The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
60
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structure length |
60
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Chain Sequence |
GSSPKAVALYSFAGEESGDLPFRKGDVITILKKSDSQNDWWTGRVNGREGIFPANYVELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Yeast SH3 domain structural genomics
rcsb |
| molecule tags |
Contractile protein
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| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| molecule keywords |
Hypothetical 40.4 kDa protein in PES4-HIS2 intergenic region
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| total genus |
12
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| structure length |
60
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| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-03-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2HDA A; 2K3B A; 2CH4 W; 3I9Q A; 5L23 A; 3VS4 A; 1CSK A; 1HSQ A; 2YSQ A; 4LUE A; 1M3A A; 1M27 C; 1WFW A; 2CRE A; 1GL5 A; 1U3O A; 1E6G A; 1BK2 A; 2KBT A; 1M3B A; 1X6B A; 4AG2 C; 2BZY A; 4RUG A; 1VA7 A; 4Z8A A; 2FRY A; 4OMM A; 3UAT A; 1GBR A; 1X43 A; 2ROL A; 1ZUU A; 1AZG B; 3EHR A; 2C0T A; 2EYX A; 1U06 A; 1G83 A; 4GBQ A; 1G2B A; 1M3C A; 4HVU A; 4CC3 A; 2GNC A; 2EBP A; 2DYB A; 2OI3 A; 2VKN A; 3FJ5 A; 3TSZ A; 1K0S A; 1AWW A; 1UUE A; 2KRN A; 2J6F A; 4OMP A; 4ESR A; 2RQV A; 4KRT A; 2C0I A; 4J9F A; 1OPL A; 1QLY A; 1UGV A; 2CT3 A; 4RTT A; 5ECA A; 2HSP A; 5IH2 A; 4RTZ A; 4RTX A; 2AKK A; 3NMZ C; 2EGE A; 1K1Z A; 4D8D A; 1JO8 A; 2D0N A; 1X69 A; 2CSI A; 2V1R A; 1GFC A; 1TUC A; 2KE9 A; 2P4R A; 2EGA A; 3NHN A; 1Z9Z A; 1UFF A; 2CH4 A; 1QWF A; 2L3Q A; 3EG3 A; 4IIO A; 3VS2 A; 4D8K A; 1HD3 A; 3VS1 A; 1AWJ A; 3VS3 A; 2OAW A; 3I5S A; 2J05 A; 1PWT A; 4ZNX A; 2XMF A; 2O2O A; 3H41 A; 2RQW A; 2GTO A; 2D8H A; 2KRM A; 4CC2 A; 2FPF