The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
KELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVGDRQGFVPAAYVKKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Thermodynamic and Structural Characterization of Asn and Ala Residues in the Disallowed II' Region of the Ramachandran Plot
pubmed rcsb |
| molecule tags |
Cytoskeleton
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| source organism |
Gallus gallus
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| molecule keywords |
ALPHA II SPECTRIN
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| total genus |
12
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1999-08-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HJD A; 4LE9 A; 1T3S A; 3LH5 A; 1ZUU A; 2DX1 A; 4RTU A; 2EKH A; 1BB9 A; 2DVJ A; 2HDA A; 2MCN A; 1CSK A; 2DIL A; 1U5S A; 1AWO A; 2LZ6 B; 1WLP B; 4F17 A; 1X69 A; 3I9Q A; 1SRM A; 2D8H A; 2L3Q A; 1WXU A; 4X1V A; 2ROL A; 4Z89 A; 4AFU C; 2J06 A; 2A28 A; 2JM8 A; 2ESW A; 5IHK A; 1V1C A; 4EIK A; 1K4U S; 1MV3 A; 2GTJ A; 2CUB A; 2A37 A; 3H0H A; 3I5R A; 3UA6 A; 2C0O A; 1AD5 A; 1I0C A; 4F16 A; 1RLQ C; 1PNJ A; 3NHN A; 1K9A A; 2AK5 A; 1QLY A; 1WFW A; 1T3L A; 1X2Q A; 2RPN A; 5FWC A; 5GJV B; 1K1Z A; 1B07 A; 1UUE A; 4J9I A; 3REA B; 1H8K A; 2HBW A; 2G6F X; 2HSP A; 1YP5 A; 3M0T A; 4AG2 C; 1WDX A; 2L3P A; 3UF4 A; 1K76 A; 1AEY A; 2DA9 A; 3EG2 A; 4OMP A; 1NYG A; 2DL8 A; 1T0H A; 2PNI A; 2KXC A; 4JZ4 A; 3GBQ A; 3SHW A; 2DLP A; 3EHR A; 4JZ3 A; 1YWO A; 1HD3 A; 2YSQ A; 4GBQ A; 3O5Z A; 2SRC A; 1GBQ A; 4J9H A; 2EBP A; 2AKK A; 2V1Q A; 2FPE A; 2AKL A; 4DEY A; 1QWE A; 4ZNX A; 3VS5 A; 1M3C A; 4Z8A A; 2O9V A; 4WCI A; 2MIO A; 1Y57 A; 1QWF A; 2K6D A; 1FYN A; 2V1R A; 3M0R A; 1M8M A; 2EGE A; 2LCS A; 3UAT A; 1AVZ C; 1WI7 A; 2EPD A; 2JTE A; 5IXB A; 2AZS A; 3NPF A; 3VS1 A; 1OPK A; 5IHI A; 4F14 A; 1W1F A; 4HXJ A; 4RTZ A; 4JJD A; 3ULR B; 3NGP A; 4AG1 C; 2ROT A; 2ECZ A; 1KSW A; 1X2K A; 1X27 A; 1UDL A; 2F2X A; 2LJ0 A; 2CH4 W; 1G2B A; 5I22 A; 1GFD A; 2DE0 X; 3M0P