The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
KELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAYVKKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of a Src-homology 3 (SH3) domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Cytoskeleton
|
| source organism |
Gallus gallus
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| molecule keywords |
ALPHA-SPECTRIN SH3 DOMAIN
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| total genus |
11
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1993-05-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5IH2 A; 2IIM A; 1K9A A; 1ZUY A; 2JMC A; 3M0S A; 2YUN A; 1B07 A; 2MCN A; 1JU5 C; 2NWM A; 1HJD A; 2KGT A; 2CSI A; 1I07 A; 4LE9 A; 5FW9 A; 4GBQ A; 3LH5 A; 1WXB A; 1K4U S; 5FWB A; 2LP5 A; 4J9G A; 1NM7 A; 1K0S A; 3UA7 A; 2LQN A; 2L0A A; 4HXJ A; 5IXF A; 2DIL A; 4LUD A; 2O2O A; 5L23 A; 2DBM A; 3ZL7 C; 2KEA A; 3SEM A; 4HCK A; 2JT4 A; 3NHN A; 1T0H A; 3I9Q A; 1GCP A; 4HVW A; 1X6B A; 3I5S A; 1GRI A; 1A0N B; 1RLP C; 5IXB A; 2KT1 A; 3RNJ A; 4J9D A; 1JXO A; 2DVJ A; 2GNC A; 1GFD A; 3ULR B; 1SHF A; 1UJ0 A; 2O9S A; 4J9C A; 3M0R A; 3VS5 A; 1JEG A; 1M3A A; 2JM8 A; 2CUD A; 1ZX6 A; 2LX7 A; 1KIK A; 4JJD A; 2RF0 A; 2ESW A; 3UAT A; 1CSK A; 1VYU A; 1X2Q A; 3JV3 A; 4EIK A; 1JQQ A; 2RNA A; 3H41 A; 4CC7 A; 1V1C A; 1HSQ A; 2K3B A; 3M0T A; 4J9I A; 1Y0M A; 5GJW B; 1SRM A; 2HSP A; 2FO0 A; 2LJ1 A; 2CH4 W; 4J9F A; 2BZ8 A; 1BK2 A; 1B3Q A; 1OOT A; 1QLY A; 2K79 A; 3O5Z A; 1AWJ A; 4M4Z A; 1AVZ C; 5EC7 A; 2SEM A; 2AKK A; 2DL5 A; 4DEX A; 1PRL C; 3R6N A; 1N5Z A; 2XMF A; 4K11 A; 1YP5 A; 4JPB W; 2OI3 A; 2L3Q A; 2YDL A; 4QT7 A; 4LNP A; 1MV0 B; 2NUZ A; 2HEQ A; 1KJW A; 1JO8 A; 2CDT A; 2YUQ A; 3PVQ A; 2AZV A; 2DL3 A; 4HVV A; 4Z8A A; 2A37 A; 2VWF A; 3EG0 A; 1W70 A; 2O31 A; 5IHI A; 1SRL A; 4JZ4 A; 2CH4 A; 