The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
60
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structure length |
60
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Chain Sequence |
SGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKRE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A novel, specific interaction involving the Csk SH3 domain and its natural ligand.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
TYROSINE-PROTEIN KINASE CSK
|
| molecule tags |
Transferase/hydrolase
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| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
10
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2001-06-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2X3X D; 3NMZ C; 1GBR A; 4GLM A; 4J9F A; 2ECZ A; 4HVU A; 1T3S A; 3I9Q A; 1I07 A; 4LNP A; 1IO6 A; 4ORZ A; 1H92 A; 2J6K A; 2F2X A; 2KYB A; 4DEY A; 2NUZ A; 1AZE A; 1PRL C; 1GL5 A; 1K4U S; 2CT4 A; 2EKH A; 2HDA A; 4J9C A; 3THK A; 3VS1 A; 2OAW A; 1RLQ C; 2DF6 A; 1NYG A; 2A08 A; 2YUQ A; 2M0Y A; 1WA7 A; 2LJ1 A; 4Z8A A; 2L0A A; 2EGA A; 1QLY A; 2LQW A; 2ED1 A; 3I5S A; 3EGU A; 2BZX A; 1K0X A; 1QWE A; 3M0U A; 4JPB W; 4OML A; 4CC4 B; 1NLP C; 3NGP A; 4ZNX A; 3QWX X; 2KRO A; 3C0C A; 5L23 A; 3EG1 A; 1SRL A; 4RTV A; 2DL4 A; 2K79 A; 2DJQ A; 4IIO A; 2EYY A; 5IH2 A; 2GGR A; 1X27 A; 2GTJ A; 1G2B A; 4OMN A; 4LUD A; 1GCQ A; 2L3Q A; 2YUO A; 2FO0 A; 2DBK A; 3I5R A; 4JZ3 A; 1SSH A; 2GQI A; 4JJD A; 2EW3 A; 2BZY A; 4WCI A; 2P4R A; 2DLP A; 2MCN A; 1NYF A; 1WXB A; 1RI9 A; 1PKS A; 2L2P A; 2RMO A; 5I22 A; 1GRI A; 2D1X A; 2K9G A; 1K0S A; 4M4Z A; 1U3O A; 2AZS A; 1TUD A; 1JEG A; 4RTW A; 3GBQ A; 3O5Z A; 3VS6 A; 1ZUK A; 1BK2 A; 2YT6 A; 4HVV A; 5FWB A; 5FW9 A; 5EC7 A; 2OI3 A; 2EYZ A; 2J6O A; 1SHF A; 2AZV A; 2K2M A; 2J06 A; 5IHN A; 1MV0 B; 1CKB A; 3ULR B; 1U06 A; 4AG1 C; 1AWJ A; 1GFD A; 1OV3 A; 1J3T A; 4F14 A; 1UTI A; 5GJV B; 2EVR A; 1PWT A; 1UDL A; 1KJW A; 2BTT A; 1JQQ A; 3EHQ A; 1WIE A; 2RQU A; 1BU1 A; 2HEQ A; 1NEG A; 2FEI A; 3VRZ A; 1CKA A; 2KT1 A; 2KXD A; 2MIO A; 3EG0 A; 2DMO A; 3REA B; 1UFF A; 2GBQ A; 1JXO A; 2XMF A; 1AEY A; 2EGC A; 2C0I A; 2CH4 A; 2RF0 A; 4HXJ A; 2ABL A; 2FPE A; 4IIM A; 4OMO A; 2FRY A; 2LNH B; 1OOT A; 1T3L A; 2AKK A; 1UUE A; 2KXC A; 2JTE A; 4JJC A; 1CSK A; 2CSI A; 4EIK A; 1ZBJ A; 5FWC A; 2SRC A; 2FPF A; 4Z89 A; 3UA6 A; 2DA9 A; 2JMC A; 4J9E A; 2K6D A; 1QKW A; 2LX7 A; 1GCP A; 3U23 A; 1AWW A; 1UG1 A; 2JMA A; 4LUE A; 1WLP B; 1GBQ A; 2DIL A; 4HCK A; 2C0O A; 3VS7 A; 1UJ0 A; 3CQT A; 1WFW A; 2FPD A; 2KRN A; 1OEB A; 1E6G A; 4AFS C; 2DRM A; 2J6F A; 1KSW A; 1FMK A; 3M0T A; 3M0P A; 1GCQ C; 1B3Q A; 3KFV A; 1S1N A; 3VS0 A; 2AKL A; 4RTZ A; 1NEB A; 1ARK A; 3EG3 A; 2M51 A; 4R0K A; 1BB9 A; 2LQN A; 1ZUU A; 2DX1 A; 3EG2 A; 2CH4 W; 4JJB A; 2A28 A; 4AG2 C; 1PRM C; 5GJW B; 4OMP A; 4DEX A; 1JXM A; 4Y92 A; 1WDX A; 2EBP A; 1I0C A; 2CDT A; 2FG0 A; 1V1C A; 5IHI A; 1W6X A; 3NPF A; 4LE9 A; 2DBM A; 1NM7 A; 1UJY A; 3VS4 A; 2DYB A; 1ABQ A; 2JXB A; 2KEA A; 2FRW A; 3RBB B; 4CC7 A; 1AZG B; 4K11 A; 1MUZ A; 2PNI A; 1XOV A; 2LCS A; 2EYX A; 3IQL A; 2KYM A; 1AVZ C; 2AK5 A; 2VKN A; 1ABO A; 2LP5 A; 3ZL7 C; 1Z9Q A; 2O88 A; 1WX6 A; 1YP5 A; 1ZSG A; 1W70 A; 1E6H A; 4OMM A; 1K1Z A; 1T0J A; 4JZ4 A; 4RTU A; 2JT4 A; 4RTT A; 1JO8 A; 3RNJ A; 1UHF A; 3A98 A; 2I0N A; 2DM1 A; 1HJD A; 2DNU A; 2D8J A; 2V1R A; 2DRK A; 2DVJ A; 3UF4 A; 1U5S A; 1K9A A; 2KR3 A; 3M0Q A; 1H3H A; 1WXT A; 2DL7 A; 2HSP A; 2B86 A; 2A37 A; 2KBT A; 4F17 A; 1OPK A; 4QT7 A; 1YN8 A; 4D8D A; 1VYT A; 2YSQ A; 1UHC A; 1SHG A; 2ED0 A; 2CT3 A; 1WXU A; 3VS2 A; 3VS3 A; 1WI7 A; 2L3S A; 4J9H A; 2PTK A; 1OPL A; 2KT8 A; 2ROT A; 3VRY A; 1T0H A; 2SEM A; 2RQT A; 1SEM A; 1QCF A; 2X3W D; 2CUB A; 2JM8 A; 3M0R