The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
|
sequence length |
69
|
structure length |
69
|
Chain Sequence |
GSSGSSGGEEYIALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTGSIGDRSGIFPSNYVKPKDSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution Structure of the third SH3 domain of human intersectin 2(KIAA1256)
rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
INTERSECTIN 2
|
| total genus |
9
|
| structure length |
69
|
| sequence length |
69
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-07-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CUB A; 3TSW A; 2EYX A; 2C0I A; 1X2K A; 3RNJ A; 4EIK A; 2FRW A; 4Y92 A; 1SPK A; 1KIK A; 1UJ0 A; 3EG1 A; 1WFW A; 1SHG A; 2A28 A; 2C0O A; 2FG0 A; 1QWE A; 2EGE A; 2LJ1 A; 2CDT A; 3O5Z A; 5IXF A; 3SEM A; 4D8K A; 3REB B; 1SEM A; 2FPF A; 2JM9 A; 1I0C A; 3VS7 A; 2RMO A; 1RUW A; 3RBB B; 4OMP A; 1Y0M A; 1WXU A; 3UA6 A; 3EHR A; 5I11 A; 4AFS C; 3I35 A; 4R0K A; 2RF0 A; 1KJW A; 4Z8A A; 2L0A A; 1GBR A; 1K0S A; 1UEC A; 4HVU A; 1MUZ A; 1QKW A; 4RTV A; 1MV3 A; 1AZE A; 1VYU A; 2MOX A; 1WA7 A; 1M27 C; 2VVK A; 1WXB A; 2CUD A; 3NGP A; 4ZNX A; 4ORZ A; 1FYN A; 2RQV A; 4LUD A; 4AFQ C; 1K76 A; 2CH4 W; 2FRY A; 3H0I A; 2KRO A; 1GBQ A; 4JJC A; 1NEB A; 1UGV A; 1JO8 A; 4KRT A; 4E6R A; 4J9I A; 2V1R A; 2YUP A; 4QT7 A; 1E6H A; 4HVV A; 2MIO A; 3C0C A; 2ED0 A; 5IH2 A; 2SRC A; 1AOJ A; 3PVL A; 5I22 A; 1H3H A; 1OEB A; 2G6F X; 5FWB A; 4F16 A; 1NM7 A; 3NPF A; 2KRM A; 2ECZ A; 2C0T A; 1JXM A; 2PTK A; 4IIO A; 2YSQ A; 4F17 A; 1PHT A; 1WI7 A; 2JM8 A; 2O31 A; 4GLM A; 1SRL A; 1H8K A; 2AKK A; 2LP5 A; 2LNH B; 2LX7 A; 2DL3 A; 3I9Q A; 2J6O A; 4OMO A; 3JV3 A; 1CKB A; 1G2B A; 2NUZ A; 2LMJ A; 1W6X A; 1T0J A; 1UTI A; 2CT4 A; 2GQI A; 2CSI A; 4OML A; 2AKL A; 2A36 A; 1UHF A; 2ESW A; 5GJV B; 2HBW A; 2VKN A; 2XMF A; 4X1V A; 1H92 A; 1WLP B; 2KT1 A; 3VS3 A; 3VS2 A; 2F2V A; 5IHN A; 1FMK A; 2SEM A; 1UE9 A; 3QWX X; 1W70 A; 2K79 A; 2LQN A; 3VS4 A; 4OMQ A; 2HCK A; 4J9B A; 1K0X A; 3NHN