The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
68
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structure length |
68
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Chain Sequence |
GSSGSSGLKMQVLYEFEARNPRELTVVQGEKLEVLDHSKRWWLVKNEAGRSGYIPSNILEPLSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of human hypothetical protein FLJ21522
rcsb |
| molecule keywords |
Hypothetical protein FLJ21522
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| total genus |
6
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| structure length |
68
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| sequence length |
68
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-02-01 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SEM A; 2DLP A; 2CH4 A; 1YP5 A; 2LJ0 A; 2OI3 A; 2KYB A; 4OMP A; 3U23 A; 2LNH B; 2EYZ A; 4Z88 A; 4M4Z A; 2EYY A; 1JU5 C; 2KT1 A; 3UA6 A; 1Z9Q A; 1OPK A; 2F2X A; 3THK A; 1OV3 A; 5EC7 A; 2O2O A; 2DBK A; 3EG0 A; 3H0F A; 1FYN A; 2O9V A; 2L3Q A; 1AZE A; 2YT6 A; 1GRI A; 4CC2 A; 3I5R A; 2A08 A; 3VS4 A; 1UHF A; 1OPL A; 2EYX A; 2LJ1 A; 2PZ1 A; 1WFW A; 1ZSG A; 4FSS A; 3SEM A; 2FO0 A; 1GCQ C; 2J6F A; 1I0C A; 1X2Q A; 3EHR A; 3ULR B; 1K76 A; 3QWY A; 3GBQ A; 1MV0 B; 5I11 A; 4RUG A; 2V1Q A; 4AFS C; 1K0X A; 2EGC A; 1MUZ A; 3JV3 A; 2DM1 A; 1KJW A; 1U06 A; 2KBT A; 2GGR A; 5FW9 A; 2AZS A; 1GCP A; 2EKH A; 2AKK A; 4LUE A; 1YNZ A; 2LCS A; 5I22 A; 1RI9 A; 4JJC A; 1WLP B; 1JEG A; 1PNJ A; 1WDX A; 4X1V A; 4RTT A; 2YDL A; 1M3A A; 2K6D A; 2C0T A; 1BK2 A; 2J6O A; 1K4U S; 1SHF A; 3CQT A; 1AEY A; 2YUP A; 1KIK A; 2VVK A; 2IIM A; 1AWW A; 4WCI A; 3QWX X; 2DA9 A; 2DL4 A; 2W10 A; 2CRE A; 4HXJ A; 2DE0 X; 2G6F X; 2M0Y A; 3VS0 A; 2K7A A; 4IIO A; 1S1N A; 1ARK A; 2JM9 A; 2K9G A; 3I9Q A; 1V1C A; 2XMF A; 2GQI A; 2HEQ A; 1UTI A; 2GNC A; 2VKN A; 1H92 A; 2VWF A; 1J3T