The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
65
|
structure length |
65
|
Chain Sequence |
MTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKGDVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural Analysis of the SH3 Domain of beta-PIX and Its Interaction with alpha-p21 Activated Kinase (PAK)
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Rho guanine nucleotide exchange factor 7
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
6
|
| structure length |
65
|
| sequence length |
65
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1GBR A; 2DM1 A; 2YSQ A; 3UF4 A; 2CUB A; 2BZX A; 2YT6 A; 3I5R A; 2KRN A; 2J6K A; 1JXM A; 2X3W D; 1NLP C; 2EPD A; 2RQT A; 4J9F A; 4J9H A; 1AWO A; 2HDA A; 2FRW A; 3ZL7 C; 1KIK A; 2C0O A; 4KRT A; 2LP5 A; 4LE9 A; 2LJ1 A; 3LH5 A; 1NEG A; 1WFW A; 1K0S A; 2JMC A; 3I35 A; 1NYF A; 2FEI A; 1PHT A; 2KXD A; 2LQN A; 4J9B A; 5GJW B; 2RMO A; 1NG2 A; 1ABQ A; 2DE0 X; 5ECA A; 1BU1 A; 1T3S A; 2DLP A; 1GRI A; 3SHW A; 2FO0 A; 2HEQ A; 1AZE A; 3UA7 A; 1K0X A; 4RTY A; 4HVU A; 1YN8 A; 2DJQ A; 1SHF A; 3M0Q A; 1GBQ A; 1T3L A; 2AKL A; 4K11 A; 1SRM A; 1PWT A; 3FJ5 A; 1U3O A; 2W10 A; 2JT4 A; 3VS3 A; 2RPN A; 2D8J A; 2KGT A; 3REB B; 1M3A A; 1WXB A; 3H0I A; 1MV3 A; 2YUO A; 2RQV A; 1I0C A; 2G6F X; 1GCQ A; 1E6G A; 3PE0 A; 3H41 A; 3VS5 A; 2FRY A; 2LNH B; 3QWY A; 2E5K A; 2LCS A; 5IHI A; 1FYN A; 4WCI A; 3NHN A; 4J9E A; 3SEM A; 1IO6 A; 5FWB A; 4ZNX A; 2PTK A; 1OPK A; 1UUE A; 4M4Z A; 1RUW A; 1BB9 A; 2EYX A; 2JM8 A; 2D0N A; 2ESW A; 4D8D A; 1E7O A; 1OV3 A; 2CDT A; 4RTV A; 4CC3 A; 3JV3 A; 5IH2 A; 4HCK A; 3M0T A; 4CC2 A; 1HD3 A; 3EHQ A; 1CKA A; 1M30 A; 1BK2 A; 2CT3 A; 1AZG B; 1GCQ C; 2EVR A; 4A63 B; 1GCP A; 2YUN A; 2QDL A; 2J06 A; 1W70 A; 2DBK A; 2H8H A; 4RTW A; 5HCK A; 2DF6 A; 2D1X A; 1VYT A; 4AFZ C; 1UDL A; 2FPD