The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3G6E Q; 3CC2 Q; 2OTJ Q; 1VQK Q; 1Q7Y R; 3I55 Q; 2QA4 Q; 1K8A R; 1Q81 R; 3CCL Q; 3CD6 Q; 3G4S Q; 3CCS Q; 1VQ8 Q; 2QEX Q; 1VQ6 Q; 1VQ4 Q; 1QVF P; 3CME Q; 3OW2 P; 1YJW Q; 3CCQ Q; 3CC7 Q; 1M1K R; 1VQP Q; 1YJ9 Q; 3CCU Q; 1YHQ Q; 3CPW P; 1YIT Q; 3CMA Q; 1S72 Q; 1Q82 R; 1VQ7 Q; 3CXC P; 1YJN Q; 1VQM Q; 1YIJ Q; 1K73 R; 1YI2 Q; 3CCV Q; 1QVG P; 1Q86 R; 1KC8 R; 1M90 R; 3CCE Q; 3CC4 Q; 1K9M R; 1JJ2 P; 1NJI R; 1VQ9 Q; 1VQL Q; 3CCM Q; 1N8R R; 3CCJ Q; 1KD1 R; 3CCR Q; 3I56 Q; 1W2B P; 1VQ5 Q; 2OTL Q; 3G71 Q; 1VQN Q; 1VQO Q; 1KQS P; #chains in the Genus database with same CATH topology 2HZY A; 3QKJ A; 1PWT A; 2XD0 A; 3VS0 A; 3JCM Q; 1AWO A; 1MV0 B; 3PGG A; 2GCX A; 1WFW A; 2ZGW A; 4PFZ A; 4EPC A; 1UGR B; 3REB B; 1ZQ1 A; 2KEA A; 4E47 A; 2RD1 A; 4RTZ A; 2BE7 D; 2K2V A; 4J9H A; 3CPW A; 1DJ7 B; 2V8J A; 4IIM A; 2DXT A; 2KT1 A; 1QP3 A; 4M75 E; 2DRK A; 3GNF B; 5FRM A; 2FZC B; 3CCJ T; 3CCR T; 2OTL T; 2JM9 A; 3TU4 K; 2YXY A; 1AD5 A; 2WSF E; 3M53 A; 4FSX A; 3TVT A; 4C8Q C; 2KR3 A; 2JTF A; 2YLB A; 2FZK B; 4Y92 A; 1QKX A; 1PSF A; 1WJS A; 1C0M A; 1VQK Q; 1N5Z A; 4J9C A; 2DVE A; 5GAM h; 4FIB A; 4JJC A; 4C0G A; 2O4X A; 3V8L A; 1S1N A; 2HMA A; 3M0Q A; 2YRD A; 2JXB A; 4B9X A; 2E3I A; 3S3N A; 2DTO A; 5I2S A; 1PRM C; 4DOW A; 3VKI A; 1OI1 A; 2DX1 A; 1UHF A; 1Q86 R; 3NFC A; 4C8Q B; 5KE3 A; 4J9G A; 4JPB W; 2BZX A; 1Y57 A; 1M4Z A; 2XG8 D; 1PHT A; 3AT1 B; 1Y7X A; 2FEI A; 3G6E Q; 4C5G A; 4DEX A; 3CD6 Q; 3PVQ A; 2OI3 A; 4XTU A; 3JCM W; 3JCM P; 4LXC A; 2B86 A; 2Y4Y A; 3TEE A; 4FT2 A; 4L59 A; 1FX7 A; 2CZ7 B; 1H3Z A; 3L1A A; 1YJN Q; 3CC2 A; 3VS3 A; 4PKC C; 2KI7 A; 4F7U F; 4M78 E; 4A4F A; 1VQ6 A; 2L3R A; 3JCM c; 2EGC A; 1GCQ C; 5FU7 B; 2VV5 A; 3FC3 A; 2VKN A; 4O5V A; 2F2V A; 2BTT A; 2FRY A; 2COY A; 3C95 A; 1WHJ A; 3FIF A; 5HKC A; 1VQO T; 1M1K R; 2QQR A; 3H41 A; 4J9I A; 3EGD A; 3JCM g; 