The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
TFKSAVKALFDYKAQREDELTFTKSAIIQNVEKQDGGWWRGDYGGKKQLWFPSNYVEEMIN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of of the SH3 domain of phospholipase C Gamma-1
rcsb |
| molecule tags |
Hydrolase
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| source organism |
Rattus norvegicus
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| molecule keywords |
1-phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate phosphodiesterase ga
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| total genus |
13
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| structure length |
61
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| sequence length |
61
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| ec nomenclature |
ec
3.1.4.11: Phosphoinositide phospholipase C. |
| pdb deposition date | 2004-11-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1BB9 A; 3M0Q A; 2AZV A; 5FWB A; 1GBR A; 2EYY A; 2LCS A; 4F14 A; 1S1N A; 4OMO A; 3VS7 A; 3UA6 A; 2BZY A; 2W0Z A; 4RTX A; 2YUO A; 5IH2 A; 4D8K A; 1JXM A; 2YT6 A; 2A36 A; 1VYV A; 2VWF A; 1NYG A; 1YNZ A; 2GGR A; 1X2K A; 2JS2 A; 2VKN A; 4J9D A; 2LP5 A; 2GTJ A; 2ESW A; 3VS4 A; 2L0A A; 1CKA A; 1A0N B; 2RNA A; 1TUC A; 2C0T A; 1H92 A; 2JT4 A; 1ARK A; 2FEI A; 4Z89 A; 2DF6 A; 2KE9 A; 2HSP A; 1V1C A; 2ABL A; 4RTU A; 4GBQ A; 2EKH A; 1T3S A; 3I5S A; 1WA7 A; 1GCQ A; 2JS0 A; 2DL5 A; 1UJY A; 2HBW A; 2DL4 A; 2EPD A; 2J7I A; 1X27 A; 1VYT A; 5HCK A; 1OPK A; 1U5S A; 2MCN A; 1PRM C; 2BZ8 A; 2FPE A; 1ZX6 A; 1ZSG A; 2M51 A; 1WFW A; 2CT4 A; 4D8D A; 1K76 A; 2D1X A; 1AWJ A; 1N5Z A; 2KGT A; 1UGV A; 2PTK A; 1PWT A; 1HD3 A; 4J9I A; 3EGU A; 2C0O A; 2YSQ A; 3H0I A; 1E6G A; 1B07 A; 1ABO A; 2CT3 A; 2EVR A; 2ENM A; 1AD5 A; 1WYX A; 2FRW A; 2RQW A; 4LE9 A; 2D8J A; 1NYF A; 3ZL7 C; 2DA9 A; 2K2M A; 1W6X A; 1WDX A; 2AK5 A; 2A28 A; 4OML A; 1YCS B; 1OOT A; 2CSI A; 2L3S A; 2FG0 A; 2CUD A; 2O31 A; 1CKB A; 2GTO A; 1HJD A; 2LJ3 A; 1PKS A; 1H3H A; 1QWF A; 1M3A A; 3M0P A; 1QCF A; 2CH4 