The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
66
|
structure length |
66
|
Chain Sequence |
DRMAAPRAEALFDFTGNSKLELNFKAGDVIFLLSRINKDWLEGTVRGATGIFPLSFVKILKDFPEE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of SH3 domain of p40phox
rcsb |
| molecule tags |
Oxidoreductase activator
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Neutrophil cytosol factor 4
|
| total genus |
7
|
| structure length |
66
|
| sequence length |
66
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-04-04 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4HXJ A; 2GBQ A; 2DMO A; 2EBP A; 2JMA A; 5GJW B; 4AG1 C; 1TG0 A; 2QDL A; 1RLQ C; 4OMM A; 2W0Z A; 2K79 A; 1WA7 A; 1JXM A; 1YCS B; 2A36 A; 1UJY A; 4AFS C; 2DL7 A; 2FRY A; 2J6F A; 1GRI A; 4RTX A; 1X27 A; 2M0Y A; 2FG0 A; 2GTO A; 1GBR A; 4RTZ A; 3REB B; 1GCQ A; 2A08 A; 1SRL A; 2L0A A; 2MOX A; 3VS3 A; 1GBQ A; 1AWW A; 1M30 A; 2KXC A; 1PHT A; 1ARK A; 1UE9 A; 2EPD A; 4LNP A; 1CKA A; 1SRM A; 1B3Q A; 1M27 C; 2JXB A; 2P4R A; 2DLP A; 4J9H A; 2EYY A; 1BBZ A; 2KXD A; 2BZX A; 2RQT A; 2CT3 A; 4QT7 A; 3RNJ A; 2YUO A; 4KRT A; 1UGV A; 2MCN A; 1JQQ A; 1QLY A; 1TUC A; 1OPK A; 2D8J A; 2KGT A; 2DE0 X; 2D0N A; 2LJ1 A; 1Z9Q A; 4CC2 A; 5IHK A; 2CT4 A; 1S1N A; 2F2X A; 3A98 A; 3O5Z A; 1YN8 A; 3PVQ A; 1ZBJ A; 4JJC A; 4ESR A; 1AWJ A; 4Z88 A; 2O9V A; 1YWO A; 2C0T A; 3THK A; 1T3S A; 4E6R A; 2OI3 A; 1GFC A; 1UJ0 A; 1X69 A; 1GFD A; 1AEY A; 1NLP C; 4AFU C; 4RTW A; 1X6G A; 3VS1 A; 2DIL A; 2DRM A; 3VS4 A; 4OMO A; 2K6D A; 1NEB A; 2FO0 A; 4JZ4 A; 2GNC A; 3H0F A; 1M3C A; 3QWY A; 2KT1 A; 4AFQ C; 3EGU A; 3TSW A; 1JO8 A; 4WCI A; 1G83 A; 4J9F A; 4JJB A; 2HSP A; 4HVU A; 3LH5 A; 4GBQ A; 3UA6 A; 2KNB B; 2LP5 A; 1VA7 A; 2LCS A; 4J9E A; 2KBT A; 1ABO A; 2X3W D; 4RTY A; 1A0N B; 2LNH B; 1WXU A; 2C0I A; 2GGR A; 1GCP A; 3JV3 A; 1K9A