The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
67
|
structure length |
67
|
Chain Sequence |
SGGCELTVVLQDFSAAHSSELSIQVGQTVELLERPSERPGWCLVRTTERSPPQEGLVPSSTLCISHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Regulation of RhoGEF Activity by Intramolecular and Intermolecular SH3 Domain Interactions.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Rattus norvegicus
|
| molecule keywords |
Huntingtin-associated protein-interacting protein
|
| total genus |
6
|
| structure length |
67
|
| sequence length |
67
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 2004-07-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4GLM A; 3UF4 A; 1AWO A; 2OAW A; 2RQW A; 2C0T A; 3RBB B; 2LMJ A; 2K2M A; 3THK A; 1QKW A; 4RUG A; 5IHK A; 3UA6 A; 2ROT A; 2LX7 A; 3KFV A; 5FWC A; 1ABO A; 1CSK A; 1YN8 A; 1AEY A; 2HBW A; 1WDX A; 1NG2 A; 1SHF A; 1U3O A; 4OMP A; 2BZ8 A; 2L0A A; 4RTZ A; 1ZLM A; 3SHW A; 4F16 A; 1QLY A; 1Y0M A; 2A08 A; 1G83 A; 5HCK A; 5IH2 A; 3EG2 A; 4M4Z A; 1IO6 A; 4OMN A; 2CSI A; 2YUP A; 4X1V A; 3QWX X; 3UA7 A; 2J7I A; 1OPL A; 2KYM A; 1PNJ A; 1VA7 A; 3H0F A; 3IQL A; 2GTO A; 1NLO C; 1HSQ A; 1RI9 A; 2LP5 A; 4J9B A; 2JM9 A; 2KXC A; 2M0Y A; 2RQV A; 4GBQ A; 1K76 A; 4AG1 C; 2F2W A; 2HCK A; 3I35 A; 1GRI A; 2EYW A; 4R0K A; 2V1R A; 3M0R A; 2L3P A; 2PZ1 A; 2CSQ A; 1ZSG A; 1GL5 A; 2DMO A; 1TUD A; 1GBQ A; 3NHN A; 2AZV A; 2O2O A; 3NMZ C; 1NYF A; 1VYU A; 2CH4 W; 4AG2 C; 5IXB A; 1SEM A; 2LJ0 A; 4JJD A; 1CKB A; 1UHF A; 1AWW A; 4J9I A; 1X2K A; 2O88 A; 4FSS A; 4J9H A; 4CC4 B; 2ABL A; 1YWO A; 2QDL A; 3JV3 A; 2EYY A; 1AD5 A; 2ESW A; 1KSW A; 2MCN A; 1H92 A; 2KT8 A; 2E5K A; 2EGC A; 2LNH B; 2G6F X; 2O31 A; 2PTK A; 3EG1 A; 2A28 A; 1SRL A; 4OMO A; 1QKX A; 4EIK A; 1UDL A; 1ZBJ A; 5IXF A; 5IHN A; 2KEA A; 4Y92 A; 2YDL A; 2KYB A; 3VS4 A; 1XOV A; 4QT7 A; 1SHG A; 