The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
KELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKTEVNGRQGFVPAAYVKKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solvation in Protein Folding Analysis: Combination of Theoretical and Experimental Approaches
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN
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| molecule tags |
Sh3-domain
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| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
11
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-12-18 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1OPL A; 2LJ3 A; 1M3A A; 3M0S A; 1ZUY A; 3VRZ A; 3KFV A; 5ECA A; 2SEM A; 1YWO A; 2W0Z A; 2DRM A; 3EGU A; 3EG1 A; 4OMP A; 3M0Q A; 2JS2 A; 2M0Y A; 2FPF A; 2JMA A; 2EGA A; 1Y57 A; 2OJ2 A; 4IIM A; 4JZ3 A; 2DVJ A; 5L23 A; 1UHF A; 2GNC A; 3M0T A; 4CC2 A; 3EG0 A; 1NM7 A; 2RQR A; 1IO6 A; 2CUB A; 1U5S A; 3VS3 A; 1VYV A; 4QT7 A; 1UJ0 A; 1MV0 B; 3TSZ A; 4AFU C; 2V1R A; 3I9Q A; 1SRM A; 4OMN A; 5IH2 A; 3I5S A; 2DM1 A; 1UHC A; 3PE0 A; 1WFW A; 5FWB A; 2YUQ A; 2DRK A; 1BU1 A; 3VS5 A; 1CKB A; 1WXB A; 2KGT A; 2KXC A; 2ESW A; 2HBW A; 1GBR A; 2MIO A; 1GCP A; 2GBQ A; 1GRI A; 4HXJ A; 3U23 A; 1BK2 A; 2MCN A; 2L3S A; 2AZV A; 2VWF A; 4D8D A; 4GBQ A; 1BBZ A; 1BB9 A; 4CC3 A; 1X43 A; 1WXT A; 1SSH A; 4J9F A; 3TSW A; 2J6O A; 5EC7 A; 1SRL A; 2W10 A; 2RQU A; 1M8M A; 1K4U S; 1RUW A; 1WX6 A; 2FO0 A; 2YUP A; 4JJB A; 3R6N A; 2HDA A; 1W6X A; 3UA6 A; 1YWP A; 2EYZ A; 2O31 A; 1B3Q A; 1LCK A; 1X27 A; 1ZX6 A; 4Z89 A; 1UGV A; 1YCS B; 2BTT A; 1AOJ A; 2AKK A; 2HCK A; 2RPN A; 2ABL A; 1SEM A; 2GGR A; 3REA B; 1PRL C; 1PWT A; 2D8H A; 3SHW A; 1X2Q A; 2JM8 A; 1QWF A; 2LP5 A; 3VS4 A; 2RF0 A; 3VRY A; 1T0J A; 1PRM C; 1T3L A; 2G6F X; 1WIE A; 4M4Z A; 2RQT A; 2LQN A; 2DMO A; 4RTW A; 1AD5 A; 4KRT A; 2RN8 A; 1VA7 A; 2LNH B; 1W70 A; 4K11 A; 2KRM A; 3EHQ A; 1CKA A; 1Y0M A; 2K79 A; 4Y92 A; 1V1C A; 1PNJ A; 1AWJ A; 1NEG A; 1FMK A; 2GTJ A; 2DL8 A; 4ORZ A; 4ESR A; 1RI9 A; 3EG3 A; 2LQW A; 1PKT A; 2DLP A; 4D8K A; 1J3T A; 1K0S A; 1UE9 A; 4X1V A; 2LX7 A; 1JU5 C; 2PNI A; 2A28 A; 2O2O A; 4RTT A; 2I0N A; 1TUD A; 4R0K A; 1UFF A; 4OMQ A; 