The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
68
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structure length |
68
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Chain Sequence |
DPKFEAAYDFPGSGSSSELPLKKGDIVFISRDEPSGWSLAKLLDGSKEGWVPTAYMTPYKDTRNTVPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
High-throughput structural genomics of yeast SH3 domains
rcsb |
| molecule tags |
Contractile protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| molecule keywords |
Myosin-3 isoform
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| total genus |
12
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| structure length |
68
|
| sequence length |
68
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-02-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QWF A; 4J9C A; 4JZ4 A; 1KSW A; 2BZY A; 4JJB A; 3TSW A; 1NYF A; 1SPK A; 3EG0 A; 1T3L A; 3PE0 A; 1OPK A; 2JS0 A; 2G6F X; 3VS6 A; 2DL7 A; 1AVZ C; 2EQI A; 1ABO A; 2F2W A; 2D1X A; 2GNC A; 2KT8 A; 2LP5 A; 4AFZ C; 2GBQ A; 3M0R A; 2RQU A; 3VRY A; 3I9Q A; 2J7I A; 2GTO A; 1E6H A; 4D8D A; 2PTK A; 1WLP B; 4J9I A; 1AWJ A; 3QWX X; 1RI9 A; 1KFZ A; 4J9G A; 4AFQ C; 2B86 A; 1NG2 A; 2YSQ A; 2H8H A; 3M0T A; 2HDA A; 2DF6 A; 2CUB A; 2O2O A; 1PNJ A; 2CSI A; 1XOV A; 2MIO A; 5I11 A; 1U5S A; 4HVW A; 2JW4 A; 2CH4 W; 2CSQ A; 2EKH A; 2EW3 A; 2D8J A; 4J9D A; 2HCK A; 1QKW A; 1ZBJ A; 2M51 A; 2FRY A; 4D8K A; 2KEA A; 1CSK A; 1AEY A; 2K9G A; 4ORZ A; 1JO8 A; 4JPB W; 1AD5 A; 2RMO A; 2DL4 A; 4Y92 A; 2VVK A; 3EGU A; 1UHC A; 1GFC A; 1ZUU A; 2A08 A; 2DVJ A; 3M0S A; 1W6X A; 2KRM A; 4X1V A; 2ED0 A; 5FWC A; 2EYZ A; 1BB9 A; 1SSH A; 2K2M A; 1X6B A; 2KXC A; 4J9B A; 4F17 A; 2GQI A; 2RPN A; 2KRN A; 2C0I A; 4OMN A; 3I5R A; 1ZX6 A; 1WYX A; 1V1C A; 1WI7 A; 2LQN A; 2JTE A; 1YP5 A; 2ROL A; 5IH2 A; 3R6N A; 4GBQ A; 1MV0 B; 2KE9 A; 4OMP A; 1SRM A; 4RTV A; 1PKT A; 1FMK A; 1UFF A; 1U3O A; 2V1Q A; 3EG3 A; 1NLP C; 2AZV A; 2EYX A; 1B3Q A; 2J6K A; 4JZ3 A; 3CQT A; 1HSQ A; 3VS3 A; 2DBK A; 4HVU A; 2LJ1 A; 5IXF A; 4K11 