A; 1K4U S; 1UHF A; 2DBK A; 2HBW A; 1W1F A; 1I0C A; 4LUE A; 3EG1 A; 3NHN A; 1MUZ A; 1PKT A; 2OJ2 A; 2PNI A; 4RUG A; 1OEB A; 1UHC A; 2EGE A; 1H92 A; 2KYB A; 1WFW A; 2PZ1 A; 1N5Z A; 4IIO A; 2L3S A; 4X1V A; 1B07 A; 1WX6 A; 3CQT A; 1PRM C; 2YUQ A; 2SEM A; 2DF6 A; 3M0R A; 4F16 A; 1K0S A; 1AWO A; 2HCK A; 4CC7 A; 2RMO A; 2AKL A; 2CH4 W; 2NUZ A; 2ROT A; 2ABL A; 3ULR B; 4CC3 A; 1NG2 A; 2DJQ A; 4A63 B; 2DL5 A; 2JM8 A; 2AZV A; 1XOV A; 1NEG A; 2LJ3 A; 2KEA A; 1MV0 B; 2A28 A; 4ORZ A; 5IH2 A; 2G6F X; 1HSQ A; 1AZG B; 2DM1 A; 1SEM A; 1T0J A; 3H0I A; 2M51 A; 1E6G A; 1X2K A; 3H0H A; 3UA7 A; 2CUB A; 2CUD A; 2AK5 A; 1U06 A; 4RTU A; 1X6B A; 2LQN A; 2OAW A; 1UDL A; 1KSW A; 2KRM A; 1WYX A; 2DX1 A; 4D8K A; 2FPD A; 4RTT A; 1CSK A; 2IIM A; 2J06 A; 1I1J A; 2B86 A; 2DYB A; 1GL5 A; 2RN8 A; 1NYG A; 1I07 A; 2XMF A; 5IXB A; 1GCQ C; 1NLO C; 1ABQ A; 2BZY A; 5IXF A; 1VYT A; 1QWE A; 5EC7 A; 1QKW A; 2LZ6 B; 1AD5 A; 3EHR A; 1LCK A; 2YUN A; 1UTI A; 4OML A; 4LE9 A; 4LN2 A; 1RLP C; 3FJ5 A; 4CC4 B; 1AVZ C; 1AOJ A; 2NWM A; 1JXO A; 3TVT A; 4OMP A; 2JMC A; 4Z8A A; 3C0C A; 3RBB B; 2ED1 A; 1RI9 A; 4R0K A; 1PRL C; 1YNZ A; 2K7A A; 3U23 A; 4AG2 C; 3UAT A; 5IHI A; 1SHG A; 1NYF A; 3NGP A; 2KRN A; 2CSI A; 1UEC A; 3VRZ A; 1KFZ A; 1PWT A; 2LJ0 A; 2L2P A; 3M0Q A; 1YWP A; 2GTJ A; 1U5S A; 4M4Z A; 2K3B A; 2EKH A; 2HEQ A; 2LQW A; 3VS5 A; 3I35 A; 2GQI A; 3EG2 A; 5I11 A; 3M0P A; 1VYU A; 2D8H A; 2I0N A; 1OOT A; 2W10 A; 1SSH A; 1T3L A; 5GJV B; 1WLP B; 2RF0 A; 1X43 A; 1BB9 A; 4OMN A; 3SHW A; 4OMQ A; 2FPF A; 2EW3 A; 5FWB A; 2JM9 A; 2DL8 A; 1RUW A; 1K1Z A; 3I5S A; 3M0T A; 1ZUK A; 2V1R A; 1CKB A; 1QCF A; 1H3H A; 4EIK A; 4JJD A; 2D1X A; 3IQL A; 2EYX A; 2DNU A; 2YT6 A; 2DVJ A; 3QWX X; 1W70 A; 2MIO A; 2VWF A; 1OV3 A; 4DEX A; 2RQU A; 2SRC A; 4K11 A; 1M8M A; 1QWF A; 2RPN A; 1K76 A; 1ZLM A; 2BZ8 A; 4J9B