A; 2JXB A; 3EG1 A; 2IIM A; 2EKH A; 2EYY A; 1AWW A; 2DL4 A; 2RQR A; 1SHG A; 1EFN A; 1FMK A; 1WYX A; 2YDL A; 4F14 A; 2SEM A; 1JQQ A; 4JJC A; 4ESR A; 1ZBJ A; 1X69 A; 2P4R A; 3KFV A; 4F17 A; 2RN8 A; 2GQI A; 5I11 A; 1UEC A; 2EW3 A; 2VVK A; 2GGR A; 2JW4 A; 3UA6 A; 1PRL C; 3M0S A; 2KT8 A; 2CUD A; 1AWX A; 1YWP A; 1N5Z A; 3RBB B; 1Z9Q A; 2DRK A; 2AZV A; 4AG1 C; 2B86 A; 3NGP A; 3M0R A; 2DL3 A; 1T0J A; 3PVQ A; 5IXB A; 1G2B A; 1GL5 A; 1GFD A; 4ORZ A; 4RTZ A; 2GTO A; 2K3B A; 2J6F A; 2L0A A; 2A37 A; 2FPF A; 3CQT A; 2VWF A; 4X1V A; 1K4U S; 3VS1 A; 1GFC A; 2LQW A; 2YUQ A; 2C0T A; 2F2W A; 2D8H A; 4JJD A; 1TUC A; 2ROL A; 4EIK A; 2EGC A; 2JS0 A; 1YP5 A; 2V1R A; 1PRM C; 5FW9 A; 1WLP B; 2NUZ A; 1AOJ A; 1AWJ A; 1A0N B; 1RLP C; 4QT7 A; 1MV0 B; 2MIO A; 1TG0 A; 5IXF A; 2L3P A; 1UJY A; 2A08 A; 2DA9 A; 5IHN A; 2KXC A; 2EYW A; 1NLO C; 1WI7 A; 5FWC A; 2DRM A; 2HSP A; 2CRE A; 2LJ3 A; 2JTE A; 2MCN A; 1WA7 A; 1UHF A; 1MUZ A; 1JO8 A; 1PNJ A; 2FPE A; 2DVJ A; 2KNB B; 2JS2 A; 1OPL A; 4OMP A; 3TSZ A; 1M8M A; 2X3X D; 4HVV A; 2JMA A; 4LN2 A; 1H8K A; 2RQW A; 3U23 A; 2KRM A; 3EG2 A; 4J9D A; 4OMQ A; 1SSH A; 3VS6 A; 1NM7 A; 1U5S A; 1AD5 A; 1QKW A; 2SRC A; 4OMN A; 4Z88 A; 1NEB A; 2O2O A; 1YWO A; 1W6X A; 2CSQ A; 1UGV A; 1ZX6 A; 2ED0 A; 2FG0 A; 3RNJ A; 1QLY A; 4RTX A; 1U06 A; 2BTT A; 2L2P A; 1VYU A; 2OAW A; 1LCK A; 1WXU A; 1SRL A; 1RI9 A; 1M27 C; 2A28 A; 1M3B A; 3IQL A; 2O9V A; 1KJW A; 2O88 A; 4Y92 A; 4AFU C; 1CKB A; 2K7A A; 4J9C A; 2CSI A; 4J9G A; 1ARK A; 2M51 A; 2PNI A; 1K9A A; 1WIE A; 1QWE A; 1RLQ C; 2YUP A; 3TVT A; 1Y57 A; 1ZUK A; 1HSQ A; 2L3S A; 2O31 A; 4DEX A; 2AKK A; 2K79 A; 2EGA A; 1UFF A; 2DL5 A; 5GJV B; 3VS7 A; 1HJD A; 1CSK A; 3I5S A; 1PKT A; 2RNA A; 1K76 A; 2O9S A; 2C0I A; 2DX1 A; 1UG1 A; 4RTU A; 3M0U A; 2KT1 A; 3EG3 A; 3NPF A; 2LJ0 A; 3VRZ A; 2I0N A; 2ENM A; 2LZ6 B; 