The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
2
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sequence length |
59
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structure length |
59
|
Chain Sequence |
VTLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Inferential Structure Determination
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase FYN
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| total genus |
2
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2005-04-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3VS1 A; 1ZX6 A; 1GL5 A; 2AKL A; 3SHW A; 4E6R A; 2JW4 A; 4OML A; 1T0H A; 1UHC A; 2LJ3 A; 2M0Y A; 2LJ0 A; 2L2P A; 2L0A A; 3EHQ A; 3M0P A; 1NYF A; 1OPL A; 1WXT A; 1M8M A; 1RUW A; 1UGV A; 2DBK A; 5IXF A; 1Y57 A; 5EC7 A; 5IH2 A; 2HDA A; 4OMP A; 2DL5 A; 3M0Q A; 1OEB A; 2DA9 A; 1T3S A; 2YUO A; 2CT4 A; 2AZV A; 1M30 A; 2EW3 A; 2FPF A; 2KXD A; 4OMN A; 1Y0M A; 1S1N A; 2VKN A; 2EGE A; 3PE0 A; 2VWF A; 4RUG A; 4RTZ A; 2CUD A; 2D8J A; 4JZ3 A; 2KYM A; 1K0S A; 3M0U A; 2LCS A; 2DMO A; 1B07 A; 1Z9Q A; 2CDT A; 1WIE A; 1WXB A; 2JS0 A; 4R0K A; 2DL7 A; 4J9F A; 2DJQ A; 2DRK A; 1SHF A; 2DRM A; 3UAT A; 1U5S A; 1ZUU A; 2JXB A; 4DEX A; 2RQR A; 2KXC A; 2GGR A; 2HCK A; 1UJ0 A; 1NLO C; 1SHG A; 4AFQ C; 4Z8A A; 1YP5 A; 2ESW A; 4JZ4 A; 4JJB A; 4OMO A; 3CQT A; 3JV3 A; 3ZL7 C; 2IIM A; 1VYT A; 4HVW A; 1U06 A; 2DL4 A; 4F17 A; 3EG3 A; 2BZ8 A; 2RN8 A; 2JMC A; 2DYB A; 3I5S A; 2XMF A; 5IHK A; 2DIL A; 3M0T A; 2LNH B; 1JXO A; 2J05 A; 1AOJ A; 1X43 A; 1M3C A; 1YWO A; 1MV3 A; 4J9B A; 2G6F X; 1UJY A; 2CUB A; 2KNB B; 2HEQ A; 2K9G A; 1K9A A; 2FPD A; 1Z9Z A; 4RTX A; 1SRL A; 2C0I A; 1TUC A; 2DL8 A; 2PTK A; 2KYB A; 4AFZ C; 2YSQ A; 2BTT A; 1IO6 A; 4EIK A; 2MIO A; 4WCI A; 2F2V A; 5FWC A; 2PNI A; 2J7I A; 1QCF A; 1JXM A; 2YDL A; 2FO0 A; 3ULR B; 2KBT A; 2V1R A; 1UHF A; 4LNP A; 1JU5 C; 1ZBJ A; 1KIK A; 1ABQ A; 1JQQ A; 2HSP A; 3I5R A; 4F16 A; 1GFC A; 1AWX A; 2O2O A; 4CC2 A; 3REB B; 2EBP A; 2DVJ A; 1MV0 B; 1AVZ C; 3VS7 A; 1SSH A; 1K76 A; 2LZ6 B; 2AKK A; 1I07 A; 2VVK A; 1HSQ A; 3IQL A; 1OOT A; 1BU1 A; 1VYV A; 3EG1 A; 1G83 A; 2J6O A; 1ZUK A; 3TSZ A; 2EYZ A; 2KRM A; 4LUE A; 1ZUY A; 3PVQ A; 3VS3 A; 4AG1 C; 1NG2 A; 2B86 A; 4Z89 A; 1U3O A; 1NLP C; 2KEA A; 1QLY A; 1ZLM A; 3VS6 A; 1M3A A; 4A63 B; 1GRI A; 1VA7 A; 4D8K A; 1NEB A; 2J6K A; 1PKT A; 3REA B; 4LE9 A; 1AZG B; 2RNA A; 4K11 A; 4GLM A; 3VS2 A; 2RPN A; 2CH4 A; 1AEY A; 1KSW A; 2DL3 A; 2JMA A; 1I0C A; 1H92 A; 1JO8 A; 3VS0 A; 2YT6 A; 1X2K A; 1SRM A; 2BZX A; 1LCK A; 1CKB A; 2DNU A; 2KRS A; 3VRZ A; 1AWJ A; 2EPD A; 4FSS A; 2O9V A; 2FEI A; 4LUD A; 2GTJ A; 1BK2 A; 1N5Z A; 2OJ2 A; 2CRE A; 2CSQ A; 2LJ1 A; 1YCS B; 4JPB W; 3NMZ C; 4M4Z A; 1WI7 A; 2EGC A; 1K1Z A; 4HXJ A; 2D1X A; 2KE9 A; 1ZSG A; 1QKX A; 3R6N A; 3C0C A; 1NM7 A; 2KRO A; 2ROL A; 1OV3 A; 2SEM A; 1KFZ A; 2D0N A; 1GCQ A; 1X6B A; 2P4R A; 1UDL A; 3QWY A; 2DX1 A; 2OAW A; 2DBM A; 1PRM C; 2L3S A; 1M27 C; 4AFS C; 2AK5 A; 1QWF A; 2PZ1 A; 1FYN A; 1W6X A; 5GJW B; 4JJD A; 3M0S A; 1AD5 A; 1G2B A; 1UTI A; 1X27 A; 2EGA A; 2O88 A; 5IHI A; 1WA7 A; 2L3P A; 3EG2 A; 2ECZ A; 3PVL A; 3KFV A; 1E6H A; 2HBW A; 3M0R A; 2C0T A; 4QT7 A; 4RTV A; 1TUD A; 4ESR A; 1YWP A; 4RTU A; 5IHN A; 2A37 A; 5I22 A; 1X69 A; 3EGU A; 1X2Q A; 2LMJ A; 2DLP A; 2K6D A; 1QWE A; 4KRT A; 1UE9 A; 1SEM A; 2H8H A; 2ED0 A; 2RF0 A; 2J6F A; 1HD3 A; 1AZE A; 3NPF A; 1K0X A; 1RLP C; 1PKS A; 4DEY A; 2NWM A; 2RQW A; 2FRY A; 2J06 A; 2F2W A; 2JS2 A; 4Y92 A; 3NGP A; 2MCN A; 4LN2 A; 3VS4 A; 1YN8 A; 1E7O A; 2JTE A; 2NUZ A; 2K2M A; 2CT3 A; 3I35 A; 2EYX A; 1CSK A; 1B3Q A; 2KRN A; 3TVT A; 1GBR A; 4D8D A; 2LP5 A; 2EYY A; 1WXU A; 1UEC A; 2EKH A; 2RQU A; 1T0J A; 1GFD A; 4X1V A; 1GCQ C; 1RLQ C; 1UG1 A; 1W70 A; 2LQW A; 2W0Z A; 2K79 A; 1HJD A; 4J9C A; 4AG2 C; 1E6G A; 2V1Q A; 2KT1 A; 2GBQ A; 2OI3 A; 1WDX A; 5GJV B; 3H0I A; 2F2X A; 3TSW A; 3THK A; 2RMO A; 1UUE A; 4HVU A; 1PRL C; 2YUP A; 1H3H A; 1X6G A; 1V1C A; 2EQI A; 4OMQ A; 1FMK A; 2L3Q A; 2GNC A; 2ROT A; 5L23 A; 3I9Q A; 1EFN A; 4RTW A; 1RI9 A; 1KJW A; 1PNJ A; 4Z88 A; 2O31 A; 2EYW A; 2CH4 W; 2O9S A; 1M3B A; 2ENM A; 2GQI A; 1WX6 A; 4J9H A; 2FRW A; 1H8K A; 3U23 A; 4F14 A; 1VYU A; 1QKW A; 2M51 A; 2EVR A; 1WYX A; 3H0F A; 2MOX A; 4RTY A; 1MUZ A; 2YUQ A; 2LQN A; 2E5K A; 1J3T A; 1PHT A; 2SRC A; 3FJ5 A; 2X3W D; 3UA7 A; 2QDL A; 3EHR A; 4IIO A; 2KT8 A; 2JT4 A; 2YUN A; 3UA6 A; 3H0H A; 3RBB B; 3A98 A; 1T3L A; 2KR3 A; 3QWX X; 2DF6 A; 1XOV A; 3RNJ A; 2K7A A; 1ABO A; 1BBZ A; 1ARK A; 4RTT A; 2I0N A; 1NEG A; 5HCK A; 4J9I A; 4IIM A; 2BZY A; 1TG0 A; 3VRY A; 3LH5 A; 1YNZ A; 4CC4 B; 4J9E A; 2AZS A; 3O5Z A; 3VS5 A; 1AWO A; 5FW9 A; 2KGT A; 4AFU C; 1OPK A; 2GTO A; 2A28 A; 4CC7 A; 1CKA A; 3GBQ A; 2FPE A; 2A36 A; 4HVV A; 5FWB A; 1JEG A; 2X3X D; 4HCK A; 2ED1 A; 1A0N B; 1K4U S; 1I1J A; 2DE0 X; 2RQV A; 3SEM A; 5IXB A; 5ECA A; 3EG0 A; 4JJC A; 4ORZ A; 2CSI A; 4OMM A; 4ZNX A; 2ABL A; 1GBQ A; 1PWT A; 1UFF A; 1WLP B; 3H41 A; 2FG0 A; 2K3B A; 1BB9 A; 1AWW A; 2JM8 A; 5I11 A; 2D8H A; 2LX7 A; 1W1F A; 3NHN A; 1GCP A; 4CC3 A; 2DM1 A; 2JM9 A; 3UF4 A; 4GBQ A; 4J9D A; 1NYG A; 1WFW A; 2C0O A; 2W10 A; 1SPK A; 4J9G A; 2A08 A; 2RQT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4OB3 B; 2OTL Q; 5GAO m; 4OVA A; 4E6R A; 5IN1 A; 2F1L A; 4OML A; 3OBW A; 5FU6 C; 3MEU A; 3CD6 A; 1B34 A; 2DKG A; 2FL7 A; 1G3T A; 3FJP A; 3OYI A; 3M4Y A; 1VQ7 A; 4CI0 C; 2VYT A; 5EG2 A; 5EC7 A; 2E64 A; 4M77 A; 2DL5 A; 4C8Q D; 1OEB A; 3MET A; 5LL6 S; 4E7J A; 2YUO A; 3CCR A; 4ZTJ A; 2KDS A; 2QK0 A; 2EW3 A; 5CKE A; 5FRO A; 3EGX A; 4E47 A; 4HKE A; 2EGE A; 2VWF A; 4RTZ A; 4PJO B; 4P5N A; 2DZ9 A; 2DMO A; 1BCM A; 4A4E A; 2JS0 A; 4R0K A; 5GMK j; 3I56 T; 2MAM A; 2A0F B; 3ME9 A; 4KGZ B; 1TSF A; 5GAN 8; 4LXC A; 1HXD A; 3UAT A; 3NFC A; 3FEO A; 2BE7 D; 4Y28 E; 1YJW T; 4Z8A A; 2ESW A; 4EMK B; 4OMO A; 3A5Z B; 1N6A A; 4JRP A; 1G8X A; 5KYU B; 1Q81 C; 4HT9 A; 4M7D A; 2E5Q A; 4J7F A; 3G1J A; 1VYT A; 2MWO A; 2VUB A; 2DL4 A; 2QA4 Q; 1M1F A; 2MWP A; 3X26 B; 1I81 A; 2RN8 A; 3I5S A; 5IHK A; 1UEB