The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
127
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structure length |
127
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Chain Sequence |
GSSGSSGPIDLITVGSLIELQDSQNPFQYWIVSVIENVGGRLRLRYVGLEDTESYDQWLFYLDYRLRPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPMEVFKDHADLSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the 2nd mbt domain from human KIAA1617 protein
rcsb |
| molecule keywords |
KIAA1617 protein
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| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
19
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| structure length |
127
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| sequence length |
127
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-05-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02820 | MBT | mbt repeat |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4IUU A; 4BDY A; 4E7J A; 2D9T A; 2BUD A; 3DLM A; 4QQG A; 4E7K A; 1N27 A; 2RI3 A; 2R5A A; 2F5K A; 3FC3 A; 3OYC A; 5C0M A; 3QJ6 A; 4IUV A; 3OYK A; 3OYJ A; 2BIV A; 2NLU A; 4IUR A; 3L2V A; 3L2U A; 4E7L A; 2IG0 A; 5KCO A; 3P8D A; 3OYF A; 4BDZ A; 4II1 A; 3H8Z A; 5J26 A; 2X4W A; 3M9Q A; 3UT1 A; 4QVZ A; 2LRQ A; 2FHD A; 3Q1J A; 4ZTF A; 2HQX A; 2K3Y A; 3NTK A; 2QQR A; 3LYI A; 3PMI A; 3LX7 A; 2RJD A; 4BE2 A; 3MP6 A; 2RHU A; 4IUT A; 4N4H A; 4BAC A; 2B8A A; 4BD3 A; 3P8H A; 3BDL A; 4UC4 A; 4B9W A; 4FU6 A; 3OYA A; 4C5H A; 3S3O A; 2EQU A; 3OQ5 A; 2MWO A; 2K3X A; 1XNI A; 3OB9 A; 5KCH A; 3OYD A; 3FDR A; 3L2R A; 3LGF A; 2L3R A; 2WAC A; 3OMC A; 3OS1 A; 3OYN A; 2R57 A; 3QII A; 5FRM A; 3E9F A; 2R58 A; 1OZ3 A; 2R5M A; 2LCC A; 5FRN A; 1KHC A; 4N4G A; 5KE2 A; 4PL6 A; 2E5Q A; 4CRI A; 2L8D A; 5KE3 A; 5CIU A; 5IN1 A; 3MEW A; 2X4Y A; 2M16 A; 2G3R A; 3PFS A; 5D6W A; 4QQD A; 3QBY A; 4NS5 A; 4GY5 A; 3PMT A; 5C6S A; 1WJR A; 4E7I A; 2LDM A; 3OYH A; 3ASK A; 2RHI A; 2GFA A; 2P0K A; 4IUP A; 3S6W A; 2E6N A; 3L42 A; 2M0O A; 3MEV A; 3OYB A; 2HQE A; 4PLL A; 2DIQ A; 3NTH A; 