The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
74
|
structure length |
74
|
Chain Sequence |
GSSGSSGSTMTVIKDYYALKENEICVSQGEVVQVLAVNQQNMCLVYQPASDHSPAAEGWVPGSILAPFSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of SH3 domain of mouse Kalirin-9a protein
rcsb |
| molecule keywords |
Kalirin-9a
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
6
|
| structure length |
74
|
| sequence length |
74
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 2004-05-27 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UDL A; 3SHW A; 2EQI A; 1WXU A; 3JV3 A; 2MOX A; 2K79 A; 2KEA A; 2GNC A; 1QLY A; 1RUW A; 4KRT A; 1ZSG A; 2CRE A; 2GQI A; 2CSQ A; 2J6K A; 2DM1 A; 2ECZ A; 2QDL A; 4E6R A; 4X1V A; 4J9H A; 4Z89 A; 2K7A A; 1VA7 A; 1K0X A; 4AG1 C; 2DRM A; 2X3X D; 2CT3 A; 3H0I A; 2YDL A; 3EHQ A; 2YUP A; 1LCK A; 2EBP A; 2EVR A; 1NM7 A; 2L3S A; 1YN8 A; 4J9C A; 1NEG A; 4A63 B; 1JEG A; 4RTW A; 4CC7 A; 4OMM A; 2DL4 A; 3QWY A; 1ARK A; 1NLP C; 4D8D A; 3KFV A; 2DX1 A; 2CSI A; 2C0I A; 1ZUU A; 4RUG A; 1NLO C; 2KT8 A; 5IXF A; 2KBT A; 2B86 A; 1BB9 A; 1NG2 A; 1PRL C; 3NGP A; 1WI7 A; 4EIK A; 5FWC A; 2JMA A; 1VYV A; 2FPE A; 3I5S A; 3RBB B; 3VS6 A; 5HCK A; 4QT7 A; 1WXT A; 1OEB A; 3I35 A; 3IQL A; 1OV3 A; 2O9V A; 2CH4 A; 4J9G A; 1M30 A; 1WDX A; 5IXB A; 2AKL A; 2J7I A; 1B07 A; 1SSH A; 1HD3 A; 2A08 A; 4RTU A; 2CDT A; 3M0R A; 2BZ8 A; 2NUZ A; 3GBQ A; 4F14 A; 1KJW A; 4CC4 B; 2JM9 A; 2RQW A; 1U3O A; 1YP5 A; 4GBQ A; 2LMJ A; 2CUB A; 2P4R A; 2KGT A; 1YNZ A; 2JT4 A; 1I1J A; 1PKS A; 4D8K A; 1J3T A; 4HVW A; 1HSQ A; 2F2W A; 1ZUY A; 1JXO A; 2C0O A; 2ED1 A; 3C0C A; 4K11 A; 2KRM A; 4OML A; 4Z8A A; 2A37 A; 1S1N A; 1QKW A; 1M8M A; 2AKK A; 3M0U A; 4LE9 A; 5L23 A; 1UHF A; 2MIO A; 3ULR B; 1PWT A; 1X2Q A; 1SRM A; 3UA7 A; 2FRY A; 1UGV A; 2ROT A; 1H3H A; 1K9A A; 2LCS A; 4AFQ C; 1HJD A; 1SHG A; 1M3A A; 1WX6 A; 2HSP A; 1NYG A; 2JS0 A; 1UE9 A; 3A98 A; 1H92 A; 2O9S A; 2KT1 A; 2RF0 A; 1X6B A; 2O88 A; 2CUD A; 2J6O A; 1QKX A; 1SHF A; 