The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
96
|
structure length |
96
|
Chain Sequence |
GSSGSSGTSKQRYSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELPLTAGKYLYVYGDMDEDGFYEGELLDGQRGLVPSNFVDFVQDNESRLASTSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Solution structure of the first SH3 domain of KIAA0318 protein
rcsb |
| molecule keywords |
RIM binding protein 2
|
| total genus |
5
|
| structure length |
96
|
| sequence length |
96
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-05-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RF0 A; 2J05 A; 1K1Z A; 4RTW A; 2EGC A; 1WX6 A; 3O5Z A; 2A36 A; 2EYZ A; 4JJB A; 1X43 A; 2EYY A; 2RNA A; 2CT3 A; 2ROT A; 2RQR A; 2K3B A; 3EGU A; 1QKW A; 2SRC A; 4JPB W; 2O88 A; 3EG3 A; 2KRM A; 3M0S A; 4HXJ A; 1RLQ C; 3I35 A; 1OV3 A; 1QKX A; 1CKA A; 1UE9 A; 2CRE A; 2FRW A; 4LNP A; 3UA7 A; 2J6K A; 1AZG B; 2KRO A; 2DJQ A; 2GNC A; 4OMN A; 4CC3 A; 1KIK A; 4J9F A; 2YSQ A; 2P4R A; 2X3W D; 1WXU A; 1WFW A; 2M0Y A; 1K76 A; 2KGT A; 1RUW A; 2K7A A; 2GBQ A; 4RTX A; 1GFC A; 1GCP A; 2HCK A; 2DIL A; 1SRM A; 1TUD A; 1I07 A; 2FPD A; 2GQI A; 3VS3 A; 2JM8 A; 1E6H A; 1PRL C; 2ESW A; 1N5Z A; 2FPE A; 1U5S A; 2O9V A; 1M8M A; 2D8H A; 1GL5 A; 2RQV A; 3EG0 A; 1K0X A; 4EIK A; 3EHR A; 2AZV A; 1OEB A; 1U06 A; 2JMC A; 1K0S A; 3IQL A; 2CH4 A; 2J6F A; 2OI3 A; 2PTK A; 4QT7 A; 2QDL A; 1T3S A; 1ZBJ A; 1UG1 A; 1AEY A; 1H3H A; 2F2V A; 3I9Q A; 3PVQ A; 1E7O A; 2JW4 A; 1BB9 A; 1FMK A; 3REB B; 2MIO A; 1FYN A; 2LNH B; 2I0N A; 4D8D A; 2EVR A; 2K79 A; 4HVW A; 1W1F A; 1NYF A; 3JV3 A; 4AFU C; 2A28 A; 2CDT A; 4WCI A; 1QWE A; 1YCS B; 4IIM A; 4Y92 A; 2EGA A; 3H0F A; 3I5R A; 1GBQ A; 2YUQ A; 3I5S A; 1AOJ A; 2RN8 A; 1ZX6 A; 3H0I A; 3NPF A; 2EW3 A; 1M30 A; 2RQU A; 2LZ6 B; 3TSW A; 5ECA A; 1UGV A; 2F2W A; 1VA7 A; 1OOT A; 1W70 A; 