3LLR A; 3KUF A; 4A4F A; 4QQ6 A; 4BE0 A; 3OA6 A; 3OYG A; 1WJQ A; 3MP1 A; 2RHX A; 3PNW C; 4C5E A; 4IKF A; 2BKD N; 1SSF A; 2RO0 A; 4IUQ A; 4HCZ A; 5M9O A; 4N4I A; 3FEO A; 3OYL A; 4ZTJ A; 2LVM A; 3OS2 A; 3MO8 A; 1WGS A; 4A4E A; 2JTF A; 4FL6 A; 2YRV A; 3FLG A; 2CKK A; 5D6Y A; 1WJS A; 2EQK A; 3ME9 A; 3DB3 A; 3LGL A; 5FRO A; 1OYX A; 2X35 A; 3OY9 A; 1G5V A; 4RG2 A; 2RHZ A; 3C4S A; 4L59 A; 2VYT A; 3EAE A; 3QKJ A; 4Z02 A; 2O4X A; 3DB4 A; 2DAQ A; 3S3N A; 5D6X A; 2EQJ A; 1OI1 A; 2RJE A; 2PQW A; 2XDP A; 2RJF A; 3MP8 A; 3ZEH A; 2RHY A; 2O4X B; 3O8V A; 4C5I A; 2QQS A; 1MHN A; 3MET A; 2LTO A; 4QW2 A; 3SD4 A; 4A4H A; 4B9X A; 3CEY A; 3H6Z A; 2GF7 A; 2RI2 A; 2L89 A; 4E7H A; 4EDU A; 4PLI A; 3GOX A; 5IAY A; 4BE1 A; 2XK0 A; 2EKO A; 2EQM A; 3MEA A; 3L2Q A; 2MWP A; 5KH6 A; 4A4G A; 3F70 A; 2DIG A; 4X34 A; 3UWN A; 4OVA A; 4LD6 A; 3NTI A; 3OYI A; 2JZ2 A; 3OS0 A; 1OZ2 A; 4C5G A; 2RJC A; 2X4X A; 3OYM A; 3OMG A; 1RI0 A; 2EFI A; 3S3M A; 4Q5W A; 1H3Z A; 2M1H A; 3MEU A; 3E9G A; 2RI5 A; 3L2W A; 5J39 A; 2GFU A; 3OYE A; 3LH0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1UHC A; 4F16 A; 1N27 A; 2R5A A; 2RM4 A; 3CCM Q; 3OBY A; 1PSF A; 4RCB A; 2FPE A; 1LCK A; 2EJ9 A; 3UA6 A; 2RQW A; 1AVZ C; 1RAD B; 4RCC A; 2DO3 A; 4C92 D; 1N8R U; 2ZPF B; 3HSB A; 3CC4 Q; 1I5O B; 1ZSG A; 1Y07 A; 4J8O A; 2QDY B; 5LL6 S; 1NE8 A; 3CD6 T; 1ZBX A; 4XU3 A; 1K0S A; 3CCQ T; 1QW1 A; 4RTZ A; 1VQN A; 3CCU T; 3BW1 A; 2EIF A; 3FDR A; 4J9I A; 4OMM A; 2KY9 A; 5GAN h; 3I55 T; 4J9E A; 3LW5 E; 1X43 A; 2L8D A; 2OI3 A; 8ATC B; 1SEM A; 1SKU B; 4VUB A; 2VXE A; 2EPD A; 3PVQ A; 2YSQ A; 1W2B S; 4D6W A; 4KUI A; 1AHJ B; 4M78 D; 1YHQ Q; 4IIO A; 1QWE A; 4PLL A; 3U23 A; 2M02 A; 4KGZ B; 2V1Q A; 1RLP C; 3CCM A; 1R0C B; 4JRK A; 2CZ6 B; 3UAT A; 4R55 A; 3M55 A; 1QCN A; 1R8O B; 3WXM B; 4QVD A; 1WHJ A; 3HTR A; 2DTO A; 2OTL Q; 3CC7 A; 3CC2 T; 1ZQ1 A; 1BKB A; 2XID A; 1SHG A; 4OB2 B; 2KXC A; 4EMK B; 4AMC A; 1QP3 A; 2PVG B; 2V8J A; 2SEM A; 5A0D A; 4WF2 A; 4C8Q C; 5KYW B; 5EC7 A; 2K7A A; 2KQW A; 3H6Z A; 4HKE A; 1PRL C; 5KYU B; 4PJJ A; 5KYY B; 