The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
60
|
structure length |
60
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Chain Sequence |
PSNATFGMGDRVRKKSGAAWQGQIVGWYCTNLTPEGYAVESEAHPGSVQIYPVAALERIN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A plasmid-encoded dihydrofolate reductase from trimethoprim-resistant bacteria has a novel D2-symmetric active site.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxidoreductase
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| source organism |
Escherichia coli
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| molecule keywords |
DIHYDROFOLATE REDUCTASE
|
| total genus |
12
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
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| ec nomenclature |
ec
1.5.1.3: Dihydrofolate reductase. |
| pdb deposition date | 1996-10-03 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3T9N A; 2VV5 A; 2GQV A; 2RH2 A; 2P4T A; 3UDC A; 1VIF A; 2OAU A; 2RK2 A; 1VIE A; 3SFM A; 2RK1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2X51 A; 3OYL A; 1RLQ C; 1TTH B; 3JSC A; 1VQO Q; 1VQN T; 3VJP A; 1ZX6 A; 1D1C A; 4XU1 A; 2YT6 A; 1Y7X A; 4OMP A; 2LCC A; 5LL6 S; 4M7D D; 2ATC B; 1QW1 A; 3OS5 A; 2E65 A; 3JCM P; 4C92 F; 3OYA A; 3S3M A; 2CSQ A; 2V26 A; 1ZA1 B; 1WXU A; 2V8I A; 1HXD A; 1LPL A; 2X3W D; 2HNI A; 1JJ2 P; 4M75 B; 4BE0 A; 2JUF A; 3UT1 A; 1FMW A; 4JRI A; 1N8R R; 2KT1 A; 4RMO A; 2ZPE B; 4JRQ A; 1IRX A; 5J26 A; 4C5H A; 2OX7 A; 1M90 R; 3CD6 Q; 2RB6 A; 3NTK A; 4M7D G; 2MAM A; 3OB9 A; 1YIT Q; 1TSF A; 3A8M B; 2EJF A; 1UJ0 A; 2OTL A; 2QDL A; 1Z9Z A; 1FMK A; 2HD0 A; 3CME T; 2L3S A; 4OMQ A; 3I55 T; 4O6J A; 4X1V A; 4JJN K; 3L2W A; 3TU4 K; 1VQP T; 1U8R A; 3H0I A; 3AHU A; 3E9F A; 1PKT A; 4XU2 A; 1K9A A; 4JLI A; 2JS0 A; 2K5F A; 1RAE B; 1HD3 A; 2LT4 A; 4BUG A; 5J39 A; 1Y0M A; 2KR3 A; 4C92 D; 4X34 A; 5HKC A; 2LJ1 A; 4KRT A; 5GAM f; 2HMA A; 2RJE A; 2NUZ A; 3EG9 B; 1GCQ C; 1QVG A; 2ROT A; 5GJW B; 1KD1 R; 1FWZ A; 3MEW A; 3CMA A; 4FYW B; 4JZ3 A; 5AT1 B; 2H3J A; 1SRM