The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
74
|
structure length |
74
|
Chain Sequence |
GSSGSSGVENLKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSESGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the second SH3 domain of human intersectin 2 (KIAA1256)
rcsb |
| molecule keywords |
Intersectin 2
|
| molecule tags |
Endocytosis/exocytosis
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
11
|
| structure length |
74
|
| sequence length |
74
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-02-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2D8H A; 2ENM A; 2XMF A; 1KJW A; 1UGV A; 4ZNX A; 3EGU A; 1AWW A; 5L23 A; 1W1F A; 2RNA A; 2C0I A; 1GFC A; 2F2X A; 2YUQ A; 3I9Q A; 4J9G A; 2X3X D; 1MV0 B; 2YT6 A; 3EG0 A; 3UA7 A; 4OMM A; 3NHN A; 2LZ6 B; 1SRM A; 5EC7 A; 2LJ3 A; 2CT4 A; 3QWX X; 3I35 A; 2HBW A; 1OPK A; 1J3T A; 4HVV A; 3NPF A; 1NLO C; 1U5S A; 1JU5 C; 1WA7 A; 1M3A A; 1WI7 A; 1BU1 A; 1T0H A; 1WX6 A; 2CDT A; 4AFU C; 3H0F A; 1SHG A; 1EFN A; 2M51 A; 4HVU A; 4DEX A; 2KNB B; 2DX1 A; 4GLM A; 1E7O A; 4J9E A; 1T0J A; 2ECZ A; 2D1X A; 2YUP A; 4Y92 A; 4ESR A; 2HCK A; 1VYU A; 5FW9 A; 1RLQ C; 1T3L A; 1TUC A; 1H92 A; 2ROL A; 2J06 A; 1BB9 A; 2DMO A; 4EIK A; 2FRW A; 2L3Q A; 4Z88 A; 1GCQ C; 2SRC A; 3VS6 A; 2LQW A; 2A28 A; 1PKT A; 2RF0 A; 5GJV B; 2KRS A; 2YSQ A; 1SSH A; 1YP5 A; 1T3S A; 2DIL A; 2MOX A; 1M3C A; 4D8K A; 1AEY A; 1N5Z A; 2EYW A; 3R6N A; 2KBT A; 3QWY A; 1K0X A; 3UA6 A; 4AFZ C; 1Y0M A; 2DLP A; 2VKN A; 2LJ1 A; 2LCS A; 4HVW A; 1PRM C; 2KT1 A; 1V1C A; 2O9S A; 5IXB A; 1MUZ A; 1UJ0 A; 2GNC A; 2FPE A; 2OI3 A; 4J9B A; 3VS4 A; 2DRK A; 1CKA A; 4FSS A; 4IIM A; 2AK5 A; 2CH4 W; 5FWC A; 1AD5 A; 2O31 A; 1BK2 A; 4F14 A; 3TVT A; 1S1N A; 4Z8A A; 1XOV A; 4A63 B; 4LUD A; 2VVK A; 4HCK A; 4OMP A; 1UTI A; 1MV3 A; 2OJ2 A; 3M0S A; 2P4R