The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
66
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structure length |
62
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Chain Sequence |
SLLEKVLKEWKGHKVAVSVGFTGTLEDFDEEVILLKDVVDVIGNRGKQMLIGLEDINWIMLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Conserved hypothetical protein Pfu-1806301-001 from Pyrococcus furiosus
rcsb |
| molecule keywords |
Conserved hypothetical protein
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| source organism |
Pyrococcus furiosus
|
| total genus |
12
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| structure length |
62
|
| sequence length |
66
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-12-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3L1A A; 4N0A C; 4C8Q E; 4M77 G; 2DZ9 A; 3EFR A; 4M77 C; 3M4G A; 4Y91 A; 1U1S A; 1WQW A; 4XU0 A; 2HNI A; 3V8L A; 4EMK C; 5GMK m; 3RER A; 4M7D E; 4M78 A; 2FYK A; 4M77 F; 1B34 A; 2DEQ A; 5GAM e; 4JRK A; 2Y90 A; 4NOY A; 3JCM P; 3RKX A; 5GAO l; 1KQ2 A; 3GIB A; 2RD1 A; 4M78 D; 5LJ5 h; 1BIB A; 3HFN A; 3JB9 H; 4M78 B; 2CGH A; 3JB9 D; 3FIF A; 1B34 B; 2RM4 A; 4RCC A; 3SWN A; 4C8Q A; 2DJZ A; 4EMG A; 2VC8 A; 5GAO n; 1N9S A; 1BIA A; 5GAM j; 4HA8 A; 4RCB A; 4A53 A; 1H64 1; 4M75 E; 3BFM A; 4M7D A; 5GAN f; 1M8V A; 3SWN B; 1HXD A; 5LJ3 d; 1WQ7 A; 4M78 G; 3V8K A; 4C8Q B; 4M78 C; 4QVC A; 3VU3 C; 5GMK e; 4XQ3 A; 5GAN g; 3JB9 G; 3QHS A; 4PJO A; 2EWN A; 4J6W A; 4M7D B; 1N9R A; 4F7U E; 1I4K 1; 3BY7 A; 1LNX A; 2DTO A; 4M78 F; 4PJO D; 3JB9 F; 1TH7 A; 4PNO A; 4PJO B; 4C8Q G; 4C8Q C; 3INZ A; 4C92 E; 5GAO r; 5LJ3 h; 4M75 A; 4M7D G; 2EJ9 A; 4A54 A; 4M7A A; 4XU2 A; 4C8Q F; 3RKY A; 5GMK l; 4JRI A; 5GAN 5; 4PJO G; 1HK9 A; 1YCY A; 5LJ5 f; 4M75 B; 5GAO p; 4PJO C; 4M7A D; 4M7D F; 4M7A B; 5LJ5 g; 4XTU A; 4HT8 A; 5GMK i; 3JCM c; 5I21 A; 4EMH A; 2YLC A; 3PGG A; 1LJO A; 4PJO F; 3JB9 J; 4XTX A; 2E65 A; 1WNL A; 3RUX A; 4C92 A; 4JUV A; 4NL2 A; 5GAN e; 4JLI A; 3RES A; 4M75 G; 2EJG A; 3RIR A; 4C8Q D; 5GAM d; 4M7A G; 4M7A C; 2EJF A; 2DXU A; 2QTX A; 4M77 E; 3SB2 A; 4C92 B; 4HT9 A; 4M7D D; 2DZC A; 4M75 F; 4XTW A; 3JCM e; 3L2Z A; 4J6X A; 4MMK A; 3JCM J; 2DVE A; 4XU1 A; 5GAO m; 4M7A F; 3SWN C; 5GMK j; 3JCM Q; 4V2S A; 1WPY A; 1KQ1 A; 3V8J A; 1Y96 A; 5LJ3 f; 5GAN 7; 4XTV A; 4XTY A; 3V7C A; 4C92 G; 3JCM d; 5GAM h; 4M7D C; 5LJ3 g; 4N0A A; 1I5L A; 1Y96 B; 4X9C A; 5LJ5 e; 2E64 A; 4M75 D; 5GAO q; 4C92 F; 2YHT A; 4F7U A; 3V7S A; 4M78 E; 3HSB A; 2RB6 A; 3BDU A; 1M5Q 1; 4QVD A; 3JB9 I; 2VXE A; 4J6Y A; 3JCM h; 3JCM W; 3QSU A; 5GMK h; 4F7U B; 1JRI A; 5GAN 6; 5GAN 3; 4MML A; 4DQ2 A; 1I81 A; 4M75 C; 3AHU A; 5GAN 8; 2E1H A; 2E10 A; 4C92 D; 3BW1 A; 2FB7 A; 1I8F A; 1X01 A; 4XU3 A; 4XTZ A; 1U1T A; 3QO3 A; 2DKG A; 4F7U G; 2I2L A; 4J5Y A; 5GAN 4; 5GAN j; 3EFS A; 4WF2 A; 5CAI A; 5GAN d; 5DY9 A; 1D3B A; 5LJ3 e; 3JCM X; 5GAM f; 4PJO E; 4C92 C; 2YLB A; 4F7U F; 3FB9 A; 2E41 A; 2JN0 A; 2EAY A; 3JCM b; 5GAM g; 1D3B B; 2VXF A; 1JBM A; 3FJP A; 4M77 A; 3RKW A; 3V7R A; 5GAN 2; 2RA2 A; 5LJ3 j; 2DXT A; 4EMK A; 4OP0 A; 3HFO A; 2DTH A; 1MGQ A; 3QUI A; 4M77 D; 4M7A E; 4M77 B; 5GAN h; 3JCM f; 4X9D A; 2ZGW A; 4EMK B; 5LJ5 j; 2DTI A; 2K57 A; 3JCM g; 4NL3 A; 3JCM V; 1LOJ A; 5LJ5 d; #chains in the Genus database with same CATH topology 1M8M A; 2HEQ A; 4C8Q E; 1U3O A; 4Y91 A; 1M3B A; 2KRS A; 3KXT A; 4IUQ A; 2O01 E; 1WI7 A; 5CK9 A; 2K2V A; 3JV3 A; 1VQK T; 2WAC A; 2BZY A; 2XID A; 1BIA A; 2FPF A; 3CCR A; 2PVG B; 1UJ0 A; 3JCM e; 3VU3 C; 1BYM A; 1C0M A; 2F5T X; 2PQW A; 2QEX T; 2RHZ A; 4QVZ A; 4C92 E; 1IRX A; 2XMF A; 3REA B; 4M7A A; 1WYX A; 5LJ5 f; 1N5Z A; 3VKI A; 1K4U S; 4J9H A; 1QVF A; 3CCL T; 4EMH A; 2O9V A; 1UGQ B; 2COW A; 3A8L B; 4FYV B; 2XDB A; 3P8B B; 2E70 A; 1QVG A; 2BIV A; 3EGD A; 3ZL7 C; 2D6F A; 4M7A G; 3A98 A; 4M7A C; 2E5Q A; 1RAB B; 3PFS A; 3I56 Q; 1Q95 G; 1YJN A; 2JM8 A; 1JJ2 P; 2BTT A; 5LJ3 f; 3VV0 A; 2MI6 A; 4BY6 C; 3G71 T; 2QGG A; 1I5L A; 1YIJ Q; 1AD5 A; 4OMN A; 1KHC A; 2WSC E; 1AT1 B; 3I55 Q; 3BDU A; 2LRQ A; 5GAN 6; 3GBQ A; 2C0I A; 1M90 C; 1YI2 T; 4J8O A; 2HKQ B; 4PFP A; 3TRE