The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
67
|
structure length |
67
|
Chain Sequence |
GSMSTSELKKVVALYDYMPMNANDLQLRKGDEYFILEESNLPWWRARDKNGQEGYIPSNYVTEAEDS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain from Bruton's tyrosine kinase.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
BRUTON'S TYROSINE KINASE
|
| total genus |
5
|
| structure length |
67
|
| sequence length |
67
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1997-10-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1PRL C; 1NLO C; 2GGR A; 2K9G A; 1FMK A; 3EG2 A; 1UJY A; 1A0N B; 2O9V A; 3SHW A; 1ABQ A; 2D1X A; 1BU1 A; 2A36 A; 1G83 A; 3H0F A; 2LJ0 A; 2MCN A; 1UE9 A; 4CC2 A; 1W70 A; 1QKW A; 2IIM A; 4F14 A; 2A08 A; 1AOJ A; 3VS0 A; 1ABO A; 2ESW A; 3I5S A; 1QCF A; 3M0R A; 4IIM A; 1K0X A; 2YUO A; 5IHI A; 1G2B A; 2DRK A; 3FJ5 A; 2KEA A; 1YWP A; 2GQI A; 1QWE A; 1E7O A; 5IHN A; 2JS0 A; 2KE9 A; 2L3P A; 4IIO A; 1YN8 A; 3C0C A; 1W6X A; 4RTX A; 5FWC A; 3I9Q A; 1JU5 C; 4J9B A; 2DX1 A; 1X69 A; 2PZ1 A; 2KRS A; 5I11 A; 4AFS C; 1HJD A; 3UAT A; 2RQW A; 1UJ0 A; 1GRI A; 1Z9Q A; 1K9A A; 3EG3 A; 2D8J A; 3GBQ A; 1WFW A; 2LNH B; 2F2W A; 1WXB A; 2CSI A; 4J9F A; 1MV3 A; 1TUC A; 5IHK A; 1CSK A; 1OEB A; 3M0Q A; 4DEX A; 1AWJ A; 1X2Q A; 2CSQ A; 2EGA A; 2KYM A; 3H0H A; 2DF6 A; 2FPD A; 1JQQ A; 2LQW A; 2DBM A; 1U5S A; 2ECZ A; 2EGC A; 4OMP A; 1KSW A; 1AZG B; 2EW3 A; 3RNJ A; 3VS7 A; 2NWM A; 1JXO A; 3M0T A; 2CUB A; 1CKB A; 2KT8 A; 1X27 A; 2KT1 A; 5IXB A; 4CC7 A; 2DA9 A; 1AWO A; 2D8H A; 3TVT A; 1K1Z A; 2W0Z A; 1VYT A; 1Y57 A; 1AEY A; 2EKH A; 1HD3 A; 2VVK A; 3PVQ A; 5GJW B; 2V1R A; 2LCS A; 4Z88 A; 2G6F X; 2DBK A; 2F2X A; 3I35 A; 2LJ1 A; 3I5R A; 2DYB A; 1XOV A; 3VS1 A; 2CH4 A; 2AKK A; 2J6F A; 4LUD A; 1M3A A; 2RF0 A; 2SEM A; 3VS3 A; 1NYF A; 2MOX A; 2OJ2 A; 1RUW A; 