A; 1HJD A; 2JXB A; 4OMO A; 2DL4 A; 2KXD A; 4AG2 C; 2DL3 A; 2V1R A; 2J05 A; 1TG0 A; 1SRL A; 1NEB A; 3GBQ A; 1PHT A; 1WLP B; 1ZUY A; 3M0R A; 1M3B A; 1JQQ A; 2RQV A; 2A08 A; 1ZUU A; 1TUD A; 1UE9 A; 2EVR A; 3C0C A; 2JM8 A; 1LCK A; 5IHK A; 2HDA A; 2CRE A; 4AG1 C; 1W6X A; 1AZG B; 2EBP A; 3A98 A; 4CC4 B; 4LNP A; 4OML A; 2GQI A; 1Y57 A; 3KFV A; 4F17 A; 1JEG A; 1X27 A; 2EQI A; 1A0N B; 3RNJ A; 3VRY A; 1K0S A; 1YN8 A; 2DE0 X; 2JMC A; 4DEY A; 1FYN A; 3PVQ A; 1WFW A; 4ORZ A; 3CQT A; 1OV3 A; 1SHF A; 2K7A A; 1ARK A; 4AFQ C; 2EPD A; 1B3Q A; 2CUD A; 2V1Q A; 2EYX A; 2KE9 A; 1PNJ A; 3M0T A; 3U23 A; 5IH2 A; 1UG1 A; 2K79 A; 2DL5 A; 1GCP A; 1U06 A; 2AZS A; 2LP5 A; 2BZY A; 1NEG A; 2LNH B; 2RN8 A; 5GJW B; 2EGA A; 1SEM A; 1X6G A; 4F16 A; 1AVZ C; 1QLY A; 1Z9Q A; 2J6F A; 4LE9 A; 2LJ0 A; 4J9C A; 3LH5 A; 2RQW A; 2L3S A; 2A36 A; 5IHI A; 2JT4 A; 2DRM A; 3VS1 A; 4QT7 A; 2EGE A; 3SEM A; 1AZE A; 2D8J A; 2GBQ A; 1B07 A; 2FEI A; 2FPD A; 4J9H A; 1GBR A; 2DBK A; 2C0O A; 1AWJ A; 2DF6 A; 3PE0 A; 4CC2 A; 3ULR B; 3ZL7 C; 1M8M A; 1G2B A; 2IIM A; 2GTJ A; 2M0Y A; 1UHC A; 1E6G A; 1UHF A; 1UUE A; 1SPK A; 2KRM A; 1GBQ A; 4RTT A; 2D0N A; 3UF4 A; 2KEA A; 3RBB B; 1CKB A; 1NLP C; 2L2P A; 1M30 A; 2F2W A; 1JXO A; 3IQL A; 2RQU A; 2EYZ A; 1YWP A; 2K6D A; 2W10 A; 1VA7 A; 4GBQ A; 4D8D A; 1Z9Z A; 2ED1 A; 2JM9 A; 2EYY A; 3VS2 A; 3H41 A; 1AWX A; 1HSQ A; 4Z89 A; 2X3W D; 2DVJ A; 4RTW A; 2ROT A; 4RTV A; 2KXC A; 1M27 C; 4RTX A; 1GL5 A; 1PKS A; 1ZSG A; 1KIK A; 2O9V A; 1BBZ A; 2YUN A; 2GTO A; 3EHQ A; 1NYF A; 1W70 A; 3M0U A; 3NMZ C; 2K9G A; 1NG2 A; 4M4Z A; 1UJY A; 1QKX A; 1WIE A; 1KSW A; 2DL7 A; 1OEB A; 2RQR A; 1X69 A; 1JO8 A; 4JJB A; 3VS5 A; 2I0N A; 2NWM A; 3TSZ A; 2AKK A; 1WDX A; 2ABL A; 4J9D A; 3VS7 A; 4JZ4 A; 2DM1 A; 2KGT A; 2H8H A; 2BZ8 A; 1WXB A; 1X2K A; 3UAT A; 5IHN A; 4AFS C; 5HCK A; 1PWT A; 