The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
|
sequence length |
69
|
structure length |
69
|
Chain Sequence |
GSSGSSGGEEYIALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTGSIGDRSGIFPSNYVKPKDSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution Structure of the third SH3 domain of human intersectin 2(KIAA1256)
rcsb |
| molecule keywords |
INTERSECTIN 2
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
9
|
| structure length |
69
|
| sequence length |
69
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-07-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5IHN A; 2XMF A; 2GTO A; 3IQL A; 4AG1 C; 1X6B A; 2BZY A; 2E5K A; 1UHF A; 2DM1 A; 2VVK A; 2EBP A; 2CDT A; 2P4R A; 5IXB A; 3KFV A; 4A63 B; 1XOV A; 2EGC A; 2RQU A; 3THK A; 3EGU A; 1GCP A; 1GCQ A; 3I5S A; 1S1N A; 2D8H A; 1M3C A; 3QWY A; 4Z88 A; 2JMA A; 2LNH B; 4IIO A; 1UDL A; 4J9B A; 3VS6 A; 3H0H A; 1MV3 A; 2LZ6 B; 1I1J A; 2ROT A; 1BK2 A; 1AWJ A; 1TUD A; 1X43 A; 2GBQ A; 4KRT A; 2FRY A; 2O88 A; 2CH4 A; 2BTT A; 1SHG A; 2J7I A; 2M51 A; 2KRO A; 2GNC A; 1VA7 A; 2JS2 A; 2DA9 A; 4HVU A; 2F2V A; 2CUB A; 2DL8 A; 2FEI A; 1AVZ C; 1WI7 A; 2ABL A; 1M30 A; 2SRC A; 1PRL C; 1Z9Z A; 1W6X A; 3H41 A; 3U23 A; 1YCS B; 3FJ5 A; 3EHR A; 4RTU A; 2GQI A; 1NG2 A; 1WXU A; 1X2K A; 1FMK A; 2LJ1 A; 1E6H A; 2KEA A; 2DE0 X; 5IHK A; 4JJC A; 1UG1 A; 3SEM A; 2EQI A; 1NEG A; 1MUZ A; 1UE9 A; 4F17 A; 1HSQ A; 1OOT A; 2J6K A; 1SRM A; 1BBZ A; 2PNI A; 1X6G A; 5IXF A; 2LQN A; 3I9Q A; 4HXJ A; 1CKB A; 4OMQ A; 3REB B; 1I0C A; 1PWT A; 1NM7 A; 2EGE A; 1QLY A; 4FSS A; 2DL5 A; 2O2O A; 2I0N A; 2CSI A; 2RQV A; 4J9G A; 4J9H A; 2K3B A; 3M0R A; 3M0Q A; 1FYN A; 2V1Q A; 4X1V A; 4RTX A; 3UA7 A; 4D8K A; 1I07 A; 4LE9 A; 3VS1 A; 2B86 A; 2KYB A; 3TSW A; 1Z9Q A; 1UJ0 A; 1WXT A; 3NPF A; 5FWB A; 1NEB A; 1SSH A; 2RF0 A; 1QCF A; 2KXD A; 1LCK A; 2CRE A; 4GBQ A; 4ORZ A; 4OMM A; 4ZNX A; 1K0S A; 2FPD A; 2ROL A; 2KGT A; 1UJY A; 2J6F A; 3CQT A; 2DRK A; 2EKH A; 2JM8 A; 2JXB A; 2O9V A; 4J9I A; 3M0P A; 2BZX A; 2JM9 A; 1VYU A; 1PHT A; 2QDL A; 4RTV A; 1GBQ A; 1X27 A; 4D8D A; 4JPB W; 5GJV B; 1U3O A; 5FW9 A; 4M4Z A; 2M0Y A; 2RQT A; 4DEY A; 2DMO A; 2FO0 A; 2LQW A; 1ZSG A; 2O9S A; 2J06 A; 1UHC A; 1WIE A; 1ZX6 A; 2PZ1 A; 1YP5 A; 4QT7 A; 1J3T A; 1ABO A; 1NLP C; 4AFU C; 2CT3 A; 3SHW A; 1EFN A; 1SHF A; 1JXM A; 2NUZ A; 1N5Z A; 2RQW A; 2K9G A; 1AEY A; 3ZL7 C; 3EG3 A; 2ED0 A; 4RTY A; 1M3B A; 2A08 A; 1Y0M A; 1KSW A; 5GJW B; 2A28 A; 5L23 A; 2SEM A; 1T3L A; 2CT4 A; 2CSQ A; 2NWM A; 2OI3 A; 1WFW A; 1UTI A; 1NYG A; 1PKS A; 1RLQ C; 2W0Z A; 3VS5 A; 2KYM A; 1T0J A; 2D0N A; 2ECZ A; 1K9A A; 1BU1 A; 2O31 A; 1SEM A; 1PRM C; 2FG0 A; 4LUE A; 1M27 C; 1TG0 A; 1T0H A; 2KRS A; 1BB9 A; 4J9F A; 2GTJ A; 1JQQ A; 1YN8 A; 4RTT A; 4JZ3 A; 1G83 A; 3VRZ A; 2KE9 A; 1PKT A; 1E7O A; 1KFZ A; 1B3Q A; 2HSP A; 1RUW A; 4GLM A; 3GBQ A; 1M3A A; 2EPD A; 2A37 A; 4WCI A; 2YUN A; 1CSK A; 2J05 A; 1NLO C; 4LUD A; 2BZ8 A; 3PVL A; 1GRI A; 1AWX A; 1HJD A; 1AWW A; 3NGP A; 2K6D A; 2A36 A; 2J6O A; 2PTK A; 2GGR A; 2X3W D; 2C0O A; 2EYX A; 1ZUK A; 1W1F A; 4J9E A; 1JO8 A; 5FWC A; 1QKW A; 1WXB A; 3M0T A; 2C0I A; 2F2X A; 3NMZ C; 2D1X A; 2HCK A; 4AFS C; 2K79 A; 3A98 A; 2D8J A; 2ED1 A; 2DX1 A; 2JS0 A; 2RMO A; 3EHQ A; 3REA B; 2EW3 A; 3LH5 A; 1MV0 B; 1SRL A; 3VRY A; 2KT1 A; 1AWO A; 2LJ3 A; 1WDX A; 4IIM A; 3C0C A; 4HCK A; 2DJQ A; 1X2Q A; 1U06 A; 2FPE A; 2LMJ A; 4CC2 A; 3VS0 A; 2JTE A; 2LJ0 A; 1ARK A; 2AZV A; 2KRM A; 2CH4 W; 2VKN A; 2MIO A; 4CC7 A; 2AKK A; 2DLP A; 2JW4 A; 4RTZ A; 2W10 A; 2EVR A; 3EG1 A; 3UA6 A; 3EG2 A; 4AFZ C; 5I22 A; 2KBT A; 4Z8A A; 1WA7 A; 2YUP A; 2KT8 A; 4CC3 A; 4OMP A; 1UUE A; 2EGA A; 1QWE A; 1E6G A; 1H3H A; 1W70 A; 