The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
MEYVEALYQFDPQQDGDLGLKPGDKVQLLEKLSPEWYKGSCNGRTGIFPANYVKPAF
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural analysis of the yeast SH3 domain proteome
rcsb |
| molecule keywords |
Pin3p
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
11
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-01-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4HXJ A; 2ESW A; 3NMZ C; 3PVL A; 2LX7 A; 1G2B A; 1WIE A; 4OMM A; 1A0N B; 1X2Q A; 2XMF A; 2GBQ A; 2J7I A; 1PNJ A; 1ZUY A; 1HD3 A; 1S1N A; 1SPK A; 2L0A A; 1UJ0 A; 3EHR A; 3EG3 A; 1YNZ A; 1FYN A; 2FRY A; 2RN8 A; 2RQV A; 1MV3 A; 5HCK A; 1M3B A; 1UG1 A; 1I0C A; 2D8J A; 2DA9 A; 2CUD A; 1AWO A; 4CC3 A; 1WDX A; 4HVW A; 2CH4 W; 1AZG B; 2HSP A; 1QKX A; 1TG0 A; 2DL4 A; 1T0H A; 1OEB A; 3IQL A; 3QWY A; 2C0O A; 2O9S A; 1RLQ C; 4ESR A; 1BK2 A; 3NHN A; 4LUD A; 3VS5 A; 2LJ3 A; 1FMK A; 2LMJ A; 2K7A A; 2RQU A; 4J9E A; 2O31 A; 1ABO A; 1NLO C; 1M3C A; 1GCQ C; 2HBW A; 1T3S A; 2W10 A; 3H0F A; 2ED1 A; 4AG1 C; 3QWX X; 1X27 A; 4AG2 C; 3M0U A; 4AFZ C; 1PWT A; 2BZX A; 2DRK A; 1W1F A; 1U3O A; 2LQW A; 4Z88 A; 2DYB A; 3THK A; 3VS3 A; 1Z9Q A; 3UA6 A; 1Z9Z A; 2JXB A; 3EHQ A; 1GFD A; 2AKL A; 2O9V A; 3M0R A; 2PZ1 A; 1LCK A; 5IHK A; 3RBB B; 2CUB A; 3EG1 A; 4IIM A; 3CQT A; 1K1Z A; 4HVV A; 3LH5 A; 2EYZ A; 2PTK A; 3KFV A; 4ORZ A; 2MIO A; 4LN2 A; 4IIO A; 3VS0 A; 1E6G A; 5I22 A; 1AVZ C; 2M0Y A; 4J9D A; 2YUP A; 5GJV B; 4OMN A; 5IHN A; 1J3T A; 2GQI A; 2KXD A; 1UHC A; 2EW3 A; 4KRT A; 2D1X A; 1GBQ A; 1RUW A; 1WXT A; 2FPD A; 3EG2 A; 1WXB A; 2HCK A; 1PKT A; 1VYT A; 1M8M A; 2J05 A; 2YDL A; 2KT8 A; 2DBK A; 2LQN A; 2AKK A; 1NEB A; 2DLP A; 2EGC A; 1PHT A; 2F2W A; 5IXF A; 1E7O A; 4AFU C; 1K9A A; 1KFZ A; 2O2O A; 2X3W D; 1SHG A; 2GTJ A; 1G83 A; 2CH4 A; 1AOJ A; 1UDL A; 2JMA A; 2ECZ A; 4LUE A; 2NWM A; 1Y0M A; 4A63 B; 2DL7 A; 2A28 A; 3NGP A; 1GCP A; 2JM8 A; 1UEC A; 3UAT A; 4CC4 B; 4RTU A; 1GBR A; 2KRO A; 1UUE A; 2EYX A; 2M51 A; 2VVK A; 3JV3 A; 1RLP C; 2YUQ A; 3VRZ A; 2K6D A; 1T3L A; 2K9G A; 3M0S A; 2X3X D; 1OOT A; 5I11 A; 5ECA A; 2DX1 A; 2J06 A; 2NUZ A; 4X1V A; 1NYG A; 1RI9 A; 2DMO A; 2AZS A; 