A; 1Z9Z A; 4FSS A; 2JS0 A; 3SEM A; 1J3T A; 2DL3 A; 2BTT A; 2K2M A; 3NPF A; 1YP5 A; 4GLM A; 2JTE A; 2O9S A; 5FW9 A; 3VRY A; 1IO6 A; 3EG3 A; 2EGA A; 2C0O A; 1UG1 A; 2ROL A; 2CRE A; 2CH4 A; 3KFV A; 1ZSG A; 2EGC A; 1SPK A; 2DBM A; 2RNA A; 2YDL A; 2V1Q A; 2PTK A; 1PNJ A; 2KRS A; 2O31 A; 2EYZ A; 2EYW A; 2FPE A; 3ZL7 C; 1V1C A; 1H8K A; 5IHN A; 2YSQ A; 1OPL A; 4J9G A; 3EG0 A; 4D8D A; 1W6X A; 3VS7 A; 3NMZ C; 4J9C A; 3VS0 A; 1JU5 C; 3M0S A; 2CDT A; 4ZNX A; 4F14 A; 2RQR A; 2VKN A; 1HD3 A; 1U3O A; 1UUE A; 3TSZ A; 1BU1 A; 5HCK A; 4JZ3 A; 1WIE A; 2J6K A; 1HJD A; 3EHQ A; 1WDX A; 1K0X A; 3I5R A; 4LUD A; 1ZUU A; 4HVW A; 4J9D A; 1E6H A; 1KIK A; 1E7O A; 2AZS A; 4Z89 A; 1Y0M A; 2L3P A; 2A37 A; 2JT4 A; 2J7I A; 2HDA A; 1T0H A; 3REA B; 4DEY A; 3VS2 A; 1WXT A; 2FRW A; 4IIM A; 2H8H A; 1AWX A; 1PKS A; 2KR3 A; 4JPB W; 3R6N A; 4J9I A; 3VS6 A; 3PE0 A; 2E5K A; 2EVR A; 1G2B A; 2J6O A; 1FMK A; 1KJW A; 3PVL A; 5I22 A; 2KRO A; 2KYM A; 2O88 A; 4AFZ C; 1MV3 A; 1M3B A; 1QKX A; 2KT8 A; 3H41 A; 1M3A A; 2J05 A; 2L3Q A; 2JW4 A; 1WI7 A; 2LMJ A; 1EFN A; 2LX7 A; 2AKK A; 2ENM A; 2ECZ A; 2DRK A; 4RTV A; 2ESW A; 1SHF A; 2DA9 A; 2KE9 A; 2FEI A; 1ZX6 A; 1NM7 A; 1ZUY A; 1WXB A; 2CSQ A; 1VYV A; 2RQV A; 2EQI A; 3GBQ A; 2VVK A; 2YUP A; 1TUD A; 2RQW A; 4F17 A; 1X2Q A; 1FYN A; 2X3X D; 4HVV A; 1UFF A; 1BK2 A; 5L23 A; 5ECA A; 2O2O A; 1Y57 A; 4Y92 A; 4HCK A; 3M0U A; 2ED0 A; 5FWC A; 1AZE A; 2K9G A; 2F2W A; 3UF4 A; 1JEG A; 2F2V A; 2DL4 A; 3I9Q A; 2JS2 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4RG2 A; 5A0L A; 5CKD A; 3CME Q; 3MP1 A; 2QEX Q; 1RLQ C; 4OMM A; 1VQ7 Q; 1JXM A; 5LJ3 h; 1YJ9 T; 4DBR A; 2RHY A; 1KD1 C; 3QJ6 A; 4MMK A; 4NL3 A; 4FT4 A; 3RMQ A; 4AFS C; 2FRY A; 2J6F A; 1GRI A; 2DZ9 A; 1X27 A; 3J81 E; 2L3R A; 2FG0 A; 2HKQ B; 2L0A A; 3VS3 A; 1SRL A; 2MOX A; 1KD1 U; 2PUO B; 5GAO