The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
88
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structure length |
88
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Chain Sequence |
GSSGSSGSEIQLNNKVARKVRALYDFEAVEDNELTFKHGEIIIVLDDSDANWWKGENHRGIGLFPSNFVTTNLNIETEAAAVSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of the Signal transducing adaptor molecule 2
rcsb |
| molecule keywords |
Signal transducing adapter molecule 2
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| total genus |
6
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| structure length |
88
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| sequence length |
88
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-04-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LQW A; 1SSH A; 1U06 A; 3VS6 A; 2BZY A; 1Z9Q A; 1UJY A; 2AZV A; 2HDA A; 2LP5 A; 2DIL A; 1SEM A; 2RF0 A; 3UA6 A; 1B07 A; 1SPK A; 5FWC A; 2X3X D; 1ZSG A; 1SRL A; 4QT7 A; 1G83 A; 3H0F A; 3VS0 A; 2BZX A; 2CSQ A; 4Z8A A; 1NEB A; 2MCN A; 1QCF A; 4HVV A; 5I22 A; 1FYN A; 1CSK A; 2YSQ A; 2LX7 A; 4J9H A; 3UAT A; 1OV3 A; 3I5S A; 4WCI A; 4D8D A; 2F2W A; 4GLM A; 4RTU A; 4HVW A; 4JJC A; 1BU1 A; 4J9I A; 1GL5 A; 1JO8 A; 2A08 A; 2YUQ A; 2DNU A; 1AWX A; 5IHK A; 1W1F A; 1UHC A; 1Z9Z A; 1X2K A; 1UHF A; 1TUD A; 2CUB A; 2KXD A; 2DX1 A; 2ED1 A; 1GFD A; 1KSW A; 1ARK A; 1OOT A; 1A0N B; 2RQR A; 2DJQ A; 2DL7 A; 4F14 A; 3TVT A; 1QKX A; 4OML A; 3I5R A; 2EVR A; 2DRK A; 1MUZ A; 1YNZ A; 2OJ2 A; 1VYV A; 2KRS A; 4ORZ A; 2M51 A; 2GNC A; 1Y57 A; 2KGT A; 4RTW A; 1QKW A; 1I07 A; 2PNI A; 4AFU C; 1AZE A; 2RQT A; 4A63 B; 2W10 A; 2D8J A; 1Y0M A; 1T0H A; 2DVJ A; 2XMF A; 1NEG A; 4AG2 C; 2EGC A; 2LQN A; 1QLY A; 2LJ0 A; 2DF6 A; 1VYU A; 2K3B A; 4LUD A; 2O88 A; 1WFW A; 3EHR A; 1K0S A; 2KYB A; 3VS2 A; 2MOX A; 1H92 A; 3ULR B; 2CRE A; 4AFQ C; 2KRO A; 2CH4 A; 2OAW A; 2ROL A; 1UFF A; 3JV3 A; 2FPD A; 3IQL A; 2VKN A; 2JTE A; 1RLP C; 1HJD A; 2PZ1 A; 4AFZ C; 3TSZ A; 4GBQ A; 2J6F A; 1AWW A; 2CT4 A; 4E6R A; 1I0C A; 3CQT