The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
59
|
structure length |
59
|
Chain Sequence |
AMATAVALYNFAGEQPGDLAFKKGDVITILKKSDSQNDWWTGRTNGKEGIFPANYVRVS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
3-D proteome of yeast SH3 domains
rcsb |
| molecule keywords |
Hypothetical 41.8 kDa protein in SPO13-ARG4 intergenic regio
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
10
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2EKH A; 3M0R A; 4OML A; 1AVZ C; 1T0H A; 4J9H A; 4E6R A; 1M3C A; 2LJ3 A; 1WI7 A; 2KR3 A; 1I0C A; 2SEM A; 2BTT A; 1TUC A; 1WYX A; 1AWX A; 2L2P A; 1JQQ A; 4FSS A; 1MV3 A; 2KRO A; 1VYV A; 2W0Z A; 3M0P A; 3PVL A; 2A08 A; 2EW3 A; 2D8H A; 2MIO A; 3VS5 A; 1BB9 A; 1AD5 A; 2L3S A; 4RUG A; 1W70 A; 1GCP A; 2PZ1 A; 1FMK A; 1OV3 A; 3IQL A; 5IH2 A; 1JEG A; 2GTJ A; 1WDX A; 4RTZ A; 1ZLM A; 1NYG A; 2J6F A; 1K1Z A; 1PKT A; 2L3P A; 1HSQ A; 2HSP A; 1E6G A; 4HVV A; 1OPK A; 1HJD A; 1J3T A; 1H92 A; 2BZ8 A; 1JU5 C; 1NLP C; 1WXB A; 4WCI A; 1I07 A; 2KT1 A; 2KXC A; 4A63 B; 1QLY A; 2E5K A; 2M0Y A; 2P4R A; 2J7I A; 2LX7 A; 1T0J A; 3SHW A; 2C0O A; 1NEB A; 1Y0M A; 2ED0 A; 4LUE A; 1KJW A; 2DL8 A; 2AK5 A; 4J9G A; 1QKX A; 2C0I A; 1OEB A; 3QWY A; 2I0N A; 2CSQ A; 4F16 A; 2LQN A; 1WXT A; 4D8K A; 1X27 A; 3O5Z A; 1U5S A; 2DE0 X; 2AZV A; 2KNB B; 1WIE A; 1M3B A; 1VYU A; 1GRI A; 3PE0 A; 2FEI A; 4OMQ A; 2JTE A; 1SHF A; 5I11 A; 4F17 A; 2LP5 A; 2GGR A; 1AZE A; 2NUZ A; 2G6F X; 1PKS A; 1YWO A; 4J9D A; 5IHK A; 2LJ0 A; 2DL7 A; 4X1V A; 2EYY A; 2FPE A; 1UJY A; 5HCK A; 3VS7 A; 2RF0 A; 2RQV A; 2D0N A; 2FO0 A; 2J05 A; 2DM1 A; 1G83 A; 2CDT A; 4JPB W; 4CC2 A; 2DL4 A; 1W1F A; 4J9E A; 4LE9 A; 1YNZ A; 3RNJ A; 3I5S A; 1X2Q A; 1Z9Q A; 1RUW A; 1QCF A; 2DRK A; 1K9A A; 4J9C A; 4RTT A; 3EGU A; 2JS0 A; 3NHN A; 1GCQ A; 2HDA A; 3KFV A; 1GL5 