The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
63
|
structure length |
63
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Chain Sequence |
PEVPFKVVAQFPYKSDYEDDLNFEKDQEIIVTSVEDAEWYFGEYQDSNGDVIEGIFPKSFVAV
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of Yeast BBC1 SH3 domain, triclinic crystal form
rcsb |
| molecule tags |
Contractile protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| molecule keywords |
Myosin tail region-interacting protein MTI1
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| total genus |
14
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| structure length |
63
|
| sequence length |
63
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-05-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2F2X A; 3UAT A; 3VS2 A; 2OJ2 A; 2D8H A; 1KSW A; 4A63 B; 1UTI A; 2L3Q A; 1WXB A; 2XMF A; 2A28 A; 2CT3 A; 1U5S A; 2DBK A; 2J6F A; 5GJV B; 1M3B A; 2LP5 A; 1K1Z A; 2RMO A; 1M3C A; 2CSI A; 4HXJ A; 1RUW A; 1OV3 A; 2EYW A; 1SRM A; 2KXD A; 2AZS A; 4OMM A; 1KIK A; 2BZ8 A; 4M4Z A; 1Y0M A; 1QKX A; 3H41 A; 1PNJ A; 2L0A A; 2RN8 A; 1FMK A; 4J9F A; 1VYV A; 2ABL A; 2LJ0 A; 1PRL C; 4EIK A; 2YUN A; 2LCS A; 1I0C A; 3GBQ A; 3ULR B; 1E7O A; 4OMN A; 1WIE A; 1AEY A; 2DLP A; 2C0T A; 2LJ1 A; 1PHT A; 3JV3 A; 4AG1 C; 2A37 A; 4OMP A; 1ZUU A; 2EBP A; 3VS1 A; 1UEC A; 1JO8 A; 1JEG A; 1Z9Z A; 2CUB A; 1UHF A; 1YWO A; 2DF6 A; 3UA7 A; 4R0K A; 2DL7 A; 2FPE A; 2DL8 A; 4KRT A; 1ZSG A; 2L3P A; 2BTT A; 1RI9 A; 1NG2 A; 2K7A A; 1LCK A; 3RBB B; 1AWX A; 4K11 A; 1OOT A; 3REA B; 1ABQ A; 4J9H A; 2JS2 A; 1SEM A; 1GBR A; 2SRC A; 2D0N A; 1GFD A; 1U06 A; 2FG0 A; 1JXM A; 3EG1 A; 4Z8A A; 2KYM A; 5IHI A; 1WXU A; 2K79 A; 3TVT A; 3VS5 A; 4JJC A; 3SEM A; 2FRY A; 3H0F A; 1N5Z A; 4QT7 A; 1M3A A; 2EW3 A; 1TG0 A; 2KRN A; 1X27 A; 2L3S A; 3CQT A; 1YNZ A; 1UFF A; 4RTV A; 3VS6 