2SEM A; 4F14 A; 3M0T A; 1QWF A; 1ZUU A; 1UTI A; 1N5Z A; 2YT6 A; 2JW4 A; 3M0U A; 1OEB A; 2DVJ A; 1B3Q A; 1X27 A; 2KRM A; 4AFZ C; 5I22 A; 1YWP A; 5GJW B; 2W0Z A; 2KXD A; 1M3C A; 2KR3 A; 3VS5 A; 4F17 A; 1AZE A; 2KGT A; 5FWB A; 4A63 B; 2DLP A; 1GFC A; 2LCS A; 1GCQ A; 2LQW A; 2RF0 A; 3QWY A; 2EVR A; 2HDA A; 5IHI A; 1T0J A; 1KJW A; 1W1F A; 3VRY A; 2CUB A; 3I5S A; 2B86 A; 2DJQ A; 4LUE A; 2I0N A; 1EFN A; 1RLQ C; 4OMM A; 1JXO A; 1OPK A; 1A0N B; 2CDT A; 4J9F A; 4J9D A; 2MOX A; 1UG1 A; 5EC7 A; 1BB9 A; 2KNB B; 4AFQ C; 4RTT A; 4JZ4 A; 2KRO A; 1NEB A; 2X3X D; 3VS1 A; 1M3A A; 1JQQ A; 2O9V A; 1WXU A; 2CUD A; 2H8H A; 2JMA A; 2GTJ A; 4KRT A; 1X69 A; 1U5S A; 3LH5 A; 1U06 A; 2DE0 X; 1UJ0 A; 2ECZ A; 2HEQ A; 2J6F A; 2NWM A; 4RTX A; 2JT4 A; 2LZ6 B; 2KE9 A; 1OOT A; 1M3B A; 1JU5 C; 2A37 A; 2CH4 A; 2FEI A; 1K0X A; 2EPD A; 2PNI A; 1YCS B; 1NLP C; 2J6O A; 3VS6 A; 3EGU A; 2LJ3 A; 1YNZ A; 1JXM A; 3NPF A; 2O9S A; 3R6N A; 3VS2 A; 2DYB A; 3M0P A; 1CKA A; 2EKH A; 3O5Z A; 1S1N A; 2RQT A; 4ZNX A; 2J6K A; 1UGV A; 2FPD A; 2FG0 A; 2JMC A; 2FRY A; 3PE0 A; 4RTW A; 4HVV A; 5ECA A; 3VRZ A; 1ARK A; 2F2V A; 4OMQ A; 2M51 A; 1FMK A; 3VS3 A; 2JXB A; 2DL5 A; 1WIE A; 1KIK A; 2AKL A; 1SRM A; 1V1C A; 3VS7 A; 1WFW A; 1G2B A; 1K9A A; 1E6H A; 1ABQ A; 1ZX6 A; 1BK2 A; 3I5R A; 1E7O A; 4JJB A; 1AVZ C; 2GGR A; 4E6R A; 2MIO A; 1NEG A; 2GBQ A; 4ESR A; 1M27 C; 2P4R A; 2BZX A; 1Z9Q A; 2EYX A; 4Z88 A; 2NUZ A; 2RQR A; 4IIO A; 1WI7 A; 3REB B; 1JO8 A; 1WX6 A; 2V1Q A; 1GCQ C; 2EGA A; 1VYV A; 2OI3 A; 2K6D A; 2EW3 A; 3EG3 A; 1T3S A; 1YP5 A; 2JS2 A; 1UHC A; 4Z8A A; 2GQI A; 1AWJ A; 2L3Q A; 2FPF A; 2BZY A; 5I11 A; 1ZUK A; 1QCF A; 2ENM A; 4RTU A; 1HD3 A; 2XMF A; 3TVT A; 2VKN A; 3NGP A; 2KBT A; 4ORZ A; 2EGE A; 1I0C A; 3CQT A; 2YSQ A; 4LN2 A; 2CT4 A; 4HVU A; 1JEG A; 1RUW A; 4CC2 A; 2CT3 A; 2AKK A; 1VYT A; 1H3H A; 4OML A; 