A; 1VQ5 A; 3HTR A; 4WF2 A; 1TSF A; 2BKD N; 3OYY A; 3H6Z A; 4PJO E; 5HKC A; 2JJ9 A; 4FW1 A; 2JS0 A; 3T9N A; 2LNV A; 1HD3 A; 3S3N A; 2HQX A; 2RNA A; 2HSE B; 3EG2 A; 3HFO A; 4PKC C; 5AYF A; 3OYD A; 4RTX A; 4BI8 B; 1LOJ A; 1X2K A; 1TTH B; 3OS5 A; 2EYQ A; 4LD9 K; 1VIE A; 2X35 A; 4CI0 C; 9ATC B; 1UEC A; 4F16 A; 1KIK A; 1VQP A; 3THK A; 5FLX E; 4WCI A; 2PU9 B; 3H8Z A; 1RAH B; 2DYB A; 2E6N A; 2K6D A; 2QG9 B; 3EG9 A; 3Q1J A; 1Q81 U; 3R6N A; 5GAN g; 3LX7 A; 1D0X A; 1NJI R; 4M78 F; 1UE9 A; 4RTY A; 1JXO A; 1X2Q A; 1VQL T; 2AZS A; 4M75 A; 4A54 A; 2RPN A; 2DD5 A; 3CBO A; 4M7D F; 2RQW A; 4IIM A; 1I5O B; 1GFD A; 1K73 R; 2J6K A; 4J9I A; 5KE3 A; 3JB9 J; 2MWO A; 3RUX A; 1PG5 B; 5GAN e; 1VA7 A; 4N4H A; 3RIR A; 4M75 G; 2F2W A; 1KC8 C; 2DL3 A; 3GPL A; 2Z0W A; 2EYZ A; 4XTW A; 2XHC A; 2V1R A; 1M27 C; 2DM1 A; 4O6J A; 1WHH A; 4C0D C; 2CS7 A; 2FRY A; 1OU8 A; 3JAM E; 2OTL Q; 1NLO C; 1N8R R; 2QXF A; 3V7S A; 1Y71 A; 1MMD A; 1T0H A; 1WX6 A; 2CH4 W; 5FRO A; 2LQK A; 2KRO A; 4DBQ A; 2AHJ B; 4A4E A; 4DBF A; 4XTZ A; 4RMO A; 5IH2 A; 3C0C A; 4KH1 B; 2DPP B; 3OMG A; 1IB8 A; 4B9X A; 1VQ9 T; 4M77 A; 3OS0 A; 4CC7 A; 1Z9Z A; 3TVT A; 2KVQ G; 1SKU B; 5KCO A; 2XI9 A; 4LDX A; 1GCQ A; 3CC7 Q; 2YDL A; 4N0A C; 1PWT A; 3LH0 A; 2R5M A; 4M77 G; 5A0L A; 4M77 C; 1UB4 A; 3M4G A; 4XU0 A; 3E1S A; 3M9Q A; 1S72 T; 1YJ9 Q; 1VQ7 Q; 1C1A A; 1GCQ C; 3SD4 A; 1VQM T; 1UFF A; 2RN8 A; 4C8Q A; 2DJZ A; 1OOT A; 3CME T; 2J6F A; 4JJC A; 5J3B A; 3GOX A; 1GXI E; 3JB9 G; 5CCA A; 3J81 E; 3OYN A; 2QDL A; 5CQX A; 4PJO B; 2CT4 A; 4C8Q G; 2CP2 A; 4C8Q C; 3INZ A; 1GFC A; 8ATC B; 2EJ9 A; 1AOJ A; 5A0G A; 4IUP A; 4IKF A; 1Y07 A; 1RAD B; 1SPK A; 2K2M A; 1TUD A; 3P8D A; 5FWC A; 4C92 A; 1K1Z A; 3CCM Q; 2GTJ A; 4FYW B; 2EIF A; 4FM4 B; 1M1K U; 2QA4 T; 2E5K A; 2JW4 A; 2B8A A; 3G6E Q; 3L2Z A; 2YUN A; 4ZTJ A; 4ZGJ B; 1ABO A; 2K3X A; 5D6W A; 2M0Y A; 4C92 G; 1VQ8 A; 3ULR B; 1WA7 A; 1QP2 A; 5KYW B; 2D9T A; 1FX7 A; 3CC2 T; 1TUC A; 4B6M A; 1NYG A; 1SHF A; 2BE7 D; 1YJW T; 1JJ2 A; 4M78 E; 4DOW A; 4J6Y A; 3M0Q A; 2ZPH B; 4PJL A; 1WLP