3REB B; 2DL3 A; 2W0Z A; 2BZ8 A; 2P4R A; 4Z89 A; 4JPB W; 2C0T A; 1JO8 A; 3RNJ A; 1QKW A; 2CRE A; 2LJ1 A; 1AWW A; 5FW9 A; 1VYU A; 4FSS A; 1M3A A; 2O88 A; 1B3Q A; 2KYB A; 2RPN A; 2K79 A; 1WA7 A; 3NPF A; 4J9H A; 2DRM A; 4AFQ C; 1AZE A; 2VWF A; 2OJ2 A; 1YWP A; 1PRL C; 4JJC A; 1UE9 A; 1UJY A; 2J6K A; 4D8K A; 1MV0 B; 1JQQ A; 1GRI A; 1ZSG A; 2KXC A; 3REA B; 2FPE A; 2KYM A; 3O5Z A; 2A37 A; 2KEA A; 3M0Q A; 1KJW A; 2RMO A; 1WX6 A; 2A08 A; 3C0C A; 1KIK A; 3U23 A; 4DEX A; 2ED0 A; 2A36 A; 1HSQ A; 2DF6 A; 2EGE A; 2V1Q A; 4EIK A; 1M30 A; 2RQW A; 1UGV A; 1K4U S; 2LZ6 B; 4OML A; 1K0S A; 1ZUK A; 1OPK A; 2KE9 A; 1JEG A; 1VYV A; 1GCQ A; 2DNU A; 1JXM A; 3I35 A; 1WXU A; 1NLP C; 3TSZ A; 4RTV A; 4F17 A; 2JMC A; 1SHF A; 1XOV A; 2QDL A; 3VS7 A; 2LCS A; 1WFW A; 2KRS A; 2CT4 A; 3I5R A; 1OPL A; 2KRN A; 2KRM A; 2YUO A; 2B86 A; 2F2X A; 3TSW A; 3FJ5 A; 2AK5 A; 2OAW A; 2EYW A; 2KR3 A; 3H0I A; 5IH2 A; 2RF0 A; 2CDT A; 4HVU A; 2PNI A; 1W6X A; 1ABQ A; 4F16 A; 1VA7 A; 1AD5 A; 1U06 A; 2V1R A; 2BZY A; 4Z8A A; 2D8H A; 1BB9 A; 2IIM A; 2KBT A; 1ZBJ A; 1X6G A; 2ROL A; 4J9G A; 1WLP B; 4RTT A; 2JS2 A; 2FRW A; 4ZNX A; 4JZ3 A; 1T0J A; 1I1J A; 1CKA A; 4K11 A; 1NEG A; 1M27 C; 1K0X A; 4CC2 A; 4WCI A; 2E5K A; 3VS1 A; 2RQR A; 2LJ0 A; 4R0K A; 4JJB A; 4E6R A; 4J9C A; 1KSW A; 1BU1 A; 2RNA A; 2VKN A; 5FWC A; 2D0N A; 4CC7 A; 3I9Q A; 3VS2 A; 1K76 A; 1X69 A; 2J6F A; 1WI7 A; 2RQT A; 2CT3 A; 2CSI A; 4J9F A; 1X2K A; 2FPF A; 4JZ4 A; 1W70 A; 1BBZ A; 3ULR B; 1EFN A; 1CKB A; 1E6H A; 1QLY A; 4F14 A; 1OV3 A; 1AWX A; 2SEM A; 4D8D A; 2J6O A; 3A98 A; 1H8K A; 2MCN A; 4OMP A; 3VRY A; 3UA7 A; 1ARK A; 3ZL7 C; 4HCK A; 2EVR A; 2HDA A; 1IO6 A; 3VS6 A; 4AFS C; 2FO0 A; 1ZUU A; 1SRL A; 2DL8 A; 4RTX A; 3PVQ A; 2GGR A; 1PKS A; 4J9B A; 1WYX A; 1NYF A; 2ENM A; 1SEM A; 1YN8 A; 2DVJ A; 1JU5 C; 2LP5 A; 3H41 A; 2SRC A; 1X6B A; 2DE0 X; 2CSQ A; 4RTW A; 3M0P A; 1ZLM A; 3PE0 A; 5FWB A; 4OMO A; 1NG2 A; 2H8H A; 3GBQ A; 1GFC A; 2KNB B; 1JXO A; 1V1C A; 1QWE A; 4J9I A; 1SSH A; 1SRM A; 2JW4 A; 2JT4 A; 2LNH B; 1HJD A; 2EGA A; 1MUZ A; 1UTI A; 2AZV A; 3M0T A; 5IXB A; 2DL5 A; 5IHI A; 2HEQ A; 2OI3 A; 3TVT A; 2DM1 A; 2FG0 A; 4Y92 A; 2L3Q A; 4LNP A; 1PRM