The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3CCR Q; 3CCQ Q; 1M1K R; 3OW2 P; 1YI2 Q; 1KC8 R; 1VQ5 Q; 3CC7 Q; 1VQ7 Q; 1YIJ Q; 1VQL Q; 1YHQ Q; 1KQS P; 1N8R R; 1NJI R; 2QEX Q; 1YIT Q; 3G6E Q; 1QVG P; 3CC2 Q; 3CPW P; 3G4S Q; 2OTJ Q; 3CME Q; 1YJN Q; 3I55 Q; 1YJ9 Q; 3CXC P; 3G71 Q; 1Q82 R; 1M90 R; 1YJW Q; 1VQ8 Q; 3CCL Q; 3CC4 Q; 1S72 Q; 1VQP Q; 1VQK Q; 2OTL Q; 3CCS Q; 1VQM Q; 1VQN Q; 3CCU Q; 3CCE Q; 1Q7Y R; 1K73 R; 1JJ2 P; 2QA4 Q; 1Q86 R; 1KD1 R; 1K9M R; 1QVF P; 3CD6 Q; 1VQO Q; 3I56 Q; 3CCJ Q; 1W2B P; 3CCV Q; 1VQ6 Q; 3CMA Q; 1VQ4 Q; 1K8A R; 3CCM Q; 1VQ9 Q; 1Q81 R; #chains in the Genus database with same CATH topology 1WQW A; 1VQM T; 1UFF A; 4Y92 A; 2OTJ A; 3GBQ A; 1VQO T; 3CCL A; 5IXB A; 2DYI A; 5GAM g; 1PSF A; 2XU8 A; 2CZ7 B; 3OYI A; 5GAN 2; 3URG A; 2ZPF B; 1K9A A; 3IQL A; 1RAI B; 1ZUY A; 2QAS A; 4II1 A; 1IRE B; 4PJJ A; 2DM1 A; 3CME A; 4FSS A; 2YSQ A; 1VQ8 A; 2LDM A; 2PQW A; 3CC4 A; 1S72 A; 2K79 A; 5GAO m; 4C92 E; 3GIB A; 3ULR B; 1WPY A; 5LJ3 d; 2LX7 A; 1RAE B; 4D8K A; 2NUZ A; 2C0T A; 3N5B B; 2X4J A; 3CBM A; 4F16 A; 2VGN A; 1M8V A; 1WQ7 A; 2JTE A; 1ZSZ C; 4M75 E; 4OMQ A; 2EGE A; 5GAN j; 4PKC C; 4M7A D; 2OI3 A; 1KG1 A; 4XQ3 A; 3RMQ A; 5ECA A; 2X4X A; 4ZGJ B; 1VQL T; 4AFQ C; 1WJQ A; 1KHC A; 4AG1 C; 1PWT A; 3H0H A; 3OYC A; 1FMW A; 5HY6 A; 1KQ1 A; 4BB7 A; 4LDU A; 2VKN A; 2XDD A; 4IUT A; 3G6E A; 1Y96 A; 1VYU A; 4BI4 A; 3G4S A; 2JOY A; 2FVU A; 2OTL A; 3OYG A; 1ZQ1 A; 2QDY B; 1UGR B; 2LJ0 A; 2QEX Q; 1X2K A; 1RAC B; 3L2V A; 2K5I A; 4TVR A; 2E5K A; 1JBM A; 2DXT A; 1GL5 A; 1K0S A; 4BY6 C; 2YLB A; 2J05 A; 2NUT A; 1G83 A; 3FIF A; 5M9O A; 1Q82 C; 5FRM A; 1O75 A; 3H9N A; 3V8L A; 4M4Z A; 2CP0 A; 5IXF A; 5GMK h; 4Y28 E; 2KRS A; 3CMA T; 1YIT Q; 1D1B A; 4HVU A; 1UJ0 A; 4M7D G; 3S3O A; 3LGL A; 2K3X A; 4PFZ A; 1MNE A; 3VS6 A; 2DZC A; 2HZY A; 4M7D A; 3MKD A; 2YHT A; 1SEM A; 2LQN A; 4ZTJ A; 3OS5 A; 3CC2 A; 