A; 2LZ6 B; 4JJB A; 2YUQ A; 2YUN A; 2L2P A; 4AG1 C; 3PVQ A; 1K0S A; 1UE9 A; 2HCK A; 3VRY A; 1X69 A; 2C0O A; 4J9D A; 4J9E A; 2ECZ A; 2JXB A; 4OML A; 2EPD A; 1E6H A; 3RBB B; 1CKA A; 2CH4 W; 4Y92 A; 1JO8 A; 4JZ4 A; 3VS7 A; 1K9A A; 2LQN A; 2A36 A; 2BTT A; 2YSQ A; 1TG0 A; 3EHQ A; 1UGV A; 2LJ3 A; 5FWC A; 1PHT A; 2KXD A; 3TVT A; 1GBQ A; 3VS6 A; 1SRL A; 1VYT A; 1RUW A; 1SRM A; 2D1X A; 2DRM A; 1UG1 A; 1FMK A; 4QT7 A; 1M3C A; 2AZV A; 1Y57 A; 2NWM A; 2LX7 A; 2CUB A; 5IXB A; 1JXM A; 4K11 A; 2LMJ A; 1QCF A; 1YN8 A; 2DNU A; 4D8K A; 2PTK A; 2KXC A; 3SHW A; 1BU1 A; 1YWO A; 2KNB B; 2CSQ A; 4RTV A; 1W6X A; 3H41 A; 2A28 A; 2CDT A; 1YWP A; 2BZY A; 4LNP A; 2JMC A; 2X3X D; 1X6G A; 4HVW A; 4AFU C; 2KGT A; 3M0P A; 4DEY A; 1ZLM A; 2DF6 A; 4J9I A; 2DBM A; 4IIM A; 1AWX A; 2GTJ A; 2J05 A; 1B07 A; 4LN2 A; 2E5K A; 2DJQ A; 2YUO A; 4R0K A; 3M0R A; 4JJD A; 4HVU A; 2RQR A; 1PKS A; 2JT4 A; 2O88 A; 1UHC A; 2ROT A; 4CC3 A; 4D8D A; 2OAW A; 1NYF A; 1GFD A; 2FRW A; 1T3L A; 1W70 A; 4RTY A; 2P4R A; 2V1R A; 1Z9Z A; 4J9G A; 2KYM A; 2PNI A; 1E7O A; 2AKL A; 4OMQ A; 1IO6 A; 1TUC A; 4E6R A; 2HBW A; 2EBP A; 1UJ0 A; 1K1Z A; 2CSI A; 1X2K A; 4J9B A; 5L23 A; 2KR3 A; 2CT3 A; 2SRC A; 4ESR A; 3IQL A; 1I07 A; 2DL5 A; 1QKX A; 1T0H A; 1M27 C; 3KFV A; 1CKB A; 2DRK A; 2O31 A; 5ECA A; 2RQW A; 3EG2 A; 2D8J A; 1G83 A; 1PKT A; 1Y0M A; 1H8K A; 1H3H A; 1BBZ A; 2CT4 A; 2L3S A; 4GBQ A; 2MCN A; 1NM7 A; 4LE9 A; 1SHG A; 1HSQ A; 2DMO A; 2RQU A; 2B86 A; 3VS5 A; 3EGU A; 1AVZ C; 1GFC A; 2EW3 A; 3M0T A; 1PRM C; 4J9H A; 1WXU A; 2AK5 A; 2EYW A; 1X43 A; 3VS1 A; 3TSZ A; 2K79 A; 4RTU A; 1JXO A; 4F16 A; 5IH2 A; 2X3W D; 1HJD A; 2ABL A; 4ZNX A; 2J6K A; 1GL5 A; 5IXF A; 2DX1 A; 1QWF A; 4OMO A; 3REA B; 4RTZ A; 3NPF A; 3M0U A; 2RPN A; 4HCK A; 2DL3 A; 1X6B A; 2GBQ A; 1VYU A; 1HD3 A; 1WXB A; 2J06 A; 1OOT A; 2JS0 A; 3REB B; 3H0H A; 3RNJ A; 2DYB A; 1GBR