A; 2DRM A; 2YSQ A; 3M0T A; 4F16 A; 1PKT A; 2W10 A; 1HJD A; 4J9B A; 3C0C A; 1AD5 A; 1GCQ C; 1T0H A; 1AZE A; 2CSQ A; 2JM9 A; 4D8D A; 2KE9 A; 2YDL A; 4DEX A; 3I5S A; 1A0N B; 3IQL A; 4CC2 A; 2YUO A; 4OML A; 2NWM A; 2O9V A; 2YT6 A; 4LUE A; 3I9Q A; 1J3T A; 4CC4 B; 1BK2 A; 4J9D A; 2EGE A; 2JT4 A; 1QKW A; 2CDT A; 2M0Y A; 2NUZ A; 3NMZ C; 2YUP A; 4Y92 A; 1ABO A; 5HCK A; 4ORZ A; 1K0X A; 2O9S A; 2KYB A; 3U23 A; 5ECA A; 3VRZ A; 2J7I A; 3NPF A; 2J05 A; 4CC3 A; 1AWO A; 1AOJ A; 2EPD A; 2LX7 A; 2DRK A; 4OMQ A; 2JXB A; 3TSW A; 1MUZ A; 1SHG A; 2C0O A; 2RQW A; 2X3W D; 2JW4 A; 2K6D A; 2GGR A; 2KRM A; 4GBQ A; 2O2O A; 2RQU A; 1AWJ A; 1GRI A; 5I22 A; 2K2M A; 1JU5 C; 2O31 A; 2KRS A; 2ESW A; 4ESR A; 3NHN A; 4WCI A; 1TUD A; 2B86 A; 2CH4 W; 2EGC A; 1W6X A; 1W70 A; 4LUD A; 1OEB A; 2KNB B; 4D8K A; 1WLP B; 4HVV A; 1GFC A; 2LQW A; 3UF4 A; 4F17 A; 2VKN A; 2SEM A; 2CH4 A; 4IIM A; 2DL5 A; 1U3O A; 4HVW A; 3H0H A; 4OMO A; 2F2V A; 1SPK A; 3ZL7 C; 3QWX X; 2F2W A; 2EGA A; 1NEB A; 3EG3 A; 3O5Z A; 4LE9 A; 3I35 A; 4JZ4 A; 1GBQ A; 2YUQ A; 3VRY A; 4X1V A; 2DNU A; 1KFZ A; 2DJQ A; 5L23 A; 1UJ0 A; 4JZ3 A; 1YP5 A; 2HEQ A; 1ARK A; 2A36 A; 1ZX6 A; 1X2Q A; 2DE0 X; 1HD3 A; 2LNH B; 2LQN A; 3RNJ A; 1AZG B; 2GTO A; 2DVJ A; 1GL5 A; 2ROT A; 2DM1 A; 2JMC A; 2FRW A; 1X6G A; 2W0Z A; 3TSZ A; 1WI7 A; 1RLQ C; 1NYG A; 2AKL A; 4J9I A; 2PZ1 A; 3H0I A; 1QWF A; 1YN8 A; 4HVU A; 2E5K A; 2IIM A; 1ZUY A; 1M30 A; 1QWE A; 2D8J A; 1UDL A; 1PKS A; 2DYB A; 1UJY A; 1X6B A; 2J6K A; 2JS0 A; 2EYY A; 2J6O A; 3VS4 A; 1SRL A; 1X69 A; 4JJD A; 2D1X A; 3THK A; 4AG2 C; 4RTU A; 2VWF A; 1H92 A; 4RUG A; 1FYN A; 2CUD A; 1V1C A; 2JM8 A; 1GCP A; 2G6F X; 2BZX A; 4JJB A; 1TUC A; 2X3X D; 1G83 A; 1BBZ A; 3SHW A; 1X2K A; 2KRO A; 1S1N A; 1UG1 A; 1MV0 B; 1NLO C; 3EG2 A; 1MV3 A; 5I11 A; 2DIL A; 2HBW A; 5IH2 A; 1ZUK A; 2MIO A; 1WDX A; 4J9C A; 2KT8 A; 2FO0 A; 2KBT A; 