The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MEAIAKVDFKATADDELSFKRGDILKVLNEESDQNWYKAELNGKDGFIPKNYIEMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Complex (adaptor protein/peptide)
|
| molecule keywords |
GRB2
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| publication title |
Molecular and cellular analysis of Grb2 SH3 domain mutants: interaction with Sos and dynamin.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
10
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-11-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2YT6 A; 4DEY A; 2FPD A; 4HVW A; 2L2P A; 3EGU A; 3TSW A; 1QKW A; 4CC4 B; 2C0T A; 2FO0 A; 1UJ0 A; 3VS3 A; 2BZX A; 2PTK A; 3THK A; 1ZSG A; 3M0S A; 3NPF A; 2ECZ A; 4OMQ A; 4J9E A; 2JM9 A; 2CUB A; 2X3W D; 4LN2 A; 2V1R A; 2L0A A; 2ED0 A; 4QT7 A; 1I1J A; 2MIO A; 2KBT A; 1W6X A; 2KT1 A; 2VVK A; 2HCK A; 2J06 A; 1JEG A; 1E6G A; 2SRC A; 3EHQ A; 2DX1 A; 1WX6 A; 1VYU A; 1W70 A; 1AD5 A; 1M27 C; 2AK5 A; 1UHF A; 2CT4 A; 2KRO A; 2DRK A; 4A63 B; 2DL8 A; 4RUG A; 4CC3 A; 5L23 A; 1VYV A; 1QCF A; 1S1N A; 1M3C A; 4X1V A; 2CSQ A; 3EG0 A; 1VYT A; 1B07 A; 1I0C A; 1ABO A; 2LX7 A; 2FEI A; 1H8K A; 4ESR A; 1K0S A; 2C0O A; 1WDX A; 1GCQ A; 1IO6 A; 4J9I A; 2KXC A; 3VS5 A; 3NGP A; 1U5S A; 1GRI A; 2QDL A; 3EHR A; 2DRM A; 2JM8 A; 2MCN A; 3ULR B; 1LCK A; 2D1X A; 3H0I A; 1WXB A; 2KNB B; 1ZX6 A; 2YSQ A; 4Z8A A; 3PVQ A; 1UEC A; 2CH4 W; 1GCQ C; 1Y0M A; 1PRM C; 1WIE A; 3I5S A; 1PRL C; 2F2X A; 1OEB A; 4JJB A; 3QWY A; 2A28 A; 2RQU A; 4ZNX A; 2LJ3 A; 2GNC A; 2O88 A; 2I0N A; 4J9D A; 1GFC A; 2CT3 A; 2D0N A; 1CSK A; 4GLM A; 1H3H A; 1H92 A; 1RLQ C; 1GL5 A; 3VS2 A; 2GQI A; 2EGE A; 2OJ2 A; 3UA7 A; 4HCK A; 1Z9Z A; 1X43 A; 2LZ6 B; 1OPK A; 2M0Y A; 2W0Z A; 3M0P A; 2J6O A; 5IHN A; 2ENM A; 2RQV A; 3UA6 A; 1UUE A; 2LCS A; 1X69 A; 2DL5 A; 4LE9 A; 5I22 A; 2AZV A; 1ZBJ A; 2DL4 A; 4LUE A; 2JW4 A; 2RNA A; 1WA7 A; 2A36 A; 5IXB A; 1NLP C; 4OMN A; 1SPK A; 3LH5 A; 4RTT A; 3R6N A; 1XOV A; 3FJ5 A; 3RNJ A; 