The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
127
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structure length |
127
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Chain Sequence |
GSSGSSGPYNKNGFKVGMKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDGYSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGHKLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFENQNITVIPSGFSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the first mbt domain from human KIAA1798 protein
rcsb |
| molecule keywords |
KIAA1798 protein
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| molecule tags |
Protein binding
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
11
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| structure length |
127
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| sequence length |
127
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-05-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02820 | MBT | mbt repeat |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2D9T A; 5D6X A; 4E7K A; 3F70 A; 4FL6 A; 3DB3 A; 4IUV A; 1WJR A; 2RHU A; 2X4W A; 3FDR A; 3NTK A; 4EDU A; 3L2Q A; 3CEY A; 2RHI A; 1N27 A; 3NTH A; 5IAY A; 4IUR A; 4PLL A; 5C0M A; 2EQK A; 4Q5W A; 3OYM A; 2GF7 A; 2EQU A; 5KCH A; 2LVM A; 2EKO A; 2RO0 A; 3NTI A; 3S3M A; 2FHD A; 3OY9 A; 4IUQ A; 5M9O A; 2F5K A; 2QQS A; 3Q1J A; 2JZ2 A; 4E7L A; 4Z02 A; 4C5I A; 4IUU A; 3MP6 A; 3S3O A; 3E9F A; 4IUP A; 2E5Q A; 4N4I A; 3DLM A; 4ZTJ A; 3LGL A; 3H8Z A; 3QJ6 A; 4QW2 A; 5FRO A; 3FC3 A; 2R58 A; 3M9Q A; 4II1 A; 3S6W A; 3OYL A; 2RI3 A; 5IN1 A; 2O4X A; 4HCZ A; 3OYH A; 3UWN A; 2L8D A; 2X35 A; 4BDY A; 2RI2 A; 4CRI A; 4A4E A; 2RJF A; 4UC4 A; 3MEA A; 3FEO A; 4A4G A; 3LH0 A; 5KE3 A; 4A4H A; 2K3Y A; 3OS1 A; 3EAE A; 3OYF A; 2MWP A; 4E7H A; 4PL6 A; 3OYB A; 4PLI A; 2CKK A; 3OS2 A; 4A4F A; 4LD6 A; 3H6Z A; 4RG2 A; 3OYC A; 2RJE A; 3OYJ A; 2LRQ A; 5J26 A; 3OS0 A; 4BAC A; 3OYN A; 4BD3 A; 2L89 A; 3PNW C; 3OYA A; 3PFS A; 3L42 A; 1WJQ A; 3O8V A; 4OVA A; 4E7I A; 4IKF A; 1MHN A; 4ZTF A; 5KH6 