The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
74
|
structure length |
74
|
Chain Sequence |
GSSGSSGVENLKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSESGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Endocytosis/exocytosis
|
| molecule keywords |
Intersectin 2
|
| publication title |
Solution structure of the second SH3 domain of human intersectin 2 (KIAA1256)
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
11
|
| structure length |
74
|
| sequence length |
74
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-02-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DRM A; 1ZUK A; 2YUN A; 1RUW A; 2DE0 X; 2CSI A; 2HCK A; 2ED1 A; 4F14 A; 2GBQ A; 1NLO C; 3H0I A; 2QDL A; 1X6B A; 2O9S A; 2JM8 A; 2IIM A; 3TVT A; 1HJD A; 1T0H A; 2PTK A; 1I0C A; 2RQU A; 2YT6 A; 3PVQ A; 2GGR A; 3VS6 A; 5FW9 A; 1WLP B; 1JO8 A; 1WXT A; 2KBT A; 1MV0 B; 2A28 A; 1JU5 C; 4LNP A; 2SEM A; 1KFZ A; 2L3Q A; 4JJD A; 1BBZ A; 2JMC A; 4RTW A; 5IHK A; 1Z9Z A; 1RLP C; 2NWM A; 5ECA A; 1CSK A; 3REA B; 2DMO A; 1QWE A; 4OMO A; 2FPD A; 1B07 A; 3U23 A; 2CSQ A; 1X69 A; 1FYN A; 2J7I A; 3I5R A; 2RQT A; 2YDL A; 2EYY A; 1PHT A; 4OMM A; 2LZ6 B; 1E6H A; 3H41 A; 3H0H A; 1SHF A; 2CRE A; 1ZLM A; 1SRM A; 3SHW A; 1QKX A; 2YUP A; 4OMP A; 5HCK A; 2EVR A; 4OMQ A; 1UTI A; 1M3B A; 1YWP A; 2GQI A; 1PRL C; 4J9F A; 2CT3 A; 4OMN A; 1AWO A; 2KE9 A; 2X3X D; 1AWJ A; 3I35 A; 1Y57 A; 2L2P A; 5IHI A; 2RNA A; 1AZG B; 3TSZ A; 1OEB A; 4J9C A; 1OOT A; 2JTE A; 4E6R A; 3M0R A; 2CUB A; 1NYF A; 3A98 A; 2MIO A; 1WI7 A; 1SEM A; 1K0X A; 1W70 A; 1NM7 A; 2CT4 A; 2XMF A; 2YSQ A; 1I1J A; 1MUZ A; 4A63 B; 4J9G A; 2DA9 A; 1LCK A; 1S1N A; 1WX6 A; 2L3S A; 1RI9 A; 1T3S A; 3EG2 A; 3EHQ A; 1FMK A; 1VYT A; 4RUG A; 1KJW A; 3VS3 A; 1M3A A; 1K9A A; 3NPF A; 2OI3 A; 2RQW A; 1ARK A; 1UUE A; 1W1F A; 1NEG A; 