The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
4
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sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
SLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Kinase
|
| molecule keywords |
ABL TYROSINE KINASE
|
| publication title |
The solution structure of Abl SH3, and its relationship to SH2 in the SH(32) construct.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
4
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1997-10-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3M0U A; 4J9H A; 3VS7 A; 4DEX A; 1KFZ A; 4OMQ A; 1AWW A; 2EQI A; 1U5S A; 2EYZ A; 2OAW A; 1WXT A; 2CUD A; 1FMK A; 1JU5 C; 2DIL A; 2O2O A; 3UA7 A; 1QCF A; 1WLP B; 2SRC A; 4J9I A; 1M3A A; 1NG2 A; 1M3B A; 1AWX A; 4HVV A; 2F2X A; 2K9G A; 3R6N A; 2EGE A; 1GFD A; 1TUD A; 1RLP C; 1B3Q A; 2RQT A; 2HSP A; 2SEM A; 1UTI A; 2EPD A; 2VWF A; 4F14 A; 1ZUU A; 2A08 A; 1ZUK A; 1VYU A; 1K0X A; 1ZSG A; 2V1Q A; 1BU1 A; 1Z9Q A; 3RNJ A; 5EC7 A; 2MCN A; 1JO8 A; 1WFW A; 3GBQ A; 2NUZ A; 3QWX X; 2BZX A; 2FRY A; 1JXO A; 3EG3 A; 3O5Z A; 2EKH A; 2CUB A; 2L3Q A; 2ROL A; 1J3T A; 2GTJ A; 2A28 A; 4LE9 A; 1T0J A; 4LNP A; 2JS0 A; 1GFC A; 1HSQ A; 1WXB A; 2RF0 A; 2W10 A; 2VKN A; 1SHG A; 2EBP A; 1B07 A; 2JS2 A; 2LCS A; 2EYW A; 3EG2 A; 1WX6 A; 2K2M A; 2D8H A; 2LZ6 B; 1UFF A; 1PNJ A; 3KFV A; 3VS6 A; 3ULR B; 1XOV A; 3C0C A; 1ZUY A; 4OML A; 5IH2 A; 1X69 A; 4HCK A; 1EFN A; 2EW3 A; 4J9C A; 4JZ4 A; 2C0O A; 2MIO A; 1JXM A; 5ECA A; 2YDL A; 4RTX A; 4ORZ A; 4RTY A; 1HJD A; 5IXB A; 2KE9 A; 2KT8 A; 1UHF A; 4D8K A; 1W70 A; 1NYF A; 4CC4 B; 2IIM A; 2D1X A; 2X3W D; 1FYN A; 1ABO A; 4AFZ C; 1TUC A; 2L3P A; 2DL7 A; 1RUW A; 2HDA A; 2RPN A; 2J05 A; 4D8D A; 2V1R A; 1NLO C; 2LP5 A; 3H0H A; 3M0T A; 4K11 A; 1GL5 A; 2J6O A; 4CC7 A; 1OPK A; 3NGP A; 1QKX A; 2EYY A; 2YUN A; 2KXC A; 2PZ1 A; 2DM1 A; 1G83 A; 2GNC A; 5L23 A; 1KJW A; 3VS5 A; 2YUQ A; 4F16 A; 2O88 A; 2BTT A; 2HEQ A; 3U23 A; 2JW4 A; 2DL8 A; 2FPE A; 1QLY A; 2K6D A; 1U06 A; 2YUP A; 2DMO A; 2RQU A; 1K4U S; 3THK A; 1Z9Z A; 1S1N A; 3SEM A; 2KRS A; 1A0N B; 2KYB A; 1OEB A; 2PNI A; 4R0K A; 4J9G A; 3UA6 A; 4HVW A; 1H8K A; 2M0Y A; 1GCQ C; 2O31 A; 1AOJ A; 2FPF A; 5IXF A; 2AZV A; 1BBZ A; 1BK2 A; 1X6G A; 1HD3 A; 4HVU A; 1AZE A; 4EIK A; 1K1Z A; 1YWO A; 1M8M A; 3VRY A; 4JJC A; 2OJ2 A; 1GRI A; 3EHQ A; 2ENM A; 2DE0 X; 2JT4 A; 4RTV A; 4DEY A; 2EGA A; 1M3C A; 2DL3 A; 2FRW A; 1WIE A; 4GBQ A; 2ESW A; 2J06 A; 1AZG B; 2DX1 A; 1I1J A; 4JZ3 A; 2EVR A; 2KRO A; 2RN8 A; 1VYV A; 1UEC A; 4RTZ A; 1SSH A; 4RTT A; 2P4R A; 1I0C A; 3FJ5 A; 3VS2 A; 1WI7 A; 4CC2 A; 4J9D A; 3VS1 A; 2L0A A; 2DLP A; 2BZ8 A; 2JM9 A; 1T0H A; 2CH4 A; 1T3S A; 2JMA A; 4Z89 A; 3PE0 A; 2BZY A; 2DF6 A; 1KSW A; 2L3S A; 2F2W A; 5I11 A; 2DVJ A; 3UAT A; 1MV0 B; 2KEA A; 2LNH B; 2DBK A; 5IHN A; 4RTW A; 1PKS A; 2LX7 A; 4ESR A; 1UHC A; 4RUG A; 1SRM A; 4QT7 A; 4Z8A A; 1PRL C; 1WYX A; 3EGU A; 1BB9 A; 1VYT A; 2ED1 A; 2KNB B; 2G6F X; 4ZNX A; 4A63 B; 2CSI A; 4AG1 C; 1SRL A; 2KGT A; 2KYM A; 1OV3 A; 1NM7 A; 1X43 A; 2CSQ A; 2J6K A; 1W1F A; 3TSZ A; 2KXD A; 1UE9 A; 2CT4 A; 4AFQ C; 3VS0 A; 2AZS A; 1CSK A; 1YWP A; 3M0P A; 1NLP C; 5IHI A; 2GGR A; 2KBT A; 2KRM A; 2FPD A; 2D8J A; 4LUD A; 1WXU A; 4AFU C; 2RMO A; 1QKW A; 1UGV A; 4IIM A; 1AEY A; 1WDX A; 1UJY A; 3PVL A; 1K76 A; 1PKT A; 4OMN A; 4Y92 A; 2O9V A; 2JTE A; 3VRZ A; 1SEM A; 2AKK A; 1GCQ A; 2O9S A; 3PVQ A; 5GJW B; 1X27 A; 1UDL A; 2AKL A; 2YT6 A; 3I9Q A; 3M0S A; 3M0Q A; 1VA7 A; 5FWB A; 1GCP A; 2QDL A; 1W6X A; 2LJ3 A; 2W0Z A; 1UJ0 A; 1H3H A; 2VVK A; 1ARK A; 2FEI A; 3JV3 A; 1AWJ A; 2C0T A; 4GLM A; 1ZX6 A; 1MV3 A; 2LJ1 A; 2A36 A; 2A37 A; 1U3O A; 3EG0 A; 2CDT A; 1PRM C; 1T3L A; 1SPK A; 1YCS B; 1NEB A; 2HCK A; 2DA9 A; 2GBQ A; 4M4Z A; 4KRT A; 2KT1 A; 2D0N A; 1TG0 A; 2MOX A; 3I5S A; 4IIO A; 3UF4 A; 4OMM A; 2RNA A; 4E6R A; 1M27 C; 2FG0 A; 3A98 A; 2ECZ A; 2DJQ A; 2C0I A; 1CKB A; 1AVZ C; 1LCK A; 5FWC A; 4AFS C; 3LH5 A; 1Y0M A; 3NHN A; 3REA B; 2RQV A; 1H92 A; 1ABQ A; 2YUO A; 2RQR A; 1X2K A; 2B86 A; 2CH4 W; 1K0S A; 1JEG A; 1MUZ A; 1E6G A; 4Z88 A; 3EG1 A; 2DBM A; 4JJD A; 1NEG A; 3TVT A; 2HBW A; 2PTK A; 4J9F A; 1PHT A; 2FO0 A; 2I0N A; 4FSS A; 2LMJ A; 3VS4 A; 4JPB W; 1ZBJ A; 2DYB A; 2DL4 A; 1Y57 A; 1IO6 A; 2EYX A; 1YN8 A; 5GJV B; 4X1V A; 1E7O A; 5I22 A; 3H0I A; 3I5R A; 1M30 A; 2ABL A; 2KR3 A; 3ZL7 C; 3H41 A; 2CT3 A; 2K3B A; 2NWM A; 1NYG A; 1X6B A; 2DL5 A; 4RTU