2YUO A; 1QWE A; 2PTK A; 1UFF A; 1I07 A; 3EG1 A; 2DA9 A; 2K2M A; 2E5K A; 4HXJ A; 4JPB W; 2PNI A; 3FJ5 A; 1KFZ A; 1IO6 A; 2LMJ A; 1WYX A; 1HD3 A; 1ZBJ A; 1X43 A; 2DL8 A; 4WCI A; 1CSK A; 1G83 A; 1UDL A; 2JS2 A; 2OAW A; 2FRY A; 1NM7 A; 3H0I A; 3VRZ A; 2KRO A; 3PVL A; 1WXU A; 4K11 A; 1AOJ A; 1AWO A; 1ABQ A; 4E6R A; 1K1Z A; 3I5S A; 1GCQ A; 1H8K A; 2CSQ A; 3I5R A; 2KR3 A; 2AKL A; 2O88 A; 2JTE A; 2KT8 A; 1RI9 A; 2HEQ A; 4LN2 A; 5IXF A; 4OMN A; 1I0C A; 2C0T A; 4KRT A; 1UEC A; 4R0K A; 2DNU A; 2GGR A; 2KRN A; 2CUB A; 3NGP A; 1H3H A; 1NYG A; 4LUE A; 1PRL C; 3EG3 A; 2DYB A; 1ZX6 A; 3THK A; 2L0A A; 4RTZ A; 2NUZ A; 2A37 A; 1VYT A; 1QCF A; 1OOT A; 2PZ1 A; 2CH4 A; 4RTU A; 2DBM A; 2KYB A; 5FWB A; 2RQT A; 2J6K A; 3M0Q A; 2SEM A; 2FO0 A; 2AZV A; 3EHR A; 4JJD A; 2JW4 A; 2B86 A; 2F2V A; 1K76 A; 1QKW A; 4JZ3 A; 4X1V A; 2RMO A; 2L3P A; 2CSI A; 1WXT A; 3SHW A; 2DJQ A; 4CC7 A; 1RUW A; 2LX7 A; 5ECA A; 2ESW A; 2HSP A; 3JV3 A; 2ED0 A; 4J9I A; 2BTT A; 3VS0 A; 2MCN A; 1GFD A; 3O5Z A; 3TSW A; 1K4U S; 2BZX A; 1YWO A; 1YCS B; 5I22 A; 1U3O A; 2KYM A; 1E6H A; 1X2Q A; 2EGC A; 1ZUK A; 1FMK A; 2VWF A; 5I11 A; 4JJC A; 1K9A A; 1X6B A; 2K3B A; 3H0H A; 4RUG A; 4IIO A; 4J9F A; 2EKH A; 2J7I A; 3M0P A; 3REB B; 2J6O A; 2RPN A; 3VS3 A; 1ABO A; 4RTY A; 2YDL A; 1VYV A; 3EG2 A; 2QDL A; 1OPL A; 2FG0 A; 2O2O A; 1I1J A; 2W0Z A; 4CC3 A; 4OMQ A; 2G6F X; 1GRI A; 2FPF A; 2JMA A; 1JXM A; 2LQN A; 3REA B; 1YNZ A; 2JS0 A; 1RLP C; 1QWF A; 2CT3 A; 1ZLM A; 2MIO A; 2EW3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1AHJ B; 1N27 A; 2V8I A; 4PJJ A; 3OYE A; 3CCJ A; 5L23 A; 2YLB A; 4KGX B; 2C0I A; 2F2X A; 3JCM b; 1TU0 B; 4PJN A; 3OQ5 A; 3DLL A; 2X3X D; 3OYM A; 1MV0 B; 1BIA A; 5FU7 B; 2YT6 A; 2FZG B; 2LZ6 B; 2LJ3 A; 4CI0 C; 1NJI C; 4C92 A; 1BYM A; 1OPK A; 1U5S A; 2LQ8 A; 4GLK A; 4OB1 B; 4KGZ B; 