A; 3A98 A; 1G2B A; 1MV3 A; 1RLQ C; 2ESW A; 2H8H A; 1TUD A; 2KRM A; 3M0S A; 4CC7 A; 1NEG A; 1A0N B; 4RTX A; 1EFN A; 1T3S A; 1KSW A; 2JTE A; 1AD5 A; 2RQV A; 5HCK A; 3EG1 A; 2C0I A; 1NG2 A; 2BZ8 A; 1BB9 A; 1ABO A; 2MOX A; 4AFZ C; 1U5S A; 1M3B A; 1NLO C; 1RLP C; 2K3B A; 1WIE A; 2DVJ A; 2FRY A; 2D0N A; 2A37 A; 1B3Q A; 4A63 B; 2K2M A; 2KRN A; 1CSK A; 1UEC A; 1AWJ A; 1LCK A; 3EG3 A; 4KRT A; 2M51 A; 1AWO A; 2L3P A; 5GJW B; 2FEI A; 5IHI A; 2RMO A; 3PVL A; 1QLY A; 3H0I A; 4CC4 B; 2RF0 A; 2FPD A; 3VS2 A; 2JMA A; 2J7I A; 4EIK A; 1PRL C; 4F17 A; 1W1F A; 2EVR A; 2O9S A; 1UFF A; 2W0Z A; 2KRS A; 1AZG B; 5GJV B; 2ED1 A; 2ROL A; 3VS3 A; 1JQQ A; 2QDL A; 4J9F A; 3UAT A; 1ABQ A; 4HVV A; 2RN8 A; 3NMZ C; 3PE0 A; 1YCS B; 2OJ2 A; 2FPF A; 4AFQ C; 1SPK A; 1UUE A; 1WA7 A; 4RTW A; 1WI7 A; 2KT8 A; 4ORZ A; 2FPE A; 5IHK A; 2SEM A; 1NEB A; 3TSW A; 2JS2 A; 5FWB A; 2JM8 A; 2ED0 A; 2I0N A; 2HSP A; 3UA7 A; 4LUD A; 4AG2 C; 2KE9 A; 2NUZ A; 1WXT A; 1ZBJ A; 1ZUU A; 4Z89 A; 2CUD A; 1T0J A; 1WYX A; 2BZX A; 2LQW A; 1AOJ A; 1UJY A; 2KRO A; 3UF4 A; 1N5Z A; 3O5Z A; 3ZL7 C; 2EQI A; 2GTO A; 4OMN A; 3VRZ A; 1ZUY A; 2EGA A; 3NHN A; 1E6G A; 4GLM A; 1M8M A; 4JZ3 A; 1SSH A; 3I35 A; 3R6N A; 2DL7 A; 1ZUK A; 1VYV A; 2FG0 A; 2DL8 A; 3M0Q A; 4J9C A; 4OMM A; 2F2V A; 2DIL A; 1KFZ A; 1ZX6 A; 2F2W A; 1QWE A; 1I1J A; 1M30 A; 2KEA A; 2L0A A; 5IHN A; 1NLP C; 4F14 A; 2RNA A; 4Z8A A; 1PWT A; 2MIO A; 2ENM A; 4JPB W; 2LP5 A; 2RQT A; 2EGE A; 1X27 A; 1GCQ A; 3C0C A; 1UDL A; 1XOV A; 3LH5 A; 2D8H A; 1OEB A; 4DEX A; 3I5S A; 1VA7 A; 2HDA A; 2JW4 A; 1NYG A; 3NGP A; 1QKW A; 1U3O A; 1WX6 A; 3FJ5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1JB0 E; 2CH4 A; 3OBY A; 2KYB A; 3U23 A; 3NTK A; 1EX4 A; 4M4Z A; 3CCQ A; 1IRX A; 1Z9Q A; 1IHV A; 5FU6 C; 3G6E T; 2FHD A; 1R0B G; 3KUF A; 4HT8 A; 3EG0 A; 3M53 A; 2O01 E; 5C0M A; 1XNI A; 1U1T A; 1YHQ T; 1GRI A; 7AT1 B; 2PUO B; 4CC2 A; 3I5R A; 3JCM V; 5IAY A; 2LJ1 A; 3JSC A; 1GCQ C; 3G6E A; 3DLM A; 1I0C A; 3OS0 A; 5CKD A; 4M75 C; 3HPW A; 3OBW A; 1YHQ A; 1MV0 B; 4M75 G; 1MUZ A; 2PUK B; 4MDW A; 4N4G A; 1WHL A; 1SF9 A; 1KK7 A; 1QVF A; 4M77 D; 3V8L A; 5A0L A; 1MMG A; 4F7U A; 3PFS A; 3VKI A; 4X1V A; 4C0D B; 5KYY A; 1VQP Q; 2DZ9 A; 3MO8 A; 2J6O A; 1JJ2 A; 3M54 A; 1KIK A; 4ME7 A; 1N8R R; 2YXY A; 1X75 C; 1AWW A; 4BY6 C; 2CRE A; 2G6F X; 4IIO A; 4JDS A; 2JM9 A; 1M1G A; 1V1C A; 1FMW A; 2BE7 D; 4KGV B; 3G6E Q; 2VWF A; 1TWB A; 5CQX A; 2RD1 A; 4RG2 A; 3J81 E; 4PJM A; 2DJZ A; 2L2P A; 2VXF A; 1K0S A; 3PVQ A; 1M90 C; 3HL8 A; 2HCK A; 3VRY A; 1X69 A; 3E9G A; 2QQB A; 2RJE A; 4KGX B; 2QGF B; 4BDZ A; 1MMA A; 4Y92 A; 2F5K A; 3VS7 A; 4BUG A; 1K9A A; 2YHT A; 1LOJ A; 2BTT A; 1RAA B; 1BI3 A; 1P92 A; 5FWC A; 2HL3 A; 3PMI A; 2KXD A; 1VUB A; 4KUI A; 3QO3 A; 4M77 G; 1K9M U; 1KQS P; 2D1X A; 2A7Y A; 3QBY A; 3M56 A; 2NWM A; 2RJD A; 5FRN A; 1LNX A; 2V8I A; 3JCM b; 3EFR A; 3OS1 A; 1YN8 A; 1C6V X; 2DNU A; 4ZN3 A; 2QK0 A; 3A8M B; 4JS4 A; 4XAX B; 4M78 F; 3SHW A; 3M4G A; 4HKE A; 4ZTF A; 4M7D D; 2MMP A; 3HP9 A; 2X35 A; 3UDC A; 1QP3 A; 1KC8 C; 3H41 A; 2A28 A; 2CDT A; 3JCM g; 4QQ6 A; 3LX7 A; 5KYW A; 3CCE T; 4F04 B; 2KGT A; 3M0P A; 1ZLM A; 3RES A; 4FYX B; 5FLX E; 5GAO l; 4BE2 A; 3GNF B; 3OYY A; 5KYY B; 3PT9 A; 5GAM d; 5GAN 4; 1YJ9 Q; 3CME Q; 3CCE A; 3OMG A; 3QJY A; 2QQA A; 4L5G A; 4XTW A; 3MEW A; 1N9R A; 4PJN A; 2DD5 A; 3L2Q A; 2OAW A; 1KC8 R; 1T3L A; 2RK2 A; 3TEE A; 1G8X A; 3MEU A; 4FYV B; 2V1R A; 4M7A F; 2GF7 A; 2XD0 A; 4M77 E; 1NJI C; 2HBW A; 2MYS A; 4LDX A; 3HFN A; 2MI6 A; 2CSI A; 5D6X A; 1N8R U; 1VQK T; 2SRC A; 3NTH A; 5AT1 B; 2DL5 A; 1M9S A; 2E12 A; 1QKX A; 4RKU E; 2ZPF B; 4GY5 A; 1PKT A; 3MEV A; 3CCJ T; 3FB9 A; 3OYH A; 2Y90 A; 3VUZ A; 1K73 C; 1VQK A; 2L3S A; 5FRM A; 4EMH A; 3LYI A; 1MNE A; 5FU7 