The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3CXC P; 1YJN Q; 1VQ5 Q; 3CCM Q; 1KQS P; 3CC4 Q; 1Q82 R; 3CCV Q; 1W2B P; 1Q7Y R; 1YIJ Q; 1VQ9 Q; 1VQM Q; 3CCL Q; 2OTL Q; 1YJ9 Q; 2QEX Q; 2QA4 Q; 1VQ7 Q; 1YJW Q; 3CCJ Q; 1VQ8 Q; 1VQL Q; 1Q81 R; 1M90 R; 1M1K R; 3I56 Q; 3CCU Q; 3CC2 Q; 3CC7 Q; 3G6E Q; 3CD6 Q; 1YIT Q; 1QVF P; 3G4S Q; 2OTJ Q; 1JJ2 P; 3I55 Q; 1Q86 R; 1VQK Q; 3CPW P; 1QVG P; 3CCQ Q; 3CCR Q; 1N8R R; 1VQN Q; 1K73 R; 1VQ6 Q; 3CCS Q; 1KC8 R; 3CMA Q; 3CCE Q; 1VQP Q; 1YHQ Q; 1K8A R; 3CME Q; 1YI2 Q; 3OW2 P; 1S72 Q; 1NJI R; 1VQ4 Q; 1K9M R; 1KD1 R; 3G71 Q; 1VQO Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CXC P; 1IO6 A; 3CQT A; 3QZ9 B; 2QA4 T; 2J06 A; 1BKB A; 1I1J A; 2H3J A; 1PKS A; 2KXC A; 3PVL A; 2BZX A; 3X20 B; 1IRE B; 3LYI A; 3CCR T; 3RNJ A; 1I8F A; 1WI7 A; 4N0A A; 2L89 A; 1WXB A; 4M77 F; 1X2K A; 1SRM A; 2RQU A; 2CP5 A; 5LJ3 f; 4BI8 B; 3G71 Q; 1UG1 A; 1OEB A; 1WZO A; 4M75 C; 4JDS A; 3M0T A; 1G8X A; 2Z0W A; 1I5O B; 2ZPB B; 1GBQ A; 4JZ4 A; 1JQQ A; 4XU1 A; 1V1C A; 2BKD N; 2VKN A; 4OGE A; 2HAX A; 2DXC A; 2NUZ A; 1D0X A; 2XD0 A; 2ZGW A; 1QVG S; 3M53 A; 4LUD A; 4J9F A; 2DJQ A; 3JCM h; 4LNP A; 2OTJ A; 2E70 A; 3PNW C; 2JN0 A; 1UJ0 A; 5KYU A; 4QVC A; 4BAC A; 3JB9 F; 3JV3 A; 4BI4 A; 2RJE A; 5GAM d; 1N9R A; 5KYW A; 2KVQ G; 4KBM B; 4HCZ A; 3BE3 A; 1BIA A; 1N8R U; 1R8O B; 1X2Q A; 2V1R A; 1VQO Q; 3I5S A; 3NTH A; 1XQH A; 1Q7Y R; 2JT4 A; 2LJ0 A; 3OW2 A; 3VUZ A; 2X3X D; 5GJW B; 2KT8 A; 4KUD K; 3CXC A; 1UGQ B; 5GMK i; 1VYU A; 2VC8 A; 3RKY A; 2OTL A; 1KG1 A; 1F1B B; 2E3H A; 2XKO C; 1UTI A; 3CCQ Q; 2DIQ A; 1OUL A; 3JCM W; 5GMK m; 4BB7 A; 1ABO A; 3G6E A; 2E5K A; 1N8R C; 2P84 A; 2L0A A; 1GBR A; 2QQR A; 1U06 A; 2BIV A; 2GFU A; 5FU6 C; 2HNI A; 2LMJ A; 2J05 A; 3VUB A; 2QTV A; 3M56 A; 4BDY A; 3QHS A; 4M75 D; 3CD6 T; 1R0C B; 1QWF A; 1NLO C; 2X3W D; 2K5F A; 4LDV A; 5GAO q; 1Q81 C; 2QQS A; 4OGC A; 3G7Z