The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
67
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structure length |
67
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Chain Sequence |
GSEIVVAMYDFQATEAHDLRLERGQEYIILEKNDLHWWRARDKYGSEGYIPSNYVTGKKSNNLDQYD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The solution structure and intramolecular associations of the Tec kinase SRC homology 3 domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
TYROSINE-PROTEIN KINASE TEC
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| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
11
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| structure length |
67
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| sequence length |
67
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2001-08-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3I9Q A; 2A37 A; 1J3T A; 2EGE A; 3QWX X; 4J9C A; 1Z9Q A; 3EHQ A; 2ECZ A; 1Y0M A; 4RUG A; 4CC7 A; 2F2W A; 2DVJ A; 4GBQ A; 1K9A A; 1K0X A; 2JMA A; 5ECA A; 3I5R A; 2RQU A; 4Y92 A; 2JMC A; 1UGV A; 2BZ8 A; 3M0Q A; 3SHW A; 2J06 A; 3M0R A; 1WA7 A; 1JQQ A; 2L3P A; 1BU1 A; 3TVT A; 2FPE A; 3PVL A; 2MCN A; 3VS5 A; 1ABQ A; 1CKA A; 2DJQ A; 2BZY A; 2AZV A; 1X69 A; 1YN8 A; 2DMO A; 2YUO A; 4CC4 B; 1QKW A; 1G83 A; 4EIK A; 2DL8 A; 4R0K A; 1Y57 A; 3QWY A; 1UDL A; 4AFZ C; 1IO6 A; 2CDT A; 1N5Z A; 1K4U S; 1GBR A; 1PRL C; 1B3Q A; 1NM7 A; 1NYG A; 2EYX A; 2I0N A; 2FRW A; 2OI3 A; 3THK A; 1KSW A; 3EG2 A; 1RLP C; 1ZUY A; 2O88 A; 4DEY A; 3ULR B; 2IIM A; 3VRY A; 5EC7 A; 1HSQ A; 3R6N A; 1ZUK A; 4J9G A; 2PNI A; 1PWT A; 4OMM A; 1TUC A; 2O9S A; 1T3S A; 3REB B; 1I1J A; 2CSQ A; 3NPF A; 2NWM A; 1UJ0 A; 1H3H A; 2C0I A; 4RTV A; 1NEB A; 1AOJ A; 2DL4 A; 1AWX A; 2MIO A; 5I11 A; 2CUB A; 1VYU A; 3M0U A; 1B07 A; 2O31 A; 1QLY A; 2J6O A; 4OMN A; 4AG2 C; 2KRN A; 4F17 A; 