B; 3CCJ A; 2DEU A; 4CI0 C; 1GFC A; 1RI0 A; 3G1J A; 3ER0 A; 3BW1 A; 1TXQ A; 3M9Q A; 4LD6 A; 3A8O B; 3PNW C; 2I2L A; 4F16 A; 4PJO D; 3G7Z A; 3FLG A; 5KYU B; 2OTJ Q; 4X34 A; 2FZC B; 2WSC E; 4F7U F; 4OB2 B; 1ZSZ A; 3MCA B; 5CIU A; 4C5H A; 2E64 A; 2K5F A; 1HD3 A; 2P0P A; 5GAO p; 1VQ7 T; 1OOT A; 2D9T A; 3RNJ A; 2DYB A; 1UGQ B; 1VIE A; 2ZPE B; 4HCZ A; 2M9U A; 2XG8 D; 1M1K R; 1PSF A; 1VQK Q; 3M55 A; 3BY7 A; 1EIF A; 4DOW A; 1U8R A; 3MKD A; 4IUR A; 4OP0 A; 1VQ7 A; 5IN1 A; 2HMA A; 5KYN A; 1LPL A; 1ACM B; 2BZ8 A; 2K5L A; 2QA4 T; 2CP2 A; 4M7D E; 4NOY A; 3OYN A; 5J3B A; 4XK8 E; 1RLP C; 5CAI A; 4XTY A; 2FRY A; 2OX7 A; 2ZGW A; 3JCM f; 1U1S A; 1NPR A; 3I55 T; 2DO3 A; 3VJP A; 3CCV Q; 1UEC A; 4KRT A; 2QA4 A; 4BI3 A; 1RAB B; 3CBP A; 1M2V A; 2QAS A; 1UGS B; 5GAM g; 2K57 A; 3H0I A; 4PJO G; 1YIJ T; 1VQL T; 3I55 A; 2QQS A; 2LCL A; 4F17 A; 5CKH A; 1UFF A; 1RAC B; 1AZG B; 1VQ7 Q; 1MHN A; 2L8D A; 2DFU A; 1YIJ A; 3UAT A; 1Q86 C; 1ABQ A; 1VQL A; 3CC4 Q; 2RN8 A; 1SPK A; 1KQ2 A; 2VB6 A; 1WI7 A; 3OSV A; 3QPH A; 1VQ4 T; 2JS2 A; 4N0A C; 1JRI A; 4Z02 A; 2GQV A; 2ED0 A; 2CGH A; 4JRP A; 2FZK B; 2KE9 A; 4P5N A; 4E7Z A; 1ZUU A; 4Z89 A; 2QA4 Q; 1KG1 A; 1TTH B; 2F5T X; 2LQW A; 1AOJ A; 2CP6 A; 1VQ4 A; 1ZSZ B; 3UF4 A; 5KCH A; 3JB9 F; 3O5Z A; 3ZL7 C; 1D3B A; 1Q82 U; 1KQS S; 3LWI A; 4C8Q A; 3I55 Q; 8AT1 B; 3CC2 T; 2K3Y A; 2DPP B; 3HFO A; 3GPL A; 1I8F A; 3LW5 E; 1NZ9 A; 1YJW T; 1VYV A; 3M0Q A; 2WSE E; 1D1C A; 1WHH A; 3I56 T; 2F2V A; 3A8L B; 1YIJ Q; 1Y07 A; 1VQL Q; 4BE1 A; 3CC2 A; 4J7F A; 1VQN Q; 2EYQ A; 1G3W A; 4PJO E; 4MZP A; 3O8V A; 4M78 C; 1YJW A; 2ZPH B; 1VQ9 Q; 4L59 A; 5GAO m; 3QYH B; 3CCL Q; 3I56 A; 4OB0 B; 2LP5 A; 3ME9 A; 3V7R A; 2EGE A; 1X27 A; 3BDL A; 2DIQ A; 3OS2 A; 3UT1 A; 1UDL A; 1OEB A; 1M4Z A; 1VA7 A; 4E47 A; 1NYG A; 1VQ4 Q; 2ATC B; 1U3O A; 2JNG A; 3OS5 A; 1S72 T; 1M1F A; 2DLP A; 2OI3 A; 2LNH