The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QVF P; 3CXC P; 1VQ9 Q; 3CME Q; 3I56 Q; 1N8R R; 3CMA Q; 3CC4 Q; 1VQ7 Q; 1YI2 Q; 1YHQ Q; 1W2B P; 1YIJ Q; 3CC2 Q; 1Q82 R; 1VQP Q; 1K8A R; 1VQL Q; 1K9M R; 3CCE Q; 1VQN Q; 1KD1 R; 3CCR Q; 3CCL Q; 3CC7 Q; 3CPW P; 3G4S Q; 1Q7Y R; 2QEX Q; 1Q86 R; 1M1K R; 2OTL Q; 1YJW Q; 1KQS P; 1VQO Q; 1YIT Q; 3CCU Q; 1YJN Q; 1S72 Q; 1K73 R; 3CCQ Q; 2QA4 Q; 3I55 Q; 1JJ2 P; 1Q81 R; 1NJI R; 1VQM Q; 2OTJ Q; 1KC8 R; 1VQ8 Q; 3CCM Q; 1VQK Q; 1VQ5 Q; 3G6E Q; 1QVG P; 3CCV Q; 3CCS Q; 1YJ9 Q; 3CD6 Q; 1M90 R; 3OW2 P; 1VQ6 Q; 1VQ4 Q; 3G71 Q; 3CCJ Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 1JQQ A; 5CKB A; 2XKO C; 5GMK e; 1H64 1; 4PLI A; 4XTZ A; 1PNJ A; 8ATC B; 1VYU A; 2DJZ A; 2QXF A; 1YNZ A; 2M16 A; 1VQ4 A; 4FYX B; 2FZC B; 2VWF A; 1V1C A; 1K73 R; 2E3H A; 2QI2 A; 1BK2 A; 3OYC A; 1W6X A; 2P0Q A; 1MMG A; 3QG1 A; 1SHF A; 4QQ6 A; 1YJN A; 4O6J A; 4Z89 A; 4QVC A; 1NM7 A; 2RQR A; 1M9S A; 1KG1 A; 1ZSG A; 4OML A; 4BY6 C; 3EG0 A; 4DBH A; 2YUN A; 4M7A G; 3EFO B; 1Q95 G; 3CXC S; 2DIG A; 3I55 T; 1G3W A; 3EAE A; 3NGP A; 4CC4 B; 4F7U A; 3SWN C; 1QMC A; 1VQ6 Q; 4PK4 A; 1D3B A; 2KR3 A; 4B9W A; 2RHX A; 3PMT A; 2K5L A; 3QDR B; 3RKW A; 5LJ3 f; 4J9E A; 5A2Q E; 1ACM B; 3EGX B; 2DVE A; 2LDM A; 1QQJ A; 2LT4 A; 1GBQ A; 1SSH A; 3G7Z A; 2K9G A; 3HKS A; 4E7L A; 1H8K A; 1OV3 A; 3OYI A; 1QKW A; 3CCS Q; 3VYH B; 2VKN A; 2CSQ A; 1T0H A; 2GQI A; 2VGM A; 2PVO B; 2DO3 A; 4OP0 A; 2OAW A; 2HQX A; 3BY7 A; 4QT7 A; 4C92 E; 2LX7 A; 2F69 A; 5CKE A; 2KRO A; 2R58 A; 1XJW B; 1AWO A; 1T3S A; 3S3M A; 1VQL A; 1O9S A; 3RMQ A; 3EGD B; 5DM7 R; 1M5Q 1; 3OB9 A; 1VA7 A; 2XIC A; 4M75 G; 1QW1 A; 3JV3 A; 2Z0W A; 1ABQ A; 4E7I A; 1D1B A; 2CT4 A; 4IUQ A; 4NL2 A; 4Z8A A; 3JCM e; 3CCV A; 1UGV A; 3H0H A; 1VQ6 A; 1WHH A; 5HCK A; 4RTY A; 2WSE E; 4M7A A; 2V8I A; 5DLO A; 1VQO T; 5LJ5 f; 4AFZ C; 3TSW A; 1M2V A; 4MDW A; 4HKE A; 5HK3 