W; 3I35 A; 1RUW A; 1I1J A; 1OV3 A; 1QLY A; 2DM1 A; 2IIM A; 3REB B; 3ULR B; 3M0S A; 3QWX X; 3M0U A; 1AOJ A; 4RTZ A; 2K7A A; 2K3B A; 1UE9 A; 2LQN A; 4RTT A; 3I9Q A; 3EG2 A; 1TUD A; 2YUQ A; 2NWM A; 5GJV B; 4LUE A; 3THK A; 4HVU A; 2D8H A; 2X3X D; 2KRN A; 2L2P A; 2DVJ A; 2F2W A; 1UFF A; 3UAT A; 4AFQ C; 2E5K A; 1PHT A; 1NG2 A; 4KRT A; 4CC2 A; 2DBM A; 2DJQ A; 1KFZ A; 1MUZ A; 2LMJ A; 1T0J A; 2DIL A; 4HXJ A; 1E6H A; 4LN2 A; 1NLO C; 2ROT A; 1WXB A; 1GCP A; 1XOV A; 2EGC A; 3NPF A; 3JV3 A; 2EYX A; 2W10 A; 1TG0 A; 1MV3 A; 2FRY A; 4OMP A; 1QWE A; 1GL5 A; 2LJ1 A; 4F17 A; 2J6O A; 2CSQ A; 2QDL A; 5FW9 A; 2PNI A; 2LX7 A; 2HDA A; 4A63 B; 2AKL A; 1M3C A; 2LZ6 B; 2K9G A; 1M30 A; 2RF0 A; 3QWY A; 3RNJ A; 1SEM A; 3CQT A; 1NEB A; 3RBB B; 1YWP A; 2KT8 A; 2DLP A; 2DRM A; 2KBT A; 4LNP A; 1I0C A; 4R0K A; 2F2X A; 1UEC A; 3GBQ A; 4RUG A; 3R6N A; 2EYZ A; 2KRS A; 1I07 A; 2KT1 A; 4IIO A; 1Z9Z A; 1LCK A; 2GQI A; 2PZ1 A; 1UTI A; 1YWO A; 2OI3 A; 4J9G A; 4LUD A; 2FPF A; 2JTE A; 1K9A A; 2OAW A; 1T3L A; 3VRZ A; 4ORZ A; 2KRO A; 2KXC A; 1UG1 A; 2DRK A; 1KJW A; 4JZ3 A; 1RLP C; 4CC4 B; 1SRL A; 1BU1 A; 1BK2 A; 4DEY A; 1K1Z A; 1YP5 A; 2RN8 A; 1U06 A; 2AZS A; 2F2V A; 1FMK A; 3PVQ A; 4GLM A; 3FJ5 A; 1K0S A; 2DL7 A; 2RMO A; 2P4R A; 2SRC A; 5GJW B; 1PKT A; 4RTW A; 2DX1 A; 2AKK A; 2YUP A; 2EGE A; 3PE0 A; 1JQQ A; 2D0N A; 1X6B A; 2RQU A; 1PNJ A; 3TVT A; 2ED1 A; 1ZBJ A; 4JJB A; 3U23 A; 1WI7 A; 2ED0 A; 2XMF A; 4M4Z A; 2RPN A; 1QKX A; 2J06 A; 2L3Q A; 1M27 C; 1OPL A; 3H0H A; 1ZUU A; 3NGP A; 1G83 A; 4OMM A; 2L3P A; 1NLP C; 4OMN A; 4AG1 C; 2YUN A; 4IIM A; 4Z8A A; 3EG1 A; 3NMZ C; 2B86 A; 1J3T A; 1WIE A; 1H8K A; 1K0X A; 2GNC A; 3SHW A; 4JJD A; 4RTV A; 3C0C A; 3A98 A; 4OMQ A; 1GRI A; 2RQT A; 1GBQ A; 4WCI A; 4Z88 A; 2I0N A; 1M3B A; 2FPD A; 3TSW A; 2DE0 X; 5IXF A; 1AVZ C; 3VS2 A; 3M0R A; 1JXO A; 2JM9 A; 1X6G A; 1K4U S; 1NEG A; 1ZLM A; 1HSQ A; 2ECZ A; 1W70 A; 2FO0 A; 3O5Z A; 2KNB B; 1RI9 A; 1W1F A; 1UUE A; 2J6F A; 2JW4 A; 4HCK A; 2BTT A; 2JMC A; 2K79 A; 5FWC A; 1CSK A; 1VA7 A; 2BZX A; 2RQV A; 1JO8 A; 1U3O A; 5EC7 A; 