The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
GSSGSSGASLLARYPPEKLFQAERNFNAAQDLDVSLLEGDLVGVIKKKDPMGSQNRWLIDNGVTKGFVYSSFLKPYNPRRSHSDASSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
NMR structure of SH3 domain of Hypothetical protein BAA76854.1
rcsb |
| molecule keywords |
KIAA1010 protein
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| total genus |
11
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| structure length |
92
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| sequence length |
92
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-06-11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RN8 A; 1UTI A; 5GJV B; 1NLO C; 1QCF A; 1M30 A; 2X3W D; 2DRK A; 3GBQ A; 2DL7 A; 1B07 A; 1W70 A; 1CSK A; 2D0N A; 4R0K A; 1U06 A; 3UA6 A; 2ENM A; 4RTU A; 2LZ6 B; 4JZ3 A; 2ESW A; 1UJY A; 2G6F X; 1AWJ A; 2DM1 A; 2YUN A; 1WIE A; 1CKB A; 2FPF A; 3VS4 A; 2MIO A; 3TVT A; 2W0Z A; 2BZ8 A; 2KRO A; 1ABQ A; 1X2K A; 1V1C A; 1VA7 A; 5ECA A; 2GQI A; 1AWX A; 1QWE A; 4LN2 A; 2DBM A; 4CC2 A; 4LE9 A; 1PRM C; 2C0T A; 2CUD A; 2KXD A; 2RQU A; 1SPK A; 4JJC A; 2L0A A; 2LQN A; 4CC4 B; 3EG2 A; 1T3L A; 4HXJ A; 2DL8 A; 1YN8 A; 4D8D A; 2JT4 A; 1VYV A; 1UEC A; 2FO0 A; 1YWO A; 4J9D A; 1SHF A; 4J9B A; 3UA7 A; 2YT6 A; 1PWT A; 3VRZ A; 2YUQ A; 2A36 A; 2ECZ A; 2O88 A; 1QKW A; 3I5S A; 1AWO A; 4FSS A; 2BZY A; 2J05 A; 1RLP C; 1WYX A; 1AD5 A; 1NEG A; 1XOV A; 3PVL A; 4AG1 C; 4D8K A; 2MOX A; 1U5S A; 1VYU A; 2O9S A; 2HSP A; 4OMP A; 4HVU A; 4OMN A; 5FW9 A; 1K0X A; 2DYB A; 3ULR B; 2JTE A; 1AWW A; 4J9I A; 4KRT A; 1WXB A; 2X3X D; 1S1N A; 2KBT A; 4JPB W; 4OML A; 2V1R A; 1AZG B; 1WFW A; 2JM8 A; 1VYT A; 2F2V A; 3EHR A; 3JV3 A; 1MV3 A; 1NYF A; 1WDX A; 2CRE A; 1NYG A; 2EBP A; 2HBW A; 3KFV A; 2GNC A; 1JU5 C; 1MV0 B; 4LUE A; 3REB B; 1ZBJ A; 1E6H A; 1T3S A; 2DIL A; 