q; 2HNI A; 2JXB A; 2P4R A; 2EYY A; 4DOW A; 3H8Z A; 2MK5 A; 5CR2 A; 1UGV A; 1JQQ A; 3RDV A; 1OPK A; 2D8J A; 4IUU A; 1OU8 A; 4CC2 A; 4RMO A; 2QQB A; 3CCR A; 3O5Z A; 3C12 A; 3FLG A; 4Z88 A; 1M9S A; 1D3B B; 4ELY C; 4FYW B; 1UJ0 A; 5GAM g; 4N0A A; 5GMK i; 1XJW B; 1OI1 A; 2HKN A; 4J6Y A; 5FU7 B; 1QVG P; 2EQJ A; 2ZGW A; 3VS1 A; 4OMO A; 3OYE A; 2K6D A; 2EQU A; 2FO0 A; 6AT1 B; 2VC8 A; 4JZ4 A; 2GNC A; 4QQ6 A; 3M9Q A; 2VB6 A; 4X9C A; 3VYG A; 4HVU A; 3LH5 A; 3MCA B; 1VQM T; 5D7U A; 4F7U B; 4O5V A; 2KNB B; 2NUT B; 1ZSZ A; 1ABO A; 1VIE A; 1WXU A; 1PCX A; 1GCP A; 4M77 E; 3QUI A; 2CGH A; 2HBW A; 3HP9 A; 4M7D E; 1W1F A; 3EG1 A; 1HXD A; 3ASK A; 1Q81 R; 3NHN A; 3S3N A; 3OYB A; 1MUZ A; 2OJ2 A; 5GAM j; 4BDZ A; 4E7K A; 2EGE A; 1H92 A; 3G6E A; 2WSE E; 5GAO l; 2YUQ A; 3VJP A; 3BDL A; 2XG8 D; 3PMT A; 4M77 A; 4OVA A; 2GFU A; 1VQ8 Q; 3CCQ A; 1SSF A; 3CD6 T; 4M7D A; 2CH4 W; 3CEY A; 1M1K R; 4JS5 A; 1AT1 B; 3CMA A; 2QI2 A; 4QVZ A; 2FZK B; 4A4E A; 2YLB A; 2QQ9 A; 4A63 B; 1MMA A; 2AZV A; 1NEG A; 2E65 A; 2LJ3 A; 4Q5W A; 1VQO Q; 3CCE Q; 1AZG B; 1SEM A; 3V8J A; 2HQH A; 1X2K A; 2LNV A; 2COW A; 2CUD A; 1VQ7 A; 3OS2 A; 4RTU A; 1X6B A; 1OU9 A; 3RMS A; 3JAM E; 4B6M A; 4XTV A; 3A1P A; 1WZO A; 1WYX A; 3DB3 A; 1WHL A; 4M75 E; 2FPD A; 4E47 A; 1CSK A; 3UWN A; 2B86 A; 3G4S Q; 2XDB A; 5IXB A; 1NZ9 A; 1M90 C; 3MO8 A; 1G8X A; 5IXF A; 5EC7 A; 1QKW A; 3M56 A; 4JJN K; 3EHR A; 1Q86 U; 3FJ5 A; 2BE7 D; 1AVZ C; 1AOJ A; 3V8K A; 2NWM A; 3TVT A; 4AT1 B; 4M7A E; 3OYN A; 3CCV T; 4M75 A; 4C8Q B; 1RAA B; 5LL6 S; 1RI9 A; 2MWO A; 3QZ9 B; 4J83 A; 1PRL C; 2K7A A; 3QSU A; 3OB9 A; 2DVE A; 5IHI A; 3OQ5 A; 1K8A U; 1C6V X; 3MKD A; 1G5V A; 2CSI A; 2KMT A; 4PKC C; 1UEC A; 1PWT A; 1VQ4 T; 4IUR A; 5GAM e; 1YJW Q; 4N0A C; 2ATC B; 5IN1 A; 5LJ3 j; 1BI1 A; 4MDX A; 4QVC A; 2IG0 A; 4DBQ A; 2GQI A; 2GFA A; 5I11 