1NLO C; 5HCK A; 1KFZ A; 1E6G A; 1GCQ A; 2EGC A; 4OML A; 2CSQ A; 1XOV A; 2AK5 A; 2A08 A; 2AKL A; 1X6G A; 2KBT A; 4FSS A; 2RMO A; 2LCS A; 4Z8A A; 2CRE A; 1U3O A; 2BZY A; 3VS1 A; 1HD3 A; 4DEY A; 2EYY A; 1WDX A; 1JO8 A; 2A36 A; 1SHG A; 1KJW A; 1RLP C; 3LH5 A; 4OMO A; 2YUO A; 1T0H A; 2KRS A; 4LE9 A; 3VS6 A; 2VVK A; 4LNP A; 1KIK A; 1M3B A; 1E6H A; 2KRO A; 3THK A; 2C0I A; 2SRC A; 3A98 A; 3H0I A; 3UF4 A; 2DF6 A; 2JS0 A; 3PVL A; 1ZLM A; 2J6F A; 2DL5 A; 3H0F A; 2IIM A; 1EFN A; 1UG1 A; 1Z9Q A; 2RNA A; 2KEA A; 2O9S A; 2GQI A; 4AFQ C; 1NEB A; 4HVV A; 2ECZ A; 1QLY A; 2C0O A; 2JM9 A; 5I22 A; 3FJ5 A; 3O5Z A; 2DNU A; 1WI7 A; 4AG2 C; 2YT6 A; 2KYB A; 4IIO A; 2PZ1 A; 2O9V A; 2QDL A; 1QKX A; 1AWX A; 3VS2 A; 2VKN A; 1G83 A; 2E5K A; 3ULR B; 4J9C A; 2O88 A; 4RTV A; 1MV3 A; 1HJD A; 1ABO A; 2DX1 A; 2LMJ A; 2DA9 A; 4DEX A; 2ED1 A; 2FPD A; 2HEQ A; 2K7A A; 2D8J A; 1CSK A; 2MOX A; 4JPB W; 1JEG A; 1GFD A; 3UAT A; 4JJC A; 1GBQ A; 2JXB A; 2F2W A; 3RBB B; 5IXF A; 2J06 A; 1JQQ A; 1PKS A; 1H8K A; 2KR3 A; 4LUE A; 2B86 A; 2DL7 A; 2KT1 A; 2FRY A; 2L0A A; 2ROT A; 1B07 A; 1Z9Z A; 2J6K A; 1YN8 A; 3M0U A; 2LZ6 B; 4F17 A; 1KSW A; 3PVQ A; 4J9I A; 1OV3 A; 2A37 A; 1K76 A; 4CC4 B; 1AWO A; 2EPD A; 2CT4 A; 5IHK A; 2JW4 A; 2C0T A; 2XMF A; 5FW9 A; 1I07 A; 5I11 A; 2DYB A; 2M51 A; 4Z88 A; 1NG2 A; 1VYU A; 1AVZ C; 3ZL7 C; 4ZNX A; 1UTI A; 2LJ1 A; 1S1N A; 1QWE A; 3IQL A; 2X3X D; 2DE0 X; 2LJ0 A; 1K0X A; 2KXD A; 1WXU A; 2X3W D; 1FYN A; 5FWC A; 2EBP A; 3SEM A; 2YSQ A; 1WA7 A; 1X6B A; 1U06 A; 3JV3 A; 2KT8 A; 4HVW A; 2J05 A; 3UA7 A; 3I35 A; 1YP5 A; 4JZ4 A; 2KE9 A; 2EYW A; 1K1Z A; 2DL4 A; 1VYT A; 2PTK A; 4J9D A; 3C0C A; 1I0C A; 2K6D A; 2ENM A; 2FRW A; 1JXM A; 1AZE A; 1UUE A; 2EYX A; 1AEY A; 2CH4 W; 1YNZ A; 1GCQ C; 1QKW A; 2CUD A; 2ED0 A; 1NLP C; 1AZG B; 1QCF A; 3RNJ A; 3H0H A; 4CC7 A; 4RTU A; 3EG2 A; 1H92 A; 1W1F A; 2KNB B; 2YUN A; 1G2B A; 5GJV B; 4RTY A; 1OOT A; 1TG0 A; 2F2X A; 2K9G A; 4AG1 C; 4RTX A; 4HVU A; 2CH4 A; 4J9B A; 3NPF A; 3VS7 A; 1NYG A; 1M3C A; 2D1X A; 2F2V A; 3H41 A; 3REB B; 4OMM A; 4HCK A; 4AFZ C; 1E7O A; 2H8H A; 2AZS A; 1GFC A; 2KYM A; 3NMZ C; 4EIK A; 1UDL A; 2RQW A; 2D0N A; 1SHF A; 4LUD A; 1JXO A; 4J9H A; 1PHT A; 4GLM A; 1NYF A; 3VS0 A; 