The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
|
sequence length |
72
|
structure length |
72
|
Chain Sequence |
GSSGSSGTPFRKAKALYACKAEHDSELSFTAGTVFDNVHPSQEPGWLEGTLNGKTGLIPENYVEFLSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of human olygophrein-1 like protein (KIAA0621)
rcsb |
| molecule keywords |
Olygophrenin-1 like protein
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
9
|
| structure length |
72
|
| sequence length |
72
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-06-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QLY A; 4WCI A; 2KYB A; 2EGE A; 5I22 A; 4EIK A; 4F14 A; 2LJ0 A; 1NEG A; 1H3H A; 2D8J A; 1NLP C; 2L0A A; 2LP5 A; 2KT8 A; 3PE0 A; 2JMA A; 1I0C A; 3NHN A; 1GCQ A; 2YDL A; 1FYN A; 2JXB A; 1K4U S; 2RQT A; 4LUD A; 1ZUY A; 2KGT A; 2KEA A; 1WDX A; 1MV0 B; 2AK5 A; 4J9E A; 3VS2 A; 1QWE A; 4R0K A; 2LZ6 B; 1EFN A; 1E7O A; 2CDT A; 1VA7 A; 4J9C A; 1A0N B; 3THK A; 1K0X A; 2DE0 X; 2A08 A; 1I07 A; 4OMM A; 3EG3 A; 4D8D A; 2D1X A; 2YUQ A; 3M0Q A; 1TUC A; 4J9B A; 1Z9Q A; 4LNP A; 1UHC A; 1T0J A; 5ECA A; 1M27 C; 1WXB A; 1PRM C; 2YSQ A; 1YWO A; 5IHI A; 1SHF A; 2RNA A; 1RI9 A; 2F2W A; 2O31 A; 4J9H A; 5IH2 A; 1GFD A; 4AG2 C; 5IXF A; 2M51 A; 1PKT A; 2AKL A; 4DEY A; 1HD3 A; 4JPB W; 3U23 A; 1B07 A; 2K79 A; 2FPF A; 3I9Q A; 1W6X A; 4RTU A; 2BZ8 A; 1OPL A; 2CRE A; 1VYU A; 2DX1 A; 1V1C A; 3VS3 A; 2EBP A; 2LCS A; 5I11 A; 1KSW A; 2DVJ A; 1LCK A; 4HVV A; 2DBK A; 1YP5 A; 5FWC A; 2EPD A; 2J7I A; 2JS2 A; 2DF6 A; 2O88 A; 2EYW A; 1GRI A; 3TSW A; 2DMO A; 1OOT A; 1ZUK A; 3UA6 A; 1H8K A; 1MUZ A; 1QWF A; 4RTX A; 1T3S A; 2D0N A; 4Z8A A; 2CT3 A; 4FSS A; 1NG2 A; 2RQV A; 4AFZ C; 4HXJ A; 3FJ5 A; 2L3S A; 3UA7 A; 2HEQ A; 1KFZ A; 2DNU A; 1JO8 A; 2J05 A; 2A36 A; 1JQQ A; 1UEC A; 2KRM A; 1ARK A; 4RTT A; 5IHK A; 2L3Q A; 1AVZ C; 2DM1 