The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
MEYVEALYQFDPQQDGDLGLKPGDKVQLLEKLSPEWYKGSCNGRTGIFPANYVKPAF
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural analysis of the yeast SH3 domain proteome
rcsb |
| molecule keywords |
Pin3p
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
11
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-01-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1NYF A; 1UHC A; 2LMJ A; 1HJD A; 3I5R A; 3JV3 A; 2FRY A; 1JU5 C; 2O9V A; 2HDA A; 2OAW A; 2KGT A; 2HCK A; 3M0U A; 1MV0 B; 2RF0 A; 1TG0 A; 2EPD A; 2W10 A; 4LUD A; 2JS2 A; 4OMO A; 2YT6 A; 1QLY A; 2J6F A; 2DX1 A; 3I5S A; 1OPK A; 2CSQ A; 2K9G A; 2YSQ A; 5I11 A; 1QWE A; 3EG1 A; 2W0Z A; 4ZNX A; 2AZS A; 2HEQ A; 2OI3 A; 1X27 A; 4IIM A; 3QWY A; 1KIK A; 1WA7 A; 1Y0M A; 2MCN A; 3R6N A; 2ROT A; 1UTI A; 2AKK A; 3GBQ A; 3M0T A; 4HVW A; 2QDL A; 1IO6 A; 1ZUY A; 4AFZ C; 2FPD A; 4OMM A; 2DM1 A; 2H8H A; 1AVZ C; 1SEM A; 1UGV A; 1H8K A; 1W70 A; 3U23 A; 1WX6 A; 2JS0 A; 2GTJ A; 1H3H A; 4OMP A; 2JT4 A; 4WCI A; 2RQT A; 1ZUU A; 5GJW B; 4EIK A; 2RQR A; 4F14 A; 2D8J A; 1WXB A; 4E6R A; 1OOT A; 1SHF A; 3ZL7 C; 3ULR B; 3VS5 A; 1YWP A; 1TUD A; 4AFU C; 1NEB A; 2LX7 A; 3UAT A; 4QT7 A; 1JQQ A; 1RUW A; 2MIO A; 2LQN A; 3H41 A; 2K6D A; 4D8D A; 3H0F A; 2V1R A; 2RPN A; 2L3Q A; 1X6G A; 5L23 A; 4ESR A; 3VS2 A; 4LUE A; 1VYV A; 3EGU A; 2K7A A; 1T3L A; 2DL5 A; 2DRK A; 2DJQ A; 1UDL A; 1AWO A; 2C0O A; 1X2Q A; 4OMQ A; 3A98 A; 1BBZ A; 3UA7 A; 2GTO A; 1ZX6 A; 2CUD A; 1Y57 A; 3IQL A; 1UUE A; 2FO0 A; 4J9D A; 4GBQ A; 4J9B A; 2D8H A; 2JMA A; 3NPF A; 1W6X A; 4JJD A; 1SRL A; 1AWW A; 2KRM A; 3RNJ A; 1WI7 A; 4FSS A; 1ARK A; 1FYN A; 2KRN A; 2VVK A; 3M0P A; 1CKB A; 3UF4 A; 1M8M A; 1V1C A; 2B86 A; 4AFQ C; 1SPK A; 2KE9 A; 1AD5 A; 2CT3 A; 1T0J A; 2A37 A; 1CSK A; 1I07 A; 3QWX X; 1U5S A; 4JPB W; 2J6O A; 2M0Y A; 3H0H A; 2X3X D; 5FWB A; 2K2M A; 3TVT A; 3M0Q A; 2PZ1 A; 1QCF A; 4HCK A; 4LNP A; 1QWF A; 5HCK A; 4J9H A; 2KXC