The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
|
sequence length |
59
|
structure length |
59
|
Chain Sequence |
MEAIAKHDFSATADDELSFRKTQILKILNMEDDSNWYRAELDGKEGLIPSNYIEMKNHD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural Comparison of the Unstable drkN SH3 Domain and a Stable Mutant
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Protein E(sev)2B
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Drosophila melanogaster
|
| total genus |
8
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SHG A; 1AVZ C; 1JU5 C; 2EKH A; 1UG1 A; 1XOV A; 2M0Y A; 1T0H A; 1ABO A; 1SSH A; 2L3P A; 1QLY A; 2YUP A; 1WIE A; 2L3Q A; 4AG2 C; 2W10 A; 3PE0 A; 2O2O A; 4D8D A; 2DX1 A; 1X2K A; 2ED0 A; 4LNP A; 1HD3 A; 2VVK A; 2K3B A; 2RQV A; 1VYU A; 1Y57 A; 2RF0 A; 3JV3 A; 3VS0 A; 1M3B A; 1CSK A; 3EHQ A; 2KGT A; 2CT3 A; 4HVW A; 2GNC A; 2IIM A; 1YCS B; 2CDT A; 2YSQ A; 2K7A A; 4LUD A; 1NEG A; 1WX6 A; 4CC7 A; 2BZX A; 2DVJ A; 2DLP A; 4CC4 B; 2O9S A; 1PKS A; 1B3Q A; 2ROT A; 1YWO A; 1WI7 A; 2DL5 A; 2CRE A; 1E6G A; 2SEM A; 2EYW A; 4RTT A; 4M4Z A; 2VWF A; 2HDA A; 1X43 A; 2JS2 A; 1TUD A; 3EG1 A; 1PKT A; 5FW9 A; 1ZSG A; 2LP5 A; 4IIO A; 3VS6 A; 3U23 A; 2KT1 A; 1AZE A; 5IHI A; 2EBP A; 2RQR A; 1TG0 A; 1PRM C; 1KSW A; 1QWE A; 5HCK A; 1I07 A; 4JJC A; 2JM8 A; 2RMO A; 1NG2 A; 5FWC A; 2C0I A; 4ESR A; 1S1N A; 1GCP A; 2X3W D; 4ZNX A; 2DYB A; 2D0N A; 4GLM A; 2AKK A; 1LCK A; 2KRO A; 5GJW B; 1YWP A; 4Z88 A; 1WXU A; 4IIM A; 2EQI A; 2O88 A; 2NWM A; 2DL7 A; 3H0H A; 2ED1 A; 4J9G A; 1FMK A; 2J6K A; 2YT6 A; 4K11 A; 1A0N B; 2OJ2 A; 1GRI A; 2V1R A; 4LN2 A; 4R0K A; 1YN8 A; 3RBB B; 1K0S A; 2HCK A; 1H92 A; 1UDL A; 3QWX X; 3QWY A; 1KFZ A; 1AEY A; 2EGC A; 2DRM A; 1MUZ A; 2RQW A; 4X1V A; 2FEI A; 4JPB W; 1M27 C; 3I5R A; 3M0U A; 2B86 A; 1OPK A; 1B07 A; 2K9G A; 1CKA A; 1AWX A; 3I9Q A; 1E6H A; 2JM9 A; 2M51 A; 2JTE A; 4LUE A; 3UA7 A; 2CH4 A; 1UJ0 A; 4HCK A; 2KR3 A; 3TSZ A; 1KJW A; 3VS1 A; 1MV0 B; 3H41 