The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
66
|
structure length |
62
|
Chain Sequence |
SLLEKVLKEWKGHKVAVSVGFTGTLEDFDEEVILLKDVVDVIGNRGKQMLIGLEDINWIMLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Conserved hypothetical protein Pfu-1806301-001 from Pyrococcus furiosus
rcsb |
| molecule keywords |
Conserved hypothetical protein
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| source organism |
Pyrococcus furiosus
|
| total genus |
12
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| structure length |
62
|
| sequence length |
66
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-12-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4M7A C; 3L1A A; 2VC8 A; 5GAO p; 4M75 G; 4PJO B; 4J5Y A; 4NL3 A; 4XU3 A; 1I81 A; 4EMK B; 4C8Q E; 1N9R A; 2JN0 A; 3JCM W; 3JCM f; 5I21 A; 4PJO A; 3L2Z A; 1WQW A; 5GMK h; 3JCM J; 3RES A; 1TH7 A; 4QVD A; 5GAN 4; 2DVE A; 3JB9 D; 3SWN B; 4HT8 A; 5GAO r; 1HXD A; 4C8Q C; 4QVC A; 3SWN A; 4M78 F; 4C92 G; 5GMK i; 5GAN d; 2RM4 A; 4M75 E; 4RCC A; 4M78 B; 4M77 G; 4N0A C; 5GAN 6; 2HNI A; 2DXT A; 4M78 A; 4V2S A; 4EMH A; 2FB7 A; 3JCM c; 4N0A A; 4HT9 A; 2Y90 A; 2VXF A; 4M75 C; 5GAN 2; 1WPY A; 4JRK A; 4PJO D; 4M7D F; 1LOJ A; 4C92 E; 2K57 A; 4M7D B; 4M7A F; 4HA8 A; 4XTU A; 3HFN A; 3BW1 A; 3EFR A; 4M77 E; 4MML A; 4M7D A; 3VU3 C; 4F7U G; 4M7A B; 2E64 A; 3SB2 A; 2DZ9 A; 3QHS A; 4C92 C; 5GMK l; 5GAN 7; 5GAN 8; 4M7A A; 2EAY A; 3INZ A; 3V7S A; 4XTW A; 4DQ2 A; 4M77 C; 2EWN A; 1M5Q 1; 4M78 D; 5GAM d; 3M4G A; 3HSB A; 1KQ1 A; 3RKW A; 1Y96 A; 4XU2 A; 1X01 A; 1LNX A; 5GAN g; 4XTV A; 1D3B B; 1LJO A; 2DTI A; 4F7U E; 4C8Q A; 5LJ5 d; 3RER A; 5LJ3 d; 3JB9 G; 1D3B A; 3FB9 A; 3HFO A; 3JCM b; 3RUX A; 3V7R A; 2DTO A; 4A53 A; 3QSU A; 4M7D D; 1H64 1; 2RA2 A; 3JB9 I; 3RKY A; 5GAN e; 1BIA A; 2EJG A; 2DXU A; 5LJ3 e; 4M7A D; 3V8K A; 1WQ7 A; 3V7C A; 3QUI A; 4M75 A; 5GMK m; 2I2L A; 3FIF A; 3JCM d; 3JB9 J; 5GAN j; 3EFS A; 2CGH A; 3BDU A; 4MMK A; 4PJO G; 4C92 F; 5LJ3 j; 5LJ5 j; 1MGQ A; 3JCM X; 2DTH A; 