A; 1JJ2 P; 2KRS A; 1B7T A; 4N0A C; 3REB B; 2CS7 A; 4JJN K; 2DD5 A; 4ESR A; 3CC4 T; 4RTV A; 1K73 U; 4M7A A; 4A4K A; 1K8A U; 2KAF A; 1QW1 A; 2OTL T; 1W70 A; 1Q82 R; 3VS6 A; 4B9W A; 3CCJ T; 1PRL C; 2HQE A; 2YWW A; 2OAW A; 3MP6 A; 5FRN A; 3LX7 A; 5GMK h; 4OB3 B; 1PRM C; 2DPP B; 2EPD A; 3QUI A; 3MPU B; 1YI2 T; 4M78 G; 3SFM A; 3EAE A; 1M30 A; 1AHJ B; 1Y57 A; 4ANJ A; 3FDR A; 2F5T X; 1TTH B; 1PG5 B; 3I55 A; 1LOJ A; 2V26 A; 3CCS A; 4HVW A; 2YRV A; 2CP0 A; 2K3X A; 3X26 B; 4AFS C; 1YHQ A; 2DYI A; 1VQ5 A; 2YUQ A; 2E5Q A; 3M4G A; 3URG A; 4LXC A; 2DKG A; 1X69 A; 3OYK A; 1QKX A; 1VQP T; 4E7H A; 1TS9 A; 1WXT A; 2EIF A; 5KE3 A; 5KYY B; 2VUB A; 3R6N A; 4J9B A; 3VU3 C; 2CYZ B; 3LWH A; 4GY5 A; 1X27 A; 2NUP A; 2LVM A; 2YT6 A; 1WGS A; 4ELZ C; 3Q1J A; 1RI0 A; 5FWB A; 4LE9 A; 1YIT Q; 3M0R A; 5FW9 A; 1IGU A; 1VQ8 A; 1ZBX A; 2F69 A; 2EQI A; 2MOX A; 5J39 A; 1FWZ A; 4LUE A; 4ZN1 A; 4XK8 E; 1YHQ T; 5GAN 6; 1JJ2 A; 2J6O A; 1VQ5 T; 1Y71 A; 4PKC C; 3A5Z B; 3EH2 A; 4RUG A; 2ZPH B; 5D6X A; 4M77 E; 3JCM c; 1MNE A; 1WHG A; 4M75 B; 4KUI A; 1B34 A; 3CEY A; 1SPK A; 4M7D G; 5HY6 A; 5GAN f; 4JRI A; 4PJJ A; 1RAA B; 5KH6 A; 1ZLM A; 3LH5 A; 2RHX A; 2LX9 A; 3S6W A; 5IXF A; 1ZUU A; 3FEO A; 4M75 F; 2EYW A; 2PQW A; 4M77 A; 1KHC A; 5LL6 S; 1AOJ A; 5LJ3 d; 2GCX A; 4F17 A; 3OW2 S; 4O5V A; 3VRZ A; 3CXC S; 1VQN A; 1XTD A; 4PJO F; 2C0O A; 3NTI A; 3GBQ A; 1BYM A; 2BTT A; 2KRM A; 2RF0 A; 2EYX A; 3TSW A; 5FU7 C; 2DLP A; 3X25 B; 3S3M A; 3OMC A; 2QQB A; 4CC4 B; 2J7I A; 2RMO A; 3A8O B; 5A0D A; 2GTO A; 2DK3 A; 2GQI A; 2RHY A; 2GGR A; 5LJ3 h; 5KCO A; 2K79 A; 5L8R E; 1WDX A; 3WVD B; 4C8Q A; 2E6N A; 1LNX A; 4XTZ A; 1WLP B; 3JCM X; 3UT1 A; 2MK5 A; 5FU6 B; 5GMK j; 2K2M A; 3CCU Q; 3RBB B; 2DTH A; 3HKS A; 2CKK A; 1QVF P; 2OX7 A; 4DEX A; 1AT1 B; 1PD0 A; 3P8H A; 2HZY A; 3QPH A; 1X75 C; 1M2O A; 2LQ8 A; 3G71 T; 5I21 A; 3EG0 A; 1GFD A; 1PWT A; 2M0Y A; 3QYG B; 