2CT4 A; 2BZX A; 2M0Y A; 2D8H A; 1HD3 A; 2LQW A; 2PZ1 A; 2AK5 A; 2JM9 A; 2VKN A; 2EYZ A; 4RTZ A; 2FRY A; 2DRM A; 2FRW A; 2J6K A; 3TSZ A; 1OV3 A; 2KR3 A; 1ZLM A; 2X3X D; 2M51 A; 2KBT A; 1AWW A; 1J3T A; 3CQT A; 4Y92 A; 4WCI A; 4RTU A; 3QWY A; 4AG2 C; 1WA7 A; 1WDX A; 3VS6 A; 4JJC A; 1VYV A; 2RQU A; 2CUB A; 2DJQ A; 2D8J A; 1ZUU A; 2J7I A; 2A36 A; 4F17 A; 1M3C A; 1JXM A; 4AFU C; 2OJ2 A; 1FMK A; 2GBQ A; 1UTI A; 1ABO A; 4ZNX A; 4R0K A; 2ED0 A; 1AD5 A; 4RTX A; 1UFF A; 3EHR A; 5IHN A; 3RBB B; 4AG1 C; 2AKL A; 1PWT A; 4JJB A; 2YUO A; 3REB B; 4OMO A; 1UJY A; 3TSW A; 1U06 A; 4RTT A; 1WI7 A; 2MIO A; 2EGC A; 2K6D A; 1RUW A; 1UEC A; 1QCF A; 4Z89 A; 4D8D A; 3FJ5 A; 1YNZ A; 1ARK A; 2CSQ A; 3I5R A; 2JTE A; 3VS1 A; 1WIE A; 5I22 A; 1OPL A; 2PNI A; 1G2B A; 2EYX A; 2RQR A; 2D0N A; 1X43 A; 1ZUK A; 3H0H A; 1GCQ A; 2J6O A; 2JMA A; 1BB9 A; 4DEY A; 1PKT A; 1QKW A; 2F2V A; 4JZ3 A; 1M8M A; 4IIM A; 2X3W D; 2DNU A; 1NLP C; 3QWX X; 2I0N A; 1BBZ A; 1ABQ A; 2K2M A; 2JW4 A; 2GGR A; 3GBQ A; 1CKA A; 1X69 A; 4AFS C; 2L3S A; 2DYB A; 2DMO A; 2EGE A; 1AWO A; 4AFZ C; 2EBP A; 2CRE A; 1MV3 A; 2KRS A; 2RQW A; 3EG1 A; 3VS3 A; 2VVK A; 1GCQ C; 1X6G A; 2EGA A; 1K1Z A; 3EG2 A; 3I35 A; 3VRY A; 2KNB B; 1SEM A; 1W1F A; 2DL7 A; 2ENM A; 1E6H A; 2LMJ A; 2KRO A; 2RMO A; 1GBR A; 2HBW A; 1U5S A; 3A98 A; 4RTV A; 4RUG A; 4J9H A; 4X1V A; 2BTT A; 3VS4 A; 4GLM A; 1ZBJ A; 2B86 A; 4RTW A; 2EYW A; 4FSS A; 2PTK A; 2GTO A; 2DX1 A; 2EVR A; 4LUE A; 2G6F X; 1T3S A; 1WXU A; 1I0C A; 5ECA A; 1Z9Z A; 4ORZ A; 1SSH A; 3H0F A; 2KT8 A; 1PNJ A; 3KFV A; 5HCK A; 1OEB A; 3IQL A; 1NG2 A; 4KRT A; 4F16 A; 3EHQ A; 4A63 B; 3TVT A; 2QDL A; 1MUZ A; 2DL8 A; 3C0C A; 2DBK A; 4RTY A; 1WX6 A; 4HVU A; 5IHK A; 4LN2 A; 1M3B A; 2ROL A; 1YWP A; 1UDL A; 2EKH A; 2KXC A; 2KE9 A; 1KSW A; 4IIO A; 2C0O A; 2BZY A; 1SPK A; 1YN8 A; 4J9B A; 4AFQ C; 1RLQ C; 2A08 A; 1E7O A; 3NPF A; 2HDA A; 2RQV A; 2LJ3 A; 1NEB A; 1VYT A; 4D8K A; 1QWF A; 1GBQ A; 1WFW A; 3EGU A; 1YWO A; 1TUD A; 2DM1 A; 4J9E A; 1M30 A; 1UG1 A; 1I1J A; 1RI9 A; 2P4R A; 1CKB A; 2SRC A; 2KYB A; 2FPE A; 2A28 A; 2V1R A; 1T0J A; 3REA B; 3UF4 A; 2V1Q A; 1X2K A; 2LJ0 A; 2AZS A; 2LZ6 B; 1AWX A; 3PE0 A; 1S1N A; 2EW3 A; 2ABL A; 1W6X A; 1Z9Q A; 2ROT A; 2DL4 A; 2HCK A; 3M0U A; 4OMM A; 1PRM C; 4CC4 B; 2L3P A; 1UHF A; 1NLO C; 1H8K A; 1WLP B; 2L2P A; 4OMP A; 4ESR A; 2J05 A; 2FPD A; 4CC2 A; 4CC3 A; 4Z88 A; 3SHW A; 2W10 A; 1UHC A; 2DF6 A; 2LNH B; 1H92 A; 1OPK A; 1U3O A; 2K9G A; 2D1X A; 2KRM A; 2O9V A; 3VS7 A; 2O88 A; 1BU1 A; 1K0X A; 2EPD A; 1TG0 A; 3M0Q A; 2KYM A; 1UGV A; 3PVL A; 5GJV B; 1UE9 A; 1G83 A; 2JXB A; 1E6G A; 1X27 A; 1XOV A; 3THK A; 5I11 A; 1FYN A; 1T3L A; 1K76 A; 3NMZ C; 2JS0 A; 2YUP A; 3UA6 A; 2DLP A; 2EQI A; 1GL5 A; 2KRN A; 4OMQ A; 1AZE A; 2J06 A; 1LCK A; 3U23 A; 2EYY A; 3VS2 A; 1TUC A; 1UUE A; 3VS0 A; 2W0Z A; 1EFN A; 1NYF A; 1WXT A; 1YCS B; 2YSQ A; 1H3H A; 2F2W A; 1NYG A; 2K7A A; 1PKS A; 2RN8 A; 2FEI A; 2MOX A; 1IO6 A; 2OAW A; 3VRZ A; 2RPN A; 3NGP A; 1GFC A; 1QWE A; 4E6R A; 1ZSG A; 1VA7 A; 1KFZ A; 1QKX A; 2RQT A; 2F2X A; 1PHT A; 2DA9 A; 2KXD A; 2C0I A; 1M27 C; 2H8H A; 1AZG B; 3EG3 A; 4OMN A; 2YT6 A; 1NEG A; 4F14 A; 3M0P A; 4OML A; 1AOJ A; 1Y57 A; 1SHG A; 2CT3 A; 2E5K A; 3H0I A; 2FG0 A; 2DRK A; 2FPF A; 2J6F A; 2C0T A; 2DE0 X; 2ECZ A; 1WYX A; 1AEY A; 2GTJ A; 2GQI A; 2ED1 A; 2JS2 A; 2LCS A; 5FWC A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1W2B S; 2IIM A; 3QSU A; 2HL5 C; 2YUN A; 2B8A A; 1KD1 R; 4LD9 K; 4GBQ A; 1D3B B; 4M75 F; 1PSF A; 3RDV A; 4BE2 A; 1VIF A; 3P8D A; 4XU0 A; 4HXJ A; 2DET A; 2DIL A; 4LUD A; 3CCL Q; 3DB4 A; 3ZL7 C; 2KEA A; 4IKF A; 2WSE E; 1NZ9 A; 3NHN A; 4QQD A; 2E64 A; 4PNO A; 5KCH A; 3CCS T; 5CR2 