2F2W A; 2L3Q A; 1GBR A; 4OMN A; 2DF6 A; 1GL5 A; 2AK5 A; 3O5Z A; 2K7A A; 1T3S A; 1ZUY A; 2AZS A; 4OMO A; 1TUC A; 2YUQ A; 1KIK A; 1WYX A; 4J9C A; 3QWX X; 1AZE A; 1QKX A; 2RPN A; 2C0T A; 2H8H A; 2RNA A; 2YDL A; 5IH2 A; 3UF4 A; 2V1R A; 1JU5 C; 3H0I A; 2DIL A; 4K11 A; 2RN8 A; 3VS4 A; 2DNU A; 1GCQ C; 1RI9 A; 2L2P A; 3EG0 A; 1AZG B; 1H92 A; 1QWF A; 1YWP A; 4RTW A; 2AKL A; 2DL7 A; 4JJD A; 4E6R A; 2ENM A; 3ULR B; 5HCK A; 1GFC A; 1H8K A; 3VS7 A; 2EYZ A; 2DL4 A; 2VWF A; 2DL3 A; 2EYW A; 2IIM A; 5I11 A; 1X69 A; 2OAW A; 3NHN A; 3PE0 A; 2YT6 A; 3TVT A; 1IO6 A; 1Y57 A; 3UAT A; 3M0U A; 4ESR A; 1HD3 A; 2DBK A; 1WX6 A; 2YSQ A; 3I5R A; 5EC7 A; 2EYY A; 1OV3 A; 2ESW A; 2MOX A; 2HEQ A; 2DVJ A; 1ZBJ A; 1U5S A; 1WLP B; 1G2B A; 1PNJ A; 3M0S A; 2KNB B; 2KR3 A; 2KRN A; 4JJB A; 2L0A A; 1VYV A; 4J9D A; 2X3X D; 1K4U S; 4CC4 B; 1GFD A; 1YNZ A; 1NYF A; 2CUD A; 2HBW A; 2LX7 A; 2FPF A; 2K2M A; 2FRW A; 4HVV A; 3I35 A; 1M8M A; 1AOJ A; 2JT4 A; 4R0K A; 3VS3 A; 4AG2 C; 2MCN A; 1RLP C; 1SPK A; 1KJW A; 1K0X A; 2G6F X; 1VYT A; 3PVQ A; 3R6N A; 4Z89 A; 4HVW A; 1UEC A; 2JMC A; 1UGV A; 2HDA A; 4EIK A; 2YUO A; 1JEG A; 5ECA A; 1A0N B; 4LNP A; 1ABQ A; 4F16 A; 3JV3 A; 4RUG A; 5IHI A; 4AFQ C; 1K76 A; 1OEB A; 2RQR A; 3H0F A; 4OML A; 1ZUU A; 4LN2 A; 3RBB B; 1JXO A; 2L3S A; 3TSZ A; 1V1C A; 2LCS A; 1CKA A; 3RNJ A; 1AD5 A; 2DRM A; 1K1Z A; 2L3P A; 4JZ4 A; 2KXC A; 1OPL A; 1B07 A; 4Y92 A; 4F14 A; 1YWO A; 2DYB A; 2LP5 A; 2DBM A; 2OJ2 A; 3VS2 A; 1OPK A; 4DEX A; 1ZLM A; 1UFF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5DY9 A; 5IHN A; 2XMF A; 4JUV A; 3AHU A; 4OF1 A; 1VUB A; 3MET A; 1UHF A; 5I21 A; 2QQA A; 2JZ2 A; 4E7I A; 3QZ5 B; 3G6E A; 2ZZD A; 2BUD A; 3THK A; 3CCL Q; 5D7U A; 3OYD A; 5GAN 2; 2ZPI B; 4JS4 A; 2JMA A; 3CC4 A; 2LNH B; 2MWO A; 3JCM f; 4J9B A; 4XTX A; 3H9N A; 1B7T A; 3H0H A; 5L8R