5FW9 A; 2CT4 A; 4LN2 A; 3KFV A; 4Z88 A; 1H8K A; 2GTJ A; 1GCQ A; 3QWY A; 1JQQ A; 2L2P A; 4F14 A; 2C0I A; 2RPN A; 2EYZ A; 2MOX A; 1VYU A; 1K4U S; 2RQT A; 2AZV A; 4J9G A; 2OI3 A; 2K9G A; 2EKH A; 1QLY A; 2KT1 A; 4ZNX A; 2K3B A; 1ZLM A; 1VA7 A; 2KXC A; 3VS7 A; 1B07 A; 1H3H A; 1YCS B; 1M27 C; 1NYF A; 4AFS C; 2RF0 A; 2KR3 A; 4RTY A; 2RQV A; 2ROL A; 1CKA A; 2LJ3 A; 1M8M A; 4AFQ C; 3M0S A; 4Z89 A; 2KGT A; 1PWT A; 1K9A A; 1K76 A; 4CC7 A; 1NM7 A; 1KJW A; 5IXF A; 2EQI A; 1NEG A; 1SSH A; 2ENM A; 2DX1 A; 2FEI A; 2ED0 A; 2AK5 A; 2PNI A; 3LH5 A; 1AVZ C; 3EG0 A; 4FSS A; 1WA7 A; 2EVR A; 3UA6 A; 1HSQ A; 2V1R A; 1CSK A; 2EYX A; 2BZY A; 1B3Q A; 1PRM C; 1BB9 A; 1UE9 A; 4JPB W; 3EGU A; 2GNC A; 4RTW A; 3VS3 A; 3NGP A; 1VYT A; 1UHC A; 1W1F A; 3EHR A; 2AKK A; 3I5R A; 4RTT A; 2DA9 A; 2DL4 A; 2J06 A; 2M51 A; 2V1Q A; 1WX6 A; 2FPF A; 4HCK A; 5EC7 A; 4DEY A; 1IO6 A; 3R6N A; 1SHF A; 2ECZ A; 1UUE A; 1OPL A; 2MCN A; 1YWP A; 2HCK A; 4J9E A; 4RTX A; 2A08 A; 2RQR A; 2LMJ A; 1G2B A; 2OAW A; 1E6G A; 2VVK A; 3PVL A; 3REB B; 1RLP C; 2LZ6 B; 1I07 A; 3M0P A; 4GLM A; 1K0S A; 2QDL A; 3FJ5 A; 1T0J A; 2H8H A; 2JTE A; 4LNP A; 4AFZ C; 1WYX A; 1T3S A; 1AWW A; 1JXO A; 1I1J A; 2DBM A; 2ED1 A; 1Y57 A; 5GJW B; 2CRE A; 2KEA A; 1T3L A; 2DMO A; 3M0Q A; 2GQI A; 1NLP C; 2FPD A; 5IHK A; 3A98 A; 5FWC A; 4IIO A; 2I0N A; 2RNA A; 1QCF A; 1CKB A; 2DL3 A; 3M0R A; 3M0U A; 1X43 A; 1UGV A; 2P4R A; 2HSP A; 1OPK A; 2GBQ A; 4AFU C; 4E6R A; 5FWB A; 1EFN A; 5IHN A; 1XOV A; 2HDA A; 1BU1 A; 1WFW A; 5IXB A; 2PTK A; 3PVQ A; 4RTZ A; 1WXT A; 1ZBJ A; 3PE0 A; 2JMA A; 3EHQ A; 1Z9Q A; 2O88 A; 3VS0 A; 1E6H A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1G3W A; 1U8R A; 1I4K 1; 1KSW A; 4N0A A; 4A63 B; 2E70 A; 5DLQ E; 2QG9 B; 1FXX A; 4JRQ A; 3OYH A; 2HQX A; 2RMO A; 1ZA2 B; 2CSI A; 2DZ9 A; 3UWN A; 1Q81 C; 4J83 A; 2QI2 A; 2EYW A; 2M02 A; 2AZS A; 