A; 1E7O A; 4IUT A; 1Y96 B; 4FU6 A; 3VRZ A; 3CCU A; 3CXC A; 1T0J A; 2NUT B; 3QBY A; 3QZ5 B; 2RJE A; 4PJO C; 2DTI A; 3VV0 A; 3J81 E; 1QLY A; 3CCS A; 2RJC A; 3REB B; 3EFS A; 1ZSZ C; 3M4Y A; 4XU2 A; 2KXC A; 1YP5 A; 4BI4 A; 5LJ3 h; 1BIB A; 2FG0 A; 2MIO A; 2J6F A; 4M78 B; 4PJN A; 5D7U A; 2KE9 A; 1QVF S; 2OTJ Q; 4HCC A; 5GAO p; 1Y57 A; 3G4S A; 1OX9 A; 2L3P A; 2JJ9 A; 2BIV A; 1MGQ A; 1YWP A; 3HRS A; 5ECA A; 4BAC A; 3G71 T; 2FB7 A; 1YHQ Q; 4BE2 A; 2H8H A; 3HFN A; 1GFD A; 2O4X A; 1B07 A; 1IHW A; 3I56 A; 3V8K A; 1WJR A; 4II1 A; 1C1A A; 4DEX A; 2LCL A; 3V8L A; 5I22 A; 1ABO A; 4KT0 E; 2K7A A; 1OZ2 A; 1NJI U; 4M75 A; 2HCK A; 4XAX B; 1VQ7 Q; 2RQU A; 1D09 B; 2NUP A; 1JB0 E; 1YIJ T; 1N8R U; 3HFO A; 3JB9 I; 1LCK A; 1NLP C; 2RM4 A; 2SEM A; 5EG2 A; 1OU8 A; 3PT9 A; 1NLO C; 3VS4 A; 2H3E B; 3J7A F; 1YFN A; 2ZPE B; 5LJ5 h; 3QZ9 B; 2CT3 A; 3I5S A; 3E19 A; 1PCX A; 4MZP A; 2EAY A; 4M7D C; 2JTE A; 5FU6 C; 3CBM A; 3GIB A; 3THK A; 3OS2 A; 4KGV B; 5GJW B; 3WVE B; 5GAM h; 4N4G A; 3LH5 A; 4LN2 A; 3X28 B; 2L89 A; 4C0D B; 1XOV A; 2DJQ A; 3VRY A; 2RN8 A; 5FRM A; 3RER A; 2DD4 A; 3UPU A; 4M78 F; 2IPO B; 1TOV A; 3CME T; 2O9V A; 4QQD A; 5GAN j; 1WJS A; 3GOX A; 1M8V A; 1RAA B; 2HL5 C; 1WIE A; 2O9S A; 5I11 A; 3OW2 A; 1GCQ C; 4GLK A; 4J6Y A; 3I55 A; 4OB2 B; 1KSW A; 4RTV A; 1RI9 A; 2JMC A; 2DIL A; 4FSX A; 3NTK A; 2PVG B; 4BDY A; 4JLG A; 4YTL A; 3PTA A; 1BKB A; 3CCL T; 2EFI A; 4PLL A; 3DLM A; 2A37 A; 2LC4 A; 2RK2 A; 2LT1 A; 2RPN A; 2QQ9 A; 3PVQ A; 2F2W A; 5IT9 E; 3CD6 T; 2KBT A; 2AT1 B; 4ZTJ A; 2L8D A; 1TSF A; 1KHC A; 2DA9 A; 1BU1 A; 3M0U A; 4F7U B; 1M3A A; 4J9F A; 2LJ0 A; 4JZ4 A; 3CC7 Q; 1WQW A; 1D3B B; 4M77 A; 1K73 C; 4ANJ A; 2HZY A; 1U1T A; 4KH1 B; 4PJL A; 4OMM A; 1OYX A; 2CUB A; 5CQX A; 3G71 Q; 1Z9Z A; 3CXC P; 3MPU B; 2KXD A; 2YUP A; 1ZUY A; 2BZY A; 1JXO A; 1VQ5 A; 2KSS A; 4OVA A; 5GMK i; 4M7D B; 5GAO r; 3MP8 A; 1SG5 A; 3RBB B; 