3UA7 A; 2KXD A; 3O5Z A; 1OPK A; 3THK A; 4Y92 A; 4E6R A; 1EFN A; 2ROL A; 2B86 A; 2I0N A; 1BBZ A; 1NEB A; 2LP5 A; 2ABL A; 3R6N A; 1X43 A; 3PVL A; 5ECA A; 3M0U A; 1K0S A; 4HVV A; 1RI9 A; 1SSH A; 2ENM A; 5GJV B; 3SEM A; 4X1V A; 2BZY A; 3VS6 A; 1GCQ C; 4HXJ A; 4Z8A A; 2HCK A; 4HVW A; 2XMF A; 2LX7 A; 2YUQ A; 1M30 A; 2KXC A; 3H0I A; 2DRM A; 4WCI A; 1AWX A; 2O2O A; 2RQU A; 2YSQ A; 1YNZ A; 2HEQ A; 2EBP A; 3IQL A; 2KRM A; 2DNU A; 2KYB A; 2YDL A; 1WI7 A; 2EYY A; 2DMO A; 2RPN A; 1H92 A; 2ED0 A; 1PHT A; 4JJC A; 2VKN A; 4FSS A; 1UGV A; 1ZUU A; 2DL4 A; 2FPE A; 2JMC A; 2HBW A; 1N5Z A; 4JJB A; 1W1F A; 2MIO A; 3VS4 A; 2KBT A; 1TUD A; 2KRN A; 2KRO A; 2L2P A; 1NEG A; 1H8K A; 2X3W D; 3EHR A; 2GTO A; 1WYX A; 4F16 A; 4R0K A; 3A98 A; 4ESR A; 1AZE A; 1ZUK A; 1WLP B; 1YP5 A; 2RNA A; 3TSZ A; 3U23 A; 1S1N A; 2K3B A; 4OMQ A; 5IH2 A; 1NM7 A; 4J9D A; 1X2K A; 3M0P A; 4J9H A; 1M8M A; 1UEC A; 1T3L A; 2SRC A; 4RTZ A; 1GFC A; 1I07 A; 1BB9 A; 2LQN A; 3LH5 A; 4LUE A; 1ZUY A; 1E6H A; 4RTW A; 1GBR A; 2AKL A; 2GBQ A; 2GNC A; 4OMN A; 2C0T A; 3NHN A; 1IO6 A; 1VYU A; 4JZ3 A; 1KJW A; 1SEM A; 4AG2 C; 2FG0 A; 3TSW A; 2J7I A; 2K2M A; 1QLY A; 2OI3 A; 2DM1 A; 2YT6 A; 3REB B; 2DE0 X; 4GBQ A; 2LJ3 A; 2A37 A; 2P4R A; 3REA B; 2EYX A; 1AVZ C; 1OOT A; 1B07 A; 1NYG A; 4KRT A; 3VS2 A; 2VWF A; 4RUG A; 1HSQ A; 4CC3 A; 2PNI A; 2JT4 A; 1T0J A; 4J9E A; 4JZ4 A; 1UHF A; 3EHQ A; 3ZL7 C; 1PNJ A; 3QWY A; 3EG1 A; 4AFZ C; 2LZ6 B; 1PWT A; 3H41 A; 1ZSG A; 2CRE A; 1T0H A; 1CKA A; 5I22 A; 3VRY A; 2CH4 W; 4DEY A; 1KFZ A; 2DL7 A; 1WXT A; 4EIK A; 3EGU A; 1KIK A; 2CDT A; 4ZNX A; 4M4Z A; 2X3X D; 4J9C A; 3RBB B; 2DL5 A; 2CUD A; 5FW9 A; 2J6K A; 1E6G A; 2EYW A; 4LE9 A; 4JPB W; 4RTY A; 1Z9Z A; 3JV3 A; 1GCQ A; 2J6O A; 3KFV A; 4JJD A; 4LNP A; 2ROT A; 2FRY A; 2NUZ A; 4Z89 A; 2DJQ A; 1H3H A; 5FWB A; 2J05 A; 