1WA7 A; 2JM9 A; 2A08 A; 3ULR B; 1VYU A; 3LH5 A; 2FG0 A; 2DBK A; 2ENM A; 2FPF A; 1M27 C; 1G2B A; 4ESR A; 1OPK A; 3KFV A; 3NMZ C; 4OMQ A; 2DLP A; 2CSQ A; 2NWM A; 3A98 A; 2ED0 A; 2C0T A; 2YUO A; 1CKB A; 3PVL A; 1AWO A; 2DX1 A; 1YP5 A; 5IH2 A; 3VS7 A; 1WIE A; 1M3B A; 4AG2 C; 4LUE A; 1X2K A; 1NLP C; 1JEG A; 2DYB A; 2FRY A; 3M0P A; 2J6O A; 4AFS C; 2CUD A; 4JJC A; 2EYW A; 3EG1 A; 1IO6 A; 4K11 A; 1WXB A; 2EGE A; 1JO8 A; 3RBB B; 3VRY A; 2LX7 A; 3VS4 A; 2YDL A; 1SRL A; 1LCK A; 2CUB A; 2H8H A; 1M3A A; 1RI9 A; 2MCN A; 3NHN A; 2O2O A; 4OMP A; 1WYX A; 4J9G A; 2DF6 A; 2JS2 A; 4R0K A; 1GBR A; 1X6G A; 2EYX A; 1VYV A; 2L0A A; 1OPL A; 1QCF A; 1ZSG A; 4J9I A; 2CSI A; 2MOX A; 1UUE A; 4AG1 C; 1X6B A; 1SHF A; 2LCS A; 1PHT A; 1GCQ C; 4DEY A; 2KRN A; 2L3S A; 1Z9Q A; 2ROL A; 2O9S A; 4JZ4 A; 3FJ5 A; 4F14 A; 2NUZ A; 1B3Q A; 3QWY A; 2VKN A; 2KYM A; 1ZLM A; 2JT4 A; 5FWB A; 4ZNX A; 5IHI A; 1T0J A; 2KYB A; 2DRM A; 2GTJ A; 2RQT A; 2LJ0 A; 2AKL A; 2VWF A; 2OAW A; 1AD5 A; 2C0O A; 2AK5 A; 1XOV A; 2LJ1 A; 2DNU A; 1W6X A; 1ZUY A; 2RMO A; 2PNI A; 4OMO A; 1X69 A; 2L3P A; 1NEB A; 1MUZ A; 2EQI A; 3M0Q A; 3UAT A; 2J06 A; 1UJ0 A; 1EFN A; 1ABQ A; 3VS2 A; 5L23 A; 4HCK A; 3THK A; 3H0H A; 5I22 A; 1CSK A; 2F2X A; 1AZE A; 1H8K A; 2HSP A; 1T0H A; 1HD3 A; 2LMJ A; 4LE9 A; 5FWC A; 4JJD A; 1BBZ A; 5FW9 A; 2ECZ A; 2JS0 A; 3QWX X; 3VS0 A; 2RQW A; 3EHQ A; 4LN2 A; 4J9C A; 2K2M A; 1K9A A; 4AFZ C; 2DM1 A; 1SHG A; 2KE9 A; 2XMF A; 3ZL7 C; 1KSW A; 2DE0 X; 4J9E A; 1ARK A; 1MV3 A; 4Z89 A; 1UDL A; 1YWO A; 2DL5 A; 1QWF A; 3RNJ A; 2AZS A; 2DL8 A; 1E6G A; 4FSS A; 1SEM A; 2B86 A; 2K9G A; 2RPN A; 2EPD A; 1AVZ C; 1HSQ A; 1NYG A; 1PKT A; 2HBW A; 1AWW A; 1YN8 A; 3H41 A; 4OMM A; 3NGP A; 4IIO A; 4CC7 A; 2YUP A; 5IHK A; 2K6D A; 2HEQ A; 1WXT A; 5IXF A; 1PWT A; 2KXC A; 1UHF A; 2LQN A; 2W0Z A; 2A37 A; 1AWX A; 