3PVL A; 2RN8 A; 2KYM A; 2HEQ A; 2AZS A; 4Z89 A; 5IH2 A; 4CC4 B; 4K11 A; 2J6K A; 3REB B; 4FSS A; 1SRL A; 2DL5 A; 2LJ0 A; 2RQR A; 2A36 A; 1Y0M A; 2E5K A; 1H8K A; 2FG0 A; 3I5S A; 2DNU A; 4JJC A; 1NYG A; 4HVU A; 1H3H A; 1KIK A; 2V1Q A; 1X2K A; 2HBW A; 1VYV A; 2FPF A; 1X43 A; 4OML A; 2D1X A; 4IIM A; 2BZX A; 3VRY A; 1CKA A; 3ULR B; 1ABO A; 3O5Z A; 3NMZ C; 4M4Z A; 2BTT A; 1E6G A; 4RTZ A; 3IQL A; 1T3L A; 4WCI A; 4DEY A; 2CDT A; 2MCN A; 3H0F A; 4DEX A; 2HDA A; 3M0U A; 3JV3 A; 1YP5 A; 2AK5 A; 2OAW A; 2EW3 A; 2KT1 A; 1I07 A; 1NG2 A; 2DRK A; 4HCK A; 4AFZ C; 1SSH A; 2DL3 A; 2C0T A; 2LX7 A; 4CC3 A; 3VS4 A; 1GCQ A; 2JXB A; 1Z9Q A; 4ORZ A; 1YWO A; 1OV3 A; 2KGT A; 3M0T A; 2LMJ A; 1E7O A; 2F2X A; 1UHC A; 2K79 A; 3THK A; 1OPK A; 2K9G A; 3EHR A; 1B3Q A; 3KFV A; 1ZX6 A; 2C0I A; 1K0S A; 2EGA A; 1YNZ A; 3VS5 A; 4RTV A; 2GNC A; 2VWF A; 5IHN A; 1PKS A; 1HSQ A; 1PNJ A; 4CC2 A; 2DX1 A; 3UAT A; 2K2M A; 2H8H A; 4CC7 A; 2CH4 A; 3EGU A; 2A37 A; 3UF4 A; 2J6F A; 1TUC A; 2EYZ A; 3VS7 A; 2KR3 A; 1WIE A; 1G83 A; 2CH4 W; 1GL5 A; 1PKT A; 4AFU C; 1GFC A; 1ZSG A; 2KEA A; 2VKN A; 3QWY A; 2GTO A; 4JZ3 A; 1UJY A; 2ROT A; 1ABQ A; 2DL4 A; 2RF0 A; 3SEM A; 1RLQ C; 3GBQ A; 5FWB A; 2ABL A; 1AWW A; 2FEI A; 2KRN A; 2K6D A; 2ESW A; 1AWX A; 1WFW A; 2BZ8 A; 2DBM A; 4F16 A; 1QKW A; 4HXJ A; 3M0S A; 4Z8A A; 1ZUY A; 2MOX A; 1QLY A; 3RNJ A; 1V1C A; 1QCF A; 1EFN A; 1MV3 A; 2JT4 A; 4JZ4 A; 1ZBJ A; 2EKH A; 2JMA A; 2K3B A; 1UE9 A; 4J9B A; 1W6X A; 2DL7 A; 2A08 A; 1AEY A; 1GFD A; 1T0J A; 2KXC A; 2OJ2 A; 4RTX A; 2DVJ A; 1UDL A; 4D8D A; 1PRM C; 4LUD A; 2PZ1 A; 2NUZ A; 3ZL7 C; 1GBR A; 2AKK A; 2FRW A; 4AFQ C; 1ZUU A; 1GCQ C; 1QWF A; 1N5Z A; 1YN8 A; 4GLM A; 2KYB A; 2W0Z A; 2AKL A; 3RBB B; 2FRY A; 2JM9 A; 2L0A A; 4J9E A; 4HVW A; 5FWC A; 2L3P A; 1GRI A; 1M27 C; 2C0O A; 1TG0 A; 2D0N A; 2EYW A; 1M8M A; 4EIK A; 