1M8V A; 5DY9 A; 3PGG A; 4Y91 A; 4JUV A; 5GAO l; 4OP0 A; 4M77 F; 5GAN h; 2E41 A; 4C92 A; 1Y96 B; 2VXE A; 5LJ3 h; 4M77 B; 3RKX A; 4J6Y A; 4C8Q F; 5GAM g; 2EJ9 A; 4M77 A; 1I8F A; 4C8Q B; 5GAN f; 3JCM V; 3AHU A; 2DJZ A; 1U1S A; 5LJ5 g; 4RCB A; 3JCM Q; 4J6X A; 4M78 G; 5LJ3 g; 3JCM P; 1I5L A; 3QO3 A; 5GAN 3; 3FJP A; 5GAM e; 2YHT A; 4XTY A; 3RIR A; 1N9S A; 4M75 F; 3JCM h; 4F7U F; 4PJO E; 5GMK j; 4EMG A; 1KQ2 A; 4PJO C; 1HK9 A; 5LJ5 e; 4A54 A; 2RD1 A; 2RB6 A; 4M75 B; 2QTX A; 4EMK C; 4F7U B; 5GAM j; 3GIB A; 4NL2 A; 4X9D A; 4F7U A; 1I4K 1; 4C92 D; 3JCM g; 2DKG A; 3BY7 A; 5GAO m; 4EMK A; 4M7D G; 4M78 E; 4XTZ A; 4X9C A; 3SWN C; 5GAO n; 4M77 D; 4WF2 A; 5GAM h; 4M7A G; 1WNL A; 4JLI A; 2FYK A; 3BFM A; 4C8Q D; 4C92 B; 4J6W A; 3JB9 F; 4XU0 A; 3JCM e; 4JRI A; 4M78 C; 1YCY A; 2DEQ A; 1JBM A; 5GAM f; 5LJ5 h; 4XQ3 A; 3JB9 H; 2YLC A; 4XU1 A; 1BIB A; 5CAI A; 1B34 B; 2E1H A; 2E10 A; 4M7D E; 2ZGW A; 4NOY A; 4PNO A; 4C8Q G; 1B34 A; 5GAN 5; 1JRI A; 3V8J A; 5GAO q; 5GMK e; 5LJ5 f; 2EJF A; 5LJ3 f; 4M7A E; 4M75 D; 4XTX A; 2DZC A; 2YLB A; 3V8L A; 2E65 A; 4M7D C; 4PJO F; 1U1T A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2M51 A; 2HBP A; 4LD9 K; 2R58 A; 4PJN A; 3L2Z A; 4Z8A A; 1MMD A; 2IIM A; 5GAN 4; 2DVE A; 2PUO B; 4RMO A; 3CCS Q; 2F1L A; 1JXM A; 2LTO A; 3CME Q; 2QGF B; 3I56 Q; 1BB9 A; 2KYB A; 4IIM A; 2C0O A; 1VA7 A; 2YRD A; 2HQH A; 4ZGD B; 1YI2 A; 1SRM A; 3H0H A; 3UA6 A; 4CC3 A; 2RJE A; 2OJ2 A; 1IB8 A; 2RN8 A; 3VS1 A; 1G3Y A; 4C0G A; 5IXF A; 1QKW A; 3OYD A; 5CQX A; 1JO8 A; 3HSB A; 1KQ1 A; 1X75 C; 2SRC A; 1X01 A; 5LJ3 d; 1VQM Q; 1IRE B; 2GBQ A; 3CD6 A; 4M7D D; 2DMO A; 2XU8 A; 3A8G B; 3MHX A; 2RMO A; 3G4S A; 2I2L A; 1EZZ B; 1W70 A; 2L0A A; 1KHI A; 3OYA A; 2CH4 A; 2ZPB B; 3EG0 A; 4JUV A; 2K6D A; 4OP0 A; 4DBR A; 4DEX A; 1KHC A; 3PIO A; 4GLM A; 2KR3 A; 1YIJ A; 1I8F A; 5GAN f; 1QCO A; 2HMA A; 3QO3 A; 1BYM A; 1RAG B; 3J81 E; 4HCC A; 1BI3 A; 2A7Y A; 2PNI A; 4PJL A; 2QTX A; 4MZP A; 4EDU A; 1VQL T; 7AT1 B; 2G6F X; 3CC2 T; 1K76 A; 1EX4 A; 4M7A