3H41 A; 1T0H A; 1Y0M A; 1SEM A; 3LH5 A; 2KRO A; 2F2V A; 5FWB A; 2A36 A; 2DBK A; 2D1X A; 3FJ5 A; 2MCN A; 1MUZ A; 2SEM A; 1UJY A; 2DMO A; 3I5R A; 2FEI A; 1Z9Z A; 1OOT A; 4Y92 A; 1KFZ A; 2YSQ A; 1CSK A; 2L3Q A; 4ESR A; 2LQW A; 1PRM C; 2GTJ A; 2FO0 A; 2D8J A; 2NWM A; 4OMO A; 3VS1 A; 2YT6 A; 1M27 C; 3RNJ A; 4J9F A; 1WXB A; 4LUD A; 2CT4 A; 1PNJ A; 3UA6 A; 1WLP B; 2FRW A; 2FPD A; 2EPD A; 3QWX X; 2V1R A; 2DLP A; 2A28 A; 1ABQ A; 4GLM A; 2FG0 A; 3VS2 A; 2L3P A; 2LJ0 A; 3EG0 A; 1CKA A; 4LNP A; 1GCP A; 1RLP C; 2O2O A; 3EHR A; 4JJD A; 1AVZ C; 3R6N A; 2VWF A; 2KNB B; 1QWF A; 1MV0 B; 3EG2 A; 3UAT A; 1G83 A; 2V1Q A; 1RI9 A; 4RTY A; 1UTI A; 2DNU A; 4IIO A; 3VS0 A; 5IHK A; 1AEY A; 4AFU C; 2FPF A; 2DL7 A; 2RMO A; 1AWW A; 2GTO A; 1JO8 A; 2JMC A; 1W70 A; 2M0Y A; 1K4U S; 1JXM A; 1K76 A; 1OPK A; 1WA7 A; 1H8K A; 1UHC A; 1FYN A; 2O31 A; 4DEY A; 1QCF A; 1N5Z A; 1AZE A; 2KRS A; 1UFF A; 2LZ6 B; 2I0N A; 1XOV A; 1X43 A; 2ENM A; 3M0P A; 2EGC A; 1B3Q A; 1KSW A; 3M0Q A; 4Z88 A; 2YUO A; 4OMQ A; 2ED0 A; 1TG0 A; 2YUQ A; 1ZX6 A; 4RTV A; 1SPK A; 3ZL7 C; 2DJQ A; 3EG3 A; 2KYB A; 1BK2 A; 2RNA A; 2K6D A; 3TSZ A; 1UJ0 A; 3THK A; 1U5S A; 5IHI A; 1GFC A; 3NHN A; 1T3L A; 3EGU A; 2YUN A; 2HEQ A; 2EYW A; 3VS7 A; 1X27 A; 1BBZ A; 1E7O A; 4AFZ C; 2LJ3 A; 3EG1 A; 1TUD A; 2PTK A; 3CQT A; 2KR3 A; 2JW4 A; 2AK5 A; 2KRN A; 3M0S A; 2CH4 W; 4LUE A; 4JJB A; 2AZS A; 1UG1 A; 1KIK A; 2OI3 A; 1AWO A; 1W1F A; 1WIE A; 4F16 A; 1E6G A; 1NEB A; 2LJ1 A; 1ZLM A; 2PZ1 A; 3I9Q A; 1JU5 C; 2ESW A; 2L2P A; 3VS4 A; 1AD5 A; 1GRI A; 2DBM A; 1WYX A; 2EYZ A; 2EKH A; 1V1C A; 2K9G A; 3NMZ C; 4RTZ A; 4CC3 A; 1Y57 A; 4M4Z A; 1M3B A; 1PHT A; 4DEX A; 1RLQ C; 2K3B A; 2EW3 A; 1BU1 A; 2HBW A; 4J9B A; 1WFW A; 1YWP A; 4F17 A; 4JZ4 A; 2RQT A; 2EYY A; 2KYM A; 4R0K A; 1X2K A; 3H0F A; 1T0J A; 3REA B; 2G6F X; 2VKN A; 5GJV B; 1GCQ C; 4CC2 A; 1E6H A; 5I11 A; 2LP5 A; 4J9I A; 2DL5 A; 2C0T A; 1Z9Q A; 2DF6 A; 4LN2 A; 2X3W D; 2LNH B; 1YCS B; 4J9E A; 2EGA A; 3UF4 A; 1GBQ A; 1I07 A; 2DRK