The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
PMFEAAYDFPGSGSPSELPLKKGDVIYITREEPSGWSLGKLLDGSKEGWVPTAYMKPH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Yeast Myo5 SH3 domain, tetragonal crystal form
rcsb |
| molecule tags |
Contractile protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| molecule keywords |
Myosin-5 isoform
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| total genus |
11
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| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-01-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CSQ A; 2EPD A; 1OPL A; 1M3A A; 2KE9 A; 1PWT A; 4JJC A; 1T3L A; 1PHT A; 2VWF A; 2C0T A; 1W6X A; 1W1F A; 2JMA A; 4IIM A; 1AVZ C; 4JJD A; 2BZY A; 2PZ1 A; 1PRM C; 2W10 A; 2QDL A; 1NM7 A; 2JXB A; 2BTT A; 4GLM A; 1ZUU A; 1E6G A; 1GFC A; 1K1Z A; 3NGP A; 2KT1 A; 4RTV A; 1JQQ A; 1UTI A; 1G83 A; 1MV0 B; 3I35 A; 2MCN A; 2V1Q A; 4AFZ C; 2C0O A; 2KGT A; 2D1X A; 2MIO A; 1T0J A; 3UA7 A; 3M0Q A; 1X6B A; 2L3P A; 2PNI A; 2X3W D; 1WI7 A; 2EYZ A; 1TUD A; 4Z89 A; 3VS3 A; 1GBR A; 1ZX6 A; 3UF4 A; 2AK5 A; 2DYB A; 1A0N B; 1ZUK A; 3M0S A; 1UDL A; 3A98 A; 4RTZ A; 1AZE A; 1E7O A; 4JZ3 A; 2GBQ A; 1JXM A; 2P4R A; 3I9Q A; 2CUB A; 3H0I A; 2RQW A; 2LQW A; 2SRC A; 2EVR A; 2H8H A; 2EQI A; 2ENM A; 3VRY A; 1GL5 A; 2EBP A; 1I1J A; 1ABO A; 4A63 B; 1X43 A; 2DL4 A; 2D0N A; 3H0F A; 3QWX X; 2FO0 A; 1I07 A; 1UEC A; 2E5K A; 3TVT A; 4JZ4 A; 2DA9 A; 1GBQ A; 1K76 A; 2HSP A; 3VRZ A; 2HCK A; 4IIO A; 4OMN A; 4EIK A; 2EYY A; 1K0S A; 4J9G A; 2JT4 A; 1QCF A; 5IHI A; 3UAT A; 2JMC A; 2KNB B; 1XOV A; 1YWO A; 2GTJ A; 2K3B A; 2RQT A; 1GCP A; 5FWB A; 1CKA A; 3SEM A; 2DL7 A; 2DMO A; 2D8H A; 1YNZ A; 2FPD A; 2G6F X; 1GCQ C; 3JV3 A; 2EYW A; 2SEM A; 1VYU A; 3EHR A; 2FPE A; 1JXO A; 2OJ2 A; 3REB B; 1HSQ A; 2A08 A; 3SHW A; 4J9E