A; 2LQW A; 4JJC A; 2O9V A; 3QWX X; 4DEY A; 3VS7 A; 2NWM A; 3R6N A; 1ZLM A; 4J9D A; 2O9S A; 2DA9 A; 5GJW B; 2DRM A; 1ABO A; 1OOT A; 5GJV B; 1T0H A; 2ECZ A; 2GQI A; 1T3L A; 1WXB A; 1QKX A; 2JS0 A; 4FSS A; 3PE0 A; 2YUQ A; 1M8M A; 5IXF A; 1X2Q A; 1K76 A; 1KIK A; 2EKH A; 1SSH A; 2EYW A; 1A0N B; 2J7I A; 1SHG A; 1QCF A; 2RN8 A; 1YWO A; 3RBB B; 1PRL C; 4Z88 A; 4RTW A; 1V1C A; 2KNB B; 2J6O A; 1FMK A; 1W6X A; 2LP5 A; 3RNJ A; 3VS6 A; 1JXO A; 3H0F A; 2DL4 A; 1NLP C; 1E7O A; 2AZS A; 2DF6 A; 2O31 A; 1E6H A; 1CKB A; 4OMN A; 1EFN A; 1GRI A; 2ESW A; 2PZ1 A; 1MUZ A; 1PKS A; 2DMO A; 1KFZ A; 2EQI A; 2LNH B; 2DL7 A; 3M0P A; 2G6F X; 2RQT A; 2JM9 A; 2RPN A; 1NLO C; 3M0T A; 3UA7 A; 4EIK A; 4K11 A; 2LJ1 A; 1AOJ A; 2KGT A; 1NEB A; 1UG1 A; 4LN2 A; 1UTI A; 2KRS A; 1MV0 B; 4J9B A; 4CC7 A; 2GBQ A; 1VYU A; 2O88 A; 2CDT A; 1XOV A; 2DE0 X; 4WCI A; 1GCP A; 2YUP A; 2X3X D; 2B86 A; 4DEX A; 1AWX A; 2M51 A; 2EYZ A; 2GTJ A; 2JMC A; 2FO0 A; 1N5Z A; 1NM7 A; 2AZV A; 2DL5 A; 2K7A A; 1JQQ A; 3EG1 A; 4JPB W; 3VS0 A; 2MOX A; 3A98 A; 4F14 A; 1GFD A; 1W1F A; 2BTT A; 3M0S A; 1H92 A; 2LX7 A; 3IQL A; 3TSW A; 1VYV A; 2YT6 A; 2MCN A; 2KXC A; 3CQT A; 4CC4 B; 1IO6 A; 1YWP A; 4AFZ C; 4Z89 A; 5HCK A; 1T0J A; 1B3Q A; 2KYB A; 2A08 A; 1JU5 C; 2FRW A; 1J3T A; 1Y57 A; 2LMJ A; 2JS2 A; 2HBW A; 2SEM A; 3TVT A; 2KEA A; 3VRZ A; 2D8J A; 4A63 B; 3THK A; 3REA B; 1M30 A; 2F2W A; 1NYF A; 3SHW A; 1CKA A; 2YUO A; 2DNU A; 2AKL A; 1PHT A; 4AG1 C; 1QWE A; 1KJW A; 2JT4 A; 3M0R A; 2A36 A; 3C0C A; 1BBZ A; 1X6G A; 2EVR A; 1AZE A; 4IIM A; 3GBQ A; 3I5R A; 2CUB A; 4R0K A; 1ZX6 A; 1PKT A; 5I11 A; 1WI7 A; 2JTE A; 4OMQ A; 1UE9 A; 2F2V A; 1RUW A; 4HXJ A; 2DVJ A; 2GGR A; 2J06 A; 2BZ8 A; 4JJB A; 1GCQ C; 1ABQ A; 2KYM A; 1X27 A; 2DRK A; 2L0A A; 1WX6 A; 1WLP B; 4LNP A; 2QDL A; 2LJ3 A; 4RTU A; 1K9A A; 1H8K A; 1YNZ A; 4JZ4 A; 1WYX A; 1I0C A; 1K4U S; 1U5S A; 2L2P A; 3EGU A; 2LJ0 