The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
96
|
structure length |
96
|
Chain Sequence |
GSSGSSGTSKQRYSGKVHLCVARYSYNPFDGPNENPEAELPLTAGKYLYVYGDMDEDGFYEGELLDGQRGLVPSNFVDFVQDNESRLASTSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the first SH3 domain of KIAA0318 protein
rcsb |
| molecule keywords |
RIM binding protein 2
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
5
|
| structure length |
96
|
| sequence length |
96
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-05-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SRM A; 2DM1 A; 1JU5 C; 2CT3 A; 1KIK A; 2H8H A; 3RNJ A; 2K9G A; 3LH5 A; 3PVL A; 5FWC A; 2OI3 A; 2DRM A; 4K11 A; 1VA7 A; 2HCK A; 2BZ8 A; 2OAW A; 3M0U A; 4F14 A; 2EYY A; 1X2K A; 2K6D A; 3I35 A; 2LQN A; 2VWF A; 1H3H A; 2JS0 A; 2DL3 A; 1UUE A; 2CT4 A; 1ZBJ A; 1PRM C; 2EQI A; 1M30 A; 2KEA A; 2EVR A; 1M3C A; 2MIO A; 4AG1 C; 1BU1 A; 4J9I A; 2YUQ A; 4CC7 A; 1NEB A; 1GFD A; 2CUB A; 1NLP C; 3VS0 A; 2HEQ A; 3VS2 A; 2KGT A; 1GCQ A; 1UJ0 A; 1X43 A; 4R0K A; 1OEB A; 3THK A; 1IO6 A; 1RLQ C; 1MV3 A; 1PKT A; 1UHF A; 1W6X A; 1VYU A; 1MV0 B; 2FRW A; 2ED0 A; 2EYW A; 2DA9 A; 2DL4 A; 3NHN A; 2RN8 A; 3REB B; 1FYN A; 2D0N A; 2RNA A; 2SEM A; 2AZS A; 2KT1 A; 2J6F A; 4AFU C; 1WI7 A; 2DBK A; 4JJC A; 3QWY A; 1PHT A; 1BK2 A; 1AOJ A; 1QKW A; 1X6B A; 2LQW A; 2JMC A; 2C0T A; 4AG2 C; 1K9A A; 2PTK A; 2YDL A; 1AWX A; 1CKB A; 2G6F X; 1U3O A; 5EC7 A; 4AFQ C; 1OPK A; 3UA7 A; 2AZV A; 1CSK A; 4LUE A; 2JS2 A; 4FSS A; 1JO8 A; 3VS7 A; 1QCF A; 1K4U S; 1E7O A; 2I0N A; 1GCQ C; 3VS4 A; 1SSH A; 1U06 A; 5HCK A; 3M0P A; 1I07 A; 5IHI A; 2LP5 A; 5FW9 A; 2ENM A; 2DLP A; 4JPB W; 4LN2 A; 2O2O A; 2JTE A; 4Y92 A; 1AD5 A; 1PKS A; 1SPK A; 2C0O A; 3EG0 A; 2JW4 A; 2JM9 A; 1X27 A; 2RMO A; 1M8M A; 1OV3 A; 3O5Z A; 1M3A A; 1UTI A; 2DL7 A; 1G2B A; 1LCK