A; 5AT1 B; 3EGX A; 3M0P A; 5GAO n; 4M7A A; 4LDU A; 1SSH A; 1WLP B; 2RF0 A; 3CCS Q; 4MZT A; 3C95 A; 1QVG S; 2EW3 A; 2DL8 A; 2V1R A; 4BE1 A; 2K5F A; 5IAY A; 1H3H A; 1WHG A; 1N6A A; 2E6Z A; 4EMK A; 1UB4 A; 1M1G A; 2D1X A; 1ZSZ C; 3FRN A; 3SWN C; 5C6S A; 4TVR A; 1LJO A; 1VQ5 A; 3VU3 C; 1ZA1 B; 1TWB A; 3QWX X; 4MML A; 3DLL A; 1W70 A; 2VWF A; 1OV3 A; 2B8A A; 1M8M A; 3QII A; 4M7A F; 5HK0 A; 4FSS A; 3SEM A; 4FCY A; 1TSF A; 1WJR A; 2DEQ A; 4EMG A; 2K2M A; 4KH0 B; 1YP5 A; 3OW2 S; 3NTI A; 1K9M R; 1N9R A; 1VQ8 A; 2VGM A; 5FW9 A; 4FM4 B; 2K5I A; 2HL5 C; 4C92 E; 3MET A; 3GNF B; 2JOY A; 2ROL A; 3KFV A; 2CH4 A; 4HCC A; 4NOY A; 2DBM A; 2EWN A; 3CCJ T; 5GAM f; 1VQO A; 1PNJ A; 2KRS A; 2EYZ A; 1N9S A; 3ZL7 C; 4PJL A; 2RK2 A; 2HD0 A; 4J9C A; 2HL3 A; 2M9U A; 3I56 A; 1VQ9 T; 1JU5 C; 2CDT A; 2ZPE B; 1D0Z A; 1U3O A; 4C92 A; 4L59 A; 4OGE A; 2ZPI B; 2R5A A; 5HCK A; 1Y07 A; 1QCO A; 1OYX A; 1HJD A; 1WDX A; 3TU4 K; 2CYZ B; 1JRI A; 1S72 Q; 1Y71 A; 3OYF A; 4RCC A; 4ZGJ B; 2QGF B; 4GLK A; 2D0Q B; 3UDC A; 3VS2 A; 3OMC A; 1NJI R; 2FRW A; 4IIM A; 2QK0 A; 2H8H A; 2NUT A; 3GPL A; 1Q7Y R; 1Q82 C; 3JCM J; 1X6O A; 1Y7X A; 2KI7 A; 2RJE A; 2QAZ A; 2E5K A; 1PD1 A; 3URG A; 3EH1 A; 5I22 A; 2KRO A; 4O6J A; 4AFZ C; 1N8R R; 3QJY A; 2LQ8 A; 2J05 A; 3CCL T; 2LMJ A; 5L8R E; 1Q82 U; 3JB9 J; 1PG5 B; 4YTL A; 2DA9 A; 4E7L A; 2DJZ A; 1YJW A; 3C4S A; 3KBG A; 4HCB A; 4OB3 B; 1SG5 A; 3GBQ A; 2QGG A; 2VVK A; 2RQW A; 4F17 A; 1UGP B; 4A4H A; 1ACM B; 2QDY B; 4F7U F; 3LW5 E; 1FYN A; 4IUT A; 1IRE B; 1BK2 A; 3CCU A; 4M7A C; 3CCS A; 4J6W A; 1Y57 A; 4Y92 A; 4HCK A; 2E6N A; 1VQK A; 2E5Q A; 3UT1 A; 2CKK A; 2JTM A; 4JLG A; 4MZP A; 2K9G A; 1M5Q 1; 2F2W A; 1KG1 A; 5GAM d; 2EQK A; 4XQ3 A; 4HXJ A; 4EMK C; 5LJ3 f; 5GJW B; 1C0M A; 1YCS B; 4BAC A; 4XAX B; 1FMV A; 2RHX A; 1UJY A; 1RAE B; 2K3X A; 4C8Q E; 2K4Y