The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
27
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sequence length |
106
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structure length |
106
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Chain Sequence |
SSPKRPYLLRAYYDWLVDNSFTPYLVVDATYLGVNVPVEYVKDGQIVLNLSASATGNLQLTNDFIQFNARFKGVSRELYIPMGAALAIYARENGDGVMFEPEEIYD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Specificity versus stability in computational protein design.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Stringent starvation protein B homolog
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| molecule tags |
De novo protein
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| source organism |
Haemophilus influenzae
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| total genus |
27
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| structure length |
106
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| sequence length |
106
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-25 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SspB-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ZSZ B; 1OU8 A; 1OX9 A; 1OUL A; 1TWB A; 1ZSZ A; 1OU9 A; 1YFN A; 2QAS A; 1OX8 A; 2NYS A; 2QAZ A; 1ZSZ C; #chains in the Genus database with same CATH topology 2X9H A; 3OS0 A; 1WPY A; 3M56 A; 3M0P A; 5DM7 R; 4O5V A; 4RTV A; 3EG2 A; 2QEX Q; 2AHJ B; 4D8K A; 1GCQ A; 2AIR B; 1HYO A; 3CQT A; 1PC0 A; 1MHN A; 1OPK A; 2X35 A; 4ZTF A; 3A98 A; 3QKJ A; 3I56 Q; 4LUE A; 3ZBD A; 1OEB A; 2EQM A; 4RG2 A; 2CP5 A; 1ARK A; 3S3N A; 2FRW A; 4J9G A; 3CCV Q; 1XTD A; 4XTV A; 2K2M A; 2P4T A; 3CPW P; 4A4G A; 1S72 A; 1M1G A; 2FYK A; 3X25 B; 4F7U F; 3OMC A; 4FSX A; 2A3L A; 4QVZ A; 1YJN Q; 1M3B A; 5GAN e; 4RTU A; 1JJ2 P; 1V1C A; 4N4G A; 3M57 A; 3NTI A; 1NLP C; 4F7U B; 2RHX A; 3PT9 A; 1U1S A; 2BE7 D; 1U8R A; 2YUN A; 3MEV A; 4XTZ A; 3CCU Q; 1NPR A; 2PVG B; 4JPB W; 3TSW A; 3MPU B; 2DIL A; 2DTH A; 3CC7 Q; 4M7D A; 1O75 A; 1OU8 A; 1M2V A; 4D6W A; 4M7A E; 2QGG A; 3OYD A; 2K4Y A; 2RHY A; 1AHJ B; 3PTA