A; 1X2Q A; 1H8K A; 2O9V A; 5ECA A; 2KRN A; 2KRS A; 2C0I A; 1UE9 A; 1G2B A; 2LCS A; 1QKW A; 4ZNX A; 5IXF A; 4AFU C; 1IO6 A; 3THK A; 1UHF A; 4LN2 A; 2RPN A; 4HXJ A; 3EG1 A; 3NHN A; 1E6H A; 2L2P A; 1NLO C; 1SRM A; 4CC3 A; 1AWW A; 3CQT A; 4LE9 A; 3VS1 A; 1I0C A; 2YUQ A; 2B86 A; 4HVU A; 4AFS C; 3EG2 A; 1YCS B; 2RQU A; 1CKB A; 2LMJ A; 1WFW A; 2L3Q A; 1UUE A; 2O9S A; 2GNC A; 2DLP A; 3NMZ C; 1M27 C; 2F2V A; 2DF6 A; 1UHC A; 4RTX A; 1ZSG A; 2EW3 A; 3O5Z A; 4Y92 A; 3VS7 A; 1OPK A; 4HVV A; 3LH5 A; 1K4U S; 4OMM A; 2RQV A; 4KRT A; 4OMP A; 5HCK A; 1WLP B; 4GBQ A; 3R6N A; 2KYB A; 3UA6 A; 3IQL A; 1WYX A; 1YN8 A; 2EGA A; 1WXT A; 1Y57 A; 2HBW A; 2AKL A; 2JM9 A; 2CT3 A; 1OEB A; 1YWP A; 2OAW A; 1CSK A; 3PVL A; 2XMF A; 1H3H A; 3RBB B; 2JS2 A; 1OOT A; 2DL8 A; 2HDA A; 2KXC A; 2L0A A; 2AZS A; 3PVQ A; 2F2X A; 3KFV A; 2AZV A; 1UJ0 A; 1X2K A; 3TSW A; 2FEI A; 2DNU A; 1N5Z A; 2DRK A; 1ABQ A; 1HD3 A; 2YUO A; 2ED0 A; 4J9F A; 5GJW B; 2CH4 A; 1TUC A; 5GJV B; 1VYT A; 2O31 A; 2M51 A; 5I22 A; 1NYG A; 4K11 A; 2CSI A; 2O88 A; 1U3O A; 3GBQ A; 4Z8A A; 1PKT A; 2W0Z A; 5IHN A; 1WDX A; 2DBK A; 2KEA A; 3I5S A; 2KYM A; 4HCK A; 3H41 A; 2HEQ A; 3ULR B; 4AFQ C; 4LUD A; 2LX7 A; 1SHG A; 2J05 A; 2DRM A; 2YUN A; 3M0U A; 1PRL C; 1MV3 A; 3M0T A; 1WX6 A; 4DEY A; 1BK2 A; 4RTT A; 3TSZ A; 4F16 A; 2GGR A; 2LJ1 A; 1S1N A; 2KRO A; 2DBM A; 1ARK A; 1SSH A; 3QWY A; 1M8M A; 1AEY A; 2KBT A; 1GCQ A; 1K0X A; 1H92 A; 1NG2 A; 1AZG B; 2RQR A; 1X69 A; 3C0C A; 1LCK A; 1QLY A; 2KRM A; 2DM1 A; 2CDT A; 1AD5 A; 2FPF A; 1BB9 A; 4OML A; 2A28 A; 1UGV A; 1GRI A; 2DL5 A; 2JM8 A; 1KFZ A; 4JJB A; 1EFN A; 2A36 A; 2K79 A; 1X27 A; 2GTO A; 2JW4 A; 2ROT A; 2K9G A; 2J6K A; 2LP5 A; 2EYX A; 3VS5 A; 4LUE A; 2FRW A; 5FW9 A; 4RTY A; 1RLP C; 2BZX A; 1AWJ A; 1AWX A; 4OMQ A; 4ESR A; 2J06 A; 1NEB A; 2PTK A; 2J6F A; 2JTE A; 1SRL A; 