5C0M A; 1MMA A; 2ECZ A; 3HRS A; 3D7S B; 2GQV A; 4M7A D; 2K6D A; 1VQO A; 2FRW A; 1IXD A; 2WAC A; 2D8H A; 1FXX A; 2EQJ A; 2RPN A; 1CSK A; 4J5Y A; 1VQ6 Q; 2E41 A; 2QXF A; 2DEU A; 1Y96 A; 3TQ7 P; 2MAM A; 2FPD A; 1BBZ A; 3CCQ A; 1H92 A; 4MZT A; 1G83 A; 1O75 A; 1YBY A; 2O88 A; 3QYH B; 1Q82 U; 2O4X A; 4MMK A; 3JB9 J; 3JAM E; 5KYU B; 3VYH B; 4M77 C; 3MJX A; 3L2R A; 5LJ5 g; 2SRC A; 1IGQ A; 3TEE A; 1G2B A; 1UGV A; 2DZC A; 2EQU A; 3A1P A; 3DKM A; 2FYK A; 1G3Y A; 1VQO T; 2O01 E; 5KYN A; 2I2L A; 4Y91 A; 2KNB B; 1T3L A; 3F70 A; 3CCM Q; 3CCV Q; 1JEG A; 1VQ9 Q; 2QEX Q; 3WXM B; 2R57 A; 2A7Y A; 4ELY C; 2B8A A; 2JS2 A; 3VJP A; 4F7U E; 3CCQ T; 1JJ2 S; 2PZ1 A; 2YRC A; 1KSW A; 2YDL A; 1QVF A; 2K57 A; 3PE0 A; 5GAO l; 4BE1 A; 3HTR A; 3V8K A; 2E10 A; 2Y4X A; 3EGX A; 2YXY A; 4F16 A; 4IUQ A; 4J6X A; 2DTO A; 2RI2 A; 3O5Z A; 2HSP A; 4XTX A; 2RI3 A; 3RUX A; 1M9S A; 2NUT B; 4XTV A; 1VQ7 A; 3WVE B; 1N8R R; 3ZEH A; 2CSI A; 2KDS A; 4NL2 A; 4F7U A; 2EQM A; 3EFO A; 2LJ1 A; 3X24 B; 1RLP C; 2HQX A; 5LJ5 f; 1YJW Q; 1Q81 R; 3QKJ A; 2EKO A; 3SWN A; 2ED1 A; 3VYG A; 2FZG B; 2L3P A; 3LWI A; 3OYD A; 2RM4 A; 4M77 D; 1OPK A; 5LJ3 j; 1YIT A; 5GAM e; 4M7D A; 1E7O A; 1TOV A; 1O9S A; 2C0I A; 2MWO A; 2JXB A; 1WIE A; 1RAC B; 2E12 A; 2V8I A; 2OAU A; 2KRO A; 4M7A F; 5GAN d; 2DVE A; 4PJO E; 5CO7 A; 1ZA2 B; 4C92 B; 2RI5 A; 1BI3 A; 5FU7 B; 4LDY A; 4JS4 A; 3OBW A; 3NGP A; 1K8A R; 2ENM A; 3JB9 H; 3SDZ A; 2CUD A; 1D3B B; 3QJY A; 2DFU A; 1G3T A; 1QMC A; 4YTL A; 1N9S A; 1WHK A; 4CI0 C; 3AHU A; 3CPF A; 2FB7 A; 2JOY A; 3LLR A; 5GAN 8; 1RAF B; 1TH7 A; 4EDU A; 4C8Q D; 4FSX A; 1YIT T; 4PNO A; 5GMK e; 3HL8 A; 4WCI A; 2XDP A; 5GAN h; 1KFZ A; 2IG0 A; 5CVI A; 1UHC A; 1WXU A; 4PK4 A; 1MV3 A; 2HKQ B; 4OB1 B; 1PSE A; 3L2Z A; 1S72 Q; 1E6G A; 2KE9 A; 4DBR A; 2L8D A; 4IIO A; 3EG9 A; 3GNG A; 1WHH A; 1GFC A; 4R56 A; 3C4S A; 3I56 Q; 1D09 B; 2F2V A; 4L6V 5; 4ZTJ A; 1QWE A; 