A; 1HSQ A; 1K1Z A; 1GL5 A; 3O5Z A; 4RTY A; 3VS0 A; 1GCP A; 5FWC A; 3VS1 A; 2K3B A; 2V1Q A; 1GCQ C; 1E6H A; 1MV3 A; 2DE0 X; 2EGE A; 2F2X A; 4CC2 A; 3SHW A; 4J9I A; 2DNU A; 1K0X A; 2CH4 A; 4HVV A; 3I35 A; 4GLM A; 3UA6 A; 1W1F A; 3THK A; 1JXO A; 3EG2 A; 4K11 A; 1BU1 A; 2EGA A; 3PVQ A; 1QKX A; 2GQI A; 2JM9 A; 3VRY A; 2DL3 A; 2ROL A; 4RTU A; 1UJY A; 3M0S A; 3NGP A; 5FW9 A; 4Z88 A; 3FJ5 A; 2KR3 A; 1AOJ A; 2LZ6 B; 1CKA A; 4RTX A; 4F17 A; 1AZE A; 5IHI A; 4HVU A; 4ORZ A; 1YCS B; 4OMN A; 2I0N A; 2DL8 A; 1M3A A; 2KXD A; 2EBP A; 2IIM A; 1HD3 A; 3EG3 A; 1B07 A; 1VYU A; 2EQI A; 2EYZ A; 2XMF A; 1XOV A; 2KT8 A; 2ED0 A; 2O31 A; 2VWF A; 2MOX A; 2CUB A; 3REA B; 1RI9 A; 2DL4 A; 1U3O A; 2ECZ A; 2LNH B; 4J9F A; 5IHK A; 1K0S A; 1UEC A; 1U06 A; 4M4Z A; 2NUZ A; 1AEY A; 2RQV A; 1BB9 A; 2DBK A; 4OML A; 4DEX A; 2FPE A; 4X1V A; 4J9G A; 1X6B A; 4A63 B; 1KJW A; 2FG0 A; 4KRT A; 1GCQ A; 1VA7 A; 1MUZ A; 2D1X A; 1WYX A; 1NM7 A; 2DL7 A; 1X2K A; 1UHF A; 1PKT A; 1ABO A; 1OV3 A; 4CC7 A; 1G2B A; 1SRM A; 2AKL A; 1NYG A; 3TSW A; 2KRS A; 1RLP C; 2EVR A; 2EKH A; 1K4U S; 2CDT A; 2K79 A; 1JEG A; 4F16 A; 2PTK A; 1QKW A; 3SEM A; 2X3W D; 1I1J A; 1YWO A; 1PKS A; 4JJB A; 1X43 A; 1GFD A; 3VS6 A; 1M30 A; 4Z89 A; 2L3S A; 2OJ2 A; 1JO8 A; 5IXF A; 2EGC A; 4JZ4 A; 2HBW A; 2DRM A; 4CC4 B; 2GBQ A; 4RUG A; 4Y92 A; 3RBB B; 2DVJ A; 1BK2 A; 1I0C A; 2FRW A; 2JM8 A; 2LJ1 A; 2LP5 A; 1EFN A; 1PRL C; 2KYB A; 4RTW A; 2BZ8 A; 1ZUK A; 2RMO A; 2KT1 A; 2LQW A; 1M27 C; 1YNZ A; 4Z8A A; 2O9S A; 1AZG B; 2KEA A; 2O2O A; 2YUO A; 1ZBJ A; 3PVL A; 1WIE A; 2DA9 A; 1VYT A; 2JXB A; 2KNB B; 1YP5 A; 2DF6 A; 1H92 A; 1OPL A; 2C0I A; 2AK5 A; 3VRZ A; 1Z9Q A; 2RQW A; 1GFC A; 2G6F X; 4DEY A; 1K76 A; 3REB B; 3I9Q A; 3EHR A; 1SHG A; 4JJC A; 5EC7 A; 2JTE A; 3H0I A; 2A08 A; 2E5K A; 4LN2 A; 2NWM A; 2M51 A; 2EYY A; 2BZX A; 2C0T A; 1TUC A; 2L3P A; 1E7O A; 2AZV A; 2BZY A; 2VKN A; 1NEG A; 3NMZ C; 4J9C A; 1ZLM A; 1PNJ A; 1RLQ C; 1OEB A; 2DYB A; 2J7I A; 2ED1 A; 4IIO