A; 2KRM A; 2KRO A; 2VKN A; 2RQW A; 1ZLM A; 1ABQ A; 4QT7 A; 1SHG A; 2NUZ A; 4D8D A; 1RLP C; 3I5S A; 4LUD A; 3I5R A; 3JV3 A; 3I9Q A; 2KBT A; 2YUN A; 1AWW A; 2KT8 A; 2EGA A; 2RF0 A; 2AK5 A; 1NLO C; 2LJ1 A; 4GBQ A; 4J9F A; 3UAT A; 3PE0 A; 2K79 A; 3NPF A; 2O9S A; 2CSQ A; 1K0X A; 1WDX A; 1GL5 A; 1HD3 A; 2HDA A; 2DYB A; 2EPD A; 2X3W D; 4RTX A; 1HSQ A; 2K2M A; 1GCP A; 1KFZ A; 3M0Q A; 2L0A A; 1QLY A; 1QWF A; 3H0I A; 2KXC A; 1VYV A; 1X2Q A; 1Y0M A; 2RQT A; 2CH4 W; 3EHQ A; 2AKK A; 4F17 A; 4RTU A; 4JZ3 A; 2VVK A; 4OML A; 2LCS A; 1GRI A; 1AEY A; 1PNJ A; 3KFV A; 1I0C A; 2J05 A; 2CUD A; 4DEX A; 2YT6 A; 1T0J A; 2EBP A; 3PVQ A; 1G83 A; 4OMO A; 1UDL A; 2RQV A; 4CC4 B; 5GJW B; 2DL5 A; 1ABO A; 3EGU A; 4J9C A; 1ZX6 A; 2M0Y A; 2X3X D; 2ROT A; 2A36 A; 2J6O A; 2L3S A; 1X69 A; 4JJB A; 3REA B; 2FEI A; 3EG2 A; 4DEY A; 2F2V A; 1OOT A; 4Z88 A; 2YUO A; 3C0C A; 2DBM A; 2KXD A; 2LX7 A; 4RTZ A; 5IHK A; 2LNH B; 2ABL A; 5L23 A; 2DF6 A; 4Z89 A; 2K3B A; 1UHC A; 2EKH A; 4HCK A; 1T3S A; 1TG0 A; 1ZSG A; 4M4Z A; 4RTV A; 1HJD A; 2CSI A; 4OMP A; 3SHW A; 2KRS A; 1M3B A; 3U23 A; 2KYM A; 2ED1 A; 3VS6 A; 1GFC A; 2KRN A; 2DRK A; 2LJ0 A; 5I11 A; 1B07 A; 2DE0 X; 2F2W A; 3VRZ A; 2GTJ A; 2BZY A; 2NWM A; 4J9H A; 1NYG A; 4A63 B; 2EGE A; 1WXT A; 2M51 A; 1I1J A; 2EW3 A; 3VRY A; 1K0S A; 4ZNX A; 1JXO A; 5GJV B; 1M27 C; 2MOX A; 4HVU A; 1CKA A; 4D8K A; 4IIO A; 5IXB A; 1K76 A; 4F16 A; 3M0R A; 2SRC A; 1X6G A; 4KRT A; 2QDL A; 1AWO A; 1RUW A; 2FO0 A; 4HXJ A; 4JJD A; 4LNP A; 1QKX A; 3IQL A; 2A08 A; 4CC2 A; 1AZG B; 1WXB A; 1UEC A; 3GBQ A; 1WFW A; 3H0F A; 1V1C A; 2V1Q A; 1U5S A; 2YSQ A; 1Z9Z A; 2YUP A; 3M0S A; 5IXF A; 2FRY A; 4J9G A; 2LJ3 A; 2EYX A; 2XMF A; 1PWT A; 4ORZ A; 1NM7 A; 2JXB A; 1UE9 A; 3TSW A; 3ULR B; 3M0T A; 2BTT A; 4HVW A; 2EGC A; 3FJ5 A; 4RTY A; 2FG0 A; 1XOV A; 2D8J A; 4OMN A; 1T0H