1QKX A; 2DLP A; 2HSP A; 4J9G A; 2QDL A; 2RQR A; 2PTK A; 2DL8 A; 1UHC A; 2JS2 A; 1T3S A; 1M27 C; 1J3T A; 3EG0 A; 3PE0 A; 2OAW A; 2JTE A; 5L23 A; 2RQT A; 2KGT A; 1YCS B; 1GCP A; 2LMJ A; 2RQV A; 2CT3 A; 2E5K A; 3NGP A; 2EYZ A; 2L0A A; 1I1J A; 4AFQ C; 2M0Y A; 2J06 A; 2DVJ A; 1X6G A; 4F17 A; 2BZ8 A; 1I0C A; 1ZBJ A; 1NG2 A; 1QWF A; 3ULR B; 2JM8 A; 2EGE A; 3NMZ C; 2C0I A; 1GFD A; 1NLP C; 4RTU A; 2AK5 A; 1MUZ A; 4AG1 C; 1PKS A; 3VRZ A; 4AFU C; 2K7A A; 2O9S A; 2CT4 A; 2FPF A; 1UFF A; 1UDL A; 1SRM A; 2M51 A; 2BTT A; 1GL5 A; 1UUE A; 4J9I A; 2C0O A; 1RLQ C; 1JEG A; 1YWO A; 4OMM A; 2A28 A; 2F2V A; 1WDX A; 2HDA A; 4HCK A; 2JMA A; 3UF4 A; 1VYV A; 1PRM C; 1SHF A; 1BK2 A; 2JXB A; 2K6D A; 2O31 A; 4LN2 A; 1SHG A; 2L3S A; 2JM9 A; 2RN8 A; 1SRL A; 1VA7 A; 2FEI A; 1OV3 A; 2EVR A; 1ZLM A; 2D0N A; 1UTI A; 2EPD A; 2AZS A; 1MV0 B; 2BZX A; 1WXU A; 1PKT A; 1LCK A; 1K4U S; 4OMO A; 4D8D A; 1U3O A; 1TG0 A; 1SPK A; 1ZX6 A; 4K11 A; 1M3B A; 5IXF A; 2KR3 A; 1WA7 A; 3CQT A; 2K79 A; 3UA6 A; 5EC7 A; 1UG1 A; 1WIE A; 4HVU A; 1Y0M A; 4GLM A; 1B3Q A; 2DIL A; 1U06 A; 2L3Q A; 4RTT A; 2YUN A; 1AWW A; 2FRW A; 4A63 B; 4CC4 B; 5HCK A; 1WX6 A; 2ED1 A; 2RMO A; 3QWX X; 2DL3 A; 2GTJ A; 1FYN A; 1K76 A; 1JXM A; 2KNB B; 3VS5 A; 1JO8 A; 4QT7 A; 2EQI A; 2O88 A; 2W10 A; 3NPF A; 2JW4 A; 2FO0 A; 1AD5 A; 4RTV A; 1GBQ A; 2AZV A; 2H8H A; 2V1Q A; 1X6B A; 4OML A; 1OPL A; 4D8K A; 1RLP C; 2YUP A; 1V1C A; 1ARK A; 4ORZ A; 1M3C A; 3M0S A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1FMK A; 5KYX A; 2V26 A; 3EG2 A; 3QKJ A; 3HRS A; 1UJY A; 5AYF A; 1K9M C; 1M1K U; 2NUP B; 3OBY A; 3RER A; 4A4K A; 4F7U G; 5KE2 A; 1BU1 A; 2DFU A; 2LJ0 A; 2MCN A; 3CCV Q; 1UE9 A; 4F7U E; 1W70 A; 5GMK j; 4HKE A; 4F14 A; 2A08 A; 4ZN3 A; 4ELY C; 1QCF A; 3E19 A; 4IIM A; 4PLL A; 3CCQ A; 2YUO A; 5LJ3 e; 2DEU A; 1G2B A; 