2O9S A; 4ESR A; 3PVL A; 1GFD A; 1QKW A; 2OJ2 A; 1SRM A; 4JZ4 A; 3EHR A; 2O9V A; 4J9F A; 2KYM A; 1WXT A; 3VS6 A; 2RQR A; 1ZUK A; 3M0T A; 1GFC A; 2MIO A; 1UDL A; 2O2O A; 4J9C A; 4CC7 A; 4CC3 A; 1G2B A; 1VYU A; 1PRL C; 2JXB A; 2KXD A; 3VS0 A; 2CRE A; 1JU5 C; 5IHK A; 2HCK A; 3EHQ A; 3H41 A; 2CUB A; 5I11 A; 2DMO A; 1WXU A; 1UHC A; 4X1V A; 4AFZ C; 2CDT A; 5ECA A; 2DYB A; 4Y92 A; 4EIK A; 1M8M A; 2J6K A; 4J9E A; 3SEM A; 1Y57 A; 1NM7 A; 1SHG A; 2EQI A; 1SPK A; 3VRY A; 2ROL A; 1UHF A; 2A37 A; 4QT7 A; 1MV0 B; 3UF4 A; 2G6F X; 1IO6 A; 2V1Q A; 1ABQ A; 1OEB A; 1RLQ C; 5L23 A; 1BBZ A; 1AWW A; 2EW3 A; 1X2Q A; 2EGA A; 2LQW A; 2J05 A; 2O88 A; 2MOX A; 1X69 A; 5IHN A; 2SEM A; 2KYB A; 3IQL A; 2GBQ A; 4RTY A; 2V1R A; 3KFV A; 1B3Q A; 4AFU C; 4FSS A; 2X3W D; 1Z9Q A; 4HVV A; 1AZE A; 2KEA A; 3REA B; 3NHN A; 3VS3 A; 3TSZ A; 2M0Y A; 3VS5 A; 3EG3 A; 1EFN A; 2NUZ A; 2YDL A; 1X43 A; 3H0F A; 3LH5 A; 3UA7 A; 2VVK A; 1SHF A; 5I22 A; 2H8H A; 2KRM A; 3EG0 A; 1AWO A; 1E7O A; 5IXB A; 1GCQ C; 4K11 A; 1KIK A; 3I5R A; 1AZG B; 1YN8 A; 2EYW A; 2LNH B; 2KR3 A; 4HVW A; 1KSW A; 4J9H A; 1SSH A; 5IHI A; 1Y0M A; 2JM8 A; 1AWX A; 2A08 A; 4E6R A; 1AEY A; 1JEG A; 3VS1 A; 1ZUY A; 1T0H A; 4DEX A; 2CH4 A; 1WLP B; 2EBP A; 2DL8 A; 2LJ0 A; 2DNU A; 2C0I A; 2HEQ A; 2DBK A; 4F16 A; 4JPB W; 2JMA A; 1FYN A; 1WX6 A; 1UJ0 A; 4J9B A; 2K6D A; 4AFS C; 4JJC A; 4ZNX A; 2DL3 A; 4AG2 C; #chains in the Genus database with same CATH topology 2AZV A; 1RAE B; 3OSV A; 1GBR A; 4F14 A; 4OMO A; 3J80 E; 5GAN 6; 2BZY A; 2W0Z A; 3CCE T; 2L5Q A; 4RTX A; 5IH2 A; 1FXX A; 2A36 A; 4C92 G; 1V76 A; 2YXY A; 1NYG A; 1IXD A; 2JS2 A; 5IAY A; 3MEU A; 1B34 B; 2LP5 A; 1Q81 U; 2GTJ A; 3MEA A; 4FIB A; 2L0A A; 2KAF A; 1IHW A; 1Y96 B; 3X26 B; 4E2F B; 4O5V A; 2QQS A; 3OS0 A; 1H92 A; 2JT4 A; 1XQH A; 2JJ9 A; 3OQ5 A; 2PUK B; 2HSP A; 1V1C A; 2ABL A; 1RAF B; 4RTU A; 4XQ3 A; 3SWN B; 1YJW T; 1VIE A; 3WXM B; 3S6W A; 2JS0 A; 3V7C A; 4EDU A; 2IPO B; 1FMV A; 1KHI A; 1U5S A; 2MCN A; 3CCE A; 4PFP A; 2DXT A; 4II1 A; 2MK5 A; 2MMP A; 4N0A C; 4D8D A; 2VGM A; 2D1X A; 3VU3 