A; 1B3Q A; 1AVZ C; 1W1F A; 2IIM A; 3H0H A; 2EYZ A; 2P4R A; 2O9V A; 2FPD A; 1NG2 A; 1E6G A; 4ESR A; 4HVV A; 2GGR A; 3NMZ C; 5FWB A; 1A0N B; 1KJW A; 1AWJ A; 1YP5 A; 1NYF A; 1QWE A; 2E5K A; 1UJY A; 2DL8 A; 2MCN A; 2F2X A; 1GBQ A; 4RTW A; 2O88 A; 2CH4 A; 2RPN A; 1UG1 A; 3TVT A; 1E6H A; 1EFN A; 1WLP B; 2JM8 A; 2KE9 A; 2OJ2 A; 4GLM A; 1MUZ A; 2DIL A; 1TUD A; 1ARK A; 1VYT A; 1SHF A; 1YCS B; 1UFF A; 1WYX A; 2CRE A; 3H41 A; 3R6N A; 1YWP A; 2GTO A; 1WXU A; 4WCI A; 2AKL A; 4IIM A; 2ESW A; 1GBR A; 3NGP A; 1UGV A; 3SEM A; 1ZUU A; 2B86 A; 4EIK A; 1AZE A; 2RQU A; 2A28 A; 1BB9 A; 1OPL A; 2PNI A; 2GNC A; 3QWX X; 2A37 A; 1W70 A; 1SRL A; 2GBQ A; 1Z9Q A; 3RBB B; 2DNU A; 1S1N A; 2O31 A; 3VS5 A; 2DVJ A; 2J6K A; 2CDT A; 4AFZ C; 5IHN A; 2J06 A; 3EG3 A; 3ZL7 C; 1FMK A; 1ZUK A; 2HBW A; 1T3L A; 2DX1 A; 1PRL C; 2JT4 A; 4J9E A; 1YN8 A; 4AFS C; 2L3Q A; 4OMQ A; 3TSZ A; 2DJQ A; 2W10 A; 2PZ1 A; 2JMA A; 2KNB B; 2V1R A; 1JXM A; 2C0I A; 2FPE A; 1JQQ A; 2L3P A; 3EG1 A; 4J9B A; 4RTT A; 2KR3 A; 2W0Z A; 3VS3 A; 1SEM A; 2ROL A; 2LMJ A; 1H8K A; 3UF4 A; 1N5Z A; 2KYB A; 1ZUY A; 2ECZ A; 1WIE A; 2BZX A; 4RUG A; 2D1X A; 1RI9 A; 1YWO A; 1YNZ A; 2LZ6 B; 2HSP A; 1TUC A; 4J9D A; 5IH2 A; 4E6R A; 4X1V A; 2GQI A; 1H92 A; 2J7I A; 1WA7 A; 4JZ4 A; 1K1Z A; 1JEG A; 2D8H A; 1J3T A; 3A98 A; 5ECA A; 2RQR A; 1NEG A; 1Y57 A; 4Z8A A; 3VS1 A; 4OMM A; 3UA6 A; 2K7A A; 4LE9 A; 5I22 A; 2DMO A; 3CQT A; 1KSW A; 1WX6 A; 3EHR A; 4CC3 A; 1BBZ A; 2FPF A; 2L2P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1KQS P; 4ZN3 A; 3RNJ A; 1NJI U; 2QEX Q; 2KI7 A; 3JCM b; 2K3Y A; 3CPF A; 2DRM A; 1UGR B; 2COW A; 1VA7 A; 4KUL A; 4ZN1 A; 4F14 A; 1HK9 A; 1K8A C; 1Q95 G; 2DL3 A; 2CT4 A; 3TEE A; 2EQI A; 1M30 A; 1Y96 A; 2DKG A; 2KEA A; 5DLQ E; 4M7D C; 1M3C A; 3V7R A; 4CC7 A; 3BDU A; 3OW2 A; 4PFP A; 4CI0 C; 4VUB A; 