2DNU A; 1NYG A; 4HVW A; 4LUD A; 2ROT A; 4FSS A; 2EQI A; 3REA B; 5EC7 A; 1WX6 A; 1BBZ A; 4J9I A; 2DYB A; 1JU5 C; 1G83 A; 1ZUU A; 1SPK A; 1M3C A; 3EGU A; 2JM9 A; 2CH4 W; 1KFZ A; 3R6N A; 2L3Q A; 1J3T A; 1T0H A; 3NMZ C; 1QKX A; 2KBT A; 3H0H A; 1JXO A; 3H0F A; 1B07 A; 4OML A; 4AFQ C; 1H3H A; 2KRS A; 4RUG A; 1PKS A; 2RQU A; 2DL8 A; 3VS0 A; 1ZUY A; 4JPB W; 2KYM A; 2KE9 A; 3THK A; 2GNC A; 1B3Q A; 4Z89 A; 1YCS B; 1VA7 A; 1X43 A; 2W0Z A; 1QWF A; 1JEG A; 4RTT A; 3I9Q A; 2K2M A; 1X2Q A; 2AZS A; 2VKN A; 4D8K A; 2DMO A; 2EBP A; 1UJ0 A; 1OEB A; 2DL7 A; 4CC7 A; 2AK5 A; 3PVL A; 4JZ3 A; 2DIL A; 1OOT A; 2DBM A; 3TSW A; 2V1Q A; 1XOV A; 2K9G A; 2NWM A; 5L23 A; 2BZY A; 1QCF A; 1ZSG A; 1Z9Z A; 1X27 A; 2BZ8 A; 2KYB A; 2ECZ A; 2GBQ A; 2HBW A; 1WXT A; 1YNZ A; 1AVZ C; 3VS2 A; 4R0K A; 2LX7 A; 2CH4 A; 2J05 A; 2J6O A; 2CT4 A; 1AEY A; 2KR3 A; 1H92 A; 4CC4 B; 5IHK A; 1ZLM A; 2OI3 A; 4OMM A; 3UAT A; 3GBQ A; 4JJB A; 2ED1 A; 2A36 A; 1I07 A; 4AFS C; 5I22 A; 3VS4 A; 1I1J A; 4JZ4 A; 1X6B A; 1X6G A; 2XMF A; 2F2V A; 2K6D A; 4DEY A; 1SEM A; 1WDX A; 1ABO A; 1TUD A; 2ABL A; 4LUE A; 1KSW A; 3A98 A; 4LNP A; 1UTI A; 3C0C A; 4F16 A; 2EGE A; 1S1N A; 1Y0M A; 1W1F A; 2HCK A; 3VRY A; 1UHC A; 4GBQ A; 4IIM A; 4OMO A; 1VYV A; 3QWX X; 3O5Z A; 2KRO A; 2MOX A; 2KEA A; 3ULR B; 2OJ2 A; 4GLM A; 2PZ1 A; 2F2X A; 1UE9 A; 1X2K A; 2M0Y A; 2LMJ A; 4E6R A; 1E6H A; 4HXJ A; 1V1C A; 1K1Z A; 4Z8A A; 4AG2 C; 3M0P A; 2J7I A; 3EHR A; 2EYZ A; 2RF0 A; 4IIO A; 3EG0 A; 2GTJ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1GBR A; 2P0Q A; 4C0D C; 5LJ5 h; 1ZSZ A; 3CCU Q; 5GAN 5; 4CI0 C; 4IUV A; 2CUB A; 2DET A; 4RG2 A; 2NUT B; 5CKH A; 2BE7 D; 4J9F A; 1VQ6 Q; 1G3T A; 4OF1 A; 2E5Q A; 2C0O A; 4LE9 A; 3SDZ A; 3EH1 A; 1VOM A; 1BI3 A; 3M4Y A; 4HA8 A; 1HXD A; 2GFA A; 5CR2 A; 1M1F A; 4FIB A; 2DE0 X; 2V8J A; 5ECA A; 