C; 5C6S A; 2R5M A; 1KC8 U; 4J9I A; 3CCR T; 1B07 A; 2CT3 A; 1WZO A; 4F7U G; 4B9X A; 3CCE Q; 2CP7 A; 1AD5 A; 2RQW A; 2EAY A; 4LE9 A; 5CKH A; 2D8J A; 3D7S B; 1YJW A; 1W6X A; 2AK5 A; 1YBY A; 4PJO G; 2RI2 A; 4EMK C; 3MP6 A; 2X9H A; 2O31 A; 5FU7 B; 1VQ5 T; 1QWF A; 1M2V A; 3BE3 A; 2E10 A; 2E5Q A; 4J8O A; 3CPF A; 1ZA1 B; 2XHC A; 4KUL A; 4PLI A; 5KYX A; 4C8Q E; 3OYA A; 3RDV A; 3REB B; 3CCR A; 2H3E B; 3QWX X; 1AOJ A; 2K3B A; 3V7S A; 4JDS A; 1TUD A; 5GJV B; 4DQ2 A; 3M5A A; 2KRN A; 2L2P A; 4C5I A; 3UAT A; 2ZPB B; 4N0A A; 3CCR Q; 1NG2 A; 4CC2 A; 2DBM A; 2DJQ A; 3CEY A; 2LMJ A; 1VQ5 A; 1I8F A; 2DIL A; 3FIF A; 4AT1 B; 2LDM A; 4LN2 A; 4D6W A; 2QXF A; 1WXB A; 1GCP A; 3LGL A; 2W10 A; 4LDY A; 1QWE A; 4OGC A; 4GY5 A; 3L2W A; 3DLM A; 2V8K A; 1EX4 A; 5FW9 A; 2LRQ A; 2HDA A; 4A63 B; 2AKL A; 4PNO A; 3MHX A; 2K9G A; 2RF0 A; 5LJ5 f; 3QWY A; 1VQ5 Q; 1KG1 A; 3OYK A; 5GAN 8; 1LJO A; 2FVU A; 2CZ7 B; 4EMK A; 1NEB A; 5I2S A; 2FYK A; 1YWP A; 2KT8 A; 2DRM A; 1X01 A; 1C0M A; 1I4K 1; 1N6A A; 2F2X A; 4RUG A; 3G4S T; 3X20 B; 4M7D E; 1LNX A; 5KCH A; 3MET A; 2KRS A; 3H8Z A; 2HQE A; 4IIO A; 3FC3 A; 1WPY A; 4NS5 A; 4M75 A; 3C95 A; 4LUD A; 2FPF A; 4MDW A; 1K9A A; 2OAW A; 3CCL T; 1UG1 A; 3HFN A; 4C0Z A; 2XI9 A; 1K1Z A; 2DXB A; 1K9M R; 2F2V A; 2VB6 A; 2Y90 A; 1AHJ B; 4QVC A; 3FJ5 A; 2DET A; 1M1G A; 3OBY A; 3L2V A; 3EFO A; 2SRC A; 2AKK A; 1WJR A; 2E4H A; 2O4X A; 2DVE A; 1OZ3 A; 4J7F A; 3G4S A; 4FU6 A; 2E41 A; 2HZY A; 5IT9 E; 3VKI A; 2M9U A; 2NUT B; 3TVT A; 1ZBJ A; 1QQJ A; 4C92 E; 1WHK A; 4C0D B; 3U23 A; 5IN1 A; 3CCL A; 5HKC A; 4M78 D; 4OB1 B; 5CCA A; 3CBP A; 4KBM B; 3ZEH A; 3DB3 A; 3QG1 A; 2L3Q A; 1QVF S; 4JS5 A; 3VJP A; 3H0H A; 3NGP A; 1G83 A; 2P0K A; 5GAO q; 3G4S Q; 4JRP A; 2ATC B; 4IIM A; 4JUV A; 3FLG A; 3OYC A; 4C8Q C; 2KK4 A; 1VQ8 T; 4X9C A; 4JJD A; 4MZP A; 4RTV A; 3CCL Q; 3A98 A; 1K73 R; 2LCL A; 1VQK Q; 2F1L A; 1BI2 A; 5IXF A; 1H64 1; 1JXO A; 3EAE A; 2VAS A; 1X6O A; 4HT8 A; 3M9Q A; 1VQP T; 1K4U S; 1NEG A; 1ZLM A; 1W70 A; 3O5Z A; 2XIC A; 2VXE A; 4XTX A; 4PKC C; 2NUP B; 1M1K U; 3QZ5 B; 5GAM f; 