1I1J A; 2AZS A; 2DL8 A; 3ULR B; 2FRW A; 2BTT A; 3FJ5 A; 1LCK A; 1Z9Z A; 1PKS A; 1M8M A; 2JTE A; 1X6G A; 1T0H A; 2VWF A; 2KRN A; 1AOJ A; 2KRS A; 1FYN A; 3PVQ A; 2DX1 A; 1MV3 A; 1TUC A; 1WA7 A; 2RPN A; 3H41 A; 4J9E A; 2DA9 A; 2K79 A; 4LUD A; 1X43 A; 3I9Q A; 2JS0 A; 2VVK A; 3EHQ A; 1PRM C; 3H0I A; 2DL4 A; 1SSH A; 2YUO A; 2DIL A; 4D8D A; 2YUQ A; 2W10 A; 1NM7 A; 2ED1 A; 1BU1 A; 2SRC A; 1B07 A; 4HXJ A; 2EYZ A; 2EBP A; 2C0O A; 2DBK A; 3EG0 A; 3GBQ A; 1UJY A; 2DNU A; 3U23 A; 4CC3 A; 1X2Q A; 4HCK A; 2DL3 A; 3UAT A; 1I07 A; 3RNJ A; 1Y57 A; 1PKT A; 2RNA A; 2ROL A; 1W70 A; 1ZUY A; 1OV3 A; 4K11 A; 5L23 A; 3VS0 A; 1UEC A; 4IIM A; 1MUZ A; 4JJC A; 2FO0 A; 2RN8 A; 2J06 A; 1J3T A; 5FW9 A; 1T3L A; 2EQI A; 2D8H A; 3H0H A; 1WYX A; 1X6B A; 2YUN A; 4AFS C; 4Z89 A; 1MV0 B; 1WXT A; 2X3W D; 1KFZ A; 2DM1 A; 1TG0 A; 2LJ1 A; 1PHT A; 2D0N A; 2A36 A; 2D1X A; 3M0S A; 4AFU C; 3A98 A; 4DEX A; 2AK5 A; 5GJV B; 1GBR A; 1K0S A; 2JM8 A; 3EHR A; 2OJ2 A; 1WXB A; 1SPK A; 4WCI A; 4CC7 A; 3C0C A; 1E6G A; 1NYG A; 2DBM A; 2K7A A; 2RQU A; 1W6X A; 3TSZ A; 1QWE A; 2FPE A; 4JZ3 A; 1WLP B; 1PRL C; 2J05 A; 4J9G A; 3REA B; 1K4U S; 4D8K A; 2KT1 A; 3TSW A; 2DL7 A; 1GCP A; 3PVL A; 4LNP A; 4JPB W; 1BBZ A; 2DRM A; 4LE9 A; 2DF6 A; 2L2P A; 4HVW A; 2D8J A; 2HSP A; 2K9G A; 3SEM A; 4J9C A; 2ED0 A; 2CRE A; 2GNC A; 1HJD A; 2K3B A; 2RMO A; 1UFF A; 4RTV A; 3M0Q A; 1K1Z A; 4DEY A; 2C0I A; 2F2X A; 1H8K A; 1UUE A; 2IIM A; 2LQN A; 1AWX A; 1AZG B; 1M30 A; 1UE9 A; 1PWT A; 1GFD A; 3ZL7 C; 1RLP C; 2L3S A; 4RTY A; 2DRK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2OAW A; 2QQA A; 3EGD B; 2LMJ A; 3L42 A; 1BIA A; 3NTK A; 2V8I A; 3OB9 A; 3CCS A; 3CCM Q; 1TS9 A; 3CCU A; 4MZM A; 2LT4 A; 1ABO A; 1OI1 A; 4PJO E; 2YWW A; 2YLB A; 4NOY A; 3CC7 T; 3A8L B; 4M77 F; 1WDX A; 2JVV A; 1AT1 B; 1SHF A; 4OMP A; 2L0A A; 3SHW A; 3TQ7 