A; 2QQR A; 2MI6 A; 3WVD B; 1YIT T; 1WHH A; 1GBR A; 4RTZ A; 2RH2 A; 1GCQ A; 2A08 A; 3M54 A; 4C0F A; 3ZBD A; 1UE9 A; 1TUG B; 4LNP A; 1SRM A; 2V8I A; 1M27 C; 3TEE A; 3CCR Q; 5GAM h; 4XTZ A; 2RJF A; 2DLP A; 1BBZ A; 2KXD A; 3S3M A; 3OA6 A; 4PLI A; 1IXD A; 2CT3 A; 4KRT A; 2MCN A; 5CO7 A; 1QLY A; 1TUC A; 3R6O A; 1VQP T; 2EQM A; 2DE0 X; 4C8Q A; 4N4H A; 3BFM A; 4FT2 A; 4C5E A; 4KT0 E; 4PJJ A; 3A98 A; 3PVQ A; 1YN8 A; 3OYH A; 4BUG A; 2CZ1 B; 3THK A; 2X51 A; 3HL8 A; 2OI3 A; 1GFC A; 2YRV A; 2RHU A; 1PSF A; 1AEY A; 2PVD B; 5FU7 C; 5KE2 A; 5M9O A; 2CP3 A; 1XTD A; 1X6G A; 2DIL A; 2DRM A; 1H64 1; 3CD6 Q; 2M1H A; 1RI0 A; 3BDU A; 3MEV A; 3ME9 A; 3L2V A; 2XD0 A; 3H0F A; 1YIJ T; 2CZ6 B; 3QWY A; 1S72 A; 1TH7 A; 5CCA A; 3TSW A; 1JO8 A; 4JLI A; 2HZY A; 3WXM B; 4C8Q F; 1WJQ A; 2FZC B; 3UA6 A; 3QO3 A; 1Q81 C; 4A54 A; 4J5Y A; 4XTU A; 3KUF A; 4J9E A; 2RI3 A; 2R58 A; 1ZQ1 A; 2Z0W A; 5GAN 5; 1YJ9 A; 3QZ5 B; 2DK3 A; 1K9A A; 2AHJ B; 4BE0 A; 3FDR A; 5LJ3 d; 4LUE A; 1I0C A; 2BKD N; 5I2M A; 3A8L B; 1Q81 U; 2DTH A; 4XTW A; 4RUG A; 4OB1 B; 5GAN 2; 3LX7 A; 4MZM A; 1Q95 G; 3J80 E; 1M1K C; 2ZZD A; 4X1V A; 1B07 A; 1BIA A; 1P92 A; 2XI9 A; 3CPW P; 2LDM A; 3M0R A; 4F16 A; 2IVW A; 3RER A; 1AWO A; 4A4F A; 2RMO A; 1IZ6 A; 2OTJ T; 4XTX A; 1BI0 A; 2AKL A; 1M1K U; 5AYF A; 2DXB A; 3HRS A; 1DJ7 B; 5EG2 A; 1Y96 A; 2NUP B; 4JUV A; 1VOM A; 2DL5 A; 8ATC B; 2A28 A; 1HSQ A; 1V29 B; 2JZ2 A; 1VQ4 Q; 2PUK B; 4QW2 A; 1I5O B; 3UA7 A; 1B7T A; 2ZCF B; 2KSS A; 2HAX A; 4PNO A; 3MEA A; 1KC8 R; 2QTV A; 3G1J A; 2OAW A; 1UDL A; 2KRM A; 2DX1 A; 4D8K A; 1VQL T; 2QG9 B; 2EJF A; 2XDD A; 2J06 A; 4XU1 A; 1VQN T; 1GL5 A; 5GAO p; 1I07 A; 1VQM A; 2WSC E; 1JB0 E; 1GCQ C; 1NLO C; 5CVI A; 2DO3 A; 3X26 B; 1VYT A; 1QWE A; 4HA8 A; 3MEW A; 2DTI A; 3ZEH A; 1LCK A; 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