B; 4TVR A; 3S3M A; 1YNZ A; 1X27 A; 2DAQ A; 3OW2 S; 3NFC A; 1U06 A; 3RBB B; 1X6B A; 5DY9 A; 2CP5 A; 3JSC A; 5GJV B; 4E7Z A; 4F7U F; 2L3S A; 1BKB A; 3CCQ A; 2OAW A; 1D3B B; 1VQ6 T; 3A8H B; 1RAA B; 2NLU A; 2DIQ A; 3PVQ A; 1YBY A; 2FPD A; 2FPE A; 2JS2 A; 2ZGW A; 2D0N A; 1OPL A; 4Y92 A; 4PFO A; 3EFR A; 2MWP A; 1E7O A; 1UHF A; 4K11 A; 3DKM A; 1AWW A; 1X6O A; 3CCV Q; 2F2V A; 3SDZ A; 3CEY A; 1BI0 A; 1NYF A; 2M1H A; 4BDY A; 4L59 A; 3OYC A; 1EX4 A; 3CCU Q; 1TXQ A; 4A4H A; 1XJW B; 4MDW A; 2JTF A; 2D1X A; 2PUO B; 4KT0 E; 5I11 A; 1S1N A; 2EQU A; 3C4S A; 5GAO r; 1YWP A; 4FU6 A; 2EQJ A; 1X6G A; 2VUB A; 2HQE A; 1VQO A; 1KHI A; 3E19 A; 3UPU A; 2NUZ A; 1VQ4 Q; 4JJD A; 1M2V B; 2E65 A; 1U5S A; 1WNL A; 4OMO A; 2PZ1 A; 1FMK A; 2DXU A; 4LDY A; 1VQ8 T; 2KK4 A; 2L3P A; 4A4F A; 3MO8 A; 1F1B B; 1VQN A; 1DJ7 B; 2X3W D; 4V2S A; 1WPY A; 2FG0 A; 2LT4 A; 1H92 A; 2KYM A; 5CKH A; 2QQR A; 2FRW A; 3JCM d; 1XQH A; 3O8V A; 2GBQ A; 4FSS A; 4JJN K; 4HVW A; 4FIB A; 3MP8 A; 2BZ8 A; 1N8R U; 1I1J A; 2PNI A; 2BUD A; 1YHQ T; 2DL7 A; 2FHD A; 4D8D A; 3NHN A; 2KT8 A; 2FZG B; 3CCQ T; 3CQT A; 2FVU A; 1W70 A; 4HVV A; 5GAN 4; 2VGN A; 4DEX A; 5GAM f; 1YFN A; 1VYV A; 3I5S A; 2DTH A; 2J05 A; 4F04 B; 2O4X A; 2A36 A; 3QII A; 2C0O A; 2ROL A; 4Z02 A; 2EBP A; 1FXX A; 2DE0 X; 3SHW A; 3CCE Q; 1Q86 U; 4R0K A; 2OTJ Q; 1W2B P; 1U1S A; 2RHY A; 4QQ6 A; 1BI1 A; 4MZP A; 4LUE A; 2SRC A; 1KQS P; 3QYH B; 3RKX A; 3L2R A; 4M78 B; 5IT9 E; 4MZT A; 2MMP A; 1B34 B; 1X69 A; 1K9M R; 5GAO n; 4RKU E; 1HSQ A; 1QVF S; 1WHK A; 1M8V A; 3SWN B; 3LWH A; 5GMK e; 1D1A A; 2BZX A; 2JVV A; 2LX7 A; 1UJY A; 1I0C A; 4J6W A; 1QVG S; 4M7D B; 4F7U E; 1LPL A; 3TCJ A; 2NUT B; 1UGR B; 4ME7 A; 3OS1 A; 1RLQ C; 1FMV A; 5IHK A; 2GFA A; 3WVD B; 2C0T A; 2DMO A; 3S6W A; 4L6V 5; 1EIF A; 2A0F B; 1IHV A; 3SFM A; 1VQN T; 2EQI A; 4BUG A; 2RHI A; 2V1Q A; 4A4G A; 4M7D D; 1VQK A; 1X75 C; 2DZC A; 2VYT A; 2CZ6 B; 4J6X A; 5KE2 A; 2MCN A; 3MEU A; 4XTV A; 1UHC A; 3L2U A; 3BE3 A; 1Q81 C; 3M0R A; 3NPF A; 2LCL A; 3EGX A; 1WJQ A; 1SRL A; 2QEX A; 2YHT A; 3HRU