2R58 A; 1BU1 A; 1T3S A; 3FRN A; 3MJX A; 1YIJ A; 4RKU E; 5D6Y A; 1W2B A; 1WGS A; 2VB6 A; 4FYX B; 3NTH A; 1RAD B; 4M7D D; 1SHF A; 3M0Q A; 4C92 G; 5CIU A; 3I55 A; 1ACM B; 4XTW A; 3L2U A; 1SRM A; 2LC4 A; 3FJ5 A; 1YJ9 T; 3CXC P; 1YIJ T; 2OTL Q; 4IKF A; 4A4H A; 2HZY A; 3EH2 A; 3RKY A; 4B9X A; 3REB B; 1Y7X A; 4MZT A; 2FVU A; 1B34 A; 1NZ9 A; 3VU3 C; 1KQ2 A; 1GCQ A; 1MMN A; 3I55 T; 3H41 A; 2HMA A; 2FRY A; 4GLK A; 2E5K A; 4M7A A; 1M5Q 1; 1I8F A; 4J9E A; 3OYE A; 3CPW A; 1UUE A; 4M4Z A; 3LWH A; 1BB9 A; 2E1H A; 1AT1 B; 3A8H B; 5GAN 2; 1G3Y A; 2JM8 A; 2D0N A; 3G71 A; 2ZGW A; 2ESW A; 3BW1 A; 4D8D A; 5CCA A; 3CCR A; 3RER A; 4XTX A; 4M7A E; 4M75 G; 3OYA A; 3BE3 A; 2LX9 A; 1BI2 A; 1HD3 A; 3SWN A; 1M30 A; 3E19 A; 1VQM T; 3CC4 T; 3CCJ T; 2CT3 A; 2GFU A; 3OW2 A; 2EVR A; 2FZK B; 1PCX A; 3S3N A; 2F1L A; 2QGG A; 1N9S A; 3G71 T; 3CCR T; 2BE9 B; 1N6A A; 2AIR B; 1VQ8 Q; 2DF6 A; 5CQX A; 4C5H A; 1IZ6 A; 1RI0 A; 2JXB A; 2MYS A; 2XDP A; 2PVG B; 2VYT A; 4JLI A; 1EFN A; 4JS5 A; 1WYX A; 2L3R A; 2YDL A; 2SEM A; 4JJC A; 4BD3 A; 4ESR A; 5LJ3 d; 1TWB A; 1FWZ A; 2RN8 A; 1X01 A; 4C92 B; 2K5L A; 5GAN d; 4FU6 A; 4BE0 A; 2C06 A; 3D7S B; 3MCA B; 5I11 A; 3MEW A; 4KT0 E; 2JW4 A; 5KH6 A; 2KSS A; 1PRL C; 1M8V A; 4F04 B; 2X35 A; 4LDU A; 2JTM A; 1SF9 A; 3OY9 A; 3V7C A; 1T0J A; 2YWW A; 4DBF A; 2COW A; 4J7I A; 1OX8 A; 4OB1 B; 4C92 D; 2ZPG B; 1O75 A; 5GAN 4; 2GTO A; 2K3B A; 2J6F A; 3CQT A; 4M75 B; 4XTZ A; 2LQW A; 2PUO B; 1KD1 R; 2D8H A; 4JJD A; 5GMK e; 3KXT A; 3OYM A; 2E4H A; 1VQL Q; 2AT1 B; 1OX9 A; 4JUV A; 1AOJ A; 3HKS A; 4EMK B; 2QA4 T; 1MV0 B; 2MIO A; 1KD1 C; 4QW2 A; 5IXF A; 2CKK A; 2KI7 A; 3CBM A; 2A08 A; 5IHN A; 5GAO l; 4FM4 B; 2EYW A; 1NLO C; 2JNG A; 5FWC A; 3PNW C; 2DRM A; 5CKD A; 1KQS P; 4Y91 A; 1BI0 A; 3JCM g; 3F70 A; 4M75 D; 2MCN A; 1PNJ A; 4IUQ A; 2FPE A; 4JRP A; 5LJ5 g; 