A; 5C0M A; 1VQL A; 4ELZ C; 1OZ3 A; 5GAM d; 5A0L A; 1Y96 B; 5CKF A; 3H0H A; 1VQP T; 3OS2 A; 1NJI U; 3CMA T; 1BI2 A; 4OGC A; 2HQX A; 5GAN 2; 2QQB A; 2CS7 A; 1NG2 A; 3VS2 A; 2P0P A; 3CCR Q; 2GQI A; 1W4S A; 2OI3 A; 3RDV A; 1QVG P; 1YI2 A; 2I0N A; 3V8L A; 2RNA A; 3PMI A; 3OYA A; 1VQL Q; 2KXD A; 2E10 A; 4XK8 E; 4EDU A; 4FSS A; 1JXO A; 4J7I A; 3VYG A; 3RES A; 5LJ3 f; 3QWX X; 3TVT A; 3CD6 A; 3C12 A; 5I11 A; 1K8A U; 1VQ6 A; 2CUB A; 2RJF A; 3UDC A; 1KK7 A; 4X9C A; 3M5A A; 5EC7 A; 2JS0 A; 1U06 A; 3THK A; 4GLK A; 2CP0 A; 2EQI A; 3OMG A; 2D0N A; 1OQK A; 4DBH A; 2DYI A; 1VQ8 T; 2VKN A; 4ZGJ B; 1VQO T; 1PNJ A; 1ZX6 A; 1VIE A; 1PKT A; 3UAT A; 1VQ5 T; 3VS5 A; 1OUL A; 1UEB A; 2O9S A; 1S1N A; 2M0Y A; 4LDV A; 2COY A; 3CD6 Q; 1WQ7 A; 1VQ6 Q; 2EYQ A; 3A8H B; 1AWX A; 2ROL A; 1NEB A; 1M2O A; 2DZC A; 3JCM d; 2GTJ A; 3A5Z B; 1VYV A; 3FC3 A; 2MF2 A; 2NUZ A; 4E2F B; 4FYX B; 4IIO A; 4XU0 A; 2M9U A; 4DA4 A; 3ER0 A; 1ZQ1 A; 1N6A A; 4ATO A; 2QQA A; 4M78 G; 1LJO A; 3WVD B; 1K9M C; 1VQ4 Q; 4QW2 A; 1TUG B; 3VU3 C; 4B9W A; 1W2B P; 3M59 A; 3J81 E; 2JN0 A; 1Q86 C; 1TUC A; 2YDL A; 3I55 A; 3CCJ Q; 4PJO A; 4HXJ A; 2NUT A; 1IGU A; 2ZCF B; 3OS1 A; 4EMK B; 5FU7 C; 1G3W A; 4E7S A; 4QT7 A; 2HKN A; 2DL7 A; 3DB3 A; 1GCQ C; 3QYH B; 3KUF A; 3LLR A; 4XTU A; 5KCO A; 2X3X D; 5LJ5 d; 2KE9 A; 3GF5 A; 2MCN A; 1Z9Q A; 2ZPE B; 4IUU A; 4RCB A; 1AWW A; 3G7Z A; 3R6N A; 5LJ3 g; 3T9N A; 3JB9 D; 5A0G A; 1RUW A; 4EMH A; 3EFS A; 4FT2 A; 4YTL A; 3OYF A; 3QXE B; 4CC7 A; 2G3R A; 2YRD A; 1YIT Q; 3EFO A; 2AT1 B; 4HCB A; 5CQY A; 3M54 A; 2KI7 A; 1PCX A; 1VQK T; 1KQS S; 2EGC A; 1GFC A; 4LNP A; 1JQQ A; 3I56 T; 2RJC A; 4A4H A; 1M3C A; 4II1 A; 4QVD A; 4PJM A; 1PD0 A; 3PVQ A; 4M7D C; 2LZ6 B; 4M77 E; 1LOJ A; 2D0Q B; 1TU0 B; 1CSK A; 2X51 A; 3HKS A; 1WNL A; 2DJZ A; 1YJN T; 1UFF A; 1FXX A; 2K3B A; 2LQW A; 3C0C A; 3C95 A; 1UTI A; 1XNI A; 4J9H A; 2PU9 B; 2D8H A; 1QVF P; 5M9O A; 3I5S A; 2DZ9 A; 2HDA A; 2PUK B; 2LRQ A; 1PSE A; 1WA7 A; 3SWN A; 1OV3 A; 2QQR A; 2VC8 A; 2KRO A; 1QWF A; 3QZ5 B; 2KT1 A; 3X20 B; 4WCI A; 4C0D C; 2EW3 A; 2IVW A; 4M7A F; 2RO0 A; 1ZSZ A; 3CCQ Q; 4OMM A; 1WYX A; 2GFU A; 