A; 1SSH A; 4HVV A; 2JMA A; 1KIK A; 2LNH B; 2PTK A; 1JU5 C; 1MUZ A; 2OAW A; 2RF0 A; 1GCQ A; 2HEQ A; 3EHQ A; 1NEG A; 2FRY A; 1GRI A; 1U3O A; 3H0F A; 2EYY A; 4IIO A; 5GJW B; 5IHN A; 3EG0 A; 1W6X A; 4RUG A; 1M27 C; 1RLP C; 3U23 A; 1PRM C; 4K11 A; 5FW9 A; 5HCK A; 3EG1 A; 2W0Z A; 3VRY A; 4CC2 A; 2JS0 A; 2YT6 A; 1SRL A; 2DBM A; 1VYU A; 2DL3 A; 3REB B; 2KRS A; 1JXO A; 3VS0 A; 1GBR A; 1GFC A; 2D8J A; 1PWT A; 2QDL A; 2D0N A; 1WXB A; 2NUZ A; 2DRK A; 2YDL A; 2W10 A; 2JM9 A; 4RTX A; 2OI3 A; 3VRZ A; 3EG3 A; 3M0Q A; 4ORZ A; 2O9S A; 2FEI A; 1AZE A; 2JW4 A; 2BZ8 A; 2CSQ A; 1VYT A; 4J9C A; 3VS3 A; 2DYB A; 5I11 A; 1YNZ A; 2CSI A; 2BTT A; 4OML A; 1Y0M A; 2K79 A; 1UGV A; 1NYF A; 2CUD A; 1M3A A; 4J9G A; 2YUP A; 1CKA A; 1BBZ A; 1WIE A; 1U06 A; 3THK A; 2RQU A; 3CQT A; 4CC4 B; 1E6H A; 3EGU A; 2JMC A; 2K9G A; 1ZUY A; 2RMO A; 1NLP C; 2ABL A; 2KT8 A; 4KRT A; 2RN8 A; 2A36 A; 4J9D A; 2HCK A; 2M51 A; 2NWM A; 2DL5 A; 2IIM A; 1RI9 A; 5IH2 A; 2DL7 A; 3PE0 A; 1SPK A; 1TUC A; 2KRO A; 4HVU A; 2KNB B; 2EVR A; 2K7A A; 1QKX A; 1Z9Z A; 2KYB A; 1QKW A; 1YWP A; 2LQW A; 4RTW A; 1E6G A; 3TVT A; 1WX6 A; 3NMZ C; 4E6R A; 1VYV A; 2L0A A; 2DM1 A; 2CT4 A; 1S1N A; 2DL4 A; 1NEB A; 2RQV A; 4CC3 A; 1NG2 A; 2X3W D; 1TUD A; 1VA7 A; 1JXM A; 2ED1 A; 3VS6 A; 3PVQ A; 1OV3 A; 2FPD A; 1G83 A; 3H0I A; 4JPB W; 2BZX A; 3KFV A; 4OMQ A; 2X3X D; 4JJC A; 3SEM A; 2EYW A; 2M0Y A; 2DNU A; 2YUO A; 2FO0 A; 2C0T A; 2LJ1 A; 2DJQ A; 2KXD A; 1EFN A; 4GLM A; 2YUN A; 2F2W A; 2VVK A; 1B3Q A; 2C0I A; 4J9E A; 3UA7 A; 1FMK A; 2O88 A; 2J6O A; 2VWF A; 1ABO A; 4J9B A; 4RTV A; 4Y92 A; 2KGT A; 4AFZ C; 1A0N B; 1UEC A; 4DEX A; 2DRM A; 2ED0 A; 2KR3 A; 2VKN A; 2XMF A; 2L3S A; 1QCF A; 2A08 A; 1GCQ C; 4OMO A; 1KJW A; 4CC7 A; 4IIM A; 3ZL7 C; 1I1J A; 1X43 A; 1YCS B; 5ECA A; 1OOT A; 1I07 A; 2RNA A; 3M0S A; 2EGC A; 1NLO C; 1JO8 A; 2EYX A; 1UE9 A; 3M0U A; 2H8H A; 2KE9 A; 2LQN A; 2FG0 A; 1IO6 A; 2GQI A; 2O2O A; 2KT1 A; 4R0K A; 1PRL C; 2GBQ A; 1OEB A; 1SHG A; 2DMO A; 2ENM A; 1TG0 A; 2JXB A; 1K0X A; 2MOX A; 2EQI A; 2P4R A; 