A; 2DRK A; 5ECA A; 3EG0 A; 2L3Q A; 3M0R A; 1OPK A; 2GGR A; 3IQL A; 1I1J A; 2CSQ A; 3EG2 A; 1ZLM A; 1OOT A; 1X43 A; 2O2O A; 5L23 A; 2KYM A; 2BZY A; 1ZUK A; 2LZ6 B; 4RTY A; 2DL7 A; 2AZS A; 2QDL A; 2KGT A; 2YDL A; 2J6K A; 2KBT A; 4F14 A; 4RTW A; 4RTU A; 4ESR A; 2CH4 A; 1GL5 A; 1K9A A; 3VS6 A; 1KSW A; 1PKS A; 1GFC A; 1Z9Z A; 5FWC A; 2RN8 A; 1OV3 A; 1PWT A; 2AK5 A; 1AZG B; 2EVR A; 1B3Q A; 2D8J A; 1U5S A; 2F2W A; 4JJB A; 2ENM A; 2O88 A; 1K4U S; 2DYB A; 2RQU A; 1NYG A; 1JEG A; 2J05 A; 2JMC A; 2NWM A; 2DL4 A; 1TG0 A; 4M4Z A; 2RQT A; 4Z89 A; 3LH5 A; 2DL8 A; 3FJ5 A; 2X3W D; 2K6D A; 2F2X A; 2M0Y A; 1GCQ C; 2RQW A; 3SHW A; 2KYB A; 1PRL C; 2A08 A; 1MV0 B; 2EW3 A; 3M0P A; 1QLY A; 3CQT A; 2DRM A; 4RUG A; 4A63 B; 1EFN A; 2EYW A; 1QCF A; 1V1C A; 5EC7 A; 2DL5 A; 1NLO C; 3VRY A; 3UA7 A; 1CKA A; 4JZ4 A; 1QKX A; 2BTT A; 4AG2 C; 3UF4 A; 4J9D A; 3THK A; 1RLP C; 2EBP A; 4LE9 A; 1AD5 A; 1NG2 A; 1UHC A; 1AWW A; 2V1Q A; 1Y57 A; 2JS0 A; 1VA7 A; 5IHK A; 1M8M A; 1X27 A; 1X6G A; 2FEI A; 2JMA A; 3NMZ C; 4FSS A; 1GFD A; 1BU1 A; 2M51 A; 2PNI A; 1UDL A; 2VWF A; 1KFZ A; 1NEG A; 1K1Z A; 2EGA A; 1AWJ A; 3GBQ A; 2A37 A; 1ZSG A; 1UFF A; 2CT3 A; 3M0S A; 1SHF A; 2HSP A; 2KXD A; 1TUC A; 4RTX A; 1PKT A; 3PE0 A; 1ZX6 A; 1YCS B; 2EYY A; 2E5K A; 3UAT A; 4J9C A; 1LCK A; 2O9V A; 2RQR A; 3PVQ A; 1N5Z A; 2OI3 A; 1ABO A; 1UJY A; 2RPN A; 2K7A A; 5IHI A; 2KE9 A; 4DEY A; 2FO0 A; 2KNB B; 3M0T A; 2LCS A; 1JQQ A; 2YT6 A; 2J7I A; 4OMM A; 2EKH A; 3TSZ A; 2D0N A; 1GRI A; 1X2Q A; 2AZV A; 1BB9 A; 1OPL A; 2BZX A; 2L2P A; 3H41 A; 4J9H A; 3I5R A; 3VS5 A; 2X3X D; 5HCK A; 1JXO A; 1PNJ A; 1SRM A; 3KFV A; 2DIL A; 2LQW A; 4IIM A; 2ABL A; 2KR3 A; 2K9G A; 1BBZ A; 4LN2 A; 1A0N B; 2FPD A; 1RLQ C; 4LUE A; 5GJW B; 2EQI A; 1WDX A; 1BK2 A; 2DBM A; 4AG1 C; 2KRN A; 1PRM C; 4RTZ A; 1J3T A; 2K3B A; 1YP5 A; 4AFZ C; 2GTJ A; 3H0F A; 2DF6 A; 4HXJ A; 1E6G A; 2DBK A; 2I0N A; 4GBQ A; 3U23 A; 3REA B; 4CC3 A; 2YUN A; 3ULR B; 1HJD A; 1AVZ C; 1X6B A; 4LNP A; 2L3S A; 2GNC A; 2MCN A; 4K11 