A; 1RI9 A; 1I07 A; 2JMC A; 1X2Q A; 2L2P A; 3REB B; 2OI3 A; 2F2V A; 2K7A A; 4LN2 A; 1G2B A; 1GBR A; 4LUE A; 1YNZ A; 1GBQ A; 2ED0 A; 1KIK A; 2GTO A; 2J6F A; 2M51 A; 3CQT A; 3IQL A; 1V1C A; 1E6H A; 3NPF A; 4J9B A; 4F17 A; 1SHF A; 5FW9 A; 2ROT A; 3TSW A; 1ZLM A; 2AK5 A; 2DNU A; 2X3X D; 1OPL A; 3I35 A; 4JJB A; 4WCI A; 1WA7 A; 2LQN A; 1OOT A; 3SHW A; 3VS3 A; 4J9E A; 1UG1 A; 1CKA A; 1PWT A; 3QWY A; 4OMO A; 2RQW A; 2XMF A; 2JXB A; 5HCK A; 1RLQ C; 1K9A A; 4AG2 C; 2K79 A; 5IHK A; 3H0F A; 2DRK A; 1AWO A; 2LJ0 A; 2E5K A; 1YP5 A; 2CRE A; 1UUE A; 2LQW A; 2GQI A; 4HXJ A; 2EGC A; 4CC3 A; 3NMZ C; 1JQQ A; 2YSQ A; 3EHR A; 1QWE A; 2J7I A; 1QWF A; 4OMP A; 3M0R A; 2H8H A; 1N5Z A; 1AD5 A; 2DRM A; 2KRN A; 3RBB B; 2JM8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2M02 A; 2RI2 A; 3X24 B; 3BE3 A; 1KFZ A; 4OMQ A; 4FIB A; 1U5S A; 2MMP A; 4RCB A; 4C8Q E; 4CI0 C; 5LJ5 d; 1FMK A; 3LWH A; 2DTH A; 2DIL A; 3OY9 A; 4N4G A; 3UA7 A; 2V8I A; 1YI2 T; 2MWO A; 1WLP B; 2OTL Q; 1M3A A; 1DJ7 B; 2F2X A; 1GFD A; 2DXT A; 2FL7 A; 1B3Q A; 4M77 B; 1OX9 A; 1SF9 A; 4EPC A; 5GAN h; 1UTI A; 1G3S A; 1UEB A; 3CCL A; 2EPD A; 3CCE T; 4X34 A; 3CMA T; 4J6X A; 4KUL A; 1SSF A; 1K0X A; 1Z9Q A; 3EH1 A; 2DPP B; 5EC7 A; 2MK5 A; 3CCQ T; 5GAN j; 1JO8 A; 1WFW A; 4QKU A; 2BZX A; 2FRY A; 4DOV A; 3N5B B; 4DBH A; 1JXO A; 2RHI A; 3O5Z A; 2L3Q A; 3CCM T; 2EAY A; 4JS5 A; 5FU6 B; 4M78 G; 2LC4 A; 4FYW B; 3L2Z A; 3OYA A; 2JS0 A; 3KBG A; 2DZ9 A; 3PMI A; 4M75 G; 2LVM A; 4XQ3 A; 4D6W A; 1ZSZ A; 3EAE A; 1Q81 U; 2COZ A; 2LCS A; 2K2M A; 1UFF A; 1PNJ A; 1WHH A; 2KQW A; 3HP9 A; 3EGD A; 1OX8 A; 5KYX A; 4JZ4 A; 2MIO A; 4E7L A; 1Y7X A; 1HK9 A; 4C92 C; 1PSE A; 3I56 Q; 5FRM A; 3A5Z B; 2ZGW A; 2OTJ Q; 4XU3 A; 3AT1 B; 4ZGJ B; 2D1X A; 4PJJ A; 2XU8 A; 2L3P A; 2HSE B; 4M77 F; 2DL7 A; 2RPN A; 4D8D A; 1MND A; 2CZ6 B; 1YI2 A; 2QEX T; 3G7Z A; 4CC7 A; 1QKX A; 3VJP A; 2GFA A; 2YUN A; 2DM1 A; 3OS2 A; 2GNC A; 1MMD A; 3SB2 A; 4M78 A; 5GMK h; 3CCE A; 3OBY A; 2LCC A; 2DTI A; 2O4X B; 3U23 A; 3CMA A; 1D1A A; 2WSE E; 2JW4 A; 4M75 A; 2K3Y A; 2FPE A; 1VQO T; 4L6V 5; 2RQU A; 1K4U S; 4XTU A; 3CCQ A; 5GAN e; 1A0N B; 1UGQ B; 4R0K A; 5GMK j; 1BIB A; 2HNI A; 1VQ5 T; 4LDY A; 1BBZ A; 