A; 1AWJ A; 3H0H A; 2D1X A; 2OJ2 A; 2RQR A; 4JZ4 A; 2X3X D; 3EG3 A; 3VS1 A; 2W10 A; 2PTK A; 2OI3 A; 1UHF A; 4J9B A; 1GBQ A; 1RI9 A; 2FPD A; 5L23 A; 2EGA A; 2M51 A; 4OMP A; 1YP5 A; 1RLP C; 1X6G A; 2LQW A; 2KE9 A; 1CSK A; 1PRM C; 4ZNX A; 2LJ1 A; 1N5Z A; 1WLP B; 2YUN A; 1K0X A; 2JMC A; 1PHT A; 1MV0 B; 2CUD A; 1GFC A; 1A0N B; 2RMO A; 4IIM A; 4K11 A; 4JJC A; 4Z89 A; 3LH5 A; 1LCK A; 2AZS A; 5GJV B; 1RLQ C; 2KYB A; 2KEA A; 3I35 A; 2O9S A; 4Z8A A; 4R0K A; 3I5R A; 3R6N A; 2XMF A; 1UG1 A; 2QDL A; 5IXF A; 5IHI A; 1YCS B; 3VS6 A; 1UTI A; 2F2W A; 2LCS A; 2FRY A; 1SHG A; 1EFN A; 2ABL A; 1CKA A; 2LNH B; 4F14 A; 3PVQ A; 2CT4 A; 2DMO A; 1Y57 A; 1H3H A; 2DJQ A; 4RTX A; 2VVK A; 3ZL7 C; 1ZUK A; 5EC7 A; 1SRL A; 1V1C A; 3FJ5 A; 2O9V A; 2EYX A; 2EYW A; 2VKN A; 2YUO A; 2DIL A; 2ENM A; 3C0C A; 2KT8 A; 2EYZ A; 2GTO A; 4RTW A; 3VRZ A; 2J06 A; 2B86 A; 1U3O A; 4HXJ A; 2DYB A; 1PWT A; 4AG2 C; 3THK A; 3EHR A; 3VS3 A; 3UAT A; 4ESR A; 5FWC A; 3M0U A; 2KBT A; 1NEG A; 3EG0 A; 1BK2 A; 4HVU A; 1OPL A; 2CUB A; 1FYN A; 4GLM A; 2DA9 A; 1WX6 A; 1BBZ A; 1ARK A; 2HEQ A; 2H8H A; 1KSW A; 1GFD A; 1AEY A; 2ROT A; 4JZ3 A; 2ECZ A; 2A37 A; 2DBM A; 3H41 A; 5IHN A; 1Z9Z A; 1ZBJ A; 3UA7 A; 1T3S A; 1X2K A; 4GBQ A; 4RTY A; 1NG2 A; 1GCQ C; 2EGC A; 2JM9 A; 2ESW A; 3M0S A; 1TG0 A; 2RQU A; 3TSW A; 2AKL A; 1AZG B; 2F2X A; 4HCK A; 1WXU A; 4JJB A; 3EG1 A; 1X6B A; 2X3W D; 2F2V A; 2DRM A; 1SEM A; 1PRL C; 2FPF A; 1E6H A; 1PNJ A; 4OMN A; 1JXM A; 4Y92 A; 2IIM A; 1HD3 A; 1K0S A; 1YN8 A; 4J9F A; 2V1Q A; 1BU1 A; 1AOJ A; 2K7A A; 1WFW A; 1ABQ A; 2OAW A; 2GQI A; 1MUZ A; 2KRN A; 5GJW B; 1S1N A; 1QKW A; 3A98 A; 1JXO A; 2RQT A; 4CC7 A; 2ED1 A; 2EGE A; 2YUQ A; 5I22 A; 1W6X A; 2PNI A; 1JO8 A; 2J6O A; 1M8M A; 2DL3 A; 2ROL A; 3VRY A; 2A36 A; 4EIK A; 1H8K A; 1VA7 A; 3UF4 A; 3GBQ A; 1VYT A; 