A; 2ENM A; 2LJ3 A; 3M0P A; 2H8H A; 3M0T A; 4HVU A; 1ZSG A; 2EW3 A; 1WFW A; 2HCK A; 1X27 A; 4IIO A; 1CSK A; 2K3B A; 4X1V A; 4J9D A; 2CSQ A; 4D8K A; 1I1J A; 2C0O A; 2FRY A; 1OPK A; 1WXT A; 4F17 A; 1AWW A; 4CC3 A; 1FMK A; 2RN8 A; 4LN2 A; 2YUN A; 5IXB A; 2DIL A; 4LUE A; 1UFF A; 2B86 A; 1ZBJ A; 2L2P A; 5L23 A; 3I35 A; 5EC7 A; 1UJY A; 2BZY A; 2W0Z A; 2DL4 A; 2O9V A; 4CC7 A; 2EYY A; 1YN8 A; 4JJB A; 2HSP A; 2LQW A; 1AZE A; 1SPK A; 1SHG A; 3ULR B; 3VS4 A; 3EHR A; 1YWP A; 2GTJ A; 4AG1 C; 2V1R A; 3M0R A; 4JJD A; 2HDA A; 4ORZ A; 4RUG A; 2DYB A; 1OV3 A; 2KR3 A; 2EVR A; 2K7A A; 3H41 A; 2KRO A; 2ROT A; 1T0H A; 1ZUU A; 2EYZ A; 4AFS C; 1AWX A; 1H92 A; 2DL8 A; 2LJ1 A; 3QWX X; 4OMP A; 3REB B; 4CC2 A; 2KT1 A; 2KRN A; 1Y0M A; 3M0S A; 2DBM A; 1TUD A; 2NWM A; 1X2K A; 1WYX A; 5FW9 A; 3JV3 A; 1QCF A; 3TSZ A; 3UAT A; 2VVK A; 2GQI A; 1AWO A; 3CQT A; 4LE9 A; 5GJV B; 2AKK A; 1G83 A; 1M8M A; 2HBW A; 4Y92 A; 2DL3 A; 1WX6 A; 2QDL A; 4F16 A; 2I0N A; 1NYG A; 4JZ3 A; 4E6R A; 1W1F A; 1PRL C; 5HCK A; 2FG0 A; 2SEM A; 2DA9 A; 2X3X D; 2ECZ A; 2J6F A; 3EGU A; 1VYT A; 1WIE A; 4OMO A; 2X3W D; 3H0F A; 2EKH A; 2J6O A; 1U06 A; 1X6G A; 2CSI A; 2OAW A; 4HCK A; 4CC4 B; 1UE9 A; 3SHW A; 3VS6 A; 4AFU C; 1GBR A; 1YCS B; 1TG0 A; 2VWF A; 3NPF A; 3UF4 A; 1WI7 A; 2PZ1 A; 2K6D A; 2JW4 A; 2RMO A; 1AEY A; 1X69 A; 2C0I A; 3EG0 A; 1UTI A; 1S1N A; 3VS7 A; 1RLQ C; 2FEI A; 3GBQ A; 2KRS A; 1U5S A; 1W70 A; 1NLO C; 1B3Q A; 1ABO A; 2JM8 A; 4RTZ A; 1YNZ A; 2VKN A; 2FPE A; 2GTO A; 3O5Z A; 2ED0 A; 1X6B A; 1PHT A; 1J3T A; 2LQN A; 3KFV A; 1GFC A; 3I5S A; 3VRY A; 2W10 A; 3NGP A; 3REA B; 5FWB A; 2SRC A; 2O2O A; 1XOV A; 2CH4 W; 1GCQ C; 1AOJ A; 3R6N A; 1U3O A; 1UGV A; 2FPD A; 1NEB A; 3VRZ A; 1GBQ A; 1UJ0 A; 2DRK A; 2DRM A; 2JMC A; 1JU5 C; 2DLP A; 2CUB A; 3VS1 A; 1Z9Z A; 4GBQ A; 2NUZ A; 1QKX A; 2K9G A; 2EQI