3PVQ A; 1GCQ A; 1UG1 A; 1JO8 A; 2PTK A; 2KYM A; 5FWC A; 2W10 A; 2AK5 A; 2ABL A; 2DL5 A; 4JZ3 A; 2LNH B; 3EG3 A; 2EQI A; 3H0F A; 1T0H A; 1BBZ A; 2X3X D; 2SEM A; 3RNJ A; 4J9F A; 2ROT A; 1MV3 A; 2EPD A; 2VVK A; 2FG0 A; 5L23 A; 4HXJ A; 4LE9 A; 4F16 A; 2DRK A; 2ENM A; 1MUZ A; 2CRE A; 2KXD A; 2JS0 A; 1WX6 A; 2EGA A; 2KXC A; 4KRT A; 2KBT A; 1WIE A; 2GQI A; 2FPF A; 2CH4 A; 2ROL A; 3CQT A; 1UHF A; 4M4Z A; 1NYF A; 3KFV A; 5IXB A; 3H0H A; 2M51 A; 3NGP A; 1SRM A; 3UF4 A; 4ZNX A; 4J9H A; 4ESR A; 2XMF A; 1UUE A; 3TSZ A; 1M3C A; 1X27 A; 2GBQ A; 3UAT A; 4RTY A; 2K6D A; 1ZSG A; 2VWF A; 2BTT A; 1SPK A; 2BZX A; 2L0A A; 2DBK A; 2LMJ A; 1WXT A; 1GBQ A; 3EHR A; 1SEM A; 2YSQ A; 1QWF A; 3M0P A; 2D8J A; 2J7I A; 2KRM A; 1SHG A; 2KE9 A; 1UHC A; 1GL5 A; 4RTT A; 1FYN A; 1M27 C; 2ED1 A; 3EGU A; 3O5Z A; 2P4R A; 1OOT A; 4AFQ C; 1AD5 A; 1E6H A; 2A28 A; 2RQR A; 1QKX A; 1UE9 A; 2J05 A; 2FRY A; 2ESW A; 1YWP A; 2LJ1 A; 1RLQ C; 4J9D A; 4JJD A; 2F2X A; 1ABO A; 2V1Q A; 3EG0 A; 2LP5 A; 2KYB A; 2JW4 A; 1G2B A; 3U23 A; 1TG0 A; 2LQN A; 1X2Q A; 4F14 A; 1WLP B; 1X6B A; 1YCS B; 1T0J A; 3VS1 A; 2D1X A; 2V1R A; 3GBQ A; 1W6X A; 2HDA A; 1WDX A; 1QWE A; 1AEY A; 1AWW A; 4LUE A; 1PNJ A; 2YDL A; 1NEG A; 2HEQ A; 1U06 A; 2DYB A; 3I5S A; 2RMO A; 3LH5 A; 2EYY A; 2F2V A; 1FMK A; 1JU5 C; 1H92 A; 2LJ3 A; 4LNP A; 4FSS A; 2KR3 A; 1SHF A; 4GLM A; 2D0N A; 2PZ1 A; 2LQW A; 1ARK A; 2J6F A; 2YUQ A; 1X2K A; 1KJW A; 1OPL A; 1GRI A; 2DNU A; 5IHN A; 1X6G A; 2DRM A; 2DX1 A; 4AFS C; 1M3B A; 2L2P A; 4J9B A; 2FPD A; 4WCI A; 2AKL A; 2O2O A; 1GCQ C; 2M0Y A; 3C0C A; 1W1F A; 1PRM C; 1GFD A; 1Z9Z A; 2A36 A; 1ZUU A; 2QDL A; 1HJD A; 1VYT A; 2EYZ A; 2HCK A; 2AZS A; 1UTI A; 2JS2 A; 3NMZ C; 2E5K A; 5I22 A; 3NHN A; 1CSK A; 4HVV A; 2KEA A; 1TUD A; 3REA B; 4AG1 C; 2EGC A; 1MV0 B; 4JZ4 A; 2CSI A; 1E7O A; 2VKN A; 2JM8 A; 3M0S A; 4HVU A; 1UJY A; 2EYW A; 4RTX A; 4AFU C; 2HSP