A; 5IXB A; 2PVD B; 3CMA A; 2QGF B; 1JXO A; 4KUL A; 2LT1 A; 2GNC A; 4J6X A; 4KH0 B; 1GFD A; 2WAC A; 3ULR B; 4JRP A; 1UJ0 A; 2O9S A; 3M0R A; 3UDC A; 3HRS A; 3VS5 A; 2JM8 A; 1JEG A; 1ZX6 A; 1WHK A; 4C92 C; 2QQA A; 4IUV A; 1K73 R; 2XIC A; 4EIK A; 3CC4 T; 1ZA1 B; 2A3L A; 4M75 D; 2CYZ B; 3CBO A; 3RUX A; 5GAN d; 2LDM A; 2FZG B; 1VQ4 A; 4PKC C; 2CH4 W; 2HNI A; 2KDS A; 3HRU A; 4EDU A; 1SKU B; 2L3R A; 1M9S A; 2DTH A; 1C6V X; 3SWN C; 2ATC B; 3JCM b; 1QLY A; 3EH1 A; 5FU6 B; 3CMA Q; 4OB0 B; 2AKK A; 2QQB A; 1PRL C; 3JCM W; 2OI3 A; 1R77 A; 2YDL A; 4LNP A; 1M2V A; 2NUZ A; 4L6V 5; 5D7U A; 1YI2 A; 1G3Y A; 1KJW A; 3FDR A; 4J83 A; 3PVQ A; 4HVV A; 4Z8A A; 2BKD N; 1B34 A; 4BE1 A; 1QVF S; 3V8J A; 4JZ4 A; 2CH4 A; 2COY A; 1C0M A; 3CPW S; 4PJJ A; 3LW5 E; 5LJ5 j; 2VYT A; 1OU9 A; 1R0C B; 2O4X A; 2EYZ A; 3CME T; 4RTZ A; 3V8K A; 3TSZ A; 1OV3 A; 4B9W A; 1D09 B; 1FMW A; 1PG5 B; 2M51 A; 4PK4 A; 5GAM h; 4M7D C; 4J5Y A; 5GMK m; 1WDX A; 3VS6 A; 5GAO n; 2JTF A; 1WQ7 A; 1VYV A; 5GAN 4; 1K73 U; 1VQP A; 5M9O A; 1YI2 Q; 3CD6 T; 1M1G A; 2YRD A; 4F17 A; 1M3C A; 2KVQ G; 4ZN1 A; 1JXM A; 2OAU A; 2VGM A; 4HCZ A; 2GBQ A; 4N4H A; 3EHR A; 2R5A A; 5IHN A; 3PMT A; 4AG1 C; 3OW2 P; 5LJ5 g; 4C8Q B; 3REB B; 2RJF A; 2L8D A; 4DBQ A; 2K5I A; 4M7D G; 3J81 E; 1X75 C; 3X24 B; 1NJI U; 5HK3 A; 3NTK A; 4D8D A; 3JCM Q; 2O01 E; 3I5R A; 3VS1 A; 3GNF B; 1N9R A; 4RKU E; 2RHY A; 3A8O B; 5GAN 6; 1G2B A; 2EYX A; 3SWN A; 3JCM d; 5J3B A; 1VQP Q; 1X43 A; 2HKQ B; 2QAS A; 1GCQ A; 3MO8 A; 1BB9 A; 1WHH A; 4DEY A; 2JN0 A; 5HKC A; 2F2V A; 3JCM c; 4IIM A; 1M5Q 1; 1K9M R; 1M90 U; 3QWX X; 5CO7 A; 3O8V A; 1BBZ A; 5A0L A; 4DOW A; 5GAO p; 4XU2 A; 3PT9 A; 3CCR A; 1CKA A; 2FB7 A; 1VQ6 T; 2DMO A; 3MCA B; 4AFZ C; 3S3O A; 2P0Q A; 4M78 F; 3EG1 A; 3VS3 A; 3M9Q A; 2EJ9 A; 4XAX B; 3CCV T; 4AMC A; 1X6G A; 9ATC B; 2EQJ A; 4C5I A; 3NFC