The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
27
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sequence length |
106
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structure length |
106
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Chain Sequence |
SSPKRPYLLRAYYDWLVDNSFTPYLVVDATYLGVNVPVEYVKDGQIVLNLSASATGNLQLTNDFIQFNARFKGVSRELYIPMGAALAIYARENGDGVMFEPEEIYD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
De novo protein
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| source organism |
Haemophilus influenzae
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| publication title |
Specificity versus stability in computational protein design.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Stringent starvation protein B homolog
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| total genus |
27
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| structure length |
106
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| sequence length |
106
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-25 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SspB-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1OUL A; 1OU9 A; 1OU8 A; 1ZSZ B; 1ZSZ A; 2QAZ A; 1ZSZ C; 2NYS A; 1YFN A; 1TWB A; 1OX8 A; 1OX9 A; 2QAS A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DBK A; 1OOT A; 4JZ4 A; 1QVF P; 3PVQ A; 3PIO A; 1TUG B; 1WGS A; 2FPE A; 5DLO A; 2A08 A; 1LOJ A; 5I11 A; 2YUN A; 1I4K 1; 1K73 C; 5GAN 4; 4PJM A; 3CC7 T; 3P8B B; 1PD1 A; 1SSF A; 2O9V A; 3M59 A; 1D1C A; 3Q1J A; 4C92 G; 2V26 A; 2LJ0 A; 2M51 A; 1UDL A; 2QQB A; 3CCM A; 1T0J A; 1UGQ B; 2D0Q B; 2CZ1 B; 4DBH A; 2VWF A; 2CSI A; 1OUL A; 4FYV B; 2X4J A; 2MOX A; 2VKN A; 1Q82 R; 4IIO A; 2ENM A; 4FSS A; 3ULR B; 4N4H A; 2JTF A; 1K0S A; 4YTL A; 2DL4 A; 4Z89 A; 1CKA A; 2DJQ A; 2RQR A; 3CPW A; 2RI5 A; 3CC4 T; 4F16 A; 1YWP A; 4R55 A; 4J9C A; 1RAA B; 1WA7 A; 2K79 A; 2RA2 A; 3CCU T; 1M3B A; 2HKN A; 2M9U A; 1YJ9 Q; 4F7U E; 1O9S A; 1E7O A; 5GAN 3; 1OEB A; 2W10 A; 1ZX6 A; 1Q86 U; 2AZS A; 5CKB A; 1VUB A; 4CC2 A; 1PRM C; 1M2O A; 2WSC