A; 2JXB A; 3LH5 A; 1Z9Z A; 2FRW A; 4OMM A; 1SRM A; 1SEM A; 2F2W A; 4HVV A; 1OEB A; 3A98 A; 1GCQ A; 3M0R A; 2KRM A; 1UTI A; 1JXM A; 2KE9 A; 2ENM A; 2ESW A; 1W1F A; 2GTO A; 2L3S A; 4HXJ A; 4E6R A; 2E5K A; 2NUZ A; 2K2M A; 2L0A A; 1QKW A; 1VYV A; 2HEQ A; 2W0Z A; 2D1X A; 1FYN A; 2GGR A; 2KRS A; 1PWT A; 2KXD A; 4J9D A; 2X3X D; 2LX7 A; 2FPD A; 4KRT A; 1UFF A; 3NPF A; 1KIK A; 1NLO C; 4Z89 A; 1AOJ A; 1YNZ A; 2HBW A; 2YUQ A; 1QCF A; 1W6X A; 2F2V A; 4OMN A; 3VS5 A; 1RLP C; 2KNB B; 1U3O A; 3CQT A; 3EG0 A; 1I0C A; 2EYY A; 2EGA A; 5I22 A; 2LNH B; 1NEB A; 2EW3 A; 5L23 A; 2HSP A; 1VYT A; 2I0N A; 2AZS A; 2LJ3 A; 3RNJ A; 3TVT A; 1NM7 A; 1AWO A; 1X6B A; 4RTY A; 2A37 A; 1AWW A; 1PNJ A; 1WA7 A; 2KYB A; 2D8H A; 1YP5 A; 5IH2 A; 1K76 A; 4RTZ A; 2LCS A; 1QWF A; 2DA9 A; 5EC7 A; 1PRL C; 2EGE A; 3I35 A; 1NLP C; 3EG2 A; 2LZ6 B; 2JS0 A; 3FJ5 A; 3R6N A; 3VS7 A; 3I5S A; 3SEM A; 4A63 B; 2O31 A; 1M30 A; 2P4R A; 3NMZ C; 1SPK A; 2LJ0 A; 3EHR A; 2FPF A; 1Z9Q A; 2FPE A; 2LMJ A; 1ZUK A; 3REB B; 1K0X A; 3VRY A; 3M0S A; 2CT4 A; 2DJQ A; 4CC2 A; 1M3A A; 1OV3 A; 2DBK A; 1ARK A; 2DIL A; 2DNU A; 4Z8A A; 1H3H A; 2MOX A; 2EPD A; 1M3C A; 2L2P A; 2V1Q A; 1BK2 A; 2DE0 X; 1GL5 A; 4D8K A; 2A36 A; 1RLQ C; 4J9F A; 1UEC A; 4JJD A; 1SHF A; 1UE9 A; 1GBR A; 1HSQ A; 2DL4 A; 4CC3 A; 1T0J A; 2OI3 A; 1VA7 A; 4J9E A; 4HVU A; 1IO6 A; 1AD5 A; 3VRZ A; 2RQT A; 1TUC A; 2RPN A; 4OMP A; 2PNI A; 1GBQ A; 2J6F A; 4RTW A; 2G6F X; 3UF4 A; 2CSQ A; 2AK5 A; 2GQI A; 2KRN A; 2GTJ A; 2C0T A; 1ZUU A; 2YUN A; 4FSS A; 1MV3 A; 2YDL A; 1X2Q A; 4AG1 C; 2QDL A; 1T3S A; 1EFN A; 2PZ1 A; 1W70 A; 1RUW A; 1V1C A; 3SHW A; 1BU1 A; 1ZLM A; 3TSW A; 4RUG A; 1WYX A; 5ECA A; 4OMO A; 5IXB A; 2KT8 A; 4LE9 A; 2FRY A; 3EGU A; 2MIO A; 2RQU A; 1ZBJ A; 3M0T A; 4F14 A; 2EYZ A; 3H0I A; 5IXF A; 2EVR A; 1ZX6 A; 2J7I A; 2LJ1 A; 1X6G A; 2KBT A; 2RNA A; 1U06 A; 5IHN A; 4AFQ C; 2ABL A; 2AZV A; 2KEA A; 3H0F A; 2KXC A; 2JT4 A; 4EIK A; 3VS2 A; 4AFU C; 1X69 A; 4JZ4 A; 