C; 1QWF A; 4LE9 A; 1NM7 A; 2K2M A; 2YT6 A; 5L23 A; 2KGT A; 1N5Z A; 4DEY A; 2ROT A; 4M4Z A; 3SEM A; 2DJQ A; 1YCS B; 2G6F X; 4GBQ A; 1YP5 A; 4QT7 A; 1ZX6 A; 2JTE A; 3SHW A; 1QCF A; 1CSK A; 1UHF A; 1AWJ A; 2MOX A; 4RTZ A; 1AEY A; 4OMQ A; 2EPD A; 3UF4 A; 2FEI A; 1UFF A; 2I0N A; 3R6N A; 2GTO A; 3EGU A; 1H3H A; 1U5S A; 1X43 A; 2EQI A; 2C0I A; 1Y57 A; 3I5S A; 3EG0 A; 4RUG A; 2F2V A; 1YWO A; 1TUC A; 2EKH A; 1I07 A; 2BTT A; 2JS0 A; 1GL5 A; 2JM9 A; 5EC7 A; 2K3B A; 2EBP A; 2L2P A; 2YSQ A; 4GLM A; 2ABL A; 4RTY A; 2EYY A; 1B07 A; 1H92 A; 2L3P A; 2KT1 A; 4JJD A; 3VS4 A; 2GNC A; 2YUN A; 3H0H A; 2L3S A; 1TUD A; 2DIL A; 5GJW B; 2DBM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1G3Y A; 2E1H A; 2O4X B; 3PVL A; 1G2B A; 4KGZ B; 1A0N B; 5LJ3 g; 2GBQ A; 4WTO B; 4PLL A; 1ZUY A; 1HD3 A; 2F1L A; 2BIV A; 3G7Z A; 2L0A A; 2ZPE B; 3V7S A; 4DA4 A; 1FYN A; 1UG1 A; 4DBR A; 1S72 A; 5GAN d; 3DB4 A; 2CUD A; 4CC3 A; 4HVW A; 2CH4 W; 2HSP A; 1QKX A; 1TG0 A; 1S72 Q; 1N9S A; 3IQL A; 5LJ5 j; 3QWY A; 5GAM e; 3HKS A; 4ESR A; 5GMK l; 1BK2 A; 1G3W A; 5HK0 A; 1B34 A; 4LUD A; 4J83 A; 3TQ7 P; 2LMJ A; 5LJ3 j; 4Z02 A; 3JCM X; 4ME7 A; 1M3C A; 3HRS A; 2EQM A; 4NL2 A; 3ZFJ A; 1M1G A; 1X27 A; 4EPC A; 2EIF A; 4AFZ C; 1H3Z A; 2DVE A; 3TU4 K; 1KQS S; 1D0Y A; 4E7K A; 5A0L A; 3M0R A; 1Q82 R; 3HTR A; 1M9S A; 3VKI A; 4IIM A; 3JB9 H; 5CKF A; 3S3M A; 5FLX E; 3CCL T; 2XU8 A; 2CP3 A; 4HVV A; 4M7A C; 2K3Y A; 3LH5 A; 1LPL A; 4O6J A; 1C1A A; 3KFV A; 2FYK A; 2PTK A; 1WNL A; 4ORZ A; 2MIO A; 4IIO A; 1AVZ C; 4RG8 A; 4J9D A; 2XK0 A; 2RHZ A; 5IHN A; 2GQI A; 2MPX C; 5J26 A; 5HKC A; 3CCV A; 3L2R A; 2FPD A; 2ZPH B; 1OZ3 A; 2YLC A; 2HCK A; 2CP0 A; 3DB3 A; 4ZN3 A; 4IUP A; 3PIP A; 1K9M C; 3MET A; 3CCV Q; 2J05 A; 4PKC C; 1NEB A; 2EGC A; 2F2W A; 5IXF A; 1K73 U; 5CVI A; 3L1A A; 4AFU C; 1FXX A; 3CCR T; 2X4Y A; 2X3W D; 1WHK A; 1SHG A; 2GTJ A; 3C12 A; 4EMK B; 1G83 A; 4CI0 C; 3CPW A; 4CRI A; 2ECZ A; 1BCO A; 3OB9 A; 4PK4 A; 2KK4 A; 2F69 A; 1Y0M A; 1WGS A; 1VQ7 T; 1GCP A; 4M77 C; 1Q7Y R; 5KYU B; 4OGE A; 3LH0 A; 4GLK A; 3RMQ A; 4QKU A; 2M51 A; 3VRZ A; 1MMD A; 3OS1 A; 4BDZ A; 1BI2 A; 4ANJ A; 4BY6 C; 1D1C A; 5I11 A; 2J06 A; 2XKO C; 