A; 3M0U A; 3EG1 A; 1ABQ A; 2MCN A; 1SSH A; 1WA7 A; 2J6K A; 1X2Q A; 4DEX A; 2KYM A; 2AZS A; 4JJC A; 3VS5 A; 4IIM A; 2LX7 A; 1IO6 A; 4A63 B; 2M0Y A; 1WLP B; 1M3A A; 4QT7 A; 1AZG B; 4J9F A; 2LNH B; 4HVW A; 1M3B A; 1VYV A; 1E6H A; 1UUE A; 1NYF A; 2JM9 A; 1SEM A; 2YT6 A; 1CKB A; 1PWT A; 4GLM A; 1BU1 A; 1JXM A; 2JS0 A; 1K9A A; 1N5Z A; 1T3L A; 1AD5 A; 4ZNX A; 1AWJ A; 2RQU A; 2GGR A; 2V1Q A; 1K1Z A; 4ESR A; 2FRW A; 1BB9 A; 2P4R A; 1K0S A; 1BBZ A; 1KJW A; 1UG1 A; 3LH5 A; 2A37 A; 2OJ2 A; 2J06 A; 2G6F X; 4M4Z A; 3TVT A; 2RQW A; 2D8H A; 1M30 A; 2IIM A; 3QWY A; 1PKS A; 1QKW A; 2YUP A; 3RBB B; 1K76 A; 2K2M A; 1JXO A; 2KE9 A; 2YUO A; 2O9S A; 2C0T A; 2FO0 A; 4RTY A; 3VS0 A; 1CKA A; 2GBQ A; 2RF0 A; 4KRT A; 1M3C A; 2ABL A; 4RTV A; 1E6G A; 2BZX A; 1PNJ A; 2AZV A; 1ZX6 A; 5GJW B; 2DJQ A; 1KIK A; 3EHQ A; 2XMF A; 1SRM A; 2RPN A; 4J9I A; 4OML A; 2LMJ A; 1HSQ A; 1G2B A; 2CH4 A; 4Z89 A; 1OEB A; 1HJD A; 2KNB B; 2KXD A; 3C0C A; 2MIO A; 2L3P A; 2ESW A; 4K11 A; 3PVL A; 2RQR A; 1GL5 A; 2CUD A; 1WXU A; 2EGA A; 1Y57 A; 2MOX A; 2JTE A; 2ROL A; 5IHN A; 2ED1 A; 4JZ4 A; 3IQL A; 3PVQ A; 4J9G A; 2PNI A; 1UHF A; 2BTT A; 1JEG A; 4Z88 A; 1BK2 A; 3ZL7 C; 4OMN A; 1RLP C; 2EGC A; 2KBT A; 3A98 A; 1GCP A; 1NM7 A; 2A28 A; 1RUW A; 2GNC A; 2DL7 A; 4OMQ A; 4AFQ C; 2EYX A; 3H0I A; 3NMZ C; 1X43 A; 1ZLM A; 2JT4 A; 2F2X A; 3SEM A; 2CT4 A; 2DL5 A; 2F2V A; 1SRL A; 2PTK A; 1UDL A; 3RNJ A; 3H0H A; 2E5K A; 3EG2 A; 4RTW A; 2KXC A; 2OI3 A; 1MV3 A; 3I5R A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4PK4 A; 1NJI U; 4J6W A; 4KBM B; 5I22 A; 4C92 F; 1TSF A; 5GAN g; 4FYW B; 1H3H A; 1N27 A; 1D3B A; 3PE0 A; 2JMA A; 3MCA B; 3UWN A; 1ZUY A; 2E5Q A; 1IRE B; 1ZHI A; 2AK5 A; 2VC8 A; 3OY9 A; 5FU7 C; 1K73 R; 3A5Z B; 4R0K A; 4O6J A; 1K0X A; 2JJ9 A; 2DJZ A; 3EG3 A; 2D1X A; 4IUU A; 1Y71 A; 2LCL A; 1B7T