A; 3L2V A; 1XNI A; 3OYI A; 4IUT A; 2RI5 A; 2DIQ A; 2GFA A; 3P8D A; 4QQD A; 4QVZ A; 4QQG A; 4FU6 A; 4C5E A; 5KE2 A; 3SD4 A; 1WJS A; 1OYX A; 2HQX A; 3MO8 A; 4B9X A; 3MEW A; 2R5A A; 2G3R A; 3P8H A; 1WGS A; 5D6Y A; 4E7J A; 2VYT A; 1OZ3 A; 3LYI A; 3L2U A; 3S3N A; 2RHY A; 2RHX A; 1G5V A; 5CIU A; 3QBY A; 2EQJ A; 2R57 A; 3ZEH A; 3OYD A; 3C4S A; 5KCO A; 2NLU A; 2RJC A; 2E6N A; 3OA6 A; 2LCC A; 3LGF A; 3ME9 A; 3MET A; 2GFU A; 3OQ5 A; 1RI0 A; 4C5G A; 1OZ2 A; 3L2R A; 2EQM A; 2RHZ A; 4X34 A; 2K3X A; 3MEU A; 3MP8 A; 2QQR A; 2MWO A; 3KUF A; 3L2W A; 2X4X A; 2XDP A; 2LTO A; 2B8A A; 2BIV A; 1KHC A; 2L3R A; 4BE1 A; 2JTF A; 1H3Z A; 2PQW A; 2XK0 A; 3LX7 A; 4NS5 A; 5FRM A; 4N4G A; 4GY5 A; 2YRV A; 4QQ6 A; 2M0O A; 3OB9 A; 4BE0 A; 4BDZ A; 2DIG A; 2HQE A; 3ASK A; 3OYG A; 3BDL A; 2EFI A; 3OMG A; 3OMC A; 2M16 A; 3PMI A; 4N4H A; 1SSF A; 4BE2 A; 2DAQ A; 2O4X B; 2M1H A; 3FLG A; 3GOX A; 4B9W A; 2R5M A; 2WAC A; 2X4Y A; 4L59 A; 3MP1 A; 2RJD A; 5J39 A; 5FRN A; 2BUD A; 3LLR A; 2P0K A; 1OI1 A; 2LDM A; 3OYE A; 3QII A; 4C5H A; 3PMT A; 3QKJ A; 5D6W A; 3E9G A; 5C6S A; 3MEV A; 2BKD N; 3UT1 A; 3OYK A; 2IG0 A; 3DB4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4FL6 A; 1QMC A; 1RAI B; 3JRZ A; 4PJM A; 2JMA A; 2DTI A; 3G4S T; 2E41 A; 2LVM A; 1NZ9 A; 4EIK A; 3G6E A; 2FZC B; 3MPU B; 5M9O A; 2K2V A; 2ZPF B; 3NMZ C; 1HSQ A; 4FCY A; 1Q81 R; 3JCM J; 4PNO A; 1RAH B; 1JJ2 A; 1VQ7 T; 2OTL Q; 4XTU A; 3OBW A; 1BCM A; 1IGQ A; 1SRL A; 2CP0 A; 2DKG A; 2E64 A; 2K3Y A; 1K8A U; 4V2S A; 1JJ2 S; 3OS2 A; 1AZG B; 5GMK e; 3EG9 A; 1AD5 A; 2XDB A; 2DNU A; 1G3Y A; 5LJ5 f; 3D7S B; 2KT8 A; 1M1K C; 1WJS A; 1AHJ B; 2MCN A; 5GAN e; 3R6N A; 2QTX A; 1WGS A; 4GLK A; 4PFO A; 1W2B P; 3TSZ A; 2BZX A; 4M7A F; 2RHY A; 1G5V A; 1YJ9 T; 2LQW A; 3A8O B; 1KJW A; 3G6E T; 1HK9 A; 1S72 A; 1Q82 C; 1TOV A; 4EMK C; 5KYU B; 5GAO n; 1NJI C; 4DOW A; 3I55 Q; 1WHK A; 2J6K A; 4PJL A; 3HFO A; 1BI0 A; 2L0A A; 2D1X A; 2XDP A; 2X51 A; 2H3J A; 1PM3 A; 5CO7 A; 1H3Z A; 4ZGD B; 2DD5 A; 1U1S A; 4LDY A; 1ZSZ C; 1UEC A; 2EPD A; 2W10 A; 3LW5 E; 2KK4 A; 1Y71 A; 3DLL A; 2EQI A; 1RUW