B; 2EYY A; 1IB8 A; 4B6M A; 1JU5 C; 3UA6 A; 1OPK A; 2F2X A; 4HCC A; 4J6Y A; 1Q7Y U; 3H0F A; 1FYN A; 1S72 A; 2O9V A; 2L3Q A; 2ZPG B; 4R55 A; 1JJ2 S; 3EG9 A; 5HY6 A; 1ZA2 B; 3CCM Q; 3QUI A; 2A08 A; 4QQD A; 3SWN C; 1OPL A; 2XDP A; 4M7D B; 1UGR B; 2PZ1 A; 1UEB A; 1WFW A; 1ZSG A; 2K3X A; 4FSS A; 3SEM A; 4DBF A; 4M7A C; 3EHR A; 3ULR B; 3QWY A; 3GBQ A; 3CMA T; 5I11 A; 2EJ9 A; 4M7A G; 1K0X A; 4L6V 5; 2JVV A; 1Q95 G; 1FXX A; 1LJO A; 3N5B B; 2KBT A; 1GCP A; 2EKH A; 2AKK A; 4A53 A; 3CMA A; 1YNZ A; 2LCS A; 2JOY A; 1IXD A; 4JJC A; 1WLP B; 1WDX A; 2DYI A; 3OA6 A; 4RTT A; 1WZO A; 4J83 A; 1BK2 A; 1K4U S; 3JCM X; 2Y4Y A; 4C5I A; 4HXJ A; 3CEY A; 1PSE A; 3V8J A; 2IVW A; 1S1N A; 5LJ5 d; 3OYG A; 2O4X B; 2DTH A; 4C92 E; 1QW1 A; 2HEQ A; 3X25 B; 2AHJ B; 2VKN A; 1K9M C; 2RJF A; 3WVE B; 4BE0 A; 4LDW A; 4AG1 C; 3WXM B; 5LJ3 j; 2CZ7 B; 3QXE B; 2JXB A; 4OML A; 2MF2 A; 5CO7 A; 1QQJ A; 4D6W A; 2LQN A; 2VUB A; 2L3R A; 2YSQ A; 2HQX A; 3RKW A; 1TG0 A; 3EHQ A; 1K9M R; 2YRC A; 2AIR B; 4OGC A; 5J39 A; 5C6S A; 1OZ3 A; 4PJO B; 2CYZ B; 1VYT A; 1KQS A; 5KYX A; 2DRM A; 1YJN T; 3GF5 A; 3EG9 B; 5LJ3 h; 3RER A; 3JB9 D; 2CUB A; 5GAN 3; 2DKG A; 1QCF A; 3CCS Q; 2LTO A; 2KDS A; 1YJN A; 4RCB A; 4HT9 A; 2HQE A; 5GAN d; 1SG5 A; 2OAU A; 2P0K A; 2R5M A; 4C8Q F; 1VQ6 T; 4LNP A; 1AT1 B; 3INZ A; 4HVW A; 1VQ5 T; 3RMS A; 1N8R C; 1AWX A; 2KSS A; 4LN2 A; 2E5K A; 1VQ6 A; 2QI2 A; 3M0R A; 4J8O A; 1VQM Q; 4JJD A; 2DTI A; 1VQ5 A; 1W2B P; 2RQR A; 1PKS A; 1UHC A; 2ROT A; 4D8D A; 4IKF A; 2HZY A; 1K8A R; 1GFD A; 1PD1 A; 3HRU A; 3JCM e; 2MWO A; 1RL2 A; 4B9X A; 3PIO A; 4KGZ B; 3Q1J A; 3CCQ Q; 3EH2 A; 2PNI A; 4RG8 A; 4DBR A; 2AKL A; 2EQJ A; 4FM4 B; 3L2V A; 3FEO A; 2KK4 A; 1QMC A; 4JRI A; 1X6O A; 1UJ0 A; 4J9B A; 5AYF A; 4ZTJ A; 2JJ9 A; 3IQL A; 3JB9 G; 1T0H A; 3OYA A; 3PTA A; 2RQW A; 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