A; 5GMK i; 3UT1 A; 4M7A C; 1B7T A; 2LNH B; 1JXO A; 1AOJ A; 1M3C A; 3PIO A; 1ZSZ B; 6AT1 B; 3L42 A; 4RTX A; 1RAI B; 2WSE E; 1VQN T; 2C0I A; 3BDU A; 4AFZ C; 4GLK A; 4PJO G; 4C5G A; 2RHI A; 2IVW A; 4EIK A; 5L8R E; 4M77 C; 2MIO A; 2F2V A; 2QG9 B; 5FWC A; 1KC8 R; 2PNI A; 5KCO A; 1VQ6 T; 1JXM A; 2HL5 C; 1RL2 A; 2RK1 A; 2V1R A; 3CD6 T; 2HQH A; 1VQ7 T; 1WPY A; 2K2V A; 2X4Y A; 2E10 A; 3CME A; 1KG1 A; 1VQP Q; 1KIK A; 5KE3 A; 1GFC A; 1Q95 G; 4IUP A; 1AWX A; 2O2O A; 2PVD B; 2GCX A; 3GNF B; 3EFO A; 3P8B B; 2HKQ B; 3SDZ A; 2EBP A; 2DVJ A; 3A8M B; 1BI2 A; 2QGG A; 1I07 A; 1W4S A; 2VVK A; 4BY6 B; 1BU1 A; 5FU7 C; 3EG1 A; 5GAN j; 1ZUK A; 2ZCF B; 2R58 A; 3CPF A; 3VUB A; 3SFM A; 1ZUY A; 3PVQ A; 1JBM A; 2JOY A; 5LJ5 g; 2DZC A; 4DBF A; 2PU9 B; 3CC2 A; 4RKU E; 1U3O A; 2LT4 A; 2KEA A; 4IUQ A; 4C8Q B; 1QLY A; 1ZLM A; 4PFO A; 1M3A A; 1IHV A; 3G4S Q; 3CCJ T; 2CS7 A; 2K5L A; 4M75 D; 2XID A; 2DEU A; 3VS2 A; 2RPN A; 1KC8 U; 1XNI A; 5AT1 B; 1KSW A; 2DL3 A; 1MMD A; 1RAF B; 4M78 G; 3VS0 A; 2A3L A; 4LDV A; 3CCM T; 1LCK A; 1CKB A; 2DNU A; 3C94 A; 2L8D A; 3GIB A; 5HKC A; 4IUU A; 2AIR B; 2EPD A; 2E12 A; 1MMG A; 2PVG B; 4OF1 A; 1V29 B; 1QVG A; 2CSQ A; 1YCS B; 2HSE B; 2FZC B; 1WI7 A; 2EGC A; 1K1Z A; 3KXT A; 4F7U E; 1ZSG A; 2QQ9 A; 1BKB A; 2DVE A; 3HPW A; 4C5E A; 2KRO A; 2ROL A; 1OV3 A; 2R5A A; 3L2Q A; 2D0N A; 5LJ3 h; 1X6B A; 3OMG A; 4AMC A; 2DX1 A; 2LTO A; 4ZGJ B; 3L2R A; 2L3S A; 3C4S A; 3J81 E; 4Y91 A; 3T9N A; 2M16 A; 4JRK A; 2CZ6 B; 2DYI A; 1NZ9 A; 1N8R U; 1QWF A; 2PZ1 A; 1WHG A; 4LD6 A; 1QVG S; 5GAM j; 4PJO A; 1AD5 A; 4KH0 B; 1KHI A; 3BDL A; 2DXC A; 2COZ A; 3G6E Q; 1WA7 A; 3URG A; 2XK0 A; 2XG8 D; 1M2V B; 4RTV A; 3QPH A; 3DB4 A; 2RJC A; 4C5H A; 4MZM A; 4ATO A; 1QVP A; 2VXE A; 3ZFJ A; 5A0L A; 1QCO A; 1JJ2 P; 1FMW A; 2E4H A; 2HQX A; 3VYH B; 1WHJ A; 2RF0 A; 1I8F A; 2X4X A; 3RMQ A; 1K73 C; 1K0X A; 2RK2 A; 4FYX B; 3HRS A; 2EQJ A; 2FRY A; 1VQ5 Q; 5LJ5 e; 2OTL T; 2JS2 A; 1WJS A; 3JB9 H; 5CO7 A; 1E7O A; 2NUZ A; 2XDP A; 3I35 A; 2RA2 A; 