2KQW A; 4RTY A; 1BCM A; 3OYJ A; 3M0Q A; 1VQO A; 3A8H B; 2E41 A; 4IIO A; 2KYM A; 2KEA A; 4LDY A; 5GAN e; 8AT1 B; 1YJ9 Q; 3C94 A; 2OAW A; 2JS0 A; 3QKJ A; 5L23 A; 4HT8 A; 1X2Q A; 4FW2 A; 1MMG A; 3UPU A; 1I5L A; 2YWW A; 1MUZ A; 2CKK A; 1RUW A; 1QQJ A; 9ATC B; 3LWH A; 2O31 A; 2M9U A; 5I22 A; 4KGX B; 5CIU A; 3O8V A; 5KE3 A; 3H0F A; 1W4S A; 1TH7 A; 1NBE B; 1JXO A; 2LT4 A; 4KRT A; 1EFN A; 1ZUK A; 4A54 A; 4IUV A; 4Z8A A; 2JW4 A; 3L1A A; 3JAM E; 1YBY A; 1KIK A; 2BE7 D; 3JCM V; 2EYZ A; 1OX9 A; 4KH1 B; 1HK9 A; 2DTI A; 2F1L A; 3CCV T; 4BAC A; 2DBM A; 4A4K A; 1SHF A; 2RQU A; 3JCM g; 2MI6 A; 3LX7 A; 1M1G A; 4FYY B; 1TS9 A; 2RI5 A; 3F70 A; 2P0P A; 1JXM A; 1JJ2 P; 1QP2 A; 1VQL A; 1WJS A; 3EFR A; 2CZ1 B; 3PVQ A; 3OYD A; 1QVG S; 5KYX B; 4OB1 B; 1RI9 A; 3VS3 A; 3OW2 A; 1M2V A; 1LOJ A; 3INZ A; 1M8M A; 1UHF A; 4E6R A; 1OZ3 A; 5CKH A; 3QDR B; 2JTF A; 4JZ4 A; 1Q81 C; 5GAO n; 1M1K C; 2RPN A; 2YUN A; 4JRP A; 3QJ6 A; 1VQ7 T; 1KC8 C; 2QEX T; 2MPX C; 2F2W A; 1W2B P; 1OZ2 A; 1WLP B; 2NYS A; 3PMT A; 4YTL A; 4JLG A; 4IKF A; 1D3B A; 4R0K A; 3BW1 A; 4C8Q D; 2DXC A; 3S3N A; 1FYN A; 3KFV A; 2MCN A; 1QVF S; 3CMA A; 4O5V A; 4DOW A; 2VB6 A; 2EJF A; 3C12 A; 3CXC A; 4DA4 A; 1VQP Q; 3L2R A; 1YIT T; 2DET A; 2E4H A; 1LNX A; 1UEC A; 1TSF A; 1K9M R; 1T0H A; 3GOX A; 3J7A F; 5LL6 S; 3J80 E; 3FLG A; 2CYZ B; 5J26 A; 3C95 A; 2H8H A; 2RM4 A; 1ZHI A; 4DEY A; 1D09 B; 2YUO A; 5KYW B; 2ROL A; 4FYW B; 4N0A C; 2EGA A; 2LNH B; 2HL3 A; 1OV3 A; 4C5H A; 2DVE A; 1JU5 C; 1K76 A; 5CR2 A; 1YJ9 T; 1NPR A; 5GJW B; 2O88 A; 3JCM c; 1M27 C; 1N27 A; 2YRD A; 1YIJ Q; 2KVQ G; 5IHI A; 1YWO A; 2JUF A; 1CSK A; 2FL7 A; 2K57 A; 1AZE A; 2YXY A; 2M1H A; 4DBR A; 2DLP A; 2V8K A; 3PTA A; 1G3W A; 2AK5 A; 3RDV A; 3L2U A; 4AT1 B; 1D0Y A; 3TSW A; 2HNI A; 1VQ6 Q; 2VC8 A; 3CCM Q; 4JRI A; 5LJ3 g; 2HQH A; 3RNJ A; 4CI0 C; 3JB9 J; 1Q7Y C; 4VUB A; 2HAX A; 3PIP A; 5CKF A; 3VU3 C; 1B07 A; 