4OML A; 2DBK A; 1UFF A; 2JMC A; 2K6D A; 4AG2 C; 2D8J A; 1NLO C; 1AVZ C; 2ED1 A; 2XMF A; 1ZUK A; 3O5Z A; 2A37 A; 1SHG A; 1AWW A; 1MV3 A; 1OPL A; 3UAT A; 1T3S A; 2FG0 A; 3EG1 A; 1V1C A; 2DL3 A; 4Z88 A; 1YN8 A; 1K0X A; 2B86 A; 1YP5 A; 2JTE A; 3VS6 A; 3TVT A; 1SHF A; 5IXF A; 1M3B A; 1OOT A; 4HXJ A; 3CQT A; 3SHW A; 1NEB A; 4D8K A; 1NEG A; 4AFQ C; 2O9V A; 4RTZ A; 1U06 A; 1W1F A; 2DJQ A; 2IIM A; 4E6R A; 1NYG A; 2BTT A; 2GTO A; 2YUP A; 5I11 A; 4LUD A; 4LNP A; 1U3O A; 2YUQ A; 2EYW A; 1N5Z A; 4J9F A; 2DM1 A; 1G83 A; 2DL7 A; 4RTU A; 1AWX A; 3VRY A; 1FYN A; 2CRE A; 2HDA A; 1SEM A; 1JO8 A; 2W10 A; 3M0U A; 5GJW B; 4J9B A; 1SRL A; 2RPN A; 2K2M A; 3VS1 A; 1WI7 A; 3PVL A; 2AKL A; 2GGR A; 2RF0 A; 2LMJ A; 1CKB A; 1BK2 A; 4IIM A; 2ABL A; 1UTI A; 2HBW A; 4RTX A; 3REB B; 3EG3 A; 1BU1 A; 2BZ8 A; 2JT4 A; 4F16 A; 1MUZ A; 4AG1 C; 1AZG B; 2V1Q A; 1NYF A; 1WLP B; 2DE0 X; 2FRW A; 2RQW A; 4R0K A; 2J6K A; 2EW3 A; 1MV0 B; 2VKN A; 2DLP A; 2K3B A; 1YWP A; 5IHI A; 1AOJ A; 3UF4 A; 2F2V A; 1JXO A; 2CH4 A; 5IHK A; 1HJD A; 2KXD A; 2K9G A; 2EKH A; 2DVJ A; 2CSI A; 4KRT A; 1X2K A; 4JJC A; 4RTW A; 3IQL A; 2C0I A; 1QKX A; 1ARK A; 3PE0 A; 3I5R A; 2JS2 A; 1GCP A; 2L3P A; 4FSS A; 2DIL A; 1M3A A; 4DEX A; 3JV3 A; 1K4U S; 3VS7 A; 2DBM A; 2EPD A; 1UGV A; 2ESW A; 1UHC A; 2DMO A; 1TG0 A; 1UDL A; 2NWM A; 1ZUU A; 5FWC A; 2YUN A; 4Y92 A; 2VWF A; 2AKK A; 2EQI A; 4OMP A; 1BB9 A; 2G6F X; 2KRN A; 2EGC A; 3A98 A; 2RMO A; 2EVR A; 1GFD A; 1JU5 C; 1PNJ A; 2P4R A; 2AZS A; 2KRM A; 2EBP A; 2LJ0 A; 1NM7 A; 1OV3 A; 3SEM A; 5ECA A; 2RQT A; 1YNZ A; 1WFW A; 2J6F A; 1M8M A; 3H0F A; 2DYB A; 2YDL A; 3M0T A; 2MOX A; 2CUD A; 2ROL A; 2JXB A; 4OMO A; 1KJW A; 2NUZ A; 4J9C A; 2H8H A; 2JS0 A; 1E6H A; 4WCI A; 2OAW A; 3RBB B; 1WXT A; 1UE9 A; 4Z89 A; 2L3S A; 1I07 A; 2CDT A; 4RTY A; 1A0N B; 2L3Q A; 1X6B A; 2RN8 A; 1T0J A; 2FRY A; 3EG2 A; 1M30 A; 1K1Z A; 5HCK A; 1E7O A; 1ZUY A; 2DF6 A; 3QWX X; 3NHN A; 2FPE A; 2J7I A; 2J05 A; 1AZE A; 2GBQ A; 4J9H A; 1JQQ A; 1Z9Q A; 2KYB A; 1K9A