The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
AEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural basis for the specific interaction of lysine-containing proline-rich peptides with the N-terminal SH3 domain of c-Crk.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Complex (oncogene protein/peptide)
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| source organism |
Mus musculus
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| molecule keywords |
C-CRK N-TERMINAL SH3 DOMAIN
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| total genus |
9
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1995-01-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2L2P A; 1EFN A; 1WA7 A; 4OMN A; 2RQR A; 1ZX6 A; 1PKS A; 2DRM A; 3QWX X; 1NYG A; 2BZ8 A; 4X1V A; 2AKK A; 2RQT A; 1BK2 A; 2KXC A; 1W1F A; 1W6X A; 2K3B A; 4HXJ A; 1UE9 A; 4Z89 A; 2KNB B; 3UAT A; 1JXO A; 1VYT A; 2JTE A; 2VVK A; 4D8K A; 2GQI A; 2ROT A; 2CH4 A; 2OI3 A; 1K1Z A; 1PKT A; 2O88 A; 1GBR A; 1ABO A; 1QWE A; 1ZUU A; 1WXB A; 2DX1 A; 2MOX A; 1I0C A; 2DLP A; 1B3Q A; 4J9D A; 4GBQ A; 1X2K A; 5L23 A; 2RMO A; 4OMM A; 1FYN A; 4JJB A; 2DL4 A; 2E5K A; 1WLP B; 1BU1 A; 2ED0 A; 4JZ3 A; 2RQU A; 4JJD A; 2YUQ A; 3FJ5 A; 4LUD A; 3TVT A; 1A0N B; 1CKA A; 1GCP A; 2L0A A; 3O5Z A; 2RQW A; 2V1Q A; 2HDA A; 2LQW A; 1U3O A; 1PNJ A; 5ECA A; 1CKB A; 2DL5 A; 2EYW A; 3H0H A; 1S1N A; 1YCS B; 3EG0 A; 1VA7 A; 2FPF A; 4D8D A; 3KFV A; 2YT6 A; 1NYF A; 2VWF A; 1U06 A; 4RTY A; 3VS4 A; 2DE0 X; 1KJW A; 2PZ1 A; 2JT4 A; 4OMO A; 2DMO A; 1XOV A; 1M30 A; 1Z9Z A; 2X3W D; 1KIK A; 1M3B A; 2DBK A; 2CT4 A; 2KT8 A; 3LH5 A; 4KRT A; 1GL5 A; 4AG1 C; 2OJ2 A; 1SRM A; 4GLM A; 4CC2 A; 2DVJ A; 2LCS A; 2J06 A; 2PTK A; 2HSP A; 3UA7 A; 2DF6 A; 4CC4 B; 1GBQ A; 2EPD A; 2GNC A; 2KRO A; 3VS7 A; 2J6F A; 2J7I A; 1PHT A; 1Z9Q A; 3TSZ A; 1UGV A; 1QWF A; 1ARK A; 2SEM A; 1UJ0 A; 5GJW B; 2JXB A; 2DL7 A; 3RNJ A; 2KYB A; 4ZNX A; 1T0J A; 2D8J A; 1JQQ A; 3NMZ C; 3QWY A; 4HVW A; 4RTU A; 5FWC A; 1M3A A; 2C0O A; 1UHC A; 3THK A; 1JU5 C; 4QT7 A; 2VKN A; 3ULR B; 3M0P A; 1VYV A; 2EYX A; 2YDL A; 2MCN A; 2MIO A; 2YSQ A; 2RN8 A; 4IIM A; 1OEB A; 3VRY A; 1VYU A; 2DNU A; 4HVV A; 2EQI A; 3TSW A; 3VS0 A; 4DEX A; 1ZUY A; 1UTI A; 1J3T A; 1Y57 A; 1LCK A; 3REB B; 1W70 A; 1K4U S; 2EVR A; 1NEG A; 2AKL A; 3EGU A; 4RUG A; 3VRZ A; 3PE0 A; 2AK5 A; 4HCK A; 5FW9 A; 2C0T A; 3NGP A; 3GBQ A; 1UDL A; 4LE9 A; 3VS5 A; 3RBB B; 3M0R A; 4RTV A; 3VS6 A; 2K7A A; 1AVZ C; 4Z88 A; 2CSQ A; 2RF0 A; 4J9C A; 2PNI A; 1UUE A; 2AZV A; 1WIE A; 4DEY A; 1X6B A; 1M3C A; 2ESW A; 2ENM A; 2EW3 A; 1H92 A; 4IIO A; 1T3L A; 2HEQ A; 2KRN A; 2FRW A; 3M0U A; 1SEM A; 1X2Q A; 2GGR A; 2FPE A; 2YUO A; 3U23 A; 2JS2 A; 2KYM A; 2O9V A; 1KSW A; 2OAW A; 1AOJ A; 5IXF A; 2DA9 A; 4WCI A; 2RNA A; 2H8H A; 1JO8 A; 2CH4 W; 1ZBJ A; 2RPN A; 1WXU A; 2EYZ A; 1MV0 B; 1TUC A; 2JMA A; 2K9G A; 1JXM A; 4RTZ A; 5IXB A; 4AG2 C; 1SRL A; 2LP5 A; 3H0F A; 3SEM A; 2DIL A; 2A36 A; 4OML A; 2C0I A; 1AWW A; 2CDT A; 1T0H A; 4JJC A; 2KGT A; 1NEB A; 1MV3 A; 5I22 A; 5IH2 A; 1X6G A; 1WXT A; 3VS1 A; 4LUE A; 2EGC A; 3I5R A; 3I5S A; 1WYX A; 1YNZ A; 2I0N A; 1WX6 A; 1KFZ A; 1M8M A; 2ABL A; 2O9S A; 1U5S A; 2EYY A; 2CSI A; 2BZY A; 4Y92 A; 3SHW A; 2A08 A; 1K0S A; 1X43 A; 4ESR A; 4E6R A; 1PRM C; 2F2X A; 2F2W A; 1RLQ C; 1X27 A; 2YUN A; 1G83 A; 4Z8A A; 3R6N A; 2JS0 A; 1E6G A; 1GFC A; 3NHN A; 1M27 C; 1ZLM A; 4M4Z A; 1WI7 A; 2BTT A; 2LJ0 A; 1ZUK A; 2FRY A; 4EIK A; 2AZS A; 3EHQ A; 1RLP C; 2LZ6 B; 1K9A A; 1GCQ C; 1G2B A; 1H3H A; 1K0X A; 1UJY A; 1UG1 A; 1E6H A; 1FMK A; 3H41 A; 2K6D A; 4OMP A; 2LMJ A; 2ED1 A; 2RQV A; 1YWO A; 2M0Y A; 2D1X A; 1UHF A; 1AWJ A; 2EKH A; 1NLO C; 2GBQ A; 1K76 A; 3H0I A; 4JPB W; 2DL3 