3EG0 A; 2GTJ A; 2JW4 A; 2O9V A; 1K1Z A; 2BZY A; 2DM1 A; 2F2V A; 1UG1 A; 5I11 A; 3M0Q A; 1CKB A; 1U3O A; 4QT7 A; 1GCP A; 4X1V A; 2LNH B; 2AZV A; 2LCS A; 1JEG A; 2M0Y A; 1UJ0 A; 2EQI A; 2DLP A; 2DBK A; 2ED0 A; 1UFF A; 1K76 A; 2M51 A; 4J9I A; 3VS1 A; 4AFS C; 3M0P A; 4ESR A; 3CQT A; 1JXO A; 1K4U S; 1BB9 A; 1GBQ A; 1NEB A; 2KRO A; 3PE0 A; 2VVK A; 2D8H A; 1SHG A; 2J05 A; 2DIL A; 4AG2 C; 5L23 A; 4R0K A; 2D8J A; 1JQQ A; 1VYU A; 1X2Q A; 4AG1 C; 2B86 A; 1WXU A; 4RTY A; 1VA7 A; 1AD5 A; 2FO0 A; 3LH5 A; 2LQW A; 2ROL A; 1NLP C; 1G2B A; 1KSW A; 2YUO A; 2FPE A; 1M30 A; 1IO6 A; 2DF6 A; 2LJ1 A; 4GBQ A; 2LJ3 A; 3UA6 A; 1M3C A; 4RTT A; 3I9Q A; 2EBP A; 1U06 A; 3VS0 A; 2O2O A; 2O31 A; 1AOJ A; 2K7A A; 4ZNX A; 2KRS A; 2LQN A; 4JPB W; 3R6N A; 1X27 A; 2RPN A; 1HD3 A; 3QWX X; 2J6O A; 3UA7 A; 2ECZ A; 2EYX A; 3VS2 A; 3TSW A; 5EC7 A; 1AVZ C; 4HVV A; 4J9H A; 3NGP A; 4IIO A; 2LP5 A; 5IXF A; 1TUD A; 1WYX A; 1WA7 A; 4J9D A; 1OPL A; 4RTU A; 4D8K A; 2I0N A; 5IXB A; 2ENM A; 2JS0 A; 1WXB A; 2JS2 A; 2P4R A; 4JJB A; 2KNB B; 4Z88 A; 1U5S A; 4LN2 A; 2W10 A; 1H92 A; 1XOV A; 2HSP A; 2EGE A; 5I22 A; 3FJ5 A; 5GJW B; 2YUQ A; 2RMO A; 2DYB A; 2X3W D; 4F17 A; 1YCS B; 2KRM A; 2DL8 A; 4LE9 A; 1BU1 A; 5GJV B; 2F2W A; 1UGV A; 1PWT A; 4KRT A; 3EG3 A; 2G6F X; 2EPD A; 2O88 A; 2PNI A; 2DJQ A; 1UHF A; 2EGC A; 2KT8 A; 2RQV A; 2CUD A; 1A0N B; 1UEC A; 4LUE A; 1AZE A; 3EG1 A; 1X6G A; 3NHN A; 1JXM A; 2SRC A; 1J3T A; 2KXD A; 1BK2 A; 4Y92 A; 3C0C A; 2J06 A; 1SPK A; 1WDX A; 3VRZ A; 2V1R A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1ZUK A; 2YUN A; 2MWO A; 5KYU A; 2OX7 A; 4FIB A; 4M75 G; 3G71 Q; 1NLO C; 3OS0 A; 1RAA B; 2PTK A; 2YT6 A; 2GCX A; 4GY5 A; 5AT1 B; 5A0L A; 2KBT A; 2MWP A; 2EQK A; 1JU5 C; 1KC8 U; 4LNP A; 1KFZ A; 3MO8 A; 1M1F A; 1BBZ A; 3MHX A; 2VC8 A; 2VV5 A; 2KDS A; 3M56 A; 2QGF B; 2GFA