2GTO A; 3IQL A; 2DL5 A; 3EG1 A; 1PHT A; 1W70 A; 3PVL A; 4CC4 B; 2A08 A; 2EGA A; 2KRM A; 3C0C A; 1JEG A; 2DIL A; 2EGE A; 2B86 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4XTW A; 4A4K A; 3CCR A; 4Y28 E; 2QDL A; 1QVP A; 2F5T X; 1TTH B; 1H3Z A; 5KE3 A; 3CBM A; 3A1P A; 4LD9 K; 4HCK A; 1N5Z A; 2GCX A; 5J26 A; 2CP7 A; 2RJC A; 2YRV A; 1YCS B; 4TVR A; 3BE3 A; 2J7I A; 2K57 A; 5LJ3 h; 2DL8 A; 3OYI A; 2F5K A; 1ZBJ A; 2DF6 A; 5I21 A; 2JOY A; 1TH7 A; 5C6S A; 4M7A B; 4RG8 A; 5FRO A; 1OZ2 A; 1BIB A; 1M8M A; 2ED0 A; 4X9D A; 2KNB B; 3RDV A; 5IAY A; 4M7D C; 2VUB A; 2SRC A; 2M0O A; 3VUB A; 1QKX A; 3GBQ A; 2CP6 A; 3MEV A; 3GF5 A; 3UAT A; 4FYW B; 1N6A A; 4KUL A; 2JS0 A; 2DL7 A; 1M90 C; 1IXD A; 5LJ3 g; 3JRZ A; 1YN8 A; 1QLY A; 1Y0M A; 1GXI E; 1SSH A; 2R5A A; 2LC4 A; 5GAN 4; 1K0X A; 4PJN A; 2EW3 A; 4L59 A; 3OBY A; 3M4G A; 3LYI A; 1H92 A; 5GAO p; 5HY6 A; 4N0A A; 3E9G A; 1K9M C; 2DRM A; 2BIV A; 1AWW A; 1KC8 U; 1MND A; 1VQ5 A; 4II1 A; 2K9G A; 1BI3 A; 2D0N A; 4E47 A; 2EAY A; 2ESW A; 3EHR A; 2MCN A; 3CC2 A; 2DFU A; 3A8M B; 4RCB A; 2OJ2 A; 3TRE A; 2XDB A; 1RLQ C; 2QQS A; 2L3P A; 3O5Z A; 2E1H A; 2QK0 A; 5CKF A; 4E7Z A; 1KQ1 A; 3M59 A; 3VS7 A; 2O88 A; 2YUP A; 5HCK A; 2C0T A; 4OMF B; 4ESR A; 4X1V A; 2DNU A; 3SB2 A; 1VQK T; 1WPY A; 2QTV A; 4FW2 A; 5L23 A; 1U8R A; 3VU3 C; 4JZ3 A; 4LDX A; 1RAE B; 2A7Y A; 2OAU A; 2FVU A; 1YIT T; 1JXM A; 2LQN A; 1D3B A; 2QA4 A; 4AFQ C; 2GBQ A; 3VS3 A; 3KXT A; 5GAM f; 4M7A G; 3CPF A; 1YCY A; 1K8A C; 1KJW A; 2ZGW A; 3QO3 A; 4E7K A; 3RR6 A; 1S72 Q; 2GFA A; 2I2L A; 3I55 Q; 2K3Y A; 3TCJ A; 2QDY B; 2DVJ A; 2G6F X; 1OYX A; 5GAM d; 2KGT A; 2FPF A; 1BCO A; 2VC8 A; 2RM4 A; 2JUF A; 1Q81 C; 4ANJ A; 4M75 C; 1OU9 A; 3OY9 A; 3URG A; 1IB8 A; 2MWP A; 1VQ8 A; 3PIO A; 4CI0 C; 1C6V X; 1BI2 A; 1YHQ T; 5IHN A; 1X27 A; 3JB9 I; 3OMC A; 4C0G A; 5CQY A; 3RES A; 2JZ2 A; 3FJ5 A; 2L5Q A; 2IG0 A; 1N8R U; 5FU7 B; 2PZ1 A; 2FYK A; 4BE1 A; 3MP6 A; 3NTK A; 4V2S A; 2MOX A; 2KVQ G; 3I5S A; 4QKU A; 1FMK A; 3CCJ T; 1T0J