2LQN A; 4M7A B; 2F2V A; 1AVZ C; 5KYU A; 2GGR A; 2QA4 A; 2HSE B; 3CCR T; 4ZNX A; 3UA6 A; 2HCK A; 5GAN h; 1YJ9 T; 4M75 E; 1VQN T; 1Y57 A; 2C0T A; 5GMK h; 4MZM A; 3JAM E; 3NTH A; 3Q1J A; 2FZC B; 4R56 A; 1YJW A; 1ZUY A; 2SEM A; 2F1L A; 1E6G A; 5DLQ E; 4LXC A; 3CME T; 1RAD B; 2MOX A; 1SSH A; 5FWC A; 5HY6 A; 1DJ7 B; 1R77 A; 5GAN j; 3WVE B; 2CSQ A; 2KQW A; 3JSC A; 2RQU A; 2FB7 A; 3OW2 A; 1TUD A; 3L2R A; 3FJ5 A; 3JCM f; 3JB9 F; 3V7R A; 2NUP A; 5CCA A; 3QWY A; 4A4F A; 5IXB A; 3EGX B; 4CRI A; 3QG1 A; 3G6E Q; 4C8Q E; 3CCE T; 2MWO A; 4PJO C; 2AZS A; 3CC4 A; 3P8B B; 4AG2 C; 2KR3 A; 2DXC A; 3G71 T; 1WXB A; 2BUD A; 2L3S A; 1RAA B; 2XU8 A; 2K79 A; 3OA6 A; 3HFN A; 1SG5 A; 2JTE A; 2MYS A; 5GAM g; 4O6J A; 2OAW A; 2PZ1 A; 5FRN A; 2J6F A; 2LNH B; 1KHI A; 2DEQ A; 4BAC A; 2FVU A; 4C5E A; 2K9G A; 4N4I A; 1Q7Y R; 1B7T A; 1B34 B; 3J7A F; 4OB1 B; 3M4Y A; 2XDP A; 2QYZ A; 5CKH A; 4PJO G; 3BDL A; 2LT1 A; 2EVR A; 4KGZ B; 1KC8 R; 2EFI A; 3CXC S; 3O8V A; 3H0F A; 3TRE A; 3SDZ A; 3MJX A; 4QVC A; 5A0D A; 3M9Q A; 2I2L A; 5HKC A; 1VQP A; 2CUD A; 3CMA A; 4R0K A; 2Z0W A; 4J9D A; 3SEM A; 2ABL A; 1E6H A; 3RR6 A; 1NYF A; 3J80 E; 4KH0 B; 3HSB A; 3EG9 B; 4FCY A; 1R0B G; 5KE2 A; 2XK0 A; 4LDU A; 4KRT A; 5HCK A; 3BY7 A; 3A8L B; 2GBQ A; 2FPE A; 3VS7 A; 2RHU A; 3CMA Q; 2OTL T; 1ZBX A; 3JCM g; 1K73 R; 4C8Q D; 1X6B A; 4J6Y A; 1TSF A; 2E4H A; 5HK3 A; 2DD4 A; 4WTO B; 1P92 A; 2EYY A; 1MGQ A; 3OYG A; 3M0U A; 1K0S A; 2XIC A; 1G2B A; 5KYW B; 4OGE A; 1XJW B; 3SWN C; 3VJP A; 4BDY A; 4C0Z A; 5DY9 A; 3M0S A; 3RKY A; 1Q7Y C; 1W1F A; 2DEU A; 4M77 F; 1VQ5 A; 1H64 1; 1Q95 G; 1Q82 C; 3S3O A; 1SF9 A; 2NWM A; 1ZSZ C; 5IAY A; 3VYH B; 2EIF A; 4M77 B; 2X3W D; 2K3X A; 2K3Y A; 1RAI B; 4AMC A; 4OF1 A; 1VQ8 Q; 1VQO Q; 3JCM J; 2KXC A; 3PFS A; 4DBQ A; 2XD0 A; 1VQ5 Q; 1U1T A; 4AG1 C; 1HSQ A; 2O4X B; 4J83 A; 5LJ5 g; 4ME7 A; 4N0A A; 3DLM A; 3UA7 A; 2D8J A; 2E64 A; 2DTI A; 4OMO A; 4F16 A; 1QCF A; 2XDD A; 4M78 A; 1KQ1 A; 2FPD A; 1G3Y A; 4Y91 A; 2KEA A; 1VQM A; 3OBW A; 1KC8 U; 4KH1 B; 2FL7 A; 5L8R E; 2CZ1 B; 1N8R C; 2SRC A; 2DXB A; 3BW1 A; 4PFZ A; 4M75 F; 3F70 A; 4J8O A; 4C92 E; 3CCM T; 2F2X A; 