G; 2CSQ A; 4C5E A; 4QQ6 A; 1UJY A; 2LQW A; 4M78 C; 3TSZ A; 2DEQ A; 4NOY A; 2ATC B; 2DM1 A; 3I5S A; 4GLK A; 1W2B A; 2F5K A; 3V8L A; 1K9M R; 3E9G A; 4J5Y A; 1ACM B; 1GXI E; 4KUL A; 2QEX T; 3N5B B; 2EQU A; 4ELY C; 1BK2 A; 4QVC A; 1HSQ A; 3EG9 A; 3BDL A; 4J9G A; 4V2S A; 1BKB A; 2ABL A; 2JM9 A; 4RTZ A; 5KCH A; 2Y90 A; 4J7F A; 4Y92 A; 4A4F A; 4D8K A; 1WZO A; 2KRN A; 5FWC A; 4M7A F; 2A37 A; 5FRN A; 2DRM A; 3HFN A; 3ULR B; 4F7U G; 3OSV A; 3OYH A; 2EWN A; 2HQX A; 2HZY A; 1ZUK A; 5FWB A; 5C0M A; 4AFZ C; 1SSH A; 1T0J A; 3PFS A; 3VUB A; 2CZ7 B; 4A4G A; 2PZ1 A; 3TQ7 P; 1UTI A; 2CH4 W; 1MV0 B; 2MF2 A; 2EIF A; 1WDX A; 2RA2 A; 1VQ5 T; 2VVK A; 3T9N A; 3CCM T; 3QUI A; 3CCQ Q; 2D8J A; 5LJ3 j; 2LCL A; 3M0U A; 4Y91 A; 1YJ9 T; 5FRM A; 4D8D A; 3MEW A; 4Z02 A; 4M77 B; 3UF4 A; 1KD1 R; 1ZUU A; 1I5O B; 2A3L A; 3CCR Q; 2F2W A; 2X4X A; 1N8R U; 3C95 A; 1SRL A; 1OPK A; 4F7U F; 3L2Q A; 2A28 A; 4PFZ A; 5GMK j; 1VQL A; 5LJ5 e; 2OTJ T; 1CSK A; 1M90 R; 3CC2 A; 3EGU A; 3JCM g; 1OV3 A; 4M7D G; 4EMK A; 2NWM A; 3CEY A; 1UEC A; 3L2U A; 5GAO n; 3CC4 T; 1AZE A; 3BFM A; 3OYG A; 1C1A A; 3CCU Q; 1UEB A; 2P4T A; 3JB9 H; 5CAI A; 3UA7 A; 3M54 A; 2FEI A; 1YIT T; 2M0Y A; 2F69 A; 4GY5 A; 2VKN A; 2KAF A; 5FW9 A; 3GOX A; 2JUF A; 3G71 T; 4L59 A; 4ME7 A; 1M1K R; 5I2M A; 2EYX A; 2QEX A; 4FU6 A; 4JJB A; 1YNZ A; 2D1X A; 2XHC A; 3M0Q A; 1WFW A; 2LT1 A; 1H3H A; 2LNH B; 3M9Q A; 3EG3 A; 1H8K A; 4E7K A; 4ELZ C; 5A0L A; 2OTL Q; 2RHZ A; 4X1V A; 2GCX A; 4N0A A; 3QPH A; 4M75 C; 1PCX A; 1VQ8 T; 4M7D F; 3REB B; 2LT4 A; 2D8H A; 1N27 A; 3Q1J A; 3V7S A; 1TXQ A; 3OYB A; 4JS4 A; 4FIB A; 1D3B B; 4KBM B; 3PVQ A; 3HFO A; 1VQ5 A; 3CCM A; 3EAE A; 4XK8 E; 2BIV A; 1M30 A; 4A4K A; 3PT9 A; 2EW3 A; 2QA4 T; 1YJ9 A; 3QG1 A; 2CGH A; 1MGQ A; 1SEM A; 3EG2 A; 2EGC A; 3VKI A; 3MP6 A; 2K5I A; 5GAN h; 1PSE A; 2DX1 A; 4LD6 A; 1VQK Q; 3OS5 A; 5I22 A; 2KGT A; 3OYK A; 3RMQ A; 4OMM A; 2HAX A; 5EG2 A; 5D6W A; 2OTJ A; 4HCZ A; 1M3C A; 3HRT A; 3CC4 A; 4HVU A; 3G7Z A; 2LX7 A; 2DD5 A; 1D0X A; 1I4K 1; 2DKG A; 1WA7 A; 