4ORZ A; 1ZUU A; 4RTV A; 3UA6 A; 3R6N A; 1K4U S; 4CC4 B; 3M0T A; 2KNB B; 4LUD A; 2M51 A; 4F17 A; 2YT6 A; 1UEC A; 2D0N A; 4GBQ A; 4GLM A; 1WLP B; 2CT4 A; 1JQQ A; 4JZ3 A; 2D8J A; 1H92 A; 3EG2 A; 3VS1 A; 1SSH A; 3GBQ A; 1T3L A; 2GTO A; 4RTT A; 4RUG A; 2LQW A; 2E5K A; 3PE0 A; 2HDA A; 1GRI A; 3C0C A; 1Z9Z A; 2LP5 A; 3VS6 A; 4J9D A; 2V1R A; 1UFF A; 2CH4 W; 3TSZ A; 4X1V A; 1KJW A; 4F16 A; 1HJD A; 2L2P A; 2KRS A; 1X27 A; 2DL4 A; 2JMA A; 5IXB A; 1G83 A; 2KT1 A; 5IHN A; 4J9H A; 1NG2 A; 2VVK A; 2DMO A; 4Z8A A; 2PZ1 A; 1Y0M A; 1RLP C; 1ABO A; 2DRK A; 2D1X A; 5GJW B; 4D8K A; 1AWJ A; 3M0U A; 1JU5 C; 4HVU A; 5HCK A; 2JXB A; 1WI7 A; 4A63 B; 3VS5 A; 2DL3 A; 2DA9 A; 1M3C A; 1NM7 A; 1MV0 B; 2LJ3 A; 5EC7 A; 2OJ2 A; 1J3T A; 4DEX A; 2KR3 A; 2ED1 A; 1WDX A; 1BU1 A; 3SEM A; 2C0I A; 1A0N B; 1PNJ A; 1UTI A; 2L3Q A; 2YUN A; 2JTE A; 4CC2 A; 1TUC A; 3CQT A; 4RTZ A; 1GFD A; 1ZUK A; 2FO0 A; 1SPK A; 2DVJ A; 3U23 A; 2BZX A; 4M4Z A; 2KEA A; 4RTU A; 1I1J A; 3UF4 A; 3REA B; 2FEI A; 2V1Q A; 4J9B A; 1KFZ A; 2BTT A; 1NEG A; 1PRM C; 1GCQ A; 2EBP A; 4E6R A; 1NLO C; 2J7I A; 2SEM A; 3VRZ A; 4OML A; 4KRT A; 2DL7 A; 1YNZ A; 1BK2 A; 2KXD A; 1UHC A; 2X3X D; 2DBM A; 1U3O A; 2EKH A; 2BZY A; 2GGR A; 1TG0 A; 2G6F X; 5I11 A; 2ABL A; 2KBT A; 2BZ8 A; 1UJY A; 1PKS A; 5GJV B; 4AFQ C; 1V1C A; 4RTY A; 2IIM A; 3TVT A; 3SHW A; 1Y57 A; 2AKK A; 4Z88 A; 1I0C A; 1QLY A; 1X2Q A; 1YWP A; 1B07 A; 1JXM A; 2KT8 A; 2O31 A; 3M0R A; 1VYT A; 4HVV A; 1S1N A; 2W10 A; 1JXO A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1QQJ A; 5KCH A; 2RF0 A; 1D3B B; 4MZP A; 4M75 D; 4RTW A; 2EGC A; 3MKD A; 3SWN A; 5LJ5 d; 4MML A; 2EYZ A; 1X43 A; 1TSF A; 3EFR A; 3C12 A; 4QQG A; 2CT3 A; 3J81 E; 1QKW A; 5D6Y A; 4R56 A; 3QHS A; 5GAN f; 1R0B G; 4DA4 A; 1CKA A; 1UE9 A; 2FRW A; 4KBM B; 3UA7 A; 3VYH B; 1EZZ B; 2Y90 A; 5AYF A; 