1WHH A; 2RHI A; 1X43 A; 1UJ0 A; 5LJ3 j; 1W2B A; 2RJD A; 1OEB A; 4JRQ A; 4M75 C; 4X9D A; 1I8F A; 1EZZ B; 1MV3 A; 2DEQ A; 4KT0 E; 1PKT A; 4OVA A; 4M7D F; 5GAN 5; 1WHG A; 2DD5 A; 3JB9 I; 3JCM e; 4OF1 A; 3M55 A; 2NUT B; 2DA9 A; 2KSS A; 2DL4 A; 3RMS A; 1FYN A; 2D0N A; 3UPU A; 2SEM A; 2J6F A; 3M9Q A; 1PHT A; 4M75 F; 4C0D C; 3A8M B; 1YI2 T; 4R56 A; 2ZGW A; 1WHJ A; 4AG2 C; 2HQH A; 2P4T A; 1OPK A; 1RAE B; 2JS2 A; 2MPX C; 4MZM A; 1QVP A; 1JO8 A; 3HRT A; 3KUF A; 1E7O A; 3D7S B; 2I0N A; 1GCQ C; 1WGS A; 1HXD A; 1V29 B; 3M0P A; 5FW9 A; 2ENM A; 2ZPG B; 4JDS A; 2RI2 A; 2MI6 A; 2OTL A; 2C0O A; 2JW4 A; 4EMG A; 1M8M A; 4IKF A; 3O5Z A; 2F5T X; 3CC4 T; 1VIF A; 1C1A A; 3G4S T; 4PJO D; 3PIO A; 3CCE A; 4C0Z A; 4M7D A; 4D8D A; 3OYI A; 4LUD A; 5C6S A; 5FU7 B; 3E9F A; 5CAI A; 1QVG P; 3CCU A; 2QAS A; 4MDW A; 1KD1 C; 3I9Q A; 2VGM A; 4C8Q C; 4PLI A; 1VQ4 A; 2M0O A; 2LT1 A; 2KT8 A; 4M75 A; 1D1C A; 3CC2 A; 3CPW P; 3CD6 T; 4GBQ A; 2E12 A; 3CMA Q; 3FB9 A; 4PLL A; 2K79 A; 2HKN A; 2XG8 D; 1YJN T; 1NJI C; 3NPF A; 4XU0 A; 4J6W A; 3VKI A; 3ASK A; 2MF2 A; 3RR6 A; 3EH1 A; 2DYB A; 4C8Q F; 1U8R A; 2X3W D; 2XD0 A; 3MPU B; 2K2M A; 1YBY A; 2DTI A; 1Y0M A; 1KQS S; 4PNO A; 2AKK A; 4F17 A; 4OML A; 1YIJ Q; 1AEY A; 3M4Y A; 1I0C A; 4II1 A; 3PVQ A; 3UDC A; 2RQV A; 5GJW B; 2DL5 A; 4OMF B; 3OYC A; 4OB3 B; 3ZBD A; 1WHM A; 3P8D A; 2J6O A; 5J3B A; 2E3I A; 5GMK i; 2K2V A; 4JJB A; 3NFC A; 3REA B; 2DBM A; 5IHK A; 4DBR A; 8AT1 B; 2LC4 A; 4Z89 A; 1OX9 A; 4BY6 B; 5GAN e; 1ZSG A; 2AT1 B; 1QW1 A; 4L59 A; 5KYY A; 1HJD A; 3SHW A; 2DIQ A; 2KMT A; 4M75 G; 3G71 Q; 2QGG A; 5HK3 A; 2DRK A; 5D6X A; 4FT4 A; 2CP7 A; 4BE1 A; 1VQM A; 2R57 A; 3OYJ A; 3S3N A; 5LJ3 h; 1M2V B; 3VYG A; 5KYW B; 2M51 A; 1I1J A; 4A4G A; 1VQN Q; 3VRY A; 3OYE A; 4N4H A; 3Q1J A; 1M27 C; 3QYG B; 2K5L A; 1CKA A; 3BW1 A; 2YRD A; 4IIO A; 