E; 1D1B A; 1IRX A; 1QMC A; 3ME9 A; 4LD6 A; 4ATO A; 2DTH A; 1YHQ T; 2PTK A; 4QVC A; 1RAF B; 4J9E A; 3QYG B; 1MND A; 5LJ3 f; 3D7S B; 1T3L A; 1WPY A; 1I8F A; 2P4R A; 3A1P A; 4DQ2 A; 2KRO A; 3CME Q; 2QA4 A; 2Z0W A; 3RES A; 2K9G A; 1WFW A; 5AT1 B; 1GXI E; 1IHV A; 3PMT A; 1M1K C; 1UTI A; 5LJ5 f; 5KCO A; 1X2Q A; 3CCS A; 3FC3 A; 4JPB W; 1KC8 U; 1QKX A; 3M58 A; 2E6N A; 1V29 B; 3INZ A; 1QWF A; 4AG1 C; 1UHF A; 1X2K A; 4A4H A; 5GAO l; 1VQO T; 1Q7Y R; 4Y28 E; 4JDS A; 5LJ5 d; 2OTL Q; 4M7A D; 1HSQ A; 3TEE A; 5KYY A; 3VS3 A; 2YLC A; 3GBQ A; 2HMA A; 4MZP A; 4PKC C; 2NYS A; 1JXM A; 1TTH B; 3VUB A; 3VV0 A; 2P0P A; 1TOV A; 2O4X B; 4BDZ A; 4M7A E; 3EG3 A; 1Q7Y C; 2LNH B; 1R0C B; 2QEX T; 4C92 F; 5CR2 A; 4GLK A; 1VQP Q; 1PRL C; 4OP0 A; 1I1J A; 2DYI A; 2K3Y A; 1GCP A; 2JNG A; 2D6F A; 1KSW A; 4KH1 B; 2QI2 A; 2XIC A; 3BE3 A; 4C8Q B; 1G3T A; 1BBZ A; 1WXB A; 3NHN A; 2AKK A; 1B3Q A; 2KGT A; 2JT4 A; 2O4X A; 4RG8 A; 2C0O A; 1BYM A; 2QTX A; 2CZ0 B; 4C0Z A; 1HXD A; 2CP2 A; 2X4Y A; 3UT1 A; 3CMA T; 5IT9 E; 3GNF B; 3HPW A; 1AWJ A; 2JTM A; 4LNP A; 5EG2 A; 3FEO A; 4J9F A; 1UGV A; 3JB9 H; 1N9R A; 2EVR A; 3H0I A; 2J06 A; 4J6Y A; 1U1S A; 3M0T A; 3JCM f; 1NJI R; 3J7A F; 2COW A; 2E3H A; 2NLU A; 2EWN A; 1W70 A; 4ORZ A; 1WQ7 A; 2PVD B; 3I55 A; 3QG1 A; 1PSF A; 2MPX C; 1KQS S; 2B8A A; 4KGX B; 2D0N A; 1M90 U; 2YXY A; 3C95 A; 5CIU A; 1NJI C; 2K2M A; 2KT8 A; 3JCM d; 1SRM A; 3JCM b; 3CD6 A; 3G1J A; 2J05 A; 2A0F B; 4QKU A; 3FRN A; 4OMP A; 3RUX A; 4PJO B; 3TVT A; 4JRK A; 2JXB A; 2DXT A; 3U23 A; 3RKW A; 3NTH A; 1JB0 E; 1ZSZ A; 2KK4 A; 4DOV A; 3OSS C; 4E6R A; 3QKJ A; 3NFC A; 3MEW A; 4PK4 A; 1IRE B; 5GAN f; 1JXO A; 4KGV B; 3H41 A; 3JCM Q; 1VQ4 Q; 1QVG A; 2ZPG B; 2DTO A; 3PIP A; 5A0G A; 2DLP A; 2R5A A; 4KUD K; 1B07 A; 4KRT A; 3MEU A; 2R57 A; 3V7R A; 1JEG A; 2RM4 A; 5FRM A; 1YJ9 T; 5GAN d; 1KQS P; 4HCC A; 2FZG B; 1WLP B; 1BKB A; 3CCS Q; 2FRW A; 5D7U A; 4L5G A; 3O5Z A; 4II1 A; 2KEA A; 4C5E A; 5GAN 6; 5D6X A; 3CBO A; 4XU3 A; 4ELZ C; 2P0Q A; 4FM4 B; 1E6G A; 1G3Y A; 2EYZ A; 2DEU A; 2OTJ A; 1K9M R; 2RHY A; 3OY9 A; 1JBM A; 1W2B A; 3JRZ A; 1S1N A; 3JCM X; 3L2V A; 2OJ2 A; 