A; 1Q7Y R; 2YLB A; 4M78 B; 3P8H A; 1TUC A; 4E7L A; 2M0O A; 3OYF A; 1NPR A; 1KHI A; 5KE2 A; 1UHC A; 4PFP A; 1C1A A; 4RCC A; 1M9S A; 5ECA A; 1WXB A; 1PRM C; 1G8X A; 3VV0 A; 2RNA A; 2CZ1 B; 4C92 A; 1GFD A; 2IG0 A; 4AG2 C; 5IXF A; 1VQP T; 2M51 A; 1PKT A; 2LX9 A; 3I9Q A; 4RTU A; 4BD3 A; 2VB6 A; 1VQ4 Q; 1KSW A; 2I2L A; 2DBK A; 2RI5 A; 1YP5 A; 2XK0 A; 2EPD A; 5CQX A; 3VKI A; 5C0M A; 3CCM Q; 2D0Q B; 3ZEH A; 4ZGD B; 1R8O B; 1I8F A; 3O8V A; 1H8K A; 2LT1 A; 4KT0 E; 2D0N A; 4C5H A; 3RUX A; 2RQV A; 4OP0 A; 4AFZ C; 4NL3 A; 3FJ5 A; 3UA7 A; 4HKE A; 1JO8 A; 3LWI A; 2J05 A; 2D6F A; 3G1J A; 3OYI A; 1VQK A; 3OS0 A; 3CXC A; 2AHJ B; 4KUL A; 2L3Q A; 4O5V A; 1M4Z A; 1W2B P; 2P0K A; 3OYA A; 1VQM A; 3FB9 A; 1ZSG A; 1VQ6 Q; 4IUP A; 2HSE B; 1X27 A; 1YJN A; 3A8L B; 3JAM E; 3WXM B; 3CCU Q; 4X1V A; 2CSQ A; 2E41 A; 2C0O A; 2FRY A; 4F17 A; 1AWW A; 1NE8 A; 2HKQ B; 2RN8 A; 3CPW P; 3J80 E; 5I21 A; 4LUE A; 4JUV A; 3QYG B; 3TRE A; 2X4Y A; 4M7A B; 3JCM W; 1ZBJ A; 3CD6 T; 1OQK A; 2GF7 A; 4R55 A; 1VQ6 T; 3EG9 A; 1VQ9 A; 5GAN 4; 3M53 A; 2V8K A; 1XNI A; 2EYY A; 4J5Y A; 5CCA A; 2DKG A; 3ULR B; 3VS4 A; 4M77 B; 1KG1 A; 4QQD A; 3M0R A; 4JJD A; 4C8Q D; 4ORZ A; 5J39 A; 3VUB A; 2DYB A; 2DYI A; 2V8J A; 4OB2 B; 3H41 A; 2MF2 A; 1ZBX A; 1N8R C; 2ROT A; 2RO0 A; 4RKU E; 1G3Y A; 1T0H A; 1ZUU A; 2EQU A; 1VQL T; 2A7Y A; 1AWX A; 2OTJ A; 3SDZ A; 1H3Z A; 4RMO A; 4OMP A; 3REB B; 3G6E Q; 4CC2 A; 3J81 E; 1M90 U; 1K8A U; 1WYX A; 3JB9 F; 2GQI A; 1TOV A; 2EFI A; 2GCX A; 2MI6 A; 3CQT A; 5GJV B; 1SKU B; 1G83 A; 1WHH A; 2AKK A; 2HBW A; 4Y92 A; 1VQ8 T; 2QDL A; 3M4Y A; 4F16 A; 4C8Q G; 4JZ3 A; 3A8O B; 4E6R A; 1PRL C; 1BIA A; 1VIF A; 2PQW A; 1WIE A; 5CQY A; 2QEX A; 3G6E T; 3QZ9 B; 2V26 A; 1WHL A; 4WTO B; 1KQS A; 4AFU C; 2ZAE A; 3NPF A; 2CZ7 B; 1OX9 A; 2HQE A; 2QDY B; 2PZ1 A; 2HAX A; 2YRD A; 5FU7 B; 2DXB