1NBE B; 4QVZ A; 3ME9 A; 4JS4 A; 2QTV A; 4LE9 A; 2PZ1 A; 4P5N A; 4PJM A; 3MKD A; 1M3B A; 3S3O A; 4M78 D; 4KRT A; 1VQO A; 3KBG A; 3KXT A; 1B7T A; 3VS7 A; 1X2Q A; 5DY9 A; 2GQV A; 1YIJ Q; 3JCM W; 1FMK A; 1K8A R; 1G8X A; 1PHT A; 4NL3 A; 2V26 A; 2KT1 A; 4X34 A; 1U06 A; 1UG1 A; 2CH4 W; 5GAN d; 4JJN K; 3V8J A; 3C0C A; 5IXF A; 3OYA A; 2NUZ A; 2EQI A; 3ER0 A; 4DBR A; 2KGT A; 2DXC A; 4M7A B; 1VQK T; 5GAN g; 3CPW S; 2GGR A; 1M2V B; 5GJV B; 4E47 A; 3OYN A; 1NEB A; 2G6F X; 2J7I A; 5CKF A; 3CCE Q; 3L2U A; 2LVM A; 3G71 A; 1Q86 R; 1K0X A; 4C0F A; 3CBO A; 3X24 B; 1BI0 A; 2RI3 A; 5GMK h; 2FL7 A; 4LNP A; 1BCO A; 1LNX A; 2D0Q B; 3GF5 A; 3PNW C; 4PL6 A; 5GAN 6; 1K9M R; 2KRM A; 1IGQ A; 5KYX A; 3CCJ A; 4J7F A; 2LJ3 A; 2DER A; 2GTJ A; 1MUZ A; 3M53 A; 1U8R A; 1AHJ B; 1Q86 U; 4M7D F; 1N9R A; 1VQM T; 1NE8 A; 3INZ A; 2QAZ A; 1PG5 B; 1IGU A; 5EC7 A; 4OB1 B; 1D0Y A; 4C8Q E; 3JCM J; 4E7J A; 1X69 A; 1Q7Y R; 1G3T A; 1QVF P; 1BCM A; 3I5R A; 2K3X A; 4XTV A; 1I81 A; 1BYM A; 1G3S A; 2ZZD A; 4X1V A; 1VYT A; 2KI7 A; 3R6O A; 2K3Y A; 3CCL Q; 2LCS A; 4M75 B; 1TUD A; 2DX1 A; 5LJ3 j; 1K76 A; 2C0I A; 2EYY A; 2RO0 A; 3ZFJ A; 2KRS A; 3OYJ A; 1VQ8 Q; 3TRE A; 4RUG A; 3CD6 Q; 3UWN A; 1Z9Q A; 3CCV T; 5GAO n; 1GBR A; 2W0Z A; 4CC3 A; 3SB2 A; 4JUV A; 4M7A F; 1YI2 T; 2YXY A; 1BI3 A; 3CEY A; 1TTH B; 3CME A; 1S72 Q; 3CC4 A; 2D8H A; 1UFF A; 1W2B S; 1PSE A; 4JPB W; 4Y91 A; 1QCO A; 1FMV A; 1PM3 A; 3VUZ A; 1R0B G; 1RAH B; 5AT1 B; 1SF9 A; 4XQ3 A; 3H0F A; 3JAM E; 4AG1 C; 2HSE B; 4HT8 A; 4DEY A; 3HSB A; 3RNJ A; 1W4S A; 3LWH A; 4L59 A; 2FHD A; 2YUQ A; 2EW3 A; 2XDB A; 1WHM A; 2EGA A; 5LJ5 j; 2ZGW A; 2CP7 A; 2K4Y A; 1M90 R; 5I2M A; 4JJD A; 1VQ4 Q; 4E7K A; 2CRE A; 2LQN A; 3UA7 A; 1H92 A; 3L2Q A; 3C12 A; 4C5G A; 1WDX A; 1V29 B; 1YJN Q; 2ABL A; 4M7D D; 3FEO A; 2ZPI B; 3MO8 A; 4EMH A; 3HP9 A; 4C92 G; 2LRQ A; 3NHN A; 3DKM A; 4M75 F; 4JRP A; 1VQK Q; 4Y92 A; 4LDU A; 