A; 2BZ8 A; 4RUG A; 2YUP A; 1AOJ A; 2YDL A; 2V1Q A; 4A63 B; 2O2O A; 1ZLM A; 1KFZ A; 5HCK A; 1A0N B; 1PHT A; 3R6N A; 2D0N A; 2K7A A; 1RUW A; 1TUC A; 4LN2 A; 2VWF A; 3REB B; 1QWF A; 2RPN A; 1KIK A; 4HVW A; 1AWX A; 4J9I A; 2O9S A; 2CRE A; 4RTX A; 1N5Z A; 2RNA A; 2F2V A; 2O9V A; 2EPD A; 3H0F A; 3H0I A; 2IIM A; 2KGT A; 2O31 A; 2W10 A; 2RQV A; 2RQW A; 4F16 A; 5IXB A; 2QDL A; 1UEC A; 3SEM A; 5ECA A; 3PVQ A; 1VYV A; 4J9D A; 2MOX A; 4RTY A; 1X43 A; 1YWP A; 1M27 C; 3TSW A; 4J9G A; 3M0S A; 2EGE A; 2YUN A; 2NWM A; 1YWO A; 3H41 A; 1H8K A; 1MV3 A; 1EFN A; 3UAT A; 2J05 A; 2KRM A; 1AWO A; 1WYX A; 1M3A A; 2KNB B; 3H0H A; 1M8M A; 2E5K A; 4AFQ C; 1NG2 A; 1X69 A; 1SPK A; 4KRT A; 2GTO A; 1VYU A; 2LMJ A; 4ESR A; 2DE0 X; 1HD3 A; 4CC3 A; 4AFU C; 5I11 A; 1BBZ A; 1X6B A; 1QKX A; 1ZUY A; 1NLO C; 4X1V A; 3QWY A; 2EQI A; 4OMQ A; 1AD5 A; 3TSZ A; 3LH5 A; 2LJ3 A; 2DL3 A; 1X2Q A; 2DL8 A; 4J9B A; 2JS2 A; 2OJ2 A; 3FJ5 A; 1UGV A; 1GFC A; 1W1F A; 4FSS A; 3PE0 A; 1TG0 A; 1SRM A; 1JU5 C; 2JW4 A; 2PZ1 A; 1E7O A; 2LZ6 B; 5IXF A; 1K76 A; 2D8H A; 2K3B A; 2ENM A; 3TVT A; 1RLP C; 2JM9 A; 1Y0M A; 2A36 A; 2F2W A; 3EHR A; 2EYW A; 2KE9 A; 1LCK A; 3I35 A; 1X2K A; 1HSQ A; 3NHN A; 1PNJ A; 1I1J A; 2ROL A; 1Z9Z A; 4E6R A; 1X6G A; 2KRS A; 4AFZ C; 1ZX6 A; 3UA7 A; 3VS5 A; 4Z88 A; 2ESW A; 1G83 A; 3SHW A; 2JS0 A; 2RQR A; 1UE9 A; 1B07 A; 3JV3 A; 2H8H A; 1YNZ A; 2RN8 A; 2HBW A; 1YCS B; 4GBQ A; 2DL5 A; 2W0Z A; 2G6F X; 2GNC A; 4CC2 A; 3PVL A; 1M30 A; 2CSQ A; 5IHK A; 1M3C A; 2C0T A; 1VA7 A; 1PKT A; 2HCK A; 2CUD A; 2VVK A; 1Y57 A; 1M3B A; 4D8K A; 2LJ0 A; 1FYN A; 2J7I A; 2L3P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3OW2 P; 3CCM A; 3NMZ C; 1QVF A; 1PCX A; 5GAN 2; 2GFU A; 4D6W A; 1I07 A; 3T9N A; 1IO6 A; 2DYI A; 3OA6 A; 2NUZ A; 2XG8 D; 3HRS A; 1K4U S; 2CT4 A; 2EKH A; 3VUB A; 2HDA A; 2FZK B; 4A4E A; 3G71 A; 2QQ9 A; 