A; 3FJ5 A; 1SEM A; 3LH5 A; 3ULR B; 2FRW A; 4OMM A; 1CKA A; 3VS2 A; 4A63 B; 1UJ0 A; 1K0S A; 1QCF A; 4M4Z A; 1PWT A; 4AFU C; 3H41 A; 2FPD A; 1QKX A; 3H0F A; 1T0H A; 2LNH B; 3VS4 A; 1X2K A; 1JXO A; 1X69 A; 1K1Z A; 2K7A A; 2DM1 A; 1YWP A; 2ENM A; 4LN2 A; 1UE9 A; 1E6G A; 1K9A A; 1H92 A; 2KBT A; 3SEM A; 1QWE A; 2E5K A; 2L3Q A; 2SEM A; 5GJW B; 1PKS A; 1GCQ C; 2K79 A; 1ARK A; 1SHF A; 2YUN A; 2SRC A; 3QWY A; 2CH4 A; 1H8K A; 1WDX A; 1Y0M A; 2PNI A; 3REA B; 3SHW A; 2ED1 A; 3KFV A; 4DEX A; 3NGP A; 1BBZ A; 1VYU A; 2DRK A; 2CT3 A; 3M0Q A; 3UAT A; 4IIO A; 2FPE A; 2FEI A; 1I1J A; 2V1R A; 1WXB A; 1WXU A; 2J6O A; 1Z9Q A; 3TSZ A; 2X3X D; 2RNA A; 1K0X A; 2OAW A; 2DBM A; 4EIK A; 3ZL7 C; 1WXT A; 3A98 A; 2C0T A; 4AFS C; 1UJY A; 3VS5 A; 1GL5 A; 2YDL A; 4RUG A; 2LCS A; 2ECZ A; 2F2X A; 2CT4 A; 2L2P A; 2DLP A; 1CKB A; 5ECA A; 4LNP A; 2M0Y A; 4OMQ A; 1M3B A; 2ESW A; 3NHN A; 1J3T A; 1BU1 A; 5GJV B; 1OOT A; 4WCI A; 3THK A; 2L3S A; 2DNU A; 4E6R A; 1WFW A; 4RTY A; 2NUZ A; 2RQR A; 1UGV A; 1W1F A; 2AZS A; 2EYW A; 1RLP C; 2AK5 A; 1UEC A; 3RBB B; 2KT1 A; 2YUO A; 1NM7 A; 2DRM A; 1WA7 A; 1I07 A; 1YN8 A; 3U23 A; 2BTT A; 2GTJ A; 2ABL A; 2FO0 A; 1RLQ C; 3VS1 A; 1ZLM A; 2DJQ A; 3PVQ A; 1AWX A; 2O9V A; 2KYB A; 1UG1 A; 4LE9 A; 2YUP A; 1A0N B; 2NWM A; 3UA6 A; 1TUD A; 4AG1 C; 1VYT A; 4JJD A; 1KJW A; 1X27 A; 1M3A A; 1OEB A; 1X43 A; 2EYY A; 4FSS A; 2DL8 A; 4F14 A; 1GRI A; 4LUE A; 5I22 A; 1WIE A; 1YCS B; 1AZG B; 1Z9Z A; 1M3C A; 3JV3 A; 2LJ3 A; 2BZX A; 2YUQ A; 4Z89 A; 2VWF A; 2OI3 A; 1GCP A; 1TUC A; 1X2Q A; 5IHK A; 2KR3 A; 1S1N A; 1K76 A; 4AG2 C; 1AOJ A; 2J06 A; 3GBQ A; 2RF0 A; 1MV3 A; 2RQV A; 3I35 A; 1N5Z A; 4HCK A; 4HVV A; 1SRL A; 1W70 A; 4CC4 B; 4JJC A; 2LQW A; 4RTZ A; 1GBQ A; 4CC2 A; 1T3S A; 2L3P A; 3VRZ A; 4RTU A; 2VKN A; 2EBP A; 1GBR A; 3REB B; 4CC7 A; 2CUD A; 2K6D A; 2A28 A; 4Z88 A; 4RTX A; 4Z8A A; 2LZ6 B; 2J6F A; 1K4U S; 4QT7 A; 2DE0 X; 1TG0 A; 2O88 A; 1ZSG A; 2W0Z A; 5IHI A; 2AKL A; 4ZNX A; 5L23 A; 1G2B A; 1ZUY A; 1B07 A; 3EG1 A; 2DYB A; 2C0O A; 2JMA A; 1AZE A; 2RQT A; 2FPF