2JUF A; 2DXB A; 5GAO m; 1NYF A; 3FJP A; 1N6A A; 1TUG B; 4XU3 A; 3CCE Q; 4CRI A; 2BE7 D; 1X43 A; 4N4H A; 4Z8A A; 1M3B A; 2FL7 A; 4C92 G; 3OYF A; 1X01 A; 2R58 A; 4XTW A; 2KRN A; 4C0D C; 3CCR A; 3QDF A; 4NS5 A; 1SSF A; 1G3S A; 1M3C A; 2COZ A; 5HCK A; 2FG0 A; 1B3Q A; 1OQK A; 2GNC A; 5GMK l; 1MUZ A; 1VYT A; 4HVV A; 4HKE A; 2FEI A; 3SWN C; 2O2O A; 5CK9 A; 2JJ9 A; 1HYO A; 3M0U A; 4M77 B; 2RHZ A; 3H0F A; 1TUD A; 3H8Z A; 1K76 A; 3VS2 A; 4FT2 A; 5KYX A; 2DM1 A; 1RI9 A; 8ATC B; 3M0Q A; 3T9N A; 3JCM Q; 2LJ3 A; 4IIM A; 1GL5 A; 5A0G A; 2A3L A; 1QVF S; 2W0Z A; 2RQV A; 1U3O A; 1VQK Q; 2K4Y A; 2KR3 A; 3CMA Q; 4OMQ A; 1NM7 A; 1UJY A; 4D6W A; 4X9D A; 4EMK A; 5D7U A; 2O31 A; 5GAO p; 1BU1 A; 1PHT A; 4ORZ A; 4BE2 A; 3M55 A; 4A4G A; 2VB6 A; 2X4W A; 4GBQ A; 4NL3 A; 4AFZ C; 3CCU T; 1NBE B; 2HL3 A; 2EWN A; 3RIR A; 2CZ1 B; 1R0B G; 1W4S A; 2QK0 A; 1H3Z A; 3CBP A; 2EJG A; 5ECA A; 1ARK A; 2MIO A; 4Z89 A; 2ZPI B; 4GLM A; 4LDX A; 2XDD A; 4PJO C; 2A0F B; 2EYZ A; 2PUK B; 3C95 A; 2E1H A; 1PC0 A; 3EG1 A; 1OZ3 A; 1KQ1 A; 4D8K A; 4BDZ A; 4VUB A; 2CT4 A; 2EVR A; 4E7L A; 3L1A A; 2QYZ A; 3CCM A; 2M9U A; 3CCV A; 2XIC A; 3CC2 Q; 4C8Q F; 3VKI A; 2DL3 A; 1VQ9 A; 2W10 A; 2EGC A; 1BK2 A; 2QEX A; 5CKH A; 1QVP A; 1VUB A; 1VQ6 T; 2D9T A; 2YUO A; 1M27 C; 4GLK A; 4OML A; 3CD6 A; 1KC8 C; 5LJ3 e; 2JTF A; 4A4H A; 1KD1 C; 1Y96 B; 4M7D D; 3M59 A; 4XAX B; 4PJM A; 1WYX A; 2LNV A; 2EYY A; 3CC4 A; 2X51 A; 1Q81 U; 2DL7 A; 4AMC A; 5GAN j; 3CCJ A; 4M7A E; 3OBY A; 2PVD B; 2H8H A; 3JB9 G; 1GCP A; 5LJ5 d; 4AFQ C; 5GAM h; 2PVG B; 3MEA A; 3A8H B; 3CCM T; 1EZZ B; 3KFV A; 3CCV T; 3CC7 Q; 4LDW A; 2AT1 B; 1VQ9 T; 2MYS A; 2QEX T; 1YI2 A; 2CDT A; 3AT1 B; 2V8J A; 1TG0 A; 4N4G A; 2DNU A; 1MMD A; 2EFI A; 3HFN A; 4IUU A; 1U8R A; 1YJW A; 1M1K C; 2XK0 A; 3I35 A; 1H3H A; 1AD5 A; 3CPW P; 2GBQ A; 3RMQ A; 5CKB A; 1SHF A; 2L3S A; 4RMO A; 4JRP A; 2QTX A; 5M9O A; 1YFN A; 1M2V