3KFV A; 1WXT A; 4AFS C; 2BZY A; 2AKL A; 2PTK A; 2RN8 A; 2FO0 A; 1BB9 A; 2DF6 A; 3NGP A; 2ECZ A; 1G2B A; 2DL8 A; 1UUE A; 1JQQ A; 4J9H A; 4OML A; 4Y92 A; 1UHC A; 1BBZ A; 3VS3 A; 2J06 A; 2JMC A; 4OMQ A; 2DMO A; 1J3T A; 1N5Z A; 1I1J A; 5IHK A; 1T3L A; 1OPL A; 3C0C A; 2SRC A; 1WFW A; 2BTT A; 2YUO A; 1GFC A; 4RTX A; 1PHT A; 3ZL7 C; 1AZG B; 1RI9 A; 2F2X A; 2CSI A; 4QT7 A; 3M0Q A; 1K9A A; 5FWB A; 3VS4 A; 1JO8 A; 1UJY A; 2K6D A; 2OAW A; 5GJV B; 4DEY A; 1QKX A; 1WXB A; 1K1Z A; 2H8H A; 3PVL A; 2JMA A; 1WLP B; 1U5S A; 3NHN A; 3EG3 A; 4JJB A; 4J9I A; 2C0O A; 4J9C A; 1GFD A; 3M0P A; 4WCI A; 4ORZ A; 2VKN A; 2LQN A; 2ROL A; 1NYF A; 2K79 A; 1G83 A; 5I11 A; 1JEG A; 2CUB A; 1GCQ C; 1K4U S; 3IQL A; 2D8J A; 2FG0 A; 3PVQ A; 4F16 A; 4DEX A; 2A08 A; 1H8K A; 2KYM A; 1UGV A; 1X27 A; 2J05 A; 2CH4 W; 2J6O A; 2LQW A; 3UA6 A; 1UHF A; 1Y0M A; 2MCN A; 1E7O A; 3UAT A; 1WDX A; 4J9B A; 2CUD A; 2JW4 A; 2DRK A; 3REA B; 1CKB A; 4AFZ C; 1NYG A; 1ZUY A; 2O9V A; 1HJD A; 2DL3 A; 4GBQ A; 2DBM A; 1ABQ A; 2DM1 A; 3GBQ A; 1OOT A; 2A28 A; 2BZ8 A; 1AWJ A; 1M8M A; 2EYX A; 4RTV A; 4JZ3 A; 1JXO A; 3THK A; 4F17 A; 4RTU A; 3O5Z A; 2GBQ A; 1SRL A; 2XMF A; 3ULR B; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DO3 A; 3L2Z A; 3WVD B; 5GAO l; 5LJ5 j; 3CPW A; 2M0Y A; 1WIE A; 2Z0W A; 3PE0 A; 2KMT A; 4IUQ A; 1VQ9 Q; 4KUI A; 3CME A; 5GMK l; 4A53 A; 1HD3 A; 3P8B B; 2RF0 A; 2KY9 A; 3MO8 A; 3VS0 A; 2RH2 A; 1OU9 A; 4CRI A; 1CSK A; 4DQ2 A; 2KGT A; 3CC2 Q; 3G6E T; 3G4S A; 2XDB A; 4MZM A; 1ZQ1 A; 1TU0 B; 1KHI A; 3VYG A; 1AHJ B; 1QVF P; 5A0D A; 4J7F A; 2JJ9 A; 2MAM A; 4Z02 A; 4M4Z A; 1FMV A; 2FZC B; 2DD4 A; 1VQ5 T; 2XDP A; 2VWF A; 5GAM h; 2JS2 A; 3SFM A; 3EG1 A; 2LP5 A; 2CKK A; 2RI5 A; 2LCL A; 3UDC A; 3OA6 A; 4M7D E; 3U23 A; 3PFS A; 2QI2 A; 4M7A B; 1QWE A; 5HCK A; 4JJC A; 1TSF A; 1NG2 A; 1VQN T; 1NJI C; 2C0I A; 3HFO A; 2QQR A; 3GOX A; 1VQ6 A; 4YTL A; 2X3W D; 2D0N A; 5GAO q; 2AKK A; 1D0Z A; 3ASK A; 3MEV A; 2MK5 A; 