3DLM A; 2E12 A; 4M77 B; 4J9F A; 4ZTJ A; 2X3W D; 1VQN T; 2M0Y A; 4M77 E; 1YHQ T; 2IPO B; 1R77 A; 1VQO T; 5GMK j; 3CCL Q; 1M2V A; 2RK2 A; 4KH1 B; 4NL2 A; 2QA4 T; 2HKQ B; 2HCK A; 2DIL A; 3A8L B; 1I07 A; 2GQI A; 2ZPB B; 2JM8 A; 2XDP A; 4EDU A; 3CMA Q; 1E6H A; 4XTW A; 5GAM f; 4FU6 A; 2RJE A; 1X01 A; 3ZBD A; 3OYL A; 4BDY A; 2DTI A; 2FPE A; 3URG A; 2DJZ A; 2AZV A; 1I4K 1; 4DBH A; 1W2B P; 4OP0 A; 1TTH B; 1OEB A; 3CC7 T; 1NBE B; 3RMS A; 1ZA1 B; 1TWB A; 5KYX B; 2J6F A; 2PTK A; 2QDL A; 2ZPG B; 3M59 A; 1AEY A; 2F2V A; 5CQY A; 5KYU A; 3PVQ A; 1N8R R; 2OTJ Q; 1E7O A; 3SWN B; 1OZ3 A; 1FMK A; 3PT9 A; 1VQM Q; 3EH2 A; 1K73 U; 2MIO A; 1MGQ A; 4C8Q G; 2LNH B; 1W1F A; 1SKU B; 5KCO A; 4JRP A; 2YHT A; 3HRS A; 2V8J A; 4FYY B; 3QKJ A; 2CDT A; 1N27 A; 3OS1 A; 1K9M R; 1UGS B; 2YLC A; 4XU2 A; 3LGL A; 2FHD A; 2E4H A; 1WGS A; 2E6N A; 4DOV A; 1D0Y A; 3QUI A; 5GAN 4; 1PD0 A; 1GBQ A; 5LJ3 f; 4F7U A; 2YUQ A; 3H0I A; 2A0F B; 2M16 A; 2RQU A; 2EJG A; 1M9S A; 4KT0 E; 5ECA A; 3X25 B; 1N6A A; 1RAH B; 2FG0 A; 2DBK A; 4PJO F; 4ESR A; 3CCM T; 4NL3 A; 4MDW A; 5GMK i; 3KFV A; 2G3R A; 4A4G A; 2DLP A; 3OYB A; 1MND A; 2C0T A; 4C92 A; 2YUO A; 5CIU A; 1PC0 A; 2ZZD A; 1BI3 A; 1AWO A; 1D09 B; 1YP5 A; 5IH2 A; 3BFM A; 1M3B A; 4LUE A; 4L6V 5; 4E47 A; 3A5Z B; 5KYU B; 3MEU A; 2MYS A; 2MMP A; 1VQ5 A; 1YJN T; 4HCB A; 2J6O A; 4O6J A; 3E19 A; 4JJC A; 4ATO A; 2DTH A; 4PJO A; 3I55 A; 4XTX A; 3EG1 A; 1RAG B; 2HSE B; 2XK0 A; 3EH1 A; 2E6Z A; 2RHI A; 1M3A A; 1RI9 A; 4JS4 A; 4PLI A; 2CGH A; 4BAC A; 4J9G A; 2OTL A; 4F7U B; 3UDC A; 3RUX A; 4F7U E; 3G71 A; 1VQK A; 1ZSG A; 5D6W A; 2MOX A; 1VQ4 Q; 1X6B A; 4JLI A; 4XU0 A; 3EFS A; 2YWW A; 3I56 A; 3WVD B; 2DXC A; 5GAN 8; 2ZPE B; 2KRN A; 2ROL A; 4FYV B; 3X28 B; 3FJ5 A; 4ANJ A; 2DEQ A; 5GAO m; 1OU9 A; 4C92 B; 3CCE T; 4VUB A; 2KYB A; 2GTJ A; 2LJ0 A; 4M7A C; 