A; 2J06 A; 1J3T A; 2ABL A; 1N5Z A; 2BTT A; 2LCS A; 2A28 A; 1A0N B; 4R0K A; 1ABQ A; 2L0A A; 4CC3 A; 5GJV B; 2RNA A; 2CRE A; 1KFZ A; 1UFF A; 5ECA A; 4RTV A; 1X69 A; 1WXU A; 5IHN A; 1G83 A; 2YUP A; 2YUN A; 5IXB A; 2JMC A; 2YUQ A; 1PHT A; 3LH5 A; 4D8K A; 1E6G A; 3EG0 A; 1Z9Z A; 2EYX A; 1GBQ A; 2EW3 A; 1LCK A; 2SRC A; 4JZ3 A; 1PWT A; 3VS3 A; 1WLP B; 1UG1 A; 2DLP A; 2HSP A; 2D0N A; 1NLP C; 2JW4 A; 1FMK A; 2F2V A; 1NG2 A; 2ESW A; 4AFS C; 2ENM A; 1YN8 A; 2O88 A; 2FPF A; 3VS4 A; 3KFV A; 2J6K A; 1M3B A; 1ZSG A; 3NHN A; 2SEM A; 2CSI A; 4LE9 A; 1T3S A; 2CH4 W; 2FEI A; 1PRM C; 4HXJ A; 5I22 A; 4J9E A; 2GGR A; 2KRO A; 3CQT A; 1KSW A; 2LJ0 A; 2RN8 A; 1AWX A; 2DMO A; 1NLO C; 3PE0 A; 2F2W A; 1GBR A; 1B3Q A; 2DBM A; 1K9A A; 4AG1 C; 2A36 A; 3EHQ A; 5IH2 A; 2LJ3 A; 1M3C A; 3C0C A; 2KYM A; 4AG2 C; 4RTT A; 2CT4 A; 2L2P A; 2DIL A; 4RTZ A; 1WXT A; 1AWJ A; 2GNC A; 2P4R A; 2EYW A; 1WDX A; 2RQU A; 1WFW A; 2KBT A; 1SSH A; 3VS7 A; 1JXM A; 2J05 A; 1T0H A; 3TSZ A; 1UJ0 A; 2PNI A; 1GRI A; 1UE9 A; 1S1N A; 2YDL A; 3M0R A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1N6A A; 2RJE A; 1Q86 C; 1VQL T; 2FRY A; 2O9V A; 2QQA A; 3GPL A; 2OAW A; 2E3H A; 2KGT A; 1WJR A; 2HCK A; 1MND A; 4LUD A; 2JS2 A; 4OMO A; 4WTO B; 3P8D A; 5CQX A; 3JB9 I; 2J6F A; 4AMC A; 2HNI A; 6AT1 B; 4LDV A; 5LJ3 d; 4M78 E; 1QWE A; 2LNV A; 2W0Z A; 3CCV T; 3G6E Q; 1N8R C; 1X27 A; 4FM4 B; 2JTM A; 1IHW A; 1HYO A; 1WA7 A; 4J8O A; 4PLI A; 4EMH A; 2E10 A; 5CO7 A; 4C92 D; 5A0D A; 1Q81 C; 2E6Z A; 2VGM A; 2Y4X A; 2QDL A; 2CZ1 B; 1ZUY A; 2L8D A; 4AFZ C; 1KD1 C; 1D0Z A; 2H8H A; 1U1S A; 4M77 G; 2MYS A; 4JRP A; 2CP7 A; 5J3B A; 4Z02 A; 4PNO A; 1Q95 G; 2F69 A; 5LJ3 g; 3JCM e; 1H3H A; 5HK3 A; 3HHT B; 4EPC A; 2A7Y A; 3OYB A; 2RQT A; 1SG5 A; 3CBO A; 3QJY A; 3FJP A; 3A8O B; 3MPU B; 1W2B P; 2RQR A; 5GAN 6; 9ATC B; 1D0X A; 1QP2 A; 1WXB A; 1MGQ A; 3CC4 A; 1SHF A; 3F70 A; 1NEB A; 5GAN 2; 4QT7 A; 2LQN A; 2M16 A; 3H41 A; 2X4W A; 3H0F A; 4IUU A; 4C92 