2O2O A; 4CC7 A; 1N5Z A; 1W1F A; 4ESR A; 3LH5 A; 2O31 A; 3I9Q A; 1YP5 A; 3TSZ A; 1OEB A; 2O9V A; 2VKN A; 1FYN A; 2DLP A; 1QWF A; 3VS1 A; 2EYX A; 3C0C A; 2LCS A; 2LX7 A; 1RI9 A; 2PNI A; 1M3A A; 2A37 A; 2J06 A; 1HD3 A; 2ED1 A; 2LJ3 A; 1PNJ A; 4JZ4 A; 3O5Z A; 2DL3 A; 2HCK A; 2BZX A; 2JS0 A; 1GCQ C; 2FEI A; 1W6X A; 3NGP A; 2DRM A; 1AVZ C; 2M0Y A; 1PKS A; 4IIO A; 1UE9 A; 2RQV A; 1PHT A; 1I0C A; 1UFF A; 3FJ5 A; 1A0N B; 4J9E A; 1LCK A; 1X69 A; 1UHC A; 1HJD A; 4OMQ A; 3A98 A; 2LNH B; 2IIM A; 3NPF A; 1M3C A; 1X6B A; 2YDL A; 3M0S A; 3EG0 A; 4RTY A; 1H3H A; 1WXU A; 2E5K A; 4RTW A; 1UUE A; 2A28 A; 2ABL A; 2GGR A; 1YWP A; 2PTK A; 4AFS C; 1NG2 A; 1RLQ C; 2JMC A; 3ZL7 C; 2RNA A; 1ZUU A; 1TUD A; 3PE0 A; 1GFC A; 1ARK A; 5HCK A; 1HSQ A; 2YUO A; 1UG1 A; 4HVV A; 2J6O A; 5IHK A; 4RTZ A; 2VWF A; 2K2M A; 1JQQ A; 2C0I A; 3NMZ C; 1X27 A; 2OAW A; 3RNJ A; 1I07 A; 1BU1 A; 5FWC A; 2LP5 A; 2EVR A; 4RTT A; 3UAT A; 4LNP A; 2ED0 A; 2FRY A; 4OMM A; 3UF4 A; 1TG0 A; 1BK2 A; 2DBK A; 1K76 A; 3THK A; 4AFU C; 1OOT A; 3M0R A; 1GBR A; 2KT1 A; 1MUZ A; 3M0U A; 2JMA A; 1ZSG A; 4DEX A; 1BB9 A; 3VS0 A; 3R6N A; 2KRN A; 5I11 A; 1GFD A; 2HEQ A; 2FPE A; 2EQI A; 1WA7 A; 2KT8 A; 3NHN A; 1JEG A; 2DL5 A; 4Z89 A; 1EFN A; 1WX6 A; 5GJW B; 2AZV A; 2I0N A; 2DL4 A; 2KXC A; 4A63 B; 1AOJ A; 3VS5 A; 4AFZ C; 1GL5 A; 1K0S A; 5IHN A; 2KRS A; 3QWY A; 1SRL A; 4ORZ A; 2EPD A; 2YUP A; 4J9F A; 4J9G A; 1G83 A; 2FPD A; 2CSI A; 1YCS B; 2GTO A; 1TUC A; 1ZX6 A; 2AKK A; 4IIM A; 3EGU A; 2RQR A; 2QDL A; 2M51 A; 2XMF A; 3M0T A; 4AG2 C; 1M8M A; 2DX1 A; 1B3Q A; 1X2Q A; 3H41 A; 1KIK A; 2RF0 A; 2AKL A; 4GLM A; 2MCN A; 1PRL C; 1UDL A; 1Y0M A; 2K79 A; 2RQW A; 2L3S A; 2CUB A; 3CQT A; 2K7A A; 2SEM A; 2JW4 A; 1NEB A; 2J7I A; 1U3O A; 4WCI A; 2K6D A; 2KGT A; 1ZUY A; 4K11 A; 1QKX A; 2CT3 A; 2EW3 A; 1RUW A; 2VVK A; 3SEM A; 1T0J A; 1E6G A; 