1FMV A; 1NLP C; 1WNL A; 4YTL A; 1M27 C; 2NUT A; 3CPW S; 5GAM f; 3G71 A; 1QP2 A; 1VQP T; 1D1B A; 3M5A A; 3QBY A; 2KK4 A; 3J7A F; 2YLB A; 2DL4 A; 2KDS A; 4IUP A; 2KXC A; 2OX7 A; 4PJO A; 4PKC C; 1R0B G; 3RES A; 3ZBD A; 1R77 A; 2LC4 A; 2JW4 A; 4J8O A; 1KC8 C; 2V1R A; 4BE2 A; 1VQ8 A; 1W2B P; 1UGQ B; 2V1Q A; 1I1J A; 2VXF A; 4JRK A; 2KT8 A; 2RHU A; 3OW2 S; 2HSE B; 3TEE A; 3EFR A; 2GF7 A; 4KUD K; 4E6R A; 3VU3 C; 3QWY A; 3SB2 A; 2PUK B; 3QII A; 3RNJ A; 3CQT A; 3OYY A; 4B9X A; 2DO3 A; 3M4G A; 2AZS A; 3SDZ A; 1T3S A; 1F1B B; 2K2M A; 2J05 A; 3EH2 A; 3OMC A; 1VQN T; 1A0N B; 2L8D A; 4LDW A; 2Y4X A; 2QA4 A; 5LJ3 e; 3PTA A; 1TG0 A; 1QCF A; 1IO6 A; 4N4I A; 2D0N A; 1NEG A; 1W4S A; 4QQD A; 2O31 A; 4EPC A; 1AOJ A; 1M8V A; 5D6Y A; 4KT0 E; 1Y96 B; 1W2B S; 4KH0 B; 1WHL A; 3AHU A; 1WJQ A; 2RI2 A; 2JVV A; 4O6J A; 2L89 A; 2QAS A; 4BDZ A; 2JJ9 A; 4L5G A; 4KGZ B; 1WHK A; 1WJS A; 2LVM A; 3VUZ A; 1VOM A; 4LUD A; 4PL6 A; 1YBY A; 2KXD A; 3F70 A; 4M78 E; 3FC3 A; 4JLI A; 2J6K A; 4OMF B; 4C8Q D; 1RL2 A; 3CCE Q; 4Y28 E; 1G8X A; 4IIO A; 3M0P A; 1RAC B; 4J9C A; 1UHC A; 2BTT A; 4Z89 A; 1JXO A; 2NUZ A; 3G6E Q; 3M56 A; 5I2S A; 2QYZ A; 2KE9 A; 2ED0 A; 1K8A R; 1I81 A; 1WHJ A; 1Z9Z A; 1M8M A; 5IAY A; 3QXE B; 1YHQ T; 5J26 A; 1IGU A; 1WGS A; 1OI1 A; 5GAN d; 2O01 E; 1BU1 A; 2DIQ A; 2DXT A; 1K0S A; 4O5V A; 1KQS S; 1TSF A; 2KEA A; 2QQ9 A; 3S3N A; 1H92 A; 1X43 A; 4XTU A; 2DPP B; 3DKM A; 4AMC A; 4C92 C; 5CKD A; 1PKS A; 2C0T A; 2QAZ A; 4DQ2 A; 2KQW A; 4M77 C; 4M78 D; 1X6B A; 3VS5 A; 1VQN A; 2HEQ A; 2L3Q A; 4XTV A; 3H9N A; 2XI9 A; 2LP5 A; 3V7R A; 1YN8 A; 2KMT A; 2MCN A; 3OYL A; 1YI2 Q; 3VS0 A; 5A2Q E; 2CUB A; 2XKO C; 3I55 T; 3BDU A; 3DB4 A; 2H3E B; 2ZAE A; 3ZFJ A; 1SHF A; 1Q86 C; 2O88 A; 3VRY A; 2XMF A; 4FCY A; 8ATC B; 2J6F A; 3H41 A; 5FU7 C; 3RIR A; 2XDB A; 2PQW A; 3G4S Q; 4A4H A; 4M75 B; 5IHN A; 2D9T A; 4MZT A; 2E5Q A; 1KJW A; 1E6H A; 1BI2 A; 1Q7Y R; 2JOY A; 5GAM h; 3CBM A; 1K1Z A; 3JCM e; 1YIJ Q; 4AFQ C; 2XID A; 1BIB A; 4F17 A; 1JRI A; 4KGV B; 1WHG A; 2JTE A; 