The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
|
sequence length |
72
|
structure length |
72
|
Chain Sequence |
GSSGSSGTPFRKAKALYACKAEHDSELSFTAGTVFDNVHPSQEPGWLEGTLNGKTGLIPENYVEFLSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of human olygophrein-1 like protein (KIAA0621)
rcsb |
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Olygophrenin-1 like protein
|
| total genus |
9
|
| structure length |
72
|
| sequence length |
72
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-06-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4F17 A; 4Y92 A; 2OI3 A; 1E7O A; 3U23 A; 2DYB A; 1YP5 A; 2ED0 A; 1PWT A; 4RTT A; 1SSH A; 1KJW A; 1MV0 B; 3VRY A; 2V1R A; 2J7I A; 2LMJ A; 3EG2 A; 1UDL A; 1FYN A; 2NWM A; 2L3S A; 1NEG A; 2CSI A; 2EYZ A; 1B07 A; 1FMK A; 2KT8 A; 1VA7 A; 1NLO C; 2DVJ A; 2KRS A; 4AFZ C; 1OPL A; 4CC2 A; 5GJW B; 1K4U S; 1VYV A; 2FEI A; 2VKN A; 4CC3 A; 1YN8 A; 4RTW A; 1AOJ A; 2EYY A; 1K1Z A; 2AKL A; 3M0R A; 1ABO A; 2HBW A; 3REB B; 3IQL A; 1U5S A; 2DL7 A; 1Z9Q A; 3VS4 A; 4D8D A; 1BBZ A; 4F16 A; 2MCN A; 4HVU A; 3NPF A; 2D0N A; 2AZV A; 2PTK A; 2V1Q A; 1CKB A; 1GCQ C; 1NG2 A; 1WFW A; 1WX6 A; 4JJD A; 2O2O A; 1WXU A; 1T0H A; 4RTZ A; 1X2Q A; 2AK5 A; 1SRM A; 1PRL C; 4LUD A; 2RPN A; 2F2W A; 2F2X A; 2XMF A; 2DBK A; 3H0H A; 2SRC A; 2PZ1 A; 1CSK A; 3EG0 A; 4WCI A; 1UJ0 A; 3RBB B; 2KT1 A; 2QDL A; 2K9G A; 1JEG A; 2YUQ A; 1AWW A; 2B86 A; 3M0U A; 3H41 A; 2DL4 A; 1UTI A; 2H8H A; 3VS7 A; 1AWO A; 1M3C A; 1W6X A; 1E6G A; 2YUO A; 1U3O A; 2KYB A; 1H92 A; 2HDA A; 1Y0M A; 1X6B A; 2KNB B; 2DL8 A; 4AG2 C; 2RQU A; 3TVT A; 2YUN A; 3GBQ A; 3EG3 A; 2DRM A; 3CQT A; 1ZX6 A; 2GTJ A; 2KRO A; 1WA7 A; 2YUP A; 2ECZ A; 1JXM A; 2G6F X; 4OMQ A; 5IXB A; 1M27 C; 1WDX A; 2A36 A; 2L3P A; 2CUD A; 2J6O A; 1SHG A; 1VYU A; 4JJB A; 2DL3 A; 1TG0 A; 2KRN A; 