4C92 E; 1AD5 A; 2C0O A; 2AK5 A; 1XOV A; 1G3W A; 1NJI C; 3WXM B; 1Q7Y R; 4OMO A; 2CP3 A; 1VQ6 T; 1KQS P; 3KXT A; 2IG0 A; 4IKF A; 1MUZ A; 1PM3 A; 4O5V A; 4LDX A; 4PJO B; 1OX9 A; 3VS2 A; 3C4S A; 2PUO B; 3THK A; 1T0H A; 4HA8 A; 3SWN C; 2ZPI B; 5FWC A; 4JJD A; 1BBZ A; 5FW9 A; 2ECZ A; 2NYS A; 3VS0 A; 2RQW A; 1K9A A; 2FL7 A; 1OUL A; 3ZL7 C; 1KSW A; 4C0G A; 3NTH A; 1MV3 A; 3RKX A; 3CXC P; 3MET A; 3RNJ A; 2DIG A; 4J7I A; 2EPD A; 5GAO q; 1PSE A; 1NYG A; 1PKT A; 2HBW A; 3H41 A; 4CC7 A; 4M75 F; 3PFS A; 3OSV A; 2K6D A; 1IGU A; 4XU3 A; 3INZ A; 3CCS T; 5IXF A; 2XU8 A; 3CME T; 4A4F A; 3VYG A; 1U1T A; 4CI0 C; 3G4S A; 1K4U S; 3S6W A; 3GF5 A; 4LUD A; 1YI2 T; 4EPC A; 5GAN 5; 1NE8 A; 3M53 A; 4FYW B; 4UC4 A; 2VXE A; 2XDD A; 2PUK B; 2CT4 A; 5CR2 A; 4ME7 A; 3VS1 A; 1SSH A; 1G3T A; 1YJW A; 4RTT A; 2VGM A; 5FU6 C; 5J39 A; 4C0D B; 4KGZ B; 3C0C A; 4QQD A; 3M4Y A; 3VS6 A; 3TSZ A; 1KJW A; 4F16 A; 4MMK A; 1YJ9 Q; 3G7Z A; 2KT1 A; 3L1A A; 4J9H A; 5LJ5 g; 4BY6 B; 3FDR A; 2XKO C; 3OYK A; 2R5A A; 1NG2 A; 4IUP A; 5GAO r; 1OU8 A; 1KD1 C; 4Z8A A; 4PK4 A; 1XNI A; 1Y0M A; 4PFZ A; 1VQ9 Q; 3TEE A; 1WNL A; 2D1X A; 2CP2 A; 2YXY A; 2NUT B; 3ER0 A; 3HL8 A; 2MPX C; 3CCQ Q; 3M0U A; 5GMK l; 1BI1 A; 2WSE E; 1JU5 C; 4KUI A; 2JXB A; 3FB9 A; 1M2O A; 4KGX B; 5D6X A; 3CCL T; 2DA9 A; 1Q82 R; 1J3T A; 2KR3 A; 4EMK B; 1U1S A; 3SEM A; 3V7R A; 4X9D A; 1A0N B; 4LD9 K; 2PQW A; 4JRI A; 4JS5 A; 3KUF A; 4IUQ A; 3CQT A; 2FO0 A; 4OB3 B; 5M9O A; 1SPK A; 1YFN A; 2DVJ A; 4M75 G; 4C92 C; 2KEA A; 3UF4 A; 2BE7 D; 2FEI A; 4LD6 A; 4C92 D; 3BDL A; 3E9F A; 4J9B A; 1KFZ A; 2BTT A; 2IVW A; 4MZT A; 3JCM f; 1YIT A; 4IUR A; 1EIF A; 1NLO C; 4ELY C; 2SEM A; 2DKG A; 2M1H A; 4KRT A; 2E64 A; 1YNZ A; 4IUU A; 1N9R A; 1BK2 A; 4OMF B; 1Q95 G; 2DBM A; 1U3O A; 1AT1 B; 3RES A; 2XD0 A; 2G6F X; 2OTJ T; 2ABL A; 1Q86 R; 2CZ7 B; 2RHX