A; 2KGT A; 2RNA A; 2LX7 A; 5FW9 A; 2MOX A; 1I07 A; 4RTU A; 4IIO A; 1HD3 A; 2KNB B; 1V1C A; 1WXU A; 2EKH A; 2RPN A; 5IHK A; 2RN8 A; 2CT3 A; 2W0Z A; 2RQW A; 2A08 A; 2GTO A; 1AWO A; 2LCS A; 1BK2 A; 3UA7 A; 2C0T A; 4CC3 A; 4OMP A; 4QT7 A; 4A63 B; 2DM1 A; 1EFN A; 4Z89 A; 1YP5 A; 2DIL A; 1KIK A; 1GFC A; 2JTE A; 3EG1 A; 3H0I A; 2GTJ A; 3VS6 A; 4E6R A; 2HBW A; 2X3W D; 1VA7 A; 3UA6 A; 2KRO A; 2H8H A; 1ZX6 A; 2DE0 X; 4K11 A; 4LN2 A; 1SSH A; 5GJW B; 3A98 A; 4X1V A; 2RF0 A; 2FEI A; 2L3S A; 1U5S A; 2EBP A; 1AWJ A; 2LZ6 B; 5GJV B; 4HCK A; 4Z8A A; 3H41 A; 1OV3 A; 4J9I A; 1JEG A; 5IHI A; 1S1N A; 2ED0 A; 1LCK A; 1UEC A; 1AZG B; 2EVR A; 2L3Q A; 2SRC A; 3ZL7 C; 2CH4 W; 4JPB W; 3VS7 A; 2JT4 A; 1BB9 A; 2D8H A; 4JJC A; 2EW3 A; 1KFZ A; 1K1Z A; 2DA9 A; 3VRZ A; 1H8K A; 4DEX A; 1QCF A; 4Z88 A; 1M3A A; 4LUD A; 4RTZ A; 4D8K A; 1JXO A; 2RQT A; 1NLO C; 1M30 A; 4OML A; 3VS4 A; 4IIM A; 2YUP A; 2JXB A; 2B86 A; 1W70 A; 2K79 A; 2GNC A; 1X43 A; 3PE0 A; 2NUZ A; 1RI9 A; 1T3L A; 2C0O A; 4CC2 A; 2OAW A; 3RBB B; 2KT1 A; 2K7A A; 2JM9 A; 1AVZ C; 1K0S A; 2YT6 A; 2LJ0 A; 5FWB A; 2K3B A; 3IQL A; 2DL7 A; 3SEM A; 1YNZ A; 1YWO A; 1WI7 A; 1SRL A; 2AKK A; 2CUD A; 2OJ2 A; 1AZE A; 4HVW A; 2DF6 A; 5IXF A; 3VS3 A; 1OEB A; 1ZBJ A; 2DBM A; 3TSW A; 3VS0 A; 4ORZ A; 1CKB A; 2RQV A; 2K2M A; 2KRS A; 3JV3 A; 1NG2 A; 2YUN A; 2O9V A; 1WXB A; 1NLP C; 3FJ5 A; 4OMO A; 2J6K A; 1OPK A; 1ZLM A; 1PHT A; 1WYX A; 5IH2 A; 4JJB A; 1GCP A; 1M8M A; 2DLP A; 1RUW A; 2K9G A; 2CT4 A; 3VS2 A; 1XOV A; 1E6G A; 1PKS A; 2DL3 A; 4J9E A; 1PKT A; 2FO0 A; 2KT8 A; 2G6F X; 1WFW A; 4OMQ A; 3M0T A; 1VYV A; 4RTW A; 4D8D A; 2GGR A; 3I35 A; 1I0C A; 1A0N B; 1K76 A; 1UFF A; 1JXM A; 1U3O A; 5HCK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2YHT A; 2A37 A; 1M1G A; 2EGE A; 4J9C A; 2D6F A; 3G1J A; 2YWW A; 1Y0M A; 3A5Z B; 4CC7 A; 2DVJ A; 3SWN C; 4PJM A; 3BY7 A; 4IKF A; 3G4S T; 