1H3H A; 2KGT A; 1OEB A; 1RLP C; 1WLP B; 1ZLM A; 2L2P A; 2EPD A; 3PVL A; 1ZUU A; 2JT4 A; 2KE9 A; 3FJ5 A; 2AZS A; 1YWP A; 1ZUY A; 4ESR A; 2IIM A; 3I5S A; 4FSS A; 1BK2 A; 2JMA A; 1SRL A; 1UE9 A; 2C0T A; 2KRM A; 2LQN A; 1PNJ A; 3VS5 A; 1ABQ A; 2C0O A; 2CUB A; 2LCS A; 1AD5 A; 2JM9 A; 3SHW A; 1QWF A; 3VRZ A; 1G83 A; 3LH5 A; 4OMO A; 2DRK A; 4GBQ A; 1GCP A; 1NLP C; 3JV3 A; 4GLM A; 3VS1 A; 4D8K A; 2D8J A; 2O9S A; 3VS2 A; 3PE0 A; 4IIO A; 2HEQ A; 1K9A A; 5IHI A; 3UAT A; 1WXT A; 2OAW A; 1AEY A; 2LNH B; 1UJY A; 1KFZ A; 2DF6 A; 1ZUK A; 4J9B A; 2F2V A; 1AVZ C; 2JXB A; 2L3Q A; 1ZSG A; 2CRE A; 2RQR A; 1U06 A; 1UHF A; 2EGA A; 2P4R A; 2HCK A; 4JZ4 A; 5FWB A; 2GGR A; 3I5R A; 2DNU A; 1UEC A; 3H0I A; 3UA6 A; 1UGV A; 2YDL A; 3I35 A; 2J6F A; 2GNC A; 5HCK A; 2DIL A; 4Z8A A; 1X43 A; 5I11 A; 2ROL A; 1LCK A; 4R0K A; 2EVR A; 1HSQ A; 2K79 A; 1OOT A; 4HCK A; 1IO6 A; 2DE0 X; 3VS0 A; 4J9E A; 3EG1 A; 2ESW A; 1SHF A; 1GBQ A; 1X27 A; 2YT6 A; 5FW9 A; 1H8K A; 1ARK A; 1T3L A; 1XOV A; 2CT3 A; 4X1V A; 2K7A A; 4EIK A; 2M0Y A; 1I0C A; 2EQI A; 2JW4 A; 3VS3 A; 5FWC A; 1RI9 A; 1T0J A; 5GJV B; 4OMP A; 4J9I A; 4AFS C; 4J9H A; 4J9F A; 2JS0 A; 1GBR A; 4HVW A; 2A37 A; 3A98 A; 2FPE A; 1AWX A; 4OMN A; 1T3S A; 4HVV A; 5IH2 A; 2KXC A; 1QKX A; 2VWF A; 1WI7 A; 2O9V A; 1BB9 A; 2RNA A; 2GTO A; 2W10 A; 4DEY A; 5I22 A; 2EKH A; 4ORZ A; 4LE9 A; 4JJC A; 1JO8 A; 2C0I A; 4M4Z A; 1E6H A; 2EGC A; 3PVQ A; 1GFC A; 4RUG A; 2AKK A; 4LUE A; 2SEM A; 1QWE A; 2DBM A; 2A08 A; 3ZL7 C; 2K3B A; 3EHQ A; 4F14 A; 2DLP A; 4RTX A; 2LP5 A; 2A28 A; 1QKW A; 2EW3 A; 2RQT A; 2EGE A; 4E6R A; 2X3W D; 2RMO A; 2YSQ A; 2DL5 A; 2EYX A; 4AG1 C; 4Z89 A; 2J05 A; 4J9C A; 1OPK A; 1TUD A; 1NYG A; 1Z9Z A; 2FG0 A; 1BU1 A; 2RQW A; 1W70 A; 1NM7 A; 1NEB A; 1UG1 A; 5EC7 A; 4LN2 A; 1N5Z A; 2JTE A; 1X6G A; 2LJ3 A; 2FRY A; 4KRT A; 2FRW A; 