A; 4JJD A; 2MIO A; 1WA7 A; 2RQU A; 4AFQ C; 2LCS A; 3I35 A; 4F16 A; 1OEB A; 2ED1 A; 2FG0 A; 1WDX A; 2RNA A; 1TG0 A; 2K6D A; 2EW3 A; 1BU1 A; 2JMA A; 2DBM A; 2PNI A; 5IHN A; 5FW9 A; 2IIM A; 4J9G A; 4M4Z A; 2HCK A; 1SEM A; 2BZX A; 4AFU C; 1B07 A; 1MV3 A; 1TUD A; 1SPK A; 2ABL A; 2AK5 A; 4X1V A; 1NEG A; 2RMO A; 2F2X A; 1Z9Q A; 2KT8 A; 1AEY A; 1AD5 A; 2OJ2 A; 1WIE A; 4F17 A; 2RQR A; 1S1N A; 3H0H A; 4AFS C; 2ENM A; 1YCS B; 1ZUK A; 4HCK A; 1PRM C; 3H0I A; 1VYT A; 5FWB A; 2V1Q A; 3O5Z A; 3NPF A; 1K0X A; 2JM8 A; 1ZUY A; 5IHI A; 5IXB A; 2H8H A; 2DL8 A; 3PVQ A; 1W70 A; 2L3P A; 2W0Z A; 4J9E A; 2CT4 A; 3EHQ A; 4ORZ A; 2FPD A; 2C0O A; 2VWF A; 4J9I A; 4RTY A; 2JW4 A; 4E6R A; 2EYY A; 3LH5 A; 5I22 A; 2YDL A; 3KFV A; 1LCK A; 1I07 A; 4LE9 A; 2ED0 A; 1RLQ C; 2DIL A; 2DX1 A; 2KRO A; 1SRM A; 1BB9 A; 1GCQ A; 2DBK A; 2FEI A; 1OPK A; 1UHF A; 2RF0 A; 3ZL7 C; 1UHC A; 3UA6 A; 1NG2 A; 2DLP A; 2YUN A; 2KT1 A; 5EC7 A; 1PNJ A; 2ROT A; 1YN8 A; 1ARK A; 1WXU A; 1OV3 A; 1WXT A; 2KXD A; 2HEQ A; 2X3W D; 2VVK A; 1ZSG A; 2DM1 A; 2E5K A; 4QT7 A; 4OML A; 1UJY A; 1ZBJ A; 3ULR B; 1X2K A; 1JEG A; 4OMO A; 5IHK A; 3PVL A; 2EGC A; 1KSW A; 3VS5 A; 3U23 A; 4J9C A; 1AWO A; 3REB B; 1UDL A; 3JV3 A; 2JXB A; 2I0N A; 1JXM A; 1YP5 A; 1AVZ C; 2CUD A; 4J9H A; 3QWY A; 1SHF A; 2KR3 A; 4HVV A; 2J6K A; 1RI9 A; 2DJQ A; 2D1X A; 4RTV A; 2K79 A; 1QKW A; 4GLM A; 4HVW A; 2A37 A; 3EG0 A; 2M0Y A; 1Y0M A; 1RLP C; 2A28 A; 1GBQ A; 2SRC A; 3NGP A; 1HJD A; 2NUZ A; 1T3S A; 2DL3 A; 2LZ6 B; 1I1J A; 3VRY A; 3UF4 A; 1UJ0 A; 3M0Q A; 3EG2 A; 3SEM A; 2K2M A; 4JZ3 A; 2PTK A; 2EPD A; 1H3H A; 1UEC A; 2W10 A; 1SRL A; 1NYG A; 2LQN A; 2FPE A; 2K9G A; 2CSQ A; 3M0U A; 5FWC A; 4LUD A; 1FYN A; 2L3S A; 4Y92 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3A5Z B; 2BIV A; 4F04 B; 1M1K R; 2CH4 W; 4J7I A; 4BY6 C; 2X4X A; 4PKC C; 1XQH A; 4LUE A; 3VYG A; 3RKX A; 2G3R A; 1SG5 A; 