1RLQ C; 3ME9 A; 4ZGE B; 2NYS A; 4OGC A; 4C0F A; 1VQP Q; 1YJW A; 2CP7 A; 1N6A A; 2AHJ B; 5CQX A; 1QVG A; 5A0D A; 2ED1 A; 1G5V A; 1D09 B; 1PG5 B; 2RM4 A; 4F7U G; 4OML A; 3NGP A; 4ZNX A; 3HFO A; 2EQU A; 5CQY A; 3OS5 A; 2F5K A; 2KRO A; 3EFR A; 2XD0 A; 2DK3 A; 3C0C A; 5L23 A; 1YIT A; 2DL4 A; 3L2Q A; 3PNW C; 1U8R A; 5IH2 A; 1XTD A; 4M7A C; 1R0C B; 3CC2 T; 1H64 1; 5DY9 A; 1EIF A; 4EMG A; 3OMC A; 1GCQ A; 3NFC A; 3I5R A; 4JZ3 A; 6AT1 B; 1SSH A; 3OBY A; 2EW3 A; 3TEE A; 2BZY A; 2XDB A; 2P4R A; 2RB6 A; 4HCZ A; 5CCA A; 5LJ5 f; 4FYY B; 4N4I A; 5KH6 A; 1M90 C; 2RMO A; 1YI2 A; 1K0S A; 2AZS A; 1TUD A; 4M7D D; 5GMK i; 3RMS A; 3O5Z A; 1VQ8 A; 1YFN A; 1ZUK A; 3VS6 A; 2YT6 A; 4HVV A; 5FWB A; 2QK0 A; 3CCR A; 2J6O A; 2E41 A; 1SHF A; 2ZPI B; 2K2M A; 3P8H A; 3A8M B; 4AG1 C; 4KGV B; 1J3T A; 3LGL A; 5FRO A; 5IN1 A; 2FZC B; 1MNE A; 5GJV B; 2OTL A; 1H3Z A; 1ACM B; 3J81 E; 1KJW A; 1WIE A; 1BU1 A; 1RAD B; 1NEG A; 1R77 A; 3ZBD A; 5GAO r; 1Q81 C; 3OYB A; 4HA8 A; 1CKA A; 2LQK A; 5FRN A; 3V8K A; 4XAX B; 1VQ5 Q; 2DMO A; 3TU4 K; 1JXO A; 2XMF A; 4JJN K; 3PMI A; 4JRP A; 1OU9 A; 2IG0 A; 2MK5 A; 5FRM A; 2EGC A; 4OB0 B; 2COW A; 2RF0 A; 4HXJ A; 2ABL A; 1VUB A; 3G4S A; 3A1P A; 3JCM d; 1YJ9 A; 4OMO A; 3OB9 A; 2LNH B; 3QDF A; 3NTH A; 2QI2 A; 1Q82 R; 5GAN 5; 4ZTJ A; 2JTE A; 4EIK A; 3MKD A; 3QSU A; 1ZSZ C; 2FPF A; 2D6F A; 2JMC A; 2K6D A; 2LX7 A; 1AWW A; 3JB9 F; 2JMA A; 4LUE A; 4N0A A; 5J3B A; 2A3L A; 2DTH A; 2C0O A; 3VS7 A; 3D7S B; 5D7U A; 2HBP A; 1E6G A; 4PJO D; 3CPW P; 4JS4 A; 3JRZ A; 3V7S A; 4AFS C; 1UGP B; 1VQN T; 1FMK A; 2V8K A; 2X4Y A; 4FCY A; 4BY6 B; 1K8A R; 4CRI A; 2ZCF B; 4FW2 A; 4ATO A; 1NEB A; 2M51 A; 4QW2 A; 4R0K A; 3HRT A; 2K5L A; 2PVD B; 2DX1 A; 1TSF A; 1LNX A; 3EG2 A; 5KYY B; 1X01 A; 3FRN A; 2A28 A; 4C0G A; 1MMD A; 1VQ5 T; 1V29 B; 1JXM A; 2P0K A; 3CCQ Q; 1ZA2 B; 1V1C A; 1W6X A; 4FT2 A; 1VQ4 A; 