2FPF A; 4AFU C; 2VVK A; 3EHR A; 2LX7 A; 2KXD A; 3UA7 A; 1VYT A; 2ABL A; 1K0X A; 3NGP A; 5ECA A; 1GCQ A; 2D8H A; 3I9Q A; 1QCF A; 1M3A A; 4RTY A; 1M30 A; 2EBP A; 2GQI A; 1K0S A; 4IIM A; 1Y57 A; 2X3X D; 1JQQ A; 4ZNX A; 2BZY A; 2MIO A; 3C0C A; 2L0A A; 4OMM A; 1HJD A; 1UUE A; 2W0Z A; 2JS2 A; 3M0P A; 1GFD A; 4K11 A; 1YCS B; 1AZG B; 1PKT A; 4CC7 A; 5L23 A; 1SEM A; 1W1F A; 2CSQ A; 1YNZ A; 3O5Z A; 3UF4 A; 4Z88 A; 1EFN A; 4CC4 B; 4RTV A; 3SEM A; 1MUZ A; 4RTU A; 2HSP A; 2LQW A; 1HD3 A; 3NMZ C; 2BTT A; 2NUZ A; 4AFQ C; 2J06 A; 2DM1 A; 2LJ0 A; 2BZ8 A; 2DX1 A; 2KBT A; 4JZ3 A; 3TSW A; 2DMO A; 2GBQ A; 2OJ2 A; 4OML A; 2KEA A; 1WYX A; 2JM8 A; 1NYF A; 2FO0 A; 2JMC A; 2PNI A; 3M0S A; 2O88 A; 1X2K A; 1I07 A; 3R6N A; 3VS6 A; 1UHC A; 3EGU A; 4JPB W; 1G2B A; 2LZ6 B; 1K76 A; 2E5K A; 1J3T A; 1M3B A; 2I0N A; 1PRM C; 1MV3 A; 2KR3 A; 2CH4 A; 1GRI A; 1A0N B; 2ROT A; 2O31 A; 3QWX X; 5IXF A; 2LJ1 A; 4DEX A; 2K6D A; 4A63 B; 1M8M A; 4QT7 A; 2RQV A; 1PKS A; 3RNJ A; 1S1N A; 2K2M A; 2CDT A; 1CKA A; 2D1X A; 1AWJ A; 2CH4 W; 1JXO A; 1WXB A; 2RN8 A; 1JU5 C; 1OV3 A; 3QWY A; 1SPK A; 2CT4 A; 3ULR B; 3M0Q A; 2RF0 A; 2ENM A; 4HXJ A; 3KFV A; 3THK A; 1ZBJ A; 2KYM A; 1RUW A; 4LNP A; 3TSZ A; 3H0F A; 5IHK A; 1YWO A; 1GL5 A; 1KIK A; 1WIE A; 2J6K A; 1X69 A; 1V1C A; 2EYW A; 3NHN A; 1PHT A; 1UFF A; 1QLY A; 2DA9 A; 2ED1 A; 1TUC A; 5IHN A; 3REA B; 2DJQ A; 1I1J A; 1B3Q A; 1RLQ C; 2FPD A; 3M0T A; 2MOX A; 4J9G A; 4J9D A; 1KSW A; 2M51 A; 2BZX A; 1AZE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4M78 E; 5GAN 7; 4KUI A; 1E7O A; 3U23 A; 2DYB A; 2DJZ A; 4P5N A; 4CRI A; 1FMV A; 3HRU A; 1MV0 B; 5FU7 C; 3A8G B; 5A0L A; 2EQJ A; 1NEG A; 3S3O A; 2KVQ G; 1NLO C; 2GCX A; 4QKU A; 1KC8 U; 1QVF A; 1QCO A; 1LJO A; 1D09 B; 4AFZ C; 1YIT A; 4CC2 A; 1M1F A; 4FCY A; 3AHU A; 1Q81 U; 5CKB A; 1VUB A; 3EFR