2CT3 A; 2KYM A; 4Z88 A; 2YUP A; 4LUD A; 2CSI A; 3U23 A; 1K76 A; 2DX1 A; 4CC3 A; 2SRC A; 4AFS C; 2FG0 A; 3CQT A; 5IXB A; 1SSH A; 1QWF A; 3NPF A; 5FW9 A; 1UDL A; 2EPD A; 1IO6 A; 2DF6 A; 3ULR B; 4JJD A; 1UHC A; 2K79 A; 4IIO A; 2RPN A; 2CH4 W; 2EBP A; 5FWB A; 4QT7 A; 2KRS A; 2L0A A; 2EVR A; 1T3L A; 2LMJ A; 3H0I A; 4D8D A; 1M3A A; 2DBK A; 4J9I A; 1UEC A; 4OMM A; 4AFU C; 2K9G A; 1TUD A; 3RBB B; 2FRW A; 3UA6 A; 4LN2 A; 2MOX A; 4LNP A; 1B3Q A; 1UE9 A; 2CH4 A; 1U06 A; 2V1R A; 2RQW A; 1B07 A; 1UUE A; 2HBW A; 2HCK A; 2YDL A; 1UJ0 A; 1I1J A; 1WA7 A; 1KFZ A; 1QWE A; 2BZY A; 1X43 A; 2JMA A; 1ZUU A; 3SEM A; 2JT4 A; 4DEY A; 1K4U S; 1XOV A; 2AKK A; 2MCN A; 2EQI A; 1SRM A; 1KIK A; 1NM7 A; 2KGT A; 1AWO A; 3M0T A; 2YT6 A; 2K2M A; 2LZ6 B; 2O88 A; 2KXD A; 2JXB A; 1ZSG A; 4DEX A; 4M4Z A; 1M27 C; 2JS2 A; 2K3B A; 3I9Q A; 2DNU A; 2GBQ A; 2YSQ A; 3JV3 A; 3VS0 A; 3M0Q A; 2RNA A; 2DL5 A; 1GBR A; 4AG1 C; 2DLP A; 2DVJ A; 4AFQ C; 2KRM A; 1UGV A; 2VWF A; 2L3Q A; 2O31 A; 1OOT A; 4RTU A; 4HVW A; 1NLO C; 1ABO A; 1NYF A; 3QWX X; 2CRE A; 4KRT A; 1AWW A; 3REA B; 4OMO A; 2GNC A; 1G2B A; 2D8J A; 2O2O A; 2BZX A; 4RTV A; 3EHQ A; 2RN8 A; 4CC4 B; 1UFF A; 3TSZ A; 1E7O A; 4AFZ C; 3VS2 A; 1ZX6 A; 3NGP A; 2JM8 A; 1X69 A; 1SPK A; 2C0T A; 3EG2 A; 2J6K A; 5ECA A; 1ZUY A; 2JW4 A; 2K6D A; 3VS4 A; 4ORZ A; 1YWP A; 3REB B; 2A28 A; 3H0F A; 1CKB A; 2NWM A; 3TVT A; 3NMZ C; 1M30 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2EKH A; 4OML A; 3SB2 A; 2JTF A; 4XTV A; 2LJ3 A; 1YJ9 T; 2KR3 A; 4OMF B; 2P0K A; 1VOM A; 1B7T A; 2BTT A; 1VQ6 A; 1TUC A; 3JB9 G; 3M53 A; 1NJI R; 3G71 A; 1VQ9 T; 4F7U G; 4UC4 A; 1VYV A; 3DKM A; 1VQO T; 3JCM h; 2A08 A; 1YI2 A; 2D8H A; 2EJF A; 1W70 A; 3HP9 A; 4OF1 A; 5GAO l; 2EQU A; 2M0O A; 2FZG B; 3RIR A; 1PKT A; 4LXC A; 3VUZ A; 2HSP A; 1E6G A; 4O5V