The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
EYVEALYQFDPQQDGDLGLKPGDKVQLLEKLSPEWYKGSCNGRTGIFPANYVKPAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural genomics of yeast SH3 domains
rcsb |
| molecule keywords |
Ypr154wp
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
10
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2XMF A; 2PTK A; 3SEM A; 2KNB B; 4KRT A; 2FRW A; 4GLM A; 1NG2 A; 3I35 A; 2D8H A; 2K3B A; 2DF6 A; 3M0S A; 2YT6 A; 1VYV A; 2KT1 A; 1M3A A; 2RQV A; 4CC7 A; 2O9V A; 1SHF A; 1RI9 A; 1VYU A; 5GJW B; 1PKS A; 1RUW A; 3M0R A; 1YP5 A; 4JZ4 A; 4D8D A; 3NHN A; 2K9G A; 1K4U S; 1GRI A; 2JT4 A; 2K6D A; 4HXJ A; 1B07 A; 4RUG A; 4ZNX A; 3TSZ A; 1GCQ A; 2J05 A; 1BU1 A; 2O2O A; 1YNZ A; 1I07 A; 2DIL A; 1TG0 A; 2OI3 A; 1ZX6 A; 1N5Z A; 2KR3 A; 1GBQ A; 2HEQ A; 2K79 A; 2D0N A; 5EC7 A; 2P4R A; 3VS7 A; 4OMO A; 1ZUU A; 2VKN A; 1K1Z A; 1SRM A; 2JS0 A; 1NLP C; 2SEM A; 2DBK A; 2MIO A; 1WLP B; 1A0N B; 1ZSG A; 1GBR A; 1UDL A; 1NYF A; 1Z9Q A; 4AG1 C; 1M27 C; 4JJD A; 1GCQ C; 1UHF A; 2ED0 A; 5HCK A; 3UA6 A; 4A63 B; 4Z88 A; 2AKL A; 1UTI A; 1M8M A; 4OMN A; 2PZ1 A; 3M0P A; 1M3B A; 1TUD A; 1I1J A; 4LUD A; 2AK5 A; 2CUD A; 3ULR B; 1TUC A; 1WXU A; 2J6O A; 2ESW A; 2G6F X; 3EG1 A; 2A37 A; 1JU5 C; 2BZX A; 3ZL7 C; 2HCK A; 2LP5 A; 2ECZ A; 4AFZ C; 1SEM A; 2C0T A; 2EGE A; 3TSW A; 3EG3 A; 1QCF A; 2DL5 A; 4DEX A; 2J7I A; 2LCS A; 3EG2 A; 2EQI A; 5FWB A; 4D8K A; 4ESR A; 3H0H A; 4J9G A; 2JW4 A; 1MV0 B; 2DYB A; 4M4Z A; 2FPE A; 2EYW A; 2DX1 A; 2CH4 W; 2BTT A; 2O9S A; 1ABO A; 4F17 A; 2W0Z A; 1E7O A; 3VS1 A; 4F14 A; 3NGP A; 2JMA A; 2KRS A; 2RF0 A; 3M0U A; 1YWO A; 3TVT A; 2DJQ A; 2J6K A; 1OPK A; 1KJW A; 3GBQ A; 2DRK A; 3M0Q A; 2LJ1 A; 2IIM A; 1QLY A; 2OAW A; 1JQQ A; 5IHI A; 3A98 A; 2CUB A; 1NM7 A; 3JV3 A; 2JXB A; 4ORZ A; 1ARK A; 1X6G A; 1GFD A; 1GCP A; 2EW3 A; 4E6R A; 1SRL A; 2JM8 A; 2M51 A; 2QDL A; 3PVL A; 1AZG B; 4RTZ A; 2GTO A; 1CKB A; 1K76 A; 2CDT A; 1WXB A; 2EYX A; 1T3S A; 3NPF A; 3H41 A; 2FPD A; 2FO0 A; 2RQU A; 2F2W A; 3VS2 A; 4Z8A A; 3EGU A; 2KYB A; 2DNU A; 2D8J A; 4HVW A; 2X3W D; 4JZ3 A; 4OMM A; 1AWJ A; 4J9D A; 2MCN A; 1V1C A; 2VVK A; 4Y92 A; 2RNA A; 2LNH B; 1ZLM A; 5FW9 A; 2ABL A; 2JM9 A; 3EHR A; 3VRY A; 1YN8 A; 3FJ5 A; 4AG2 C; 2EYZ A; 2DE0 X; 1E6G A; 2L3S A; 2EPD A; 1ZUK A; 2JMC A; 2LQN A; 4FSS A; 2DM1 A; 2A36 A; 1EFN A; 2EKH A; 2LJ0 A; 1UJY A; 2C0I A; 1AD5 A; 2KE9 A; 1JO8 A; 1PWT A; 2C0O A; 4QT7 A; 4RTT A; 1WDX A; 1WI7 A; 1ZUY A; 2LZ6 B; 5GJV B; 1VYT A; 3RNJ A; 3I5R A; 2CH4 A; 1WXT A; 5IXF A; 1WIE A; 1AEY A; 1OOT A; 1Y0M A; 2FPF A; 1WYX A; 1HJD A; 3NMZ C; 2K7A A; 2KRN A; 1UFF A; 2ROL A; 3H0I A; 1BK2 A; 4JJC A; 1NEG A; 2DL7 A; 4CC3 A; 1J3T A; 2YDL A; 1PHT A; 1YWP A; 4CC4 B; 1AVZ C; 2NWM A; 4IIO A; 1OEB A; 2FEI A; 2A28 A; 3VS4 A; 3VRZ A; 5ECA A; 1MUZ A; 2YSQ A; 2KXD A; 1AWX A; 3SHW A; 2LMJ A; 3RBB B; 1X27 A; 2OJ2 A; 3QWX X; 3U23 A; 2RMO A; 1SSH A; 1QKX A; 2RQW A; 4F16 A; 1ZBJ A; 1SHG A; 2V1R A; 2JS2 A; 3VS3 A; 4J9E A; 1K0X A; 1Z9Z A; 1K0S A; 3EG0 A; 3O5Z A; 5IHN A; 1CKA A; 2BZ8 A; 3H0F A; 2L2P A; 2V1Q A; 4OML A; 1UE9 A; 1JXM A; 2CRE A; 2X3X D; 4EIK A; 5I11 A; 1UEC A; 1AWO A; 2CSQ A; 2L0A A; 2M0Y A; 4HVU A; 3CQT A; 4LE9 A; 1X6B A; 4X1V A; 2I0N A; 3I9Q A; 1H8K A; 2A08 A; 2DL8 A; 1K9A A; 2LJ3 A; 1AZE A; 3VS6 A; 2CSI A; 4OMP A; 1SPK A; 1MV3 A; 2YUQ A; 4GBQ A; 3UA7 A; 3UAT A; 2DL4 A; 1BB9 A; 2O31 A; 5FWC A; 2RQT A; 5L23 A; 2KBT A; 1B3Q A; 1G83 A; 4JJB A; 1NYG A; 1H3H A; 3EHQ A; 3THK A; 2O88 A; 1VA7 A; 3QWY A; 2F2X A; 2KXC A; 4CC2 A; 2JTE A; 2DL3 A; 1U06 A; 1NLO C; 1U3O A; 2BZY A; 1JEG A; 2ENM A; 2EBP A; 2YUN A; 2HBW A; 2KRM A; 1W6X A; 1M3C A; 3IQL A; 1UG1 A; 4DEY A; 1X69 A; 2DRM A; 1U5S A; 4AFS C; 4AFQ C; 1Y57 A; 2D1X A; 1OV3 A; 2LX7 A; 5IHK A; 1H92 A; 1OPL A; 1PRL C; 4RTY A; 2RPN A; 1LCK A; 3VS0 A; 1W70 A; 4LNP A; 2EGA A; 2RQR A; 2L3Q A; 2H8H A; 2FG0 A; 2AZV A; 4J9B A; 1RLP C; 3KFV A; 4RTX A; 5I22 A; 4J9C A; 2KRO A; 1T0H A; 1AOJ A; 4WCI A; 3REA B; 1UGV A; 1QKW A; 1WA7 A; 2MOX A; 3LH5 A; 3I5S A; 2K2M A; 1XOV A; 2KGT A; 5IH2 A; 2KEA A; 1S1N A; 4IIM A; 1FMK A; 4AFU C; 1M30 A; 2GGR A; 4JPB W; 1CSK A; 1PKT A; 4Z89 A; 2L3P A; 1GFC A; 1ABQ A; 1JXO A; 2E5K A; 4HVV A; 4HCK A; 4J9H A; 4OMQ A; 1UJ0 A; 1WX6 A; 2AZS A; 2GNC A; 2FRY A; 1X2Q A; 2DVJ A; 3PVQ A; 2CT3 A; 2J6F A; 2DLP A; 1PNJ A; 4RTU A; 2DBM A; 1UHC A; 1UUE A; 2GBQ A; 2ROT A; 1I0C A; 1AWW A; 1W1F A; 2AKK A; 4R0K A; 4K11 A; 3VS5 A; 1QWE A; 4J9I A; 1YCS B; 1HSQ A; 1IO6 A; 4RTW A; 1BBZ A; 1T0J A; 1WFW A; 2KT8 A; 1QWF A; 2YUP A; 1NEB A; 1KIK A; 3UF4 A; 1HD3 A; 2GQI A; 3M0T A; 1FYN A; 2DMO A; 1E6H A; 2SRC A; 1G2B A; 2J06 A; 1X43 A; 2HDA A; 2EGC A; 2F2V A; 4LN2 A; 2EYY A; 3C0C A; 3REB B; 2EVR A; 5IXB A; 2VWF A; 2W10 A; 1KSW A; 4J9F A; 2KYM A; 2B86 A; 1GL5 A; 1PRM C; 3PE0 A; 1KFZ A; 2PNI A; 2HSP A; 2GTJ A; 1X2K A; 2NUZ A; 4LUE A; 1RLQ C; 2RN8 A; 2LQW A; 1T3L A; 2DA9 A; 4RTV A; 3R6N A; 2ED1 A; 2YUO A; 2CT4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4BE1 A; 4XU0 A; 2MMP A; 2XI9 A; 3SEM A; 1H3Z A; 6AT1 B; 2RHY A; 3M59 A; 2E10 A; 1PSE A; 2FZG B; 4KUL A; 4F7U E; 3MO8 A; 3A5Z B; 1RUW A; 1VQ8 T; 3M0R A; 3M4Y A; 2K5L A; 3I55 T; 3QPH A; 2E70 A; 3JCM X; 5LL6 S; 1G3T A; 5KYU A; 3QZ9 B; 4F7U B; 4HXJ A; 1B07 A; 4RUG A; 1GCQ A; 2BKD N; 1I07 A; 2DIL A; 1TG0 A; 2ZPF B; 1N5Z A; 1YJ9 Q; 2QEX A; 1VQO A; 1AHJ B; 1SSF A; 3G6E T; 1NLP C; 4ANJ A; 5GAN g; 2MK5 A; 1A0N B; 2JUF A; 5KCH A; 1NYF A; 1Z9Q A; 1M27 C; 3CPW A; 1LVK A; 5GAO q; 5IN1 A; 3EFO B; 1UTI A; 1VIE A; 5CO7 A; 3OYD A; 3M0P A; 2CZ6 B; 2RO0 A; 1TUD A; 4LUD A; 2HAX A; 1TTH B; 1Y96 A; 1S72 T; 4C92 G; 3E1S A; 3QZ5 B; 3EG1 A; 4J6W A; 2A37 A; 3CXC A; 3L2Q A; 2BZX A; 2HCK A; 3DB4 A; 3CCJ Q; 3GPL A; 4M75 F; 3QII A; 2RB6 A; 2H3E B; 2ECZ A; 2P0P A; 2DXU A; 1Q82 C; 2EWN A; 1SEM A; 3JB9 G; 4PJO F; 3NTK A; 2E3I A; 1K9M U; 4UC4 A; 1QCF A; 3JB9 I; 3H0H A; 1M1K C; 2JW4 A; 1MV0 B; 4M4Z A; 2BTT A; 3G4S A; 4F17 A; 5CAI A; 1KC8 C; 1E7O A; 1VQ5 Q; 3PIO A; 2K57 A; 2ZPE B; 3DLM A; 4F14 A; 3E9F A; 3TVT A; 4LDV A; 4M7A A; 1KJW A; 3CD6 Q; 4JRK A; 1JQQ A; 2KDS A; 2LCL A; 1NM7 A; 2JXB A; 1ARK A; 1SRL A; 4CRI A; 1M4Z A; 4C92 D; 2DK3 A; 1K76 A; 2P4T A; 1M8V A; 1WXB A; 4N4H A; 1WGS A; 4J83 A; 1XQH A; 2K3Y A; 2FO0 A; 3PMT A; 4AMC A; 2RQU A; 1YIJ Q; 3EH1 A; 1YJW T; 2KYB A; 4HVW A; 1BI0 A; 2RH2 A; 1QMC A; 4JZ3 A; 3JB9 D; 2M0O A; 3CCU A; 4C5G A; 3I56 Q; 3CCU T; 4C8Q G; 5D6Y A; 2JM9 A; 3JCM d; 4AG2 C; 3FJ5 A; 2HQH A; 1IRX A; 3TEE A; 4DOV A; 4HA8 A; 1VQ7 