1AOJ A; 2CRE A; 1BBZ A; 1MUZ A; 1UG1 A; 3EG3 A; 2ROL A; 3EGU A; 3U23 A; 4D8D A; 5IHK A; 2YDL A; 2LNH B; 2VKN A; 2ESW A; 1K9A A; 1KIK A; 2CUD A; 1ZUY A; 1M3C A; 4Z88 A; 1SPK A; 4FSS A; 4AG2 C; 1BU1 A; 1NEG A; 2VVK A; 2K7A A; 1QKX A; 3H0H A; 4ORZ A; 1X6G A; 5I11 A; 2FRY A; 2FG0 A; 3M0P A; 1GFD A; 3VS2 A; 2K6D A; 3FJ5 A; 1TG0 A; 1Y0M A; 1Z9Q A; 2IIM A; 1WIE A; 2DVJ A; 2CH4 W; 4J9B A; 4J9I A; 1VYV A; 2DIL A; 1M30 A; 2I0N A; 1WA7 A; 4D8K A; 3RNJ A; 4F14 A; 2V1R A; 2J6O A; 2CT4 A; 1QWE A; 3NPF A; 1JO8 A; 4X1V A; 4CC4 B; 3REA B; 3EHQ A; 2YT6 A; 1RUW A; 1UFF A; 2KXD A; 2DX1 A; 4J9C A; 4J9H A; 4HVW A; 1JU5 C; 4JPB W; 4CC7 A; 5IH2 A; 1U06 A; 2RN8 A; 2MOX A; 1FYN A; 1JEG A; 1T0H A; 4AG1 C; 1NLP C; 1OV3 A; 3VS0 A; 2OI3 A; 1B07 A; 2ECZ A; 2DE0 X; 1VA7 A; 1AWO A; 1U5S A; 2DJQ A; 5EC7 A; 4F17 A; 1RLQ C; 4OMO A; 3VS4 A; 1ZLM A; 1KJW A; 1QWF A; 2LQN A; 4CC2 A; 2LJ0 A; 2J7I A; 3VS6 A; 1WXU A; 2LJ3 A; 2YSQ A; 3EG0 A; 1W70 A; 4RUG A; 1YP5 A; 3M0R A; 1B3Q A; 2NUZ A; 4WCI A; 1Z9Z A; 4LNP A; 4DEX A; 2DL3 A; 3I5R A; 2LZ6 B; 4J9D A; 4M4Z A; 1HJD A; 2L3S A; 3PE0 A; 2M0Y A; 2A37 A; 4RTU A; 1FMK A; 1NYF A; 4QT7 A; 2BZ8 A; 2K2M A; 2X3X D; 1ZBJ A; 2NWM A; 2RNA A; 3ZL7 C; 1PNJ A; 2AKK A; 2KR3 A; 1M3B A; 2ABL A; 1RI9 A; 2EKH A; 2EGE A; 4R0K A; 1V1C A; 1WXB A; 5IXB A; 1KSW A; 2D8J A; 1UJY A; 2F2W A; 2JS0 A; 2KT8 A; 1SEM A; 5L23 A; 2RF0 A; 2ED1 A; 2RMO A; 1T3S A; 2YUP A; 5FWC A; 2GQI A; 2EGC A; 1J3T A; 1SHF A; 2O2O A; 4E6R A; 4RTW A; 1PKS A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1R0C B; 3CC2 T; 1BI2 A; 1RAH B; 1TXQ A; 2PUO B; 1PHT A; 2NUP B; 4XTY A; 3JB9 H; 4M7D F; 1YJ9 A; 3CCS Q; 2JMA A; 2K3Y A; 3QHS A; 4M77 E; 4IIM A; 1PRM C; 4E7H A; 3TQ7 P; 1NM7 A; 4C92 F; 2X4J A; 5DY9 A; 4KT0 E; 1K1Z A; 2KT1 A; 4RTV A; 1JQQ A; 2FZC B; 3I35 A; 1WZO A; 1KQ2 A; 4QVZ A; 