The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
GSSGSSGASLLARYPPEKLFQAERNFNAAQDLDVSLLEGDLVGVIKKKDPMGSQNRWLIDNGVTKGFVYSSFLKPYNPRRSHSDASSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
NMR structure of SH3 domain of Hypothetical protein BAA76854.1
rcsb |
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
KIAA1010 protein
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| total genus |
11
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| structure length |
92
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| sequence length |
92
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-06-11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3VS6 A; 2JMA A; 2KXD A; 1H92 A; 1OV3 A; 1X6G A; 4AFS C; 2DBM A; 1X69 A; 1U06 A; 2JS0 A; 2EBP A; 1GFD A; 2EW3 A; 1KJW A; 1AEY A; 1AD5 A; 4M4Z A; 2KBT A; 2J7I A; 2CT4 A; 2FPD A; 1UFF A; 1WXB A; 3NHN A; 1H8K A; 4Y92 A; 3KFV A; 1T3S A; 2C0I A; 4CC4 B; 5IHI A; 1N5Z A; 4J9I A; 4EIK A; 2RQV A; 1BBZ A; 2KR3 A; 2V1Q A; 1X27 A; 2O2O A; 2FRW A; 2CSQ A; 1K0X A; 2BZY A; 4AG2 C; 2VKN A; 4OMP A; 2CT3 A; 1KFZ A; 2DRK A; 1UG1 A; 2A28 A; 1SHG A; 2DL7 A; 1UJY A; 1IO6 A; 1CKB A; 3QWY A; 1NG2 A; 2DNU A; 4HVV A; 2DVJ A; 4ESR A; 1WFW A; 5ECA A; 2RN8 A; 1Z9Q A; 2HCK A; 1WIE A; 2B86 A; 1GL5 A; 1GRI A; 2HSP A; 2I0N A; 4JZ3 A; 1WYX A; 1TG0 A; 2A08 A; 1KSW A; 1PRM C; 4AG1 C; 1E7O A; 2ECZ A; 2X3W D; 1MV3 A; 2QDL A; 2O9V A; 1J3T A; 2L3P A; 2MOX A; 1BU1 A; 5GJV B; 2EYX A; 2KRM A; 1PHT A; 1SEM A; 5FWC A; 1GCQ A; 1SRM A; 2BZX A; 4F17 A; 2DLP A; 4OMQ A; 1QLY A; 1H3H A; 2GQI A; 2M0Y A; 4Z8A A; 3H41 A; 2G6F X; 1JQQ A; 2AZS A; 4J9H A; 2JTE A; 2LJ3 A; 4R0K A; 2HBW A; 1JXO A; 2D1X A; 1Y57 A; 2PNI A; 1M3B A; 2LMJ A; 2RQW A; 2YT6 A; 3PVL A; 2LCS A; 4HXJ A; 2XMF A; 4D8K A; 3I9Q A; 3ULR B; 1VA7 A; 2LJ0 A; 2RPN A; 1X43 A; 1HSQ A; 3NGP A; 4LNP A; 2ENM A; 1VYU A; 2V1R A; 1I1J A; 2LQN A; 2FPF A; 3U23 A; 1X2Q A; 2DL4 A; 1ZLM A; 2DMO A; 1YCS B; 4RTY A; 1ZBJ A; 2M51 A; 2YUP A; 3O5Z A; 1WX6 A; 2BZ8 