2L0A A; 4N4I A; 1HYO A; 4LD9 K; 9ATC B; 2L2P A; 3DLM A; 1K9M C; 1H3H A; 2QG9 B; 4FL6 A; 5GAO q; 2EYQ A; 1PKS A; 2HCK A; 8ATC B; 1IHW A; 1MUZ A; 1SEM A; 5KE3 A; 2OTL T; 2KVQ G; 3EFO A; 4M78 G; 1NYF A; 4C92 D; 3CC2 A; 4CRI A; 1B34 B; 5CKE A; 3THK A; 2LT4 A; 1K4U S; 2MWP A; 3X25 B; 4ELY C; 1VYU A; 3OQ5 A; 1K0X A; 2AHJ B; 4M77 G; 2NUT B; 2EQK A; 2DRK A; 4J9I A; 4C92 E; 5LJ5 j; 3EG9 B; 1RL2 A; 4F7U A; 1RLQ C; 2EQI A; 2K7A A; 3MCA B; 2DPP B; 1YFN A; 3CPW S; 3H9N A; 3QDF A; 4HXJ A; 5CKF A; 4AG2 C; 3A98 A; 1JQQ A; 3I56 A; 2VV5 A; 4RMO A; 4XAX B; 4XTU A; 5IHN A; 1ZSZ C; 1VYV A; 2GFA A; 3UAT A; 1I0C A; 5IXF A; 2X4X A; 2J6K A; 1RI0 A; 3JAM E; 4BI3 A; 2KRN A; 1KQ1 A; 3EH2 A; 1OZ3 A; 1X6B A; 1NZ9 A; 4M7A B; 3VU3 C; 3OYF A; 3CC7 Q; 1LVK A; 3EG9 A; 2OX7 A; 1N9S A; 1BI3 A; 5LJ3 e; 1YNZ A; 1TG0 A; 2I2L A; 3I55 Q; 4IKF A; 2HDA A; 4BI8 B; 3RR6 A; 1BCO A; 2FO0 A; 1YJN A; 1YJW A; 2LNV A; 3EGU A; 2O01 E; 3VS6 A; 1B7T A; 4HT9 A; 1D3B B; 2EYW A; 1BI0 A; 1M27 C; 2PUK B; 4J6W A; 3CCE A; 2HEQ A; 1IZ6 A; 1U3O A; 2GTO A; 3CCM T; 3M53 A; 2EGA A; 4C0D C; 1C1A A; 1KJW A; 4HCB A; 1Z9Z A; 2ATC B; 3PTA A; 2ZPB B; 1M8M A; 2GTJ A; 4V2S A; 2YSQ A; 3CC4 Q; 1VOM A; 2H8H A; 4AT1 B; 2GNC A; 2X51 A; 3VS4 A; 3REA B; 3OS1 A; 3C0C A; 2DXC A; 2XDB A; 3CCU Q; 4DEX A; 1NE8 A; 2E5K A; 5GMK m; 1JRI A; 1D3B A; 1FX7 A; 4EMH A; 4ZTF A; 4M78 F; 2DAQ A; 2D8H A; 2LC4 A; 4WTO B; 2E3I A; 4M75 G; 4ZN3 A; 3OBY A; 4M77 F; 4O5V A; 3CCL A; 2A3L A; 2Y4Y A; 2WAC A; 4RTY A; 2DZC A; 2YLB A; 1YIJ A; 4LUD A; 3QBY A; 4QT7 A; 1VQ4 T; 3OS2 A; 1ZBJ A; 2MMP A; 1WDX A; 3PMI A; 2QXF A; 1RAI B; 1M2V A; 4CC4 B; 3QZ9 B; 4HT8 A; 1VQ5 A; 1UB4 A; 4OMF B; 3X28 B; 2OAW A; 4EMG A; 2MF2 A; 4ZTJ A; 2J6F A; 5KYW B; 2RQU A; 4XTZ A; 2AKL A; 3CCS T; 3RMQ A; 2FVU A; 4PJN A; 2FEI A; 1ZUY A; 4PJJ A; 1Q86 C; 3CXC P; 4VUB A; 2P4T A; 2RNA A; 2HSP A; 5DLQ E; 3SB2 A; 5GAN j; 5IXB A; 1Y96 A; 3JCM e; 3HFO A; 2LT1 A; 3CBP A; 4JLG A; 4LDW A; 4UC4 A; 2X3X D; 1Q95 G; 2EKO A; 2QQS A; 3TQ7 P; 2QYZ A; 4M7D G; 1OU8 A; 3F70 A; 2JVV A; 4Z02 A; 2K5F A; 5IN1 A; 1W4S A; 2ZAE A; 1KC8 C; 1VQL A; 1F1B B; 3OBW A; 5IHK A; 3QSU A; 