5A2Q E; 2RI3 A; 4A54 A; 1LVK A; 3VYG A; 1K9M U; 2WSC E; 5FRN A; 3V8K A; 4J5Y A; 1Y96 A; 4QQ6 A; 3CCR Q; 1AHJ B; 4OB3 B; 1W6X A; 1JU5 C; 2DX1 A; 1X69 A; 1D1C A; 3L2W A; 2DPP B; 3LWI A; 4E7Z A; 3UAT A; 2QGF B; 5C0M A; 1HYO A; 1UJ0 A; 2RB6 A; 4F04 B; 1Z9Q A; 1VQ9 T; 3EFS A; 4IUP A; 1WXB A; 4J9F A; 2CZ0 B; 5IHK A; 1CSK A; 1OEB A; 4M75 G; 4DEX A; 3H0H A; 5GAM d; 4M7D A; 4E7J A; 4M75 E; 4MZP A; 1RL2 A; 2EQJ A; 1KSW A; 5CKB A; 4C92 F; 3X26 B; 2NWM A; 5LJ5 h; 3HP9 A; 4DBR A; 3HPW A; 1X27 A; 4FT4 A; 2D8H A; 3TVT A; 2PVD B; 4B6M A; 3CC2 A; 1MND A; 3PIO A; 2VVK A; 2X9H A; 1C1A A; 1KK7 A; 4OGC A; 1FMV A; 4IUU A; 3JB9 D; 2DYB A; 3CCL Q; 3CC4 A; 2PQW A; 1XTD A; 4N0A A; 3VS1 A; 3M58 A; 2PUO B; 3BDU A; 2E10 A; 2AKK A; 2JUF A; 2PUK B; 1PSE A; 2RF0 A; 3CCJ A; 1RUW A; 2VGM A; 2X4J A; 4BI8 B; 3SD4 A; 1G3T A; 3X28 B; 3FIF A; 4XU0 A; 3MEV A; 2E65 A; 1MNE A; 3M4Y A; 3R6N A; 5CKD A; 3CCV T; 3PVL A; 4N4G A; 4HVV A; 3TCJ A; 5LJ3 g; 2OTL Q; 2KVQ G; 3SEM A; 5LJ5 j; 4X1V A; 1VQ5 Q; 2JTM A; 1GCQ C; 4F7U F; 4Z8A A; 4J83 A; 3MP1 A; 2EKO A; 2E41 A; 2DET A; 3OS0 A; 4JS4 A; 3H0I A; 2DRM A; 1AWX A; 1YNZ A; 4C8Q C; 2EBP A; 1W2B A; 2OTJ Q; 1MMD A; 2K57 A; 1WI7 A; 2EYY A; 3P8H A; 3CCR T; 2ED0 A; 3OW2 S; 1ZUU A; 2JOY A; 2FPE A; 2FZC B; 1VQ6 Q; 4RCC A; 4JJB A; 1W1F A; 1TH7 A; 2MIO A; 3VS4 A; 4ZGE B; 3C4S A; 1TUD A; 2KRN A; 2KRO A; 2YRD A; 3I55 A; 1VQO Q; 1SKU B; 3CMA A; 1Q7Y U; 2M16 A; 1AZE A; 3OS2 A; 2YXY A; 2ZPB B; 1YP5 A; 1ZBX A; 3TSZ A; 3X20 B; 4R56 A; 2DTO A; 4M78 B; 3ZBD A; 1S1N A; 5IH2 A; 1Y07 A; 2LQK A; 1X2K A; 2EQK A; 4LDW A; 1MMA A; 4M7A A; 2HQH A; 4ZTF A; 3X25 B; 2LCC A; 3OYC A; 3EGX A; 1D0Y A; 1IGU A; 1ZUY A; 5GAN g; 2IVW A; 3RUX A; 4RMO A; 4M75 F; 2C0T A; 4M77 G; 1IO6 A; 1VYU A; 2O4X B; 4BE1 A; 1QLY A; 4M77 E; 2DM1 A; 4MMK A; 3QBY A; 2YT6 A; 2YRC A; 