3H8Z A; 4HVV A; 2VV5 A; 4XAX B; 2RK2 A; 1ZA1 B; 2ZAE A; 4M77 C; 4J9D A; 4OMQ A; 3PTA A; 3VS6 A; 4E7S A; 1BYM A; 2M9U A; 3MHX A; 1VQ4 T; 4OMN A; 2XU8 A; 4Z88 A; 2O2O A; 3EG9 B; 3ZEH A; 1VQ9 T; 4EMH A; 2DER A; 1UGV A; 1ZX6 A; 1R77 A; 4RTX A; 3OYF A; 1O9S A; 2BTT A; 2KDS A; 3MKD A; 2OAW A; 3V8J A; 3ZBD A; 3C12 A; 1RI9 A; 2MMP A; 1W2B S; 1YHQ A; 3JB9 F; 2DZ9 A; 2O9V A; 3JCM J; 1VQK T; 4Y92 A; 5KYY B; 3TRE A; 3OYD A; 4J9G A; 2DIG A; 1ARK A; 5GMK h; 2QQR A; 1K9M R; 1WIE A; 1ZUK A; 2X9H A; 3QYG B; 4DEX A; 3MO8 A; 5HK0 A; 3NTI A; 1HJD A; 1CSK A; 1SKU B; 3I5S A; 2JUF A; 4C0D B; 2O9S A; 2JTF A; 1UG1 A; 4BDZ A; 1MMD A; 1BI1 A; 2ENM A; 3S3M A; 2IG0 A; 5A0G A; 4JS4 A; 5CVI A; 4OB3 B; 1G83 A; 1M90 R; 1IRE B; 1M3C A; 3QDR B; 3EGU A; 1YJ9 Q; 1BIB A; 1YIJ Q; 3ASK A; 1KFZ A; 4E7I A; 1J3T A; 1T0H A; 1QKX A; 2RK1 A; 1H3H A; 4RUG A; 1TUG B; 4M75 E; 3HRS A; 3I55 Q; 4JPB W; 2V26 A; 4FCY A; 1Q95 G; 2KE9 A; 3P8B B; 1M90 C; 2GNC A; 1B3Q A; 3CME A; 2HQH A; 2F69 A; 1QWF A; 2K2M A; 1K9M U; 1XQH A; 4LD6 A; 2HBP A; 2RH2 A; 5DY9 A; 4HCB A; 3OYB A; 3CCQ T; 2CZ0 B; 2M16 A; 3RDV A; 3UDC A; 1G3W A; 4XQ3 A; 2DK3 A; 3CC4 Q; 1IXD A; 3TSW A; 1QW1 A; 1XOV A; 2BZY A; 2DTO A; 1BCM A; 1ZSG A; 1PD0 A; 3G71 Q; 3WVD B; 3CCR Q; 3GOX A; 1YJW T; 2VXE A; 1YNZ A; 1AVZ C; 2J6O A; 3G6E A; 2KR3 A; 1M90 U; 1TTH B; 1H92 A; 5KYX A; 4CC4 B; 1QCN A; 3HL8 A; 4PKC C; 4PFZ A; 4QQG A; 1N27 A; 3GBQ A; 4JJB A; 1LVK A; 2F5T X; 4J6W A; 2E6N A; 2RJF A; 3L2W A; 1WJS A; 3HFO A; 3PMI A; 3G4S A; 2QQ9 A; 4XTU A; 1OYX A; 2Y4Y A; 4PJL A; 1MND A; 2KQW A; 3CXC A; 1ABO A; 5GAO m; 2EAY A; 1KSW A; 2ZPI B; 5FU6 C; 4BE1 A; 2DXU A; 4FT2 A; 4M78 F; 3L2Q A; 3X26 B; 4IIM A; 4OMO A; 4XU1 A; 4J8O A; 3G4S T; 3EFO A; 3M9Q A; 2YRD A; 3O5Z A; 2MOX A; 2KEA A; 3OS0 A; 3ULR B; 3SD4 A; 3HPW A; 4LDW A; 1VQO A; 2EJF A; 3MP6 A; 1E6H