4AFS C; 1X2K A; 1I1J A; 3M0R A; 1OEB A; 2OI3 A; 3EHR A; 1X69 A; 2JTE A; 2K3B A; 2OAW A; 1M27 C; 2K2M A; 2L2P A; 2V1Q A; 2L3Q A; 1M30 A; 2KRN A; 1ARK A; 3I5R A; 1T3S A; 4E6R A; 1WLP B; 2DL3 A; 3GBQ A; 5IHI A; 1N5Z A; 1RLQ C; 1TUC A; 2CT3 A; 1H3H A; 3QWX X; 4J9G A; 2ROL A; 1ZBJ A; 1WYX A; 2CDT A; 2EKH A; 2L3P A; 4LN2 A; 2DJQ A; 2EW3 A; 2P4R A; 1ZUU A; 5IXB A; 1ABQ A; 2DBK A; 2NUZ A; 4F14 A; 1OPK A; 1AWW A; 4A63 B; 1MUZ A; 4J9E A; 3NGP A; 2GTO A; 5GJW B; 1SPK A; 2FEI A; 4JJD A; 2NWM A; 3TVT A; 4RTZ A; 2BZ8 A; 2DBM A; 2EGE A; 1HSQ A; 1ZUK A; 4WCI A; 2CSI A; 2EQI A; 5IHN A; 3QWY A; 2HSP A; 4RUG A; 2DIL A; 3CQT A; 1UEC A; 2JMC A; 1A0N B; 2FPE A; 2FG0 A; 2EVR A; 2J7I A; 2RQV A; 2JT4 A; 1GL5 A; 1K9A A; 2YDL A; 4F16 A; 1UJY A; 2BZX A; 1ZSG A; 3M0P A; 3NHN A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1QVF S; 1ZUY A; 2A7Y A; 1YWO A; 4PJM A; 3EGU A; 4RCB A; 3M0Q A; 2X4Y A; 3CCU A; 2M0Y A; 3CEY A; 2JTM A; 2YHT A; 1YFN A; 3FB9 A; 3EGD B; 4JZ3 A; 3EGX A; 2BKD N; 3DB3 A; 3M0T A; 4CC2 A; 3OS2 A; 1VQK A; 2QTX A; 2RQR A; 1FX7 A; 4C8Q C; 8ATC B; 3LH0 A; 3S3M A; 1VQ9 T; 1U5S A; 3OA6 A; 4QT7 A; 3TSZ A; 3J80 E; 3I9Q A; 2QQB A; 1YIT Q; 4RMO A; 4KH0 B; 1I8F A; 3OYK A; 2DYI A; 1UHC A; 1WFW A; 2YRD A; 2X4X A; 3C95 A; 4BI8 B; 2DRK A; 5KYW A; 3L2R A; 3V7R A; 2PUO B; 5FRM A; 1BI0 A; 4IUP A; 3QSU A; 2HBW A; 1GBR A; 1XNI A; 4C8Q B; 2MIO A; 1GCP A; 4HT9 A; 3X28 B; 2D6F A; 4KH1 B; 1WJS A; 3CCJ T; 2FB7 A; 3QDF A; 3OYM A; 2MCN A; 3T9N A; 2VWF A; 1LNX A; 4D8D A; 4GBQ A; 1BBZ A; 1BB9 A; 3MO8 A; 2K5F A; 2EQM A; 4DBQ A; 5KE2 A; 1Q86 C; 5EC7 A; 4OB2 B; 1M8M A; 1OX8 A; 1ZSZ A; 1K4U S; 2PUK B; 5KCH A; 2PVD B; 4JJB A; 1EX4 A; 3R6N A; 3CC2 T; 3RKX A; 3CC4 Q; 3UA6 A; 2O31 A; 4OB3 B; 3OS5 A; 4JS4 A; 5D6Y A; 1QW1 A; 3A8G B; 2RPN A; 1VQ6 Q; 2E6N A; 1NPR A; 1PWT A; 2L8D A; 2E3I A; 1X2Q A; 2JM8 A; 4FYY B; 1PRM C; 2G6F X; 4BE2 A; 5L8R E; 2HMA A; 3CCE A; 4RTW A; 5D6W A; 1AD5 A; 4KRT A; 2K3X A; 4ME7 A; 4K11 A; 3CCV T; 3R6O A; 2KRM A; 3DLM A; 2K5L A; 1ZA1 B; 1N6A A; 4ORZ A; 4ESR A; 1RI9 A; 3EG3 A; 1PKT A; 2DLP A; 4RG2 A; 1UE9 A; 1JU5 C; 2Y4X A; 3CCS A; 1VQK T; 4ZGJ B; 2DET A; 2DO3 A; 3QKJ A; 1M1K C; 2DD5 A; 2VC8 A; 2VUB A; 1S72 Q; 5HCK