4M75 G; 1UUE A; 1Y07 A; 2J6F A; 2R58 A; 1W2B A; 4O6J A; 3RER A; 4V2S A; 1NJI R; 4M7D D; 2YWW A; 3L1A A; 1VQ8 A; 2HAX A; 2O9S A; 5LJ5 d; 1D1A A; 1QKW A; 1HXD A; 1SRM A; 4JLI A; 4J9F A; 2KYM A; 3VS6 A; 5CKB A; 1VQM T; 1I5L A; 1D0Y A; 1UGQ B; 2AT1 B; 2CRE A; 1JU5 C; 1VQP A; 1JJ2 P; 2HCK A; 4IUR A; 3VYG A; 1KQS S; 1VQ8 Q; 4AFZ C; 3MCA B; 1D3B B; 1O9S A; 5LJ5 g; 2DYB A; 3VUZ A; 3P8B B; 5CO7 A; 4M7D C; 4M77 D; 4C8Q A; 1NM7 A; 3G1J A; 3E9F A; 1SPK A; 2DIQ A; 3GOX A; 1IO6 A; 4KH1 B; 2MPX C; 2RHX A; 2V1Q A; 1OEB A; 3EFS A; 1PSE A; 1VQP Q; 3DB4 A; 4C92 D; 1G3T A; 1WJQ A; 1X2Q A; 2YHT A; 1VQM A; 1LOJ A; 5I21 A; 3M56 A; 3LWH A; 2V8J A; 1M1F A; 2R57 A; 2V1R A; 4AFU C; 4QW2 A; 2X3W D; 3CMA T; 4HVV A; 4M77 B; 4QVZ A; 3REA B; 2LNV A; 5CR2 A; 1EFN A; 1X43 A; 3H0F A; 3BDL A; 3LH5 A; 1NE8 A; 3UA7 A; 1TTH B; 5M9O A; 5GAN 2; 4ANJ A; 1VQM Q; 4C92 C; 1KIK A; 2DER A; 3GNF B; 1KSW A; 2F5T X; 7AT1 B; 3E2U A; 4EMH A; 4YTL A; 1ZUY A; 2L8D A; 4DEX A; 3KBG A; 5A0L A; 2DL8 A; 4M78 F; 2DNU A; 1BIB A; 4EMG A; 2C0I A; 4FW2 A; 3A8H B; 2F69 A; 3CMA A; 1W4S A; 2CZ0 B; 1K9M C; 3MKD A; 1UJ0 A; 4J9B A; 2GCX A; 2DL3 A; 1VQ4 T; 4AG2 C; 4ZTF A; 1TWB A; 3CD6 T; 5GAN 5; 5D7U A; 2CP0 A; 4PJO D; 3LGF A; 4JLG A; 1RL2 A; 1S72 Q; 5CVI A; 1JXM A; 3EH2 A; 3CMA Q; 3ZBD A; 2VC8 A; 2DEU A; 1VYV A; 3RIR A; 8AT1 B; 1X2K A; 3KXT A; 3CBO A; 2Y4X A; 4C8Q G; 3LX7 A; 2ESW A; 3VS4 A; 2CS7 A; 4KGX B; 1G3Y A; 2RNA A; 1TUC A; 3G7Z A; 4M7A A; 1ARK A; 2JN0 A; 4Z89 A; 1VQ4 A; 4B6M A; 1OU8 A; 3CD6 A; 2EJ9 A; 3LH0 A; 5GAM g; 3PIO A; 2EKH A; 1IRX A; 3M55 A; 3HFO A; 3I5S A; 4KUI A; 2R5A A; 4Y91 A; 1WA7 A; 4XAX B; 5A0D A; 2DL5 A; 2GF7 A; 5HCK A; 1K73 C; 2BZ8 A; 4IUQ A; 1WFW A; 4XK8 E; 3HRS A; 1VQO Q; 3MPU B; 2RJC A; 1K76 A; 3HL8 A; 1RAD B; 1AWJ A; 3G71 T; 2KGT A; 4MDX A; 1VQ4 Q; 2PTK A; 3SFM A; 1WQ7 A; 2GFA A; 4QKU A; 1HD3 A; 1HK9 A; 3CD6 Q; 2QTV A; 3MO8 A; 3TEE A; 1K8A R; 2QQR A; 2QQ9 A; 2E1H A; 3A8L B; 2YSQ A; 4E7J A; 3H0I A; 1KD1 R; 3CPW A; 1ZQ1 A; 1E6G A; 5GMK i; 1RAA B; 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