1BK2 A; 1HD3 A; 2P0P A; 4JJC A; 1GXI E; 3CCM A; 5FU7 C; 1K73 U; 4XTY A; 3L2W A; 2DL3 A; 4PJO F; 4WTO B; 2DK3 A; 4O5V A; 1VQN A; 3QXE B; 1WHM A; 1Y71 A; 4GBQ A; 2K5I A; 2DX1 A; 1I1J A; 1TSF A; 5HK0 A; 1QP3 A; 4JZ3 A; 1S72 T; 2KRO A; 2D6F A; 2G3R A; 1I81 A; 5D6Y A; 2NYS A; 1WI7 A; 4OP0 A; 2JVV A; 2L5Q A; 3WVD B; 2DVE A; 3MO8 A; 4L5G A; 3CC2 T; 4BE1 A; 3CCR T; 5FRO A; 2ATC B; 1KQS A; 1T3S A; 2JMA A; 4LDU A; 2MWP A; 4B6M A; 3JCM V; 3MEV A; 2KI7 A; 5I11 A; 2YRD A; 2MI6 A; 3CD6 T; 3FEO A; 4M75 E; 4J7F A; 1OU9 A; 3QJY A; 4C92 B; 4A4F A; 2ZPG B; 5GAM h; 1FX7 A; 1NJI U; 4XTZ A; 2DD5 A; 2DKG A; 2OAU A; 4Z8A A; 1VQL Q; 1TOV A; 1IGU A; 2DEU A; 3JCM h; 2QEX A; 2ED1 A; 1QCO A; 5GAM j; 2R5M A; 4ZNX A; 2E64 A; 1SRL A; 3L1A A; 3C95 A; 4M77 D; 2PUK B; 4E7S A; 3G71 Q; 1KQ1 A; 1M9S A; 1W1F A; 4RG2 A; 4KBM B; 3TSZ A; 3QO3 A; 1Q81 C; 1VQO A; 3FDR A; 2LQ8 A; 1KQS S; 1U1T A; 3HKS A; 1YJ9 A; 4AFQ C; 1EZZ B; 5GMK e; 1Q7Y U; 1VQ5 A; 4JS4 A; 4LDV A; 1M4Z A; 1NLP C; 1YIJ T; 5LJ3 f; 4F7U G; 2MAM A; 2HL5 C; 3QDF A; 2KRM A; 2VXE A; 2D8J A; 1WXU A; 2RMO A; 1AEY A; 1WDX A; 3CCV T; 2O9V A; 1XTD A; 3VRZ A; 1B34 B; 1GCQ A; 5GJW B; 4E2F B; 2D9T A; 3M0S A; 1TXQ A; 2DD4 A; 3QYG B; 1VA7 A; 2R5A A; 5FU7 B; 4BD3 A; 4BE2 A; 3KUF A; 5I2S A; 1UJ0 A; 2VVK A; 3A8L B; 2QGF B; 4EMK C; 5LJ5 f; 3JV3 A; 2KSS A; 1V76 A; 5KYW B; 4PJO D; 5CVI A; 3JRZ A; 1ZX6 A; 1MV3 A; 2LJ1 A; 3CC2 A; 2A36 A; 4C92 F; 2DJZ A; 3CCR A; 1SPK A; 4RMO A; 5FRN A; 3A8G B; 1QP2 A; 1VQ9 Q; 3CD6 A; 1F1B B; 2HCK A; 4DQ2 A; 1RAG B; 2E3I A; 4KRT A; 4M4Z A; 1BIA A; 3JB9 I; 2RNA A; 1IRX A; 3UDC A; 2DJQ A; 2NUT B; 4OVA A; 3QDR B; 1CKB A; 4OB0 B; 2YLB A; 3JCM b; 1WQW A; 5CIU A; 1G8X A; 3REA B; 2EYQ A; 2WSF E; 1H92 A; 1ABQ A; 4J7I A; 2YUO A; 5GAM e; 2QTX A; 4HCB A; 4F7U A; 4KGX B; 1MUZ A; 1E6G A; 3VYG A; 3EG1 A; 4M7A G; 4ELZ C; 3CCS T; 1K73 C; 3C4S A; 1NEG A; 3TVT A; 2HBW A; 3JCM e; 3M57 A; 2K3X A; 3VUZ A; 1OQK A; 3VS4 A; 4RKU E; 1ZBJ A; 2Z0W A; 2DYB A; 2DL4 A; 3EG9 A; 1KC8 C; 1IO6 A; 4M7D G; 2JUF A; 5GJV B; 1E7O A; 5I22 A; 3H0I A; 2Y4X A; 1M30 A; 5GMK m; 2KR3 A; 2H3E B; 1VQ8 Q; 1YIJ A; 1X6B A; 5KYU A; 2L2P A; 2E12 A; 4IUU A; 5KE2 A; 2BE7 D; 2LNV A; 3AHU A; 3OMG A; 