A; 4HVU A; 3EG2 A; 2B86 A; 1HJD A; 1UFF A; 5FWB A; 1IO6 A; 2A28 A; 4RTW A; 2D8H A; 4F14 A; 2QDL A; 2HCK A; 1I07 A; 2KRS A; 1WDX A; 2HBW A; 2DBM A; 1AD5 A; 1QLY A; 4RTT A; 1QKX A; 3IQL A; 2BZX A; 4FSS A; 2L3S A; 1ABQ A; 1WFW A; 2DYB A; 1HD3 A; 1NM7 A; 2J6K A; 1AWX A; 1SSH A; 3VS2 A; 2LJ1 A; 1Y0M A; 2X3X D; 1H8K A; 1ZSG A; 2FPD A; 1TUD A; 1QCF A; 4J9I A; 4LNP A; 1N5Z A; 2K79 A; 3A98 A; 4JZ4 A; 5GJV B; 2F2V A; 3EG1 A; 5IHN A; 4AFS C; 3CQT A; 4ORZ A; 2V1R A; 3I35 A; 5EC7 A; 4K11 A; 1GFD A; 2JW4 A; 1BB9 A; 2O2O A; 3C0C A; 1AZE A; 3EHR A; 2KXD A; 2CT3 A; 3ZL7 C; 1YP5 A; 1AWO A; 2NWM A; 2ROL A; 1GCQ A; 2KEA A; 2GTJ A; 2XMF A; 2W0Z A; 1RUW A; 1E7O A; 1I1J A; 1YWP A; 3PVQ A; 2L3P A; 2CUD A; 2DRK A; 2FO0 A; 3NPF A; 2KBT A; 4AFZ C; 3M0T A; 4RTX A; 2M51 A; 4J9E A; 1GRI A; 4J9B A; 2LNH B; 1RI9 A; 1X69 A; 2SRC A; 2LX7 A; 1UEC A; 4J9G A; 1HSQ A; 2KRM A; 4AFU C; 3I9Q A; 1T3S A; 4R0K A; 1BBZ A; 2EBP A; 2EGE A; 1OOT A; 3M0S A; 2EGA A; 1AZG B; 5IHI A; 2K2M A; 5I11 A; 4A63 B; 1SPK A; 1B07 A; 1CSK A; 2YUP A; 2LJ3 A; 2KR3 A; 1OV3 A; 1OPK A; 4CC3 A; 2FG0 A; 4F16 A; 2JM8 A; 2DJQ A; 3REA B; 5IHK A; 1PRL C; 1NLP C; 2FEI A; 1JEG A; 2L3Q A; 2CRE A; 3M0Q A; 4OMQ A; 1SHF A; 2P4R A; 1YN8 A; 2NUZ A; 3UA6 A; 2CUB A; 1OPL A; 1V1C A; 4J9H A; 4J9F A; 2KT1 A; 2D0N A; 4F17 A; 3VS3 A; 3EG3 A; 2A37 A; 2DL8 A; 2DM1 A; 5HCK A; 4CC7 A; 2KE9 A; 2W10 A; 1PWT A; 1TG0 A; 2LQN A; 4AFQ C; 3UF4 A; 2IIM A; 2O31 A; 2ECZ A; 2GTO A; 2J05 A; 4LN2 A; 1NG2 A; 2JMC A; 1AEY A; 1QKW A; 2J6O A; 3PVL A; 2G6F X; 2JM9 A; 1MUZ A; 3JV3 A; 1SHG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1WQ7 A; 4KBM B; 2L2P A; 1EFN A; 1UGQ B; 2OX7 A; 2XIC A; 3TEE A; 5L8R E; 1VQP A; 1P92 A; 2RQR A; 1ZX6 A; 4DA4 A; 1PKS A; 3QWX X; 1NYG A; 4X1V A; 2AKK A; 3UDC A; 2X51 A; 2QA4 Q; 4RG2 A; 3QHS A; 1YIJ T; 2F5T X; 2K57 A; 1OYX A; 