2DVJ A; 3REA B; 2DF6 A; 1ZUK A; 2NUZ A; 2RQT A; 2CSQ A; 1QLY A; 5IXF A; 4GBQ A; 1T0H A; 2KYB A; 1ZLM A; 2K3B A; 1SHG A; 2EGC A; 2J6F A; 4LUD A; 2NWM A; 2RMO A; 1FMK A; 1AZE A; 2GBQ A; 4HCK A; 2BTT A; 3H0F A; 4QT7 A; 2D1X A; 2DMO A; 4Y92 A; 1CKA A; 1SSH A; 2V1Q A; 3EHQ A; 1GCP A; 3VS3 A; 2KNB B; 1ABO A; 1M3B A; 3M0P A; 1SEM A; 2DA9 A; 2YSQ A; 2SRC A; 1X43 A; 3VRY A; 1K1Z A; 1UGV A; 1KSW A; 2KE9 A; 2JS2 A; 2PZ1 A; 2FG0 A; 2LQW A; 5IXB A; 2ROL A; 1UHF A; 1K4U S; 2DE0 X; 2CH4 W; 1Z9Z A; 1OPK A; 4OMO A; 4J9H A; 2OJ2 A; 3M0Q A; 1PKT A; 5L23 A; 4X1V A; 4EIK A; 3I35 A; 2EGE A; 3SHW A; 1WXT A; 1KJW A; 2ROT A; 1UJ0 A; 3TSW A; 2A08 A; 1X6G A; 2JM9 A; 1SRM A; 3VS2 A; 2RPN A; 2LJ1 A; 2F2W A; 4ZNX A; 3U23 A; 2EYW A; 2D8J A; 2L2P A; 2AK5 A; 2LJ0 A; 2CT4 A; 1IO6 A; 1AEY A; 2D8H A; 5IH2 A; 2K9G A; 1JXM A; 5EC7 A; 1GCQ A; 3PVQ A; 3RBB B; 3EG3 A; 2H8H A; 2CH4 A; 3H0I A; 4DEY A; 4F16 A; 1H8K A; 2P4R A; 2KEA A; 4AFQ C; 1JXO A; 2J6K A; 1OPL A; 4F14 A; 1J3T A; 2EKH A; 1M27 C; 2L3P A; 2LMJ A; 4JJD A; 2FRW A; 3H0H A; 3I5R A; 4E6R A; 2EYY A; 2F2X A; 2KR3 A; 1OV3 A; 1JO8 A; 5FWB A; 2JXB A; 2EGA A; 1H92 A; 2KRM A; 3VS7 A; 4M4Z A; 2L3Q A; 4HVW A; 1NM7 A; 2DNU A; 1I1J A; 2DJQ A; 1G2B A; 2KYM A; 2B86 A; 3IQL A; 4J9C A; 2OI3 A; 1WLP B; 1Y57 A; 5I22 A; 3QWX X; 1K9A A; 4F17 A; 1Z9Q A; 1GRI A; 4JJB A; 1BBZ A; 1WI7 A; 4Z88 A; 2GTJ A; 3EG1 A; 2AZS A; 2EYZ A; 2W10 A; 4Z8A A; 1E7O A; 4RUG A; 4RTV A; 1YNZ A; 2CDT A; 5IHI A; 1NLP C; 2C0O A; 1KFZ A; 3VS6 A; 4CC3 A; 1GBQ A; 2HDA A; 4RTX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5GJV B; 5LJ5 h; 4KH0 B; 2H3J A; 3A1P A; 2DRK A; 2EQK A; 1B07 A; 3TCJ A; 1CSK A; 5HK3 A; 4R0K A; 1TU0 B; 3X20 B; 1UEB A; 4BDY A; 1K8A R; 4XTZ A; 3GOX A; 3RIR A; 4JZ3 A; 2HQX A; 3OW2 A; 2D9T A; 1VQL T; 2VV5 A; 2G6F X; 1ZA1 B; 1AWJ A; 2DM1 A; 5LJ3 g; 4II1 