P; 1QLY A; 2EIF A; 1YIJ Q; 2A08 A; 2VYT A; 3NFC A; 3G71 T; 5LL6 S; 4A4K A; 3JCM g; 2CSI A; 3CXC S; 1W2B A; 1UEB A; 2P0Q A; 4C8Q A; 3CBP A; 3UA7 A; 2YRV A; 1SG5 A; 3H6Z A; 1VQ6 A; 2KYM A; 2X4Y A; 3HP9 A; 1PNJ A; 1VA7 A; 4KH0 B; 3IQL A; 3ASK A; 1HSQ A; 3GLX A; 4N4H A; 2QDY B; 3VYG A; 2JM9 A; 4ZTJ A; 2F5T X; 4LDV A; 4OGC A; 2DET A; 2M0Y A; 4FSX A; 5DLO A; 3LGF A; 3MP1 A; 3RDV A; 2XIC A; 2HCK A; 3X26 B; 1EIF A; 1GRI A; 4PJJ A; 4PJO C; 3M0R A; 4NL3 A; 2PZ1 A; 2CSQ A; 1ZSG A; 4RCC A; 4JRQ A; 1GL5 A; 2HMA A; 4JLG A; 3CC4 A; 1M9S A; 1NYF A; 3C4S A; 1QCN A; 2CH4 W; 1KD1 R; 2EQU A; 1I4K 1; 5GAO r; 1LOJ A; 2LJ0 A; 4JJD A; 1CKB A; 4OP0 A; 3GOX A; 1W2B S; 1AWW A; 2CYZ B; 1X2K A; 2XDP A; 2CP2 A; 2DTI A; 2XD0 A; 3QJ6 A; 4C92 G; 3OYH A; 3PGG A; 2BIV A; 2JTM A; 3JV3 A; 3OMC A; 2MCN A; 1VQ8 A; 2KT8 A; 2E5K A; 3LH0 A; 3SDZ A; 2O31 A; 2G6F X; 4E7S A; 2PTK A; 1UB4 A; 2QA4 T; 5GAN j; 2LCL A; 4OMO A; 4FYV B; 1YIT T; 5C0M A; 2KEA A; 3OYA A; 4XTU A; 2D0Q B; 2YRC A; 2X4J A; 4PL6 A; 4E7K A; 1XOV A; 4HKE A; 4QT7 A; 1YJN A; 1KHI A; 1WQ7 A; 1KG1 A; 4PJO B; 3M0T A; 2E3I A; 1UTI A; 5HK0 A; 2YT6 A; 2DVJ A; 5GMK h; 4AFZ C; 4ZGD B; 4R56 A; 2KR3 A; 5GAM f; 3PIP A; 2PQW A; 5FWB A; 1IRX A; 1GFC A; 2LCS A; 1VQ5 T; 2HDA A; 1C6V X; 1IHV A; 2LRQ A; 3HKS A; 4N0A A; 1X6O A; 2CUB A; 1N9R A; 2VC8 A; 2O4X A; 1K73 R; 4M7A A; 5CO7 A; 3E19 A; 1RLQ C; 1JXO A; 2KSS A; 1A0N B; 4J9F A; 5HK3 A; 2KNB B; 4AFQ C; 5GMK l; 4RTT A; 4WTO B; 1I8F A; 1M3A A; 3VS1 A; 2OTJ A; 2ATC B; 4J7F A; 2DE0 X; 3QYH B; 4FU6 A; 4B6M A; 1UJ0 A; 3JB9 I; 3OBW A; 4RTX A; 1VQP Q; 5GAM h; 2QA4 Q; 1Q81 U; 4A4H A; 1QVG P; 4KH1 B; 3CCM A; 1MMA A; 2CH4 A; 1VQM A; 5LJ3 j; 1K0X A; 1YCS B; 5KYY B; 2RI2 A; 3X20 B; 2EYQ A; 4ELY C; 3X25 B; 3R6N A; 5FRN A; 3M0P A; 4ZN3 A; 1U8R A; 2RQT A; 4XTV A; 3O8V A; 2QAS A; 5DM7 R; 3QJY A; 4ZGE B; 