3MEU A; 2E12 A; 2M0O A; 1VQL T; 2JXB A; 2KEA A; 2L8D A; 3MP6 A; 4CC7 A; 1AZG B; 2ZPH B; 2DAQ A; 3CCL Q; 1AVZ C; 5GMK h; 2VKN A; 1ABO A; 1I8F A; 2LP5 A; 4BB7 A; 4XTZ A; 5A0G A; 3CCS Q; 4RTT A; 4BI3 A; 2IPO B; 2K3Y A; 2BIV A; 1HJD A; 1S72 Q; 1NPR A; 3C94 A; 3QJY A; 4M7D G; 2JZ2 A; 1U5S A; 3RDV A; 3M0Q A; 2LX9 A; 1KQS S; 2P84 A; 3RUX A; 1YN8 A; 2WSE E; 3X26 B; 2YSQ A; 4DOV A; 1KHC A; 1FX7 A; 2XU8 A; 2ED0 A; 2E64 A; 1TS9 A; 1WXU A; 4ZN3 A; 3RMQ A; 1NPP A; 3VS2 A; 2FYK A; 2L3S A; 4FT4 A; 3L42 A; 1OPL A; 3VRY A; 2Y4Y A; 1ZHI A; 2SEM A; 1PM3 A; 1HYO A; 4X34 A; 4X9C A; 1KC8 U; 2MWP A; 2JUF A; 2MPX C; 4ZGJ B; 1Y96 B; 1IXD A; 4MDW A; 4QVZ A; 4C92 C; 4E7K A; 1BI0 A; 3CXC A; 1VQ7 Q; 3CD6 A; 1A0N B; 3R6N A; 1TUC A; 4C5I A; 1I81 A; 2EQJ A; 3JSC A; 3CCL T; 1AWX A; 2ZPB B; 2CRE A; 4ELZ C; 1UEB A; 2RNA A; 2DPP B; 1Q82 U; 1XNI A; 2F2V A; 2CZ1 B; 4PLL A; 3CC4 A; 2IIM A; 3I55 Q; 4OF1 A; 2RH2 A; 4O6J A; 3CCS T; 1Q81 R; 2OAU A; 1S72 T; 2MMP A; 4EMH A; 4FW1 A; 4FIB A; 1WJS A; 4OVA A; 1HK9 A; 4PJO G; 1M27 C; 3TSW A; 2NWM A; 3OYY A; 3SWN B; 3GOX A; 4RCC A; 1H8K A; 3LYI A; 1M1K R; 1LVK A; 1K8A U; 2E6Z A; 2KRM A; 1AT1 B; 1WYX A; 3X20 B; 8ATC B; 4QVC A; 4FU6 A; 3UDC A; 3KXT A; 2DE0 X; 1BBZ A; 1ZUY A; 3HPW A; 3M55 A; 1M1F A; 2D0Q B; 3QWY A; 4OMQ A; 2IVW A; 3TSZ A; 1Y96 A; 2LJ3 A; 3QII A; 4E7Z A; 4QQ6 A; 1WGS A; 1G3W A; 2H3E B; 1Q86 R; 3M9Q A; 1OU8 A; 2OJ2 A; 4RG2 A; 1GFC A; 2ZAE A; 1OZ2 A; 4XTX A; 3GLX A; 4DBR A; 1SRM A; 2JW4 A; 1PD0 A; 2D8H A; 4J6X A; 1N27 A; 1I4K 1; 3EHR A; 3QYG B; 1LCK A; 4LDY A; 3I55 T; 4MDX A; 1HSQ A; 4OMF B; 5FU7 B; 2GFA A; 1IHW A; 3L2R A; 1Z9Z A; 5KYX B; 4BUG A; 1O9S A; 3M56 A; 2DTO A; 2F5T X; 1UB4 A; 4C8Q B; 1K73 C; 1ZX6 A; 4Z88 A; 2JVV A; 2DIG A; 3SHW A; 3CMA A; 2RQR A; 4M75 B; 1UE9 A; 1MMA A; 2OX7 A; 1YNZ A; 1SF9 A; 2RN8 A; 3MCA B; 4PNO A; 3SWN A; 1SSF A; 1IRE