A; 1Y57 A; 1E7O A; 1NEG A; 1BK2 A; 2DIL A; 2BZ8 A; 1I0C A; 4GLM A; 2DMO A; 3IQL A; 4ESR A; 2KXD A; 2O31 A; 1VA7 A; 5FWB A; 5IXB A; 1M8M A; 2X3W D; 1H3H A; 1WX6 A; 4IIM A; 1NYG A; 2EGC A; 3O5Z A; 3PVL A; 1T0J A; 3H0H A; 1OPL A; 2RQW A; 1JEG A; 1MUZ A; 2K3B A; 1ABQ A; 4KRT A; 1M30 A; 1YWO A; 1OV3 A; 1HD3 A; 4OMO A; 2CDT A; 2MCN A; 2QDL A; 4F16 A; 1UUE A; 2RN8 A; 2KRS A; 2GGR A; 2O9S A; 2HSP A; 2JM9 A; 1GFD A; 2HEQ A; 1UTI A; 2YT6 A; 1U06 A; 2IIM A; 3NPF A; 1UDL A; 2W10 A; 3NMZ C; 2JS2 A; 4HXJ A; 2CRE A; 2J05 A; 2XMF A; 2KRO A; 1G83 A; 4OML A; 1ZUK A; 2A36 A; 4DEY A; 2EGA A; 2JMC A; 1AWW A; 2DA9 A; 2DL3 A; 3VS0 A; 4J9H A; 2L0A A; 2DX1 A; 1NLO C; 3C0C A; 2LJ0 A; 3EHR A; 2EPD A; 1AWO A; 4RTT A; 1LCK A; 3UA7 A; 2JM8 A; 1UHF A; 2P4R A; 3EG2 A; 2KGT A; 2AKK A; 1YNZ A; 3M0U A; 1PRM C; 2PZ1 A; 2D8H A; 2ROT A; 2FG0 A; 3RNJ A; 2JXB A; 1QLY A; 2LMJ A; 1VYV A; 5EC7 A; 4J9E A; 1JU5 C; 2HBW A; 2A37 A; 3M0P A; 1KIK A; 4J9F A; 1IO6 A; 3TVT A; 2KYM A; 1EFN A; 1JQQ A; 3EHQ A; 2DL5 A; 2KNB B; 2JT4 A; 4CC3 A; 4RTW A; 3VS7 A; 1X6G A; 2F2V A; 5HCK A; 1GCQ A; 2EVR A; 2I0N A; 2OJ2 A; 3I5S A; 1M27 C; 3H0I A; 2D0N A; 5IHN A; 3UF4 A; 2LX7 A; 1FYN A; 2MOX A; 1JXM A; 2EGE A; 1NEB A; 1HJD A; 1RUW A; 4R0K A; 1PHT A; 1PRL C; 4LUD A; 5FW9 A; 1SHG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2M02 A; 3CCM T; 4J9C A; 4JJB A; 5LJ5 e; 2X51 A; 5GAN g; 2QK0 A; 3QDF A; 1M8V A; 1VQM Q; 2JS0 A; 2V8K A; 3EG9 A; 2G6F X; 1VQ9 Q; 2EQI A; 5KYW A; 4M7A F; 3LWI A; 2VC8 A; 4XTW A; 4C8Q A; 2XDB A; 3VRY A; 5KCH A; 3I9Q A; 1OZ3 A; 4J7F A; 4D8D A; 1WLP B; 3C94 A; 5GAN f; 3QWX X; 2YRD A; 3CXC S; 4J9G A; 1OUL A; 2YSQ A; 2RB6 A; 4JDS A; 3M0T A; 2HDA A; 5C0M A; 1WHK A; 2DF6 A; 4M75 G; 2DTO A; 4GLK A; 4J6X A; 2MWO A; 5CKE A; 4N4H A; 3GF5 A; 1XOV A; 4AT1 B; 2JW4 A; 4MDX A; 2CH4 W; 4PFP A; 2D8J A; 4B9W A; 3RES A; 5CQY A; 1XQH A; 2NUT B; 4RCC A; 3J81 E; 3JB9 F; 2M51 A; 2K9G A; 2HSE B; 2HNI A; 1IHW A; 4NL2 A; 4M77 E; 3HSB A; 1GFC A; 2AHJ B; 2QA4 A; 2ED0 A; 5GAM d; 3H8Z A; 2KI7 A; 3QO3 A; 2KXC