2K3B A; 4Z89 A; 3A5Z B; 3QZ9 B; 1VYT A; 1FMW A; 1EZZ B; 2GQI A; 5AYF A; 1K1Z A; 2O88 A; 4C5H A; 1GBR A; 1YHQ A; 1QWE A; 1ZUU A; 3S3O A; 1K9M U; 2MOX A; 2DX1 A; 5A2Q E; 1I0C A; 4UC4 A; 3M4Y A; 1B3Q A; 1X2K A; 5J39 A; 3GNF B; 2EJ9 A; 5L23 A; 1ACM B; 2MAM A; 3FLG A; 1QVF A; 2ED0 A; 4JZ3 A; 2RQU A; 4LUD A; 3TVT A; 3CCE Q; 1LJO A; 4J6Y A; 5CIU A; 4MDW A; 1GCP A; 3OSV A; 3O5Z A; 2RQW A; 2OTJ Q; 4ZTJ A; 2PUO B; 1YJW A; 1U3O A; 1M5Q 1; 4F7U G; 2OTL T; 1W2B P; 1S1N A; 1VA7 A; 5GAN 4; 4KGX B; 2NUT B; 4F7U B; 1I8F A; 2LX9 A; 1M2V B; 1K8A R; 1NYF A; 1YI2 A; 3JCM P; 2P0Q A; 2NLU A; 1XOV A; 3PIO A; 3LLR A; 2QI2 A; 3MJX A; 2MI6 A; 2DBK A; 4FL6 A; 2BE9 B; 1RAC B; 2BKD N; 3JB9 J; 3CC7 A; 3QJ6 A; 1C0M A; 4BDZ A; 3PMT A; 2E4H A; 1MMN A; 2CKK A; 2EPD A; 1AT1 B; 1M90 C; 2XHC A; 2J6F A; 1ZHI A; 4M78 D; 1UGV A; 3FB9 A; 1UB4 A; 1V76 A; 3D7S B; 4X9C A; 2JZ2 A; 3CMA Q; 2DL7 A; 1WJS A; 3JCM h; 2E65 A; 2DXT A; 4ZN1 A; 1UGS B; 1NZ9 A; 3NMZ C; 2E3I A; 4HVW A; 1HYO A; 1QVG P; 1M3A A; 4E7J A; 1ZSZ B; 2C0O A; 4X9D A; 1OZ3 A; 3ULR B; 5LJ3 g; 4ELY C; 4Z02 A; 4IUV A; 2EQU A; 1KG1 A; 3QSU A; 4QQD A; 2YRD A; 3M5A A; 4B9W A; 2P0K A; 1LCK A; 2DZC A; 5GAO p; 1W70 A; 5DLQ E; 3I55 A; 3EGU A; 4RUG A; 1IGQ A; 4NOY A; 4M78 A; 3PE0 A; 4MML A; 5FW9 A; 1K8A U; 3NGP A; 3FRN A; 4LDV A; 3VS5 A; 3G71 Q; 4M75 D; 4WF2 A; 2K7A A; 1AVZ C; 4JRI A; 3E9F A; 2CSQ A; 2PNI A; 2EFI A; 4DEY A; 4P5N A; 3VUZ A; 1M3C A; 2ESW A; 3ZFJ A; 4PJO F; 2EW3 A; 5FU7 B; 4IIO A; 1VQM A; 3DKM A; 1VQ9 Q; 2D9T A; 2FRW A; 4M7A F; 3M0U A; 1KSW A; 2OAW A; 5GMK l; 1JO8 A; 2CH4 W; 4E7S A; 3CCR A; 1WXU A; 1MV0 B; 1TUC A; 1VQK Q; 1FWZ A; 1Q95 G; 2BIV A; 3SEM A; 2ZGW A; 2A36 A; 2CDT A; 3FEO A; 4JJC A; 5I22 A; 1NEB A; 1WHK A; 5IH2 A; 3BDL A; 5GAN e; 1B34 B; 3OYI A; 5IAY A; 4LUE A; 3OS0 A; 2KVQ G; 2QQR A; 1RAA B; 3TCJ A; 4C92 F; 5KYY B; 3CCL T; 