B; 3UWN A; 1QVF P; 2CP3 A; 2W0Z A; 2WSF E; 5GAN d; 2RI3 A; 1M2V B; 2DVE A; 4LDU A; 3UT1 A; 3X24 B; 3PVL A; 1M30 A; 1X75 C; 5IHK A; 2HQX A; 2C0T A; 5KE3 A; 1RAA B; 2CZ7 B; 2CUD A; 1M90 U; 2FVU A; 1Y57 A; 2ZPF B; 3RR6 A; 1HXD A; 1VQ9 Q; 2QA4 T; 4M77 D; 5GMK j; 1JJ2 S; 2H3J A; 1QVG P; 4A54 A; 3JCM g; 2DJZ A; 2ECZ A; 2B8A A; 5GAM g; 2DIQ A; 2OTJ Q; 2KAF A; 4IUQ A; 2YRD A; 3VU3 C; 1IHV A; 1D0X A; 2X35 A; 4L59 A; 4ORZ A; 4BI4 A; 7AT1 B; 1JRI A; 2M02 A; 3JCM c; 1RAI B; 2DF6 A; 2M0Y A; 4MZT A; 4NS5 A; 3OYN A; 5GAN e; 5KYX A; 2L0A A; 1Q81 U; 4C8Q A; 4LXC A; 2YRC A; 4C8Q E; 2DZ9 A; 2LQW A; 2K4Y A; 4QKU A; 4M75 A; 2AT1 B; 2LRQ A; 3I5S A; 5LJ5 d; 2QGG A; 1W2B P; 1GXI E; 3CC7 A; 1QWE A; 4XU2 A; 2RK2 A; 4JPB W; 4CC4 B; 4EPC A; 4RG8 A; 2E1H A; 1Y71 A; 2YXY A; 3G6E Q; 3E9F A; 2RK1 A; 1SRL A; 4C92 F; 5HK0 A; 4F04 B; 2K79 A; 2DJQ A; 3EGX B; 2GTJ A; 2LQ8 A; 2EQK A; 1G2B A; 5CK9 A; 1VQ9 T; 2YUO A; 2FO0 A; 2DBK A; 3CBP A; 4M78 C; 1KD1 C; 1K9M C; 2DET A; 2MCN A; 4O5V A; 1RI9 A; 1PKS A; 5J39 A; 2L2P A; 2OTJ T; 1GRI A; 2DXT A; 2D1X A; 2K9G A; 4M4Z A; 4NL3 A; 4RTW A; 1VQK Q; 4R55 A; 1BK2 A; 2DXC A; 3I56 T; 3VV0 A; 3CCU A; 5LJ5 e; 2EYQ A; 4BE2 A; 1TXQ A; 2MF2 A; 2EYZ A; 1WHJ A; 1RAH B; 2J06 A; 3JCM b; 4A53 A; 4EMK B; 5IHN A; 1MV0 B; 1CKB A; 2CZ0 B; 2CP5 A; 2RI2 A; 2ZGW A; 3RKY A; 4PFP A; 1UTI A; 2QXF A; 2QTV A; 1YBY A; 2M9U A; 3CME A; 3EHQ A; 2BTT A; 1U1S A; 3FC3 A; 3SB2 A; 5DLQ E; 4F7U A; 2KXD A; 3EG0 A; 2XHC A; 2JJ9 A; 3G6E T; 1AEY A; 5D6Y A; 8AT1 B; 2CKK A; 2CH4 A; 2FHD A; 3OS2 A; 3HRU A; 3EGX A; 4IIM A; 5CAI A; 1B34 A; 1R8O B; 3BDL A; 2FRY A; 1OOT A; 1YJ9 Q; 2LNV A; 4KT0 E; 2RI5 A; 1K73 R; 3HL8 A; 3WVE B; 5IT9 E; 1CSK A; 2CSI A; 4M77 G; 3JCM h; 3X25 B; 4Z89 A; 2BE7 D; 2DA9 A; 3DKM A; 5GAM h; 2EWN A; 4BE1 A; 1UG1 A; 1YIJ Q; 4HCK A; 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