2EW3 A; 5L23 A; 1ZX6 A; 3I5S A; 1AWX A; 1X6G A; 1H3H A; 1PHT A; 2GGR A; 3RNJ A; 2JS2 A; 1WYX A; 1KFZ A; 1K0S A; 1JEG A; 2J6F A; 2FRW A; 3R6N A; 1UHC A; 2D1X A; 2KRN A; 4LUD A; 1HSQ A; 4D8D A; 1ZBJ A; 1M30 A; 2EGA A; 2LP5 A; 3QWX X; 1SHF A; 4OMN A; 2LMJ A; 3VS4 A; 2OJ2 A; 2KRM A; 3VS2 A; 4D8K A; 2K3B A; 4LUE A; 2E5K A; 2CH4 A; 2K2M A; 1JQQ A; 1ZLM A; 1ABQ A; 3RBB B; 4LN2 A; 1XOV A; 1W70 A; 2GTO A; 2LX7 A; 1T0J A; 1GCP A; 2JT4 A; 1H92 A; 5FWB A; 1OPL A; 2B86 A; 3FJ5 A; 3TSZ A; 1NM7 A; 4FSS A; 4HVW A; 1SEM A; 1ZUK A; 2J7I A; 1ARK A; 5IXF A; 4RTT A; 2RQW A; 1N5Z A; 4Z88 A; 2I0N A; 1UG1 A; 5EC7 A; 1YN8 A; 2DBK A; 4HCK A; 3IQL A; 2J05 A; 1PKT A; 1M3B A; 2LJ3 A; 4OMM A; 1AWW A; 1AWJ A; 3PVL A; 4QT7 A; 1UJ0 A; 1WA7 A; 1BU1 A; 4LNP A; 4ESR A; 3QWY A; 1AOJ A; 2DF6 A; 1WXT A; 1E7O A; 2EYZ A; 4AFS C; 4J9F A; 1UFF A; 2CRE A; 3TSW A; 2PZ1 A; 3I35 A; 1RUW A; 2RQT A; 1X6B A; 2CDT A; 1BK2 A; 1LCK A; 1PKS A; 2SEM A; 2RQR A; 4JJB A; 1J3T A; 2YUQ A; 1MV0 B; 2O31 A; 1GL5 A; 4M4Z A; 2GNC A; 2L2P A; 4RTY A; 3H41 A; 3VS7 A; 4A63 B; 2FPF A; 2KEA A; 4AFQ C; 2KBT A; 1Z9Q A; 1CKB A; 2F2V A; 2CT3 A; 1UTI A; 3A98 A; 1UHF A; 2AZV A; 2J6K A; 1AZG B; 1ZSG A; 2KYM A; 3JV3 A; 3C0C A; 2BZY A; 1UJY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1HJD A; 1OZ2 A; 3UWN A; 1ZUU A; 4XU0 A; 2EKH A; 1RL2 A; 4M7D F; 2DVJ A; 2HDA A; 2QGG A; 2DIL A; 3H8Z A; 1JJ2 A; 4O5V A; 1YIJ Q; 2V26 A; 2LZ6 B; 2COZ A; 4JRK A; 2D8H A; 2L3Q A; 4JRP A; 3LH0 A; 2LT1 A; 3SD4 A; 4M78 D; 2ROL A; 1N9R A; 4AFU C; 2RB6 A; 4M7A F; 2A28 A; 3DB3 A; 2D6F A; 1M9S A; 1BIB A; 2JM8 A; 2ESW A; 2HNI A; 4J7I A; 4EIK A; 1K4U S; 1MV3 A; 2CUB A; 2A37 A; 4NOY A; 1NJI R; 3I55 Q; 1QCN A; 3I5R A; 2EJ9 A; 1WNL A; 2Y4Y A; 3OS5 A; 4F16 A; 1RLQ C; 1PNJ A; 3NHN A; 2AK5 A; 4UC4 A; 1X2Q A; 4J5Y A; 1B07 A; 1K1Z A; 1UUE A; 4XU2 A; 3EAE A; 4OGE A; 3REA B; 1H8K A; 3JCM V; 4KH1 B; 3FJP A; 2HSP A; 1MGQ A; 4Q5W A; 2QA4 Q; 4C8Q B; 5GAO l; 2L3P A; 1UB4 A; 3A8H B; 3OBW A; 1NYG A; 2DL8 A; 1T0H A; 3CC4 Q; 1VQL A; 2PNI A; 