A; 1Z9Z A; 2NWM A; 3REA B; 4PFO A; 5LJ5 h; 2DMO A; 1QWE A; 4OMO A; 2F69 A; 1WQW A; 1PC0 A; 1G3T A; 5FU6 B; 1ZSZ C; 1SG5 A; 5HK3 A; 1SHF A; 3SWN C; 3E9F A; 5GAN j; 1R0C B; 3CCM A; 1NJI U; 1Q86 C; 2YUP A; 2RO0 A; 1MGQ A; 3EGX A; 1TWB A; 4F7U B; 5KCO A; 3OSS C; 1KQS P; 2CT3 A; 3CC7 T; 3V7S A; 5IHI A; 1B34 A; 3EFO A; 4L59 A; 3QSU A; 1OEB A; 5GAN 4; 4J9C A; 3L1A A; 1OOT A; 4BB7 A; 1K9M C; 3H8Z A; 3M0R A; 2JOY A; 1OZ2 A; 2V8J A; 3PNW C; 3TU4 K; 1K0X A; 4BI8 B; 1NM7 A; 4OB1 B; 1BCO A; 3GOX A; 3CCM Q; 1S1N A; 1RI9 A; 3F70 A; 3OYK A; 1LVK A; 3I55 A; 5FLX E; 4N0A C; 2B8A A; 1D09 B; 4RUG A; 1ACM B; 4ELY C; 1M3A A; 2OI3 A; 1ARK A; 1NEG A; 3RMS A; 2RN8 A; 1SF9 A; 4OB3 B; 4A4G A; 5IH2 A; 2Y4X A; 3VYH B; 2RQR A; 4A4E A; 2RA2 A; 2E5K A; 3PIP A; 1BI1 A; 4LDX A; 4QVD A; 3AHU A; 1KIK A; 2V1Q A; 1KQ2 A; 1PCX A; 5GAO r; 3CCJ A; 1DJ7 B; 2CP3 A; 1M1G A; 3HRS A; 4YTL A; 3M55 A; 3I55 Q; 2BZX A; 3VU3 C; 1CKA A; 3OS2 A; 4DBF A; 2QI2 A; 3HKS A; 8AT1 B; 4M75 C; 1K8A U; 4DEY A; 4ZGD B; 3OYI A; 4MZP A; 3JV3 A; 1N8R C; 1I07 A; 3ZEH A; 4HCK A; 5LJ5 j; 2DL3 A; 3M9Q A; 3OYB A; 4OB2 B; 2QQR A; 4CC3 A; 4JRK A; 3VS4 A; 1GCQ A; 5LJ3 j; 2JXB A; 8ATC B; 2XDP A; 4R56 A; 2LCL A; 2HQH A; 1YWO A; 4PJO D; 1OV3 A; 3EG9 A; 5GAO q; 3JSC A; 2E1H A; 5CK9 A; 2COZ A; 1VIE A; 3CCJ Q; 2K4Y A; 3EHR A; 3RMQ A; 1R8O B; 1X6O A; 3OBY A; 5IHN A; 2XHC A; 7AT1 B; 2QEX T; 1HSQ A; 1PNJ A; 1BKB A; 5CCA A; 4QQG A; 3O8V A; 4F7U G; 2DX1 A; 4CC7 A; 1BCM A; 2CH4 A; 3X25 B; 2E6Z A; 2CGH A; 1O75 A; 2HAX A; 3AT1 B; 5A0G A; 4UC4 A; 2HL5 C; 1FWZ A; 2DAQ A; 2QQS A; 1QVG S; 2RI5 A; 3MEA A; 1D0Y A; 2RF0 A; 1QCN A; 5KYY B; 4M7A F; 3RUX A; 1YJN A; 2COY A; 2XG8 D; 1YI2 A; 3HP9 A; 5D6Y A; 5HK0 A; 3G4S A; 4FCY A; 4HT8 A; 2QTV A; 2K57 A; 1QLY A; 2DYI A; 2RM4 A; 1QCF A; 1P92 A; 3MEW A; 3QPH A; 4XU2 A; 5CAI A; 5A2Q E; 1EFN