5D6X A; 3RER A; 1M1G A; 2HQE A; 2Y90 A; 1QW1 A; 2IPO B; 2LP5 A; 4XU2 A; 2EKH A; 3ZBD A; 4KUI A; 2RB6 A; 4BI8 B; 3DLM A; 4M75 B; 4M78 A; 2RHX A; 3NTI A; 2JUF A; 1VQ9 Q; 1W70 A; 4O5V A; 3CCL A; 1OI1 A; 4J9C A; 3Q1J A; 4LDU A; 3QDF A; 5GAN 4; 4PJO C; 5GJV B; 2O4X B; 1G3W A; 3H0I A; 2F2X A; 2YWW A; 2YRD A; 3JCM g; 4PFZ A; 1BYM A; 2NYS A; 3WXM B; 1Q81 U; 4JLI A; 3G71 Q; 2EQI A; 2YRV A; 5GAO p; 2L3Q A; 2GNC A; 2XDD A; 1WQW A; 4TVR A; 1KJW A; 3WVD B; 1PNJ A; 4C5I A; 3S6W A; 1VUB A; 4PLL A; 1M3B A; 2VV5 A; 1S72 A; 1U8R A; 1TOV A; 1WX6 A; 1YIJ A; 4F14 A; 2QA4 T; 4XQ3 A; 3QZ5 B; 4FT4 A; 1OZ2 A; 2YUQ A; 2E5K A; 2JJ9 A; 1PHT A; 1TH7 A; 3HKS A; 5KH6 A; 4II1 A; 4M75 G; 4J7I A; 3H0H A; 4BE1 A; 1C0M A; 1YJW Q; 1ZA2 B; 1T3L A; 2H3J A; 2KR3 A; 2RHZ A; 3MPU B; 2LNV A; 4FT2 A; 2DF6 A; 1WGS A; 4A4F A; 1WJR A; 1BBZ A; 1VIF A; 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4FYW B; 1KC8 C; 4EMH A; 7AT1 B; 2DTI A; 4XU0 A; 1HK9 A; 2XKO C; 2FZK B; 1NLO C; 1YJN A; 4JRI A; 1NPP A; 3G6E T; 2NUP B; 3JSC A; 4E7L A; 3CQT A; 2QGF B; 3FB9 A; 4MDX A; 3ZL7 C; 1Q86 R; 1YIT A; 2VB6 A; 1KQS A; 1TU0 B; 4F17 A; 1MGQ A; 3NTH A; 5GAN 2; 3JCM J; 5I2S A; 2X9H A; 1K73 U; 2JMC A; 2EAY A; 2P0Q A; 1D3B B; 4M7D G; 3EGD B; 1IHW A; 3CCV T; 4ELZ C; 1UGR B; 1YWO A; 4C0F A; 3CME Q; 1UJY A; 2CUB A; 2HEQ A; 1M90 R; 5CQY A; 1Z9Z A; 1TUC A; 2KYB A; 1IO6 A; 1X75 C; 1VQ5 T; 1N8R C; 4WCI A; 3CXC A; 3N5B B; 2J7I A; 4JS4 A; 1Q82 U; 2YDL A; 2QQB A; 2V8J A; 1YFN A; 2KBT A; 1UHF A; 5KYW B; 5GAM h; 3JCM f; 2JTF A; 1ZBJ A; 2HSP A; 4KUL A; 3CC2 Q; 1RAC B; 2DK3 A; 3OYH A; 4CC2 A; 1EIF A; 1MNE A; 4BE2 A; 4M75 C; 1VQ9 T; 1R0C B; 4VUB A; 2M9U A; 1QVG P; 1VQM A; 1K9M R; 3CC4 T; 1VQO A; 3QKJ A; 3H8Z A; 2E3H A; 1N27 A; 3IQL A; 3AHU A; 1G83 A; 3FRN A; 3QYH B; 3TSZ A; 2EYZ A; 2KRM A; 3M57 A; 3OS1 A; 2RO0 A; 4AG1 C; 1NG2 A; 4C92 E; 4KUD K; 1NLP C; 3A8H B; 4M7A F; 3GOX A; 1M90 U; 4HT8 A; 3OSV A; 3G71 T; 1VA7 A; 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