A; 1VQ8 A; 3I35 A; 1SEM A; 1W1F A; 2FZC B; 4M7A B; 2ENM A; 4KH1 B; 1GBR A; 1U5S A; 4RTV A; 1YCY A; 2DEQ A; 3A1P A; 3VS4 A; 1R0B G; 1VOM A; 2COW A; 4M7D A; 2GTO A; 3CC2 A; 3GPL A; 2DX1 A; 1JJ2 P; 5I2S A; 3CCR Q; 3CCQ T; 2DVE A; 3OYA A; 4ORZ A; 2DZ9 A; 1SSH A; 3H0F A; 2KT8 A; 3HFO A; 1PNJ A; 5HCK A; 3RER A; 1NG2 A; 2DYI A; 1FWZ A; 1U1T A; 4A4F A; 2ZCF B; 4F16 A; 3TVT A; 1MUZ A; 1G3S A; 4M78 D; 5IHK A; 2DBK A; 4RTY A; 5GAO m; 4LN2 A; 1VQ8 Q; 3HPW A; 1D3B A; 2ROL A; 3DB3 A; 1VQ9 A; 2EKH A; 3ER0 A; 3X25 B; 4BY6 B; 4BD3 A; 4OB2 B; 1YN8 A; 1QVG A; 1D0X A; 3C12 A; 1TXQ A; 1XJW B; 3NPF A; 1QW1 A; 1XNI A; 4PJO F; 1K9M U; 4OF1 A; 3CC2 Q; 2RQV A; 4EMK B; 2LJ3 A; 1NEB A; 1VYT A; 2V8K A; 2C06 A; 3TU4 K; 3E1S A; 4DBF A; 1RAC B; 1VIE A; 1WFW A; 3RKW A; 3OMC A; 2E3H A; 1N8R C; 1I1J A; 2LVM A; 2FPE A; 3QZ5 B; 3RMS A; 1AT1 B; 2NYS A; 2HQH A; 3QHS A; 1O9S A; 3C4S A; 2LZ6 B; 1AWX A; 1Z9Q A; 1LOJ A; 2JOY A; 2RH2 A; 2DK3 A; 4FCY A; 3EFR A; 4OMM A; 3JB9 I; 2QG9 B; 1KD1 C; 1VQ9 Q; 2L3P A; 1H8K A; 1WLP B; 2L2P A; 2RA2 A; 4F04 B; 3EAE A; 2CZ1 B; 5FRM A; 2J05 A; 4CC2 A; 4CC3 A; 1QP2 A; 3SHW A; 4OGC A; 2LNH B; 1KHC A; 3WXM B; 1VQO Q; 2K9G A; 3HP9 A; 1OX9 A; 4E7I A; 4N4G A; 2O88 A; 2ZPG B; 1K0X A; 3E9G A; 1TG0 A; 5EG2 A; 2XI9 A; 4IUQ A; 5C6S A; 4M7D E; 2YLC A; 5GJV B; 3QZ9 B; 4CRI A; 4PJO D; 4MDX A; 2ZPF B; 1X27 A; 4XQ3 A; 3THK A; 3BE3 A; 1YIJ A; 1YHQ T; 4OB1 B; 3CXC A; 1KC8 R; 3OB9 A; 3MPU B; 1GL5 A; 2EQI A; 1KHI A; 2M0O A; 1VQ5 T; 3PGG A; 2XID A; 2QK0 A; 2K3Y A; 2DXB A; 3VS0 A; 1NYF A; 2YSQ A; 1HYO A; 5CVI A; 4EMH A; 4FYX B; 3ZFJ A; 2RPN A; 3NGP A; 1VQO T; 3H8Z A; 3TEE A; 1I4K 1; 1PHT A; 4J7I A; 2M02 A; 3CCJ T; 4HT8 A; 1YIJ Q; 3EGD B; 5GAN j; 3MHX A; 5GAM e; 2C0I A; 1AZG B; 4BB7 A; 2YT6 A; 5CKE A; 5LJ3 d; 5KYW A; 4F14 A; 4FYW B; 5GAN 3; 3RR6 A; 1D1C A; 3JCM P; 