1OUL A; 3SWN A; 1NPR A; 1Q81 R; 1Q82 U; 3I56 Q; 1YJN A; 1QKX A; 1IRX A; 4KUL A; 1H64 1; 4J9F A; 1OYX A; 1VQL Q; 2ABL A; 3PIO A; 5GAN e; 3LYI A; 2LCS A; 4BI8 B; 3CCE Q; 1I0C A; 4OMN A; 4MMK A; 3A8G B; 5HKC A; 1K73 C; 1P92 A; 4B6M A; 5LJ5 f; 1K73 R; 1JO8 A; 2RI5 A; 5LJ5 j; 3PMT A; 1UHF A; 4M77 F; 5GAO r; 1YWO A; 2DAQ A; 2DF6 A; 3UA7 A; 2BTT A; 3CMA T; 4HKE A; 9ATC B; 2K7A A; 3RBB B; 2VAS A; 5CCA A; 2ZPE B; 1AHJ B; 3CCQ A; 1D09 B; 2M0O A; 3M56 A; 4M7D D; 1K8A U; 3CBM A; 2D0N A; 5AT1 B; 1GFD A; 2FG0 A; 4NL3 A; 1JXM A; 1KQS A; 4Z8A A; 1WXU A; 1KD1 U; 2GQV A; 1K8A C; 1JJ2 A; 4HT9 A; 4M7A A; 4M78 A; 3R6O A; 3MKD A; 1K8A R; 5M9O A; 4ZGD B; 1TG0 A; 5DLO A; 2HQH A; 1KD1 C; 4WF2 A; 2QXF A; 3M4G A; 3CQT A; 1VOM A; 1YNZ A; 3CBP A; 5CKE A; 3VS6 A; 3M55 A; 3OW2 A; 3E19 A; 4F16 A; 2NUP B; 1AZE A; 2JM9 A; 4D8D A; 2KE9 A; 2YDL A; 3KBG A; 3JCM P; 1TOV A; 4J6Y A; 1A0N B; 1VQ8 T; 2YUO A; 2MMP A; 2YLC A; 1JBM A; 2HL5 C; 1VQL T; 3OYE A; 1J3T A; 4FYW B; 2E6N A; 4J9D A; 3CCE T; 2R58 A; 2M0Y A; 3FC3 A; 2FHD A; 4BY6 C; 1SSF A; 5CQX A; 4MZT A; 4OMF B; 3ASK A; 2R57 A; 2J7I A; 3MET A; 2OAU A; 1NZ9 A; 5GMK h; 2Y90 A; 1R8O B; 1AOJ A; 2EPD A; 2COZ A; 4RKU E; 1D0X A; 2RHZ A; 3LGF A; 2EQK A; 1GRI A; 1I8F A; 4PL6 A; 2ATC B; 2O31 A; 2AT1 B; 1RL2 A; 2KRS A; 4QQ6 A; 3NHN A; 2CH4 W; 2B86 A; 2EGC A; 2CGH A; 1I5O B; 1ZBX A; 2XDD A; 5CKH A; 2KNB B; 4C92 A; 4M75 B; 1WHH A; 2F1L A; 4M7A E; 2LQW A; 4M78 E; 3UF4 A; 1QVF S; 2DD4 A; 2QTX A; 3BDU A; 4IIM A; 3JCM X; 2DL5 A; 4M77 G; 1TS9 A; 1RAF B; 1SPK A; 1YHQ T; 3ZL7 C; 3QWX X; 2F2W A; 5HK0 A; 1WGS A; 2EGA A; 2GFU A; 1EX4 A; 3QDF A; 3CXC P; 2RI3 A; 2P4T A; 1GBQ A; 3INZ A; 1BI2 A; 2E5Q A; 3E9G A; 2YUQ A; 4JZ4 A; 3JCM Q; 3A1P A; 1V76 A; 4X1V A; 3AHU A; 2E64 A; 2KVQ G; 3OYJ A; 1VQ8 A; 5FRO A; 2HEQ A; 3GNG A; 1YFN A; 1X2Q A; 2DE0 X; 1HD3 A; 2ZPH B; 5KYN A; 4PJO F; 