2ZZD A; 3G71 Q; 4GBQ A; 4KH0 B; 1U1S A; 4JS4 A; 1KD1 R; 1AHJ B; 2QTX A; 5FWB A; 4ATO A; 4J7I A; 3CCS T; 1BBZ A; 2ZPH B; 2RJE A; 3CPW S; 5CCA A; 1Q86 C; 5GAN h; 2DPP B; 1ZBX A; 1SHG A; 5C0M A; 3FB9 A; 2L5Q A; 2SEM A; 2ESW A; 2DJZ A; 1AWJ A; 2QEX A; 5GMK m; 4PJO F; 3VS7 A; 3CCQ Q; 1WYX A; 4RTZ A; 1VOM A; 3MEW A; 3NTI A; 1JRI A; 5IHK A; 1KQS P; 5GMK i; 4M77 F; 1ABO A; 2LRQ A; 1I07 A; 1UG1 A; 1WGS A; 4J8O A; 3GPL A; 1GFC A; 4AFU C; 2EJ9 A; 1OX8 A; 2M51 A; 4A4F A; 2YT6 A; 3O5Z A; 4X9C A; 5CAI A; 2RK1 A; 3OY9 A; 1YIT A; 4BD3 A; 2QQS A; 2ATC B; 4PNO A; 3MP6 A; 3OSS C; 2GQV A; 1N5Z A; 3CEY A; 3OQ5 A; 1YHQ Q; 3SFM A; 2PVD B; 1UE9 A; 2A36 A; 2FYK A; 3EG9 A; 2DE0 X; 2HMA A; 3EFO B; 4FL6 A; 4GLM A; 1BCO A; 1T3L A; 3SWN C; 1X75 C; 1PRL C; 3TCJ A; 1K4U S; 2RMO A; 3MCA B; 5HK0 A; 2EYW A; 2ROT A; 1KJW A; 3BDU A; 3E9G A; 1YJ9 A; 2CDT A; 2DKG A; 5C6S A; 2FRW A; 1Q82 U; 2ZAE A; 4JJB A; 3RBB B; 2EKH A; 4LDV A; 4BE0 A; 3M4Y A; 3X28 B; 3CME T; 1AWW A; 1WDX A; 4FT2 A; 1VQ8 T; 3CCR Q; 2P4R A; 1LPL A; 2KBT A; 1QVP A; 4XTY A; 1VQ6 T; 4PFP A; 4RG2 A; 2KNB B; 5KYX A; 2F5K A; 1XTD A; 3HRS A; 4MZP A; 3NFC A; 4PJN A; 5FU7 B; 1IHV A; 2CT3 A; 2Y4Y A; 1QLY A; 3M56 A; 3VS2 A; 1I1J A; 2K2M A; 3G71 T; 1X43 A; 2AZS A; 4LE9 A; 4PFO A; 2M16 A; 4LNP A; 3NTH A; 4NOY A; 1YP5 A; 1TG0 A; 1QVG A; 2QGF B; 4ESR A; 1TUD A; 2MIO A; 1B34 B; 1P92 A; 2EQJ A; 4PLL A; 1IHW A; 2YLC A; 3C4S A; 1NLO C; 1FX7 A; 3RKW A; 4PJO B; 1LJO A; 3NHN A; 1M5Q 1; 2LP5 A; 2K4Y A; 3EH1 A; 2RQT A; 4M77 B; 2HDA A; 4FCY A; 3RER A; 1IO6 A; 1WIE A; 2F69 A; 3CCQ T; 2CT4 A; 4OMN A; 4PJO D; 4E7I A; 4FW1 A; 2P0Q A; 4KUL A; 5L8R E; 4WCI A; 2J06 A; 2QQR A; 3REB B; 1QVF A; 5KYW A; 3RES A; 1Z9Q A; 3DKM A; 5FLX E; 1SPK A; 4RUG A; 4C5G A; 2KSS A; 5AYF A; 1GCQ A; 4A63 B; 5FU6 C; 3TU4 K; 2CP2 A; 3S6W A; 1VQP A; 1HYO A; 2RA2 A; 1YCS B; 1KHI A; 2CUB A; 1YHQ T; 5GAN 4; 4QW2 A; 1O9S