A; 1KQ2 A; 2PUK B; 4A53 A; 3UAT A; 4FU6 A; 1ZSG A; 4A63 B; 5KYY A; 4JZ4 A; 2CRE A; 1PSF A; 2DBK A; 4PJO F; 3VUZ A; 5FRN A; 2DIQ A; 4EPC A; 1T3L A; 1ZHI A; 1YI2 T; 2AK5 A; 2OAW A; 4BDY A; 1WHH A; 5FRM A; 2F1L A; 1QCN A; 4PJL A; 2QEX T; 4EMK A; 2HL3 A; 5IN1 A; 3JCM V; 3LYI A; 3FC3 A; 2ZPH B; 4A4E A; 1BIB A; 4BE1 A; 1JXM A; 1PWT A; 5KYX A; 1T3S A; 1B07 A; 3SB2 A; 1OV3 A; 3CCV T; 5C6S A; 4Q5W A; 2EVR A; 4MZT A; 4ELY C; 2MYS A; 1TUG B; 4LD6 A; 2CP3 A; 1VQ7 A; 1KG1 A; 2JS2 A; 1R8O B; 3RUX A; 5CQY A; 4XU3 A; 3M58 A; 1PSE A; 3JB9 F; 4HCC A; 4PJN A; 2DRK A; 1VQ5 A; 1A0N B; 2FZK B; 1YJW A; 3DKM A; 1RAD B; 1UGP B; 1WHJ A; 1PG5 B; 1OQK A; 2X4J A; 1K0X A; 3PIP A; 1U5S A; 1WLP B; 2H3E B; 1WFW A; 1VA7 A; 4A4H A; 1UGQ B; 1JO8 A; 4F17 A; 1AZE A; 4FL6 A; 3OYM A; 2JZ2 A; 4E7I A; 3OYH A; 2IG0 A; 2GNC A; 1JJ2 S; 4RTY A; 1RAA B; 4RUG A; 1Q95 G; 5GAN e; 3SFM A; 3FEO A; 1NJI R; 3EG3 A; 2CT4 A; 4J9E A; 2V8K A; 2O31 A; 1WZO A; 2MIO A; 4OP0 A; 1WDX A; 1AOJ A; 3Q1J A; 1VQM T; 3DLM A; 1K73 R; 4M7A B; 2DEU A; 2X4Y A; 4KBM B; 1WJS A; 3UF4 A; 1RAI B; 3VS0 A; 5CKD A; 3JB9 D; 1Y96 A; 4EMK C; 3OYC A; 4Z02 A; 1VQ8 Q; 2P0P A; 1RAG B; 2COW A; 2QQS A; 1NE8 A; 2F2X A; 8AT1 B; 2ROL A; 3MP6 A; 3OS0 A; 3OQ5 A; 3QHS A; 4JUV A; 2W10 A; 1KQ1 A; 2DE0 X; 4EIK A; 2I0N A; 3MKD A; 3VUB A; 5CKB A; 2EJG A; 4OGE A; 4Z8A A; 5GMK h; 2EKO A; 2J7I A; 2NUP A; 2JNG A; 1QKW A; 5CCA A; 3FIF A; 3EGX B; 4OMF B; 4M75 F; 4J9G A; 2QK0 A; 1KJW A; 5EG2 A; 3JB9 G; 2GQI A; 1GBR A; 2XK0 A; 1BU1 A; 5HK3 A; 1UJY A; 2EGC A; 2FYK A; 3URG A; 4C8Q B; 2CP2 A; 4R56 A; 2OJ2 A; 1B34 B; 1JBM A; 2FPE A; 1M2V B; 5LJ5 f; 1MMA A; 2A3L A; 1Q82 U; 2Y4X A; 2KGT A; 5J3B A; 2HZY A; 4N4H A; 1VQ4 Q; 2KVQ G; 2BZY A; 2JTM A; 3VV0 A; 1K9M R; 3JCM g; 2E41 A; 2LX9 A; 3JCM e; 1VQL Q; 2XIC A; 3C95 A; 5GAN 8; 2LC4 A; 4DBR A; 2EKH A; 1X6O A; 3EG1 A; 1PRL C; 2DL7 A; 2G3R A; 3DB4 A; 4X9C A; 2OTL Q; 2G6F X; 1RAB B; 3RMQ A; 2XID A; 3CC7 A; 2D6F A; 2DXC A; 4F04 B; 1I5O B; 3OYN A; 3PNW C; 5KYU B; 1YJ9 Q; 1VIF A; 4M75 D; 1QWE A; 2E70 A; 3I9Q A; 4PLI A; 3REB B; 2RQR A; 