2YRV A; 1EFN A; 4HVU A; 5GAO q; 3G4S Q; 4A54 A; 2KNB B; 2VUB A; 5GAM g; 1M8V A; 4BE1 A; 4GY5 A; 1R0C B; 2M9U A; 4E7H A; 8AT1 B; 2HCK A; 1IRX A; 3X28 B; 3S3N A; 1RLQ C; 4ELY C; 3OS2 A; 1T3L A; 3EGX B; 1TUC A; 2O4X B; 1K8A U; 1BB9 A; 1VQM T; 4HCZ A; 1VQ4 Q; 2DMO A; 3BDU A; 3TQ7 P; 3CCR T; 3VS6 A; 2LQW A; 1V29 B; 5GJV B; 2YRC A; 1T3S A; 2F5T X; 3DB3 A; 4M77 E; 2MOX A; 2HL5 C; 3CBM A; 4D8K A; 2RK1 A; 4FYV B; 2PUO B; 1YJN Q; 2E70 A; 1Y0M A; 2VKN A; 3GLX A; 4J5Y A; 1YIT T; 3CCR A; 1V1C A; 2O9S A; 1MUZ A; 2KY9 A; 1VQP A; 1G3T A; 2XDP A; 1O75 A; 2CP5 A; 1FXX A; 1KC8 R; 1NPP A; 2DO3 A; 4KGV B; 1YIT A; 5J3B A; 1S1N A; 3V8L A; 2A7Y A; 2L3R A; 2MK5 A; 4OMP A; 4NL3 A; 3M0S A; 2P4R A; 5GAN 5; 1HJD A; 4XTV A; 2JNG A; 2ZPF B; 5LJ3 h; 2DXB A; 1YIJ T; 1SRL A; 4M77 A; 1PD0 A; 3DB4 A; 4NOY A; 3AHU A; 2MI6 A; 2RQV A; 1ZUU A; 1TUD A; 5GAN g; 2EVR A; 4A53 A; 4RG2 A; 1SKU B; 1N9S A; 2L8D A; 5LJ3 g; 2CRE A; 5DY9 A; 3QZ5 B; 3O8V A; 1JEG A; 2MF2 A; 3VRY A; 1C1A A; 1YN8 A; 2DE0 X; 1VQL T; 3OY9 A; 1VQN T; 4DEY A; 3X25 B; 2EKO A; 3L2U A; 3CD6 T; 4LDW A; 2E3I A; 8ATC B; 1SHF A; 4AFQ C; 2HNI A; 4ANJ A; 2KE9 A; 1PNJ A; 1QVF A; 5HK3 A; 1UG1 A; 3L2V A; 1GCP A; 1V76 A; 3JCM X; 2AZS A; 1Q86 R; 2QA4 T; 1VQN A; 2LNH B; 3VUZ A; 1YFN A; 1YI2 T; 4J6W A; 4XK8 E; 3CD6 A; 1X6G A; 3LGF A; 2J6F A; 4LE9 A; 1BI2 A; 3I56 T; 2LJ0 A; 4BI8 B; 3I55 T; 3M58 A; 2MWP A; 1U8R A; 1ZHI A; 5M9O A; 2D8J A; 3C95 A; 3OW2 S; 4J9H A; 1X01 A; 1GBR A; 1YI2 A; 4OMF B; 3HFN A; 1AWJ A; 1U1T A; 2DF6 A; 4KH0 B; 3I56 A; 3MJX A; 2VGN A; 1I5L A; 3CXC P; 4ZGE B; 3T9N A; 1VUB A; 1KHI A; 3JB9 F; 3CC2 Q; 2EQK A; 2KRM A; 4RTT A; 4QVD A; 4A4F A; 3G71 T; 1JXO A; 1LNX A; 1X75 C; 4XAX B; 5GAO m; 4FW2 A; 3H41 A; 1AWX A; 4ZTJ A; 2EJG A; 2X3W D; 4C5G A; 3MEA A; 4RTW A; 2KXC A; 1M27 C; 2XID A; 4RTX A; 4EDU A; 1ZSG A; 1BBZ A; 4FYY B; 5FU7 C; 2GTO A; 1NYF A; 3M0U A; 3G71 A; 1PG5 B; 1PC0 A; 2K9G A; 1NG2 A; 3N5B B; 4N4H A; 2RQR A; 3PT9 A; 4BD3 A; 2CKK A; 3QO3 A; 1IZ6 A; 2O01 E; 1QVG P; 2AKK A; 3M53 A; 2D9T A; 4JZ4 A; 3OMC A; 3VV0 A; 2A3L A; 4FL6 A; 2KGT A; 3EH2 A; 3JCM P; 1X2K A; 5GMK i; 4AFS C; 4X9C A; 1PWT A; 2YUO A; 2LNV A; 5LJ3 d; 1UFF A; 1N6A A; 1I07 A; 3EG1 A; 2DA9 A; 2K2M A; 1Q7Y R; 1OU9 A; 1VQ8 A; 3CCE A; 3OYK A; 4M7D D; 1JJ2 P; 1VQ7 T; 1HD3 A; 1NBE B; 4EMH A; 2DER A; 2DTI A; 1X43 A; 2H3J A; 3JCM e; 4WCI A; 1WJR A; 1BKB A; 2OAW A; 4DBR A; 1VQM Q; 3QSU A; 1BI0 A; 5A0G A; 1PSF A; 3RES A; 5DM7 R; 2KRO A; 3V7R A; 2ZPB B; 4V2S A; 2CSQ A; 2JTF A; 2P4T A; 3EG9 B; 2RHZ A; 1B7T A; 1MMA A; 1YBY A; 1XJW B; 2NLU A; 1YIT Q; 1P92 A; 3NTK A; 3TCJ A; 1VIE A; 1S72 A; 1Q81 R; 1RAC B; 1UEC A; 2DNU A; 4LD9 K; 3M59 A; 1WHH A; 4M75 G; 3UT1 A; 3OS0 A; 1PCX A; 4JJN K; 4KT0 E; 3THK A; 3LGL A; 3SB2 A; 3JB9 I; 1IRE B; 2A37 A; 1VYT A; 3RER A; 4KUI A; 1OOT A; 3CCV A; 4C92 F; 1JBM A; 1KC8 C; 1RAG B; 2DBM A; 1D1C A; 5FWB A; 2RQT A; 3OSS C; 2J6K A; 2E41 A; 2DKG A; 3PNW C; 2EWN A; 2EQU A; 2JW4 A; 1K9M U; 2KAF A; 3CMA T; 2F2V A; 5CQX A; 1YIJ Q; 1M90 U; 5LJ3 f; 4XU0 A; 3VJP A; 1KQS P; 1RUW A; 2RJE A; 2RI5 A; 3OYH A; 2KMT A; 2ED0 A; 4J9I A; 3CMA A; 1TTH B; 1M1G A; 1YWO A; 3JCM h; 2Z0W A; 5I22 A; 2F1L A; 2QTV A; 5CKE A; 5LJ5 j; 2RH2 A; 1VQL Q; 1VQN Q; 3ASK A; 4IUP A; 3CC7 T; 3CD6 Q; 2E6Z A; 4IIO A; 3P8B B; 1TOV A; 3PFS A; 2EKH A; 1VQO T; 3X20 B; 2J7I A; 2CP2 A; 1QVP A; 1M2O A; 1UEB A; 2DVE A; 2CZ7 B; 2W0Z A; 1I1J A; 4CC3 A; 3PIP A; 2QA4 Q; 1I8F A; 4QVC A; 4HCB A; 3BDL A; 2G6F X; 2A0F B; 1YI2 Q; 5D7U A; 1M1K R; 4XQ3 A; 1Q86 C; 3REA B; 1EX4 A; 3I56 Q; 2CT3 A; 2MIO A; 3QHS A; 3I55 Q; 1FWZ A; 2D8H A; 2K5F A; 4M77 F; 2QDY B; 3EGU A; 4M7A G; 2QQS A; 4LD6 A; 3INZ A; 2YUQ A; 2FHD A; 5LJ5 e; 