1U3O A; 3OYG A; 4X9C A; 3CC7 T; 4FT4 A; 2KBT A; 5CVI A; 1I4K 1; 5AT1 B; 1X6B A; 1WQ7 A; 2BZY A; 5A0G A; 5CKH A; 3M54 A; 3MET A; 5LJ3 h; 3L42 A; 1C0M A; 3EHR A; 3SWN A; 2C0T A; 2EYX A; 2MI6 A; 5LJ3 g; 1U06 A; 2CP7 A; 1G2B A; 1M3C A; 3BE3 A; 4OP0 A; 1KHI A; 1UB4 A; 4EMK C; 1YJW T; 2ZPH B; 3TQ7 P; 1K0S A; 4KUI A; 2PQW A; 3CCS T; 4J9F A; 1OPL A; 3OS0 A; 1IHW A; 5GAM h; 1UGV A; 4PJO G; 3VUB A; 2HSP A; 2RHY A; 4RTZ A; 4RTX A; 1VQK Q; 1K9M C; 3NMZ C; 3GIB A; 3CCV A; 1PCX A; 4D8D A; 3RES A; 3CCE T; 1UGQ B; 2V1R A; 1JBM A; 3AHU A; 1BI3 A; 5FRN A; 3M5A A; 3EFS A; 4FYW B; 2L3Q A; 3VS2 A; 3LGL A; 4E7Z A; 1HD3 A; 5FU6 C; 4RKU E; 1VQ6 Q; 4C92 B; 3I5S A; 1IRX A; 2L3R A; 3EH2 A; 4ZNX A; 4ZN1 A; 2XMF A; 1S72 Q; 1H3Z A; 3H41 A; 2QQ9 A; 2RQW A; 1WJR A; 2D8H A; 2KRM A; 4F7U A; 1G5V A; 3OYM A; 2QA4 A; 5GAN j; 4JJC A; 4DOV A; 4M7A B; 2O9V A; 1Q82 C; 4FL6 A; 3V8L A; 2RI5 A; 3LWH A; 4HKE A; 3V8J A; 4YTL A; 2CYZ B; 5LJ5 j; 2V26 A; 2DA9 A; 4M78 D; 5GJW B; 3M59 A; 1MND A; 4C0Z A; 1HXD A; 2HKN A; 2QEX A; 1WXB A; 2DTH A; 2JS0 A; 3MPU B; 1Q86 C; 1X2Q A; 1AHJ B; 4A53 A; 3CCJ A; 1SSH A; 2EYW A; 1A0N B; 4C8Q E; 1RAD B; 2KDS A; 1PRL C; 4Z88 A; 4WTO B; 3I56 Q; 1LNX A; 3OA6 A; 2FHD A; 2J6O A; 4E7S A; 2XDD A; 2EWN A; 1ACM B; 1FWZ A; 3RNJ A; 1JXO A; 4M75 E; 1NLP C; 2AZS A; 2DF6 A; 5GAO r; 3CCL Q; 1CKB A; 1EFN A; 4PJL A; 2YRC A; 1NBE B; 4KT0 E; 3A8G B; 3FJP A; 2EQI A; 4M77 B; 3RMQ A; 5L8R E; 2G6F X; 2F1L A; 3C95 A; 4XU1 A; 2RPN A; 1NLO C; 2LJ1 A; 1QW1 A; 1NEB A; 5GMK j; 2DZ9 A; 1MV0 B; 1PC0 A; 4B9W A; 2GBQ A; 1KQ2 A; 5KYU B; 1N9S A; 4OMF B; 4WCI A; 4A4F A; 2YUP A; 4C92 D; 2C06 A; 4BE2 A; 2BE7 D; 3PIO A; 2E3H A; 2JMC A; 5GAN 7; 3EG1 A; 4FYV B; 3VS0 A; 3CC2 A; 4BUG A; 3M58 A; 4F14 A; 1GFD A; 2BTT A; 1QMC A; 5KYY A; 2CGH A; 2VV5 A; 5J3B A; 4M7A D; 3TSW A; 2MWP A; 1VYV A; 1UGR B; 2YT6 A; 1YI2 A; 1RAB B; 2KXC A; 2X4Y A; 3CBO A; 3BDL