2KEA A; 2KDS A; 1PD0 A; 2K3X A; 4R55 A; 3CCL A; 1X2K A; 1S72 A; 1NLO C; 2A0F B; 4XTX A; 5IXB A; 1UE9 A; 1Q7Y U; 3CC2 A; 1QCO A; 2HEQ A; 1WX6 A; 2DK3 A; 3EGD B; 2LCL A; 4WCI A; 2DA9 A; 1ZQ1 A; 3CMA Q; 5GAO q; 2XD0 A; 2L2P A; 3VS2 A; 2RJD A; 5CK9 A; 1LNX A; 2DD4 A; 3I56 Q; 2FG0 A; 1ACM B; 1BBZ A; 4BY6 C; 1OPL A; 1RAH B; 1Q7Y C; 2LQ8 A; 1WA7 A; 3CC4 Q; 4LE9 A; 1WYX A; 2JTE A; 5GAN f; 3EHQ A; 3ME9 A; 1ZUY A; 1BYM A; 2F2W A; 2DL5 A; 3I5S A; 2O01 E; 2HBW A; 3I55 A; 1EFN A; 2YUO A; 1MUZ A; 1VQP A; 1KSW A; 1Q86 U; 1NLP C; 1SPK A; 2DF6 A; 3G7Z A; 2O4X A; 5KCO A; 1YIT A; 5GAN 2; 4LDW A; 2GTO A; 2K9G A; 3M0S A; 3LH0 A; 4C0D B; 4LNP A; 2QA4 T; 2FB7 A; 2RM4 A; 3TSW A; 2VV5 A; 3CCS T; 3CCU Q; 2YRC A; 4Y92 A; 1VQ7 Q; 1Q86 C; 2EYQ A; 2DZ9 A; 4XTU A; 7AT1 B; 2BUD A; 5D7U A; 1G2B A; 1CSK A; 1M30 A; 2A36 A; 1LCK A; 3QO3 A; 1BCM A; 4JDS A; 4GLM A; 2BE7 D; 3QDR B; 1YJW Q; 4QVZ A; 1NEG A; 3X20 B; 3M0U A; 5A0D A; 1PKS A; 1UFF A; 4KGV B; 4HA8 A; 4J9F A; 1WXB A; 1M1G A; 1N9R A; 2IIM A; 2KRO A; 2EGA A; 1KFZ A; 2CH4 A; 2DX1 A; 3RR6 A; 1XOV A; 1T0J A; 1OZ3 A; 4IUV A; 5GAN 5; 1PM3 A; 4M7A F; 4QQG A; 4F7U E; 4DQ2 A; 3ZEH A; 3JCM f; 1W6X A; 3UA6 A; 2FRY A; 5KYW A; 4C5I A; 4IUT A; 2BZX A; 2LNH B; 1XTD A; 4N4G A; 1Q82 R; 3WXM B; 2RF0 A; 5FU7 C; 1VQ9 T; 2K3B A; 1GL5 A; 4J7I A; 3CCQ Q; 1ZBX A; 3RDV A; 1K0S A; 2JXB A; 1K8A U; 4M7D A; 2XI9 A; 3E1S A; 2X4W A; 2FPF A; 4XU0 A; 1U06 A; 2K5I A; 2DIL A; 1M8V A; 5LJ3 j; 1M1K U; 2NYS A; 4C8Q F; 1B3Q A; 1IB8 A; 3L42 A; 2ENM A; 2MF2 A; 1D1A A; 3TEE A; 2RK2 A; 1NPR A; 1UUE A; 1AD5 A; 3HL8 A; 2FVU A; 1M90 C; 1M3C A; 3O5Z A; 4M7A D; 2I2L A; 1UTI A; 4ORZ A; 4E7K A; 2J6F A; 3DB3 A; 4ZTJ A; 2RJF A; 3L1A A; 3M59 A; 2DL8 A; 4P5N A; 2MWP A; 1UDL A; 2RK1 A; 3SEM A; 5DLO A; 1PD1 A; 3CPW S; 4J9C A; 3RMS A; 1IO6 A; 1EX4 A; 4ZGE B; 1KC8 C; 3GP8 A; 4RTT A; 4C92 A; 1JQQ A; 3QYG B; 4M7A G; 2CUB A; 2CP0 A; 3CCJ A; 1Q81 U; 4J6Y A; 3G1J A; 3QUI A; 4A54 A; 5GAN 7; 1TUC A; 1PRM C; 2YRV A; 2EYX A; 1MMN A; 2HKQ B; 2RMO A; 2KBT A; 2CUD A; 3LH5 A; 4A4F A; 1M1F A; 2QG9 B; 3CC7 Q; 