A; 4DBF A; 2RJE A; 3VS4 A; 4F7U E; 3PMI A; 2BZ8 A; 1NPP A; 1V1C A; 1BI1 A; 1M90 C; 4R55 A; 1SKU B; 1KQS S; 2M16 A; 4C8Q C; 1PRM C; 2KXD A; 2DTO A; 2RQU A; 4LXC A; 3RDV A; 4IUP A; 1T3L A; 1Q82 C; 2DL8 A; 2CP3 A; 1EX4 A; 2COY A; 4ZTJ A; 1MMD A; 4J9D A; 2NUT B; 4J9B A; 3UA7 A; 1VQP Q; 2AHJ B; 3HRT A; 4MZP A; 5GAN h; 4E2F B; 1JBM A; 4LDU A; 2YUQ A; 1AWO A; 5C0M A; 4FSS A; 1NEG A; 4FW2 A; 4D8K A; 3JCM f; 1IHV A; 5FU6 C; 2MPX C; 4HVU A; 4A4H A; 2LCC A; 4F7U G; 2Y4X A; 2COW A; 3NTH A; 4E7I A; 5GAO r; 3JB9 G; 3ULR B; 4HKE A; 2I2L A; 2JTE A; 3BE3 A; 2OTJ T; 2OTL Q; 1S1N A; 4OML A; 1KC8 R; 3LWH A; 1AZG B; 1WFW A; 3RKY A; 3G4S Q; 1P92 A; 1VYT A; 5FRN A; 1QP3 A; 1PSF A; 3EHR A; 1MV3 A; 3JV3 A; 2R5M A; 2COZ A; 2RHZ A; 4RCB A; 1NYG A; 3CCV T; 3KFV A; 2LNV A; 4L59 A; 1M2V A; 3REB B; 7AT1 B; 2K57 A; 1N5Z A; 1W1F A; 3P8H A; 4PJO F; 2O9V A; 3CEY A; 2LX7 A; 1GXI E; 4LD6 A; 1VQP A; 5A0L A; 2YWW A; 1IRX A; 5CKB A; 1YJ9 T; 4PK4 A; 2NUP A; 1WZO A; 2QA4 Q; 3J81 E; 4M7A G; 1YHQ Q; 4PLI A; 5LJ3 d; 1VQK Q; 1AHJ B; 5CKE A; 1NJI U; 3G71 T; 4JZ4 A; 1UGQ B; 3CC2 A; 2V8K A; 4EMG A; 1LPL A; 3NGP A; 4M78 F; 3CD6 T; 1H64 1; 2M0Y A; 1PKS A; 1IGU A; 2OTL A; 2HQE A; 4B9X A; 4C92 E; 2RHY A; 1VQ8 Q; 3CCE A; 1Q86 U; 4C8Q B; 1Q7Y R; 1X69 A; 2QGG A; 1HJD A; 3S3M A; 1G5V A; 3VUZ A; 1M3C A; 1X6O A; 4RTY A; 1H3H A; 4PFZ A; 5KYX B; 3OY9 A; 1KHI A; 3EAE A; 3QZ9 B; 1YWP A; 3N5B B; 2CGH A; 4AFS C; 3L2W A; 1RLQ C; 3ZL7 C; 2ZPE B; 2X4J A; 4FSX A; 2DVE A; 1OU8 A; 4IKF A; 2YRD A; 1GFC A; 3JCM P; 1HSQ A; 5FU6 B; 4BI3 A; 1UG1 A; 5IHK A; 1TSF A; 3OYH A; 1U8R A; 2K2M A; 1VQL Q; 2C0I A; 1VIE A; 1X27 A; 1RAC B; 1I07 A; 2F69 A; 1XNI A; 2LP5 A; 1Q95 G; 2FL7 A; 1M2O A; 2YLB A; 1KK7 A; 3UF4 A; 1TG0 A; 3VYG A; 1OOT A; 1D0Z A; 2KT1 A; 3M0U A; 5GAM j; 4J7I A; 3OYB A; 4M7D E; 1YJW T; 4DEX A; 3M9Q A; 3JCM h; 