2DXC A; 1YHQ T; 3UA7 A; 4D6W A; 2K57 A; 2MWO A; 2ZAE A; 4IUU A; 2XDD A; 4JLG A; 3QWX X; 5I2S A; 2ATC B; 4HVV A; 3ZEH A; 1JU5 C; 3GP8 A; 1Y96 A; 2YWW A; 1T0H A; 1WX6 A; 4BDZ A; 4AFU C; 1UGP B; 3H0F A; 2LX9 A; 4JS4 A; 3CBP A; 2DX1 A; 4VUB A; 4GLM A; 3G71 Q; 2ZPG B; 2YHT A; 2FZK B; 2JUF A; 5GAM j; 1VIF A; 1G3S A; 2DFU A; 3OYD A; 3MHX A; 4J7F A; 4Y28 E; 3QDF A; 2ROL A; 2J06 A; 3CCU T; 5FRM A; 4C8Q B; 1GCQ C; 1G3W A; 2A28 A; 1PKT A; 2RF0 A; 2QK0 A; 1VQK T; 2KRS A; 1SSH A; 2QYZ A; 4PJL A; 1YP5 A; 3JB9 D; 3OW2 A; 2LDM A; 1N5Z A; 3R6N A; 4O5V A; 3QWY A; 2DYI A; 2L89 A; 3C12 A; 3CCU A; 2DLP A; 4HVW A; 3C4S A; 1PRM C; 2OAU A; 5KYU A; 5IXB A; 2FPE A; 2RI2 A; 1VQK A; 3LW5 E; 2QQ9 A; 5GAM e; 5FRN A; 2DRK A; 3GNF B; 1CKA A; 1NPR A; 4FSS A; 4IIM A; 1G3Y A; 3H6Z A; 2YLC A; 4M75 A; 1Q7Y C; 1QCN A; 3EGX A; 1VQ7 Q; 2O4X A; 1OU8 A; 4Z8A A; 1XOV A; 3H9N A; 2E6N A; 4LUD A; 2VVK A; 1UTI A; 3M4Y A; 1XNI A; 2OJ2 A; 3JB9 H; 4M78 G; 2JXB A; 4PJO B; 5CCA A; 2DL4 A; 1KD1 R; 2V1R A; 1UGS B; 1TG0 A; 2J05 A; 1NEB A; 3CCJ T; 5IAY A; 4KUL A; 4B9W A; 1WLP B; 1ZUY A; 3X26 B; 2A08 A; 4C5H A; 3C0C A; 1MHN A; 4WTO B; 5GAN j; 4MML A; 2JM8 A; 2OTJ T; 1LCK A; 5IHK A; 3A98 A; 2IG0 A; 4LNP A; 4OML A; 3KFV A; 3RKX A; 3E19 A; 1Q81 C; 2E3H A; 3BY7 A; 1K0S A; 4B6M A; 2HD0 A; 3MP6 A; 1NE8 A; 2RJF A; 2DJZ A; 2D6F A; 4DA4 A; 4M7A E; 1WFW A; 4ORZ A; 3SWN A; 2FYK A; 4BB7 A; 4E7J A; 3CCL A; 2OTJ A; 2EPD A; 1B3Q A; 2CUD A; 3MEV A; 2EYX A; 1VQ6 Q; 3QJ6 A; 3M0T A; 1K8A R; 1QVF P; 5KYU B; 1VQ5 T; 4FYX B; 4BE0 A; 4OB3 B; 2BZY A; 2RO0 A; 4ME7 A; 4F16 A; 5GAN e; 5KE2 A; 1AVZ C; 1Z9Q A; 4M75 B; 3CCS A; 4O6J A; 2QQR A; 4J9C A; 2RQW A; 4BI3 A; 4FT4 A; 1MGQ A; 1VQ5 A; 3VS1 A; 3JCM Q; 4C92 D; 3VU3 C; 3QYG B; 1D3B B; 2GBQ A; 3OYY A; 2M1H A; 4FW1 A; 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