A; 4JDS A; 1K1Z A; 3M0P A; 1NJI R; 5CQY A; 1V76 A; 2RF0 A; 4IIO A; 3EG0 A; 2F5K A; 2CP7 A; 2GTJ A; 4C92 C; 3JCM b; 3ME9 A; 2RB6 A; 2YSQ A; 3UF4 A; 1JXM A; 2QA4 Q; 2MF2 A; 2X51 A; 4NL3 A; 1NLP C; 2RQT A; 1NJI C; 4J9H A; 3CPF A; 2QQS A; 2FB7 A; 4E7K A; 1JB0 E; 2DYI A; 1KIK A; 2LJ1 A; 3LH5 A; 3CCE A; 1NEG A; 2JMC A; 1AHJ B; 3I35 A; 3I56 A; 1NYF A; 2D0Q B; 5GJW B; 1MGQ A; 1NG2 A; 2LRQ A; 1ABQ A; 3HSB A; 3HFN A; 4C0F A; 4M75 C; 3VKI A; 3V7S A; 1GRI A; 3JB9 I; 2E3I A; 3MEV A; 2HEQ A; 1VQ4 Q; 4MML A; 3QII A; 3UA7 A; 4ZN3 A; 1OZ2 A; 4RTY A; 3DKM A; 4KUI A; 2AKL A; 3M57 A; 5IT9 E; 1RAC B; 3EGD A; 1M1G A; 5J3B A; 1WHH A; 2W10 A; 3JCM P; 1NJI U; 4C8Q G; 2JT4 A; 3CCM A; 2RPN A; 4PJM A; 3DLL A; 2E10 A; 1MHN A; 4M7D G; 3A8M B; 1M2V A; 1MV3 A; 2RQV A; 1D3B A; 1OZ3 A; 2VUB A; 3C95 A; 2G6F X; 2ZPH B; 3M5A A; 3L42 A; 2XID A; 3VS5 A; 4LXC A; 2LT1 A; 5IHI A; 4PNO A; 1WHL A; 1NBE B; 4KGZ B; 2WSE E; 1VQL T; 1IO6 A; 5FWB A; 4ZNX A; 3QYH B; 3QHS A; 1OPK A; 3PIO A; 1NPR A; 5A0D A; 4X9D A; 2XDD A; 1RAB B; 3H6Z A; 4DBH A; 4QQD A; 3BDL A; 5I21 A; 5KYW B; 3QKJ A; 3EHQ A; 2DTH A; 1MMA A; 1GCP A; 2PU9 B; 2QDL A; 1HYO A; 3OS2 A; 2DBK A; 2EQK A; 1XNI A; 2H8H A; 1KQS A; 1WNL A; 2LNV A; 4HKE A; 4NOY A; 1F1B B; 2D1X A; 3G1J A; 5KYN A; 4KGV B; 3HRU A; 2FPD A; 3UPU A; 2IIM A; 3PGG A; 2GF7 A; 2EYY A; 1AWW A; 3OMC A; 4FT4 A; 5FRM A; 3JB9 H; 3DB3 A; 5DLO A; 2BKD N; 1JQQ A; 1JRI A; 1ZBJ A; 1JBM A; 1YJN A; 4OP0 A; 1BKB A; 1TU0 B; 1SSF A; 2EKO A; 3NFC A; 2O4X B; 4PJO G; 1KHC A; 4C8Q B; 2VVK A; 2GGR A; 3CCQ Q; 3UA6 A; 2LTO A; 4M7D B; 4C0G A; 2KT8 A; 2CYZ B; 1S72 A; 5GMK j; 2QGF B; 2EYQ A; 1AWX A; 3JSC A; 1YWP A; 3RBB B; 3JB9 D; 5GAO r; 5GAM f; 1PSF A; 3CC7 A; 3JAM E; 3E1S A; 5GAM e; 3VUZ A; 3ZFJ A; 2ZCF B; 3M0R A; 2DL3 A; 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