1G8X A; 1ZQ1 A; 1ZUU A; 2AK5 A; 3NMZ C; 1D09 B; 4LDU A; 4KT0 E; 3SD4 A; 2AT1 B; 5DY9 A; 3RKX A; 3M4G A; 4C0G A; 1RAH B; 2DE0 X; 5FRO A; 1YP5 A; 4D8D A; 3DKM A; 2DL5 A; 1NM7 A; 5CO7 A; 5I21 A; 4JLI A; 4RG2 A; 3GLX A; 2CSQ A; 3A8M B; 2ZPE B; 4IUV A; 3E9G A; 1QVG S; 4X34 A; 1K73 R; 2DL8 A; 4R56 A; 3V7S A; 2LP5 A; 2E41 A; 4M75 F; 3ZL7 C; 1PM3 A; 4RTX A; 2ZPF B; 1VQM A; 2ZGW A; 1Y7X A; 3QHS A; 1YJN Q; 3WVE B; 1LJO A; 4NL2 A; 3QJ6 A; 3MEV A; 3R6N A; 2QQR A; 2LQK A; 2GQI A; 1DJ7 B; 1NPP A; 4FW1 A; 1UEC A; 4N4G A; 3OYD A; 1KFZ A; 3I55 T; 4FT4 A; 1VQK A; 2X3W D; 4RKU E; 2DER A; 1SRL A; 3LW5 E; 1W2B S; 4PNO A; 1XNI A; 5GJV B; 3JCM c; 1VQN A; 1MMG A; 1AOJ A; 2DL3 A; 4PL6 A; 3L2R A; 2A36 A; 3GOX A; 1J3T A; 3QXE B; 4PJL A; 3OW2 A; 3BDL A; 3UDC A; 3CD6 T; 1KD1 U; 2CT4 A; 3CBM A; 4JRI A; 3BDU A; 2SEM A; 2DIQ A; 1M90 R; 3UA7 A; 3QJY A; 1BU1 A; 3PVL A; 1QVG P; 5LJ3 h; 2MK5 A; 4C92 A; 1VIE A; 5KYX A; 2EGE A; 1TH7 A; 4FT2 A; 4EIK A; 4M7D F; 2JZ2 A; 2X35 A; 2FYK A; 2KR3 A; 4M78 D; 5LJ5 h; 2D9T A; 2YT6 A; 2RQW A; 1OX9 A; 3L2U A; 1X6G A; 1M90 C; 2JN0 A; 3LGL A; 4X1V A; 5IHI A; 2HQH A; 3WXM B; 5LJ3 g; 2COY A; 2P0K A; 3AHU A; 3M57 A; 3M0U A; 4M78 E; 4E7J A; 1VQ9 A; 5FWC A; 4PFO A; 1GFC A; 2HKQ B; 1AZE A; 1ZUK A; 1T0H A; 5L8R E; 1M1K R; 5FRN A; 3O8V A; 1VQ8 A; 5LJ5 g; 3DB4 A; 2IG0 A; 4F04 B; 1X69 A; 2EGC A; 1EX4 A; 1W2B P; 4B9W A; 1JJ2 A; 1Y0M A; 1QQJ A; 5KYY B; 2V1R A; 3VYG A; 4C0F A; 1TS9 A; 1WHJ A; 4F14 A; 1SSH A; 2FZC B; 2OAU A; 3MET A; 1PC0 A; 2OTJ T; 1YIT A; 2XU8 A; 5I2M A; 3SEM A; 3CCJ Q; 5AYF A; 4E7Z A; 4Y91 A; 2M1H A; 1GBQ A; 3C94 A; 3HRS A; 2DIG A; 4XTW A; 3GPL A; 4QVZ A; 4ZGJ B; 4NOY A; 3NGP A; 1BIA A; 1PHT A; 2NWM A; 1VQL Q; 3HRU A; 3CXC A; 2JTE A; 2J6O A; 2LCL A; 3CCV A; 2DKG A; 5GJW B; 4JJD A; 3CC2 T; 5GMK l; 4IUQ A; 2XK0 A; 4B6M A; 2ZPH B; 2DO3 A; 3JB9 G; 1D0Y A; 4E7L A; 5HK0 A; 1D0Z A; 5CQY A; 4OMQ A; 4J9B A; 1ZHI A; 1BI1 A; 3OYN A; 4KUL A; 4X9C A; 2LMJ A; 2RJC A; 3RIR A; 4C5G A; 3EFS A; 4PFP A; 3JCM h; 3EHR A; 4HCZ A; 2CP0 A; 2CH4 A; 1M8V A; 1N5Z A; 1NYG A; 1R0B G; 2DVJ A; 3I56 T; 1PCX A; 4C92 C; 2FL7 A; 1I81 A; 3CCR