3OBW A; 2YLC A; 4JZ3 A; 2K5I A; 4QVD A; 2JVV A; 4N4G A; 3A8M B; 3M0T A; 1CSK A; 2KAF A; 2L3Q A; 4J6Y A; 4B9W A; 3OQ5 A; 1JEG A; 3CC2 T; 4HVU A; 4HKE A; 4EDU A; 1VQP Q; 5DY9 A; 3PE0 A; 4E6R A; 1VQ6 T; 2NYS A; 1I07 A; 5A2Q E; 3PFS A; 2P4T A; 1G2B A; 4OF1 A; 2SRC A; 1SF9 A; 2E4H A; 1SSH A; 2I0N A; 3CEY A; 4HCB A; 3GF5 A; 1BI2 A; 1X69 A; 4ATO A; 2DNU A; 1PD1 A; 3CCS Q; 5J39 A; 1OEB A; 4Z89 A; 1NE8 A; 1PSE A; 2YUP A; 3C12 A; 2KQW A; 3JCM b; 3OYA A; 2ABL A; 2RJE A; 1UEC A; 3I56 A; 3X28 B; 1ABQ A; 2HKN A; 2COW A; 1AWX A; 4QQ6 A; 1K9M R; 2LJ1 A; 4L5G A; 2YT6 A; 5GAM e; 5LJ3 h; 2QEX A; 3JB9 F; 4FYX B; 2FPE A; 3CXC A; 1NJI U; 2HL5 C; 1UDL A; 5D6W A; 2DYI A; 1XQH A; 2V1R A; 3OSV A; 4KGV B; 4MDW A; 2HSE B; 2QXF A; 1B3Q A; 3EH2 A; 2ZZD A; 4CC2 A; 4M7D A; 2DXB A; 2FO0 A; 5EC7 A; 1B34 A; 1MNE A; 2MWP A; 2KT8 A; 3EG9 A; 5CKD A; 2Z0W A; 4WTO B; 4V2S A; 2LQK A; 1VIF A; 2JMA A; 3I56 T; 3M57 A; 3L2V A; 2OAU A; 3CCQ Q; 2H3J A; 2KMT A; 1EIF A; 4PJM A; 5KYX A; 3CCU Q; 2LMJ A; 1TSF A; 4KRT A; 1VQ8 Q; 5CR2 A; 3OYH A; 2QEX T; 4JDS A; 1M1F A; 4GLK A; 4PJO G; 5CK9 A; 4M4Z A; 2DLP A; 3EG1 A; 5CAI A; 2DL8 A; 5GAN h; 2KYM A; 4C92 F; 1GL5 A; 1KK7 A; 2V26 A; 5HK3 A; 1VQL A; 2VC8 A; 5GAO m; 1H92 A; 3LWH A; 3HFN A; 2W10 A; 1YJ9 Q; 5J3B A; 4ZGE B; 2E12 A; 2JMC A; 3QUI A; 2PUO B; 2QQB A; 3S3M A; 1M90 R; 3M9Q A; 2AT1 B; 2F1L A; 1VQ9 Q; 3CCL A; 1RLQ C; 3VUZ A; 3M58 A; 1GXI E; 2O4X B; 3EFO B; 4N4I A; 3M0R A; 3O8V A; 1VQ7 A; 1D1C A; 2KXC A; 2D9T A; 1VQ4 Q; 2GTO A; 1I5L A; 2RK2 A; 4M75 A; 2RH2 A; 2QYZ A; 4M77 C; 2J06 A; 3OMC A; 5GAM j; 4ELY C; 3M0U A; 1NPR A; 2J6K A; 2D6F A; 1SG5 A; 1AHJ B; 1D09 B; 1B7T A; 2QI2 A; 1KD1 R; 2MI6 A; 2CH4 A; 4QQD A; 3OBY A; 2Y90 A; 5AT1 B; 3CPF A; 1I1J A; 4M77 D; 4C5E A; 3SEM A; 4XK8 E; 4RTV A; 2QTV A; 2D1X A; 2G3R A; 2LNH B; 1I4K 1; 3CCL T; 5LJ3 e; 4M77 B; 1D0Y A; 3CC4 Q; 1N8R C; 4XQ3 A; 4F16 A; 2O88 A; 