2HBP A; 4LN2 A; 3CCV A; 4DBR A; 4JDS A; 1ZHI A; 3O8V A; 4DBQ A; 1KIK A; 5KYX B; 1EIF A; 3RUX A; 2M51 A; 3CC7 Q; 2CKK A; 1NJI C; 1TTH B; 1E6H A; 3EGX B; 4J9B A; 5GAO l; 1N9S A; 3DB4 A; 2RJD A; 1ZLM A; 2DNU A; 3I35 A; 3GF5 A; 4MZP A; 1WA7 A; 2A0F B; 1FMV A; 4MDX A; 2IG0 A; 1BKB A; 3I55 T; 1OOT A; 4M7A A; 3A1P A; 2COW A; 3KXT A; 4C92 D; 3E9G A; 1K9A A; 5IHK A; 3SD4 A; 2DRK A; 3G4S T; 4M7D A; 2YLC A; 2LQW A; 1Q7Y C; 2GQI A; 1M2V A; 4M78 B; 1QWE A; 4XU0 A; 3OYJ A; 1QWF A; 4OMP A; 3M0R A; 2QQB A; 1N5Z A; 1KD1 U; 4RG8 A; 1AD5 A; 4JLG A; 2KRN A; 2PUO B; 3CCS A; 3M0U A; 4BUG A; 5HY6 A; 1X01 A; 5IT9 E; 3T9N A; 1G5V A; 4C8Q G; 3CCL Q; 2OX7 A; 3J80 E; 1MHN A; 3QYH B; 4QVZ A; 1YBY A; 4PJO E; 4J9I A; 4LDX A; 5A0L A; 1NG2 A; 1AWX A; 4HVV A; 4XAX B; 2DEQ A; 1FWZ A; 3R6N A; 1YIT T; 3QBY A; 2COY A; 1OI1 A; 4TVR A; 2VGN A; 3P8B B; 2HSP A; 3CEY A; 8ATC B; 1PC0 A; 4F14 A; 5KCH A; 1I4K 1; 2A08 A; 1ZUK A; 1VYU A; 2CP7 A; 3V7S A; 1BU1 A; 4FT4 A; 4E7J A; 1VOM A; 2M1H A; 1JRI A; 2PU9 B; 2QAZ A; 2NUZ A; 2P0Q A; 2HQE A; 4A4G A; 4JUV A; 3QWX X; 4PLI A; 3GLX A; 2JTF A; 2ZPF B; 4C5G A; 5AT1 B; 5L8R E; 9ATC B; 2GTJ A; 4LNP A; 1YJN T; 1HSQ A; 2VV5 A; 2FVU A; 2VKN A; 3I55 A; 3WXM B; 3JB9 H; 5KYY A; 3EG2 A; 1WX6 A; 4PK4 A; 1VQ4 T; 2X35 A; 3UPU A; 4A4H A; 1AT1 B; 2FZG B; 2V8K A; 3C0C A; 1LOJ A; 1ZUY A; 5IH2 A; 4C8Q A; 3DLL A; 3G4S A; 4HCK A; 1VQP T; 3L2R A; 2XG8 D; 2EQK A; 3CCJ T; 4CRI A; 3PTA A; 3OYD A; 2QYZ A; 4A4K A; 1QVF P; 4RTY A; 3G1J A; 3V7C A; 2RK1 A; 5IXB A; 3VYH B; 5CKE A; 5D6W A; 1BI2 A; 1QCN A; 4IUT A; 1UHF A; 4D8K A; 3LWI A; 4C0G A; 1NYF A; 1NPR A; 4PFO A; 3QZ9 B; 4FCY A; 2FHD A; 5GAN f; 1ABO A; 3OS0 A; 3RES A; 3M54 A; 3CCE Q; 2JN0 A; 3CMA Q; 2I2L A; 3SWN A; 1QVG P; 4K11 A; 2WAC A; 1GL5 A; 2J6O A; 4FT2 A; 1OPK A; 2DER A; 3OYC A; 3CCQ Q; 2XDB A; 2KXC A; 1YIT A; 5L23 A; 3VS5 A; 4XTX A; 2YUQ A; 4F16 A; 2BIV A; 2O88 A; 1H3Z A; 4FW2 A; 4IUR A; 4GY5 A; 4JRQ A; 1YHQ T; 1QLY A; 2YUP A; 2DMO A; 5GAO q; 4X9C A; 2XD0 A; 1Z9Z A; 1S1N A; 2KYB A; 3UA6 A; 1VQN Q; 4HVW A; 1VQK T; 2O31 A; 5IXF A; 2AZV A; 4EIK A; 1YWO A; 4OF1 A; 2CS7 A; 4FYV B; 3EHQ A; 2EQM A; 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