A; 3QII A; 4PJO D; 2X35 A; 2V1Q A; 1AWX A; 3M57 A; 4M78 F; 3SB2 A; 1VQP A; 3ZL7 C; 1OI1 A; 5AT1 B; 1SRL A; 2BZY A; 3PMT A; 3P8D A; 2KGT A; 2XMF A; 4J9G A; 2DER A; 5A0L A; 4L5G A; 5IAY A; 2QAS A; 1D1B A; 5C6S A; 3TVT A; 3QXE B; 1YJW T; 1FYN A; 3CCL Q; 1JBM A; 2DL5 A; 1FMV A; 4C0D B; 3I9Q A; 3UF4 A; 4J6W A; 3JCM P; 2AZS A; 2LC4 A; 4F04 B; 4BD3 A; 1NEG A; 2K9G A; 3MP1 A; 2KBT A; 3PVQ A; 2ROL A; 2EGA A; 1N27 A; 1ZUK A; 3SWN B; 4WF2 A; 3L2Q A; 1OZ2 A; 1SHG A; 4DEY A; 1RL2 A; 2DE0 X; 5HK3 A; 1LCK A; 1D1A A; 1S72 A; 2K2V A; 4BI3 A; 1DJ7 B; 2MWP A; 2CGH A; 4F7U F; 1QP2 A; 3DB3 A; 3L42 A; 3H9N A; 2FRY A; 4E7Z A; 4B6M A; 1UEB A; 2DRM A; 1ZHI A; 4M4Z A; 1NPP A; 1WHL A; 1WJS A; 2C0T A; 2JMA A; 3RR6 A; 3CPW A; 5GAN 2; 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4JJD A; 4ZGJ B; 2D6F A; 1KJW A; 1I5L A; 5CAI A; 5D6W A; 1VYV A; 3KXT A; 1QKW A; 3V8J A; 1VOM A; 2E64 A; 4M78 E; 5J3B A; 1X6O A; 1ZUY A; 3BDL A; 2WSC E; 1UE9 A; 1ZA1 B; 2RN8 A; 1AEY A; 2LQK A; 3ZBD A; 5DLQ E; 3X28 B; 2O9S A; 1BCM A; 2LT4 A; 2IVW A; 2LP5 A; 5FRO A; 2DBM A; 3CC2 T; 2GFA A; 1ZQ1 A; 4ME7 A; 4A4F A; 4DA4 A; 4J6Y A; 2K5I A; 3FC3 A; 1KHI A; 2JW4 A; 1BIB A; 5KYW B; 7AT1 B; 3JCM f; 2LX7 A; 2ZPF B; 4M78 A; 5GAN 5; 1LJO A; 3M4Y A; 3OSV A; 2ESW A; 2RA2 A; 5GAO n; 2Y4Y A; 1G3W A; 4R0K A; 1M8M A; 3PGG A; 4PFO A; 4AT1 B; 3L2W A; 2DL8 A; 2OTJ Q; 3CPW S; 3ME9 A; 2GF7 A; 1UGR B; 3CC7 T; 2HCK A; 4QQ6 A; 2E4H A; 2LCL A; 1WHJ A; 2VWF A; 2X4J A; 5I22 A; 4IUT A; 4C8Q C; 3UWN A; 4BUG A; 1BI2 A; 4ZN3 A; 4E7K A; 2HBW A; 1W2B A; 4HCK A; 4JRK A; 2CP3 A; 2VVK A; 3UA7 A; 2FPE A; 4RTX A; 4M7D E; 1D0Y A; 2HBP A; 3NTK A; 2VXE A; 1NYG A; 1KQ2 A; 1OV3 A; 1OPL A; 1GCQ C; 2DBK A; 3CME Q; 4MDX A; 4N4I A; 2P4R A; 1YJN Q; 4Y92 A; 2RJC A; 4KUL A; 3VS4 A; 4M7A B; 1M2V B; 1BI1 A; 1M1K R; 4DOW A; 1HSQ A; 3G6E Q; 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