A; 2LQN A; 4FSS A; 1IGU A; 1M1G A; 2DM1 A; 3CME T; 4QW2 A; 5J39 A; 2C0I A; 2KE9 A; 3NFC A; 4XTW A; 3PIP A; 1PWT A; 2C0O A; 3QJ6 A; 3MEA A; 4EMK C; 4E7I A; 1VQ4 A; 1WIE A; 1AEY A; 1OOT A; 2WAC A; 2D9T A; 1M2V A; 2KRN A; 3CBO A; 2ROL A; 1LOJ A; 1X6O A; 4M77 G; 1UGP B; 2DL7 A; 1M90 R; 1VQ6 A; 2CZ1 B; 1AVZ C; 3M9Q A; 2FEI A; 1ACM B; 4OB2 B; 3WVD B; 2NUP A; 4E7S A; 1NZ9 A; 2FB7 A; 3LWI A; 1O75 A; 2QGF B; 1AWX A; 3SHW A; 4E7H A; 3RBB B; 4A4E A; 2VV5 A; 2RMO A; 1QKX A; 1TH7 A; 4M7A E; 1JJ2 P; 3CCM Q; 1SHG A; 1NPP A; 4C8Q D; 1YBY A; 5KE3 A; 5D6X A; 3QDR B; 2A7Y A; 4B9W A; 4A53 A; 3M4G A; 1D0X A; 4J5Y A; 2FL7 A; 2YWW A; 4M7D B; 4M7A B; 1W4S A; 5GAM d; 5I11 A; 2QK0 A; 3UDC A; 1UEC A; 1AWO A; 1YI2 A; 2VGN A; 4ATO A; 2QEX Q; 3CBM A; 4OF1 A; 5L8R E; 2L0A A; 4DOW A; 2P0Q A; 2RI5 A; 3CQT A; 5A2Q E; 3M54 A; 4X1V A; 3SWN B; 2CKK A; 3FEO A; 4HCZ A; 2R57 A; 3V8L A; 1K9A A; 1WHG A; 4M75 A; 2O4X B; 4GBQ A; 5LJ3 e; 3HFN A; 5IAY A; 1JBM A; 2DXT A; 4J6Y A; 4M77 D; 2RQT A; 2FZC B; 1B3Q A; 4ZTF A; 2GCX A; 1H3H A; 4WF2 A; 5FU7 B; 3EHQ A; 4XU3 A; 4HKE A; 3QWY A; 2HQX A; 2QA4 T; 8ATC B; 3H8Z A; 4QVZ A; 1D1B A; 3BE3 A; 1XTD A; 2HKQ B; 1RAC B; 1K8A R; 1MNE A; 5GMK i; 5CKF A; 1VQP T; 3TQ7 P; 2ZPG B; 3CMA A; 1UG1 A; 4DEY A; 1Q7Y C; 4AFS C; 4M7D C; 2D1X A; 1OV3 A; 2WSC E; 4KH1 B; 1H92 A; 1OPL A; 1OI1 A; 1BKB A; 1X01 A; 3LWH A; 3G4S Q; 3HKS A; 3VUZ A; 5GAN 6; 3JB9 H; 1VIF A; 4RTX A; 5I22 A; 4J9C A; 2KRO A; 1T0H A; 4B9X A; 4WCI A; 2VC8 A; 1I81 A; 1WA7 A; 1QCO A; 1VQ9 T; 3CC4 A; 1B34 A; 2BUD A; 1BYM A; 3ZBD A; 1JJ2 S; 5IH2 A; 2KMT A; 4IIM A; 5GMK j; 3OY9 A; 1ZQ1 A; 1CSK A; 4Z89 A; 2L3P A; 4JLI A; 1LJO A; 2DZ9 A; 5KYX B; 2E5K A; 4OMQ A; 2AZS A; 3JCM c; 1X2Q A; 2DVJ A; 2RHI A; 5FU6 C; 5M9O A; 2DLP A; 4MZT A; 4PLL A; 4JLG A; 3S3M A; 3A8O B; 1FMV A; 2HZY A; 3ZEH A; 2EAY A; 2LT4 A; 3X28 B; 1JRI A; 4M75 E; 4BUG A; 2AKK A; 4PNO A; 2E5Q A; 1QWE A; 3HP9 A; 1IO6 A; 4RKU E; 1Q86 U; 1FMW A; 2QQS A; 1NEB A; 1VQ7 Q; 1UGR B; 3M0T A; 1N8R U; 2RJF A; 2LCC A; 1G2B A; 3L2U A; 3VYG A; 1YJ9 A; 3V7S A; 2HDA A; 4QVD A; 3OYB A; 4LN2 A; 1IZ6 A; 2EVR A; 3JCM b; 1VQ4 Q; 2VWF A; 1R0B G; 2DTO A; 