4HVU A; 1H64 1; 2JM8 A; 3FIF A; 4PJO B; 2ESW A; 3M0U A; 1PG5 B; 1RLQ C; 2VV5 A; 3F70 A; 3JCM P; 1YHQ A; 7AT1 B; 4M77 A; 3HPW A; 2CH4 A; 3CMA T; 4LNP A; 5L8R E; 3WVE B; 1RI0 A; 2I2L A; 1PD0 A; 3V7S A; 4M77 G; 1VQL Q; 5IHN A; 2QGG A; 2BUD A; 4ZGE B; 1VQ9 T; 1Q81 U; 2YDL A; 1X2K A; 2OTL A; 3OYJ A; 1K76 A; 3QHS A; 3EHR A; 1G2B A; 1OU9 A; 3CXC S; 1M1K R; 5GAN 6; 4M7D C; 1UGV A; 3RNJ A; 4EIK A; 1JO8 A; 3P8H A; 4UC4 A; 1VOM A; 4B9W A; 4O6J A; 2M0Y A; 5KCH A; 1IGQ A; 4M7A A; 1HD3 A; 3E1S A; 1RAC B; 4CC2 A; 1KHC A; 1BI3 A; 3CME Q; 2XDB A; 4M7A G; 2J05 A; 5IN1 A; 4C0D B; 2EWN A; 2KAF A; 4J9F A; 3JCM V; 1OPK A; 4NL2 A; 2LDM A; 3FRN A; 2NUT B; 1VQL A; 2ZZD A; 2DXB A; 2FRY A; 4NOY A; 3OYB A; 4PJM A; 1Y96 A; 2OAU A; 4PJO E; 2ABL A; 1WLP B; 4BUG A; 4IUQ A; 1RAA B; 2V26 A; 8AT1 B; 3EFO B; 3HFN A; 2DMO A; 2CKK A; 2OX7 A; 4BY6 B; 1QVP A; 1KQS A; 1NJI R; 4XU0 A; 1OYX A; 3PIO A; 1LVK A; 2DNU A; 4E47 A; 3C0C A; 1N8R C; 3URG A; 1M27 C; 2CGH A; 2WSF E; 2DXT A; 4QT7 A; 2D6F A; 3GIB A; 3X25 B; 3PVL A; 1Y7X A; 2HAX A; 4X1V A; 3REB B; 4KGX B; 3CME A; 2L89 A; 4B6M A; 4E7H A; 4EDU A; 1OPL A; 2P4R A; 5GAN 5; 2MWP A; 2DIG A; 4GLK A; 1JB0 E; 2DL5 A; 3OYI A; 3FB9 A; 2RH2 A; 2EAY A; 2HZY A; 2QAS A; 2KVQ G; 1WQ7 A; 3CCL T; 4Q5W A; 5A2Q E; 4KBM B; 4HT8 A; 1UJ0 A; 1CKA A; 3A8L B; 3E9G A; 5I2S A; 1BBZ A; 3RR6 A; 4F7U B; 3OYC A; 2ZPE B; 3RKY A; 2EJF A; 4LXC A; 2FEI A; 2NLU A; 2OJ2 A; 2WSC E; 1Y0M A; 1WYX A; 2K9G A; 2XDD A; 2ED1 A; 1AT1 B; 4HCB A; 2FL7 A; 3MP6 A; 1QVG P; 3CPF A; 3T9N A; 4IUT A; 3QSU A; 5LJ3 h; 1DJ7 B; 1PSE A; 2AZS A; 3S3O A; 4F17 A; 2EQU A; 3VS5 A; 2LX7 A; 2Y4X A; 4LUD A; 2H3J A; 2KNB B; 2WAC A; 3HHT B; 1SPK A; 1TUC A; 2L2P A; 1ZUU A; 1Q86 R; 1VIE A; 2OTJ Q; 3NGP A; 2DTH A; 1D3B A; 3VJP A; 1HJD A; 1OOT A; 2E6Z A; 3BY7 A; 1TXQ A; 2F2V A; 3CCR Q; 1K9M U; 1AOJ A; 1KHI A; 1YWP A; 2J6F A; 1I81 A; 4J9H A; 2LC4 A; 1WQW A; 2DYI A; 4IKF A; 2HSE B; 4TVR A; 1D1C A; 1OV3 A; 1T0J A; 2A28 A; 2JTF A; 4CC3 A; 1Q81 C; 5J3B A; 2ZGW A; 1WHK A; 1KSW A; 1YJN T; 2RHZ A; 1Q95 G; 1FXX A; 3H0H A; 4D8D