B; 3A8L B; 2RPN A; 1VQ6 T; 4M77 E; 5L23 A; 1VYV A; 1T3L A; 2MK5 A; 5D6Y A; 1X2Q A; 1O9S A; 2LCL A; 5EG2 A; 4OMQ A; 1Q86 U; 3MCA B; 4LD9 K; 3CXC P; 3WXM B; 3CCS T; 1YI2 T; 3GNF B; 2QGF B; 2JMA A; 4M7D A; 3V8K A; 4DBH A; 4A4G A; 4XU2 A; 2RA2 A; 5D6W A; 3L42 A; 3OQ5 A; 4JDS A; 2DD5 A; 1ARK A; 1D1B A; 4EMK C; 1SPK A; 4PL6 A; 2HKQ B; 2O01 E; 1N8R U; 4MDX A; 1KHI A; 1T0J A; 2A37 A; 3QWX X; 4PJO D; 4JPB W; 2X3X D; 3OW2 A; 2ZPB B; 2RJD A; 2ZCF B; 3L2U A; 1FXX A; 3PIO A; 1Y07 A; 4HCK A; 4LNP A; 5LJ3 e; 4KGX B; 1HSQ A; 2RM4 A; 2RK2 A; 1VQ4 A; 1Q81 U; 1GCP A; 1D1C A; 3SD4 A; 4BUG A; 1TWB A; 1KD1 U; 3VS1 A; 2MI6 A; 1MV3 A; 1VQO T; 3SHW A; 3G7Z A; 2EKO A; 4C5I A; 3JB9 H; 2XK0 A; 4M7A E; 3OYG A; 4HVV A; 2FZK B; 2ZZD A; 4OB3 B; 1W1F A; 2QA4 A; 4A54 A; 1K9M C; 3THK A; 2RD1 A; 4C0D B; 2HAX A; 2K5F A; 1WQW A; 2P0P A; 3CCU Q; 1DJ7 B; 2DL3 A; 4C0F A; 3M0S A; 3NGP A; 3HL8 A; 5FW9 A; 3OSS C; 2LZ6 B; 2FB7 A; 1AZE A; 1JBM A; 2YXY A; 4OMN A; 1M1G A; 1H3Z A; 4FYW B; 2LT1 A; 4XTU A; 2IIM A; 1HD3 A; 3L2R A; 2CGH A; 4YTL A; 1B07 A; 2E41 A; 4BY6 C; 3RER A; 4PLL A; 5KYX A; 1VYU A; 4L6V 5; 3I56 A; 1IXD A; 2KT8 A; 5DM7 R; 4IUT A; 1X75 C; 3REA B; 1VQM A; 4J9F A; 1K0S A; 1UEC A; 4M4Z A; 3E9G A; 4ELY C; 4X1V A; 4A63 B; 1KJW A; 3VUZ A; 1D0Y A; 1GCQ A; 4M77 A; 2MWP A; 3RKX A; 3RKY A; 2QEX Q; 2IPO B; 2K3Y A; 1MUZ A; 1WYX A; 2D1X A; 1VQ8 T; 3KBG A; 3HSB A; 4KUD K; 2LC4 A; 3JB9 J; 1KQS S; 3TSW A; 4DBF A; 4P5N A; 3PIP A; 2EKH A; 1TU0 B; 4FT4 A; 2K79 A; 2A3L A; 3OS0 A; 4M75 D; 3WVD B; 3CPW S; 2PTK A; 2OTJ A; 2X3W D; 1I1J A; 1YWO A; 1PKS A; 4JJB A; 4M78 B; 3VS6 A; 1QVF A; 5CIU A; 3OYD A; 4B9W A; 4PKC C; 5IXF A; 1K9M U; 3MKD A; 1VQN Q; 2DVJ A; 3VYH B; 2LP5 A; 4F7U F; 2GCX A; 2KQW A; 4L5G A; 3CMA A; 1I5L A; 4X9C A; 4KUL A; 2RMO A; 5CKD A; 3EGX B; 2LCC A; 3MET A; 3QO3 A; 2DD4 A; 4KGV B; 2KEA A; 3L2Z A; 4IUP A; 1ZBJ A; 3PVL A; 2KNB B; 5GAM f; 3CEY A; 1H92 A; 4M75 B; 3JRZ A; 2EQK A; 1AT1 B; 2P0Q A; 1GFC A; 4XQ3 