2DAQ A; 2O2O A; 4C92 E; 2HBP A; 2HL5 C; 3CPW A; 3M53 A; 1Q81 C; 1YCY A; 2CZ6 B; 1WNL A; 5GAO m; 1KQS A; 1VQN Q; 1TWB A; 5GJV B; 4AT1 B; 1D09 B; 3JV3 A; 4RTW A; 2E1H A; 3CCL Q; 1W4S A; 3ER0 A; 1S72 Q; 4ELZ C; 3CC2 Q; 4QW2 A; 2PTK A; 4R0K A; 2QTV A; 1X6G A; 2FZC B; 4F7U G; 4ESR A; 2WAC A; 1Y71 A; 3HFN A; 3M4Y A; 4O5V A; 1JRI A; 2C06 A; 3OYF A; 3C4S A; 4HKE A; 2FO0 A; 4MZM A; 1QVP A; 2ED1 A; 1MND A; 2PVO B; 4PLL A; 5DLQ E; 3L2Q A; 2KNB B; 3AT1 B; 4LXC A; 1VQK A; 3QZ9 B; 2LTO A; 1IHW A; 2DET A; 2LT1 A; 2CP5 A; 2FRW A; 2P4T A; 1F1B B; 5I2M A; 3MEV A; 4M77 B; 1I0C A; 1GRI A; 1VQ4 A; 2B86 A; 2DFU A; 3CCM A; 3P8D A; 1UG1 A; 3HRS A; 3I55 Q; 1HYO A; 1BKB A; 1VQL A; 4DA4 A; 4FM4 B; 1VQP Q; 5ECA A; 3LGL A; 1QKX A; 2GF7 A; 4VUB A; 2CP6 A; 4C92 C; 2M16 A; 1LOJ A; 1VQO T; 4NL2 A; 3OSV A; 2PQW A; 2KMT A; 2XDP A; 1YIJ A; 3M57 A; 3X24 B; 1U3O A; 5EC7 A; 1K8A R; 2HDA A; 4J9H A; 4PJO E; 1QVF P; 1FX7 A; 1YJ9 A; 2EW3 A; 4B6M A; 4HVU A; 2AIR B; 2F5T X; 3CXC S; 2ZCF B; 1D0X A; 1QCF A; 1NJI C; 3OS1 A; 1UB4 A; 4ZGD B; 1HK9 A; 2FPD A; 3L2U A; 2DVJ A; 3LWH A; 3FDR A; 3I5R A; 2X9H A; 1O9S A; 1P92 A; 3OW2 P; 1D0Y A; 5GMK m; 1GFD A; 3RER A; 1UEC A; 5DM7 R; 3CD6 T; 1DJ7 B; 4QVD A; 4FCY A; 1YI2 Q; 2AKK A; 4NL3 A; 2A37 A; 3I56 A; 1C0M A; 2DLP A; 2DEQ A; 2YUP A; 4Z89 A; 1GFC A; 1PC0 A; 4LDX A; 2VVK A; 4C5G A; 1HJD A; 4PK4 A; 4CC2 A; 2VXE A; 3CXC A; 1K76 A; 3CC4 A; 3JB9 J; 5LJ5 g; 2QQA A; 5GMK l; 1Z9Q A; 4OF1 A; 1GBQ A; 3KBG A; 4C92 G; 5LJ5 e; 5GAO p; 3CCE A; 4C0F A; 3FB9 A; 5CR2 A; 1W2B S; 5LJ3 d; 2O9V A; 4XQ3 A; 4AFZ C; 1OI1 A; 2NUP B; 5IT9 E; 1VQ6 A; 3E19 A; 5D6Y A; 5GAM j; 4BAC A; 4J6X A; 3EFR A; 4QKU A; 2C0O A; 2YLC A; 1AEY A; 2K4Y A; 1IZ6 A; 2FHD A; 2K3Y A; 2A7Y A; 1ZSZ A; 2MMP A; 4HCB A; 2DKG A; 3LLR A; 4HVV A; 3CCU A; 3MET A; 4A4G A; 3NFC A; 2DRM A; 2C0T A; 4E7L A; 1YNZ A; 3VS1 A; 1W2B A; 4II1 A; 2E12 A; 3G71 A; 4KUD K; 3MEU A; 3G4S T; 2EQM A; 2RNA A; 3CBM A; 1EIF A; 1N27 A; 3CCR A; 4PJM A; 2RI5 A; 4WTO B; 1X01 A; 4C5E A; 2CZ1 B; 1LVK A; 3A8L B; 2OI3 A; 1FYN A; 1OX9 A; 2RHI A; 4PJO D; 