5IT9 E; 1D1A A; 2DMO A; 2P0K A; 1TS9 A; 3P8D A; 2P4T A; 4Z89 A; 3PT9 A; 1JO8 A; 3WVE B; 4J6X A; 5GAM h; 3CPW P; 4FSS A; 1VQN T; 3QII A; 3EGX B; 4C8Q C; 3GIB A; 4D6W A; 3F70 A; 2KYB A; 1VIF A; 3C4S A; 2RPN A; 2K79 A; 4N0A A; 1JB0 E; 2DRM A; 3R6O A; 3SWN B; 4QQD A; 1BI1 A; 4D8K A; 4FSX A; 1S72 T; 2D0Q B; 1GRI A; 2MWO A; 1ZSG A; 1FWZ A; 1WHM A; 3TEE A; 3GP8 A; 2RJE A; 4C5I A; 1PG5 B; 2ED0 A; 4DEX A; 2A36 A; 2HQE A; 1HSQ A; 2QG9 B; 3I55 A; 4X9D A; 3PGG A; 4EIK A; 3P8H A; 3VV0 A; 2RHI A; 1UGV A; 3V8K A; 2LZ6 B; 4OML A; 4HCB A; 5A2Q E; 2NUP A; 5KYX A; 2GFU A; 3I55 Q; 3OYY A; 2KE9 A; 1NJI R; 4J6Y A; 5FU7 C; 4NOY A; 1JEG A; 1GCQ A; 1JXM A; 4V2S A; 1IB8 A; 3TSZ A; 2AT1 B; 3EFS A; 1RAG B; 1Q95 G; 3C95 A; 4F7U E; 1XOV A; 2IVW A; 3OYL A; 2CT4 A; 2PVO B; 1M90 U; 3FRN A; 2Y4X A; 2AK5 A; 4M78 B; 4YTL A; 2RJC A; 1KC8 R; 3N5B B; 1VQL A; 2QQS A; 1QVG A; 4DOW A; 2Y90 A; 2WSE E; 4PJO B; 2CDT A; 1YHQ A; 5KYY B; 1WHL A; 1W6X A; 1NZ9 A; 2K5F A; 3Q1J A; 1VQL Q; 5FRM A; 4F16 A; 4PFP A; 5CK9 A; 1U06 A; 2DZC A; 2QQB A; 1Y07 A; 4Z8A A; 1YHQ Q; 4L6V 5; 2D8H A; 2HMA A; 4QVC A; 2EKO A; 1C6V X; 4RTT A; 1BI3 A; 2Y4Y A; 3G6E A; 1M27 C; 3G71 A; 4CC2 A; 3VS1 A; 2RQR A; 2LJ0 A; 4MML A; 4JRQ A; 3RER A; 2JNG A; 3G6E Q; 3G71 Q; 4J9C A; 4AT1 B; 2D0N A; 4CC7 A; 3LLR A; 3L2U A; 1QVG P; 2KAF A; 2CSI A; 4KUI A; 3OYM A; 3EG9 A; 4JZ4 A; 2HZY A; 2L5Q A; 1BBZ A; 1VQ6 T; 2DKG A; 1EFN A; 2JVV A; 1CKB A; 1E6H A; 4OGC A; 5GAM g; 2MF2 A; 1I81 A; 1IGQ A; 2KI7 A; 3A98 A; 3BW1 A; 3EGD A; 1KD1 R; 1Q81 U; 2CGH A; 2F5K A; 3VRY A; 3ZL7 C; 3HRU A; 3CPW S; 3MHX A; 2XIC A; 4AFS C; 2DXT A; 5CQY A; 4XQ3 A; 5DM7 R; 1ZUU A; 4FT4 A; 3FB9 A; 3OYB A; 2COZ A; 4OMF B; 2X9H A; 3M58 A; 4M7A B; 1VQ8 A; 5GAM j; 1YN8 A; 1PD0 A; 1VQO A; 1JU5 C; 4ZGJ B; 3H41 A; 3S3O A; 1WHJ A; 1VQ8 Q; 2DZ9 A; 3CBO A; 4DBQ A; 1C0M A; 1HYO A; 4RTW A; 1VQO Q; 5CCA A; 3T9N A; 3QBY A; 2JN0 A; 4A4K A; 1P92 A; 3OS5 A; 4OMO A; 4C0D B; 1M1K U; 4FM4 B; 5CIU A; 1QQJ A; 2QTV A; 1ZSZ A; 1VQK T; 3G4S A; 3OYI A; 4ATO A; 4A4G A; 2JT4 A; 4F7U B; 3EH2 A; 4C92 D; 1WPY A; 1ZBX A; 2OI3 A; 1Q81 C; 1R77 A; 2VXF A; 3M4G A; 2VXE A; 1QVF A; 2YLB A; 5L23 A; 2KGT A; 