5FW9 A; 3V8J A; 4JLI A; 4M75 B; 5GAO q; 2DIG A; 2DET A; 3NFC A; 2FG0 A; 5IXF A; 3KBG A; 3MEA A; 5KE3 A; 1I4K 1; 1K73 U; 1X75 C; 3RMS A; 2NLU A; 1D3B B; 2O01 E; 1X6O A; 2A08 A; 3CCS T; 2RHZ A; 4KBM B; 1OU9 A; 2O31 A; 1VQK A; 4QKU A; 4QQD A; 2P84 A; 4ANJ A; 2JMC A; 4J7F A; 4J6X A; 3I56 A; 4AFS C; 2KSS A; 4A4K A; 4VUB A; 4C8Q F; 1XOV A; 1B34 A; 1D09 B; 3CCV A; 4OMP A; 1LNX A; 4C8Q B; 2Y4Y A; 3JCM X; 2HKQ B; 3OQ5 A; 1K9A A; 1YJN A; 3JV3 A; 1PRM C; 3EAE A; 2VVK A; 2ENM A; 3QPH A; 1VQK Q; 1WXT A; 3G1J A; 3H6Z A; 1JEG A; 2KAF A; 2RN8 A; 3QJY A; 3LH0 A; 3CCU A; 1VQ7 T; 1KG1 A; 2WSE E; 4Y92 A; 2HZY A; 4E7K A; 3S3M A; 1MMA A; 2PNI A; 4J9I A; 4B6M A; 3CC7 A; 4J9E A; 1U3O A; 1WXU A; 2CGH A; 1YIJ T; 1VUB A; 1D0Y A; 1I07 A; 5GMK e; 2IPO B; 2JMA A; 2QDL A; 3PVL A; 2DAQ A; 4LE9 A; 2K5F A; 1F1B B; 2WSC E; 4C92 D; 4BDZ A; 3QDR B; 2QQ9 A; 1WIE A; 1IB8 A; 2M1H A; 3LYI A; 3OS5 A; 2R58 A; 1IO6 A; 3JB9 I; 2DIQ A; 1EIF A; 3OB9 A; 3KFV A; 4CC2 A; 4JRQ A; 3A8O B; 3CCR A; 1TOV A; 5CKB A; 1FMV A; 3RUX A; 2J06 A; 3MET A; 1RAE B; 4IUV A; 4RTZ A; 1C0M A; 1D0X A; 2E6Z A; 4DOV A; 3AHU A; 2XHC A; 4ZTJ A; 1K9M R; 4NL2 A; 1JJ2 A; 2J05 A; 3MP6 A; 1H3H A; 2KDS A; 1TS9 A; 4E7J A; 4XTX A; 5FU6 C; 1YJ9 Q; 1IZ6 A; 1VQN Q; 1Q86 R; 2COZ A; 1FX7 A; 2DVE A; 1ZUU A; 2HQH A; 1YHQ T; 5D7U A; 4ELY C; 2LVM A; 2DM1 A; 4IKF A; 2KY9 A; 4N0A C; 5GAN 4; 2VXE A; 3CME Q; 4GBQ A; 2LCS A; 2LX9 A; 5KYY B; 4FYW B; 3CCE A; 2MIO A; 4M78 C; 4J9F A; 4J6W A; 1X01 A; 1UDL A; 2V26 A; 2E5K A; 3HRT A; 1X6G A; 2CP2 A; 3G71 A; 3RKW A; 4Z8A A; 2DE0 X; 3EG1 A; 3L2U A; 1EX4 A; 1KD1 C; 2JS2 A; 3X26 B; 3X24 B; 4F14 A; 4M7A G; 1VQ4 A; 3CBO A; 3CCE Q; 3L2W A; 1M5Q 1; 2GQV A; 1V76 A; 1SHF A; 2LJ1 A; 1WZO A; 1HJD A; 2A28 A; 5GAM e; 1PKS A; 3G71 Q; 2A37 A; 4C5H A; 2P0K A; 3CCJ A; 2RA2 A; 4HVU A; 4PFO A; 2YUP A; 2DRM A; 3VRZ A; 4K11 A; 2ZPH B; 3L42 A; 2A0F B; 4PJL A; 5C6S A; 4AFQ C; 3UPU A; 3X28 B; 5KCH A; 4JRK A; 1GL5 A; 2DA9 A; 4E6R A; 2M02 A; 2RM4 A; 3ZFJ A; 2EYZ A; 4OVA A; 2JNG A; 1SRM A; 2AZV A; 3PIO A; 2DVJ A; 3LW5 E; 1PHT A; 3GBQ A; 2ROT A; 3BE3 A; 1BB9 A; 4BE0 A; 1BIA A; 2LP5 A; 3EH2 