A; 5CCA A; 2K3B A; 1OI1 A; 3QO3 A; 4RUG A; 1XTD A; 2O4X B; 4F7U E; 2VGN A; 4J9D A; 4JPB W; 2MMP A; 3H0F A; 1YI2 A; 4JRI A; 2OTJ A; 2D8J A; 1MND A; 4C8Q B; 3TQ7 P; 5CKH A; 4A4G A; 4X34 A; 2HQH A; 1YJW T; 4JRQ A; 2LNH B; 2AK5 A; 4KUD K; 2HBW A; 4XTX A; 1GFC A; 4JJD A; 4DBR A; 1TU0 B; 2K5I A; 4JDS A; 4LN2 A; 3CPW A; 2CP2 A; 2F5K A; 3EHQ A; 3SWN A; 3VS1 A; 3TEE A; 2BIV A; 5IHI A; 2LP5 A; 1JJ2 A; 4II1 A; 4LDY A; 4DA4 A; 3EGU A; 1TH7 A; 3A8G B; 5DM7 R; 2JOY A; 3EH1 A; 3M5A A; 3OYY A; 4F14 A; 3JCM d; 2NWM A; 4M7D B; 4M7A C; 2VWF A; 1VUB A; 3OMC A; 4XK8 E; 2GBQ A; 2M51 A; 3E9F A; 4N4G A; 2V1R A; 5KE2 A; 5A0L A; 3BFM A; 2YT6 A; 4PJO D; 5L23 A; 2MOX A; 3RMS A; 2EYX A; 1N9S A; 2M9U A; 2E1H A; 4OGC A; 3CCS T; 2D0Q B; 4D8K A; 1X01 A; 2P4T A; 3JB9 F; 3OA6 A; 3M0Q A; 4C8Q E; 1WJQ A; 3MP1 A; 5GAM d; 3SHW A; 3VYG A; 1NPR A; 3E2U A; 2QDL A; 3JCM Q; 2KDS A; 1GRI A; 3G6E A; 2GQV A; 2QXF A; 1NZ9 A; 2E64 A; 5FRO A; 2DD4 A; 3VKI A; 1M90 U; 2HKQ B; 2DAQ A; 1V1C A; 4MML A; 2FZC B; 1U1S A; 1FX7 A; 4XU2 A; 5GAN 3; 3GP8 A; 1MHN A; 5FU7 C; 3MCA B; 2VGM A; 2KYB A; 1TWB A; 1KQS P; 1B34 A; 2EGA A; 4RTV A; 2DL8 A; 3JB9 J; 2ZPB B; 4O5V A; 4QVC A; 3A1P A; 1X6B A; 3UDC A; 4EMK C; 3EGD B; 3CCV Q; 1VQO Q; 4M7D E; 2IVW A; 1QMC A; 2CZ0 B; 2AKL A; 1K9M C; 3CCJ Q; 1B7T A; 1IHW A; 1ZSZ B; 1YP5 A; 2P84 A; 4E7S A; 3ZL7 C; 2HNI A; 5IXF A; 2YXY A; 4PNO A; 2V8I A; 4QQG A; 3HRT A; 3UPU A; 4MZT A; 1WPY A; 5C0M A; 4JRP A; 4IUV A; 2YUQ A; 1ZUK A; 2DL3 A; 1N9R A; 2DF6 A; 3UT1 A; 2E12 A; 4ZTF A; 2FG0 A; 5CQX A; 2QQR A; 3PMI A; 5LJ5 h; 2DKG A; 3ZFJ A; 2O9V A; 2CUB A; 4GLM A; 3R6O A; 1KC8 C; 3CC4 T; 1X6G A; 2DE0 X; 2JS0 A; 4FU6 A; 4NL3 A; 2C0O A; 1XNI A; 2E65 A; 2PZ1 A; 4JZ3 A; 2L3R A; 3VS7 A; 4BB7 A; 3HL8 A; 1D1A A; 2CRE A; 3TCJ A; 2KYM A; 2F2W A; 1IHV A; 4CRI A; 2RK1 A; 3RKW A; 5KE3 A; 5CIU A; 1UTI A; 1VQO A; 2AIR B; 3CCV A; 5D6W A; 4C8Q F; 3CCJ A; 1UEB A; 1X2Q A; 4ORZ A; 1VYV A; 3ASK A; 1Q7Y C; 3JB9 D; 4LDX A; 2JS2 A; 3I35 A; 3VS2 A; 1ZA2 B; 5DLO A; 3OSV A; 1VQP T; 3JCM f; 1UGR B; 2CP5 A; 4X9C A; 1TTH B; 