5AT1 B; 3UWN A; 2KGT A; 3CD6 T; 4QVD A; 3JRZ A; 3UA7 A; 3M0Q A; 1G3Y A; 4C92 A; 2PNI A; 1D0Y A; 3UT1 A; 1Q86 U; 3H6Z A; 3OYJ A; 1TUD A; 2R58 A; 7AT1 B; 2NLU A; 2RA2 A; 4ZN3 A; 1GBR A; 1KQS P; 3OYC A; 1QVF S; 4RTZ A; 1Q81 C; 2OTL T; 4AMC A; 3JCM h; 3I9Q A; 1Q7Y U; 1VQP T; 3H0I A; 3CC2 Q; 2RQW A; 1Q95 G; 3P8D A; 1VQL T; 2SRC A; 2H8H A; 3EFS A; 3OYI A; 1NE8 A; 2ENM A; 3M4G A; 1X43 A; 5C0M A; 3M58 A; 4C5G A; 2DJZ A; 3TVT A; 1WJR A; 4JZ4 A; 1YJ9 Q; 4XTU A; 2QEX A; 1GBQ A; 4M75 F; 4PLI A; 1K76 A; 4IIO A; 4EIK A; 2EYY A; 4J9G A; 1QCF A; 5IHI A; 2JMC A; 1XOV A; 3HTR A; 4JS5 A; 1YWO A; 2GTJ A; 2DL7 A; 5J39 A; 3JCM P; 1ZQ1 A; 2VYT A; 4F7U G; 3F70 A; 1X01 A; 2XDB A; 2D8H A; 1AT1 B; 5GAO r; 4EMK B; 4RG8 A; 4M75 A; 2XDP A; 1LPL A; 1VYU A; 2FVU A; 3REB B; 1HSQ A; 3CCM A; 4J6X A; 4PJL A; 5IN1 A; 2CGH A; 1WJQ A; 5A0G A; 1VQL Q; 1QVG A; 2COW A; 5ECA A; 4GY5 A; 1WHL A; 2C0I A; 1UE9 A; 3JCM J; 9ATC B; 1QKW A; 3OW2 A; 2GQV A; 4ZTJ A; 1Y7X A; 1IO6 A; 2CZ1 B; 4HXJ A; 2FZK B; 3NHN A; 1E6H A; 2E5Q A; 2L2P A; 1SRM A; 4CRI A; 1AWW A; 3QDF A; 1RAI B; 2MF2 A; 1BYM A; 3QDR B; 1BI3 A; 3PIP A; 1QVP A; 1KD1 C; 4NL2 A; 2RQU A; 4PFP A; 4KUL A; 2EJ9 A; 4JLG A; 4CI0 C; 1ZSG A; 3HHT B; 3J81 E; 1VQ8 A; 3O5Z A; 3VS7 A; 4F04 B; 4HVV A; 5GAM d; 4KRT A; 3CCM Q; 4OB3 B; 1XNI A; 5FRM A; 2A0F B; 4GBQ A; 1ZA1 B; 4M7D C; 2DTI A; 2OAU A; 4FIB A; 3JCM V; 1NJI U; 2V8K A; 4LXC A; 2LRQ A; 1Y57 A; 2HBW A; 1LNX A; 2RHI A; 1OEB A; 2OAW A; 5I21 A; 4HCZ A; 1FWZ A; 1M1K U; 3PVL A; 4GLK A; 2HL5 C; 4N0A A; 3JB9 G; 1UEB A; 3A5Z B; 1OU9 A; 3CME T; 3GNF B; 2HDA A; 2L0A A; 2A3L A; 3KFV A; 4LDX A; 5HKC A; 1X2K A; 3C94 A; 2FEI A; 2DNU A; 5LJ3 f; 1ABQ A; 4J8O A; 3M55 A; 1HD3 A; 1ZA2 B; 2CH4 A; 2D9T A; 5D6W A; 3LGF A; 3RKW A; 1W2B S; 1VYT A; 3QBY A; 5LJ3 j; 1KK7 A; 4M7D B; 3CMA T; 5I22 A; 1NYG A; 1RAC