3JB9 F; 5GAO m; 5KYU B; 5CKE A; 3QKJ A; 3GF5 A; 4PJL A; 3RES A; 3RUX A; 3OS0 A; 1WJS A; 2CKK A; 1NZ9 A; 4Z8A A; 2O9V A; 2QQB A; 2MIO A; 8AT1 B; 1FYN A; 4DBH A; 1F1B B; 5GAN j; 4KUI A; 2LCS A; 3UAT A; 1G3W A; 3A5Z B; 2RM4 A; 5FU6 C; 3LX7 A; 3HHT B; 3PFS A; 5IXB A; 2AZS A; 3NPF A; 5IHI A; 3C94 A; 1U8R A; 2M02 A; 1NJI U; 5KCH A; 3NGP A; 1KQS S; 2X51 A; 2ROT A; 3HPW A; 2ECZ A; 3OBY A; 3I56 Q; 3MCA B; 1BIA A; 4CI0 C; 2PVG B; 2WSC E; 5GAM g; 1KIK A; 2M16 A; 2PTK A; 3NFC A; 2XHC A; 2OAW A; 2LCL A; 3CEY A; 2KK4 A; 2X4W A; 4ELY C; 2LCC A; 5KYN A; 1GRI A; 3EG0 A; 2EAY A; 4BI4 A; 3V8J A; 3CCQ Q; 1RLP C; 3U23 A; 1LVK A; 2YLB A; 5KYU A; 3GPL A; 4JRI A; 1XNI A; 3EG1 A; 4F7U F; 2VV5 A; 2DK3 A; 3VRY A; 4CC2 A; 2DBM A; 5FRN A; 1LNX A; 1Y96 A; 3OS1 A; 1VQK A; 2CP5 A; 2R5A A; 3MHX A; 3GLX A; 2MAM A; 2YDL A; 3WVD B; 1M1K C; 4BY6 C; 2DD4 A; 5FU6 B; 5DLO A; 3E2U A; 3CCS Q; 2OI3 A; 3EG3 A; 3OA6 A; 4XTU A; 3G4S A; 3VYG A; 3CMA Q; 1Q95 G; 1VQK T; 3TEE A; 2DYB A; 5I11 A; 1PSE A; 1Y0M A; 2GF7 A; 2K2V A; 2CUD A; 4J9G A; 1NBE B; 2YUP A; 1BBZ A; 3JCM b; 4RMO A; 2RQU A; 4CC4 B; 4M7D E; 3EGU A; 3RMS A; 2HKQ B; 2MWO A; 3G4S T; 1ZUY A; 4PJO E; 2ABL A; 4QKU A; 1XTD A; 2HCK A; 4FSX A; 3C95 A; 4QQG A; 1ZSZ A; 2QYZ A; 3RER A; 4E47 A; 5IH2 A; 1VIE A; 2KQW A; 3HL8 A; 1SPK A; 1TUC A; 2RI2 A; 4M7A E; 2VC8 A; 2EVR A; 1QKX A; 4XK8 E; 1YWP A; 1TSF A; 3LLR A; 4MDX A; 3TVT A; 1WX6 A; 4A4E A; 3NMZ C; 2E4H A; 3HRT A; 2RHZ A; 5A0D A; 2DM1 A; 1NEB A; 3G1J A; 3E1S A; 3QPH A; 1C6V X; 3G71 Q; 1M1K R; 3CCR Q; 2X3W D; 4BB7 A; 1TUD A; 2NUP A; 3HSB A; 4BY6 B; 3CCL A; 2JZ2 A; 1RAF B; 4JLG A; 1PD1 A; 3E9G A; 5CVI A; 1OU9 A; 2JJ9 A; 2X9H A; 3A8G B; 4OMQ A; 5CR2 A; 3OMC A; 2CYZ B; 4JJC A; 4YTL A; 2DAQ A; 3OW2 S; 4ZTF A; 2L89 A; 2MMP A; 2C0T A; 2A7Y A; 4QQ6 A; 2DXU A; 1G3S A; 3CCL T; 4GLM A; 3OSS C; 1VQ6 A; 3J7A F; 5C6S A; 3UA7 A; 4BAC A; 2J6O A; 1IB8 A; 4J9B A; 4J6Y A; 2KGT A; 4JLI A; 4M7D C; 2A3L A; 2ED0 A; 2KR3 A; 4C5H A; 4PJO C; 2L3S A; 1QCF A; 4J8O A; 3QYG B; 1N8R R; 4IIM A; 