A; 2XG8 D; 5GAM j; 5GAO l; 3HL8 A; 2MI6 A; 2C0I A; 3CMA Q; 4OMN A; 1K73 U; 5GMK e; 2X4J A; 3I56 Q; 3N5B B; 3OYB A; 2ROL A; 3DB4 A; 2RM4 A; 2QEX T; 4RTV A; 4HKE A; 5GAN 8; 1PSF A; 5LJ3 d; 4VUB A; 1FMK A; 1UFF A; 4DQ2 A; 5LJ3 j; 1NLP C; 1B3Q A; 4JZ3 A; 3S3N A; 5IXF A; 4K11 A; 1YIJ Q; 1WJR A; 4Y91 A; 3FRN A; 1MNE A; 1CKA A; 4M4Z A; 1PWT A; 3EGD A; 2LT4 A; 2NUP A; 3NTK A; 3H6Z A; 4CI0 C; 3CCR Q; 5FRO A; 5DY9 A; 5CAI A; 5KYY B; 4PK4 A; 2LNH B; 5A0G A; 5CVI A; 2M1H A; 4M78 C; 1VQN A; 4OGE A; 1K1Z A; 2K7A A; 2DM1 A; 4N0A A; 4FYY B; 5FRN A; 1K9A A; 2DD4 A; 3SEM A; 1QWE A; 2E5K A; 4JJN K; 1M1K C; 5LJ5 d; 1GCQ C; 2K79 A; 5LJ5 j; 5FU6 B; 3CCS Q; 2RI2 A; 2SRC A; 3QBY A; 4FYX B; 4X34 A; 5FU6 C; 2PUK B; 3ZEH A; 3MKD A; 3J80 E; 1OU9 A; 2ED1 A; 4RG2 A; 3SHW A; 2XDP A; 1W2B A; 3QDR B; 2AT1 B; 3JCM h; 1WZO A; 1C0M A; 2FEI A; 3M58 A; 4KGX B; 4C92 E; 4C0F A; 5KCO A; 1N8R C; 2V1R A; 3FB9 A; 3CCU T; 4A4F A; 3OW2 S; 1XNI A; 4JRK A; 1Z9Q A; 2QG9 B; 3JCM P; 4XU0 A; 3CC4 Q; 1YJW T; 3SWN C; 4M7A B; 2C0T A; 2O01 E; 4M7A C; 2YDL A; 4RUG A; 3OYA A; 2ECZ A; 3JB9 G; 2L2P A; 4MZT A; 3M53 A; 2JNG A; 2OTL A; 3MHX A; 1IGU A; 2VXF A; 1QCO A; 4OGC A; 4OMQ A; 1M3B A; 1RAG B; 3OS5 A; 1OOT A; 5CKH A; 3G71 A; 3EH2 A; 4MML A; 3THK A; 3PMI A; 3OYC A; 2QQ9 A; 1UGV A; 1W1F A; 3PT9 A; 3HRT A; 1KK7 A; 2EYW A; 2AK5 A; 1LNX A; 1G3Y A; 2DEQ A; 1YI2 Q; 4PJO E; 2LRQ A; 3RBB B; 3QXE B; 1I07 A; 2RK2 A; 2GTJ A; 1D09 B; 3VS1 A; 2MK5 A; 1WNL A; 2E4H A; 2EAY A; 2DJQ A; 3CCV T; 3PVQ A; 2KYB A; 1NJI C; 2YUP A; 4JLG A; 3CCL A; 2JOY A; 2RO0 A; 4L6V 5; 2OAU A; 3QZ9 B; 1QVF P; 4M75 D; 3OYN A; 3UA6 A; 3KUF A; 1VYT A; 4E7S A; 2LTO A; 2DL8 A; 4BDY A; 4N4G A; 4M77 G; 1YCS B; 3JV3 A; 2E3H A; 2LJ3 A; 2DIG A; 4Z89 A; 1VQK A; 1WHJ A; 2VWF A; 3VUB A; 1VQO A; 1GCP A; 4M78 A; 4E47 A; 2BKD N; 1S1N A; 5CKB A; 1AOJ A; 4C8Q E; 1WJS A; 2R57 A; 4PJO F; 3CME T; 1YJ9 A; 2F1L A; 4AMC A; 4HCK A; 1SRL A; 4DA4 A; 1OX9 A; 3OS2 A; 4HCC A; 1B34 A; 2GFA A; 2QI2 A; 1T3S A; 2I2L A; 1PC0 A; 1KQS S; 4LDW A; 4IUV A; 1Q86 R; 3JCM g; 