A; 1HJD A; 3FDR A; 1J3T A; 2ZPE B; 4LDW A; 1NLP C; 1WXB A; 2K5L A; 2G3R A; 2E5K A; 2P4R A; 3GF5 A; 7AT1 B; 3CCQ T; 5LJ5 e; 2LTO A; 5GAM j; 2DL8 A; 2AK5 A; 2C0I A; 3E9F A; 5L8R E; 2I0N A; 4IUP A; 2CSQ A; 2E5Q A; 4JUV A; 3L2Q A; 1FMV A; 1U5S A; 2DE0 X; 3L1A A; 3PFS A; 2KNB B; 3CBM A; 1QVF S; 1WIE A; 3GOX A; 2E3I A; 1VQN T; 1TSF A; 4QVC A; 1RAI B; 2HKN A; 4C5I A; 5I11 A; 4F17 A; 3TCJ A; 2HL3 A; 1HXD A; 2GGR A; 3P8D A; 2NUZ A; 2Y4Y A; 2CP7 A; 4ZGD B; 4M75 E; 1YBY A; 5FLX E; 1BI0 A; 4DA4 A; 5CQX A; 1VQM Q; 5HCK A; 2ZPB B; 1M1F A; 1I81 A; 2RQV A; 5CR2 A; 2AHJ B; 5FU6 C; 2PVD B; 4LD9 K; 1VQ9 Q; 3OBW A; 3CBP A; 4BI8 B; 1VQO Q; 4LE9 A; 1YNZ A; 4E7K A; 1YIJ Q; 3LWH A; 3E9G A; 3M5A A; 1K73 U; 1K8A C; 1M5Q 1; 2HDA A; 3LGF A; 5C0M A; 3A1P A; 5GMK m; 3BW1 A; 2D1X A; 2LQK A; 1KHC A; 2RQR A; 4PFO A; 3EG3 A; 1VQ7 Q; 2HD0 A; 2E4H A; 2PTK A; 5LJ5 d; 4J9B A; 4KGZ B; 3EFO B; 2RD1 A; 2KY9 A; 2HMA A; 2FPD A; 4Q5W A; 5IAY A; 5L23 A; 4OMP A; 2P0Q A; 4QQG A; 3CCQ Q; 2YXY A; 4OGC A; 4PJJ A; 3KBG A; 2VUB A; 2LJ1 A; 2KMT A; 2YUN A; 3MCA B; 3HSB A; 3KUF A; 2CUD A; 2NUP A; 2H3E B; 2XHC A; 4IIM A; 2EJ9 A; 3JCM g; 1BCO A; 2ZPI B; 3L2U A; 4M77 E; 5LL6 S; 2O9S A; 4R0K A; 2LT4 A; 1MND A; 3R6N A; 4ELZ C; 1UG1 A; 2QDL A; 4M7D A; 5IHI A; 3PMI A; 4C5H A; 2F2W A; 3OSV A; 2LCS A; 5KE3 A; 4F04 B; 1K9M C; 2QK0 A; 3JCM J; 2RJD A; 4JJN K; 2ABL A; 2LNH B; 4F14 A; 3PVQ A; 2VXF A; 4M75 G; 4JLI A; 3CCS A; 2EYW A; 2HQH A; 3JCM X; 2VKN A; 3JCM f; 2ENM A; 1VQP A; 1AHJ B; 3RKX A; 3BE3 A; 5KCH A; 1IXD A; 2DYB A; 4XK8 E; 3THK A; 2COW A; 3VS3 A; 5DM7 R; 1Q7Y C; 1R8O B; 1BK2 A; 1V29 B; 3A8M B; 2CUB A; 3OA6 A; 2DA9 A; 4NL2 A; 5FRO A; 4LDY A; 2GCX A; 2V8J A; 3C95 A; 4XU3 A; 1MGQ A; 2ROT A; 4JZ3 A; 2A37 A; 4C8Q G; 5GMK l; 2YWW A; 5IHN A; 2EYQ A; 1X2K A; 3WXM B; 1OI1 A; 