3V8K A; 3LLR A; 2B86 A; 1Q95 G; 4OGE A; 3PE0 A; 5J26 A; 3S3N A; 3ER0 A; 2GTJ A; 3VV0 A; 1K9M R; 2GFA A; 3QXE B; 3OS1 A; 1NPR A; 5HY6 A; 5LJ3 f; 3JCM J; 2DA9 A; 2X4J A; 4C92 E; 2YUO A; 3REA B; 2RJE A; 2PTK A; 3OMG A; 4V2S A; 4KRT A; 3I35 A; 3EAE A; 4BDY A; 4C92 B; 1VYV A; 3UWN A; 1M3A A; 2RQV A; 4X34 A; 2DXC A; 1D0Z A; 2DER A; 2LQK A; 4VUB A; 2AT1 B; 3CCJ T; 2BE7 D; 5GJW B; 2COY A; 4D6W A; 1WQ7 A; 4XU1 A; 4JZ4 A; 3OS0 A; 3HHT B; 2WSF E; 4DQ2 A; 3NHN A; 1K4U S; 1GRI A; 1YI2 Q; 2QG9 B; 2K6D A; 2H3J A; 3M55 A; 3TSZ A; 4PJM A; 1ZX6 A; 2KR3 A; 3QUI A; 2K79 A; 5EC7 A; 1U1T A; 2P4R A; 1VQ5 T; 2VKN A; 1SRM A; 1QVF A; 2X4X A; 4NL3 A; 2JS0 A; 2SEM A; 3M53 A; 2MIO A; 2CP5 A; 5LJ3 h; 1GBR A; 3CD6 T; 3FLG A; 4AG1 C; 1YCY A; 4JJD A; 1MMA A; 3QG1 A; 1UHF A; 3RER A; 2ZPB B; 4Z88 A; 4OMN A; 2PZ1 A; 2COW A; 4RCB A; 2XD0 A; 4LDY A; 4BDZ A; 4QKU A; 5GAN 4; 3SDZ A; 3CMA Q; 3KBG A; 2LP5 A; 1YIJ T; 5LJ5 j; 4M7A D; 4PJJ A; 4PL6 A; 4C0Z A; 3I56 A; 1MGQ A; 3OW2 P; 2DL5 A; 1D09 B; 3I56 T; 4DEX A; 4C8Q B; 1EZZ B; 2LCS A; 2EQI A; 2WSE E; 1RAE B; 4M7D F; 4MMK A; 2DYB A; 4M78 C; 3CCE T; 2OTJ A; 2FPE A; 2EYW A; 5CKD A; 3MP1 A; 1LPL A; 2CH4 W; 4OB0 B; 3CPF A; 5KE2 A; 1ABO A; 2W0Z A; 3CC4 Q; 3HRS A; 3VS1 A; 3PTA A; 3C4S A; 2JMA A; 5J3B A; 2DJQ A; 1OPK A; 1Q82 U; 4HCB A; 2QAZ A; 4M77 E; 3RIR A; 2DRK A; 4DBF A; 2LJ1 A; 2OAW A; 5IHI A; 2DYI A; 1QQJ A; 2I2L A; 1M1K U; 2JTM A; 5IT9 E; 1X6G A; 4M77 B; 1GFD A; 4PJN A; 4XTX A; 1GCP A; 4E6R A; 2JM8 A; 2QDL A; 2ZPI B; 3X25 B; 4RTZ A; 1KC8 U; 2GTO A; 3MEV A; 2RI2 A; 4L6V 5; 1OYX A; 1T3S A; 3BDU A; 2YRD A; 2F2W A; 3VS2 A; 3EGU A; 2DNU A; 2D8J A; 3CPW P; 3CCM A; 1VUB A; 4OMM A; 4M75 G; 5GAM j; 2MCN A; 1V1C A; 4C8Q C; 4EMK A; 3JCM W; 3VYH B; 4PLI A; 2LNH B; 4JS4 A; 5CQY A; 4PJO G; 2DFU A; 5GAO r; 3VRY A; 2LQ8 A; 2L3S A; 1OU9 A; 1UGS B; 2A36 A; 1EFN A; 3OYN A; 2EKH A; 2RK2 A; 3JCM e; 3CXC P; 2LJ0 A; 2QEX T; 1VQO T; 2EQM A; 1JO8 A; 2LVM A; 1NJI C; 2LZ6 B; 5GJV B; 4RCC A; 3GF5 A; 5A0G A; 1Q81 U; 5A0L A; 3EH2 A; 3UPU A; 3JCM V; 1WYX A; 3NMZ C; 4BE2 A; 1U1S A; 1UFF A; 3H0I A; 4IUT A; 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