A; 3H6Z A; 4Y91 A; 1YNZ A; 1IB8 A; 3CC2 T; 2EGC A; 1KC8 U; 1BIB A; 5GAN d; 1YFN A; 4XTU A; 3UF4 A; 4D8D A; 1X27 A; 3A1P A; 1PKT A; 3X25 B; 4M7D C; 3MO8 A; 4V2S A; 1E6G A; 2A08 A; 1N8R R; 1C6V X; 3KBG A; 2FPE A; 4JRQ A; 3OMC A; 3A8L B; 3BFM A; 1M90 R; 2GNC A; 4FSX A; 2D8J A; 4A4H A; 5KYY B; 4DBQ A; 1YIJ A; 3EAE A; 2KY9 A; 2JM9 A; 2D0Q B; 3EG0 A; 3MP8 A; 5A0D A; 4B9W A; 2D9T A; 4F7U F; 2GFA A; 1I4K 1; 4KUD K; 4J9I A; 3CBP A; 2FZK B; 2X51 A; 2PVG B; 1TUC A; 4PK4 A; 3CCR T; 1VQ6 A; 3PMI A; 3NGP A; 3CCM A; 1U1T A; 3I35 A; 3HSB A; 1K73 R; 2EYQ A; 4M7A B; 1UTI A; 2F5T X; 2RI3 A; 4KBM B; 2ABL A; 3DB3 A; 4N4H A; 2O9S A; 3G71 A; 3WXM B; 1NYG A; 3EGX B; 1K9M C; 1UGQ B; 1JJ2 S; 2HEQ A; 3CPW A; 4AG2 C; 4N4I A; 4X1V A; 1UHC A; 5GAN f; 3A8G B; 3CCJ Q; 1TU0 B; 2EAY A; 4ZNX A; 1J3T A; 2DL7 A; 3M59 A; 2OAU A; 1MV0 B; 4ZTF A; 2BZX A; 3M0R A; 1WXT A; 2EWN A; 3LW5 E; 3R6O A; 1GFD A; 3JB9 H; 1N6A A; 4HVW A; 1Q7Y U; 5HCK A; 4C0D C; 1W2B S; 1C0M A; 1LCK A; 3CCQ A; 4OMO A; 2XKO C; 3G7Z A; 4O6J A; 4UC4 A; 5KE2 A; 3CCE Q; 3OS1 A; 3E9F A; 3EFO A; 2A28 A; 2YUP A; 4M78 G; 4C8Q F; 3E2U A; 4M78 A; 1G3Y A; 2A37 A; 2MWP A; 4M7D E; 5GAN 8; 1RL2 A; 3ZL7 C; 4JUV A; 1Q86 U; 4QQG A; 4PJL A; 3OYK A; 4OMF B; 1YHQ A; 3JCM P; 1MMA A; 4FU6 A; 4DBH A; 2NUP B; 3HFN A; 2PVO B; 3AHU A; 1KD1 C; 3L2Q A; 2XHC A; 2R58 A; 2XMF A; 3ZBD A; 1OU9 A; 3MEV A; 2PUO B; 2CP7 A; 3CXC P; 1VUB A; 2V26 A; 4EPC A; 4CC3 A; 2DIQ A; 3HL8 A; 1M9S A; 4F7U B; 3JCM X; 3LH5 A; 1PCX A; 2RQW A; 4KUI A; 4QKU A; 3QG1 A; 4FIB A; 2Z0W A; 4BE2 A; 2CGH A; 4EMH A; 2XIC A; 4RCC A; 1VIF A; 3CCR A; 1M4Z A; 3GNF B; 3OSV A; 3V8K A; 5GAO p; 4MDX A; 5LJ5 j; 2A3L A; 2CRE A; 3M54 A; 2CS7 A; 4KGZ B; 4PJO G; 1EZZ B; 1JQQ A; 3EGD A; 4PJO A; 2GTJ A; 2Y90 A; 2RH2 A; 4M77 G; 2PZ1 A; 3E19 A; 3M0U A; 2VAS A; 2RJD A; 4M77 A; 2DVJ A; 2P0K A; 1WHH A; 1SRM A; 3I5R A; 3QII A; 4J6X A; 4OGE A; 2PTK