A; 2HQX A; 2P84 A; 4BI3 A; 1UTI A; 3H9N A; 4ME7 A; 4XU3 A; 3PIP A; 1IRX A; 4KGV B; 1W70 A; 1ABO A; 4N4I A; 1HXD A; 3QII A; 2MMP A; 4OB0 B; 3VYG A; 3JRZ A; 4BE0 A; 1KHC A; 3MET A; 1X6B A; 2X9H A; 2A0F B; 3EFR A; 1RAC B; 3KFV A; 3OYY A; 3PTA A; 3I5S A; 3VRY A; 3MEV A; 1R0C B; 1JJ2 S; 2O01 E; 2KY9 A; 1W4S A; 4IUR A; 1U3O A; 1NJI R; 2QA4 A; 1IB8 A; 3CCQ A; 1MMA A; 3VRZ A; 3CCL A; 3CME Q; 5FRN A; 2DLP A; 3VS1 A; 1M2V A; 3CPF A; 1W2B S; 4A4H A; 2OX7 A; 1XQH A; 1Y96 B; 4MZP A; 4Z02 A; 1Q86 C; 2DTI A; 3OYH A; 1D0Z A; 3QKJ A; 5HY6 A; 5GMK m; 1ABQ A; 2NUT A; 5LJ3 e; 1Q82 U; 4JJC A; 4PFO A; 2YRV A; 4PKC C; 3OYL A; 2DD5 A; 2LNH B; 1B34 B; 3CPW S; 3CME T; 3NTH A; 4M7D E; 1M3B A; 2YWW A; 2JM9 A; 5KYX A; 3S6W A; 3DLM A; 1BCO A; 4M75 E; 3C95 A; 3MHX A; 1N5Z A; 3FDR A; 3OYC A; 4M7A F; 1M1G A; 1TH7 A; 2EQJ A; 2FYK A; 1IXD A; 2FRW A; 1LPL A; 2VXF A; 2CP5 A; 3JSC A; 1K0S A; 2K4Y A; 1VQO A; 2A37 A; 2OJ2 A; 3MPU B; 5GAN e; 4BI8 B; 1BYM A; 4F7U B; 3QWY A; 3EGD A; 2CGH A; 2YUP A; 1QCO A; 4BE1 A; 1MNE A; 1JXO A; 4M7D D; 1BI0 A; 4M77 F; 2CP0 A; 2YUO A; 2RB6 A; 5CKE A; 3NTK A; 4RTY A; 4M75 D; 2RF0 A; 2K3X A; 2CP7 A; 4RTV A; 2E10 A; 1PNJ A; 2AZV A; 3L2W A; 1ZX6 A; 1TS9 A; 3ME9 A; 2XDD A; 1MMG A; 2NUP A; 4OML A; 2QTX A; 1G5V A; 4KH0 B; 1PSE A; 3M59 A; 2E12 A; 5A0L A; 2A3L A; 1G2B A; 2CH4 A; 1MHN A; 2KNB B; 3OSV A; 1JJ2 A; 2MIO A; 3R6O A; 3QSU A; 4M7D G; 1KD1 C; 4FU6 A; 2RQR A; 3KUF A; 2CUD A; 1VOM A; 1WXU A; 2JTE A; 2LNV A; 2EQK A; 4M75 G; 4J9G A; 1JEG A; 3DLL A; 1M5Q 1; 2KBT A; 4JRK A; 1GCP A; 3OS1 A; 1RUW A; 2GNC A; 2DL7 A; 3CCV Q; 4GLK A; 3H0I A; 1X43 A; 2RJC A; 4ZN3 A; 2CT4 A; 2DL5 A; 2F2V A; 3SD4 A; 4DOW A; 5DY9 A; 1GXI E; 3RNJ A; 3BW1 A; 4RTW A; 3JCM f; 3JB9 H; 1PC0 A; 2RJF A; 4EMG A; 3JB9 I; 2DEU A; 3LWH A; 4WCI A; 1JRI A; 2KYB A; 4MZM A; 3FEO A; 4EIK