5L8R E; 4Y91 A; 1X75 C; 3I35 A; 4M75 A; 2XU8 A; 4IUR A; 4DOV A; 5I22 A; 1ZLM A; 4V2S A; 3OYD A; 5KE3 A; 3M0P A; 2K7A A; 4ZTF A; 1VQ9 A; 1KK7 A; 2YDL A; 2EGE A; 2EWN A; 1X43 A; 1VQM Q; 2KE9 A; 2WSE E; 3QDF A; 2OTJ A; 2LX7 A; 3MEA A; 1M9S A; 3QWY A; 4E47 A; 3QKJ A; 1QWF A; 3CCJ Q; 1PHT A; 3PVQ A; 4J5Y A; 1YHQ T; 4M78 B; 4PKC C; 5GAN g; 2NUT B; 3THK A; 4FT2 A; 4M75 E; 2GFU A; 2XKO C; 4WF2 A; 3JCM X; 4PJO G; 5FU6 B; 5I21 A; 3CCQ A; 1WHL A; 3M56 A; 5GMK e; 2KQW A; 2JM8 A; 2YRD A; 3MO8 A; 2KXC A; 2X4X A; 4FYY B; 2Z0W A; 2CDT A; 4QVC A; 2O88 A; 3EFO B; 1QVF S; 2GGR A; 2CGH A; 4LD9 K; 1C6V X; 1JJ2 A; 3EG2 A; 4XK8 E; 1G3W A; 3EG9 A; 1BK2 A; 1M3B A; 3INZ A; 3LW5 E; 4IUP A; 4OVA A; 2CYZ B; 5KH6 A; 1V1C A; 3JCM J; 2LJ3 A; 1QMC A; 1ZSZ C; 2KI7 A; 4OB3 B; 2LCS A; 1XJW B; 5D6W A; 4N4I A; 2DYI A; 2RI3 A; 1E6G A; 4M77 F; 1UGS B; 4KH0 B; 2KY9 A; 3OW2 S; 1YJN A; 2CT3 A; 3GPL A; 2YLB A; 2E6Z A; 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4PFO A; 4CC3 A; 1H3Z A; 4OMN A; 1TXQ A; 5C0M A; 4DBH A; 1SHG A; 3NTH A; 4N0A A; 3UWN A; 2E64 A; 4M7A E; 5CVI A; 3CMA T; 3SHW A; 4FSX A; 2LZ6 B; 1AWO A; 2D9T A; 2F5K A; 3J80 E; 3CEY A; 4KH1 B; 2BZ8 A; 3EH2 A; 4OB0 B; 3EGX A; 3LGF A; 4QQD A; 2YWW A; 2LNV A; 3BDL A; 2QAZ A; 1U1S A; 3G71 Q; 2PUO B; 5KCH A; 4Z88 A; 5GAN j; 2R5M A; 3CCR Q; 2RQU A; 3EG0 A; 2Y90 A; 2J6O A; 1B34 A; 3V7R A; 4F7U A; 3TSZ A; 1M2V A; 1G3S A; 4M78 F; 1GCP A; 4J7F A; 4CC4 B; 2RA2 A; 2P0Q A; 3RKW A; 1CKB A; 2HQH A; 4FW1 A; 2DTO A; 1X69 A; 1VQ9 Q; 1YI2 A; 1Y07 A; 4C8Q E; 1M4Z A; 1QLY A; 1IRE B; 4GBQ A; 4PFZ A; 4B9W A; 4AFS C; 2QEX A; 3PE0 A; 1XQH A; 2K57 A; 4JJB A; 2OTJ Q; 1ABQ A; 1YN8 A; 4RKU E; 3TCJ A; 3KUF A; 1RAF B; 2YUN A; 4RCC A; 3RKY A; 5CKF A; 3PIO A; 4IKF A; 4RTV A; 4FIB A; 4L6V 5; 2EAY A; 4J9B A; 4XTY A; 3CCV A; 3G6E T; 2KSS A; 1R0C B; 1VQ5 T; 1M3A A; 1YJW T; 3JCM Q; 4M7A C; 1OOT A; 2XG8 D; 2QGF B; 4MML A; 2ABL A; 1N8R U; 2M0O A; 3JCM b; 3QBY A; 4FSS A; 3G4S A; 1M90 U; 4X9D A; 2V1R A; 4RTZ A; 3CPF A; 4M78 D; 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