A; 2KYB A; 1TUD A; 4J9B A; 1U3O A; 2EGA A; 5IXB A; 1U5S A; 3REB B; 2LP5 A; 2K7A A; 2EPD A; 1AZG B; 3RBB B; 2RQR A; 1YNZ A; 2C0T A; 2FRY A; 1YN8 A; 4Z89 A; 1GBR A; 1SSH A; 1TUC A; 3TSZ A; 3VS2 A; 2YUN A; 3I35 A; 1JXM A; 3VS3 A; 2X3X D; 3VS5 A; 2DF6 A; 4JZ4 A; 3QWX X; 1WI7 A; 2JS2 A; 2J05 A; 2BTT A; 2RQU A; 1RLP C; 1QWE A; 1CSK A; 1NLP C; 1NEB A; 2KE9 A; 2H8H A; 1Z9Z A; 2ROT A; 2KNB B; 2PTK A; 1T0J A; 3UF4 A; 5FW9 A; 2GTO A; 2FG0 A; 1GFC A; 4QT7 A; 1M3A A; 3M0Q A; 3M0S A; 3EG1 A; 1QWF A; 4RTT A; 4LUE A; 1AOJ A; 3I5R A; 2DL3 A; 2HDA A; 2K3B A; 2ED0 A; 5FWB A; 2VVK A; 3EHR A; 2DYB A; 2FEI A; 1SRL A; 2K79 A; 5IHK A; 1K76 A; 4OMN A; 2EKH A; 4DEX A; 3I5S A; 1K4U S; 1EFN A; 2SEM A; 2GTJ A; 3VS0 A; 2CSI A; 2JT4 A; 3EG3 A; 1MV0 B; 2CH4 A; 1AWX A; 3REA B; 2C0O A; 2F2W A; 2ROL A; 3TSW A; 2O31 A; 3A98 A; 3JV3 A; 4J9D A; 2LX7 A; 2VWF A; 1BB9 A; 4HVW A; 5GJW B; 2KT8 A; 4JJB A; 2O9S A; 5L23 A; 1JU5 C; 3VRZ A; 2AK5 A; 4Z88 A; 4WCI A; 1UJ0 A; 2DX1 A; 4J9E A; 2L0A A; 1G2B A; 1OPK A; 1ARK A; 1UE9 A; 4ZNX A; 1ZSG A; 2YDL A; 2KRS A; 3SHW A; 4FSS A; 2L3Q A; 3UA6 A; 4LN2 A; 4GLM A; 1RLQ C; 2JMC A; 3VS4 A; 1VYV A; 2LJ1 A; 2RMO A; 2L3S A; 1UGV A; 1UTI A; 3M0P A; 2D8H A; 1G83 A; 1W70 A; 4HVU A; 4OMM A; 2CUB A; 3EHQ A; 1ZX6 A; 2CDT A; 3CQT A; 4CC7 A; 4E6R A; 2A36 A; 5I11 A; 5IXF A; 3LH5 A; 2L2P A; 4J9C A; 2KYM A; 1QCF A; 1M3C A; 1OPL A; 4RTZ A; 1UHC A; 1Y0M A; 1AWO A; 1S1N A; 2DRM A; 4RTU A; 1E6G A; 3SEM A; 1B3Q A; 1I07 A; 2DBK A; 1LCK A; 1FMK A; 1NYF A; 3M0U A; 2EGC A; 2GGR A; 2K2M A; 4OMO A; 1ABO A; 4F16 A; 4K11 A; 4JPB W; 4RUG A; 4HCK A; 4JJC A; 1RI9 A; 1JEG A; 1OOT A; 1T0H A; 2LNH B; 1PNJ A; 2KGT A; 1KIK A; 1X2K A; 2MCN A; 4IIM A; 2J6O A; 2KEA A; 1ZUK A; 4RTX A; 2DM1 A; 4CC2 A; 4X1V A; 2KT1 A; 1WLP B; 2K6D A; 2YUQ A; 2LZ6 B; 1WDX A; 2AZV A; 1V1C A; 2EYZ A; 4JJD A; 2A37 A; 2KRN A; 5IHN A; 1NEG A; 4LE9 A; 1M8M A; 4AFQ C; 2AKK A; 2E5K A; 3FJ5 A; 2KRO A; 2W10 A; 1UEC A; 1K0S A; 3H0F A; 3RNJ A; 5I22 A; 2OAW A; 1W6X A; 2AKL A; 3EG0 A; 2D0N A; 