A; 1PKS A; 4LDV A; 3V8L A; 2C06 A; 3RKY A; 1SSF A; 4MDX A; 5A0L A; 2DZ9 A; 3SHW A; 2DPP B; 1Y57 A; 1QLY A; 3X24 B; 1HXD A; 2D9T A; 1B07 A; 2HQH A; 3A8H B; 3JRZ A; 1M90 R; 3OSS C; 3F70 A; 2W10 A; 1Q81 R; 2O01 E; 1WX6 A; 1HYO A; 2LX9 A; 3A1P A; 4JJB A; 2QEX Q; 3RKW A; 2EYY A; 2MK5 A; 2K3B A; 2SRC A; 2O88 A; 3M54 A; 3EG3 A; 2H3J A; 3M0S A; 1UGQ B; 1UGR B; 1QKX A; 2AT1 B; 4LNP A; 1YIJ T; 2GNC A; 3J7A F; 4OB1 B; 2ZAE A; 1WXU A; 1WFW A; 1K76 A; 1RUW A; 5EG2 A; 2E10 A; 1VQ8 T; 1XTD A; 4C5I A; 2KY9 A; 4M7D A; 1M4Z A; 2K2V A; 4JDS A; 1S72 T; 1KC8 C; 3MP8 A; 3NTI A; 1M1K R; 5D7U A; 5CAI A; 2LQ8 A; 1SF9 A; 4FIB A; 4DOW A; 4FT2 A; 1VQN A; 2ESW A; 2LDM A; 2QK0 A; 2O9V A; 1M8M A; 4Q5W A; 4C0D C; 2RQV A; 1GL5 A; 3EG0 A; 3MO8 A; 3V7S A; 2QA4 A; 1G3S A; 2XHC A; 2RJF A; 1G8X A; 3ASK A; 3OYC A; 2LCC A; 5FRO A; 1NJI U; 2DET A; 5LJ5 h; 1M8V A; 2CP5 A; 3HRU A; 4BY6 C; 1DJ7 B; 1KHC A; 3L2V A; 3I9Q A; 1X75 C; 4M7A F; 1KQ2 A; 1R0C B; 2P0P A; 3CC7 A; 2K79 A; 4HVW A; 3V8K A; 1JJ2 P; 1BIB A; 1NYF A; 1I8F A; 6AT1 B; 5FLX E; 3JV3 A; 5LJ5 e; 3V7C A; 1VQ5 Q; 2A28 A; 5I21 A; 1FWZ A; 4IIM A; 4Y92 A; 2EGA A; 3I5R A; 3I55 Q; 3I5S A; 3N5B B; 1VQ9 A; 4M7D B; 4HT8 A; 4E7I A; 1M30 A; 2LZ6 B; 4M7A A; 1Y7X A; 4M7D E; 1WJS A; 1M5Q 1; 1OOT A; 1W70 A; 2JM9 A; 2O4X B; 1PG5 B; 2A08 A; 3SD4 A; 2OTL Q; 2E3H A; 1OPK A; 2X9H A; 5GAN d; 4OMQ A; 3G71 Q; 2NWM A; 3JCM c; 3Q1J A; 4XTZ A; 3A98 A; 4A4H A; 1N8R C; 1RL2 A; 1QW1 A; 3OYY A; 4M77 G; 1CKB A; 3PVL A; 3M4G A; 1I81 A; 3I56 Q; 4OF1 A; 5FRM A; 4BE2 A; 5GAO l; 3VS7 A; 2KDS A; 2LQK A; 3P8H A; 3CCM A; 4LDU A; 1IRE B; 2FRY A; 1K9M C; 1TXQ A; 1Y07 A; 1AHJ B; 2KAF A; 3GOX A; 4PJL A; 2BIV A; 5GAM d; 3CPW A; 3RBB B; 3VRY A; 3FLG A; 1SRL A; 3ME9 A; 2CUB A; 2H8H A; 3SDZ A; 1WHG A; 3M57 A; 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