A; 1YN8 A; 2LQK A; 4CC3 A; 4EMG A; 3S3N A; 1K1Z A; 3CCJ T; 3RIR A; 1G3T A; 1BCM A; 2ZPB B; 2HBW A; 1BCO A; 1FMW A; 2HKQ B; 3CBM A; 3REB B; 3IQL A; 2ZAE A; 5FRO A; 1RL2 A; 1U5S A; 1F1B B; 3V7S A; 3OA6 A; 3JCM W; 4HVU A; 3QUI A; 4NL3 A; 2EYQ A; 3CPW P; 3QDR B; 4TVR A; 2AZV A; 1CKB A; 4KH1 B; 4F04 B; 1WX6 A; 2E65 A; 5C0M A; 2AK5 A; 1WHM A; 2RPN A; 1W2B A; 2PUO B; 2DBK A; 4FU6 A; 1QCN A; 2RHZ A; 2B86 A; 2DL4 A; 3G6E T; 2CS7 A; 4M7A F; 5GAO r; 1W6X A; 2YXY A; 1B34 B; 2DPP B; 1E6G A; 2YLB A; 2KYB A; 3CD6 T; 1Y0M A; 2KNB B; 4E7Z A; 4KUD K; 3PIO A; 3OYC A; 5KYY A; 4PJO F; 2YUN A; 1WJQ A; 3P8B B; 4C8Q E; 2MMP A; 2JVV A; 5GMK h; 4C5H A; 4JJN K; 1ZX6 A; 3M9Q A; 2HQE A; 4OGC A; 2YUP A; 1WQW A; 4N0A C; 1GXI E; 4X9C A; 4NL2 A; 3OW2 S; 2LT1 A; 1WDX A; 2QA4 T; 2A36 A; 2CUD A; 2M1H A; 1WZO A; 3G71 A; 4JJB A; 2HL5 C; 2XDD A; 1H3H A; 1RLP C; 3MCA B; 2L2P A; 2EPD A; 5KYU A; 2JT4 A; 5IN1 A; 4EMH A; 4M75 C; 3WXM B; 1YWP A; 3QZ5 B; 3BW1 A; 2JMA A; 1SRL A; 3VUZ A; 1NJI C; 2C0T A; 2CGH A; 2RHX A; 1PNJ A; 1OX8 A; 4M77 B; 2CUB A; 5D7U A; 3GLX A; 1QVG P; 5IAY A; 2OTJ A; 1EIF A; 2DRK A; 1Y96 A; 4GBQ A; 4AMC A; 5GAN 6; 4BB7 A; 3VS1 A; 4GLM A; 2D8J A; 2O9S A; 1O75 A; 2EKO A; 5IHI A; 5HY6 A; 3UAT A; 1MMA A; 1AEY A; 1UJY A; 1VQ4 Q; 2KAF A; 2DF6 A; 1ZUK A; 2COW A; 3SFM A; 4F7U G; 1ZSG A; 2LNV A; 2RQR A; 4N4G A; 3JB9 F; 1UHF A; 2XKO C; 2GGR A; 2R5M A; 1VQ7 Q; 5FU6 C; 3J80 E; 2XDP A; 2YDL A; 3I35 A; 2DIL A; 2L3R A; 1R0C B; 4Z8A A; 1DJ7 B; 2JTF A; 3CCQ T; 1AHJ B; 3MPU B; 3RES A; 3QII A; 4BY6 B; 1HSQ A; 1TH7 A; 5DM7 R; 2K79 A; 1OOT A; 4FIB A; 3GP8 A; 2R58 A; 4GY5 A; 3UPU A; 1BYM A; 1D3B B; 4PLL A; 1SHF A; 1GBQ A; 1X27 A; 3OBY A; 1ARK A; 2QAZ A; 3QG1 A; 4IUV A; 3PNW C; 1V76 A; 4ZGD B; 2M0Y A; 2EQI A; 2M0O A; 3VS3 A; 1QVG S; 5FWC A; 3HHT B; 3CME T; 1VQK Q; 4OMP A; 4AFS