A; 5IN1 A; 1E6G A; 3GIB A; 3CCL Q; 4M75 G; 4HCZ A; 2CSQ A; 3JCM J; 3OQ5 A; 1XOV A; 2DPP B; 2V8K A; 1NJI R; 2RO0 A; 3QZ5 B; 4XU3 A; 3OW2 A; 3A1P A; 4PFP A; 2BZY A; 1LJO A; 1OZ3 A; 1HD3 A; 3OYN A; 3L42 A; 2JUF A; 2CZ0 B; 5CKH A; 4OMO A; 2YUO A; 2KRS A; 1KG1 A; 3VS6 A; 2HZY A; 1KIK A; 4F7U B; 2KRO A; 2O4X A; 1U1T A; 2D9T A; 4M7D F; 3THK A; 2SRC A; 2QEX A; 1H64 1; 3UF4 A; 2JS0 A; 1K73 U; 6AT1 B; 5GAO p; 1UG1 A; 1Z9Q A; 2RNA A; 4FW2 A; 5GAN 4; 2KEA A; 2O9S A; 1O75 A; 5CQX A; 2CS7 A; 2P0K A; 1NEB A; 2KMT A; 1P92 A; 2QQ9 A; 2GCX A; 5GAN 3; 2R5M A; 2ZCF B; 2DNU A; 1PD0 A; 4LXC A; 4XTV A; 2KYB A; 3CPW A; 2FZK B; 4L5G A; 1YJW Q; 4LDX A; 1N8R R; 2ZPI B; 4HT8 A; 1QKX A; 1G83 A; 2COZ A; 2E5K A; 2JNG A; 3V8K A; 3S6W A; 1VIF A; 5GAO r; 3KUF A; 2AT1 B; 2LMJ A; 3QPH A; 5CR2 A; 2ZPB B; 2A3L A; 2FPD A; 4AT1 B; 4MDX A; 5LJ5 g; 4RG8 A; 5KCO A; 1QVF P; 4PJO E; 4JJC A; 1Y7X A; 5A0L A; 4C92 F; 3TCJ A; 5CKB A; 1ZHI A; 2PVO B; 2FZG B; 3M4Y A; 2P0Q A; 4J6W A; 4GY5 A; 4KUL A; 2P0P A; 3CME T; 1PSE A; 2DL7 A; 2EQK A; 1LPL A; 1YHQ Q; 1D3B B; 3LLR A; 3PNW C; 1B07 A; 3L1A A; 3M0U A; 2LZ6 B; 2L89 A; 4E7H A; 3MPU B; 2P4T A; 1KD1 U; 2YXY A; 2EPD A; 2JW4 A; 1FWZ A; 2DXU A; 5FW9 A; 3L2V A; 2DTH A; 2DTI A; 1X6O A; 1R0C B; 1S1N A; 4KGV B; 2DE0 X; 1K0X A; 5I21 A; 4JLG A; 4E7Z A; 1YIJ Q; 2NYS A; 2VB6 A; 4XTW A; 1YJ9 Q; 4M78 A; 2YSQ A; 1WA7 A; 2E1H A; 2E3H A; 5KYY B; 2M1H A; 2DKG A; 3CXC P; 1MHN A; 2EYW A; 1K1Z A; 1NJI C; 2PTK A; 3M4G A; 3FC3 A; 1GCQ C; 1QKW A; 3SFM A; 4M7D D; 1NLP C; 1U1S A; 3CCQ Q; 3G71 A; 1Q95 G; 1QCF A; 2XDB A; 4C5H A; 1JJ2 A; 2KY9 A; 1BIA A; 1KQS S; 2X9H A; 3JCM d; 5KYX B; 1G2B A; 2NUT A; 2K9G A; 3G4S A; 4PJN A; 4NOY A; 1LOJ A; 1VQ9 Q; 2MWO A; 4J9B A; 2F69 A; 4C5I A; 1K8A U; 1VQP A; 1NYG A; 4PLI A; 1M3C A; 2D1X A; 2F2V A; 3CMA A; 1VQM Q; 4JJN K; 3CCR T; 4PJO D; 1YCY A; 3QJ6 A; 4R56 A; 4OB0 B; 2PU9 B; 2H8H A; 5C0M A; 2K3Y A; 3G7Z A; 4IUR A; 1GFC A; 4EMK A; 5CCA A; 4UC4 A; 1UDL A; 3E9F A; 2RQW A; 4MZT A; 3V7S A; 2NLU A; 3CCJ Q; 1M1F A; 1N8R C; 1OEB A; 1QP2 A; 3EH1 A; 4CRI A; 4C92 D; 3CC4 T; 3EHR A; 4E7J A; 4M7D C; 1X69 A; 1M27 C; 2VYT A; 3E19 A; 2V1Q A; 1SKU B; 1VQ6 T; 4IUV A; 2COY A; 3WXM B; 3I5R A; 3OYH A; 3CC2 