1WLP B; 4F7U G; 4BUG A; 3GPL A; 3T9N A; 3CBP A; 3H8Z A; 1WYX A; 2DRK A; 2CZ6 B; 3OS0 A; 3JB9 J; 4J83 A; 4BDZ A; 2E1H A; 2DKG A; 2K2V A; 2DFU A; 2LX9 A; 5GAN 3; 2G3R A; 4EIK A; 3ASK A; 1UE9 A; 3M0Q A; 2DL4 A; 3E9F A; 2KYB A; 3OQ5 A; 4XU3 A; 5LJ3 d; 3M5A A; 3UA6 A; 5GAN 2; 2C0T A; 1QCF A; 3JRZ A; 1WZO A; 4F16 A; 5J39 A; 5LJ3 g; 5GAO q; 4M7A D; 2EYQ A; 2XID A; 2QG9 B; 3A1P A; 5GAO m; 1TUC A; 2X3W D; 5KYY A; 3NFC A; 1TXQ A; 2BZX A; 2WAC A; 2GFA A; 4J9B A; 3RUX A; 2M02 A; 2XG8 D; 3CCR T; 1PRM C; 1I07 A; 4LDW A; 2GFU A; 3ULR B; 3DB3 A; 3AT1 B; 4OMP A; 1MV0 B; 2CH4 A; 3X25 B; 4JRQ A; 2CSI A; 5L8R E; 4FSS A; 2K3B A; 3OYL A; 2FO0 A; 4J9G A; 4A4G A; 2CP5 A; 2PUK B; 1VQK A; 1VQL Q; 2EYX A; 1D0X A; 2KAF A; 2FZK B; 4C0Z A; 4EMK C; 4C92 A; 3QJY A; 1M1F A; 3P8D A; 1MMN A; 5GMK m; 1K73 U; 2BUD A; 2VVK A; 3QUI A; 4M78 C; 3JB9 G; 3CCV Q; 5HKC A; 2DYI A; 5LJ5 d; 4AFU C; 4JZ3 A; 2CKK A; 3RKY A; 1PD1 A; 1AOJ A; 2KRN A; 2MMP A; 5LJ5 g; 4MML A; 1TWB A; 4PJO E; 4RG8 A; 4J6X A; 1N6A A; 2ATC B; 3CCU Q; 4DBF A; 2PUO B; 4OMQ A; 3DLL A; 4M75 D; 5A0G A; 5GAN 7; 3FJ5 A; 2JM8 A; 1UTI A; 2RHZ A; 9ATC B; 1X6G A; 3CCQ A; 4FL6 A; 2ROT A; 1VQM A; 2L3Q A; 1PD0 A; 4RKU E; 4DA4 A; 1K8A C; 4QVD A; 3CPW P; 3G4S Q; 3OMG A; 3N5B B; 2D8J A; 2LNH B; 4A4H A; 4A4F A; 3Q1J A; 1WI7 A; 3EH2 A; 3M57 A; 1RLP C; 2X9H A; 1VQ5 T; 1WXB A; 2ZAE A; 4PFO A; 3TCJ A; 5KYW A; 2DEU A; 2KT8 A; 3CQT A; 2EQJ A; 3I56 Q; 3L1A A; 1Q82 R; 1I5O B; 3NTH A; 5HK0 A; 3VU3 C; 1Q86 C; 3OYY A; 1JBM A; 4XU1 A; 1YI2 A; 3R6N A; 4OF1 A; 1OQK A; 1KFZ A; 2EQU A; 4C0D C; 4RTW A; 4ZNX A; 2L0A A; 5GMK j; 5IHK A; 5CCA A; 1X01 A; 2CS7 A; 2DE0 X; 2EJF A; 1OU9 A; 5FWC A; 2YUO A; 3VJP A; 5GAM f; 2BZ8 A; 2ESW A; 3QII A; 4C5I A; 4EMK B; 2OTL T; 4M7D E; 5GAN e; 1VQP A; 1UGQ B; 3RKX A; 3OS1 A; 2FPE A; 4WCI A; 2J06 A; 2VUB A; 3E9G A; 2RJF A; 3EFR A; 1HSQ A; 3C95 A; 3X26 B; 1Q7Y C; 1I1J