2EVR A; 5IH2 A; 1YWO A; 3UAT A; 3VRY A; 1VYT A; 3M0R A; 1ZUY A; 1WA7 A; 4A63 B; 2FO0 A; 1AWJ A; 1M30 A; 4OML A; 1E6H A; 1YWP A; 1BK2 A; 1QKW A; 1M27 C; 2P4R A; 2DA9 A; 2YUO A; 3UA7 A; 4CC3 A; 1YP5 A; 1GBQ A; 2DL5 A; 2NUZ A; 2GNC A; 1W1F A; 2J6K A; 1GCP A; 4D8D A; 2PZ1 A; 2FPE A; 2J6F A; 2DE0 X; 1PRL C; 2GBQ A; 1HD3 A; 1UUE A; 2F2X A; 2CH4 W; 3R6N A; 1FYN A; 3NPF A; 2OI3 A; 1NLO C; 2LQW A; 3EGU A; 1I0C A; 1PKT A; 2JXB A; 4LUD A; 3VS1 A; 1SPK A; 1SHF A; 2DJQ A; 4GBQ A; 2NWM A; 2ESW A; 4J9G A; 2D8J A; 2RNA A; 2KXC A; 2RF0 A; 2K9G A; 3TVT A; 4F14 A; 2IIM A; 4AFU C; 1JO8 A; 2OJ2 A; 2DIL A; 2EQI A; 1HJD A; 2ABL A; 1GCQ C; 4AFZ C; 2JM8 A; 2DL8 A; 2JW4 A; 1QKX A; 3EG2 A; 1T3L A; 4IIO A; 2MIO A; 4ORZ A; 1AVZ C; 2SRC A; 2YSQ A; 3NMZ C; 2CUD A; 1ZUU A; 3M0T A; 1B07 A; 4KRT A; 2RQT A; 2CRE A; 2O88 A; 3ZL7 C; 1X6B A; 3C0C A; 4DEY A; 1NYG A; 3IQL A; 2F2V A; 2HEQ A; 1UHF A; 1WXT A; 4J9F A; 3PE0 A; 3H0I A; 2W0Z A; 1PWT A; 3THK A; 1AWW A; 1MUZ A; 1K9A A; 2JM9 A; 1AZE A; 5EC7 A; 1WXU A; 2ED1 A; 1UDL A; 5HCK A; 1NM7 A; 1RUW A; 1PKS A; 1CKA A; 1XOV A; 4RTW A; 3PVQ A; 1ABQ A; 4RTV A; 3GBQ A; 2EYY A; 3VS7 A; 1OEB A; 3H0H A; 2J06 A; 1A0N B; 2EGE A; 2EYW A; 1K1Z A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1RAA B; 3CD6 Q; 2KXD A; 3GF5 A; 3CCQ Q; 1X6G A; 2EQM A; 4J83 A; 4ME7 A; 1KJW A; 2RHX A; 5KYY B; 2KBT A; 2VGM A; 4KUD K; 4FL6 A; 1ZA2 B; 3NHN A; 1VQK Q; 2QTV A; 3KFV A; 2C06 A; 1Q81 R; 2Z0W A; 2D0Q B; 3G7Z A; 3E2U A; 2NUT A; 5A0L A; 1P92 A; 3CC2 Q; 2GCX A; 1U1T A; 2KR3 A; 3CPF A; 2V1Q A; 3HP9 A; 4PJO D; 2ATC B; 3A8H B; 4N4H A; 2E3H A; 1QW1 A; 4J7F A; 2CSQ A; 4OMP A; 3G71 T; 3OYI A; 4AMC A; 3JCM X; 1JBM A; 1UJY A; 1IO6 A; 2X4X A; 3GNG A; 2DNU A; 4KUL A; 2DFU A; 3G4S T; 3OS0 A; 3CD6 A; 5GAO m; 3CCQ A; 3EFR A; 2EIF A; 2ECZ A; 5KYY A; 3MEV A; 2VXF A; 2MOX A; 2QA4 Q; 1BU1 A; 3PTA A; 2KRM A; 1PHT A; 1SEM A; 3CCE T; 4AT1 B; 1QVG P; 4A4G A; 2DLP A; 5CCA A; 1QLY A; 1TU0 B; 5LJ5 f; 1H3H A; 1KD1 R; 3CMA Q; 1OZ3 A; 1FMV A; 2RJE A; 4R0K A; 4PJM A; 1M3B A; 4C0D B; 1KC8 C; 4D8K A; 3ULR B; 1WJR A; 2RPN A; 1MMD A; 1R0C B; 1VQ9 T; 2V1R A; 2OAU A; 1D1A A; 1ZSZ A; 2EQU A; 4II1 A; 4ZGJ B; 2FPF A; 3U23 A; 4ELZ C; 3G6E T; 3ASK A; 1ZLM A; 1YCS B; 3NTI A; 2ZAE A; 1G5V A; 1Q81 C; 4BI8 B; 1C6V X; 4KH1 B; 2EGA A; 5IXB A; 5FU6 B; 2QK0 A; 1C1A A; 2B8A A; 2QA4 A; 3CCJ T; 2EPD A; 1BI0 A; 4OP0 A; 3RBB B; 1ZA1 B; 1YNZ A; 4Z89 A; 2DZC A; 3AHU A; 3M5A A; 3CMA A; 3TSZ A; 3I35 A; 3URG A; 4C0G A; 2X3X D; 1KC8 U; 4C5G A; 4MZP A; 3QWX X; 4PK4 A; 1WI7 A; 2VB6 A; 3KXT A; 1QP3 A; 1YIJ T; 4PJO C; 1IZ6 A; 3CCM T; 1NEB A; 2KE9 A; 3TRE A; 3V7C A; 1Z9Z A; 4C92 F; 1M2V B; 4N0A C; 2PTK A; 4M7A E; 3I56 Q; 3QSU A; 3KUF A; 2FG0 A; 4ZGD B; 1Q81 U; 1VQ7 A; 1VQM Q; 1RI0 A; 3EG1 A; 3OS1 A; 4M78 B; 3PMI A; 2ED0 A; 3RER A; 3CCU A; 2X4J A; 2QG9 B; 5FRN A; 1YJ9 A; 2XD0 A; 1KD1 C; 4PJO E; 1ZBX A; 2HBP A; 3I5S A; 2K2V A; 1D1C A; 2HNI A; 2XID A; 4IUV A; 3RDV A; 1KQS A; 3JB9 J; 4OVA A; 3X25 B; 1D0X A; 2XU8 A; 1QQJ A; 2RB6 A; 2V8K A; 2ROL A; 1KQ1 A; 5GAM d; 3JV3 A; 1M8V A; 4J9D A; 2X35 A; 2VWF A; 1G3Y A; 3CC4 Q; 3OYE A; 2FL7 A; 3QYG B; 1M2V A; 1IRE B; 4WCI A; 5GAO p; 3OW2 A; 4PNO A; 4J9E A; 1IRX A; 3JCM b; 1EZZ B; 2FB7 A; 1G2B A; 5CKD A; 2DET A; 2X51 A; 1ARK A; 1UE9 A; 2LCC A; 1ZSG A; 3SHW A; 4FU6 A; 3LWI A; 4M78 A; 1U8R A; 2F5T X; 4FSS A; 3UA6 A; 2EWN A; 3CXC A; 1UTI A; 3M0P A; 2D8H A; 4VUB A; 3PNW C; 1C0M A; 3CME T; 1N6A A; 4HVU A; 4OMM A; 3LWH A; 3EHQ A; 1ZX6 A; 3CQT A; 2GFA A; 4CRI A; 2E65 A; 5IXF A; 3LH5 A; 3L2Z A; 1RAE B; 2X9H A; 3E1S A; 3M9Q A; 1QVP A; 2KAF A; 3DB4 A; 3FDR A; 3CC4 A; 1Y0M A; 2ZPE B; 4C5H A; 1S1N A; 2DRM A; 4RMO A; 4FW2 A; 5GAM j; 1I07 A; 2LX9 A; 2DBK A; 5LJ3 f; 3M0U A; 4JS5 A; 2EGC A; 2P0Q A; 4RUG A; 4XTV A; 2CS7 A; 1PC0 A; 3OYD A; 4E7I A; 4JJC A; 3NFC A; 4M78 G; 3QZ9 B; 2LNH B; 2KVQ G; 5GAN h; 2E64 A; 2HQH A; 4Y28 E; 2L3R A; 2EKO A; 4RTX A; 3QII A; 1I8F A; 2K6D A; 3FRN A; 1VQ5 Q; 1QVF S; 5IHN A; 5C0M A; 4LE9 A; 4AFQ C; 3QHS A; 3E19 A; 5I22 A; 1QCN A; 3MEU A; 1N8R U; 2AKL A; 