A; 2FPF A; 1AVZ C; 4RTZ A; 4FSS A; 1YWP A; 1UJ0 A; 2IIM A; 4CC4 B; 2D0N A; 3VS3 A; 2DM1 A; 1AWJ A; 2FG0 A; 5IXF A; 1NM7 A; 4HVU A; 3PVL A; 4AG1 C; 2CH4 W; 5ECA A; 1H3H A; 1AOJ A; 2L3S A; 3GBQ A; 3H0I A; 3H41 A; 3M0R A; 4M4Z A; 3VS4 A; 1T0J A; 2P4R A; 1K9A A; 1K76 A; 5FWB A; 2ABL A; 1M27 C; 4ESR A; 4D8K A; 5I11 A; 2J6O A; 1AZG B; 2F2X A; 2SEM A; 4DEX A; 2C0O A; 4EIK A; 2L3Q A; 4Z89 A; 2NUZ A; 4OMN A; 2ROT A; 1GCP A; 1AD5 A; 2J05 A; 2JS0 A; 2QDL A; 1NLO C; 1NYF A; 2L0A A; 4OMO A; 1CKA A; 1BK2 A; 5IHI A; 2V1Q A; 1ZUK A; 2A37 A; 4LNP A; 4RTV A; 5FW9 A; 3EGU A; 2C0I A; 5HCK A; 1B3Q A; 3UA7 A; 1U5S A; 2C0T A; 1V1C A; 2DL5 A; 2DL8 A; 2JM9 A; 1PKT A; 2JMA A; 1GCQ C; 2O31 A; 2GQI A; 2EW3 A; 1GFC A; 2GBQ A; 2FRW A; 1JU5 C; 2KT1 A; 4CC7 A; 1NYG A; 2RN8 A; 2RNA A; 1PNJ A; 2EQI A; 1SRM A; 1N5Z A; 2AKL A; 1QWF A; 2RQW A; 2DL4 A; 1YCS B; 4J9C A; 2LNH B; 3EG1 A; 2FRY A; 2KYM A; 3PE0 A; 5IH2 A; 2EPD A; 4CC2 A; 2KNB B; 1PRM C; 1ZUY A; 2DBK A; 4HCK A; 1TUC A; 4RUG A; 4Z88 A; 2J06 A; 1MV3 A; 3VS5 A; 1M3A A; 1UEC A; 1JXO A; 3ZL7 C; 5GJW B; 5L23 A; 3EG3 A; 2LCS A; 2K2M A; 1M3B A; 1BBZ A; 2KRN A; 4RTT A; 2YT6 A; 1K0X A; 2O9V A; 2GTO A; 1K1Z A; 1HD3 A; 3LH5 A; 2EGE A; 1J3T A; 2AZS A; 2DRM A; 3M0P A; 2EBP A; 1WX6 A; 2E5K A; 3TSW A; 4JZ3 A; 3VRY A; 3I35 A; 2M0Y A; 3VRZ A; 2YUN A; 3EHQ A; 1E6H A; 2J6K A; 1UDL A; 1ZLM A; 1YP5 A; 2FEI A; 2JT4 A; 2ECZ A; 3PVQ A; 4J9B A; 1K4U S; 1SHG A; 2AK5 A; 1CKB A; 4DEY A; 1E7O A; 1PHT A; 2ED0 A; 2G6F X; 4IIO A; 2H8H A; 4RTY A; 2LJ3 A; 2FPE A; 3FJ5 A; 1UTI A; 2LJ1 A; 2PTK A; 1YWO A; 1WI7 A; 2CUD A; 1PRL C; 2RQU A; 1JEG A; 2ENM A; 2JS2 A; 4LUE A; 1OPL A; 1ZUU A; 2VVK A; 4OMQ A; 2HCK A; 4Y92 A; 3M0U A; 2GGR A; 5EC7 A; 3RBB B; 1YN8 A; 2EYY A; 3H0H A; 3NPF A; 4J9E A; 1WXU A; 1WLP B; 1M30 A; 3THK A; 2L2P A; 2DLP A; 4RTX A; 4X1V A; 2VWF A; 2KBT A; 1VYT A; 3KFV A; 2I0N A; 2DYB A; 2JXB A; 4J9F A; 4ZNX A; 3R6N A; 2KRM A; 2KT8 A; 4HXJ A; 2DA9 A; 3SHW A; 2RPN A; 4IIM A; 4KRT A; 2LZ6 B; 3A98 A; 4LN2 A; 2AKK A; 2KR3 A; 2EYZ A; 2J7I A; 3M0Q