A; 1VQP A; 4WF2 A; 1MNE A; 4E7I A; 2JJ9 A; 5CO7 A; 2DL7 A; 2E3H A; 1AEY A; 1NE8 A; 2F1L A; 2OAU A; 2DVJ A; 4C92 D; 1PRM C; 1QMC A; 4HA8 A; 4LDY A; 4DA4 A; 1GBR A; 4OMF B; 1YJN Q; 4P5N A; 2DXC A; 4N4G A; 1YI2 Q; 4GLM A; 3G4S Q; 3RBB B; 2JM9 A; 3JB9 D; 1LPL A; 2L0A A; 2R5A A; 4HVW A; 5FWC A; 1H3Z A; 3EFS A; 1MMA A; 4L6V 5; 4EIK A; 2C0O A; 4E7L A; 1TG0 A; 1UGQ B; 2JW4 A; 2O9V A; 3EAE A; 2D0Q B; 1UG1 A; 4M7D G; 1VQP Q; 3TEE A; 3M0Q A; 3QKJ A; 5CKE A; 4X1V A; 1YHQ A; 1Q7Y R; 2FB7 A; 2AZV A; 3X24 B; 1JEG A; 2BE7 D; 4X9D A; 2OTL A; 2M0Y A; 4OB0 B; 4KBM B; 1XTD A; 1K76 A; 2FHD A; 2M16 A; 1K4U S; 4N4I A; 1N6A A; 4XTX A; 5GAN 3; 2JTM A; 2DK3 A; 2DIL A; 3S3M A; 2P84 A; 5L23 A; 4FM4 B; 4FT4 A; 3DLM A; 1M2V B; 4JUV A; 5FRM A; 1X2Q A; 4XU1 A; 4HT9 A; 4A53 A; 2ZPI B; 1YHQ Q; 1AD5 A; 4C0G A; 2CP2 A; 3CC4 T; 1BI3 A; 1C1A A; 5GAN e; 2XK0 A; 2ROL A; 2OTL Q; 4OVA A; 1U8R A; 5LJ5 d; 1TU0 B; 2DF6 A; 4PJO B; 3Q1J A; 2JTF A; 1YJ9 A; 2MI6 A; 1M3C A; 2QAZ A; 2HBP A; 3I9Q A; 2A7Y A; 1U06 A; 2E64 A; 5CVI A; 2EAY A; 3R6N A; 3PFS A; 4IKF A; 3HRT A; 1Q7Y U; 3VS2 A; 3OYY A; 3TSW A; 2NYS A; 3I55 T; 2QK0 A; 1RAI B; 3KBG A; 3OYD A; 2HKQ B; 4IIO A; 2QA4 T; 2LP5 A; 4MZM A; 1V29 B; 1WYX A; 4LXC A; 3CC7 A; 2QDY B; 1OPL A; 2VUB A; 3E19 A; 4RG2 A; 4PJJ A; 5J26 A; 3SWN A; 1M2O A; 1YJ9 Q; 2LC4 A; 1TS9 A; 1NBE B; 1WXB A; 3DLL A; 4Z88 A; 2YLC A; 1VQK A; 2W10 A; 1VQL A; 3ZFJ A; 2DIG A; 2DXU A; 5I22 A; 1G3S A; 5GAO l; 3CD6 A; 2RMO A; 4EMG A; 3C95 A; 2DYB A; 4IUR A; 5GMK i; 2GQV A; 2DL8 A; 4EPC A; 5GJV B; 2F2W A; 3CCL A; 3OQ5 A; 5DM7 R; 2DZ9 A; 2G6F X; 3CC7 Q; 2O88 A; 4M77 B; 4QW2 A; 3INZ A; 2PNI A; 3A8L B; 5D6W A; 4DOV A; 2CUD A; 1AZE A; 3EG1 A; 4C92 E; 3FB9 A; 2QGG A; 3OSV A; 4IUU A; 4C8Q B; 1SPK A; 1WDX A; 1VQK Q; 3A8G B; 3VRZ A; 4M7D C; 1VQL Q; 1M1K R; 2DRM A; 3ASK A; 4C0F A; 2CSI