A; 1WIE A; 4JJD A; 1M3A A; 1SSH A; 2JS2 A; 4HCK A; 2RNA A; 2HEQ A; 1M3C A; 1WXT A; 1ZUY A; 3H0H A; 2DNU A; 1TUD A; 2JT4 A; 3EGU A; 5IXB A; 1S1N A; 3ZL7 C; 1NYF A; 2H8H A; 2B86 A; 2L3P A; 2IIM A; 1G83 A; 1CSK A; 1XOV A; 1HD3 A; 2DE0 X; 1T0H A; 1U3O A; 2D1X A; 1ZUU A; 2FPE A; 1T3S A; 3M0Q A; 2EGC A; 5FW9 A; 1YNZ A; 2P4R A; 2DA9 A; 4DEX A; 1Z9Q A; 2W10 A; 4JPB W; 1RI9 A; 1B07 A; 2DMO A; 1GCP A; 1JU5 C; 4WCI A; 4J9F A; 1ZBJ A; 2DLP A; 3R6N A; 2ROL A; 3EHQ A; 2D8H A; 1WX6 A; 4JZ3 A; 4OMN A; 1IO6 A; 1M3B A; 1AWO A; 2JXB A; 1WYX A; 4D8D A; 2OAW A; 2ROT A; 2HDA A; 2J6F A; 1M30 A; 1ABQ A; 2ED1 A; 3VS0 A; 3EG3 A; 1ARK A; 2W0Z A; 1YN8 A; 1I07 A; 1YWP A; 2BZ8 A; 2GBQ A; 2EPD A; 3QWY A; 1UG1 A; 2JW4 A; 1GCQ A; 2KEA A; 2OJ2 A; 2J06 A; 1T3L A; 1W1F A; 2PZ1 A; 1QWF A; 2JTE A; 2K2M A; 1E7O A; 4CC2 A; 2EYZ A; 2LJ0 A; 4J9E A; 1NLP C; 2GTO A; 4CC4 B; 2DJQ A; 2DX1 A; 3I5S A; 4RTT A; 1AEY A; 2KXC A; 1YWO A; 2KRS A; 3A98 A; 3VS1 A; 4AFU C; 1U06 A; 3VRZ A; 2KT8 A; 2YUO A; 1UUE A; 3M0U A; 4CC7 A; 4Z88 A; 1VYT A; 4J9G A; 1AWX A; 2DVJ A; 2YUQ A; 1X69 A; 2LJ3 A; 2CRE A; 3TVT A; 1HSQ A; 1VYV A; 2O9S A; 4HVW A; 2DM1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4PJJ A; 1LJO A; 2CUB A; 3FDR A; 4L59 A; 4C92 D; 2RD1 A; 2WSE E; 3RNJ A; 4FT4 A; 4Y92 A; 3OW2 P; 4M78 C; 3EG1 A; 1N8R R; 2FG0 A; 4M75 G; 2EGE A; 1RAF B; 1EZZ B; 1M90 C; 3O5Z A; 3SEM A; 3CXC S; 2QA4 A; 1SEM A; 2FPF A; 1I0C A; 4CI0 C; 5KYW B; 3RBB B; 3CCS T; 2CS7 A; 1Q86 C; 5FU7 B; 4Z8A A; 1GBR A; 4HVU A; 3CCM T; 5GAO r; 4PLL A; 1AZE A; 4M77 D; 2IPO B; 4BI4 A; 2OTJ Q; 1WA7 A; 1M27 C; 3HPW A; 1WXB A; 2CYZ B; 1VQL A; 2YWW A; 3OY9 A; 3JCM P; 2LCL A; 3CXC A; 2CH4 W; 3OYB A; 1VQM Q; 3H0I A; 3PT9 A; 4BAC A; 4JJC A; 4E7L A; 3CCS A; 5IAY A; 1UGV A; 1N8R C; 1XJW B; 5KYN A; 5GAN h; 4E6R A; 5CAI A; 4XU0 A; 5IH2 A; 2SRC A; 1OEB A; 2G6F X; 3MEU A; 5FWB A; 5GAN g; 2ECZ A; 2DIG A; 2C0T A; 3SDZ A; 4PJO A; 4IIO A; 2YSQ A; 2RHU A; 4F17 A; 2XDD A; 1IHV A; 4E7I A; 1RAH B; 3JB9 F; 4GLM