A; 3RNJ A; 2MIO A; 2YUO A; 1VA7 A; 1OPK A; 1X6B A; 4J9D A; 1XOV A; 3SEM A; 1PKS A; 1W6X A; 2EYW A; 2HSP A; 1ABO A; 1GCQ A; 1JQQ A; 1X43 A; 3EG2 A; 1WIE A; 4CC3 A; 1WYX A; 2RQV A; 3UF4 A; 1T3L A; 2CT3 A; 2F2V A; 1PWT A; 1UGV A; 2A28 A; 3O5Z A; 1X27 A; 4JZ4 A; 2EGA A; 2NWM A; 4OMM A; 2D1X A; 4AFS C; 1BB9 A; 1NLP C; 2CDT A; 2FO0 A; 2D8H A; 3VS1 A; 2W0Z A; 1KIK A; 1UE9 A; 3QWX X; 2HBW A; 2BTT A; 2L3P A; 1KJW A; 5GJV B; 1RI9 A; 2K79 A; 2RMO A; 3C0C A; 1W70 A; 2DE0 X; 2A36 A; 1GBR A; 1H8K A; 2DMO A; 1WXT A; 3M0S A; 1MV0 B; 2B86 A; 2EKH A; 1EFN A; 2K9G A; 1TG0 A; 2YUP A; 2HEQ A; 2OI3 A; 2K7A A; 4R0K A; 2BZ8 A; 4F17 A; 1ZX6 A; 1ZBJ A; 4JJD A; 1AWO A; 1WXB A; 1G2B A; 1KFZ A; 2KEA A; 3NMZ C; 1T3S A; 4J9G A; 1AEY A; 2CSI A; 1X6G A; 3EG0 A; 2DBM A; 2KE9 A; 2EYX A; 2O2O A; 4OMP A; 2JMC A; 1IO6 A; 2DL3 A; 4F16 A; 1X69 A; 1HSQ A; 1RLQ C; 3QWY A; 1JXM A; 2X3W D; 1GRI A; 1GBQ A; 1WA7 A; 3NHN A; 2YDL A; 1WDX A; 1QWE A; 3I9Q A; 4K11 A; 4LE9 A; 1LCK A; 3VS7 A; 5IXB A; 1X2Q A; 3REB B; 2GTJ A; 1OEB A; 1RUW A; 1NG2 A; 1U3O A; 2SRC A; 1FMK A; 4JJB A; 2JW4 A; 1UUE A; 2O9S A; 2ESW A; 2K6D A; 1M3C A; 3NGP A; 1S1N A; 2LMJ A; 4JPB W; 3U23 A; 2KXC A; 1UG1 A; 2V1R A; 3M0T A; 1ABQ A; 1I1J A; 3REA B; 5IHN A; 1M8M A; 1E6G A; 1SHF A; 2JM8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2LQW A; 3TCJ A; 2I2L A; 2RHU A; 1NJI R; 4BY6 B; 5A0G A; 2LT4 A; 2BZY A; 1Z9Q A; 2R57 A; 4C8Q B; 2JUF A; 1WHM A; 2M9U A; 4PLL A; 3URG A; 5CR2 A; 1M90 U; 3QPH A; 2JZ2 A; 4E2F B; 5KYY A; 3H0F A; 1QVF S; 1KG1 A; 5D6X A; 3QZ9 B; 1NEB A; 2MCN A; 4HVV A; 4M78 D; 2A7Y A; 1FYN A; 4PFZ A; 3G4S A; 2YSQ A; 5IT9 E; 2QXF A; 1VQK A; 2LX7 A; 2DXC A; 3MEA A; 2F2W A; 3QBY A; 5GAN d; 4GLM A; 4RTU A; 1GL5 A; 1JO8 A; 4QQ6 A; 2JN0 A; 4J6W A; 3TQ7 P; 3RKX A; 2DNU A; 3VUZ A; 1ZSZ C; 1W1F A; 4JS4 A; 1UHF A; 1TUD A; 2E10 A; 1M1K U; 2DX1 A; 3HRS A; 1KSW A; 2NUT A; 3PIO A; 1H3Z A; 2RQR A; 2DXU A; 1WHG A; 2QTV A; 3TVT A; 1VQ5 T; 3SWN C; 1RL2 A; 4EMK A; 1VQ5 Q; 4M75 F; 5FU6 C; 2EVR A; 2DFU A; 1VIF A; 3LWH A; 1YIJ A; 1MHN A; 1VQM T; 2OJ2 A; 2RI3 A; 3UDC A; 4AMC A; 4XTY A; 2DD4 A; 4QQD A; 2X4J A; 4A63 B; 2W10 A; 4PJJ A; 2D0Q B; 1T0H A; 1TU0 B; 2XMF A; 4KGV B; 1NEG A; 3CCE A; 3EGX A; 3WVD B; 2AT1 B; 4XU3 A; 2DF6 A; 4XTW A; 2O88 A; 1M90 C; 3M57 A; 3EHR A; 5GAO l; 4JRQ A; 2WSE E; 4F7U A; 4WTO B; 1RAI B; 3VKI A; 1M8V A; 3ULR B; 2CRE A; 3V7S A; 4M7A A; 1N6A A; 2CH4 A; 3GF5 A; 1UEB A; 3QXE B; 3JV3 A; 2FPD A; 4C92 G; 2OTJ Q; 2EQJ A; 2RO0 A; 4BE0 A; 4M7D G; 2ATC B; 2JTE A; 2RJD A; 1RLP C; 1HJD A; 4JS5 A; 4AFZ C; 2HSE B; 1IRX A; 1WGS A; 2P0K A; 2LDM A; 4VUB A; 2F69 A; 2FPF A; 2DIG A; 1AVZ C; 4RTZ A; 2QQR A; 4MDW A; 1YWP A; 1UJ0 A; 4CC4 B; 3JCM X; 1M1K C; 2FG0 A; 2K5L A; 5GAN g; 3PVL A; 1VQ9 T; 1D1B A; 2NUP B; 5ECA A; 1AOJ A; 2L3S A; 4E7J A; 3CCQ Q; 4M4Z A; 1SF9 A; 1K76 A; 2CGH A; 1QCO A; 1M27 C; 4NL2 A; 4ESR A; 2J6O A; 3HFO A; 1AZG B; 3RR6 A; 4DBR A; 2SEM A; 4ZN3 A; 4DEX A; 1PSE A; 4NOY A; 4B6M A; 5LJ5 h; 2ROT A; 2J05 A; 2DTO A; 1IGU A; 3INZ A; 1NYF A; 4OMO A; 3DLM A; 4E7S A; 4C5E A; 5IHI A; 3ZFJ A; 3X20 B; 2CZ1 B; 2DEQ A; 5HKC A; 5FW9 A; 1JJ2 A; 4M77 C; 3WXM B; 5HCK A; 1W2B A; 2JM9 A; 2DPP B; 3RIR A; 2HKN A; 2BIV A; 1OZ3 A; 2D6F A; 3EH1 A; 1PNJ A; 2EQI A; 1SRM A; 5CQX A; 4WF2 A; 4PJN A; 3SDZ A; 3CC7 A; 2PUO B; 1YIT A; 3L2W A; 4C5G A; 2FB7 A; 3OBW A; 4PJL A; 2K5I A; 2FYK A; 1Y96 A; 1H64 1; 1N9R A; 5IH2 A; 1G3Y A; 3X26 B; 3TRE A; 2XDD A; 1IHV A; 2RHX A; 3ME9 A; 2CP2 A; 4C8Q A; 2HL5 C; 3VS5 A; 1M3A A; 3ZL7 C; 1JXO A; 2EAY A; 1XJW B; 2RJC A; 4PL6 A; 5FRN A; 3P8B B; 3OYG A; 2KRN A; 3JB9 H; 1M4Z A; 2O9V A; 1LNX A; 1K1Z A; 1HD3 A; 4M7A D; 3RMQ A; 3OYA A; 2KDS A; 4HT9 A; 1Y7X A; 1LJO A; 3G4S T; 5D6W A; 3G4S Q; 4FYV B; 4PJO B; 1ZLM A; 1YP5 A; 1K73 R; 4E7I A; 1YJW A; 3S3N A; 3OA6 A; 2ZPB B; 3TEE A; 1JJ2 P; 4J9B A; 1EX4 A; 1SHG A; 4JJN K; 1E7O A; 3A8G B; 3BDU A; 1W2B P; 4ZN1 A; 5KYU B; 4RG8 A; 5D6Y A; 4IIO A; 3CME A; 4OB3 B; 3JCM Q; 1D3B B; 4C0G A; 4C92 F; 2LJ3 A; 4II1 A; 4M7D F; 2PTK A; 3FIF A; 1M5Q 1; 2VVK A; 4Y92 A; 5EC7 A; 1VQN A; 2LNV A; 1YN8 A; 1KQ2 A; 4LDW