A; 4M77 D; 1AZG B; 2VKN A; 2JT4 A; 1B34 B; 3CCQ T; 4B9X A; 2HL5 C; 4XU0 A; 2LQ8 A; 1HXD A; 1R77 A; 3M54 A; 1VQP T; 3A8H B; 1MGQ A; 3JCM h; 1BKB A; 4DBR A; 2EQI A; 3NMZ C; 1Y71 A; 5FW9 A; 1RI9 A; 4KT0 E; 2KSS A; 4AG1 C; 4HCZ A; 1QWF A; 1M3B A; 3A8G B; 5CKD A; 2KRO A; 2JMA A; 1OPK A; 3REA B; 2M51 A; 3JCM Q; 4RTV A; 2H8H A; 2YHT A; 1WJR A; 2CZ1 B; 2CUD A; 2PQW A; 2YLB A; 1BU1 A; 2CRE A; 4M77 G; 3EG9 B; 3L1A A; 3JCM g; 1YWP A; 1VIF A; 1BI0 A; 3OMG A; 3FB9 A; 4R55 A; 2YUQ A; 3E1S A; 4J5Y A; 1O9S A; 5A0D A; 3MCA B; 1WHM A; 4IUT A; 3CC4 T; 1ARK A; 3E2U A; 1S1N A; 2NUP B; 3LW5 E; 3MPU B; 3S3O A; 2NUT A; 3OQ5 A; 4MMK A; 1YJW A; 5CIU A; 2JMC A; 4J8O A; 2JM8 A; 3VS5 A; 2NLU A; 4LDV A; 1WFW A; 1KIK A; 2PVO B; 1CSK A; 4BUG A; 1KD1 U; 4D8D A; 2RJF A; 3G4S T; 2VVK A; 4C0F A; 1VQL Q; 1ZSZ A; 2PTK A; 4O6J A; 2DXU A; 4PKC C; 2LT4 A; 5CKH A; 4HA8 A; 2P4R A; 3EFS A; 3G7Z A; 4JLG A; 2Z0W A; 3JCM J; 4D6W A; 2EYQ A; 5CKB A; 4IUR A; 1GL5 A; 3QDR B; 4BY6 B; 1AD5 A; 2C0I A; 2MAM A; 3EH1 A; 3J81 E; 1LVK A; 3QHS A; 4FT4 A; 2HZY A; 3EG2 A; 3TSW A; 2HBP A; 4PJO C; 2K5I A; 1OOT A; 5GMK l; 1ZUK A; 2EQK A; 2WAC A; 1GBR A; 1HK9 A; 4FSX A; 1TUD A; 5KYU B; 2DZC A; 2QA4 Q; 2KY9 A; 3C95 A; 4L6V 5; 3UWN A; 2RK2 A; 3JCM P; 3EGD A; 4IUQ A; 3OYL A; 5HK0 A; 3CCE T; 4F7U G; 1WZO A; 2EIF A; 1NBE B; 3VS6 A; 1AVZ C; 2RPN A; 5DLO A; 5I2M A; 2BZY A; 5DM7 R; 3CCV Q; 2DBM A; 2XD0 A; 4J9H A; 3CCL Q; 4Z8A A; 4JJC A; 1QVG P; 1RAC B; 1IGU A; 2X35 A; 3LLR A; 2DD4 A; 1WHJ A; 3EG3 A; 5LJ3 j; 2D1X A; 1I4K 1; 2W0Z A; 1QP3 A; 3P8D A; 4QQD A; 4M7D A; 4FU6 A; 2JM9 A; 1Q7Y C; 1JU5 C; 1O75 A; 1W2B P; 1SRM A; 4O5V A; 5DY9 A; 5I22 A; 2VGN A; 2BKD N; 1PM3 A; 2JTE A; 3L2Z A; 4OMQ A; 2YRC A; 2OX7 A; 4LDU A; 1QVG A; 3H0I A; 1AT1 B; 4PLL A; 4KUI A; 3J7A F; 3JB9 F; 1UHF A; 2JNG A; 2O01 E; 1H3H A; 1MHN A; 1VQM Q; 1EIF A; 1G3T A; 2EKH A; 1WGS A; 1D0X A; 2QGG A; 3FIF A; 1VQO T; 3TU4 K; 4RTY A; 4BDY A; 2A37 A; 3MEA A; 3RIR A; 3VKI A; 3JCM c; 1YJ9 T; 3RER A; 