B; 2CSI A; 4LDW A; 4ZN1 A; 1BI1 A; 3C4S A; 2WSF E; 2W0Z A; 4XU1 A; 5IHN A; 2KEA A; 3M56 A; 4C5H A; 1VQ8 Q; 4PJO E; 3G71 T; 4HCK A; 4E7J A; 3EFR A; 1MMN A; 2KK4 A; 5GAM h; 1YI2 T; 1S72 A; 2C06 A; 2LX7 A; 4C8Q F; 3M0U A; 5GAN 4; 4QVC A; 1WX6 A; 4DEY A; 3TSZ A; 5GAN 2; 2NUT B; 5GAO l; 4OB1 B; 1K8A R; 4F16 A; 3EFO A; 3DB3 A; 2RH2 A; 2DD5 A; 3CME Q; 1M8M A; 1H92 A; 4KUI A; 1QLY A; 4C8Q A; 2MI6 A; 1AD5 A; 1YHQ T; 4M78 F; 1UGV A; 2K57 A; 5GMK j; 2JM8 A; 1UGQ B; 1BIB A; 2A36 A; 5KYY A; 1X27 A; 2GTO A; 5GAO q; 3CMA Q; 1Y96 B; 2EYQ A; 4M77 F; 4N4H A; 5GAN 8; 2K9G A; 4M78 A; 4QQD A; 1JB0 E; 5GAO p; 5GAM e; 2FRW A; 1TSF A; 1YI2 Q; 3C12 A; 2BZX A; 1AWX A; 4M77 A; 1BI0 A; 2J06 A; 2ZPG B; 4BD3 A; 1Q82 U; 2CRE A; 1MUZ A; 4FSX A; 2HSE B; 2LTO A; 1UGS B; 1S72 Q; 2ROL A; 1O9S A; 4D8D A; 3CBO A; 2QXF A; 2ZPE B; 4J5Y A; 2BE9 B; 3V8K A; 2YDL A; 2VKN A; 1D3B B; 1K9A A; 1VQ6 T; 3CC4 T; 2RJF A; 4FYY B; 1M3C A; 3X20 B; 1VQN T; 4IUU A; 4BE2 A; 1WQ7 A; 3EGX B; 3OA6 A; 4JJN K; 1QKX A; 2BKD N; 2VUB A; 4ORZ A; 2E65 A; 3X28 B; 2FG0 A; 3M0P A; 2F5K A; 3WVE B; 1GFD A; 3VS2 A; 5GAN 5; 1Z9Q A; 1WIE A; 3HRS A; 8AT1 B; 5CAI A; 4J9I A; 4PNO A; 5CKF A; 4LD9 K; 2ATC B; 4PJO D; 2J6O A; 5FU6 C; 5C6S A; 3M59 A; 2XHC A; 2DX1 A; 4B6M A; 2MMP A; 4J9H A; 4FYX B; 1D1B A; 1JU5 C; 4PLL A; 3CC4 Q; 1TS9 A; 5IH2 A; 2RN8 A; 2MOX A; 5GAN 6; 4MML A; 4OMF B; 1P92 A; 4BI3 A; 1W2B A; 1YJW T; 1B07 A; 4N4I A; 2DE0 X; 5LJ3 g; 2M1H A; 4Y28 E; 1VA7 A; 2RO0 A; 4JRK A; 2DJQ A; 4NS5 A; 5EC7 A; 4F17 A; 5LJ5 f; 2EAY A; 4OMO A; 3CCQ A; 1B34 B; 3FEO A; 4DA4 A; 4E7I A; 2LJ0 A; 5CVI A; 1M9S A; 4C0D C; 5LJ5 j; 2JJ9 A; 4RUG A; 3ZFJ A; 5FU6 B; 3CCQ T; 4IUR A; 4XU0 A; 3BE3 A; 2HMA A; 5GAN d; 4E7Z A; 3CBM A; 2VC8 A; 3PE0 A; 4MMK A; 1NYF A; 4QT7 A; 3MEU A; 4JRI A; 2RNA A; 2DIG A; 2QTV A; 1NZ9 A; 1I5O B; 2AKK A; 