1O9S A; 3L42 A; 4J9G A; 4N4G A; 5GAN f; 2CGH A; 1H3Z A; 1YJN A; 3L2Q A; 2RHY A; 2DEQ A; 2FYK A; 1GRI A; 4LN2 A; 4C8Q D; 1NE8 A; 2QTV A; 3SB2 A; 1K0S A; 2HCK A; 1UDL A; 2FZG B; 3J80 E; 1YJ9 T; 4PJO E; 3H9N A; 3I55 Q; 1JB0 E; 3I5R A; 1YHQ Q; 1B07 A; 2K9G A; 2M51 A; 4LUE A; 3BW1 A; 1FXX A; 3UA7 A; 4L6V 5; 4PJJ A; 3GNG A; 1WGS A; 1KJW A; 2P0P A; 4E7I A; 5CQY A; 5KYW B; 3EH1 A; 1Z9Z A; 2FRW A; 4OMM A; 1OUL A; 1GCQ A; 3M0R A; 2KRM A; 3P8D A; 1JXM A; 1RAH B; 3QYH B; 2DIQ A; 1RAA B; 2ESW A; 2GTO A; 3V8K A; 2K2M A; 3KBG A; 5D6Y A; 1VOM A; 4RG2 A; 3FDR A; 1PC0 A; 3FC3 A; 3CCM A; 4BY6 B; 4M7A C; 4J9D A; 4B9W A; 4ZGJ B; 1KQS P; 4BDZ A; 2OTJ T; 3A8H B; 3L2W A; 4LDW A; 2VGN A; 4LD6 A; 1AOJ A; 5GAN 8; 1IGQ A; 4HT9 A; 2YUQ A; 3I56 A; 2F2V A; 3OQ5 A; 2X4Y A; 3S3N A; 1U3O A; 3EG0 A; 4EMH A; 1I0C A; 2YHT A; 4BE0 A; 3ZFJ A; 2CP0 A; 1MMG A; 3OS0 A; 1D0X A; 5GMK e; 4HKE A; 1AWW A; 4PFZ A; 1UGP B; 1R0C B; 2D8H A; 4MMK A; 5EG2 A; 4FSX A; 3CC7 A; 1Q86 C; 2EGE A; 2DET A; 2GCX A; 2LZ6 B; 4C8Q G; 4PJM A; 4C0D B; 2FHD A; 3SEM A; 4A63 B; 1M30 A; 3G71 Q; 4AMC A; 3QDF A; 3O8V A; 2X35 A; 2FPF A; 1O75 A; 2GQV A; 2LMJ A; 1ZUK A; 3LLR A; 1D0Y A; 2AHJ B; 3OS5 A; 1K0X A; 3T9N A; 2NYS A; 3OYB A; 2CT4 A; 2RHI A; 4CC2 A; 3CCU T; 1W2B P; 1OV3 A; 3CMA A; 2DIL A; 1VQ4 A; 6AT1 B; 3M5A A; 1Q7Y C; 2V1Q A; 3CD6 Q; 4D8K A; 4TVR A; 4X9C A; 1RLQ C; 1UEC A; 4JJD A; 1SHF A; 3RKW A; 3RR6 A; 3VUB A; 4BY6 C; 1GBR A; 5CKH A; 2DXB A; 4F7U G; 2DZC A; 2ZPI B; 4DBR A; 1KG1 A; 1QW1 A; 3CC4 T; 2J6F A; 4RTW A; 1LVK A; 1KC8 R; 2E3I A; 4X34 A; 2LT4 A; 4DA4 A; 3HKS A; 4FSS A; 1OX8 A; 5GAM j; 5GAN 2; 1T3S A; 4C5G A; 3INZ A; 1W70 A; 2IVW A; 1OZ2 A; 2M0O A; 3TSW A; 2ZAE A; 1UGQ B; 4RUG A; 2OX7 A; 3P8H A; 4OMO A; 1GXI E; 3CCR T; 4LD9 K; 4PJO A; 2MIO A; 2MMP A; 4X9D A; 2HZY A; 3ME9 A; 1HYO A; 3M0T A; 4MZT A; 3JCM J; 2QQA A; 3BDL A; 3H0I A; 4C0D C; 3C4S A; 2LCC A; 5CVI A; 2LJ1 A; 3S6W A; 1RAG B; 3JCM d; 2LRQ A; 3RER A; 1U06 