4CC7 A; 2KDS A; 2LX9 A; 4ZGJ B; 3HTR A; 4FT2 A; 3EFO A; 5GAO r; 1C1A A; 2CZ1 B; 1QVP A; 5CCA A; 2HKN A; 1QP2 A; 3LW5 E; 4X9C A; 2DE0 X; 2LCL A; 4QQ6 A; 3M56 A; 1M90 R; 2K2V A; 2RHZ A; 3L2U A; 2DXB A; 1EIF A; 4BDZ A; 3VU3 C; 2ZPI B; 4BUG A; 2JMA A; 3JCM f; 3OB9 A; 4C8Q F; 1WJQ A; 3URG A; 2BZ8 A; 1K8A R; 3JCM e; 4GLM A; 4FT4 A; 2ATC B; 4LDX A; 3MP6 A; 3M57 A; 2QDY B; 2ZAE A; 4KUL A; 5IXB A; 4PLI A; 3RKY A; 4IIM A; 4F04 B; 1NYG A; 2EGC A; 2VGM A; 2COY A; 3H0H A; 1SSF A; 2PU9 B; 2RQW A; 3EAE A; 5GAO m; 1UGS B; 3QG1 A; 3MEA A; 2M9U A; 1BI2 A; 2K3B A; 4ZTJ A; 1M30 A; 1VQ7 A; 3OBW A; 5C6S A; 1HD3 A; 4OMO A; 2CDT A; 2HQX A; 2RN8 A; 2K3X A; 1UEB A; 2O9S A; 2RA2 A; 5KE3 A; 2HSP A; 2HEQ A; 4O6J A; 4QQG A; 4DOV A; 2DAQ A; 3NPF A; 1UDL A; 3OMC A; 3UPU A; 2KRO A; 1G83 A; 4OML A; 2EGA A; 2QYZ A; 3VKI A; 3BY7 A; 5AT1 B; 2DA9 A; 3MEU A; 4J9H A; 4F7U A; 2DX1 A; 2LJ0 A; 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3LGF A; 3MEV A; 4MZM A; 4EMK A; 4M7D C; 2CSI A; 3L2V A; 3ZBD A; 4JS5 A; 2OTL T; 2MIO A; 5I11 A; 2X35 A; 2EKH A; 2HCK A; 1YJW A; 1V29 B; 1QVF A; 1TS9 A; 3FJP A; 3MPU B; 3BW1 A; 3V7S A; 3G71 T; 4JUV A; 1YHQ A; 2KK4 A; 2FRY A; 1NJI U; 1AEY A; 1CSK A; 1IB8 A; 1R77 A; 3QHS A; 4BD3 A; 2Z0W A; 2CP0 A; 1NPP A; 3SB2 A; 3CC7 Q; 1AD5 A; 4RG8 A; 2DL4 A; 3HPW A; 2DFU A; 1UHC A; 2V8I A; 2V8J A; 2RJD A; 1W6X A; 1WGS A; 1U8R A; 5CIU A; 1SSH A; 1O75 A; 3CCL T; 2YLC A; 5D7U A; 2KY9 A; 4FM4 B; 1XTD A; 2CGH A; 1VQ8 Q; 1ZX6 A; 1V1C A; 2RHU A; 3RMQ A; 7AT1 B; 3Q1J A; 4MZP A; 2H3J A; 4JRI A; 3CCV A; 4GBQ A; 2KE9 A; 1VQO T; 1SRM A; 2XK0 A; 3EG3 A; 4B6M A; 2EYX A; 1V76 A; 1HSQ A; 3VS3 A; 2DBK A; 4E2F B; 4YTL A; 4EMG A; 2RHX A; 3M4Y A; 1SEM A; 2JZ2 A; 3ULR B; 2EQJ A; 4WTO B; 1VQ5 A; 1D0Y A; 1QKX A; 3OYE A; 3CME A; 4C92 D; 3S3O A; 3M9Q A; 2B8A A; 4DBQ A; 2A7Y A; 1VQL Q; 4XTU A; 3JRZ A; 1M1F A; 1WQ7 A; 1E6G A; 1H92 A; 2KBT A; 4LDY A; 3AT1 B; 2DPP B; 2SEM A; 4PJL A; 1ARK A; 1SHF A; 1ZA2 B; 1N9S A; 3J7A F; 2CH4 A; 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