A; 1GCQ A; 1U06 A; 2GBQ A; 2LQN A; 4ZNX A; 3M0T A; 2EYX A; 2JM8 A; 3SEM A; 2HDA A; 1YWO A; 2KXC A; 1T3S A; 4IIM A; 3VRY A; 2H8H A; 5IHN A; 1OPL A; 2J6F A; 1QWE A; 1VYT A; 2J05 A; 2F2X A; 1GBR A; 4OMP A; 2RPN A; 4HVV A; 2AZV A; 4FSS A; 4JPB W; 4ORZ A; 1CKB A; 2JS2 A; 2ROL A; 2OAW A; 4JZ3 A; 5FW9 A; 2E5K A; 1TUC A; 3U23 A; 3TVT A; 1AWJ A; 1JQQ A; 3VS3 A; 2K2M A; 3TSW A; 1AOJ A; 2OJ2 A; 2DVJ A; 2KXD A; 1PKT A; 3PVQ A; 1K1Z A; 4AG2 C; 1A0N B; 2DL3 A; 3VRZ A; 2D8H A; 4WCI A; 2DYB A; 2DIL A; 3H0H A; 1K0S A; 2PNI A; 4JJC A; 2W10 A; 2LX7 A; 1UEC A; 1VYU A; 2M51 A; 2JTE A; 1X69 A; 2D0N A; 2GGR A; 4HCK A; 2KE9 A; 4RTX A; 1AZG B; 1I0C A; 1GL5 A; 4OMN A; 1G2B A; 2RQR A; 2SRC A; 4J9D A; 1UUE A; 3PVL A; 4HXJ A; 1W6X A; 3NPF A; 2VVK A; 1ABO A; 5ECA A; 1X6G A; 3O5Z A; 2JXB A; 1ZUK A; 4RTT A; 2RQV A; 3PE0 A; 2DA9 A; 2EGE A; 1GFD A; 2J06 A; 2BZX A; 4HVU A; 1MV3 A; 2XMF A; 2BZY A; 1AWX A; 1M3C A; 1NYF A; 5IH2 A; 1EFN A; 5I22 A; 2L0A A; 2IIM A; 4AFS C; 1FMK A; 5EC7 A; 1IO6 A; 2RN8 A; 1SRL A; 2W0Z A; 2BTT A; 3REB B; 2HCK A; 3VS5 A; 1ZBJ A; 2RQU A; 2ABL A; 2DE0 X; 5GJW B; 2DL8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3SHW A; 4J6W A; 2XID A; 2MOX A; 1HYO A; 2YRC A; 3JV3 A; 2GNC A; 4KRT A; 2GQI A; 2HZY A; 1YJW Q; 2YLB A; 2CSQ A; 3JCM X; 4M7A E; 3PIP A; 2QAZ A; 2ECZ A; 2DZC A; 4X1V A; 4J9H A; 1Q81 R; 4Z89 A; 4EMK A; 2EIF A; 4M7A A; 2OTJ A; 4A4K A; 5D6X A; 2X3X D; 4LDU A; 5DY9 A; 1WQW A; 3EHQ A; 2EVR A; 5GAM f; 5KYY A; 1YN8 A; 4J9C A; 5HK0 A; 1JEG A; 4RTW A; 4CC7 A; 4OMM A; 3QWY A; 1NLP C; 2JUF A; 3BE3 A; 3X28 B; 2CSI A; 3JCM g; 1UGP B; 2VGM A; 1NLO C; 4M78 C; 2KBT A; 1N9R A; 2B86 A; 1NG2 A; 1PRL C; 2E3H A; 3EAE A; 3NGP A; 4EIK A; 5LJ5 d; 3HKS A; 2E1H A; 2ZCF B; 2O4X A; 1OI1 A; 3BDU A; 1ZSZ A; 1MMG A; 1WJS A; 2C06 A; 1W2B S; 5DLQ E; 1R0B G; 1WDX A; 2CZ0 B; 4MZT A; 3CCM Q; 1SSH A; 1HD3 A; 3GBQ A; 4BY6 B; 1BCM A; 2RH2 A; 4F14 A; 2RQW A; 1U3O A; 5EG2 A; 3MEA A; 2KGT A; 1YHQ T; 1YNZ A; 1KC8 U; 4XK8 E; 