5ECA A; 3VUB A; 1VQ4 Q; 2X4Y A; 2QDY B; 5GAO m; 3SHW A; 3M0R A; 2FPE A; 3JCM c; 3P8H A; 4MML A; 4IUU A; 1VQ6 A; 3H9N A; 3JSC A; 1X69 A; 3WXM B; 2LT4 A; 1YN8 A; 1QP3 A; 2VGM A; 1QKW A; 1RAA B; 2RO0 A; 3MEW A; 1BKB A; 2ATC B; 2XKO C; 2RJC A; 3BFM A; 1MNE A; 2BE7 D; 3VJP A; 4N4H A; 1Y71 A; 3QWY A; 1UDL A; 2CDT A; 4ZTF A; 2PQW A; 3Q1J A; 1GBR A; 4RCC A; 5CKF A; 3CD6 A; 1YBY A; 3OMC A; 2DKG A; 2OI3 A; 3MP1 A; 1BYM A; 1TH7 A; 4JRQ A; 3ER0 A; 2YXY A; 1RLP C; 4DEY A; 3MJX A; 2IIM A; 3EFS A; 3D7S B; 1ZUK A; 2MF2 A; 2PNI A; 2VYT A; 1PWT A; 4OMM A; 2MI6 A; 2O9S A; 1T3S A; 1TU0 B; 1I1J A; 4BI3 A; 1RAC B; 3S3N A; 3E2U A; 5GAN 8; 2QGG A; 4RTV A; 1NEB A; 2V8J A; 1AOJ A; 4FU6 A; 1VQO Q; 2DL4 A; 4XTX A; 1UGQ B; 2MIO A; 1KC8 U; 4C92 D; 2YLB A; 3LYI A; 5FU7 B; 2DEQ A; 1QLY A; 2J6O A; 4RCB A; 3G71 Q; 4TVR A; 3JCM h; 2JUF A; 2NUT B; 4A53 A; 3CCR Q; 2KYM A; 2AK5 A; 1Q95 G; 3QUI A; 2QEX A; 3JB9 I; 4M78 B; 1T0H A; 4J7F A; 1BBZ A; 3RNJ A; 2ROT A; 1MV3 A; 2EPD A; 2FG0 A; 4C5G A; 3LW5 E; 4F16 A; 1M9S A; 1LJO A; 4KT0 E; 4ZGE B; 2LNV A; 3FLG A; 1VQN T; 3V8K A; 1QW1 A; 4DBH A; 3MEV A; 2CH4 A; 3FC3 A; 4OP0 A; 3S3M A; 4ZGJ B; 1NYF A; 3H0H A; 3F70 A; 2VB6 A; 3EGX A; 3TU4 K; 1KQ1 A; 1VQM T; 2NUP A; 4QVC A; 3VV0 A; 1OX8 A; 4XTZ A; 3TSZ A; 1K73 R; 1X27 A; 3OS5 A; 4PK4 A; 3CCV Q; 4E7S A; 3BDL A; 1Q82 R; 3CC2 Q; 2L0A A; 3CPW A; 2DBK A; 4II1 A; 1JB0 E; 4M77 D; 3EHR A; 2YSQ A; 3M0P A; 2J7I A; 1Y96 B; 2KRM A; 1D09 B; 3S3O A; 2X35 A; 1UHC A; 1GL5 A; 4RTT A; 1K8A R; 1VQN A; 5D6W A; 3EGU A; 2P4R A; 1OOT A; 4AFQ C; 5LJ5 h; 2ESW A; 2LJ1 A; 2DVE A; 3JCM Q; 2EJ9 A; 5GAN 4; 5IAY A; 1BIB A; 3GF5 A; 1VQM A; 3EG0 A; 4XU1 A; 4C0D B; 2XDP A; 2VXF A; 3EFR A; 3HRU A; 2EYQ A; 3QJ6 A; 1SF9 A; 3JB9 G; 1WHM A; 3QYH B; 1T0J A; 2LRQ A; 2D1X A; 3CMA Q; 4E7I A; 1W6X A; 1IHV A; 1AEY A; 3QKJ A; 1AWW A; 2CKK A; 3QBY A; 2YDL A; 2DYB A; 1X01 A; 2F2V