A; 1OU9 A; 3EG9 B; 1M1K U; 3CCS Q; 2Y90 A; 1B3Q A; 2XID A; 4NOY A; 1ZA1 B; 2DEU A; 4ZN3 A; 2FRW A; 1WQW A; 5HY6 A; 3OS2 A; 3CCM A; 2LMJ A; 3X24 B; 4QQ6 A; 2HBW A; 1VQ4 A; 2SEM A; 2P0Q A; 3MJX A; 1VQ8 Q; 4M7D D; 4Z02 A; 3REA B; 3S6W A; 2F2W A; 3SHW A; 2DNU A; 2CS7 A; 1WJQ A; 2AKL A; 2COW A; 1QWE A; 3M0R A; 2A36 A; 3C0C A; 1GXI E; 2RK2 A; 1W4S A; 4JRI A; 4IIM A; 3GBQ A; 3DLM A; 3S3O A; 3I5R A; 1WHM A; 2JTM A; 4R0K A; 1PKT A; 2PUK B; 5I11 A; 3A8O B; 3CC7 A; 2HL5 C; 5CQY A; 4OMQ A; 2ZZD A; 3D7S B; 3G6E Q; 1I81 A; 3RMS A; 4M77 D; 2RA2 A; 1K73 U; 2XHC A; 1V76 A; 5CKD A; 1VQL T; 1QVP A; 2JOY A; 2LJ3 A; 2M02 A; 3GOX A; 2OX7 A; 1EX4 A; 3L1A A; 4R55 A; 3CEY A; 1YNZ A; 4JZ4 A; 1K4U S; 5GAN 4; 4UC4 A; 4JJD A; 2K57 A; 3OYD A; 4B9X A; 1C6V X; 2LQ8 A; 1PSF A; 5EG2 A; 3QJ6 A; 3OW2 A; 5KE3 A; 5GAN h; 2RNA A; 1YHQ T; 2DER A; 3CME Q; 3DB3 A; 2RM4 A; 4JRK A; 2PNI A; 5IHN A; 3CCE A; 2IIM A; 2V8K A; 1B07 A; 2A3L A; 3A8H B; 1MV3 A; 4PL6 A; 4C8Q F; 3MO8 A; 4ZTF A; 2RH2 A; 4VUB A; 2LC4 A; 5I21 A; 3DB4 A; 4J6X A; 3NTH A; 2AK5 A; 4EMG A; 3M4Y A; 1QCN A; 1RI0 A; 2CZ1 B; 2KT8 A; 1AEY A; 2OJ2 A; 2XKO C; 4AFS C; 1PRM C; 2VXF A; 3NPF A; 2EQJ A; 5LL6 S; 2DL8 A; 2L3P A; 1KD1 U; 2FPD A; 4PLL A; 2VWF A; 4RTY A; 4M78 E; 4QQG A; 5FU7 B; 1KQ1 A; 3OQ5 A; 3QZ9 B; 3E2U A; 2CZ7 B; 5I22 A; 4V2S A; 3J81 E; 5GMK h; 1LCK A; 3H8Z A; 4NL2 A; 4PJO B; 2ZPG B; 5KYW B; 1GCQ A; 4D6W A; 1OPK A; 4BDZ A; 2OTL Q; 2YLB A; 2K3Y A; 2CZ6 B; 3SFM A; 3M9Q A; 1BKB A; 1ARK A; 1AT1 B; 2X3W D; 3EGX A; 4QT7 A; 2DKG A; 3ULR B; 5IHK A; 3PVL A; 1KSW A; 3U23 A; 1YIT T; 1M5Q 1; 3REB B; 4KUD K; 2JXB A; 4KGV B; 4XTU A; 1AVZ C; 3GNG A; 4O6J A; 2QDY B; 3VJP A; 4JJN K; 2H3J A; 4KH1 B; 5D6X A; 3CMA A; 1GBQ A; 2SRC A; 1T3S A; 4C92 E; 4DOW A; 3UF4 A; 1YJ9 Q; 3EG2 A; 4JZ3 A; 2VB6 A; 4KH0 B; 1VQL Q; 3JCM V; 1H3H A; 3OYE A; 1SRL A; 5CAI A; 2K9G A; 5FWC A; 4LUD A; 3QUI