2MWO A; 2FG0 A; 2DRK A; 1KQS A; 1M8V A; 1WYX A; 1C1A A; 4M7A F; 1N6A A; 3JB9 G; 2CGH A; 1AEY A; 2IVW A; 2ZAE A; 2JS2 A; 3I56 T; 1H92 A; 4X34 A; 5IH2 A; 1K9A A; 4DQ2 A; 3M0S A; 1Q86 U; 1B07 A; 4FYY B; 5GAN g; 1FX7 A; 5D6X A; 5FW9 A; 4AT1 B; 1WXB A; 3OSS C; 2OTJ A; 1KC8 U; 2LP5 A; 2R57 A; 4PLL A; 1DJ7 B; 1TSF A; 3UA7 A; 2AHJ B; 2ZPB B; 4EMK C; 5FLX E; 2XDD A; 2L0A A; 3MP8 A; 3OYE A; 3OW2 A; 5IXF A; 3UT1 A; 1Q82 U; 3P8B B; 2M9U A; 3SEM A; 4HCK A; 4XTZ A; 1G3W A; 4HVW A; 1X6B A; 3J7A F; 4LDW A; 3KBG A; 5GAM f; 1HK9 A; 1RLP C; 1VQ7 T; 2KT1 A; 3RNJ A; 4M7A D; 1MMA A; 2DVJ A; 5FU7 B; 4J9C A; 1Q7Y U; 1M3A A; 2OTJ Q; 2AIR B; 2RHI A; 3QKJ A; 4JJD A; 2RF0 A; 3I55 T; 4WTO B; 2ESW A; 3UAT A; 4II1 A; 3QYG B; 1VYU A; 1D0Y A; 2F1L A; 4C0F A; 5GAO r; 3H41 A; 3EG9 B; 1WGS A; 4CC7 A; 4JS5 A; 1V1C A; 3M0T A; 1VQM T; 5GJW B; 1YIT T; 1RAG B; 1RAA B; 1BI0 A; 1SRM A; 4C0G A; 4J9F A; 2BZ8 A; 3EGX B; 2EJG A; 5J39 A; 3CCS A; 1N9S A; 4BAC A; 2K79 A; 2EAY A; 4FT2 A; 3JB9 J; 2DFU A; 3INZ A; 1QMC A; 1KG1 A; 2SEM A; 1TTH B; 2DZC A; 2YHT A; 2LC4 A; 4K11 A; 5A2Q E; 4QT7 A; 5GMK j; 3M58 A; 2HEQ A; 4WF2 A; 2E41 A; 1JO8 A; 3ME9 A; 2CDT A; 3UPU A; 5I21 A; 2DL3 A; 2A37 A; 4VUB A; 2E65 A; 5IHI A; 1FXX A; 2V26 A; 4M75 C; 2Y90 A; 2D8H A; 4C5E A; 3JCM g; 2OTL T; 3CCS Q; 2F5T X; 1HD3 A; 2LQW A; 4EMK A; 1QVG P; 3L2R A; 2D9T A; 2FRY A; 2DRM A; 2PQW A; 4JJN K; 5CQY A; 1Y96 B; 4BE0 A; 2AT1 B; 3QWY A; 4AG2 C; 1V29 B; 4E7Z A; 4PJL A; 1UGP B; 4PFO A; 2CUB A; 1PM3 A; 3G6E T; 1K8A U; 5I2M A; 2D8J A; 3CC4 Q; 4M75 G; 2OJ2 A; 2EIF A; 1LNX A; 3OS5 A; 2VB6 A; 2XHC A; 5GAN 2; 3ZBD A; 4R0K A; 4OMF B; 2ZPE B; 2RI5 A; 4IUT A; 3RBB B; 2AKL A; 1R8O B; 2LCL A; 2CP2 A; 4M78 B; 3LWH A; 4F7U F; 4NOY A; 2QDY B; 2M16 A; 3MP1 A; 3TSW A; 3CME A; 4JRQ A; 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