A; 2LQK A; 4PLI A; 1QP2 A; 1IGQ A; 4C92 F; 2YUQ A; 3JB9 G; 5D6W A; 2ZPB B; 4XU3 A; 4C92 B; 2JJ9 A; 1K9M U; 3MCA B; 1PRL C; 3H0I A; 2DYB A; 1YIT A; 4DBR A; 1TXQ A; 4CI0 C; 2NYS A; 4M78 D; 1QKX A; 2RI3 A; 1Q86 U; 2RI2 A; 1W2B A; 3UT1 A; 1YNZ A; 2FEI A; 1YFN A; 2EAY A; 1G5V A; 4PJN A; 1SHG A; 2DXU A; 2BTT A; 2RH2 A; 1G8X A; 1FMW A; 1WHL A; 2VV5 A; 1R0C B; 2QGF B; 2Y90 A; 2EKO A; 8AT1 B; 2OTL Q; 1FYN A; 3E2U A; 4LN2 A; 3NPF A; 3CPF A; 4OMQ A; 2VYT A; 3VS1 A; 4F7U A; 1A0N B; 4QQG A; 2PTK A; 2HQE A; 3QJ6 A; 1RI9 A; 2YUO A; 3H8Z A; 2RF0 A; 1QW1 A; 4IUR A; 4M7D E; 2FRY A; 3QO3 A; 1M1F A; 1X69 A; 5LJ3 h; 3REB B; 3L2Q A; 2DL3 A; 3D7S B; 3EG0 A; 1Y96 A; 4BE1 A; 3CBM A; 3CCL T; 4FYV B; 3OW2 S; 3CCQ A; 5LJ5 e; 4RG8 A; 2XKO C; 4Z88 A; 1ZUK A; 3SB2 A; 5EG2 A; 4A53 A; 2JT4 A; 2EGE A; 3URG A; 3VS0 A; 3V7S A; 2OTJ T; 3FEO A; 1KQS P; 5KYX B; 1VYT A; 2CT3 A; 2MK5 A; 9ATC B; 1W70 A; 2JM8 A; 1UB4 A; 2DMO A; 2VGN A; 2JXB A; 1BCM A; 3M53 A; 3QDF A; 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4MDW A; 2RQW A; 4BE2 A; 2L3P A; 2WAC A; 4JJC A; 1M1K C; 2KK4 A; 3MHX A; 1YWO A; 4DBF A; 4IUT A; 1VOM A; 4OP0 A; 2L3R A; 1M27 C; 3REA B; 3I55 T; 2F69 A; 1YHQ A; 3OY9 A; 3GIB A; 3OYY A; 4C0F A; 4OMF B; 2LCC A; 5GAM j; 4DQ2 A; 6AT1 B; 3R6O A; 1YCS B; 4LDX A; 3DKM A; 4PJO D; 2E41 A; 2HL3 A; 2GTO A; 1N8R R; 1BIB A; 2FPF A; 2J6K A; 1JRI A; 1AZE A; 3SFM A; 4F7U G; 3BDU A; 4LD9 K; 4MZT A; 1WHM A; 3CXC P; 1OOT A; 1YHQ Q; 4HCK A; 1LCK A; 1VQ8 A; 1VQO A; 1ACM B; 2GFA A; 3MEW A; 4M7D F; 4GY5 A; 3M55 A; 2AK5 A; 2VWF A; 3ZL7 C; 4F17 A; 1D0Z A; 5CVI A; 3LWH A; 4M7D B; 3CC2 T; 5D6Y A; 3OYE A; 4FU6 A; 1M2V B; 4FT4 A; 3TSZ A; 1PM3 A; 2JW4 A; 1WX6 A; 3JCM h; 3L2V A; 4M7A A; 3M0T A; 4FW2 A; 3KXT A; 4FYY B; 3TU4 K; 1VIF A; 2DD5 A; 1UGV A; 2ED1 A; 4LDY A; 4DEY A; 2VUB A; 4A4E A; 2RQR A; 5ECA A; 1BU1 A; 4Q5W A; 3JCM P; 2E5Q A; 1Q7Y U; 3TQ7 P; 2CH4 W; 1Q82 U; 1X2K A; 2EWN A; 2EJF A; 1VYU A; 2P4R A; 1TWB A; 2DXT A; 4E47 A; 2E70 A; 4C0D B; 5GMK l; 4L6V 5; 1K76 A; 2E6N A; 2QTV A; 3NGP A; 4RTY A; 3DLL A; 2KYM A; 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