3R6O A; 2E5Q A; 4J83 A; 2I0N A; 4ZGD B; 1WX6 A; 2LVM A; 1TXQ A; 4M7D D; 4DBR A; 3OMG A; 3EGD A; 2V26 A; 3SHW A; 2P4T A; 2KI7 A; 4EMK A; 4E6R A; 3G4S A; 1X27 A; 2QEX Q; 2K3Y A; 4Z8A A; 1YJW T; 5GMK e; 2VGM A; 1E6G A; 1KQ2 A; 4N0A A; 1M27 C; 4M4Z A; 1PD0 A; 1WI7 A; 2BTT A; 1YCY A; 2R58 A; 2AZS A; 1YIJ Q; 1RLP C; 3JCM X; 1G2B A; 1H3H A; 1K0X A; 1E6H A; 3OS1 A; 4OMP A; 3SWN C; 4BB7 A; 4BDY A; 2RI5 A; 4XU0 A; 4TVR A; 1UHF A; 3ASK A; 2DIQ A; 1WHH A; 2DL3 A; 2KAF A; 2B86 A; 2KSS A; 3EFO A; 2A28 A; 1NJI C; 4KH0 B; 1TUG B; 1JBM A; 3CBM A; 3CC2 T; 2QDL A; 2KRS A; 3CCJ T; 2DBM A; 1N6A A; 3JCM d; 5GAN g; 1IZ6 A; 4C0D C; 3QG1 A; 5GAN 5; 4XTU A; 3QZ5 B; 2LT1 A; 1VQ7 T; 2OTL Q; 3M57 A; 3S6W A; 2EQJ A; 2LJ1 A; 3RDV A; 1WNL A; 2E41 A; 2PU9 B; 4J9I A; 4BI4 A; 1VQ5 A; 3L2V A; 4ORZ A; 4C8Q G; 2GCX A; 5EC7 A; 4K11 A; 2JW4 A; 2QYZ A; 1JRI A; 3C0C A; 1M90 R; 1BCO A; 2JOY A; 4IUP A; 5GAN 6; 1AZE A; 5LJ5 h; 4C8Q B; 3CCS T; 2E12 A; 2CT3 A; 1I4K 1; 5DY9 A; 1X01 A; 4Q5W A; 4DQ2 A; 1LVK A; 3OBY A; 2KEA A; 1OU9 A; 2CZ6 B; 4PNO A; 4E7I A; 4FYY B; 2XMF A; 1RUW A; 1YIT A; 4EMH A; 3ZEH A; 4E7K A; 4A4F A; 3X20 B; 3JCM J; 2FZK B; 2MF2 A; 5GAO r; 4XU3 A; 4J9B A; 2LNH B; 2EJF A; 3OYJ A; 3HRU A; 1MUZ A; 4R0K A; 1D3B A; 3VKI A; 1BBZ A; 2EBP A; 1DJ7 B; 5GAN 3; 2EGE A; 1VQN T; 2RJC A; 5IHI A; 3CCQ Q; 1AHJ B; 1CSK A; 2YUP A; 4F16 A; 2JM8 A; 2DJQ A; 4LDW A; 4M78 F; 3REA B; 3UWN A; 5IHK A; 4C0Z A; 1X75 C; 1JEG A; 1PC0 A; 4PJN A; 3ZBD A; 1MMA A; 4IUU A; 1YN8 A; 2QEX A; 3UA6 A; 1VQ4 T; 3C12 A; 1U1S A; 3JSC A; 4PJL A; 1WQW A; 3JRZ A; 2KT1 A; 1RAG B; 3EG3 A; 2NUP B; 3LGL A; 2IVW A; 5DM7 R; 4CC7 A; 1PWT A; 2ZPG B; 4PJO E; 2Y90 A; 2O31 A; 4RG8 A; 5AT1 B; 2ECZ A; 1M90 U; 3QPH A; 4LN2 A; 1JJ2 S; 4ZGJ B; 3CBO A; 4PL6 A; 3RKY A; 2X4Y A; 3X28 B; 3L2R A; 4M7A E; 1IXD A; 2JM9 A; 5HKC A; 1FXX A; 4IUR A; 1SHG A; 3X25 B; 3LH0 A; 3CME A; 8ATC B; 4F7U A; 1W1F A; 3O8V A; 1NPP A; 1W6X A; 4HXJ A; 5GAO n; 5KYW A; 1UE9 A; 2KNB B; 2PVG B; 4D8K A; 2VVK A; 3A8H B; 4II1 A; 2OI3 A; 3LW5 E; 4FW2 A; 4C0F A; 4RKU E; 4CI0 C; 1WXB A; 1Y96 B; 4C92 E; 3OYH A; 3BY7 A; 5M9O A; 5D6Y A; 2E1H A; 3CCL Q; 4BY6 B; 1FYN A; 4JJB A; 2CZ7 B; 2QAS A; 1RAB B; 2YUQ A; 3JCM e; 1M9S A; 2RHZ A; 3LX7 A; 3MET A; 2XK0 A; 2LRQ A; 4XTW A; 2AT1 B; 4F04 B; 4XK8 E; 2FYK A; 2V1Q A; 4X34 A; 5ECA A; 3HP9 A; 2EYW A; 3M54 A; 3GIB A; 3QDR B; 3EG0 A; 2FPF A; 4D8D A; 3KFV A; 3EFR A; 2RJD A; 3MHX A; 4J7I A; 3G1J A; 3SD4 A; 1BI3 A; 4RTY A; 1NJI R; 1SSF A; 3RES A; 1RAE B; 2JT4 A; 4OMO A; 1B7T A; 1XNI A; 4QVD A; 3A8L B; 2EYQ A; 1M30 A; 1Z9Z A; 2X3W D; 2HMA A; 1KIK A; 2RJE A; 1M3B A; 2PQW A; 3C94 A; 2MK5 A; 4JLI A; 1XQH A; 4M78 C; 1G3Y A; 4KRT A; 1D0Z A; 4GLM A; 4CC2 A; 4LD9 K; 2J06 A; 4JJN K; 2AIR B; 2RI3 A; 2HSP A; 3CCQ A; 1KQS S; 3UA7 A; 1OQK A; 2DF6 A; 3CCJ Q; 4Y91 A; 1YIT T; 1EIF A; 2GNC A; 3RMS A; 2KRO A; 1PM3 A; 2FB7 A; 2J7I A; 1PHT A; 5DLO A; 1QWF A; 1BI1 A; 3MEV A; 3M9Q A; 2SEM A; 1VQ7 Q; 1UJ0 A; 2JXB A; 5KYX B; 5IT9 E; 3RNJ A; 3M4G A; 2EKO A; 5CKF A; 4ZNX A; 2D8J A; 3JCM g; 1JQQ A; 3QWY A; 1OX8 A; 5FWC A; 3CCV T; 3JAM E; 3HL8 A; 5C0M A; 3THK A; 1N9R A; 3M0P A; 2MCN A; 3CC4 Q; 4M75 C; 2YSQ A; 2RN8 A; 2RHI A; 4IIM A; 3CCS Q; 3TSW A; 1D0Y A; 2DXU A; 4DEX A; 1ZUY A; 1J3T A; 3REB B; 4DBF A; 2JTM A; 4EMK C; 1NEG A; 2AKL A; 1QP3 A; 1VQ6 A; 4N4H A; 2AK5 A; 2O4X A; 4NL2 A; 2C0T A; 4A4H A; 5GAN d; 1UDL A; 2LC4 A; 2ZPF B; 1KHC A; 4LE9 A; 1NJI U; 3QDF A; 5KYY A; 1M8V A; 2DER A; 4AT1 B; 2ZPB B; 4N0A C; 4KUI A; 2AZV A; 1WIE A; 1X6B A; 1N8R R; 1W2B A; 2ENM A; 2D0Q B; 1T3L A; 4E7H A; 2KRN A; 4ZN3 A; 3OYN A; 3BFM A; 3UPU A; 1SEM A; 3OW2 S; 2GGR A; 2H3E B; 1FMV A; 1VQN Q; 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