A; 4ZN1 A; 2D8J A; 2L0A A; 2RA2 A; 3NHN A; 1GCQ A; 1M90 C; 1VQM Q; 1K8A C; 4LUD A; 5GAN 5; 4JLG A; 2L3R A; 2RHZ A; 4C8Q C; 1YJ9 Q; 4N4G A; 1TTH B; 1WDX A; 4L6V 5; 2DPP B; 4J9E A; 3LGL A; 1YJN Q; 2BUD A; 1O75 A; 3G4S A; 4LDX A; 1IZ6 A; 3GIB A; 1I07 A; 1VQK T; 3I55 A; 3X28 B; 3WVE B; 4A4G A; 2YUQ A; 2X4X A; 4C92 D; 4Y91 A; 1M90 R; 1Z9Q A; 1K8A R; 3HKS A; 3HPW A; 3QUI A; 8ATC B; 1UGS B; 4JRQ A; 2LTO A; 3L42 A; 1YJN T; 1RAF B; 1M1F A; 3HSB A; 4JPB W; 1B07 A; 3M54 A; 1N8R U; 4PJO C; 1D09 B; 2BZ8 A; 2L8D A; 2DD4 A; 2EBP A; 2LCS A; 3EFO B; 1SSF A; 2ZPF B; 4XU2 A; 3QJ6 A; 1LCK A; 1LVK A; 3OBW A; 1X75 C; 3L2R A; 3BE3 A; 1VQ5 A; 4C92 G; 1VQ9 T; 5EG2 A; 2O88 A; 4M75 A; 2RM4 A; 2DMO A; 5CAI A; 5D6W A; 1S72 A; 2VGN A; 4RTX A; 4XTY A; 3JCM d; 5LJ3 g; 1OUL A; 1M8V A; 2HBP A; 4FSS A; 1QMC A; 3E19 A; 3HRT A; 4J7F A; 2CZ6 B; 2A36 A; 4F7U F; 1JQQ A; 1WNL A; 1VQN A; 1ARK A; 1BKB A; 2OTJ T; 2DXU A; 2QEX Q; 3M0T A; 2VUB A; 3CCS A; 2CKK A; 2CYZ B; 2EJF A; 4A53 A; 4XU1 A; 1WZO A; 3RES A; 3RR6 A; 1UEB A; 5KH6 A; 2RK2 A; 5C6S A; 2KK4 A; 5KYU B; 4IIO A; 1WQW A; 1FXX A; 4V2S A; 3OYJ A; 5KCH A; 4FM4 B; 1AHJ B; 1RAD B; 2KVQ G; 2R57 A; 4J9D A; 3EGX A; 1OPK A; 1WXT A; 2CP6 A; 3OS5 A; 3CXC S; 4CC3 A; 1FMK A; 2PVO B; 5IAY A; 4LN2 A; 5IXB A; 2LCC A; 2QEX T; 4VUB A; 2L2P A; 1VQ7 A; 3TQ7 P; 2WSC E; 1YHQ A; 1Q82 R; 3I35 A; 2NLU A; 1TU0 B; 2K2V A; 2BZY A; 2W0Z A; 3RMS A; 4MDW A; 4C0Z A; 4N0A A; 4JJB A; 1G3W A; 3RMQ A; 1WHJ A; 1OYX A; 1VQP Q; 3SWN C; 1YWP A; 2E65 A; 3HFN A; 4AG1 C; 2V1R A; 2X4J A; 4X9D A; 4RUG A; 4DA4 A; 2KR3 A; 1AT1 B; 2QA4 Q; 2FZC B; 3QHS A; 2X4W A; 3CCQ Q; 2FB7 A; 3HFO A; 4OB1 B; 2DAQ A; 2DZ9 A; 6AT1 B; 1RAI B; 3JCM h; 1Q86 U; 2ZPH B; 2EYZ A; 4LD6 A; 4AFS C; 2HL3 A; 3HL8 A; 2ZPE B; 4XQ3 A; 1UGP B; 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