1Q86 U; 5IXB A; 1Q82 U; 3DLL A; 4ELZ C; 3M5A A; 2O01 E; 2FZK B; 2X4X A; 1XTD A; 1QCN A; 3I56 T; 2DZC A; 4IUP A; 2FO0 A; 4C92 E; 3CCV A; 1VQO A; 1NE8 A; 3OYB A; 2JTF A; 2HD0 A; 1AZG B; 2DYI A; 2OTL Q; 1WXB A; 1ZSZ C; 2LQ8 A; 2QG9 B; 4FW2 A; 1Z9Z A; 5EG2 A; 3MP1 A; 2FRY A; 1BI2 A; 1X6O A; 3MHX A; 2QAZ A; 2XMF A; 1X01 A; 4KH1 B; 3SDZ A; 4A53 A; 3CCR A; 4QVD A; 1QVG S; 4JRK A; 3M56 A; 3G1J A; 3TSW A; 4HVW A; 1PCX A; 1WJS A; 2A7Y A; 2FG0 A; 1B3Q A; 3CPW S; 3VU3 C; 3I55 Q; 3H0H A; 1JBM A; 4C8Q G; 2D0Q B; 2WSF E; 1YIT A; 4ESR A; 4HVV A; 4Y28 E; 1M90 U; 1A0N B; 2DIG A; 4M77 E; 1AWJ A; 5GAN j; 4XU3 A; 1NYF A; 2E5K A; 2V26 A; 3QBY A; 4OB2 B; 1B34 B; 2CP3 A; 2CH4 A; 3CCQ T; 4E7K A; 2GQV A; 2HL3 A; 1E6H A; 2KE9 A; 1IHV A; 5A0D A; 1ARK A; 1TUD A; 4ZGE B; 1SHF A; 1XQH A; 2RI5 A; 5GMK e; 1WXU A; 5GAO m; 1VQP T; 4IIM A; 1SF9 A; 3H6Z A; 4L5G A; 4N4I A; 2P0Q A; 1GBR A; 3JB9 J; 1KQ1 A; 2HQX A; 2CZ1 B; 1HYO A; 2DVE A; 4C92 B; 3JCM h; 3DB4 A; 4RKU E; 2RQU A; 2GF7 A; 3OYM A; 1BB9 A; 1FMV A; 2PNI A; 3QWX X; 3HL8 A; 3M58 A; 5GAN 2; 5FU7 C; 3CC2 T; 2PUK B; 4BUG A; 1Z9Q A; 1I5O B; 2DVJ A; 1WPY A; 2HSE B; 3EFS A; 2J6K A; 1VQ9 Q; 1JB0 E; 1VUB A; 1KHC A; 4HCB A; 3EG3 A; 1M1K U; 5IAY A; 4J6X A; 2ZPH B; 2M16 A; 3GOX A; 4Q5W A; 4V2S A; 2JT4 A; 3TRE A; 3M59 A; 1K9M C; 4J9E A; 1M4Z A; 4AFS C; 2CP6 A; 4EMK B; 2CGH A; 4QQD A; 3CXC P; 2WSC E; 1ZBX A; 5GAN 7; 2DFU A; 2JMA A; 3PMI A; 2L5Q A; 1M1G A; 2KVQ G; 3A5Z B; 1VQ7 A; 2FPE A; 4M77 B; 1Q82 C; 1JQQ A; 4RTT A; 2KR3 A; 4PJJ A; 1EIF A; 2W0Z A; 2YXY A; 3JCM c; 1H8K A; 1PSE A; 3OSV A; 2DEU A; 5CR2 A; 1BI3 A; 1YJW T; 1WIE A; 1RAI B; 4PJM A; 2D1X A; 4RUG A; 1YNZ A; 3GIB A; 4P5N A; 4J9D A; 2EQU A; 2P0P A; 3FLG A; 2J7I A; 2AHJ B; 1VQL T; 3A98 A; 5ECA A; 2RQR A; 2KQW A; 3JCM P; 1MND A; 1YI2 A; 4LE9 A; 4LDU A; 5I22 A; 3CQT