3INZ A; 4A53 A; 2EVR A; 5IH2 A; 2JZ2 A; 2DIQ A; 1QP2 A; 1VQ8 Q; 4OML A; 3L2R A; 2P4R A; 2KSS A; 3OYH A; 2V8I A; 5GAO l; 2YUO A; 1YP5 A; 1VIF A; 4WTO B; 1QCO A; 1GBQ A; 2DL5 A; 2J6K A; 2PZ1 A; 3V8K A; 3CCR A; 4GY5 A; 3SD4 A; 1PRL C; 1YJW T; 2CH4 W; 5J3B A; 1FYN A; 1R0B G; 3NPF A; 5GAN 2; 1NLO C; 4IUR A; 4LUD A; 2JXB A; 5J39 A; 3VS1 A; 8AT1 B; 4QKU A; 2NWM A; 4J9G A; 2D8J A; 3JCM Q; 2JTF A; 2RJF A; 3HL8 A; 3R6O A; 4LDX A; 3CBM A; 1VQ6 Q; 1NPR A; 3F70 A; 2K9G A; 4FW1 A; 4F14 A; 3MET A; 1VQP A; 1KHI A; 4Z02 A; 3RKW A; 4OB1 B; 2R5M A; 2JM8 A; 1LPL A; 2JW4 A; 3QKJ A; 2MWP A; 3G1J A; 4IIO A; 2SRC A; 3NMZ C; 1ZUU A; 1FMW A; 5KYU B; 2IVW A; 1TOV A; 1B07 A; 1OZ2 A; 2CKK A; 3ZL7 C; 1X6B A; 5GAN 5; 4DBH A; 4NL3 A; 4HCB A; 3CEY A; 2F2V A; 1WXT A; 4C92 B; 2DK3 A; 4EMH A; 3I55 T; 4M78 D; 3V8J A; 3QJ6 A; 2W0Z A; 4F7U F; 2FVU A; 1MHN A; 1AWW A; 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2G6F X; 3G4S A; 4XU0 A; 2LJ3 A; 4BE0 A; 5KYW A; 2CP3 A; 5GAM g; 5DY9 A; 3FIF A; 3PVL A; 2XMF A; 2RM4 A; 3OSV A; 5D7U A; 3CCS T; 3OW2 P; 5GAN e; 2VAS A; 2LDM A; 4M77 E; 3L2V A; 2F5K A; 2LJ0 A; 1X43 A; 1HSQ A; 3PFS A; 2LNV A; 3H9N A; 2ENM A; 2KY9 A; 1VYU A; 3E9F A; 3CCE A; 4FM4 B; 3OYN A; 1X2Q A; 2LCL A; 4ZTJ A; 4KBM B; 3S6W A; 2NUT B; 5M9O A; 2ZPB B; 2M51 A; 2YUP A; 3O5Z A; 1WHH A; 5I2S A; 3LW5 E; 3V7R A; 3BDU A; 2KYB A; 1TUD A; 2HMA A; 2PU9 B; 3CXC P; 4FT2 A; 2X4W A; 1U3O A; 3C4S A; 2LP5 A; 2BE9 B; 2P84 A; 5A2Q E; 4R56 A; 1XTD A; 2HSE B; 4JJN K; 5KCH A; 1YJN A; 2FRY A; 1VQO T; 1YN8 A; 8ATC B; 1M90 R; 3VJP A; 1VQ9 A; 2BE7 D; 1SSH A; 4EDU A; 2P4T A; 1KK7 A; 1JXM A; 2G3R A; 2YUN A; 3VS3 A; 4OB0 B; 1YBY A; 2DF6 A; 3G6E A; 2JS2 A; 4QQD A; 1D3B B; 1BKB A; 1UGQ B; 2J05 A; 2R5A A; 1Q7Y C; 2DD4 A; 2BTT A; 3VUB A; 1RLP C; 1CSK A; 4XTU A; 1FXX A; 2H8H A; 1YFN A; 2KNB B; 2CZ0 B; 1T0J A; 3UF4 A; 3CCJ A; 4CI0 C; 1M3A A; 1NJI C; 3DB3 A; 4JUV A; 2QI2 A; 1OU8 A; 1RAC B; 3M0S A; 2HDA A; 2CP2 A; 5FWB A; 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