A; 5HK3 A; 3T9N A; 4E7K A; 4LNP A; 3CPW P; 4LDU A; 4BE0 A; 1SHF A; 3QJY A; 4IUV A; 5AYF A; 4M7D B; 2D0N A; 1PSE A; 2J6F A; 1RAI B; 2AHJ B; 2OTJ Q; 3A8H B; 4XU0 A; 3I55 T; 4AMC A; 4J9B A; 4PJO A; 2F5T X; 4OB3 B; 5DM7 R; 2FPD A; 1QVG P; 4JLG A; 1I5L A; 1MMD A; 2AKL A; 2HBP A; 2CP3 A; 3M57 A; 3QZ9 B; 1KQS S; 2M0O A; 2IVW A; 4QKU A; 3X24 B; 2IPO B; 1ZUU A; 2QDL A; 1B34 A; 3HPW A; 1VYT A; 4MZT A; 3OSS C; 2AZS A; 1UTI A; 4BI8 B; 5I22 A; 1TUD A; 2EGC A; 2D0Q B; 2QQ9 A; 4JZ4 A; 3R6O A; 3GIB A; 2JM8 A; 1LNX A; 2PUK B; 1UJY A; 4RTX A; 2ZCF B; 4OB2 B; 1N27 A; 5J26 A; 5GAN e; 1YHQ Q; 2QYZ A; 2PUO B; 2LX7 A; 2ZPG B; 1I07 A; 4IIO A; 2FVU A; 5GAN 5; 3DLM A; 1V1C A; 2EKH A; 2CT3 A; 2W0Z A; 4A4K A; 3QO3 A; 2GTO A; 2HL3 A; 3SB2 A; 2LCS A; 2CZ7 B; 1BK2 A; 3GLX A; 3JCM f; 5CCA A; 2DM1 A; 1YP5 A; 1KIK A; 1GFC A; 5GAN 6; 1TWB A; 1OZ3 A; 2JTE A; 2PVG B; 3CCS Q; 3GPL A; 2HBW A; 2X3W D; 1VA7 A; 2M1H A; 4OF1 A; 3M5A A; 2MYS A; 2RHI A; 2ZPI B; 4MZM A; 1RI0 A; 3QZ5 B; 2K5F A; 2O01 E; 3A98 A; 3CC7 T; 3CEY A; 2KMT A; 3O8V A; 2L3S A; 5KYW A; 1TXQ A; 3OYE A; 5LJ3 h; 2JNG A; 2LZ6 B; 5GJV B; 2HSE B; 2R5A A; 3OYC A; 4J9I A; 2RHX A; 4BAC A; 1LPL A; 1VQ5 A; 3RUX A; 3CCL Q; 4DBQ A; 1S1N A; 1ZA1 B; 5CVI A; 2CH4 W; 2HQX A; 5CIU A; 4ZN1 A; 4E7L A; 2DET A; 3PMT A; 4HA8 A; 1K1Z A; 2WAC A; 4DEX A; 3JCM b; 3OBY A; 4RG8 A; 1QCF A; 3JCM V; 4Z88 A; 1M3A A; 3OW2 A; 2RQT A; 1NLO C; 2GFU A; 3VS4 A; 4IIM A; 2YUP A; 5FU6 B; 1M1F A; 2NUZ A; 5HKC A; 1RAG B; 4C5E A; 3CC7 A; 3PMI A; 2FHD A; 4A4E A; 2CGH A; 3BE3 A; 3CCU T; 3IQL A; 4BY6 B; 3SEM A; 1WHL A; 2XI9 A; 5D7U A; 2C06 A; 1SRL A; 2CUD A; 4KGX B; 3X25 B; 3PTA A; 1AZE A; 4HVW A; 3CCJ Q; 4MMK A; 1JRI A; 1VQK Q; 3A8M B; 1OEB A; 1ZBJ A; 2DBM A; 3TSW A; 3FRN A; 1JJ2 S; 1YIJ A; 2QQB A; 4CI0 C; 3JB9 H; 3OYL A; 2E6Z A; 5AT1 B; 1G3Y A; 2YUN A; 2O9V A; 1VQ7 T; 1OPK A; 1PHT A; 3CC4 T; 1M8M A; 