1X75 C; 1MNE A; 2F2W A; 3A8G B; 1VQK T; 1VIE A; 3CME Q; 1QVP A; 3RUX A; 5J39 A; 8AT1 B; 1NJI R; 2DXU A; 1KC8 C; 4LE9 A; 4X9D A; 4M78 D; 2HSE B; 1YIT A; 2LRQ A; 3I56 T; 2ZPH B; 4PJL A; 4IKF A; 3ULR B; 3PGG A; 1PWT A; 1OX9 A; 3UA7 A; 4E7L A; 1Y96 B; 2M9U A; 3QZ9 B; 1HJD A; 1WX6 A; 4ANJ A; 4C8Q F; 4JRQ A; 2HSP A; 1NYG A; 4F04 B; 5CKD A; 2O9S A; 2J6O A; 3OYB A; 1QKX A; 4V2S A; 1SHF A; 1T0H A; 1YBY A; 4FYY B; 1I5O B; 1SEM A; 1RI0 A; 2DTO A; 4BD3 A; 2KRO A; 5FWB A; 2A36 A; 2BIV A; 1RAC B; 2LDM A; 2SEM A; 4C0D C; 4DBR A; 4Q5W A; 5I21 A; 1Z9Z A; 1Q86 C; 4M77 G; 3CCS A; 2LQW A; 2RJE A; 2D8J A; 2QXF A; 1M27 C; 4LUD A; 4J5Y A; 2AHJ B; 2CT4 A; 3UA6 A; 4PK4 A; 2FRW A; 1BI2 A; 4C5E A; 4M77 E; 2K3Y A; 2V1R A; 1KQ1 A; 1QVF S; 3ZEH A; 5KYW B; 5CKH A; 3CC4 Q; 4A4G A; 2L3P A; 3SDZ A; 1YIJ Q; 1PSE A; 1CKA A; 5CVI A; 2RHI A; 4M77 A; 3EHR A; 4XU0 A; 4XTZ A; 2RHY A; 2CS7 A; 2M1H A; 4KH0 B; 4DA4 A; 2WSE E; 2Y4Y A; 2LCC A; 3ZBD A; 3EG2 A; 3SD4 A; 3CBM A; 3JCM f; 4RKU E; 4AFU C; 1M8V A; 2FPF A; 3CPF A; 1PCX A; 2GTO A; 2CZ1 B; 1VQ9 A; 2JMC A; 1G3W A; 1W70 A; 2DZ9 A; 2X35 A; 4XU3 A; 4A4H A; 1UHC A; 4DBH A; 2AT1 B; 1VQO T; 1QCF A; 3EFR A; 4ZGJ B; 1D1B A; 3HPW A; 3CPW P; 1UFF A; 4HA8 A; 2BUD A; 3M5A A; 1X43 A; 2EGC A; 4JRI A; 1B3Q A; 5LJ3 f; 4WF2 A; 1SPK A; 2L3R A; 3PIO A; 3WXM B; 1Q7Y R; 3EG3 A; 1ACM B; 2COZ A; 1UJ0 A; 3JB9 G; 5IT9 E; 3SFM A; 2FZC B; 3CD6 Q; 3P8H A; 4BE2 A; 1T3L A; 2DEQ A; 3EGU A; 1QVG S; 2VUB A; 4KBM B; 1Q82 R; 3CQT A; 1JJ2 P; 2DO3 A; 2KRN A; 3CC2 Q; 4BI4 A; 1TH7 A; 1IGU A; 4C8Q B; 1KIK A; 3GLX A; 1P92 A; 4R55 A; 1Y96 A; 3TCJ A; 3TQ7 P; 5GAM j; 4C92 E; 2DK3 A; 1ZLM A; 4L5G A; 2DTI A; 1YHQ Q; 3I9Q A; 1U1S A; 2E3I A; 5CKE A; 3HP9 A; 2DBM A; 4HT8 A; 4RTZ A; 3R6O A; 1V1C A; 2K9G A; 2ZPG B; 1Y57 A; 2H3J A; 1PHT A; 3M53 A; 2LX9 A; 4DEX A; 2OTL Q; 3BDL A; 1BU1 A; 3CCV Q; 4J9B A; 1IB8 A; 1X2K A; 3JCM V; 1TS9 A; 3GNF B; 3REA B; 2G6F X; 3CCE T; 3I56 Q; 1FWZ A; 2VKN A; 5GJV B; 3G4S A; 1GCQ C; 4Y28 E; 4JJN