A; 3LH0 A; 4M75 E; 3QJY A; 3CD6 Q; 2HQE A; 1N27 A; 2IIM A; 3PGG A; 3TVT A; 1WPY A; 2QG9 B; 4EDU A; 4QVC A; 1VQN T; 1HJD A; 1M90 C; 1I0C A; 5C0M A; 9ATC B; 3PVQ A; 1QVP A; 4ZGE B; 4BDY A; 3VS6 A; 3I56 T; 1N9S A; 1WLP B; 1JO8 A; 2JUF A; 1WXT A; 3CCL Q; 2Y4Y A; 2SEM A; 4BE2 A; 4JJD A; 1BI2 A; 2NUP A; 4RTW A; 2H3E B; 1PD1 A; 4C92 A; 2DFU A; 1M9S A; 1CSK A; 1JJ2 A; 1X01 A; 2YRD A; 4PJO G; 5KYN A; 1B07 A; 2FPD A; 1X69 A; 4M75 A; 2WSC E; 3JB9 H; 2J7I A; 3I5R A; 2RQT A; 3L2W A; 2EYY A; 3TQ7 P; 2LQ8 A; 4OMM A; 3H0H A; 3V8L A; 1M8V A; 1D1A A; 5KYX B; 1YJN T; 4JRQ A; 4JS4 A; 2LCC A; 4NL3 A; 2PVG B; 4OMP A; 2QEX A; 1YWP A; 4XTY A; 5D6X A; 1PRL C; 4J9F A; 5GAN h; 4RKU E; 4Y28 E; 4OMN A; 5IT9 E; 3I35 A; 1Y57 A; 2V26 A; 3NFC A; 1VQP T; 4KUI A; 2FL7 A; 5KYW B; 3JCM Q; 3OB9 A; 1Y7X A; 2PVD B; 3A98 A; 3OYA A; 4JLI A; 3OYF A; 2MIO A; 1QVF S; 1SEM A; 3M53 A; 4ANJ A; 3ER0 A; 3CMA T; 1JB0 E; 4XTZ A; 4KUL A; 3P8D A; 3OYG A; 3MP1 A; 1LCK A; 1KC8 C; 1WX6 A; 4CI0 C; 3TCJ A; 2QEX Q; 1Q82 U; 1U1S A; 1K9A A; 3E2U A; 4M78 B; 1W1F A; 5GMK m; 3LWH A; 3RER A; 2E10 A; 1KD1 R; 2IG0 A; 1IGQ A; 4TVR A; 4Z89 A; 2X9H A; 2J6K A; 2PUK B; 2KY9 A; 1SRL A; 2LJ0 A; 1D0X A; 1TOV A; 3PIO A; 4JJC A; 4PL6 A; 4HVU A; 1X2K A; 2HBW A; 4D6W A; 2FPF A; 2ZPH B; 3GNF B; 2XDD A; 1PSF A; 2D1X A; 3JB9 G; 3EH1 A; 4FSX A; 4E7S A; 4M4Z A; 2BTT A; 1E6G A; 2V8K A; 3OMG A; 1IHV A; 1EIF A; 2E12 A; 3M0U A; 3TRE A; 1UEB A; 1TH7 A; 1YP5 A; 2KT1 A; 4F04 B; 4AFZ C; 5GAM f; 3MKD A; 3OYC A; 1Z9Q A; 1VQM T; 4MDW A; 2KSS A; 1YJ9 T; 1UHC A; 3PMI A; 5LJ3 h; 4C5G A; 1X75 C; 4PJO C; 4KGZ B; 1ZX6 A; 1EZZ B; 4FL6 A; 1YNZ A; 3NTH A; 4J7I A; 4MML A; 2GNC A; 4B6M A; 4F7U E; 4B9W A; 3UAT A; 3EGX B; 2AHJ B; 1IRE B; 3OYL A; 4M7A D; 1AT1 B; 4FW2 A; 1TUC A; 2EYZ A; 3CCV T; 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