A; 1TUC A; 3NMZ C; 1RUW A; 4AFU C; 5IH2 A; 3U23 A; 2JMA A; 1WYX A; 1YCS B; 1CKA A; 3M0Q A; 2DNU A; 4K11 A; 2EYZ A; 4J9G A; 1JXM A; 2KYM A; 4F14 A; 5GJV B; 1QWF A; 1RI9 A; 1QWE A; 2O2O A; 2LQN A; 3I35 A; 1ABQ A; 1KSW A; 5FWB A; 4JPB W; 4HVU A; 1B3Q A; 4F17 A; 1KIK A; 4AFZ C; 1FMK A; 1X2Q A; 2KT8 A; 2KR3 A; 3H0H A; 1GBQ A; 2GTJ A; 4M4Z A; 1PKS A; 3C0C A; 3VS4 A; 4CC2 A; 2PNI A; 2X3X D; 2D8H A; 4RTV A; 3M0R A; 4HVV A; 4JJD A; 2M51 A; 1HD3 A; 4CC7 A; 3VS0 A; 3KFV A; 1AEY A; 4JZ3 A; 2A08 A; 2KGT A; 1AWO A; 1UJY A; 1X6G A; 2KEA A; 5EC7 A; 1SRM A; 2DA9 A; 1G2B A; 2KRS A; 1HSQ A; 2K7A A; 1KFZ A; 2BZY A; 2E5K A; 2LP5 A; 3ZL7 C; 1PKT A; 3REA B; 3H41 A; 3I9Q A; 4GBQ A; 1K76 A; 5FW9 A; 1J3T A; 1T3L A; 2RQR A; 2YUO A; 2K79 A; 1SSH A; 1BBZ A; 2SEM A; 1VA7 A; 2LQW A; 1YWO A; 3GBQ A; 4AFS C; 1UG1 A; 4EIK A; 1EFN A; 4JZ4 A; 1PHT A; 4D8D A; 2LNH B; 1QLY A; 1T0H A; 2FPF A; 1X27 A; 1AWJ A; 1ZLM A; 4IIO A; 1NG2 A; 3VRZ A; 4ORZ A; 3TSZ A; 2KE9 A; 2LJ1 A; 4OMM A; 2ROT A; 2EYY A; 2O9S A; 1Y57 A; 2F2W A; 1PWT A; 1WXU A; 1RLP C; 2EGA A; 1TUD A; 1GBR A; 2HEQ A; 2EYX A; 2OI3 A; 2O31 A; 2HSP A; 2PZ1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4M7D F; 2RHX A; 1Q7Y U; 4LD9 K; 5GMK l; 3RIR A; 3VU3 C; 2NYS A; 2FO0 A; 1UJ0 A; 2QGG A; 3OW2 A; 2K57 A; 4M77 B; 1YIT A; 4KH1 B; 5CIU A; 4J9E A; 1C1A A; 2EQM A; 1KC8 R; 2VXF A; 4J6X A; 5GAN 2; 3WXM B; 2J06 A; 2R57 A; 1UGS B; 1QVG P; 2DX1 A; 2LC4 A; 1AD5 A; 1XTD A; 2K2V A; 1UHF A; 2EKO A; 4RUG A; 3OMC A; 4N4G A; 4M7D G; 2QA4 Q; 1QCF A; 1PD0 A; 3HRT A; 4MZM A; 2JUF A; 1ABO A; 1N9R A; 2C0O A; 4M75 F; 2KXC A; 3NGP A; 2QDL A; 3QZ5 B; 2CP5 A; 4JRI A; 4Y28 E; 1VQL T; 3PNW C; 2HSE B; 2DJZ A; 3BE3 A; 3ZBD A; 3CCL Q; 5CKE A; 1ZHI A; 3OYJ A; 4Z8A A; 1UEC A; 3FDR A; 1N27 A; 1GCQ C; 5LJ3 j; 3L2V A; 3FJP A; 3EGX B; 3CXC S; 2XG8 D; 1VQO Q; 4YTL A; 3CCQ A; 2PVD B; 3GIB A; 4ZNX A; 2MWO A; 3OBW A; 1VQ5 T; 1KD1 U; 3EFR A; 2DTI A; 4C8Q A; 4J9D A; 3MET A; 1YFN A; 2D0N A; 3OW2 S; 4LDY A; 1H3H