2OAW A; 1ZSZ A; 2RF0 A; 1BU1 A; 4Y91 A; 1VQ7 T; 5KYW A; 4RTW A; 2CRE A; 1SPK A; 1T3L A; 1YJN T; 4J9E A; 2AIR B; 2ECZ A; 4PFO A; 5GAN 3; 2CP5 A; 1BI0 A; 2HBW A; 3EGD B; 3CBP A; 5LJ5 e; 2CP0 A; 4RKU E; 1NG2 A; 2DL5 A; 1XJW B; 1ZBJ A; 3VS1 A; 4M7D F; 1G3T A; 2KGT A; 4BY6 C; 3X24 B; 1O9S A; 1BI3 A; 2CP6 A; 4J6W A; 4KUL A; 4PFP A; 2K4Y A; 2RQW A; 1VUB A; 4E7L A; 4IUR A; 2QTX A; 1KQS P; 1IHW A; 3UAT A; 3VUB A; 3V8J A; 4M78 A; 2RB6 A; 2DE0 X; 1JXM A; 4ZN1 A; 2FZG B; 1WQ7 A; 1BIB A; 2KRN A; 2PQW A; 3QZ9 B; 3RNJ A; 2VWF A; 2DPP B; 1H8K A; 1G83 A; 3CCM A; 1WPY A; 1K73 C; 2RJD A; 4IUP A; 4BY6 B; 1WXT A; 3CCJ Q; 3CCR Q; 5GAN e; 4BI8 B; 1VA7 A; 1RL2 A; 3EHR A; 4FCY A; 1Q7Y R; 4N0A C; 4F17 A; 3INZ A; 2E1H A; 2DZ9 A; 2RN8 A; 3FB9 A; 3VYG A; 4M7D C; 4XTZ A; 4KH0 B; 3H8Z A; 1K9M C; 3OYG A; 7AT1 B; 3QO3 A; 4M7A G; 1Y0M A; 2LX9 A; 1W1F A; 1U06 A; 4XU0 A; 3ZL7 C; 1YCY A; 2LCS A; 4IUU A; 4XU3 A; 2O31 A; 2AK5 A; 1HSQ A; 2CT3 A; 5GMK l; 2A3L A; 4M75 F; 3CCM T; 1YI2 A; 2DER A; 4NL2 A; 5LJ3 j; 2LJ0 A; 2PU9 B; 5IN1 A; 2X4Y A; 4OMM A; 4M7D B; 2OX7 A; 1M2O A; 2KE9 A; 4ZNX A; 2X4X A; 1B34 B; 4M77 E; 5FWC A; 3EG9 B; 3MKD A; 2PVO B; 5FRN A; 2KY9 A; 2KBT A; 5LJ5 j; 4VUB A; 4C5H A; 5DLO A; 1UJY A; 1YHQ A; 3A8L B; 1VQM A; 5KYX B; 3NHN A; 2CUD A; 1TU0 B; 2RPN A; 1VQN A; 2E10 A; 3FDR A; 3VJP A; 2KDS A; 1D0X A; 2L3P A; 3A98 A; 1BCO A; 2DIG A; 3DB4 A; 3P8B B; 3EFS A; 1PKS A; 2GFA A; 1YI2 T; 2K2M A; 3ULR B; 5GAN f; 3GNG A; 3NMZ C; 2L89 A; 3TQ7 P; 2G6F X; 2M0O A; 4DBQ A; 1ZHI A; 1N6A A; 1YNZ A; 2QG9 B; 1Q82 C; 1VQ5 A; 1M90 C; 1WHH A; 3M5A A; 1M3B A; 3JCM e; 2JTM A; 5GAN j; 2OTJ A; 3PNW C; 2YUN A; 4DBF A; 4M78 F; 2V1Q A; 3CC2 Q; 1VQM T; 3SWN A; 3UA6 A; 4J7I A; 3MP8 A; 5GAM d; 2X4J A; 1VQN T; 2LQN A; 2KVQ G; 1VQ6 Q; 3LX7 A; 4BUG A; 1GCQ A; 1ZSZ C; 2ZPH B; 3L2R A; 3CPW P; 4YTL A; 5I2M A; 1WI7 A; 1AZE A; 4E2F B; 1EZZ B; 2WSE E; 5ECA