E; 3CCJ T; 2XU8 A; 2E3I A; 1I1J A; 2E64 A; 1AWJ A; 3L2Q A; 4BI4 A; 3G71 A; 3JB9 I; 3F70 A; 1NPP A; 2O88 A; 3OYK A; 2DA9 A; 4JRK A; 3VU3 C; 2CUB A; 1M8V A; 2DL8 A; 1WI7 A; 1B34 B; 2K5L A; 4PFZ A; 2VYT A; 3CC2 A; 2NLU A; 1M30 A; 1QP2 A; 5LJ3 h; 1PRL C; 4LD9 K; 4HT9 A; 1Z9Z A; 3SWN B; 3QHS A; 3OYL A; 4M7A D; 2AT1 B; 2FHD A; 3CMA Q; 1K8A U; 4DBF A; 3CPW A; 3G6E T; 3MEV A; 2XD0 A; 3OYB A; 1FMK A; 1VQ4 Q; 2KEA A; 1LNX A; 1M1F A; 3CC4 T; 4FT4 A; 5HK3 A; 2EQI A; 4C5H A; 1MUZ A; 5A0G A; 1HSQ A; 3G71 T; 2PNI A; 1VQ6 Q; 1UGQ B; 5LJ5 h; 1IZ6 A; 5KE2 A; 1PWT A; 1UEB A; 2CSI A; 1GXI E; 4J9H A; 5IAY A; 2YRC A; 3CC2 T; 3EFR A; 1C6V X; 1MGQ A; 5GAN f; 2EQJ A; 1FYN A; 5KYX B; 3UA7 A; 4M77 A; 4LE9 A; 4LDU A; 5A0D A; 3CCM A; 2B86 A; 2KYB A; 3S3M A; 4ZGD B; 1UJ0 A; 3ZBD A; 3NPF A; 5FWB A; 3CBO A; 1W2B P; 2KVQ G; 2AHJ B; 1WGS A; 4M78 E; 3OYH A; 2A3L A; 3ME9 A; 1ZHI A; 2RHY A; 3OS2 A; 2K2V A; 1WJR A; 2K4Y A; 2JM8 A; 1AT1 B; 1U1S A; 1WHM A; 2LQ8 A; 2JM9 A; 5GAN j; 1LVK A; 3JCM g; 3QG1 A; 3ASK A; 4RTV A; 5D6Y A; 2EJF A; 1GBQ A; 5KE3 A; 4J6Y A; 2K3Y A; 5FW9 A; 4M75 A; 3GPL A; 4XTU A; 3LYI A; 3QYG B; 2CZ7 B; 1WPY A; 3NTK A; 1VQO A; 1Q81 R; 2HKN A; 5FU6 C; 3NTH A; 4QQD A; 5EG2 A; 5KYY B; 1QCO A; 3CCM T; 3M54 A; 3C12 A; 1SHF A; 4A4E A; 4PJO C; 3OW2 P; 3OS0 A; 4FW2 A; 2K9G A; 1P92 A; 2EWN A; 1U8R A; 2X4W A; 3MJX A; 1QVP A; 1M3B A; 3CD6 A; 1S72 A; 3HSB A; 1KSW A; 1T3L A; 1M2V B; 2NWM A; 2OI3 A; 1JJ2 P; 1NYG A; 2KK4 A; 2ZPH B; 3JB9 J; 2C06 A; 2D0N A; 2E10 A; 4J8O A; 4BD3 A; 4N4G A; 1VQ8 A; 3X25 B; 4EMK A; 3QUI A; 2FG0 A; 4KUL A; 2PVO B; 2L89 A; 2KRS A; 4OVA A; 4J9F A; 3FEO A; 5GAN g; 1Q7Y R; 4FT2 A; 5CVI A; 5FU7 C; 2FZG B; 2E65 A; 3CD6 T; 1YIJ T; 5GAM h; 1S72 T; 1KD1 R; 2EPD A; 2A37 A; 2YUN A; 4WF2 A; 1N27 A; 1NLO C; 1UGP B; 3RER A; 1GRI A; 1BIA A; 2QAZ A; 1HJD A; 1VQM Q; 3VUB A; 2K6D A; 4LDV A; 2PTK A; 3A8O B; 3QDF A; 1I5L A; 1ZUK A; 4J9E A; 2ZPB B; 1JO8 A; 2VAS A; 3PT9 A; 5GMK m; 1VQ8 T; 2GCX A; 3M0T A; 1VQ9 A; 2VGM A; 2D1X A; 2K79 A; 2P0Q A; 2X51 A; 2D8J A; 2JS0 A; 4ZTJ A; 2X4J A; 1KQ2 A; 1KQS P; 4DBQ A; 3NFC A; 3CCS A; 3CCR A; 2ZPF B; 4OGE A; 2WSF E; 4IIM A; 2DJQ A; 1U06 A; 2FPE A; 3PTA A; 4OP0 A; 3BY7 A; 5GAN 6; 4M7D E; 2JOY A; 4KBM B; 2AZV A; 2KRM A; 2BIV A; 4V2S A; 5A0L A; 4PJM A; 3SD4 A; 3A8G B; 4ELY C; 2HQH A; 1VQ7 A; 2A0F B; 4C5G A; 2JW4 A; 3V8L A; 2MWP A; 4FCY A; 4RTZ A; 2W10 A; 3EG2 A; 3CBP A; 4N4H A; 5I22 A; 2LT1 A; 4YTL A; 1V29 B; 1VQ9 T; 4M78 G; 2EGA A; 1E6G A; 4TVR A; 1W70 A; 2F2W A; 1QVG A; 4F7U B; 3OYY A; 2K7A A; 1T3S A; 3HHT B; 4OMO A; 4HCC A; 2PUO B; 2DPP B; 4J5Y A; 2RNA A; 3CCS T; 4XU1 A; 1PD1 A; 3MHX A; 4M78 F; 1WJQ A; 2V1R A; 3H0I A; 4FW1 A; 3VS4 A; 5FU6 B; 3P8H A; 3WVD B; 3M4Y A; 5KYU A; 1H92 A; 3J80 E; 1YWP A; 3ULR B; 5CO7 A; 4PJO B; 1H8K A; 2HAX A; 4ZN1 A; 1QCN A; 2DL3 A; 4KGV B; 3CCE Q; 1VQP Q; 2VV5 A; 4XU3 A; 1Y57 A; 2CS7 A; 4ESR A; 2DBK A; 3QPH A; 1FX7 A; 3I5R A; 5KYW A; 4JLG A; 1OV3 A; 2HEQ A; 3CCL A; 1PSF A; 1G2B A; 5FRM A; 2DVE A; 3MEW A; 1D1B A; 1XQH A; 4EPC A; 2CP7 A; 2EQU A; 4ZGJ B; 5IN1 A; 2QA4 Q; 1K4U S; 3H6Z A; 1GFD A; 2RM4 A; 2RHU A; 4HKE A; 1NYF A; 2CUD A; 5AT1 B; 2LX7 A; 3WXM B; 2FPF A; 2F5K A; 1IRE B; 1W2B S; 4DOV A; 1Q82 R; 2NUT A; 3C95 A; 4QW2 A; 2JT4 A; 4R56 A; 1Q81 U; 3VS3 A; 3MP8 A; 2OAU A; 4Y91 A; 1KJW A; 2DXT A; 2KMT A; 5GAO r; 1H3Z A; 4PJO F; 3CMA A; 2JMC A; 3A8M B; 3EGD B; 3CCL T; 4EIK A; 4M78 D; 3L2V A; 1VQ4 A; 2X35 A; 3V8J A; 1A0N B; 9ATC B; 1Y7X A; 4F16 A; 3VYG A; 3EAE A; 2DD4 A; 3A5Z B; 5IHI A; 4AFQ C; 1K8A C; 4OML A; 1ZUU A; 3JB9 F; 2QDY B; 2DO3 A; 3RBB B; 1JXO A; 1V1C A; 3RIR A; 3CXC A; 1VQ6 A; 3RNJ A; 2LCL A; 3PNW C; 1AD5 A; 2DRM A; 3EH2 A; 