2ROT A; 2OTL Q; 2RJE A; 2FRW A; 2A3L A; 3G6E Q; 1NJI U; 2W0Z A; 1RAB B; 1WI7 A; 4C0Z A; 3H0I A; 4ZN3 A; 4KUD K; 3EGX A; 3SWN B; 2IIM A; 2D8J A; 1QCN A; 3VUB A; 1PKS A; 1ZSZ C; 2EYY A; 2G3R A; 2QGF B; 1SRL A; 4JJD A; 4L5G A; 3THK A; 3OYN A; 3CEY A; 2HAX A; 1HXD A; 4XU1 A; 4KH0 B; 5GAN 5; 1FYN A; 4N4I A; 4NOY A; 4QQG A; 2P0Q A; 1GCP A; 5LJ3 g; 3CME A; 1YJ9 A; 3L2Z A; 3QUI A; 4E7I A; 4OB0 B; 1XNI A; 2CP3 A; 4JJN K; 1X2K A; 3CD6 Q; 2RHX A; 3RKW A; 3V8K A; 1D3B A; 1S1N A; 4DOV A; 1PSF A; 1RAD B; 2RJF A; 4DOW A; 1VQ4 Q; 4F7U F; 1G8X A; 5KYU A; 3UPU A; 1QP2 A; 2CZ0 B; 4J7I A; 5C6S A; 4J9C A; 2KBT A; 4E7K A; 1YHQ A; 4LN2 A; 2KSS A; 3H6Z A; 2X51 A; 1SF9 A; 1QVG S; 2RHY A; 4XQ3 A; 2L8D A; 1Y7X A; 1YJW A; 1K4U S; 3CPF A; 2RQT A; 2AZV A; 2YLB A; 4M7A B; 1VIF A; 2EKH A; 3I55 A; 1ZLM A; 2E6Z A; 2KXC A; 1H3H A; 1YCS B; 3TCJ A; 3EFR A; 1NYF A; 5CKF A; 4RTY A; 3ZBD A; 3G6E T; 8ATC B; 3NTK A; 2EFI A; 2LJ3 A; 1M8M A; 4C5G A; 4QW2 A; 1PWT A; 1K9A A; 4OGE A; 2COW A; 1D0Z A; 3CCV Q; 2DVE A; 1K76 A; 1TXQ A; 4PJL A; 1KJW A; 3BFM A; 3PGG A; 3QO3 A; 4C5I A; 1WHG A; 1LNX A; 1MND A; 4A54 A; 3RR6 A; 2BUD A; 3UA6 A; 4KUI A; 1HSQ A; 1CSK A; 5KYW B; 4NS5 A; 1K9M U; 3JSC A; 1BB9 A; 3EGU A; 2Z0W A; 3VS3 A; 1BIB A; 4RCC A; 1UHC A; 4MDX A; 4PJO G; 3CD6 T; 5C0M A; 2DL4 A; 2J06 A; 2M51 A; 1YIJ Q; 3MCA B; 3HRU A; 1FWZ A; 4FL6 A; 1VQM A; 1IO6 A; 1M1F A; 3CCS T; 5LJ3 h; 2QDY B; 2ECZ A; 2CP2 A; 4M7A D; 2HCK A; 4J9E A; 4M78 D; 2A08 A; 2RQR A; 4JDS A; 3CCL A; 3RIR A; 3HFO A; 3REB B; 3CPW A; 3CCR T; 3CC4 Q; 2DER A; 1RLP C; 2LZ6 B; 2DXU A; 1TTH B; 2K5L A; 3FB9 A; 4LDY A; 1VQ5 T; 1NPP A; 3FJ5 A; 4C92 B; 3GP8 A; 2H8H A; 1LVK A; 2DK3 A; 2WSF E; 2LC4 A; 4C8Q A; 4C0G A; 1WYX A; 1T3S A; 3CCM A; 5GJW B; 2KEA A; 1YIT A; 1T3L A; 2QEX Q; 1KQS S; 3OSS C; 5IHK A; 1U1T A; 4F7U G; 1S72 Q; 1TUG B; 1TH7 A; 2PU9 B; 4M77 A; 5CQY