A; 4D8D A; 5J26 A; 2V1R A; 1U1S A; 4OMN A; 2EQK A; 5CIU A; 3TU4 K; 2P84 A; 2K57 A; 2RD1 A; 2VXE A; 4WF2 A; 1LJO A; 2E3I A; 3A8H B; 3JCM b; 2MK5 A; 2EVR A; 5CVI A; 1PKS A; 1RAB B; 2RMO A; 1FWZ A; 4Z02 A; 2DTO A; 3CCJ T; 1W2B P; 3OYK A; 1VOM A; 2VV5 A; 3JSC A; 2ROL A; 3ZBD A; 3L2R A; 1M1K R; 3OS5 A; 1D1C A; 1AWW A; 2RH2 A; 4JRK A; 1C0M A; 2J6O A; 5I21 A; 3I55 Q; 5LL6 S; 2KMT A; 2K6D A; 3JCM P; 2NWM A; 3P8B B; 4LXC A; 2E6Z A; 1U5S A; 2B8A A; 4CC7 A; 2EIF A; 1ZX6 A; 4PFP A; 2DNU A; 1KHI A; 1LVK A; 2E5Q A; 3UT1 A; 4PFZ A; 1M30 A; 1KD1 R; 4L6V 5; 3A8L B; 2HBP A; 1UB4 A; 2DXB A; 4M77 G; 1NYF A; 5A0D A; 1JU5 C; 2M51 A; 2V8K A; 3X20 B; 1KIK A; 3ZL7 C; 4LDV A; 3CCR A; 3L2W A; 1M1G A; 1M90 C; 1AWX A; 3PMI A; 4E6R A; 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3PGG A; 2X4W A; 3V7R A; 1YWO A; 4HVW A; 1RI0 A; 4LUE A; 4XTU A; 3A5Z B; 2EYZ A; 3BW1 A; 4LUD A; 1M3C A; 2OTL A; 3GNF B; 1WA7 A; 6AT1 B; 5FU7 B; 3LGF A; 1Y71 A; 1NPR A; 4N4H A; 4C8Q A; 2LQW A; 2DZC A; 1E6G A; 4C92 F; 4KUI A; 1VYV A; 3KFV A; 1YJW T; 1K8A U; 1WNL A; 2DTH A; 4F7U F; 2X4J A; 4B9X A; 1BI2 A; 3A8O B; 3WXM B; 2IVW A; 2QDL A; 3G6E T; 3FIF A; 2A7Y A; 2RA2 A; 5LJ5 e; 2L3R A; 2CUD A; 1VIE A; 2E12 A; 3M0P A; 5FRO A; 1IZ6 A; 3CME Q; 1JRI A; 4HA8 A; 3CC4 Q; 1RUW A; 3M58 A; 4RCB A; 1Q82 C; 2V8J A; 3QJ6 A; 3G1J A; 2ZPH B; 1A0N B; 1M27 C; 4A4E A; 1AEY A; 5GAO l; 4HCK A; 3QKJ A; 2COY A; 3CCQ T; 2DM1 A; 3JCM f; 2O4X B; 2YRD A; 3SEM A; 5KYN A; 1UHF A; 2H3J A; 1BI1 A; 3D7S B; 1WJQ A; 1TG0 A; 3PE0 A; 4HVU A; 3EGD A; 2DYB A; 1N5Z A; 2YT6 A; 3O5Z A; 2ZPG B; 4FW1 A; 2RK1 A; 1QVG S; 2D9T A; 2RHU A; 1HJD A; 1K9M U; 2ED0 A; 4DBQ A; 2ZPB B; 2ZPF B; 2YWW A; 5IH2 A; 1RAE B; 2DF6 A; 1QVP A; 2NUP B; 2VAS A; 1KC8 R; 5KE3 A; 2XHC A; 2F5K A; 4A53 A; 1N27 A; 4M77 C; 2KK4 A; 2MPX C; 4RG2 A; 5GMK l; 3OYM A; 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