1W1F A; 3EGD A; 1VQ4 T; 3M59 A; 4MDX A; 1RAH B; 1AWW A; 1ZQ1 A; 1NZ9 A; 3L1A A; 5HCK A; 2J06 A; 1RLP C; 1VYT A; 1N9R A; 4BB7 A; 4HVW A; 1RI9 A; 1PHT A; 3EGX B; 4ZGJ B; 2CP6 A; 1MND A; 3JAM E; 3HPW A; 4M75 E; 2I0N A; 2HNI A; 4PJJ A; 4BDY A; 3OQ5 A; 2X4W A; 3JCM c; 1YJW Q; 1VQ6 T; 4HT9 A; 2EGE A; 3HKS A; 5D7U A; 2DAQ A; 3HRS A; 2JT4 A; 3A8O B; 2DL8 A; 4BE0 A; 1TUD A; 1D0Y A; 4FW1 A; 3KBG A; 4OB1 B; 2COW A; 4IKF A; 2WAC A; 2CS7 A; 1K73 U; 1ZX6 A; 3CC7 Q; 4C8Q A; 2DA9 A; 3PIP A; 4OB0 B; 3CPW A; 1K73 C; 4DOW A; 4BI3 A; 4DOV A; 3U23 A; 3I55 A; 1Y57 A; 2EYY A; 1HJD A; 3EFS A; 1FX7 A; 3L2R A; 4MZM A; 1NYG A; 3BE3 A; 4J7I A; 1Q81 R; 2V8K A; 2K2V A; 2K7A A; 4C8Q F; 4EIK A; 3CCS T; 2E70 A; 5IH2 A; 2CP5 A; 4LDX A; 5LJ3 g; 4M78 G; 3OYM A; 4C5G A; 3CME T; 4RG8 A; 2YHT A; 1UUE A; 1V29 B; 3MP8 A; 1PKT A; 2X9H A; 3QDF A; 2DL5 A; 3I56 T; 3JCM h; 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4BAC A; 1YJ9 Q; 1KQS A; 3GIB A; 3CCV A; 1FYN A; 2QQA A; 4F7U A; 2CSI A; 1QWF A; 3A8L B; 4ZNX A; 2GGR A; 1QVG A; 4OB2 B; 1UGR B; 1TU0 B; 2BE9 B; 2HKN A; 4C92 B; 1OU9 A; 1M1G A; 2LQN A; 1X2K A; 3LW5 E; 3EFO B; 2NLU A; 2E10 A; 2CUD A; 3MKD A; 4FYW B; 1VQM A; 2OTJ Q; 1UGP B; 2EJF A; 1PNJ A; 1OUL A; 1H3Z A; 4JZ3 A; 1FMW A; 4RTT A; 1S72 Q; 5KCO A; 4QVZ A; 2AKL A; 1N8R C; 4M75 G; 2COZ A; 4FM4 B; 1C0M A; 4J9I A; 1NPR A; 3GPL A; 2JN0 A; 3JCM W; 1X27 A; 2DL7 A; 1GCP A; 2YUO A; 2E12 A; 1AVZ C; 4JPB W; 3OY9 A; 2VB6 A; 2VUB A; 1NBE B; 4C0F A; 4RCC A; 1GCQ A; 1SSF A; 3X24 B; 4KGX B; 3CCR T; 4C92 E; 3FJ5 A; 1YJN T; 1KK7 A; 5FU7 B; 2EPD A; 2OAW A; 4M77 E; 4M7D A; 2RHI A; 3X26 B; 1EFN A; 2JTM A; 1O9S A; 2KT1 A; 3QWX X; 2YSQ A; 2KVQ G; 2DBM A; 3JV3 A; 2QQR A; 2EQK A; 4XU2 A; 2WSC E; 3MEV A; 2KYM A; 1Q95 G; 3HHT B; 3JB9 G; 3REA B; 4ATO A; 2D6F A; 3VS2 A; 3V8K A; 5DLO A; 2DYI A; 2QQS A; 3KUF A; 1XQH A; 2FPF A; 2FZK B; 2R5M A; 1X69 A; 1Y7X A; 1G83 A; 2E41 A; 2MAM A; 5KYU A; 2X4J A; 2COY A; 2DVJ A; 4A4E A; 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