3CXC A; 2B8A A; 4YTL A; 1M3B A; 1KQ1 A; 2EGE A; 2RJC A; 1V29 B; 3V7R A; 1WXB A; 4ZGJ B; 1YJW Q; 2D8J A; 2F2W A; 1SEM A; 1G3S A; 1M1K C; 3MET A; 3L2V A; 1K9M R; 2GQI A; 1WGS A; 1MHN A; 1HXD A; 2EFI A; 2O2O A; 4E6R A; 5I2S A; 2WSC E; 3HFO A; 1PKS A; 3OY9 A; 2D6F A; 2EPD A; 2EIF A; 1OPL A; 3H8Z A; 4E2F B; 2E3H A; 4LDU A; 3JCM W; 1W6X A; 3CCQ Q; 3CCE A; 1AVZ C; 3CCR A; 4A4K A; 2W10 A; 3L1A A; 2QDL A; 1WQW A; 3QG1 A; 4MDX A; 2V26 A; 3NGP A; 1I4K 1; 4M7D D; 4P5N A; 5KE3 A; 3J7A F; 2DZC A; 1UTI A; 2P4T A; 2C0O A; 1MNE A; 2MIO A; 2FYK A; 3HRT A; 4X9C A; 3CCL T; 2RHY A; 3T9N A; 2X3W D; 1WI7 A; 4L5G A; 4BE0 A; 4Z89 A; 4F7U F; 3TRE A; 1ZX6 A; 2AK5 A; 4XTX A; 2DYB A; 1A0N B; 1ZUK A; 3HRU A; 3HFN A; 4B9W A; 3DKM A; 1AZE A; 3MO8 A; 4C5E A; 3CPW A; 2JTM A; 2RD1 A; 2HNI A; 5IT9 E; 3VUB A; 1ACM B; 4OGE A; 4F7U A; 3HP9 A; 3VRY A; 3EH1 A; 4EMK A; 2EBP A; 3M4Y A; 1ABO A; 5GAN 3; 2QA4 A; 1H64 1; 3QWX X; 2FO0 A; 1UEC A; 4PJO A; 4J83 A; 4WTO B; 3CCE Q; 3LH0 A; 1VIE A; 5GAN e; 1G8X A; 2RHU A; 3OYM A; 2HCK A; 5AYF A; 2ZAE A; 3UAT A; 2KNB B; 3PT9 A; 3CCL Q; 2K3B A; 5FWB A; 2RQT A; 1CKA A; 3QO3 A; 4BY6 B; 2RM4 A; 2E3I A; 1QVG S; 1VQ9 A; 2HQE A; 1GCQ C; 2DFU A; 3JV3 A; 4PKC C; 2EYW A; 2SEM A; 3JB9 I; 1JXO A; 4FL6 A; 1ZHI A; 2JVV A; 2A08 A; 4QQ6 A; 1GXI E; 3SHW A; 4V2S A; 4XK8 E; 1ZBX A; 5LJ5 g; 3V8J A; 3VYH B; 4RG2 A; 5KYU A; 3I55 A; 2O9V A; 2KRN A; 2V8I A; 3AHU A; 1VQM A; 4FYW B; 5LJ3 h; 2KAF A; 1G2B A; 2ZPH B; 1KC8 U; 4C0G A; 1R0B G; 3OSS C; 1KD1 R; 3JCM d; 1XJW B; 3CC2 A; 2QA4 Q; 2MAM A; 3EG1 A; 1FXX A; 1D1C A; 3G6E T; 1D09 B; 4CC3 A; 2AIR B; 3DLL A; 3GF5 A; 3VS1 A; 2YUQ A; 2B86 A; 4RCC A; 1OZ3 A; 3OYY A; 4HVU A; 4AFS C; 3OYG A; 3JB9 F; 3EG2 A; 3S6W A; 1YCS B; 3MP6 A; 4X9D A; 5KE2 A; 1WFW A; 2L3Q A; 1K9M C; 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