3MPU B; 5CQY A; 2GF7 A; 1KQS P; 3SWN A; 2LJ3 A; 2A37 A; 3RR6 A; 1VIE A; 5L8R E; 4XTW A; 3CBP A; 2DXT A; 1OQK A; 3VS2 A; 3QG1 A; 4AFZ C; 3CCL T; 1ZSG A; 2CRE A; 3GNF B; 1T0H A; 2EQU A; 2WAC A; 3EG9 B; 4E7S A; 4JRQ A; 3ME9 A; 1CKA A; 3ASK A; 1PC0 A; 1M1K R; 3OYG A; 1OUL A; 1QVF P; 4EIK A; 1YCY A; 3EGU A; 4ZNX A; 1KD1 R; 4M4Z A; 4FSX A; 3RES A; 2DL5 A; 1QVF A; 3HFO A; 4XTZ A; 2EYW A; 2QDY B; 1R0B G; 2XD0 A; 3C95 A; 4OMF B; 2OTL T; 2MK5 A; 4C92 C; 3JCM V; 2L8D A; 3OBW A; 1ZSZ C; 5FWB A; 2DLP A; 2J05 A; 2RQR A; 2MWP A; 2K3Y A; 5KYY A; 3I56 A; 2OTJ T; 2X4W A; 1J3T A; 3CME Q; 3OS5 A; 5GAM f; 2L5Q A; 3L2U A; 3OY9 A; 2LMJ A; 3GF5 A; 2A0F B; 3A8O B; 1VQO T; 1WHK A; 5KYU A; 2EYZ A; 3N5B B; 2QEX Q; 3CD6 Q; 5GMK m; 1UGR B; 4PLI A; 1NG2 A; 5GAO q; 3ULR B; 1SF9 A; 2YHT A; 3CCU Q; 3G6E Q; 1GFD A; 1WZO A; 4YTL A; 1VQN A; 1M2V B; 3VRZ A; 3DB4 A; 1KG1 A; 2K7A A; 2O9S A; 5I2M A; 4PL6 A; 5LJ5 d; 4A4E A; 2DXB A; 5D6Y A; 1ZHI A; 2DEQ A; 3UDC A; 5I2S A; 2F2V A; 1WDX A; 4M77 F; 2JMA A; 4M7D G; 4C8Q B; 3EFO B; 2K6D A; 3CEY A; 1M90 C; 2RN8 A; 4TVR A; 1OV3 A; 2EPD A; 2QXF A; 2AZS A; 3JB9 H; 8ATC B; 2JNG A; 1K4U S; 4M7D D; 3EH1 A; 4OMO A; 3UT1 A; 4D8D A; 1U3O A; 3ER0 A; 1QCO A; 1YIT A; 4LXC A; 5IXF A; 2KR3 A; 2XG8 D; 2R5A A; 5EC7 A; 4NS5 A; 2RJE A; 2DK3 A; 4HVU A; 2HD0 A; 1M90 U; 2DIL A; 3QDF A; 4X9D A; 1G8X A; 4DBQ A; 3E2U A; 5GAM h; 3JCM c; 2MAM A; 2XHC A; 4E7I A; 4M75 C; 2JN0 A; 4A63 B; 4PFZ A; 1WX6 A; 2FL7 A; 3QZ5 B; 2RMO A; 4RG8 A; 2DL3 A; 2FZK B; 3VUB A; 2GTJ A; 1MMG A; 3UWN A; 4AT1 B; 3CXC S; 4OB0 B; 1TOV A; 3VV0 A; 1N27 A; 4JLG A; 3ZEH A; 4JRP A; 2XDD A; 4GLK A; 2H8H A; 3CCM A; 1TXQ A; 4D8K A; 1RLP C; 1TS9 A; 1Q7Y R; 2F5K A; 1U1S A; 1D1B A; 1M3C A; 4DOW A; 2K9G A; 2ZPH B; 1G3S A; 2QQR A; 2EYQ A; 3AT1 B; 1VQ7 Q; 2QEX T; 1FMW A; 3CD6 T; 2H3J A; 1MGQ A; 1ABQ A; 1RAC B; 5GAO r; 4CC2 A; 3QJ6 A; 2HNI A; 3CCU T; 3G6E T; 4EMG A; 1AOJ A; 3EFR A; 5A0G A; 3QJY A; 3M0R A; 4QVC A; 3GNG A; 3DLM A; 3MKD A; 4PJO A; 3QUI A; 4HT8 A; 3VJP A; 3QDR B; 2DRK A; 3FJ5 A; 1WHJ A; 1K73 C; 4C92 B; 2KEA A; 4Y91 A; 3CCE Q; 1VQ4 Q; 1YWP A; 2XU8 A; 1E7O A; 5IHN A; 2YWW A; 5CQX A; 4M7A G; 1ZSZ B; 4IIO A; 1S72 Q; 4OP0 A; 1LPL A; 4RTX A; 5FWC A; 1B34 B; 3LX7 A; 4J9B A; 4J6Y A; 4M7A E; 2PZ1 A; 2KRS A; 2D9T A; 1M8V A; 3L1A A; 3TRE A; 2EWN A; 5GAO m; 3H6Z A; 1HJD A; 5IN1 A; 3M4G A; 4M7D F; 1W4S A; 2CS7 A; 1QVG P; 2DXU A; 3EG3 A; 1K73 U; 1UGS B; 2DYI A; 3GBQ A; 1WFW A; 2F2W A; 2CSI A; 3M55 A; 1MV3 A; 3OYD A; 2DJZ A; 4PK4 A; 3M0Q A; 1QVG A; 3CPF A; 2A3L A; 2EGA A; 3OS1 A; 4BUG A; 2FPD A; 1JQQ A; 8AT1 B; 2EAY A; 3A8H B; 2EGC A; 1IRX A; 4WTO B; 2EW3 A; 3VS7 A; 2RJC A; 3QSU A; 1JRI A; 4N4I A; 2KT8 A; 3M9Q A; 2KT1 A; 3GLX A; 5GAM e; 5GMK h; 2DA9 A; 3HHT B; 4F7U B; 3UPU A; 2H3E B; 1RAI B; 3F70 A; 4MDW A; 3OA6 A; 5CKH A; 4M77 C; 3G1J A; 2G6F X; 2DBK A; 3I35 A; 2IPO B; 1WJS A; 1VQ8 T; 4E2F B; 5M9O A; 5GAN h; 2CH4 A; 3PMI A; 2CZ1 B; 1Q82 C; 4B9W A; 4LUD A; 5GAN 7; 4M78 A; 3RDV A; 3JCM d; 4LD6 A; 3M53 A; 2OJ2 A; 3UA7 A; 5LJ5 f; 2KXD A; 1F1B B; 1I5O B; 1NE8 A; 2GCX A; 3JCM W; 1PD1 A; 1VQ7 T; 3THK A; 4Y92 A; 3S3O A; 1EFN A; 2ROL A; 2X51 A; 1RI0 A; 3KXT A; 3FRN A; 3QO3 A; 1X43 A; 5ECA A; 4ZTJ A; 4BDY A; 4E7K A; 3CC7 Q; 1RI9 A; 1SSH A; 1YBY A; 1TSF A; 1BYM A; 1Q82 U; 4HXJ A; 4HT9 A; 4QVD A; 2HCK A; 4HVW A; 3CC2 Q; 3OW2 P; 2DIQ A; 1OX9 A; 2KXC A; 4FYY B; 4M75 B; 5CVI A; 2RQU A; 1BIB A; 2CP2 A; 2HEQ A; 3CCE T; 1VQ4 T; 3IQL A; 2KRM A; 2DNU A; 2D0Q B; 4JJN K; 1OZ2 A; 1S72 T; 3NTK A; 2DER A; 4QQD A; 1PHT A; 1YHQ Q; 4BD3 A; 3P8B B; 4ZGD B; 3EG9 A; 1VQ9 A; 5GAN j; 1NPP A; 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