A; 2JVV A; 4ANJ A; 4M75 G; 4L59 A; 4WTO B; 5CR2 A; 3UA7 A; 4HCK A; 4QVZ A; 4J6W A; 5C0M A; 2LZ6 B; 3AHU A; 1OPK A; 3J7A F; 2QI2 A; 1LOJ A; 3M0P A; 3BY7 A; 3A8G B; 3H9N A; 2ENM A; 4KUL A; 2RQV A; 2RI5 A; 2L5Q A; 4M77 F; 3O8V A; 1RAF B; 1PSF A; 3NTI A; 1KQ2 A; 5I22 A; 2OTJ T; 1VQ4 T; 4LUE A; 2A0F B; 2JW4 A; 3LGF A; 5KYW B; 1NLP C; 4J6Y A; 1SPK A; 2LDM A; 2E64 A; 2IPO B; 1UEB A; 4M75 D; 3R6N A; 5GAN 8; 4O5V A; 1UFF A; 3FRN A; 1RAI B; 5HKC A; 4CI0 C; 1W2B A; 3CD6 Q; 2JTF A; 3M4Y A; 1M90 C; 3G71 Q; 2C06 A; 1V1C A; 1Q86 R; 3SFM A; 2B86 A; 1YP5 A; 5DLO A; 3VYG A; 3BDL A; 1SHF A; 3LWH A; 1OOT A; 2DIQ A; 5I21 A; 1YJW T; 4DBQ A; 5GAN 3; 4PFO A; 5FU7 C; 4M77 G; 4C92 E; 2IIM A; 5DLQ E; 4EMK B; 1NYG A; 1WHL A; 5I11 A; 2LT4 A; 1D3B B; 1N5Z A; 4PL6 A; 2DM1 A; 4QQG A; 1U1T A; 4F7U F; 4RTU A; 4J7F A; 3VRY A; 1X75 C; 2FVU A; 1RAA B; 1FYN A; 4E7L A; 3M0U A; 1YBY A; 2K2M A; 2KQW A; 1WI7 A; 2RHU A; 1IB8 A; 1VQ9 T; 3RER A; 4XTX A; 3PVL A; 4Q5W A; 4ZGJ B; 1H3Z A; 4WF2 A; 2ZPG B; 3QYH B; 1BIB A; 2BIV A; 2MYS A; 1MMN A; 4OGC A; 1YJ9 Q; 2WSF E; 5KYU B; 3CCV Q; 4MML A; 1VQ6 T; 2QEX Q; 3QO3 A; 2NUT A; 3MP6 A; 3P8B B; 1RAH B; 1OZ2 A; 4F04 B; 4F16 A; 1NPR A; 2JT4 A; 1MUZ A; 1OX9 A; 3UPU A; 1BCO A; 1WLP B; 2DE0 X; 2E65 A; 2M9U A; 2EW3 A; 2YHT A; 1MV0 B; 3OYE A; 3I55 Q; 3E1S A; 3PMI A; 4F7U G; 1KQ1 A; 3MP1 A; 3OYM A; 5CVI A; 3UF4 A; 2F2V A; 2DD4 A; 5DM7 R; 2P0P A; 5GAO m; 3VUB A; 2AIR B; 4C0F A; 2CSI A; 4JJC A; 1I81 A; 3Q1J A; 1NPP A; 2DBM A; 4J7I A; 1UGV A; 2ESW A; 5KCH A; 1YIJ T; 4JJN K; 1TG0 A; 1MND A; 1ZUU A; 3N5B B; 1RAE B; 3QJ6 A; 1EZZ B; 2FB7 A; 4OMP A; 2RB6 A; 5LJ3 d; 4PJO C; 4BUG A; 1JU5 C; 1Y96 B; 2QDY B; 1NM7 A; 5LJ5 f; 3A8M B; 5ECA A; 2HNI A; 2RQT A; 1YNZ A; 3MJX A; 2RI2 A; 3CME T; 2IVW A; 4M7A F; 4JS5 A; 4OMF B; 3DLL A; 1NJI C; 2ATC B; 4F7U E; 2IG0 A; 5KYN A; 5A0L A; 4OMO A; 1M9S A; 2JS0 A; 1E6H A; 3EG9 B; 4N0A C; 1VQ7 A; 3CCM A; 4PFZ A; 2L3S A; 2DXC A; 2CDT A; 4RKU E; 4RTY A; 1D0X A; 3OS5 A; 1X6B A; 3RKW A; 