4HCZ A; 2FPE A; 2CKK A; 3ZFJ A; 1D1A A; 3CC4 T; 1RL2 A; 3WVD B; 2DL5 A; 4Z89 A; 2LDM A; 4VUB A; 4EMK A; 1TUG B; 3CME Q; 5J39 A; 3V8K A; 4XU2 A; 4J6Y A; 1M1K R; 4A63 B; 4AFZ C; 1JRI A; 4MML A; 3CCM Q; 2DJZ A; 2YUP A; 5KYY A; 4J9G A; 2O4X A; 1PC0 A; 4M75 B; 4JRI A; 1D0X A; 2CSI A; 3PNW C; 3CMA Q; 1D1C A; 3PIO A; 3ZBD A; 1X75 C; 3EGU A; 4QVC A; 2RH2 A; 2RQR A; 1I4K 1; 1KQ1 A; 3GF5 A; 3QG1 A; 2M51 A; 2XMF A; 4RKU E; 3CCU T; 2DX1 A; 3CCJ Q; 2PUO B; 3LW5 E; 2AKL A; 2K79 A; 2L3S A; 2SEM A; 2JW4 A; 1QVG P; 1NE8 A; 2JN0 A; 1XQH A; 1V76 A; 2KGT A; 5KH6 A; 1M1G A; 4K11 A; 1M8V A; 3J80 E; 1RUW A; 3CCV Q; 1VQM A; 1YJN Q; 5FU7 B; 3TEE A; 1T0J A; 3EGD A; 3A8H B; 3RKW A; 1KD1 R; 5M9O A; 1NJI C; 4OB1 B; 5D6Y A; 3NTK A; 2DPP B; 4GBQ A; 3CME A; 1ZLM A; 2J6F A; 3LYI A; 3JB9 F; 3Q1J A; 3TRE A; 1N8R C; 2RB6 A; 3A5Z B; 5IT9 E; 2V8J A; 3X28 B; 2D1X A; 1YJ9 Q; 3CMA A; 1CKA A; 1ZHI A; 1GCP A; 3G7Z A; 3MEW A; 4FYV B; 3M0P A; 4ANJ A; 1R0C B; 1VQO A; 4JS5 A; 1VQ4 A; 3OSS C; 5LJ3 e; 1KD1 C; 1KSW A; 5KYW B; 4FYW B; 2BIV A; 4QW2 A; 2JS2 A; 4LDV A; 1R0B G; 5GMK m; 3CCJ A; 2LQW A; 2KMT A; 2PVO B; 1Y96 A; 3CPW P; 1K4U S; 2DE0 X; 2OJ2 A; 1YI2 A; 2C06 A; 4A54 A; 4PL6 A; 1KJW A; 3TQ7 P; 3CCS T; 3TSW A; 1X6G A; 4FU6 A; 3U23 A; 1U1S A; 2RK1 A; 4ZNX A; 4HCC A; 3QBY A; 2L2P A; 3AHU A; 4XTW A; 3L2V A; 3FIF A; 4M7A F; 3M59 A; 4PJO C; 5GAN 5; 1H8K A; 2P4R A; 1B34 A; 1WGS A; 2J6K A; 3OW2 P; 4FT2 A; 1NBE B; 1J3T A; 2L3P A; 3JCM J; 3HTR A; 2DET A; 3OQ5 A; 1ACM B; 2F2X A; 2KR3 A; 4C0Z A; 1OV3 A; 1WHJ A; 4M78 C; 3OBY A; 4L5G A; 1MND A; 4XK8 E; 4QQ6 A; 2Y4Y A; 3VS7 A; 3JCM V; 3OSV A; 4C5G A; 4E7S A; 1I5O B; 4HVW A; 2DKG A; 2FZK B; 3CC4 Q; 2KYM A; 3IQL A; 2OI3 A; 2MYS A; 2L89 A; 1Q81 C; 1IB8 A; 1HYO A; 1Z9Q A; 2YRV A; 5CKF A; 3CC7 Q; 5CVI A; 3EG1 A; 2AZS A; 3HRU A; 3OA6 A; 2EYZ A; 2W10 A; 1I8F A; 