A; 3T9N A; 1KSW A; 1WX6 A; 4CC3 A; 4M7D D; 3HKS A; 1NZ9 A; 5GMK j; 2DM1 A; 2E5Q A; 2CT3 A; 3CCV Q; 1VQO Q; 2H8H A; 3CCS Q; 3HRU A; 4BY6 C; 3L2W A; 2BZ8 A; 2K5I A; 5FRM A; 3M0U A; 1M90 C; 1K8A U; 2DET A; 4M75 D; 3GNG A; 3QXE B; 4M7A E; 4N0A C; 2XIC A; 2CZ0 B; 2JS0 A; 1S72 Q; 1PC0 A; 4MML A; 3GP8 A; 1ZBJ A; 3JAM E; 4FW1 A; 4NL2 A; 1LJO A; 2HL5 C; 1M9S A; 2EVR A; 1BU1 A; 1TTH B; 4J9I A; 2BUD A; 3G4S A; 1GFD A; 3CC7 Q; 3C4S A; 2JVV A; 4QVZ A; 1KC8 R; 1WJR A; 2EWN A; 1IGU A; 3X25 B; 2K3X A; 2X51 A; 1W6X A; 1VYU A; 3MKD A; 2FRW A; 2XKO C; 2E70 A; 3NHN A; 3CME Q; 2QI2 A; 2R5M A; 3OMC A; 2AZS A; 5GAN 3; 1YJN A; 3CCR T; 2ZPF B; 1QKW A; 5GAN h; 2CP2 A; 2JMC A; 1JRI A; 5KCO A; 1M1K C; 1K9A A; 2PTK A; 2YDL A; 1AWX A; 1Q7Y C; 2G6F X; 4AFQ C; 3CCL Q; 4JLI A; 5LJ3 d; 4FL6 A; 5LJ5 g; 1VQK A; 5GAO r; 4MZP A; 1YIT T; 2CP0 A; 1U06 A; 4BE2 A; 3RKW A; 1XNI A; 1TU0 B; 3GPL A; 2LP5 A; 4LDX A; 2VC8 A; 4LN2 A; 2O2O A; 5CKH A; 5CK9 A; 2JTE A; 4M7A B; 3OB9 A; 4PJN A; 2JM9 A; 1X27 A; 2RMO A; 2BE9 B; 2AIR B; 1N9S A; 2QQB A; 3VJP A; 4M78 D; 4KGV B; 2KRO A; 4F7U G; 3CXC S; 2VKN A; 5KE3 A; 2KDS A; 4B9X A; 1ZLM A; 2OTJ T; 5KH6 A; 1KQS A; 1RLP C; 3I5S A; 4J7F A; 2XDP A; 1K73 R; 2RB6 A; 2EAY A; 1UGS B; 3EAE A; 1RAA B; 2X4W A; 2KBT A; 3RDV A; 3MEU A; 4KGZ B; 1O75 A; 2EGA A; 2RF0 A; 1RAD B; 2MAM A; 3L2Z A; 2OX7 A; 1NLO C; 1QVF P; 3PIP A; 4EMH A; 2DTH A; 2O9S A; 1UGP B; 4XTU A; 2EPD A; 2MK5 A; 4RTX A; 3F70 A; 1BYM A; 3URG A; 1MNE A; 1D1A A; 1TS9 A; 3H0I A; 4XAX B; 2IPO B; 2ATC B; 2RQT A; 1YI2 Q; 5GAM e; 1PG5 B; 2ZCF B; 3V7C A; 3CCM A; 2LCS A; 1VQ7 T; 1MHN A; 1PNJ A; 4HT8 A; 3KFV A; 2JTM A; 1ACM B; 3BDL A; 2CUD A; 2YT6 A; 3M54 A; 1P92 A; 5D6W A; 4J83 A; 3OYD A; 5FU6 B; 1G83 A; 3I56 A; 4BDZ A; 4BB7 A; 4A4H A; 1UDL A; 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