4C5E A; 1VQ5 Q; 4HVV A; 2J7I A; 1MUZ A; 4J9C A; 2XMF A; 5D6Y A; 3P8B B; 3M58 A; 3JCM e; 1M3C A; 1M8V A; 4LUE A; 1RAI B; 4M78 G; 3RER A; 1D0X A; 2RHY A; 4C5I A; 1N8R R; 2HL3 A; 3KXT A; 1YIJ T; 4RTX A; 4DOV A; 5GAM f; 4N0A A; 4M7D F; 2ROT A; 4BE1 A; 4FYW B; 3I56 T; 4ESR A; 2YLC A; 2DTI A; 2P0P A; 2QTX A; 1R77 A; 4FYY B; 3HRS A; 2WSE E; 3VV0 A; 1BIA A; 3OS0 A; 3I5R A; 1LNX A; 4M77 B; 3RIR A; 3SDZ A; 5GAM e; 1VQ5 A; 4R0K A; 2QEX T; 1NLO C; 1GCQ A; 2H8H A; 4DOW A; 2RI5 A; 1MV3 A; 2LMJ A; 1S72 Q; 1W6X A; 4E7J A; 3SWN C; 1G3Y A; 3QDF A; 1JBM A; 2DM1 A; 2J06 A; 2YUO A; 3O5Z A; 3M9Q A; 3UA7 A; 5GAO m; 4MDW A; 1KD1 U; 1ZSZ A; 2JUF A; 1M90 C; 1PCX A; 2DXU A; 3CPW P; 1VQ7 Q; 5KYX A; 3QDR B; 1WHM A; 2RNA A; 3OYA A; 4C5H A; 2X9H A; 1PWT A; 1JJ2 P; 2FRW A; 3QJY A; 3OS1 A; 2EJG A; 5CAI A; 1QVG A; 4HCC A; 2ZPI B; 2COW A; 4C8Q D; 2L5Q A; 4M7A B; 2DET A; 3G4S Q; 1G3T A; 1NPP A; 1RAH B; 2QA4 Q; 4NS5 A; 4FIB A; 1HXD A; 3TSW A; 2RQU A; 1WXU A; 2FZK B; 2BE9 B; 3CC7 Q; 3MEV A; 1S72 A; 2HQE A; 2KRS A; 3KFV A; 4FSX A; 4ZGJ B; 2ED0 A; 3KBG A; 1WXT A; 2HL5 C; 2RO0 A; 1Y96 B; 4HXJ A; 5GAN d; 1YJ9 Q; 2DZ9 A; 2K4Y A; 1MGQ A; 3ME9 A; 1M1G A; 2PNI A; 4M77 E; 3V8K A; 1VQ7 A; 1Q81 R; 4PKC C; 1UB4 A; 1NBE B; 3DB4 A; 5D6X A; 1GBR A; 1VQ4 T; 4M7D D; 3QZ9 B; 3VU3 C; 4QW2 A; 5DY9 A; 3SD4 A; 3JB9 I; 4CC7 A; 1YIT Q; 2V8K A; 3G4S A; 4C0F A; 2YUN A; 4RTW A; 4EMH A; 2QA4 A; 5FU7 B; 3GOX A; 2BZX A; 3EG2 A; 2VB6 A; 1QVF S; 1WIE A; 3L2Q A; 4V2S A; 1ACM B; 1JU5 C; 4J9G A; 4ELY C; 1I4K 1; 3G71 T; 2FB7 A; 2D0N A; 4DQ2 A; 4M7A E; 5KYN A; 1YJ9 A; 4J6X A; 4XTZ A; 3FC3 A; 2DX1 A; 2XI9 A; 2RQV A; 3NMZ C; 3X24 B; 3VS6 A; 4BDZ A; 1UE9 A; 1M5Q 1; 3NHN A; 3QWX X; 3EFR A; 2PUK B; 2XD0 A; 2K3Y A; 3NTK A; 3JAM E; 1MMN A; 2F5T X; 1M4Z A; 4N4H A; 2B8A A; 3A8H B; 2XIC A; 1U5S A; 1D09 B; 2DXC A; 1YIT A; 2CS7 A; 2K57 A; 1W2B A; 4M4Z A; 4FSS A; 1KFZ A; 2BZY A; 5GAO n; 2Y90 A; 4E7Z A; 3OS5 A; 1XJW B; 3MEW A; 2X4Y A; 1M2O A; 2YUP A; 1GXI E; 1UHF A; 4ZN1 A; 2AKK A; 5IXB A; 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