3LGL A; 2RM4 A; 4F7U E; 3PE0 A; 2FRY A; 5ECA A; 4PJO G; 4A53 A; 1ARK A; 4LD9 K; 2F2V A; 1K9M R; 2QTV A; 3CCL Q; 3OS1 A; 3G4S Q; 4KBM B; 1G3T A; 8AT1 B; 4L5G A; 4M78 E; 4UC4 A; 1SRM A; 1X01 A; 1WFW A; 2D9T A; 1N8R R; 3LW5 E; 2DXU A; 1ABQ A; 4KUL A; 4B9X A; 4JJB A; 5FRM A; 1U1S A; 2WAC A; 4E6R A; 2MIO A; 1VQ9 T; 1Y96 B; 3FJP A; 2LT1 A; 2KK4 A; 3MEU A; 4JRI A; 4Z88 A; 3E1S A; 2NUZ A; 2CZ0 B; 2RQR A; 1I81 A; 3SWN C; 1DJ7 B; 1JO8 A; 2Y90 A; 2R5A A; 1GCQ C; 5KYX B; 1VYV A; 2HSE B; 1WHL A; 3EG3 A; 4C0F A; 5GAO p; 4FL6 A; 1UHC A; 4Z8A A; 2CGH A; 4JS4 A; 2QEX T; 3CC7 A; 1AWJ A; 2L3Q A; 2FPF A; 1ZUK A; 4M78 C; 2ENM A; 4ME7 A; 2COY A; 1WHH A; 3DKM A; 3QXE B; 3DLM A; 3WVD B; 2CP6 A; 1TXQ A; 2RHX A; 1FX7 A; 4ORZ A; 2EGE A; 4C8Q D; 4LN2 A; 1KQS S; 2DFU A; 3G71 A; 2FB7 A; 1RUW A; 3RKY A; 3MEV A; 4PNO A; 1FMW A; 2ZPE B; 3GNG A; 3LX7 A; 1JJ2 S; 1LCK A; 1Z9Z A; 3P8B B; 5GAO q; 4OB0 B; 1X6G A; 2VWF A; 1VIF A; 2EJ9 A; 2KRS A; 2DX1 A; 2ZGW A; 2K2V A; 3MEW A; 1WA7 A; 3H41 A; 3GIB A; 1UGR B; 4J9E A; 5KYW A; 1YFN A; 3OYC A; 2DVE A; 4A54 A; 2JS0 A; 3OYM A; 3RMQ A; 4HCB A; 2RJE A; 2DL4 A; 1SSH A; 4C5G A; 2DIL A; 2OTL Q; 2YUQ A; 3SWN B; 1VQL Q; 3OW2 A; 1QQJ A; 2ED1 A; 4C5I A; 4EMK A; 2SRC A; 4F7U B; 2AIR B; 2I2L A; 2EYZ A; 3EG0 A; 2DNU A; 2KAF A; 1N27 A; 4LDU A; 1RI0 A; 3S3N A; 3BW1 A; 3QII A; 1MMD A; 4RMO A; 1UGS B; 4M78 B; 4XU2 A; 3CCV Q; 3OS2 A; 3X28 B; 4XU1 A; 1YBY A; 4XTY A; 2FO0 A; 5GAN 3; 3KXT A; 3I56 Q; 1T3L A; 3MJX A; 2GFU A; 2D8H A; 2L5Q A; 2QA4 A; 2XDB A; 2F69 A; 1BI1 A; 1WXT A; 2X3W D; 1YIT A; 3OW2 S; 1KFZ A; 1TH7 A; 2LJ1 A; 4Z02 A; 3CCR T; 4BAC A; 2CP0 A; 2A36 A; 5IN1 A; 1LPL A; 4IUT A; 1GBR A; 2XK0 A; 4XU0 A; 2MPX C; 1E6G A; 2P0K A; 2K7A A; 2QGG A; 1W6X A; 4FT2 A; 3TSZ A; 2ZPG B; 2HBP A; 1VQ5 A; 3CCE T; 2IG0 A; 3HSB A; 3TSW A; 3PVL A; 3URG A; 3CPW A; 4JRP A; 