A; 3MO8 A; 2MOX A; 3ZEH A; 1KD1 C; 1OUL A; 4J9F A; 1MMD A; 2RM4 A; 2IPO B; 3SDZ A; 1Y71 A; 1P92 A; 3JB9 I; 3CME A; 2ROL A; 4A54 A; 3NPF A; 4C0D C; 2F69 A; 1UGQ B; 2GGR A; 4FL6 A; 4AFQ C; 2LDM A; 1RUW A; 5A0G A; 4LDW A; 4J8O A; 1VQ5 T; 1UHC A; 1B07 A; 2CZ1 B; 4HVV A; 2OTJ T; 4LDX A; 2R57 A; 3BW1 A; 2X35 A; 3FJP A; 1ZSZ B; 2L8D A; 5FLX E; 5KYW B; 3QJY A; 4PJJ A; 2KK4 A; 2CSI A; 2F2X A; 4MML A; 2JNG A; 1PD0 A; 2CYZ B; 2X3W D; 2M51 A; 1QVG S; 2EYW A; 4C0D B; 3WVE B; 5CQY A; 4ZN3 A; 3QXE B; 2DJQ A; 5HY6 A; 2E5K A; 1G3Y A; 1R77 A; 1W70 A; 4BE0 A; 2K6D A; 3CME T; 1GCP A; 3Q1J A; 3OY9 A; 3I56 Q; 3H9N A; 4JJB A; 2JJ9 A; 4XTV A; 3OYJ A; 4WCI A; 3X20 B; 4A4G A; 1N8R U; 4AMC A; 3KFV A; 2QEX Q; 4EMK A; 3AHU A; 1WNL A; 3VS7 A; 2E5Q A; 2M9U A; 3S3O A; 1UGV A; 1YWO A; 3A8H B; 3H6Z A; 2MCN A; 3HFO A; 1JQQ A; 3F70 A; 1ZSG A; 2A0F B; 5GAN 7; 3CXC S; 1PRL C; 4FYW B; 4BDZ A; 2O9S A; 2BE9 B; 2DAQ A; 1WJR A; 4QT7 A; 4MZP A; 1QVF P; 4FW2 A; 2P0Q A; 3I35 A; 3G71 A; 1UTI A; 1X2Q A; 1AWW A; 1CKB A; 1YIJ Q; 3VU3 C; 4R56 A; 2HDA A; 1V1C A; 1RI0 A; 1TG0 A; 2O01 E; 5CIU A; 2JTE A; 3J80 E; 5LJ3 d; 1U1S A; 1K73 U; 2EGA A; 5IH2 A; 4A4E A; 3BDL A; 2EGE A; 2LT4 A; 1FXX A; 2LP5 A; 2FL7 A; 3EFO A; 2JOY A; 3EGX A; 3NGP A; 1V29 B; 2C0I A; 3PMT A; 2B8A A; 3MEU A; 3KUF A; 3CC7 Q; 5CVI A; 4Y28 E; 3VS2 A; 1VQL Q; 5LJ5 d; 4LDV A; 2RHZ A; 2CDT A; 4D6W A; 2P4R A; 1T0J A; 1NLP C; 1K0X A; 3GLX A; 3L2W A; 3OYN A; 1K9M U; 5CKH A; 5FU7 C; 4EMH A; 5I21 A; 2CP2 A; 3CCL Q; 3RKY A; 1C6V X; 2EKH A; 4FW1 A; 3CCE A; 5KCO A; 1SEM A; 4GBQ A; 2BZY A; 1IGQ A; 2LX7 A; 1RAH B; 2GNC A; 2YUO A; 1VQ7 Q; 3CXC P; 3SWN C; 2DD4 A; 2RQV A; 4X34 A; 4DA4 A; 4C0F A; 4CC4 B; 1XTD A; 4M77 A; 3DLM A; 1TWB A; 4MZT A; 4KGX B; 3RKX A; 5CO7 A; 5GAN d; 4DOV A; 4PJO A; 2X51 A; 2L5Q A; 4PJL A; 1Y96 A; 2D0Q B; 1JRI A; 2M0Y A; 5L8R E; 1IB8 A; 2DBM A; 4ZTJ A; 1X43 A; 2XK0 A; 2EVR