A; 3OW2 A; 1UE9 A; 2KEA A; 1YIT A; 4Y92 A; 1KC8 U; 2OAW A; 2RK1 A; 2DEU A; 1I0C A; 5D6X A; 1AWJ A; 4HT9 A; 3DB3 A; 3NTK A; 2PVG B; 4D8K A; 2KMT A; 2VV5 A; 3HSB A; 3PIP A; 2EQU A; 2ZZD A; 2DLP A; 6AT1 B; 4Z89 A; 1OPL A; 1S72 T; 3VS6 A; 2GQV A; 2HBW A; 1FMW A; 5A0G A; 4N0A C; 3QJ6 A; 4QW2 A; 3M0P A; 4HVU A; 2DXC A; 4XQ3 A; 1WQ7 A; 1IZ6 A; 1CKA A; 1D3B B; 4M7A B; 3WXM B; 2HEQ A; 1WPY A; 1YWO A; 1F1B B; 4JPB W; 4OMN A; 1IO6 A; 3OYC A; 2RJE A; 2DBK A; 3OYN A; 2CDT A; 1YIT T; 5GAN 8; 3L2V A; 3OYI A; 1R0B G; 2DVJ A; 1SG5 A; 4IIM A; 1EZZ B; 2GCX A; 1WHH A; 3SWN B; 2AKK A; 5I11 A; 3M0Q A; 1X2Q A; 4M75 D; 3CCE Q; 4DBR A; 1YIJ A; 4PJO A; 5CR2 A; 5KCO A; 3E2U A; 1MMN A; 4JRK A; 1OZ2 A; 3CCJ T; 2QYZ A; 2QDY B; 2F1L A; 2YUN A; 2L3R A; 4BE1 A; 1LCK A; 1R77 A; 1Q7Y C; 4RG8 A; 3I56 A; 2QAS A; 5FRM A; 2M0O A; 1YWP A; 2BTT A; 1JU5 C; 2XDD A; 1N9R A; 3OMC A; 3CCS Q; 1B3Q A; 1MV0 B; 4AG2 C; 5A0D A; 3CD6 A; 4RUG A; 4B9W A; 1K73 U; 2R5M A; 1I1J A; 2COY A; 4C0G A; 3M56 A; 1O75 A; 2V1R A; 2LC4 A; 3UT1 A; 2YWW A; 3EG9 B; 1AZE A; 3CCU A; 2D9T A; 3CQT A; 5GAO m; 2BZ8 A; 1D0X A; 3I55 A; 1KC8 R; 1BKB A; 4M78 D; 4A54 A; 1M90 R; 4M77 F; 2OTJ Q; 2DRK A; 5IHI A; 5KCH A; 2C0O A; 2OTL T; 3H0H A; 1SKU B; 1MNE A; 3CMA Q; 2DXT A; 4E7L A; 1Q86 C; 1N8R U; 1UG1 A; 2F5T X; 3PGG A; 3ZBD A; 1IHV A; 2DO3 A; 2XMF A; 2DPP B; 2HCK A; 1QWE A; 3TU4 K; 1Y07 A; 5L23 A; 3I56 T; 2V1Q A; 5FU7 B; 1QVG A; 1MUZ A; 1BI3 A; 1FMV A; 4ANJ A; 4E7H A; 1VQO A; 3RER A; 4C0D B; 1E6H A; 1K9M C; 4PJO E; 5CVI A; 2KGT A; 1TUD A; 3VV0 A; 4EMK A; 3O8V A; 1VQP Q; 1VQ4 A; 1VYU A; 1TSF A; 2L5Q A; 4C5E A; 1QVG S; 2FB7 A; 1HXD A; 1SHF A; 4XTY A; 3MO8 A; 1G3S A; 2KSS A; 5CK9 A; 2OI3 A; 5DLQ E; 3I55 T; 4PJN A; 3QG1 A; 2YLB A; 2EQJ A; 2YUO A; 1AVZ C; 4FW1 A; 2P4R A; 1QW1 A; 4BI3 A; 2GFU A; 3CCQ Q; 3CC7 Q; 1ZUY A; 4C8Q C; 1KHC A; 1WHG A; 8ATC B; 4DEX A; 1QVF P; 2NUT A; 5GAO r; 2DZ9 A; 4NL2 A; 3KXT A; 2EYY A; 2M1H A; 1VQ9 Q; 2EAY A; 3FLG A; 3GOX A; 2AKL A; 5FU6 C; 5LJ3 e; 2E12 A; 3MKD A; 2OJ2 A; 2RF0 A; 2RMO A; 2CS7 A; 3KBG A; 1WI7 A; 3CME Q; 1UGS B; 4F04 