3V7C A; 3JCM f; 3LH0 A; 2FRY A; 5HK3 A; 2QA4 T; 4M7D A; 1MMG A; 2K5I A; 1VQM T; 1M30 A; 2AT1 B; 3GLX A; 2DF6 A; 4J83 A; 1M2V B; 1NZ9 A; 2VB6 A; 2J7I A; 1QVF S; 1AZE A; 1BI2 A; 2G3R A; 1JQQ A; 1Z9Q A; 4EMK C; 1K9A A; 4JS4 A; 3EFS A; 1Y07 A; 4M7A G; 2MPX C; 3UDC A; 2XKO C; 4CRI A; 4JLG A; 2EFI A; 4KT0 E; 4XAX B; 3QSU A; 3PIO A; 4K11 A; 1TH7 A; 4XTW A; 2KYM A; 2F1L A; 1RI9 A; 1TXQ A; 1K73 C; 4OGE A; 3CCL T; 3MP8 A; 3I35 A; 4JPB W; 1H64 1; 2KI7 A; 4HVU A; 2ZPF B; 1B3Q A; 4GLK A; 2FZC B; 3GPL A; 1KIK A; 1QCN A; 1VIF A; 4AFZ C; 5D7U A; 3OYH A; 4A54 A; 3H0H A; 1MGQ A; 3JB9 F; 3E2U A; 2HQX A; 4M7A D; 3J81 E; 3PT9 A; 2LNV A; 3OYD A; 4ZTJ A; 3G6E T; 1S72 Q; 1VQP A; 3CCE Q; 4OB1 B; 4HVV A; 3EAE A; 4M75 A; 5GAO l; 3VS0 A; 3KFV A; 3EH1 A; 5LJ5 g; 5GAN 7; 5GAO p; 2DVE A; 2ZPB B; 1X6G A; 4M7A E; 2LX9 A; 1SRM A; 2K7A A; 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5J3B A; 2RH2 A; 2ZGW A; 4QQ6 A; 2E6Z A; 3HFO A; 2DRM A; 3HHT B; 2JM8 A; 2D1X A; 4P5N A; 3EFO A; 3E9F A; 2CH4 W; 2XD0 A; 1YIT T; 4EDU A; 2OAU A; 1WIE A; 1VQ6 Q; 1PRL C; 5D6W A; 1JJ2 S; 1OEB A; 3CCU A; 2LJ3 A; 3MEU A; 2DEU A; 1VQN A; 2XID A; 4GLM A; 1H92 A; 2H3E B; 1GL5 A; 3VS2 A; 2GQI A; 3RR6 A; 3CCR A; 3GNG A; 1Z9Z A; 4E7J A; 1X43 A; 2DZ9 A; 3M56 A; 2QAZ A; 2W0Z A; 3EGD B; 1SF9 A; 2PQW A; 5KYW A; 2NUP B; 4OB2 B; 3RMQ A; 1MNE A; 1ZA2 B; 3UA6 A; 1UUE A; 2LCS A; 1X69 A; 4FCY A; 4B9W A; 2WAC A; 2LCL A; 2F69 A; 1ZBJ A; 1M8V A; 5DY9 A; 2KSS A; 1RAG B; 1QQJ A; 2LTO A; 1WA7 A; 2PU9 B; 1KC8 C; 4OMN A; 2X35 A; 1XOV A; 3FJ5 A; 3RNJ A; 1I5L A; 4AG2 C; 2D8J A; 4DBH A; 2KDS A; 5LJ3 g; 2LVM A; 1Q82 R; 1NLO C; 2ED1 A; 4JDS A; 2CKK A; 1ZUK A; 2LT1 A; 4M7A A; 1MMD A; 2FZG B; 5J39 A; 3CME Q; 3X28 B; 3S3N A; 1MV3 A; 1OPL A; 1ZSZ A; 3G1J A; 3E19 A; 1X01 A; 4EMG A; 5FU7 B; 6AT1 B; 5IXF A; 1PC0 A; 4MDW A; 3X26 B; 1D3B A; 1NEB A; 1TUG B; 4D8K A; 3I56 A; 2O9V A; 4RTZ A; 1U06 A; 1KQS A; 1W1F A; 1QVP A; 2DJQ A; 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