3CCL A; 3G4S A; 4JPB W; 4C8Q E; 2L2P A; 2K9G A; 2LNV A; 2G3R A; 4QQD A; 2ED0 A; 2CRE A; 4RG2 A; 1WJR A; 3GF5 A; 4F7U G; 3MO8 A; 1G5V A; 1H8K A; 1UUE A; 2LQN A; 4PLI A; 4L6V 5; 2HL3 A; 1M30 A; 3JCM f; 1PWT A; 1Q7Y R; 3EFS A; 3CD6 Q; 1WHM A; 1B7T A; 4IUP A; 3UF4 A; 4M78 G; 3C12 A; 2RQW A; 2K2M A; 5IHK A; 3CCJ Q; 5AYF A; 3UA6 A; 3TCJ A; 2LX7 A; 5FWC A; 5DY9 A; 2H3J A; 5EG2 A; 4C8Q C; 1QW1 A; 4M75 A; 8ATC B; 1G8X A; 4L59 A; 2CZ7 B; 2BZ8 A; 1IXD A; 1ZLM A; 5GAO n; 3CCQ Q; 4F16 A; 1Y0M A; 1G83 A; 4M4Z A; 4PJO D; 1IO6 A; 4OMN A; 2YUP A; 3OYG A; 1OPL A; 3VV0 A; 1D09 B; 3JCM h; 3H0F A; 1OU9 A; 1RAB B; 1NLO C; 5A2Q E; 3CPW P; 1YJW T; 5IAY A; 1RI9 A; 2LP5 A; 5GMK j; 2OTJ T; 1KQ2 A; 4OB2 B; 2E6N A; 2RQV A; 2IPO B; 4GBQ A; 3L2V A; 4AG1 C; 4RKU E; 2HQE A; 4BI4 A; 2L8D A; 2V1R A; 2OTL A; 1VQL A; 2HQX A; 2QQB A; 1BCO A; 2DMO A; 3CCM T; 3OY9 A; 1GBQ A; 2M9U A; 1SSF A; 3NMZ C; 2L3R A; 1VYU A; 5KYU B; 2E10 A; 1SEM A; 2KQW A; 4XU3 A; 4C8Q B; 1UHF A; 4ELZ C; 1U1T A; 1PM3 A; 1YIJ T; 3F70 A; 4Q5W A; 2E5Q A; 4WF2 A; 2COW A; 4X34 A; 4CC4 B; 4M7A E; 3BE3 A; 2QEX A; 3I56 A; 2Z0W A; 1OX9 A; 2NYS A; 2HD0 A; 4HT8 A; 4EIK A; 2DIQ A; 1LNX A; 2QGF B; 5IXF A; 5IHN A; 4GY5 A; 4M7D A; 2YRD A; 3FLG A; 2MWO A; 2KYB A; 3VS4 A; 4OGE A; 1IB8 A; 2SEM A; 2M1H A; 1ZSZ A; 1QP2 A; 2E6Z A; 2MMP A; 4BB7 A; 1D0Y A; 3CXC A; 3VKI A; 1QWF A; 1ZUU A; 1M4Z A; 3NTH A; 3MHX A; 1N5Z A; 1QCO A; 2JW4 A; 2YLC A; 1OEB A; 2EQM A; 3JAM E; 3VJP A; 2KRM A; 1H64 1; 5A0L A; 4N0A C; 4C92 F; 4J6W A; 1M3C A; 1AZE A; 2KGT A; 3CME Q; 2PVD B; 2F5K A; 4M7A C; 3FIF A; 2LQW A; 5C6S A; 2CZ1 B; 3G7Z A; 2EVR A; 4OB3 B; 5IHI A; 3GNF B; 2JN0 A; 2E4H A; 4BD3 A; 4BE2 A; 1TUG B; 1N6A A; 4LDW A; 3VRY A; 4LUE A; 2I0N A; 1V29 B; 1VQO Q; 2MI6 A; 1ACM B; 4J9D A; 2MOX A; 1Q81 C; 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