4C5G A; 3I56 T; 5GMK i; 2MYS A; 2VB6 A; 4XU3 A; 3MJX A; 5J39 A; 2BUD A; 1R8O B; 3HP9 A; 1M2V A; 1YCS B; 2G6F X; 1QCF A; 4L5G A; 1CSK A; 1AEY A; 2EPD A; 2NUT B; 2FEI A; 2E12 A; 1AHJ B; 4EDU A; 2JJ9 A; 3CMA A; 4C92 F; 4MDW A; 1Y57 A; 2E3H A; 4RUG A; 4BY6 B; 1Y7X A; 1G3T A; 1YWO A; 2EKH A; 2BTT A; 2JS0 A; 2RHU A; 2VGN A; 3X26 B; 1GL5 A; 2RD1 A; 5AYF A; 5EC7 A; 2K3B A; 2EBP A; 3FC3 A; 2YSQ A; 3G1J A; 1YJ9 A; 2RHX A; 2HL3 A; 4F7U A; 1M1K C; 2QI2 A; 3VJP A; 2L3P A; 2GFA A; 4JJD A; 2GNC A; 1YJ9 Q; 4HKE A; 4BD3 A; 5CKD A; 2ESW A; 3FDR A; 4EMK C; 2LX7 A; 1WIE A; 2XMF A; 5KYW B; 1QVG S; 2J7I A; 4N0A C; 1S1N A; 2MMP A; 5I2M A; 1UJ0 A; 3GLX A; 2YRC A; 1YNZ A; 2FRY A; 2RN8 A; 2RQV A; 4LDW A; 5FU6 B; 3JB9 J; 1M3B A; 1I0C A; 2D8J A; 1TOV A; 2L89 A; 4TVR A; 4C92 G; 3JSC A; 4ZGD B; 4JUV A; 4HT8 A; 2QAS A; 2E10 A; 1WHH A; 3M4Y A; 4E7I A; 2C0O A; 3EFO A; 4J7F A; 4B6M A; 3KXT A; 4DBH A; 3CCM T; 3VS5 A; 3OYK A; 3M53 A; 4PJL A; 4ELY C; 4XTW A; 3JCM V; 5FU7 B; 2K7A A; 2RQU A; 4N4H A; 2O31 A; 1ABO A; 1NLO C; 1GCQ C; 2ED1 A; 5FRN A; 3M0U A; 4PJM A; 1SG5 A; 1PWT A; 2BZX A; 1TXQ A; 2LQW A; 3JCM f; 1U3O A; 2M1H A; 2CZ0 B; 2RI5 A; 3RKY A; 2OTJ A; 1Z9Q A; 2PU9 B; 4FCY A; 2YXY A; 2JXB A; 2OTJ Q; 3EHQ A; 4Y28 E; 2E64 A; 3M59 A; 3QPH A; 5GAN j; 1GFD A; 4JS5 A; 3RBB B; 3CBM A; 3X20 B; 3EG1 A; 1RAH B; 3CQT A; 4A54 A; 1VQ4 A; 4M75 E; 2CYZ B; 2ZAE A; 2X35 A; 4HA8 A; 1E6G A; 3VS0 A; 3CCS A; 1VQ4 Q; 2HAX A; 2YUP A; 2PQW A; 2EQJ A; 3JCM d; 2E70 A; 3CCS Q; 1UHC A; 4KRT A; 2D1X A; 1WXT A; 2A0F B; 5KH6 A; 2V8I A; 2XID A; 4A4H A; 4R55 A; 1O9S A; 4JLG A; 4PNO A; 1YJW A; 2YDL A; 4ZN1 A; 3JB9 D; 2DBK A; 2RJF A; 3NTI A; 2MAM A; 3CD6 A; 1PHT A; 3CC2 A; 4M7D D; 2CZ6 B; 1D3B A; 3J80 E; 1K9A A; 3UT1 A; 1YBY A; 3FEO A; 4XU2 A; 1B34 B; 3CD6 Q; 2JZ2 A; 1KFZ A; 2LCC A; 2CH4 A; 1AOJ A; 5GMK e; 4N4G A; 3ASK A; 4KH1 B; 4OVA A; 1PSE A; 2M9U A; 1N8R R; 2NWM A; 4IUT A; 2MWP A; 4A63 B; 2DL7 A; 2A28 A; 2QEX T; 1Q86 U; 2JM8 A; 4LDY A; 2KRO A; 4ZTJ A; 2XDP A; 3JV3 A; 4E47 A; 3OA6 A; 3JB9 F; 1GXI E; 1QVF S; 4FYX B; 3FLG A; 3M54 A; 4M7D F; 3M0S A; 2DJZ A; 2V8K A; 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