C; 4J9H A; 3JCM P; 1PCX A; 5CO7 A; 1Q95 G; 3A98 A; 1AWX A; 3OBW A; 4PJO D; 5CKF A; 1K8A C; 2QQA A; 5FRN A; 2K2V A; 2RHY A; 5LJ5 j; 2XG8 D; 4DEY A; 5GAM j; 2EQU A; 1VQP T; 4E7K A; 1IGQ A; 4LE9 A; 5LJ3 d; 3SDZ A; 4L5G A; 1E6H A; 2EGC A; 3M5A A; 1GFC A; 1MHN A; 4RUG A; 2SEM A; 4ZTF A; 2MI6 A; 3PTA A; 1VQN Q; 1X6O A; 3LW5 E; 5DLQ E; 2PUK B; 2A28 A; 2ATC B; 4BE0 A; 2EGE A; 5A0D A; 2X3W D; 5LL6 S; 2YSQ A; 3E9F A; 3FRN A; 2COZ A; 4M77 D; 4Z89 A; 5KYX B; 4DBH A; 1NYG A; 1O9S A; 2RQW A; 1NM7 A; 4A4F A; 2K3Y A; 1NEB A; 1VQ5 A; 1Q7Y R; 1X6G A; 1YJN T; 2FRW A; 2FPF A; 1M2V A; 2VVK A; 2KXD A; 1N8R U; 4RG8 A; 1M90 C; 1K0X A; 2FVU A; 3NGP A; 3QXE B; 4PJL A; 3CCV A; 1GCQ A; 3I9Q A; 2EAY A; 2DTI A; 3LX7 A; 1M3A A; 4RTY A; 1QQJ A; 9ATC B; 1Y07 A; 3QZ9 B; 4FT2 A; 1K0S A; 1MND A; 2JNG A; 4IIM A; 3MKD A; 5D6X A; 1R77 A; 5CCA A; 3C0C A; 1HJD A; 1UUE A; 2W0Z A; 3NTH A; 4K11 A; 3G4S A; 3JCM Q; 1PKT A; 2LQ8 A; 1TSF A; 4FW1 A; 2L5Q A; 1EFN A; 3CCS Q; 3SEM A; 2HMA A; 1YHQ Q; 2BTT A; 2CZ6 B; 3OS0 A; 2DM1 A; 2LJ0 A; 2RHU A; 4FYV B; 3FIF A; 3QBY A; 3J81 E; 2C06 A; 1K8A R; 3E2U A; 1ZSZ A; 2DEU A; 1NYF A; 1BIA A; 1YJ9 A; 4A4K A; 1MMG A; 1X2K A; 1YJW T; 3JB9 J; 1WGS A; 4II1 A; 1G2B A; 2K4Y A; 3OYF A; 3G6E Q; 2E5K A; 2RM4 A; 2E3H A; 2G3R A; 4BI8 B; 3P8D A; 4QQD A; 1J3T A; 2I0N A; 2X4Y A; 3DKM A; 3OYB A; 5LJ5 f; 3JCM d; 1A0N B; 5GAM f; 2V26 A; 2O31 A; 2ZGW A; 1HYO A; 2KY9 A; 5IXF A; 4M77 A; 4XTZ A; 4A63 B; 1M8M A; 2XID A; 3LYI A; 4M7A G; 1S1N A; 3C94 A; 1KHC A; 2CH4 W; 2YRD A; 5GAO l; 2V8J A; 1IB8 A; 3QSU A; 2YRC A; 2QTX A; 3Q1J A; 3RMQ A; 3C12 A; 2KYM A; 2O4X B; 3UDC A; 4PJO G; 5GAN 2; 5DY9 A; 4LNP A; 2GQV A; 3E1S A; 3SWN C; 1N9R A; 1SSF A; 1Q86 R; 3H6Z A; 4KUL A; 5IT9 E; 1WIE A; 3CCU A; 1M9S A; 2D6F A; 1X69 A; 3JCM X; 4LD6 A; 3TEE A; 3G1J A; 2XHC A; 4M75 F; 4M77 