B; 2I2L A; 1NEB A; 3SHW A; 3CCE A; 2K5I A; 1VQ4 T; 4N0A A; 3MEV A; 1K73 R; 1FXX A; 5EG2 A; 5KYX B; 1SRM A; 1NLP C; 1XJW B; 3CEY A; 3JV3 A; 4HVW A; 3RR6 A; 1YJW Q; 5IAY A; 3GNF B; 2XHC A; 5A2Q E; 1D1C A; 1VQ8 A; 2VVK A; 4IIO A; 3S3M A; 2D8H A; 4N4I A; 4PJO B; 2YUQ A; 4JZ3 A; 1AWX A; 2L3S A; 3CCS A; 1PRM C; 2HZY A; 1WDX A; 2ED0 A; 1PG5 B; 3CCL Q; 2K7A A; 2XKO C; 1N8R R; 2J6F A; 2JXB A; 2KE9 A; 5CKH A; 1TG0 A; 4LD6 A; 2EJG A; 4BAC A; 4BI4 A; 1NEG A; 1W1F A; 2ATC B; 2QTV A; 3NPF A; 3H9N A; 3X28 B; 2EGE A; 4IKF A; 1QCO A; 4XU0 A; 4JS5 A; 3CCE T; 2JJ9 A; 2FRW A; 2VKN A; 4QQD A; 4RTW A; 5EC7 A; 1Z9Z A; 4PK4 A; 4RTX A; 3A5Z B; 2CZ0 B; 1K0X A; 3DKM A; 2E5K A; 4A53 A; 1UDL A; 4HCK A; 3EG2 A; 2KDS A; 3L2U A; 1HYO A; 1KSW A; 1U06 A; 5AYF A; 1CSK A; 3QWY A; 4C92 F; 3BFM A; 1SPK A; 5HY6 A; 2Y4Y A; 4AFU C; 3ME9 A; 3L2R A; 4ZGE B; 3NHN A; 3CCS T; 1AT1 B; 1WXU A; 2QG9 B; 3LX7 A; 2YRV A; 1VQP A; 1QP3 A; 3PT9 A; 1H8K A; 2ZGW A; 3JCM X; 4EPC A; 3MP1 A; 5J39 A; 4ZN1 A; 3EH2 A; 3O5Z A; 2OTJ T; 1BU1 A; 2HNI A; 1LJO A; 2VXE A; 3G6E Q; 2GGR A; 4JLG A; 4EMK B; 1ZA1 B; 3FDR A; 3PVL A; 3JCM e; 2ZAE A; 4M7A D; 3FJP A; 4KRT A; 3CC7 A; 4CI0 C; 2JN0 A; 3OY9 A; 4FT4 A; 1T0J A; 2QQS A; 2W0Z A; 2DTO A; 4IUU A; 2YSQ A; 2GBQ A; 5IXF A; 4M78 G; 1OPK A; 1M5Q 1; 1VQ9 A; 2JUF A; 3OW2 P; 4JRP A; 2X35 A; 3JCM c; 4BDY A; 2AIR B; 2FEI A; 3EG3 A; 4UC4 A; 1RLQ C; 2KNB B; 4C92 B; 1VQP T; 1RAD B; 3JCM V; 4KUL A; 3QJY A; 3C94 A; 2NUT B; 2DL4 A; 4HA8 A; 1BBZ A; 1XNI A; 4F16 A; 3HPW A; 3CPW A; 2X9H A; 4C8Q A; 1S72 Q; 2HQX A; 1Y96 A; 5D6Y A; 4PKC C; 1JO8 A; 4EMG A; 2ROL A; 1Q81 C; 3T9N A; 1GXI E; 3CC7 T; 3CPW S; 2JVV A; 4OML A; 2RJC A; 3ZFJ A; 4Y28 E; 3CCL A; 3M0S A; 1H64 1; 2DM1 A; 1RLP C; 1VQ9 T; 5CKE A; 2JTF A; 2M0Y A; 3X24 B; 2XK0 A; 2L3P A; 5HK0 A; 4BE0 A; 2DIG A; 3CME T; 4LDU A; 2A7Y A; 5GJV B; 2KRS A; 2PNI A; 2CP2 A; 1KIK A; 2CZ1 B; 1WA7 A; 4CC2 A; 1UHF A; 4C5H A; 4M7D F; 1YJW T; 3QKJ A; 5C6S A; 2BKD N; 3DB4 A; 2LQK A; 1QVP A; 4RTZ A; 2EJ9 A; 4E6R A; 1M3C A; 2A0F B; 3GP8 A; 1XTD A; 4MDW A; 1MV3 A; 2RO0 A; 3TVT A; 1UHC