A; 3J81 E; 1WYX A; 2E4H A; 1NPR A; 2QAS A; 3L2Z A; 3IQL A; 1AT1 B; 4KBM B; 4M75 D; 3JCM g; 2DA9 A; 3X24 B; 1XOV A; 2MIO A; 3QYH B; 4E7S A; 3ER0 A; 3H0H A; 2XI9 A; 3OYC A; 1S72 A; 2L8D A; 4C8Q G; 3JSC A; 5GAM f; 1PKT A; 1OV3 A; 2VB6 A; 4QQD A; 4M75 E; 3UF4 A; 5CQX A; 4PLL A; 4K11 A; 3UPU A; 1X27 A; 1ZSZ B; 3NPF A; 3G4S A; 1YJN T; 1YJW T; 3CCM Q; 4ZGD B; 3QWY A; 2EFI A; 5CAI A; 3L2Q A; 1SPK A; 4E7H A; 2FZK B; 1N27 A; 2DNU A; 1R8O B; 5FU7 C; 2E65 A; 3OYB A; 2RF0 A; 2RN8 A; 3M55 A; 5GAM d; 1OQK A; 2D8J A; 3CCE T; 1OYX A; 3BW1 A; 4LXC A; 1SG5 A; 2LX7 A; 3GNG A; 4ME7 A; 4DBF A; 2NUP A; 3M0S A; 5GAN g; 3RBB B; 1FYN A; 2DIL A; 2DM1 A; 2E10 A; 2YUQ A; 1Q82 U; 4MZT A; 3MPU B; 4IUR A; 4M7D D; 2KAF A; 1NLP C; 2AIR B; 5EC7 A; 1WQW A; 4MZM A; 1VQ9 Q; 3DLL A; 4C0D B; 2YHT A; 4M7D E; 2IIM A; 1OPK A; 3M0Q A; 1U5S A; 1WJR A; 2KRM A; 4RTT A; 3PFS A; 3I9Q A; 3CCL T; 3JB9 F; 2H3E B; 2PVG B; 1YIJ T; 3CQT A; 4PJO G; 2KY9 A; 2V8K A; 4XU1 A; 1LNX A; 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2IVW A; 2JUF A; 2K3B A; 4RCC A; 3OW2 P; 2EKH A; 2LQN A; 3EH1 A; 5LJ5 e; 2E6Z A; 4AFQ C; 4O6J A; 1VQK T; 3JCM V; 3CD6 Q; 2LJ3 A; 2JMC A; 3M54 A; 5GAO n; 4JRP A; 4M4Z A; 3GP8 A; 1YCS B; 1ZBX A; 4M7A G; 4BE2 A; 2DXB A; 1YBY A; 2RHU A; 2CT3 A; 4A4F A; 1G2B A; 3LLR A; 4BDY A; 1QP2 A; 4Q5W A; 3RDV A; 2L3P A; 2NUZ A; 1UUE A; 3DB3 A; 3OYI A; 3EAE A; 2JW4 A; 3REB B; 2F5K A; 1WZO A; 1QW1 A; 1M2V B; 2RHX A; 3FJ5 A; 3CXC S; 2EQU A; 2QTV A; 3RNJ A; 2QK0 A; 4M75 B; 7AT1 B; 5GAM j; 2O31 A; 2PUO B; 2GCX A; 1CKB A; 3SWN A; 1ZSG A; 2EJG A; 1FMV A; 2ABL A; 1GRI A; 1JJ2 P; 2EQM A; 1R77 A; 2YDL A; 3JB9 D; 3UWN A; 3C12 A; 1KD1 C; 1UGS B; 1VQ9 T; 1O75 A; 2QDY B; 3PT9 A; 2KDS A; 2M0O A; 2EW3 A; 2ECZ A; 1E6H A; 1AWX A; 2K5L A; 1Y96 B; 2JS2 A; 4HVU A; 1Y71 A; 2MWO A; 3E19 A; 2OTJ Q; 1Q86 R; 1SHF A; 4EDU A; 5GMK j; 1N8R U; 4LDY A; 4M75 A; 4M78 C; 2QA4 T; 4ANJ A; 1A0N B; 3HL8 A; 4OB2 B; 4M77 C; 1YIT T; 1AVZ C; 3OB9 A; 1YJ9 A; 1N6A A; 5I2S A; 3SDZ A; 2PNI A; 2JM9 A; 1GCQ C; 4DOW A; 4OB0 B; 1UGP B; 3HKS A; 4MML A; 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