A; 3VV0 A; 1QMC A; 4J9E A; 1N8R R; 1WXU A; 3GOX A; 4A4K A; 3CCM A; 3CCE T; 3RKY A; 2L2P A; 3CCE Q; 2PU9 B; 3M4Y A; 3I56 A; 3KFV A; 1PC0 A; 4F04 B; 3R6N A; 2KRM A; 1HK9 A; 2E64 A; 4HXJ A; 2LQK A; 1IXD A; 1I8F A; 3DB3 A; 3CCJ A; 1QCN A; 5GAN h; 4DBH A; 3JB9 D; 4KRT A; 2LZ6 B; 3G71 A; 4IKF A; 1QW1 A; 2J7I A; 3RNJ A; 1KQS P; 1OPK A; 2X9H A; 1X6B A; 3JRZ A; 1PKS A; 1ABO A; 4HT8 A; 9ATC B; 3UF4 A; 1T3L A; 3CD6 A; 2XG8 D; 4C8Q D; 2A28 A; 2EGA A; 1K8A R; 1BB9 A; 2FO0 A; 5GAN 6; 2HMA A; 2NUP A; 1KIK A; 2W0Z A; 3C95 A; 2HBW A; 5DY9 A; 3L2U A; 5GJV B; 1OU8 A; 4QKU A; 1R0C B; 4XTZ A; 1GBR A; 1BIA A; 1RAE B; 2G3R A; 1QVF A; 2B86 A; 1ZQ1 A; 3JB9 I; 3UWN A; 1QVP A; 4JDS A; 1KHI A; 1QQJ A; 2DZC A; 4L6V 5; 1KC8 U; 4F17 A; 2F5T X; 2MWP A; 2OX7 A; 5KYY B; 5KYW B; 4J9G A; 2EKO A; 3EG0 A; 1M2O A; 4JRK A; 1UB4 A; 2QYZ A; 4OMP A; 5M9O A; 2JMC A; 1VQ7 A; 5J26 A; 1JXM A; 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4OML A; 3HSB A; 4P5N A; 2DRK A; 1MUZ A; 3I55 T; 1YNZ A; 2IG0 A; 1VYV A; 3CCM T; 2VGN A; 2M51 A; 3CCM Q; 2K3Y A; 1Y57 A; 4RTW A; 4AFU C; 3I56 T; 1FWZ A; 3I56 Q; 4XAX B; 1G3W A; 4M75 B; 4PJO E; 1U1S A; 3CCJ T; 2EGC A; 2AIR B; 3CCJ Q; 3MEW A; 1VYU A; 1VOM A; 3G71 T; 4KUD K; 3G71 Q; 2RM4 A; 2E3I A; 1U1T A; 3JB9 G; 2FL7 A; 1OI1 A; 4E7L A; 1H92 A; 4JLG A; 4AFQ C; 1N27 A; 4M78 E; 2ROL A; 3MET A; 1ACM B; 2VKN A; 1S72 A; 2BE9 B; 4M77 B; 1WJQ A; 3TSZ A; 3CD6 T; 4ME7 A; 5AT1 B; 3CD6 Q; 2J6F A; 2DK3 A; 1AWW A; 2CT4 A; 5GMK i; 5I21 A; 3OW2 S; 1BI1 A; 4R55 A; 3PMI A; 2CP7 A; 4PNO A; 2D0N A; 3VS3 A; 2P84 A; 1AWJ A; 4HVU A; 4FU6 A; 3H41 A; 3H0I A; 3VS4 A; 1T0J A; 1YBY A; 1OQK A; 4PJO D; 5DM7 R; 1ZBX A; 3A1P A; 2COY A; 1BI0 A; 4C0Z A; 5CO7 A; 4AT1 B; 3CPF A; 4Q5W A; 5KYW A; 1M90 R; 2V26 A; 2C0O A; 4Z89 A; 5GAM d; 2RB6 A; 4OMN A; 2X4W A; 2QQ9 A; 1GCP A; 2JS0 A; 5DLQ E; 1NLO C; 3D7S B; 2DEU A; 1VQ7 T; 3CXC S; 5IN1 A; 1VQ7 Q; 1CKA A; 3PTA A; 1ZUK A; 1M9S A; 2A37 A; 4RTV A; 3EGU A; 2C0I A; 4F7U F; 1TSF A; 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