A; 2K9G A; 3MJX A; 3CCL T; 3CXC S; 3AHU A; 2YUP A; 1TS9 A; 2JMC A; 5I2M A; 1MGQ A; 2K57 A; 2R58 A; 2XD0 A; 4AFQ C; 4LD9 K; 1NE8 A; 2CH4 A; 3LWH A; 2O4X A; 1I81 A; 2L8D A; 3UA6 A; 1OUL A; 4C8Q E; 2CZ6 B; 2JTM A; 3J7A F; 5LJ5 e; 2EW3 A; 5KE3 A; 1OU8 A; 3EGD B; 1IRX A; 2JNG A; 3OS1 A; 3OYF A; 3G71 Q; 5GAM g; 4OMQ A; 4PLI A; 3H6Z A; 2EBP A; 4J5Y A; 1AOJ A; 4L6V 5; 4OP0 A; 1YIJ Q; 2YT6 A; 1E7O A; 2HAX A; 3CBO A; 3M54 A; 3V8K A; 2GTJ A; 1C6V X; 2XI9 A; 4MMK A; 4C8Q G; 4F7U A; 1X75 C; 4M77 D; 3S3N A; 2RHX A; 2B86 A; 3QZ5 B; 3HRU A; 1M30 A; 4B6M A; 2BE7 D; 2R57 A; 2VUB A; 3I56 Q; 4M7D B; 2AZS A; 2QEX A; 4LE9 A; 5GAM j; 1PD1 A; 4R55 A; 4ZN3 A; 1M2V A; 3CD6 Q; 1U3O A; 2B8A A; 1ABQ A; 1YP5 A; 4FSS A; 2CYZ B; 2H8H A; 2PQW A; 2LJ1 A; 3OSS C; 3L1A A; 2RNA A; 3VU3 C; 3OYG A; 3NGP A; 2KQW A; 3U23 A; 1JXM A; 2VAS A; 2X4J A; 1K8A C; 3CCU Q; 2WSC E; 4L59 A; 2RD1 A; 3LLR A; 2HL5 C; 2M9U A; 3RES A; 1GCP A; 2YXY A; 4E47 A; 1YBY A; 1PNJ A; 1G2B A; 1VQ5 A; 3E1S A; 5CCA A; 1TTH B; 3EHR A; 1KHI A; 4J83 A; 1RAA B; 5GAN 4; 2QA4 A; 1UFF A; 2SEM A; 3C12 A; 2GNC A; 1YN8 A; 2DK3 A; 2PZ1 A; 4M75 C; 1BCO A; 3E9F A; 2LNV A; 2QEX T; 4AFS C; 1M90 U; 3FC3 A; 3M9Q A; 3EFR A; 3S6W A; 1VQO Q; 2QGF B; 4BY6 C; 3CBP A; 2OAU A; 2YLC A; 3EGX A; 5I21 A; 2DER A; 3M57 A; 1NPR A; 3URG A; 3UPU A; 1VQ4 Q; 3EAE A; 4PJJ A; 4F7U E; 4EMH A; 1WHM A; 2MI6 A; 3HRS A; 4J7F A; 3OYA A; 2MPX C; 2CUB A; 2RPN A; 1M1G A; 2RI5 A; 1VQK A; 1KC8 C; 4MZT A; 2HBP A; 1VQ5 T; 2LCL A; 4B9X A; 2HSP A; 2ZPG B; 1KQ2 A; 3EFO B; 2QA4 T; 3PE0 A; 3LYI A; 1B34 B; 3QWX X; 3THK A; 3A8L B; 5GAN 3; 2RQU A; 2WSE E; 1VYT A; 4F7U G; 3JB9 F; 4M78 C; 3V8J A; 2BZY A; 2RHZ A; 2CT3 A; 2LJ0 A; 1ACM B; 3KUF A; 3G71 A; 2QK0 A; 2BIV A; 2LQ8 A; 1KQS A; 1TUC A; 4HCC A; 2KXC A; 4JRQ A; 3X20 B; 2E1H A; 2O4X B; 1NBE B; 4OB3 B; 1M3A A; 1QQJ A; 4LUD A; 1VUB A; 1M27 C; 3VS4 A; 1PWT A; 2DA9 A; 2ENM A; 1VQL A; 2FG0 A; 5KYW A; 1OI1 A; 1KQS S; 4L5G A; 1VQK T; 3RKY A; 4JJC A; 3H0F A; 1VQ8 Q; 1B07 A; 1UEB A; 3VJP A; 4LDV A; 4R0K A; 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