A; 2O88 A; 4KH0 B; 4EPC A; 1WHJ A; 3HSB A; 2QYZ A; 2O9S A; 3QBY A; 5CO7 A; 3MEV A; 2DO3 A; 2YRC A; 3CCL A; 3CD6 T; 2KY9 A; 3E9F A; 3M53 A; 5GAN d; 1PRL C; 1R0C B; 2YLB A; 1HYO A; 3QWY A; 5GAN 2; 1K0S A; 5LJ3 j; 2R57 A; 1NZ9 A; 2M51 A; 2LT1 A; 2R58 A; 1RAG B; 4OMQ A; 1PD0 A; 3G71 A; 2F69 A; 4QQD A; 1ZUU A; 2H8H A; 2ZZD A; 2XD0 A; 2VGM A; 2KE9 A; 3PVL A; 4R56 A; 2EGC A; 1T0J A; 2R5A A; 1TWB A; 1ZSG A; 1YI2 A; 4N4G A; 1W6X A; 2QGF B; 1BIB A; 3FIF A; 2LCC A; 2RM4 A; 3CCJ Q; 4AMC A; 4AFS C; 3PMT A; 1G2B A; 3M55 A; 3L2Q A; 4GY5 A; 1BI2 A; 1YIT Q; 2CP0 A; 2P0Q A; 1MV3 A; 1RL2 A; 1TU0 B; 4R55 A; 1M30 A; 3NTI A; 3H0I A; 3IQL A; 1QQJ A; 3TU4 K; 2IVW A; 4XU2 A; 5L23 A; 3KUF A; 1B3Q A; 4M7A D; 5LJ5 g; 2QDY B; 3OS2 A; 3HL8 A; 3VS3 A; 2E4H A; 4DBR A; 1ACM B; 3R6O A; 2QTX A; 1QCO A; 4RG8 A; 2CUB A; 4LNP A; 3OB9 A; 3REB B; 2KNB B; 2X9H A; 2P4T A; 5GAO m; 4C0Z A; 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1S72 A; 1JJ2 S; 3A8O B; 4JUV A; 1QP3 A; 4JLI A; 1KD1 U; 4E7K A; 2GFU A; 1VQM A; 4N4I A; 5KYU B; 1ZA2 B; 2W10 A; 4OB2 B; 4PLI A; 4XK8 E; 3EH1 A; 3D7S B; 2DVE A; 3CCR Q; 2L89 A; 3CME A; 3BDL A; 1KQ1 A; 3OSV A; 4NS5 A; 4E2F B; 1I07 A; 4JDS A; 3UDC A; 1PM3 A; 1H3Z A; 1AEY A; 3VYH B; 5KYY B; 3OYJ A; 3LGL A; 1NPR A; 3JCM h; 3I35 A; 3EFO B; 4GBQ A; 2CRE A; 4MML A; 1G8X A; 4M75 C; 1SHG A; 2DLP A; 3HPW A; 2V8J A; 2FZC B; 1X01 A; 2ZPF B; 2HBW A; 1PC0 A; 1WXT A; 5C0M A; 1KC8 R; 4KGZ B; 4BE0 A; 2QA4 A; 4HCK A; 4J83 A; 3V7R A; 2RQU A; 2OTL T; 1YJN Q; 5D6X A; 4M77 D; 2KBT A; 3MP1 A; 2XKO C; 2NUP B; 1NBE B; 4X1V A; 3OSS C; 3CC2 A; 1YJW A; 2RHU A; 1UGP B; 1N8R C; 5GMK m; 2FYK A; 3EG3 A; 2ED1 A; 2RK1 A; 4FW2 A; 2DL4 A; 4NOY A; 4BDZ A; 3JCM P; 2HCK A; 3H0F A; 3JB9 D; 1VQ5 Q; 3CC4 Q; 5C6S A; 3M58 A; 2LCS A; 2FO0 A; 2KAF A; 5L8R E; 1ZQ1 A; 1KK7 A; 2Y4X A; 2ABL A; 4HCZ A; 2K5I A; 1VQ6 A; 1K8A U; 3CC7 T; 2DBK A; 5IXB A; 2H3E B; 1ZBJ A; 4JLG A; 3VS6 A; 4FL6 A; 4C0G A; 5D6Y A; 5IAY A; 3VJP A; 4JRI A; 4RTV A; 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