2DLP A; 1YJ9 Q; 5CO7 A; 1PD0 A; 2HD0 A; 2CYZ B; 3OYB A; 4J9E A; 3INZ A; 2G6F X; 3OW2 P; 1M90 C; 3HFN A; 4XK8 E; 1RL2 A; 3M0T A; 4FYX B; 2HQE A; 2GGR A; 2NYS A; 2RHU A; 4F7U G; 1C6V X; 3MET A; 2LCC A; 1N8R U; 5GAM e; 1R0B G; 3I9Q A; 3QDF A; 4M7A B; 4BDZ A; 3V8L A; 4FL6 A; 2DYI A; 2DZC A; 3JCM e; 3M56 A; 5KYX A; 4N0A A; 5GMK j; 1WJQ A; 1QCN A; 4FW2 A; 2JMA A; 5A0D A; 4Y92 A; 4LD6 A; 3CC4 A; 1U1T A; 3G6E Q; 1UGV A; 2E70 A; 1M4Z A; 3M0Q A; 4HCZ A; 5IN1 A; 2ZPF B; 1BU1 A; 3PVL A; 2MCN A; 1VOM A; 1RAD B; 5FRM A; 1CKA A; 4PLI A; 1NBE B; 2IG0 A; 1G3S A; 1RAH B; 1N9S A; 3HTR A; 2DK3 A; 3CXC A; 3LLR A; 4X9D A; 3OSV A; 4C92 B; 4DQ2 A; 4JLI A; 2BIV A; 4FIB A; 2LTO A; 1WQW A; 4EIK A; 2XDD A; 1JBM A; 3JRZ A; 3NFC A; 4R0K A; 4MDX A; 1N5Z A; 4V2S A; 1PRL C; 1NYG A; 2KDS A; 2COZ A; 2M9U A; 5KYN A; 2FRW A; 5KYY A; 3EFO B; 4VUB A; 2O88 A; 1IXD A; 1RAE B; 3ULR B; 4F7U F; 3VYH B; 1TUC A; 3CCE T; 3GNF B; 2I2L A; 3NPF A; 2NWM A; 1WPY A; 4J7I A; 4QVD A; 2C0I A; 5LJ3 f; 2DIQ A; 1C0M A; 4HKE A; 1BI3 A; 1D1C A; 1M1K C; 4AT1 B; 2CUB A; 1VYU A; 3M0U A; 4KGV B; 1P92 A; 3HRS A; 5LJ5 e; 4AG2 C; 1UB4 A; 2V8K A; 3CXC P; 4F17 A; 3PVQ A; 2E65 A; 4HT9 A; 1DJ7 B; 2RJF A; 1JO8 A; 1Q81 U; 4B9W A; 2ABL A; 2DL5 A; 4JZ3 A; 4FCY A; 2LNH B; 4B9X A; 2F69 A; 4EPC A; 1M90 U; 2OX7 A; 4L59 A; 2VVK A; 5L23 A; 3CME A; 2CZ1 B; 4M77 B; 3MKD A; 4LE9 A; 1VQ6 T; 2DZ9 A; 2RM4 A; 1NJI U; 4FT4 A; 5GAO q; 2FL7 A; 2ENM A; 3MEA A; 3RMS A; 3OY9 A; 4F7U E; 2LX9 A; 3LH0 A; 2JS0 A; 1SSF A; 3GOX A; 1WX6 A; 2EGA A; 3SWN B; 3HFO A; 2ROL A; 5GMK i; 2KQW A; 1R8O B; 3KUF A; 1UHF A; 3KFV A; 1TTH B; 3UF4 A; 4PJO F; 3CD6 T; 4M7A G; 2XMF A; 3VKI A; 1WHJ A; 2CP7 A; 3OMG A; 2E3H A; 3EGD B; 4RTY A; 1ZSG A; 3LGL A; 3MO8 A; 1OYX A; 2AIR B; 2BTT A; 5FRO A; 1SPK A; 2BZX A; 5J3B A; 1YJN Q; 2P4T A; 4N0A C; 4KUD K; 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