A; 5GAO p; 1ZUU A; 4HCC A; 1IRX A; 4QVC A; 2MMP A; 3GOX A; 3G7Z A; 4F7U G; 2HQH A; 3SWN B; 2WSC E; 1WX6 A; 4Z02 A; 1K8A C; 5C6S A; 3HRU A; 3DLL A; 1QVG A; 4RCC A; 2DF6 A; 3QPH A; 2EYZ A; 1ZA1 B; 3PMI A; 4KUI A; 4JRI A; 2QQS A; 2KRS A; 1KQ2 A; 1MMA A; 1IGU A; 3U23 A; 2F2W A; 2EQJ A; 4JLG A; 4AFZ C; 4MDX A; 2A36 A; 5FRO A; 2XDB A; 2NUT A; 1Q82 U; 1M90 U; 1Q81 C; 3EGU A; 3E2U A; 2MWO A; 8ATC B; 1FMW A; 2KSS A; 2Y4X A; 5CKF A; 1TUG B; 2NLU A; 1MGQ A; 2EQU A; 4E7K A; 1XOV A; 2JW4 A; 5D7U A; 4OB0 B; 1N9S A; 3CCM Q; 1BBZ A; 1W4S A; 4EMK C; 2YWW A; 1K76 A; 2RHU A; 2EFI A; 1KD1 U; 3I9Q A; 1E6H A; 2BZ8 A; 1PC0 A; 1TXQ A; 2VB6 A; 1NEG A; 2H8H A; 2HD0 A; 2D8J A; 2CH4 W; 2KNB B; 1WIE A; 1JU5 C; 4OGE A; 4N0A A; 3LGL A; 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2RI3 A; 1D1B A; 4PJO D; 4CC3 A; 2QA4 T; 3FRN A; 4AFU C; 3G4S T; 4KH1 B; 1SKU B; 1G8X A; 1NJI R; 1X6G A; 3MEW A; 3UWN A; 4PJO B; 1WXB A; 3BY7 A; 1Y96 B; 2M16 A; 2IIM A; 5CKE A; 1ZUK A; 3JCM V; 2HQX A; 1WHL A; 3OSS C; 1X01 A; 3OMG A; 5CQX A; 3CME Q; 4FT4 A; 1M1K C; 1QCN A; 3M4G A; 1JO8 A; 2JS0 A; 1R0B G; 3QBY A; 2LCC A; 2VUB A; 2E3H A; 2RHX A; 3JCM h; 1FMK A; 2XKO C; 3HL8 A; 1K1Z A; 2X4W A; 3OYL A; 4QKU A; 2H3E B; 3R6O A; 2A08 A; 3KXT A; 1FMV A; 1S72 A; 1H3H A; 1OQK A; 1WHG A; 1AOJ A; 3C4S A; 2A28 A; 2X3X D; 1U3O A; 2E6Z A; 2NUT B; 4XTX A; 1PCX A; 4OMQ A; 4RTY A; 3HKS A; 4NL3 A; 2YUQ A; 3HSB A; 4BE1 A; 1NEB A; 1RAA B; 3RES A; 3CMA A; 3REA B; 1I5O B; 2ZAE A; 1W2B A; 4ORZ A; 1M1G A; 1K8A U; 2EPD A; 1XNI A; 4J9B A; 3V8K A; 3RKW A; 4J83 A; 1T3S A; 3BE3 A; 3RMQ A; 1M2V A; 1S72 T; 2HL3 A; 1OX9 A; 5LJ3 f; 4QVZ A; 2DFU A; 2DYB A; 2HAX A; 2RJC A; 4RMO A; 5IT9 E; 4Z88 A; 2JZ2 A; 1JB0 E; 2PVD B; 2CZ0 B; 4Z8A A; 5D6Y A; 4LD9 K; 1Q81 U; 5GAN 5; 4X9C A; 4HCZ A; 2M1H A; 3OYC A; 1M5Q 1; 5LJ5 f; 2LCL A; 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