A; 3TEE A; 1UUE A; 2RHY A; 4A4E A; 3M4G A; 2K5L A; 1D0X A; 2JM8 A; 1VQ5 Q; 2DMO A; 4IUR A; 4EMK B; 3CCJ T; 2AZV A; 4J6W A; 5IAY A; 1RAB B; 4NL3 A; 4A4G A; 2JT4 A; 1QWE A; 4C8Q B; 1KQS S; 1WA7 A; 3DB4 A; 3TRE A; 3FJ5 A; 4CC2 A; 3CCE T; 4DBF A; 1YI2 Q; 2HSE B; 2VVK A; 5CKE A; 5FWC A; 2DXU A; 2H3J A; 3UDC A; 3M9Q A; 1WX6 A; 2COY A; 4C92 F; 4JJN K; 3I55 Q; 2NWM A; 4JS5 A; 4AFS C; 1BKB A; 2X3W D; 1ZLM A; 2ZGW A; 5KYY A; 2WSC E; 1NYF A; 5LJ5 e; 3I9Q A; 1OUL A; 8ATC B; 4XAX B; 2FRY A; 4M75 F; 1GCP A; 2DEU A; 4OVA A; 4ELY C; 3MP1 A; 4R55 A; 4XK8 E; 4Z88 A; 3X26 B; 2XD0 A; 3H41 A; 2RJF A; 5GAN g; 2KE9 A; 4RTW A; 4HCZ A; 1IRX A; 2GQI A; 4M7A G; 5I11 A; 3JCM h; 4E7Z A; 3D7S B; 2CP3 A; 2CSI A; 4WF2 A; 2L3Q A; 2LQW A; 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1C1A A; 1K73 C; 4F7U A; 4BI8 B; 1GXI E; 2BKD N; 2M02 A; 2YDL A; 3VRY A; 1UJY A; 3CPF A; 4ANJ A; 5LJ3 h; 5KCO A; 2RJC A; 1GCQ C; 4M75 D; 2MWO A; 2K3Y A; 1JO8 A; 4Z02 A; 4DOV A; 1OI1 A; 2KRM A; 2RO0 A; 5CKB A; 1M30 A; 5A0L A; 2GTO A; 2FB7 A; 1YIJ T; 2WSE E; 3OA6 A; 3QUI A; 4CC4 B; 1VQM Q; 5A2Q E; 4OGC A; 4QQ6 A; 1VYV A; 2RQV A; 1W1F A; 1NM7 A; 3QYH B; 1KC8 R; 2JJ9 A; 5I2S A; 4L5G A; 3TVT A; 2M0O A; 5GAM e; 1PG5 B; 4F17 A; 3UA6 A; 2RK2 A; 3CCM T; 2YUQ A; 1IXD A; 4EMK A; 2XDP A; 1KD1 U; 4QVC A; 2ZPB B; 4J7F A; 3QO3 A; 1TTH B; 2LC4 A; 2LJ3 A; 2DJQ A; 2COZ A; 2D0N A; 4JPB W; 5LJ5 h; 2BIV A; 3QZ9 B; 1UDL A; 4M7D D; 1HXD A; 2FHD A; 4C8Q G; 2FG0 A; 2P84 A; 4D6W A; 2I2L A; 5DY9 A; 4C8Q A; 3EHR A; 4JZ3 A; 5GAN 6; 5CO7 A; 1VQ9 T; 3EGU A; 2VUB A; 1K0X A; 4RTX A; 3WVE B; 2FO0 A; 2FPF A; 2L89 A; 3V7S A; 2AKK A; 1VQK Q; 2EJG A; 2KI7 A; 1VQ5 A; 2RI2 A; 4ELZ C; 2DYB A; 1FXX A; 1WXU A; 3OYL A; 1QP3 A; 1YJW T; 1X6O A; 2DL5 A; 2VYT A; 3OYA A; 1WI7 A; 1ZSZ B; 2LQK A; 2X9H A; 1VQ4 T; 1KQS A; 1KSW A; 5A0G A; 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