A; 1RL2 A; 4Y92 A; 2EQM A; 4M7A E; 2LCL A; 2Y4Y A; 2HDA A; 3JCM P; 1U1T A; 3AT1 B; 3LW5 E; 3G4S T; 1O75 A; 1KQS A; 1CSK A; 2YSQ A; 2MMP A; 1YHQ Q; 1WFW A; 2CRE A; 5KYX B; 1E6G A; 1BK2 A; 4PJO D; 2QG9 B; 2M9U A; 2DFU A; 2P84 A; 1BIA A; 2O4X A; 4RUG A; 1VA7 A; 2F5T X; 4Z8A A; 3JCM X; 4M7D E; 2HNI A; 3MP1 A; 1D3B A; 4C8Q A; 1X75 C; 3MEW A; 1ZUU A; 3HSB A; 2FL7 A; 4BY6 B; 1WHJ A; 2EQU A; 1NJI R; 1VQK T; 3EGD B; 2E6N A; 3JCM c; 1C1A A; 3PIP A; 2DTO A; 3L2Z A; 4GBQ A; 4JRP A; 4HVU A; 2PU9 B; 4CC3 A; 1TWB A; 2GNC A; 3Q1J A; 2EBP A; 2NUP B; 2O01 E; 4IUP A; 2DYB A; 2OI3 A; 1M8V A; 1PM3 A; 4M75 A; 1Q7Y R; 2GQV A; 1AWW A; 2KRN A; 1M2O A; 2J6F A; 4IUQ A; 4N4G A; 4ESR A; 2RQV A; 3GF5 A; 4KRT A; 2C0I A; 3C4S A; 2LTO A; 2CT3 A; 3EFO B; 3CCR T; 4M77 E; 4C8Q C; 1VQ6 T; 3A8L B; 2EGE A; 3FEO A; 3QZ5 B; 4BD3 A; 2HL3 A; 2D0N A; 3L2W A; 1TUC A; 1S72 T; 3CD6 T; 2KE9 A; 2CH4 A; 2DIQ A; 2LCC A; 1W2B S; 2HQX A; 4M75 C; 1WJS A; 3M57 A; 3FC3 A; 3VS3 A; 3H6Z A; 4FCY A; 3OYI A; 1G3S A; 4M78 F; 3S3N A; 4OB2 B; 2O2O A; 5HK3 A; 3PTA A; 2DET A; 3JRZ A; 2GTO A; 3SWN B; 2LQK A; 2E41 A; 3RKY A; 2ATC B; 2LQW A; 1WGS A; 3QWX X; 1QVG S; 3VS7 A; 2NWM A; 3HKS A; 1M90 U; 1D1A A; 3P8D A; 3VV0 A; 4E7I A; 3R6N A; 1U8R A; 2EAY A; 3QG1 A; 5FU6 B; 2DRM A; 1ABO A; 3QDR B; 2PVD B; 4LD6 A; 1T0H A; 4PLI A; 1YIT Q; 4RCB A; 1VQM A; 4HCB A; 1LVK A; 3PE0 A; 1XJW B; 4OGE A; 3JCM J; 4DBF A; 1W2B A; 3CCU T; 2RHZ A; 3UDC A; 2RK1 A; 2M0O A; 5I2S A; 1W6X A; 2OTJ T; 3VS6 A; 2EJG A; 3R6O A; 3TU4 K; 2QK0 A; 1E7O A; 1TH7 A; 1VUB A; 4OMN A; 4XTY A; 1ZQ1 A; 4EMK A; 5GAN f; 2ESW A; 3N5B B; 4F7U B; 1PKS A; 2DMO A; 4C92 F; 1QVG A; 4C5G A; 2LNH B; 1RAI B; 2DL7 A; 3JB9 I; 5LJ5 f; 3M0T A; 4RMO A; 3M55 A; 3JCM f; 3G4S Q; 1AOJ A; 4JDS A; 4LN2 A; 3HRT A; 4LDX A; 4CRI A; 2DPP B; 4M7A F; 1VYU A; 4XTZ A; 2CDT A; 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