5J39 A; 2JM9 A; 1EIF A; 2ESW A; 1TG0 A; 2RQU A; 1D3B A; 4JJB A; 4M78 B; 3UWN A; 4EMK B; 3OW2 S; 3CC2 A; 4N4G A; 3HTR A; 4QQ6 A; 5DY9 A; 4C0Z A; 3G6E T; 4LDX A; 1HD3 A; 1M2V B; 2XI9 A; 3CD6 A; 2K7A A; 4M77 G; 4RCB A; 3RUX A; 1ABQ A; 2OAW A; 3ME9 A; 3QDF A; 1TWB A; 3HRU A; 1M1K C; 1XJW B; 2EGE A; 2JNG A; 2A3L A; 1M2O A; 3VYG A; 3EG9 A; 3ER0 A; 4PLL A; 3A8H B; 1QVF A; 2CP3 A; 1VA7 A; 1D0Y A; 1R0B G; 2M1H A; 2CT3 A; 3ZEH A; 2YUP A; 2CSI A; 1WZO A; 1K76 A; 2DX1 A; 3M55 A; 1BIA A; 5IXB A; 4E7Z A; 4XU0 A; 1N9S A; 4X9C A; 1QWF A; 5LJ3 d; 1NJI C; 2CP6 A; 2BKD N; 3INZ A; 2PUO B; 3CCL A; 1IRX A; 4BE0 A; 2LC4 A; 1WJQ A; 2Z0W A; 4J6X A; 3QZ9 B; 4J7I A; 1KHI A; 2RPN A; 3CCR A; 2HKQ B; 3VJP A; 2RM4 A; 2KI7 A; 2L0A A; 3CCU A; 4D8D A; 3CCS T; 2LMJ A; 2E65 A; 1M3A A; 2L5Q A; 3OQ5 A; 1D0X A; 1UEC A; 2RK1 A; 1D1B A; 2FRW A; 1UGS B; 4LNP A; 1XQH A; 4ZN1 A; 4KUI A; 2ZGW A; 4ME7 A; 2MI6 A; 2RQW A; 4JDS A; 2HBW A; 4BI3 A; 1KFZ A; 1D09 B; 1LVK A; 5KYW B; 2KAF A; 4PFP A; 4LDV A; 3G6E Q; 2JT4 A; 4FYY B; 1K4U S; 1VQK T; 4E7H A; 4RKU E; 5HK0 A; 4B6M A; 3CCE A; 1S72 T; 2BIV A; 2KGT A; 3M0T A; 2KXD A; 4R55 A; 4FW1 A; 1ZSG A; 3I9Q A; 1V76 A; 5CKH A; 1Q82 U; 1YJW Q; 1Q95 G; 4PJO A; 2GBQ A; 3MKD A; 4BUG A; 1R77 A; 2FVU A; 2YSQ A; 1VUB A; 3VS0 A; 1ZA1 B; 3M0Q A; 3CPW S; 4OB2 B; 3V8J A; 2CGH A; 2ZPH B; 1GBR A; 2RI2 A; 1ZA2 B; 1TU0 B; 1N8R C; 2NYS A; 2L8D A; 5GAN d; 1WNL A; 1PM3 A; 2QXF A; 5CKB A; 1WHM A; 1YIT T; 2CS7 A; 4MZM A; 2X4X A; 1I8F A; 3VKI A; 1G2B A; 2O2O A; 5D6W A; 2VC8 A; 1M4Z A; 1UFF A; 2RK2 A; 3LLR A; 4KUL A; 3VS2 A; 1ZX6 A; 4A4K A; 3LWI A; 1SF9 A; 4ZTJ A; 1X69 A; 3DB4 A; 2E41 A; 4XU1 A; 2JW4 A; 3EFO A; 4JRQ A; 4ORZ A; 1I5L A; 3REB B; 3H8Z A; 2PVO B; 1CKB A; 3CC7 T; 5HK3 A; 4II1 A; 3NMZ C; 2X9H A; 2FHD A; 1QVG S; 4J9H A; 3CCL T; 1M3C A; 