A; 3H6Z A; 1OU8 A; 4GLK A; 4PK4 A; 1SHG A; 4NL2 A; 2JTE A; 2BKD N; 3LX7 A; 5J26 A; 1O75 A; 3OW2 P; 2NWM A; 2M51 A; 5HK0 A; 1VOM A; 2C0T A; 4FSX A; 2Z0W A; 2BZY A; 1SF9 A; 2BE9 B; 2VKN A; 4M7D C; 1NEG A; 1PM3 A; 2AHJ B; 4AT1 B; 2DYB A; 1WJS A; 2ED1 A; 5FLX E; 2DEU A; 3CCR Q; 2ABL A; 1RL2 A; 1A0N B; 3HP9 A; 2L0A A; 4C8Q D; 4JJN K; 3OS2 A; 5GJV B; 2RNA A; 1C0M A; 2H3J A; 5KE2 A; 1X69 A; 3DB3 A; 3H9N A; 4M7A D; 5IXB A; 2OTL T; 4N4H A; 1G3T A; 4ELZ C; 1OZ2 A; 1Z9Z A; 3I55 T; 2SRC A; 3G71 T; 2XIC A; 1WHK A; 3HKS A; 2ESW A; 2KMT A; 3OA6 A; 2QQ9 A; 1VQK T; 2COW A; 3CC2 A; 2FPF A; 3VS4 A; 3J80 E; 3CC4 Q; 1TXQ A; 2CH4 W; 1Q82 R; 3MP8 A; 1TH7 A; 2Y4Y A; 3X24 B; 2XG8 D; 3X20 B; 4OVA A; 1BI3 A; 4A4E A; 3BDU A; 4C92 G; 3NTK A; 1C1A A; 3VJP A; 5HKC A; 3EGD B; 1KSW A; 1M2V A; 2NUP A; 1VQP A; 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5GMK j; 4EIK A; 1UGS B; 2F5K A; 3CC7 Q; 4F14 A; 5D7U A; 2VAS A; 3G4S A; 1YJW T; 2FYK A; 3FLG A; 1OOT A; 3E1S A; 2QTX A; 2ZPE B; 3ULR B; 3VS5 A; 2L3R A; 3I56 Q; 4J6X A; 2LX7 A; 5GAM h; 4PJO E; 3LWI A; 1JQQ A; 3OYF A; 3QII A; 3PTA A; 1VQM Q; 3MP6 A; 2K6D A; 3VKI A; 2RO0 A; 1OUL A; 3VU3 C; 1VQ5 T; 3VS2 A; 4QQG A; 2K7A A; 3P8H A; 1JJ2 S; 2C0O A; 3J7A F; 2DZ9 A; 3ME9 A; 4X9D A; 4ZTJ A; 3IQL A; 1UUE A; 2M9U A; 5DY9 A; 5IAY A; 4J9B A; 2X4Y A; 1BCM A; 2VXF A; 3CCM Q; 5LJ5 j; 3CCS A; 1YI2 A; 1P92 A; 1AWW A; 1WI7 A; 4XK8 E; 1FYN A; 2KRN A; 4M78 G; 2R57 A; 2VVK A; 2GFA A; 1Y96 B; 3EG9 B; 3QXE B; 4AFQ C; 3QDF A; 1K73 U; 3OYC A; 4NS5 A; 4LDY A; 1U5S A; 2EFI A; 1K9M R; 2M0Y A; 3H0H A; 2PU9 B; 3OSV A; 4C92 A; 2VUB A; 1M1K C; 1QCF A; 3OS1 A; 1SKU B; 2DO3 A; 3FDR A; 3CCQ T; 1M9S A; 2QQB A; 4J9H A; 5HCK A; 3RIR A; 3CMA Q; 3SWN B; 3O5Z A; 4RTY A; 5CAI A; 3INZ A; 5I2S A; 4PJN A; 1PSF A; 4BI4 A; 5FWC A; 2L5Q A; 1E6H A; 2F2X A; 4J9I A; 3FRN A; 3TCJ A; 1VQO A; 2CH4 A; 3UA6 A; 1WHL A; 3M55 A; 4M75 G; 1V76 A; 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