2E3I A; 4QVZ A; 2CDT A; 1KQ2 A; 1WHM A; 1PCX A; 5LJ3 f; 3LX7 A; 3VS6 A; 3VUB A; 2HDA A; 4BUG A; 3BDU A; 4PJO D; 2DIG A; 1IGQ A; 3EGX B; 3JB9 J; 1NLO C; 1QCF A; 2X3W D; 3ME9 A; 3GBQ A; 4OMF B; 2DL7 A; 2VYT A; 2O01 E; 3C94 A; 1N9S A; 2D0N A; 1WQW A; 4KT0 E; 1U06 A; 4ZTF A; 2ENM A; 1VQ5 A; 4JLG A; 4RTU A; 2E10 A; 2LZ6 B; 4KUL A; 1DJ7 B; 5GAN 4; 1W2B A; 1M90 U; 4EPC A; 2R5A A; 2QK0 A; 4M78 D; 3M4Y A; 2WSC E; 2VGM A; 3P8D A; 3TVT A; 4F7U A; 3URG A; 2KRO A; 3M55 A; 1X2K A; 1VA7 A; 5GMK i; 5ECA A; 3G6E A; 1Q82 U; 3UWN A; 3OMC A; 2JZ2 A; 4LN2 A; 2DBM A; 4CC2 A; 2CUD A; 4D6W A; 4JJC A; 3S3O A; 4PNO A; 3EG2 A; 5GAO q; 3CC7 A; 4OGC A; 4Q5W A; 4PJO B; 1YN8 A; 4XQ3 A; 2X4Y A; 4M77 B; 5GMK j; 4FYX B; 3O8V A; 4FL6 A; 4PJL A; 1VQN Q; 2FO0 A; 1YWO A; 3M56 A; 2ZPH B; 3CC2 T; 2RHX A; 2YT6 A; 1YCY A; 3OS5 A; 3CCR Q; 4OVA A; 2OAU A; 1FWZ A; 2K5I A; 2ECZ A; 5A2Q E; 1QKW A; 3I5S A; 2HKQ B; 2BZY A; 2V26 A; 1RLP C; 1WYX A; 4AG1 C; 3PVL A; 3CCE T; 3L1A A; 1U5S A; 1LJO A; 4LDX A; 4OMN A; 5DY9 A; 2P4T A; 2VXE A; 4BI4 A; 5GAN 2; 2JUF A; 4KRT A; 4A4G A; 1D3B A; 2X3X D; 3CPW S; 1QVP A; 4JPB W; 4MMK A; 1ZSZ A; 4ELY C; 1W4S A; 4E7J A; 3CCS Q; 5IN1 A; 3DB4 A; 1XTD A; 5LL6 S; 1K9M R; 1NYF A; 2WAC A; 4BD3 A; 4Y28 E; 2RHI A; 3H6Z A; 5LJ5 j; 4QKU A; 2HBW A; 3LH0 A; 5GAN 6; 3NFC A; 4NS5 A; 1BYM A; 4X9C A; 3LGL A; 4LUE A; 1ZBJ A; 2XK0 A; 1OI1 A; 3QKJ A; 2YXY A; 1VQN A; 3M58 A; 3I9Q A; 3SWN A; 3TSZ A; 4KGX B; 1N27 A; 1K9M C; 1RI9 A; 1H3Z A; 5KYX A; 1EIF A; 3CCR A; 1BI0 A; 3MP6 A; 3PT9 A; 1YIT T; 2HSE B; 4JJN K; 3OMG A; 1HD3 A; 2LJ3 A; 1PNJ A; 2QG9 B; 5LJ3 h; 3RMQ A; 2EQM A; 1GCQ C; 4OF1 A; 3HKS A; 2Y90 A; 1PHT A; 4C92 A; 5GAM e; 1YIJ Q; 1RI0 A; 1BCO A; 1U1T A; 1X01 A; 3FJ5 A; 4O6J A; 1A0N B; 1LCK A; 3X25 B; 3T9N A; 3VV0 A; 1QVF A; 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