3KUF A; 4JZ4 A; 2KXC A; 2V8J A; 1YWO A; 2LP5 A; 1BCO A; 2F69 A; 1K73 C; 2KDS A; 5HKC A; 3QSU A; 2RI2 A; 3M55 A; 1JJ2 S; 1ZLM A; 2P4R A; 3GOX A; 2GTO A; 3EG9 B; 1Q95 G; 1X6B A; 4C0F A; 1QVF A; 3X28 B; 2E5K A; 3JCM b; 3CMA T; 1M1K R; 3VV0 A; 1YCY A; 2CDT A; 1K9M R; 4M7D G; 4BY6 B; 2DK3 A; 2FZK B; 4XTV A; 4A63 B; 1VQ4 T; 1XOV A; 2EGC A; 5CQX A; 4E7K A; 1GCQ A; 4B9W A; 1M3C A; 4Z88 A; 1B34 A; 3VS6 A; 3JCM d; 1MV3 A; 3H8Z A; 3OY9 A; 3BE3 A; 1VQ6 T; 4VUB A; 2K5I A; 2ROT A; 1TUD A; 1R77 A; 4E7Z A; 2GBQ A; 3SWN A; 2QQB A; 2FRY A; 4M7A B; 2BTT A; 2M51 A; 1VA7 A; 5GAO q; 1C0M A; 1G3S A; 4X9D A; 2MF2 A; 2E4H A; 4XU2 A; 1RAF B; 3QYH B; 5A2Q E; 3LLR A; 1PCX A; 4L5G A; 3H41 A; 3U23 A; 5CCA A; 1ZA1 B; 3L2U A; 4RTU A; 3QBY A; 1NG2 A; 5GAO m; 1WXU A; 1X2K A; 5LJ3 e; 2LJ1 A; 1E6H A; 1Y71 A; 2DE0 X; 3PMT A; 1YJW Q; 2YRV A; 1UG1 A; 1UE9 A; 1QW1 A; 1KQS S; 4F17 A; 2IVW A; 4ANJ A; 3HRS A; 5KYX A; 3CPW P; 1SRM A; 1N8R R; 1M90 U; 1X6G A; 2LQN A; 3I9Q A; 3VUZ A; 4OMQ A; 5CKE A; 2HKQ B; 3REB B; 2KY9 A; 4JDS A; 4XTW A; 1QLY A; 4FM4 B; 1VQ5 Q; 2DL5 A; 2I0N A; 4MMK A; 2RQV A; 4J9G A; 5LJ5 e; 3PFS A; 3LGF A; 4OB3 B; 5GAN d; 4RTX A; 4J6X A; 4PL6 A; 3VS1 A; 1LOJ A; 1Z9Q A; 2JUF A; 1WXT A; 1RAE B; 1SSH A; 5KCH A; 5GAN 7; 4M7D D; 1QCF A; 1RAC B; 2CP3 A; 4GBQ A; 3JCM J; 4ORZ A; 4ZNX A; 2DEU A; 2DTO A; 1KC8 R; 5GAO n; 1VQM A; 1UJY A; 4C8Q E; 2O4X B; 3CQT A; 2EKH A; 2O9V A; 3M0P A; 2BZX A; 3OMG A; 4BI8 B; 2DXU A; 1QP3 A; 5KYY A; 2VB6 A; 4JPB W; 2KI7 A; 5GJV B; 2RQT A; 2HQX A; 2DMO A; 2LNV A; 1OU9 A; 2DXC A; 1VIF A; 3RR6 A; 1ZQ1 A; 3LX7 A; 2O9S A; 2DZC A; 2R58 A; 1SG5 A; 5GAN 4; 1HK9 A; 2PZ1 A; 1M2V A; 1XJW B; 4QT7 A; 1ABO A; 1NLP C; 3I56 Q; 2RH2 A; 4C92 E; 2K5F A; 1JXM A; 2NUZ A; 2DET A; 2RQW A; 2IG0 A; 1AHJ B; 1TXQ A; 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