A; 2YRD A; 2X4J A; 1K73 U; 1H8K A; 4PJO E; 2GF7 A; 4FT2 A; 3HRT A; 2DKG A; 4BY6 C; 1CKB A; 2K3X A; 3P8H A; 4M7A A; 2CT4 A; 2CSI A; 4OML A; 3OQ5 A; 1QVG P; 3LW5 E; 5GJV B; 1HXD A; 1H92 A; 3AHU A; 2F2V A; 5IHN A; 4M7A E; 3QWX X; 3MO8 A; 4M7D G; 2LQN A; 2CZ6 B; 1K0X A; 2VYT A; 2L3Q A; 3QSU A; 1OPK A; 3IQL A; 3CCR A; 1I1J A; 1ZLM A; 2AHJ B; 4JS5 A; 4C8Q E; 2KYM A; 2BZY A; 1ZUK A; 3CCJ T; 3OYH A; 2AZS A; 1WPY A; 2KGT A; 4X9D A; 2YDL A; 2J6K A; 5I21 A; 3EG9 B; 4ESR A; 4J7I A; 2MF2 A; 5A0D A; 4PNO A; 3VS6 A; 3PMT A; 1Q95 G; 3JCM f; 2RN8 A; 3VKI A; 1B3Q A; 1B34 B; 2F2W A; 2ZPI B; 4XTZ A; 4BY6 B; 2ZPH B; 2HQH A; 2RQU A; 2V8I A; 1M2V A; 5GMK i; 2J05 A; 2JMC A; 1OZ3 A; 2DL4 A; 2KK4 A; 2L89 A; 3OYD A; 3TEE A; 1YIJ T; 5GAM d; 3O8V A; 4C92 E; 1ZSZ A; 3INZ A; 4MDX A; 1KC8 U; 3CCJ A; 2K6D A; 3SWN C; 3GOX A; 4BDY A; 1WJQ A; 3SHW A; 3OYK A; 2E64 A; 1PRL C; 1Y96 B; 1NJI U; 3I55 Q; 3EFR A; 4HCC A; 3EGD B; 1WJR A; 1PC0 A; 2DTI A; 3F70 A; 1QKX A; 4KGX B; 1SSF A; 1S72 T; 1RLP C; 1YJW T; 4C0G A; 2EIF A; 4ZN1 A; 2JJ9 A; 2O4X B; 4FCY A; 3CCV A; 4M77 E; 4VUB A; 1M1K U; 4E47 A; 3T9N A; 2JMA A; 1GFD A; 2QA4 Q; 5GAN 6; 1BCM A; 3GLX A; 1QVF A; 3OYG A; 1VQO T; 4KH1 B; 1UDL A; 1RAI B; 1K1Z A; 4KT0 E; 3QG1 A; 3PNW C; 2ZAE A; 1MND A; 4M75 D; 4DA4 A; 3OS2 A; 2CT3 A; 1OZ2 A; 1SHF A; 2KXD A; 4B6M A; 3L2Z A; 4EPC A; 3UAT A; 1M90 U; 1QMC A; 3MKD A; 1VQL Q; 1SF9 A; 3RKY A; 2XDP A; 3EFO A; 3M59 A; 2ZPG B; 1N5Z A; 3TQ7 P; 1VQO A; 1ABO A; 1UJY A; 4O5V A; 3QKJ A; 4PFP A; 2L3R A; 3CCS Q; 3RDV A; 4A4F A; 2KNB B; 2R5M A; 7AT1 B; 3M0T A; 1JQQ A; 2EKH A; 2EWN A; 3H6Z A; 1GRI A; 2MMP A; 1X2Q A; 2AZV A; 2DPP B; 4AT1 B; 1BB9 A; 5LJ5 d; 2BZX A; 2L2P A; 3H41 A; 3I5R A; 3VS5 A; 1I81 A; 5GAO p; 3CC2 T; 1JXO A; 1PNJ A; 1SRM A; 3KFV A; 2COZ A; 1YJ9 A; 3JRZ A; 1FMV A; 4PKC C; 1A0N B; 1N8R U; 3MP1 A; 1BK2 A; 4PJO C; 4DBR A; 3M56 A; 2BUD A; 4BE2 A; 1JJ2 S; 1PSE A; 2QQ9 A; 3OYN A; 4N4I A; 2E6Z A; 2MK5 A; 3QZ5 B; 5GMK l; 3JSC A; 3RER A; 4MDW A; 1AVZ C; 4M7A