1BIA A; 2VV5 A; 5GAN h; 1G83 A; 2D9T A; 9ATC B; 2JTF A; 2VGM A; 1YI2 A; 1E7O A; 2EJ9 A; 1K73 U; 2D0Q B; 3RBB B; 2O31 A; 2CH4 W; 2LJ0 A; 2GTO A; 2MK5 A; 4XTX A; 2QAZ A; 2XIC A; 2EGE A; 4MZT A; 3X28 B; 4LDW A; 2ATC B; 2AZS A; 2E65 A; 2RJE A; 3D7S B; 2ZCF B; 4Q5W A; 2LCS A; 2CP2 A; 5GJW B; 4BD3 A; 2O9S A; 1NPR A; 2EQU A; 1QWE A; 4F04 B; 3M0Q A; 3A8O B; 5GAN g; 4FSS A; 3QWY A; 4J9G A; 3NPF A; 1QVG S; 1JXO A; 4C92 A; 1NJI R; 1LNX A; 1TXQ A; 5IXF A; 2HNI A; 2M1H A; 2KQW A; 4B6M A; 3SEM A; 2E5Q A; 2RHX A; 4PFZ A; 4M75 A; 4ZNX A; 1R0C B; 5IHI A; 3M56 A; 2L3R A; 3DLM A; 3L2Q A; 1YWO A; 2HBW A; 5KYW B; 3PMT A; 4C8Q C; 4E7L A; 1Q82 U; 2VXF A; 2X3X D; 3R6O A; 2DET A; 3CC7 Q; 1FYN A; 5KYX B; 3OYF A; 2COZ A; 3S6W A; 5IH2 A; 2FRY A; 4OML A; 3M0U A; 1UDL A; 4XTY A; 2HL3 A; 2D6F A; 5KYY B; 2DMO A; 4ZTF A; 1JJ2 P; 1UGP B; 4EMG A; 1HSQ A; 5GMK i; 1SF9 A; 1UJ0 A; 2K4Y A; 3X20 B; 1VQ4 T; 2QG9 B; 2M02 A; 2G3R A; 5DLQ E; 1Q82 R; 3HKS A; 4M7D F; 2X4J A; 1M1K U; 4BE2 A; 3OS1 A; 1FXX A; 2CSQ A; 3CCM A; 2VB6 A; 1TS9 A; 3HHT B; 1VQ7 T; 5IT9 E; 2ZPE B; 2DJQ A; 4X34 A; 2AKL A; 1RI0 A; 1JJ2 A; 3EG0 A; 4ZN1 A; 2YWW A; 4XU3 A; 3PNW C; 3CD6 A; 4PJO E; 1VQN T; 3NFC A; 1WLP B; 4M78 D; 3OSS C; 2DXT A; 1M1K R; 2NUZ A; 1PC0 A; 4WTO B; 5FRM A; 4DA4 A; 1K76 A; 3TEE A; 3HPW A; 1IHV A; 4NL3 A; 1ZA2 B; 3HSB A; 3EFR A; 3CCU T; 4AT1 B; 2P0K A; 3EGU A; 1AHJ B; 5AT1 B; 3ULR B; 2RJD A; 5GAN 3; 4RMO A; 3EAE A; 2LX9 A; 3CMA Q; 2QI2 A; 3L2U A; 4EMK C; 2ROT A; 4HVW A; 2DD5 A; 1VQ6 T; 2L0A A; 1I5O B; 3VYG A; 3UF4 A; 2LCC A; 3NTI A; 1K1Z A; 1XOV A; 4XTU A; 1Z9Q A; 1C1A A; 3GIB A; 3CCS Q; 2LNV A; 2RD1 A; 2COW A; 2DL4 A; 3CCR T; 4M78 G; 1W6X A; 4Z89 A; 1WA7 A; 1AWO A; 4DQ2 A; 3JCM V; 1E6H A; 2AT1 B; 3QDF A; 4JRQ A; 1VQ8 Q; 1WYX A; 3V8L A; 2OTL A; 1JJ2 S; 2HSE B; 1VOM A; 3PGG A; 2DIQ A; 1ZBX A; 3CC7 A; 4BDZ A; 2CZ0 B; 1EFN A; 1OQK A; 1KQ2 A; 2CZ6 B; 3HP9 A; 2EYX A; 4M75 F; 1KHI A; 2LCL A; 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