Q; 4E6R A; 3GBQ A; 5AYF A; 4L59 A; 1RLQ C; 2RHY A; 1VQ5 Q; 2JTF A; 3HHT B; 3S3N A; 4RKU E; 2EKH A; 4LN2 A; 1DJ7 B; 2P4R A; 4M7D B; 3HTR A; 2LNV A; 1PSF A; 1U8R A; 4PJO C; 2DBK A; 2NUZ A; 4F14 A; 1OPK A; 1VQN A; 4A63 B; 3NGP A; 5FU7 C; 1SPK A; 5GAO n; 3OBW A; 2FEI A; 2NWM A; 4C5E A; 2BZ8 A; 2ZPE B; 3JB9 D; 1HSQ A; 2EGE A; 2KDS A; 2CSI A; 1XTD A; 5IHN A; 5GAN 5; 4RUG A; 3CCV Q; 4O6J A; 3OYB A; 2LTO A; 4A53 A; 3CCU Q; 3G71 T; 2FPE A; 2FG0 A; 4C92 C; 1FMV A; 3MP8 A; 1GL5 A; 4PJO B; 3CCL T; 1KHC A; 1RI0 A; 3M57 A; 4F16 A; 5IAY A; 5GMK i; 1IRE B; 2CZ1 B; 1ZSG A; 3M0P A; 4QW2 A; 1RAG B; 3NHN A; 5FU7 B; 1VQK Q; 2LJ3 A; 2DFU A; 3M0S A; 3G4S T; 5A2Q E; 2DRM A; 3EG1 A; 2EQU A; 3INZ A; 2FHD A; 1VQP T; 1F1B B; 5HY6 A; 2JMA A; 4C92 B; 1TXQ A; 3HFO A; 1WHM A; 3GLX A; 2DVJ A; 2V8I A; 2NUP B; 5L23 A; 1BCO A; 2M02 A; 3V8L A; 5LL6 S; 3EG0 A; 1IO6 A; 2DZ9 A; 2FL7 A; 3HKS A; 3QXE B; 3EFO B; 4OB1 B; 3RR6 A; 3VS3 A; 1VYV A; 2K5I A; 1SSF A; 4NL3 A; 3I5S A; 3PE0 A; 5FWB A; 3VYH B; 3RER A; 2YUQ A; 3VS5 A; 1CKB A; 2DZC A; 2ESW A; 2JJ9 A; 4OMF B; 1BK2 A; 1G3Y A; 1ZQ1 A; 3VKI A; 3TRE A; 1H3Z A; 3EGX B; 2YRV A; 2EKO A; 3LWH A; 1X43 A; 1WXT A; 4M75 F; 1SSH A; 1JBM A; 1SRL A; 1C0M A; 4XQ3 A; 1VQN T; 1XJW B; 5FRO A; 3BY7 A; 4M77 G; 3CBM A; 1YWP A; 1X27 A; 3CCE Q; 3JSC A; 1VQO A; 2YRC A; 4Z89 A; 2E12 A; 3OYL A; 2HCK A; 4J83 A; 1QVG S; 3CPW S; 2GGR A; 5HK3 A; 1KC8 R; 1NBE B; 2LP5 A; 4IUQ A; 3VS4 A; 4E7I A; 3QDR B; 5GAN 6; 1T3L A; 3M55 A; 1WIE A; 4M4Z A; 3OMG A; 2DMO A; 2RN8 A; 3UT1 A; 1O9S A; 1VA7 A; 3JCM h; 3SDZ A; 3OYF A; 1KQS P; 1WGS A; 1WJQ A; 5GAN e; 3EHQ A; 1Y0M A; 1ZSZ B; 4OVA A; 2K79 A; 2QYZ A; 1AWJ A; 1NEG A; 1YI2 A; 4M7A G; 1FMK A; 1M2O A; 1K0S A; 1M1K R; 2PNI A; 4II1 A; 3EG9 B; 2O2O A; 2RJD A; 3PFS A; 1TUD A; 1KFZ A; 4OMQ A; 3CCQ T; 2AK5 A; 2QA4 A; 2XDP A; 4FT4 A; 4BD3 A; 1BIB A; 2EFI A; 3OYG A; 2XI9 A; 4AMC A; 4HKE A; 2KBT A; 3ER0 A; 1TOV A; 3I55 A; 3S3O A; 4Z8A A; 4XAX B; 2LC4 A; 3VS1 A; 4DEY A; 1JO8 A; 3MJX A; 5GAO m; 3HRU A; 1AHJ B; 2A36 A; 1OU9 A; 3MEV A; 4M77 A; 1T0H A; 5CK9 A; 2OTJ T; 5HK0 A; 2ZPG B; 4FIB A; 3FIF A; 3UWN A; 1VQM T; 1XQH A; 3J7A F; 4C0F A; 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