E; 2EQK A; 3REA B; 2GFU A; 1I1J A; 1KD1 R; 2EWN A; 3OYH A; 1P92 A; 2MOX A; 1SKU B; 3VJP A; 2M51 A; 2KK4 A; 4Y92 A; 4ATO A; 1IHV A; 2QQ9 A; 4RTT A; 1KC8 C; 2X4W A; 5KYW B; 2QGG A; 3M55 A; 1KJW A; 2M16 A; 4XTW A; 4RMO A; 1VQ4 T; 4BUG A; 2LMJ A; 1M90 U; 1ZBX A; 2FZG B; 2NWM A; 2L3S A; 1Q81 C; 2F69 A; 2CSI A; 3GOX A; 1B07 A; 1D3B A; 1VA7 A; 2DVJ A; 1TU0 B; 3OYL A; 1VQ7 T; 2RI2 A; 1TWB A; 5GJW B; 5GAO q; 1KQS P; 3GNG A; 3JAM E; 2VKN A; 1G5V A; 5FU6 B; 3OYA A; 2AKL A; 3M0R A; 4C92 A; 4D6W A; 4PL6 A; 1U1T A; 1I5O B; 4E2F B; 3JB9 G; 1VQ6 A; 1VQM Q; 3VS4 A; 4FYX B; 4ZN1 A; 3FB9 A; 1D1A A; 3L2W A; 1YIJ Q; 3JCM V; 3QJ6 A; 2X4X A; 2V1Q A; 1M4Z A; 4JJD A; 1WXU A; 4RTZ A; 3INZ A; 1Q82 U; 4LUD A; 2F2W A; 2ZPG B; 2XMF A; 1IRE B; 1CSK A; 2AHJ B; 3JCM b; 3X28 B; 3BFM A; 4J7I A; 1UJ0 A; 3RBB B; 2KT1 A; 1UGR B; 3TU4 K; 4ZGJ B; 4C92 E; 3M0U A; 1VQK T; 4C0F A; 2NYS A; 2QTV A; 3VS7 A; 5CQY A; 3EGX A; 1AWO A; 5KYX A; 2BKD N; 2YUO A; 2QEX Q; 1I5L A; 1H92 A; 2HDA A; 3CC4 Q; 3GF5 A; 4PFO A; 4AG2 C; 1VQO A; 3CCL A; 2RQU A; 4XU2 A; 3TVT A; 1RAB B; 3GBQ A; 1PD0 A; 1VQP Q; 4DBR A; 2P0K A; 2YHT A; 2OTL A; 4M7D C; 2KRO A; 1M5Q 1; 1VQN T; 1JXM A; 2QQR A; 4IUT A; 1KQS S; 4BI3 A; 1PSF A; 2DXC A; 3MP6 A; 4QVZ A; 5M9O A; 4ZGE B; 3X25 B; 1KC8 R; 5LJ5 g; 2JUF A; 5GAM g; 3KXT A; 2VYT A; 3VYH B; 3OW2 A; 1NPP A; 4L6V 5; 3CMA A; 1ZLM A; 2BUD A; 1XNI A; 3EH1 A; 8ATC B; 4M75 D; 3FJ5 A; 4ESR A; 4FYW B; 4JRP A; 1D1C A; 1BK2 A; 4E7I A; 1ABQ A; 1M2O A; 1LPL A; 1VQ8 T; 4J6X A; 2KQW A; 2JM9 A; 3SHW A; 2K5L A; 1YJN Q; 1RI0 A; 1C0M A; 1NLP C; 4D8K A; 4MMK A; 3VS2 A; 3HFN A; 3CC2 A; 2HEQ A; 1K9A A; 5A2Q E; 1V29 B; 4JDS A; 3CCM A; 1IHW A; 3H8Z A; 1AVZ C; 1M8V A; 3DLM A; 2E6N A; 3I55 A; 2P4R A; 3L2U A; 4JZ4 A; 1IRX A; 4X9D A; 2DNU A; 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