K; 5I11 A; 3G7Z A; 1YI2 T; 1MMA A; 1MND A; 2M0O A; 1WQ7 A; 2X3W D; 2RJC A; 3A8O B; 2HKQ B; 3UF4 A; 3S3N A; 4DBQ A; 1VQ5 T; 2GBQ A; 2LQN A; 3M0T A; 3CCU Q; 2EYX A; 2LC4 A; 4HCB A; 3M4G A; 1T3S A; 2KMT A; 1ZQ1 A; 5KYW A; 4IIM A; 2H8H A; 5IHN A; 1VYT A; 2J05 A; 1GBR A; 1OX8 A; 2AZV A; 4FSS A; 4EMG A; 2V8K A; 3INZ A; 5A0D A; 5LL6 S; 2JS2 A; 3CEY A; 2OAW A; 3EFS A; 3OYK A; 4E7K A; 3CC7 T; 2E5K A; 1TUC A; 2HMA A; 1WPY A; 1AWJ A; 2K2M A; 2P0P A; 3TSW A; 2VC8 A; 1Y7X A; 3HRS A; 1VQM T; 1K8A U; 2Y4X A; 2YHT A; 2OJ2 A; 2E6Z A; 3C12 A; 1VQ4 T; 3PVQ A; 1D1A A; 3OY9 A; 2DKG A; 3EH1 A; 2R5A A; 1LVK A; 3X26 B; 2D8H A; 4C0F A; 2CP5 A; 3OYC A; 3G71 Q; 2R5M A; 3FJP A; 2DIL A; 3V8L A; 2MF2 A; 3H8Z A; 3CCL Q; 4M75 C; 1WJQ A; 4PJO C; 2JTE A; 5GAN f; 2KE9 A; 1S72 T; 4ZGE B; 1I0C A; 1G8X A; 4HT9 A; 3L2W A; 3UPU A; 2QQB A; 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2O9V A; 1WGS A; 1IGQ A; 1YIT Q; 3PT9 A; 2MMP A; 3VJP A; 4FSX A; 2DXB A; 3QZ5 B; 2J7I A; 5IAY A; 4OB0 B; 2NUT B; 2A08 A; 4M7A D; 3M0R A; 1M1F A; 2NUZ A; 4FYX B; 1XNI A; 1W2B A; 2RK1 A; 1YP5 A; 1TOV A; 2P4R A; 1WZO A; 3M57 A; 3QO3 A; 3I55 A; 2JT4 A; 1PKS A; 3ZFJ A; 1J3T A; 3CCJ A; 2RI5 A; 4HVW A; 3LWI A; 1JXO A; 2C0O A; 1QP2 A; 3C0C A; 4OML A; 3RES A; 8ATC B; 4Z8A A; 2A37 A; 2XHC A; 2ZAE A; 2DFU A; 1RAH B; 2Y90 A; 5GAN 8; 5CQX A; 3ASK A; 4MZM A; 2FZK B; 3M0U A; 2EQK A; 4R56 A; 3CCS Q; 1BIA A; 2K4Y A; 3CXC S; 2EQJ A; 4RG2 A; 3EG9 A; 4LD6 A; 2AIR B; 2ROT A; 3EGX B; 3JB9 F; 4PNO A; 4QKU A; 1K9A A; 3OYA A; 4AFQ C; 4BI8 B; 3CC4 T; 1ZA1 B; 3RMS A; 4C92 F; 3CCQ A; 2KT1 A; 2CUD A; 2PQW A; 3G6E T; 1M90 R; 1NZ9 A; 3WVD B; 1QCN A; 2G3R A; 4A54 A; 1VQP Q; 2F2V A; 5C6S A; 3EFO B; 3JB9 I; 3CBO A; 4XTU A; 5FRN A; 2P84 A; 3I5R A; 3CCR A; 2F1L A; 1OOT A; 1TTH B; 4Y92 A; 2DEU A; 2YSQ A; 1KQS P; 2BE9 B; 2RJF A; 2JVV A; 1G3T A; 2HL3 A; 1G5V A; 2FO0 A; 2DYI A; 4RG8 A; 2EWN A; 1LNX A; 5KYX A; 4J9F A; 2COW A; 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