C; 2CZ1 B; 1SSH A; 2RNA A; 3OSV A; 4LDU A; 2M16 A; 1WXT A; 3CCR Q; 3H0H A; 2L5Q A; 1IHW A; 1RAG B; 2DNU A; 2XID A; 3EH2 A; 2JT4 A; 5CKB A; 1YIT T; 1M1G A; 3M9Q A; 1I5O B; 5GAO l; 4M7D D; 2H8H A; 1ZBX A; 2B86 A; 4F7U A; 5CKH A; 4ZTJ A; 4XTV A; 4OB1 B; 3QHS A; 2D6F A; 1T0H A; 2JOY A; 2D1X A; 3M0Q A; 2RJC A; 4F7U E; 4EMK A; 3CCL A; 4L6V 5; 1F1B B; 2VB6 A; 1YNZ A; 1D1A A; 2NUT A; 4DBQ A; 1FWZ A; 3L2Q A; 1YBY A; 2R57 A; 2E12 A; 3M54 A; 3UWN A; 2VGN A; 1RI9 A; 1B07 A; 2H3E B; 4C92 G; 4Y91 A; 2LCC A; 2RI2 A; 2LVM A; 3N5B B; 2DLP A; 1UGS B; 3EHQ A; 4C0D B; 2D8H A; 1ZSZ C; 4JZ3 A; 1IO6 A; 1KK7 A; 2EQU A; 4D8D A; 4M75 A; 3NTH A; 5KYX A; 1ABQ A; 1RI0 A; 4RG8 A; 4PJO F; 3S3M A; 4M75 E; 4X9C A; 2W0Z A; 1ACM B; 1I07 A; 2BZ8 A; 4NL2 A; 3QWY A; 2JW4 A; 3J81 E; 3CCV Q; 2CZ7 B; 2VXF A; 2EQJ A; 4KUD K; 3BY7 A; 4M77 C; 2K5F A; 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4TVR A; 4QVZ A; 2KRM A; 1VQK T; 4IUV A; 4J6Y A; 4FYX B; 1VQ7 T; 5I2S A; 2CP5 A; 1NJI C; 2EYQ A; 2LT1 A; 1BYM A; 1MGQ A; 1D0X A; 2DL3 A; 3I9Q A; 4OMO A; 1OUL A; 3QYH B; 1G2B A; 3SWN A; 2LMJ A; 1YHQ A; 1UTI A; 2JZ2 A; 3L2R A; 2GQI A; 4HT8 A; 3JCM h; 3CCL Q; 3PFS A; 3QII A; 2HKN A; 3HSB A; 2A36 A; 2ESW A; 3QYG B; 4N4H A; 2CP6 A; 3X24 B; 5CQX A; 2EQK A; 1WLP B; 2LT4 A; 1SKU B; 3VS2 A; 4ZGD B; 2SEM A; 3NFC A; 3JCM g; 3VS4 A; 4EMK C; 1PG5 B; 3NHN A; 1M1K C; 2DRK A; 3EG0 A; 3OSS C; 2LQ8 A; 3EG2 A; 1OOT A; 2O2O A; 3I56 A; 5L23 A; 4C0F A; 2XU8 A; 2LZ6 B; 4RTY A; 2Y4X A; 2DL7 A; 2QDL A; 4HCZ A; 2KBT A; 1O75 A; 4P5N A; 4RTU A; 2CP3 A; 5GAM f; 1K9A A; 1PKS A; 5FWC A; 1BIB A; 3C4S A; 2FYK A; 2AK5 A; 2EVR A; 4MMK A; 3JB9 G; 3A8G B; 4JJB A; 4M75 C; 2O88 A; 2QK0 A; 1R8O B; 3P8B B; 1WQ7 A; 1JEG A; 2CP2 A; 3L42 A; 3JCM J; 3GP8 A; 2QXF A; 2PVD B; 4M4Z A; 2FZK B; 4WTO B; 2QEX Q; 3ZEH A; 1VQ4 T; 2GQV A; 2X3W D; 2EJG A; 2F2X A; 4ZGE B; 4EMK B; 3LYI A; 1SG5 A; 1U1S A; 2DRM A; 2HBP A; 4RUG A; 1EFN A; 1QCF A; 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