5ECA A; 5LJ3 g; 2HMA A; 1VQ6 T; 3OYC A; 4FW2 A; 3SDZ A; 1K9M C; 4MZM A; 2RA2 A; 5D6Y A; 3HFN A; 1UE9 A; 2HQX A; 5LJ5 e; 1VQN A; 3OYL A; 4M7A C; 3QDR B; 2DO3 A; 3CME T; 3OYI A; 2K3X A; 2O2O A; 3JCM f; 1M5Q 1; 1M1K U; 2QI2 A; 2JXB A; 3MKD A; 2LDM A; 2EW3 A; 4LD9 K; 5CCA A; 5CQY A; 2MF2 A; 1ZA2 B; 3OYK A; 3RNJ A; 2FHD A; 1WYX A; 1VQN T; 1K0S A; 3RMQ A; 4M75 G; 1YI2 Q; 1YJN Q; 2K5L A; 4D8D A; 4E7Z A; 2EGA A; 4WTO B; 2XG8 D; 2KAF A; 4BE0 A; 2ZPG B; 3VS4 A; 2OJ2 A; 4RCC A; 2B8A A; 3VS2 A; 4M75 A; 1MMD A; 2R58 A; 2HZY A; 3SB2 A; 1JQQ A; 2XI9 A; 4KGV B; 5IN1 A; 3MEA A; 3X26 B; 1D1C A; 4NS5 A; 3JCM c; 5GAN 7; 4M7D B; 2X4Y A; 2JT4 A; 3RIR A; 5GAN 8; 5IT9 E; 5HK3 A; 1JJ2 S; 2QAS A; 3FJ5 A; 4PJO B; 1N8R U; 4FSS A; 3PMT A; 2QDY B; 3CCE A; 2QTV A; 3SWN C; 1UGR B; 6AT1 B; 4X34 A; 5CIU A; 4PL6 A; 2HL5 C; 4KGZ B; 5I2S A; 3OYA A; 4N0A C; 2QQS A; 2DBK A; 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2YRV A; 3WVE B; 2G6F X; 4AT1 B; 5GAN 3; 1K76 A; 3SWN A; 3EG2 A; 3CC4 T; 5KYX A; 1R0B G; 4MML A; 4QW2 A; 3GBQ A; 1BYM A; 2FVU A; 3EHR A; 4JS4 A; 1P92 A; 3HRU A; 4GBQ A; 2SRC A; 1GBQ A; 2EBP A; 3QSU A; 4PLI A; 4IUU A; 4KBM B; 1OZ3 A; 3M59 A; 4KT0 E; 5D6W A; 4L5G A; 1M90 C; 4WCI A; 1Y57 A; 1QWF A; 2V1R A; 1NPR A; 3I56 A; 3M0R A; 1KK7 A; 3CXC P; 2EGE A; 2CZ6 B; 4AMC A; 1FMW A; 2CP2 A; 2RI3 A; 4FYX B; 1VQ5 Q; 2EPD A; 3M54 A; 3VS1 A; 2JN0 A; 2M0O A; 3SFM A; 4F14 A; 1W1F A; 3CCV A; 1M2O A; 4C92 C; 1IGU A; 3ULR B; 1KC8 U; 1XJW B; 2LNV A; 4F7U G; 5IAY A; 3I56 T; 2DIG A; 1OI1 A; 2CP0 A; 2BUD A; 2R57 A; 4M77 E; 2E1H A; 1UDL A; 2F2X A; 1G2B A; 1KD1 R; 4F7U A; 2GFU A; 1JU5 C; 1MUZ A; 1WHH A; 4ANJ A; 3CCV T; 1GCQ A; 1MND A; 2HEQ A; 2E6Z A; 1I5L A; 1VQM Q; 1IGQ A; 2YRC A; 3CCJ Q; 5GJW B; 5IHN A; 4ELZ C; 4RUG A; 4R55 A; 5A0L A; 1BCM A; 2DD5 A; 3JRZ A; 1PRM C; 4K11 A; 3CBM A; 5FW9 A; 5HCK A; 3OYE A; 3L2U A; 2RJF A; 3HKS A; 1LJO A; 4LD6 A; 3GNG A; 4PJO F; 2RHY A; 5KE3 A; 2C06 A; 1WHK A; 1ACM B; 1KHC A; 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