A; 1LOJ A; 3CCV T; 2BE9 B; 2QK0 A; 1VQK Q; 4RTZ A; 1PG5 B; 1M90 C; 3OYY A; 3EHQ A; 1Q86 U; 2O88 A; 1R77 A; 3P8H A; 3JB9 D; 2AIR B; 2QQS A; 1W2B A; 5DY9 A; 3UAT A; 1M90 R; 2OJ2 A; 2QQB A; 4XTV A; 4ZGE B; 1UTI A; 2M16 A; 1WXB A; 3VJP A; 1OI1 A; 1Q95 G; 2QGG A; 2DBK A; 2J6F A; 3X28 B; 1RAA B; 2LP5 A; 2DXB A; 1YIJ T; 1OV3 A; 2KXD A; 4OMM A; 2RK2 A; 1KIK A; 3VKI A; 2KI7 A; 4JS5 A; 1Y71 A; 1NBE B; 2BZ8 A; 3EGX B; 1VQ6 A; 3H41 A; 3VUZ A; 1IZ6 A; 1SG5 A; 2L0A A; 1FMK A; 2RN8 A; 3TRE A; 1VYV A; 3DLM A; 3CCS A; 4EIK A; 2YUN A; 3GBQ A; 1E7O A; 1YBY A; 2K57 A; 4X34 A; 1PC0 A; 3CC4 T; 2C0T A; 4FW1 A; 1PHT A; 1IHW A; 2DET A; 4QKU A; 2IG0 A; 2EBP A; 2XID A; 1UEC A; 4R56 A; 3QBY A; 4RCB A; 3CCR A; 1D1B A; 2CUB A; 3CC7 Q; 3CXC A; 2L3R A; 4C8Q E; 4KGZ B; 4R0K A; 3BDL A; 2FPE A; 3JAM E; 1VQ5 A; 3HPW A; 1D3B B; 1PM3 A; 1DJ7 B; 4OB1 B; 3CC2 A; 3TU4 K; 1RI9 A; 4E2F B; 1B34 A; 4BE2 A; 1MMN A; 1LCK A; 1AWX A; 1RAE B; 3JCM b; 5FRM A; 4QQD A; 5KYU B; 1S72 T; 3VYH B; 3G71 Q; 2JS2 A; 1VQ7 A; 4M77 E; 1GBR A; 1WHM A; 2CZ6 B; 2ZCF B; 2RM4 A; 3EG1 A; 4O6J A; 1VQK T; 3TVT A; 3SEM A; 1UGR B; 4QT7 A; 3JRZ A; 1M3A A; 2DEQ A; 2EW3 A; 1KHI A; 2XDP A; 4MML A; 2RO0 A; 2RK1 A; 1TSF A; 3P8B B; 1Y96 A; 3EG9 B; 1UFF A; 2EWN A; 4BAC A; 2DRM A; 1PKT A; 4LD6 A; 5GAN g; 3C0C A; 2P0P A; 5GAM e; 1GCQ C; 4HA8 A; 1T0H A; 2MWO A; 2EKO A; 1C0M A; 2X4W A; 1D0Y A; 2XK0 A; 3CCJ Q; 3OYB A; 4DEX A; 3I5S A; 5KYY A; 2LT1 A; 2GFA A; 3M9Q A; 4ME7 A; 2O9V A; 2ZAE A; 2YT6 A; 4BDZ A; 1N8R C; 3DB4 A; 3I9Q A; 2NUT A; 2ZPB B; 1N8R R; 2CZ1 B; 2JT4 A; 4IUT A; 2CDT A; 1TWB A; 2E10 A; 3OB9 A; 2YUP A; 4Y92 A; 4ORZ A; 3V7R A; 1K0X A; 2YRD A; 2FYK A; 3VRZ A; 4M7D B; 2XHC A; 1Q81 U; 5CKD A; 4IUP A; 2YWW A; 4CC3 A; 3OYC A; 1VQ9 A; 1OZ2 A; 3PNW C; 1AWO A; 4DQ2 A; 3PIP A; 2YRC A; 4OP0 A; 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