4FT4 A; 1I0C A; 1OYX A; 3CCR T; 1VIE A; 1AWX A; 3CCU T; 1BIB A; 1M1G A; 1JQQ A; 2XDP A; 4FSS A; 2D9T A; 1VQK Q; 1VQM A; 3ZBD A; 1S72 Q; 1BB9 A; 1AD5 A; 1F1B B; 4WF2 A; 5GMK h; 1K9M R; 4M7D B; 1GCP A; 2LRQ A; 1FMK A; 5IH2 A; 1UGQ B; 1VQO A; 1WDX A; 4RTZ A; 5GAO r; 2XU8 A; 1YIJ A; 1ZLM A; 1NYG A; 4M75 D; 2E1H A; 2WSF E; 1OPK A; 3OYK A; 2RI3 A; 2E10 A; 2BZ8 A; 2F5T X; 2LDM A; 1I07 A; 2KT1 A; 4BI4 A; 2KXC A; 3CXC P; 2E70 A; 1QLY A; 4XQ3 A; 3OYH A; 1WHK A; 2DXU A; 5I21 A; 2GFA A; 2J7I A; 3NTH A; 4FCY A; 2M16 A; 3SHW A; 3M4G A; 3OMG A; 3QJ6 A; 1VQ7 A; 3CCE T; 2ED0 A; 1H64 1; 2XDB A; 2X4J A; 4LUE A; 1KJW A; 1Q7Y R; 2CP2 A; 1QKX A; 1QCN A; 3RKY A; 1QQJ A; 4PK4 A; 4F16 A; 1YIT Q; 1WXT A; 1X27 A; 1IGQ A; 4FT2 A; 4C8Q D; 3OS5 A; 3JSC A; 2RB6 A; 1ZSZ B; 1VYU A; 2FEI A; 3HHT B; 1SHF A; 2NUT B; 3MEA A; 2DIG A; 1RAG B; 3M56 A; 4XTY A; 3CC7 Q; 4FIB A; 1PC0 A; 5IHK A; 3CCL Q; 2LJ0 A; 2CYZ B; 4X1V A; 4M78 A; 4M7A B; 3A8O B; 6AT1 B; 2D0N A; 2E64 A; 3CCR Q; 1Q81 R; 2VGM A; 4X34 A; 1KQ2 A; 3SFM A; 8ATC B; 2DAQ A; 1M2V A; 4EMG A; 2DL4 A; 4J9E A; 1WHG A; 5GAM h; 1Q86 U; 1IRE B; 1RUW A; 2ZZD A; 2DRK A; 4J9C A; 3PMT A; 1G3T A; 3JCM c; 2DEQ A; 2K5I A; 3CCM T; 2DVE A; 5I2M A; 3V8L A; 1GL5 A; 1W2B S; 2OJ2 A; 3V7R A; 2X3X D; 4XAX B; 2OI3 A; 2XK0 A; 2L3R A; 4PKC C; 1UHF A; 4X9D A; 1GBQ A; 1RI9 A; 3QO3 A; 3CPF A; 3OYF A; 1JRI A; 4IUT A; 3RER A; 1VQM T; 1VQ8 T; 2LT1 A; 4EMH A; 1YP5 A; 1H3Z A; 1RLP C; 2EAY A; 3CCE Q; 4QQD A; 1N27 A; 4C92 B; 3L2V A; 4J83 A; 4JS4 A; 3S3M A; 4M78 F; 1K0X A; 3RMS A; 2JMC A; 1YIJ T; 1MV0 B; 1C0M A; 3CPW A; 2KYB A; 3OYB A; 2KEA A; 4BDZ A; 2QGG A; 1HK9 A; 2HQE A; 1KQS P; 3JCM b; 1IZ6 A; 3I5R A; 4E7L A; 3MPU B; 3VS6 A; 1UTI A; 2V26 A; 1VQ7 T; 2DFU A; 1TXQ A; 1EFN A; 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