A; 2ABL A; 3H0F A; 2L8D A; 3JCM e; 3VS2 A; 3QZ9 B; 1EIF A; 1W2B S; 4AFS C; 1BI2 A; 2BZY A; 4M7A E; 2RN8 A; 3A8G B; 2FO0 A; 3RMQ A; 4OP0 A; 3EGD A; 2CZ0 B; 1UUE A; 4J9H A; 4OML A; 2DKG A; 3CEY A; 5A0G A; 1J3T A; 4IUT A; 1MMA A; 3DKM A; 3E1S A; 1N5Z A; 2GF7 A; 3HP9 A; 2SRC A; 4A4K A; 1YI2 T; 4KH1 B; 2BTT A; 2E5Q A; 2YUO A; 3GP8 A; 1M1K C; 1GFC A; 2R58 A; 1PHT A; 3JSC A; 4BD3 A; 1VQ5 A; 1RI9 A; 2F2X A; 2CYZ B; 3CME Q; 3OYH A; 2CSI A; 3M0Q A; 1IZ6 A; 3RIR A; 1I81 A; 4Y28 E; 3OYG A; 1K73 C; 2DXT A; 2HKQ B; 5GJV B; 1VQ8 T; 2MWO A; 4DEY A; 1QKX A; 2MI6 A; 1WXB A; 2H8H A; 2JMA A; 4DBF A; 3G4S Q; 2QA4 A; 1U5S A; 1BKB A; 5A2Q E; 2JN0 A; 4C0F A; 2L89 A; 1C6V X; 1I4K 1; 2VAS A; 2QQB A; 4C92 D; 3CXC P; 2XI9 A; 4M77 D; 1GCQ C; 2BE7 D; 1K4U S; 3WVE B; 1KQ2 A; 2A08 A; 1H8K A; 2KYM A; 1VQK T; 1SKU B; 1SF9 A; 1Y07 A; 1Y0M A; 2MCN A; 2ATC B; 1WDX A; 2CP6 A; 5FRM A; 4EMG A; 2QYZ A; 3QJY A; 4IKF A; 4P5N A; 1PD0 A; 2JTF A; 2O9V A; 1YJ9 A; 4FT4 A; 1HJD A; 2CP2 A; 1U1T A; 2DM1 A; 3CCQ T; 3OYF A; 2HSE B; 4PJN A; 4JJN K; 4RTV A; 4JZ3 A; 1BCO A; 1VQ6 Q; 3CCL T; 4F17 A; 2R5M A; 3CCV T; 2QDY B; 1SRL A; 2XMF A; 4E2F B; 3JCM X; 1VIE A; 1XTD A; 5GAM f; 1EZZ B; 5LJ5 d; 3PMI A; 1SHG A; 1AVZ C; 4LDX A; 1JU5 C; 1YJN Q; 1UG1 A; 3S3O A; 4WF2 A; 1T0H A; 1ABO A; 1SSH A; 2CZ1 B; 2DTI A; 1TUG B; 4PJO B; 1W2B A; 1D1C A; 3E19 A; 4PJO F; 2VVK A; 4FIB A; 1Y57 A; 4L59 A; 3X24 B; 3CXC S; 1IHV A; 3MCA B; 5GAN 7; 2QTX A; 2Y4X A; 2CT3 A; 5IAY A; 2GNC A; 2YSQ A; 3CCJ T; 2DXU A; 2YLC A; 3EGD B; 1WX6 A; 4CC7 A; 4XTV A; 2PVO B; 2BZX A; 2DVJ A; 2DLP A; 1Q82 C; 2O9S A; 5I21 A; 5DM7 R; 1PKS A; 5GAN 4; 5AYF A; 2CZ6 B; 4C92 G; 4M77 G; 3JB9 I; 1VQM T; 2DL5 A; 3SD4 A; 3CCM Q; 2MWP A; 2EYW A; 2NLU A; 2HDA A; 1B34 A; 3BY7 A; 2HKN A; 1LPL A; 2PUK B; 2KT1 A; 5CIU A; 2XKO C; 1PRM C; 5HK3 A; 2JNG A; 1I07 A; 2MPX C; 3RMS A; 3KUF A; 5FWC A; 1KK7 A; 3M55 A; 1D3B A; 3OYD A; 1S1N A; 1BYM A; 3C95 A; 2KQW A; 2DYB A; 3QJ6 A; 1YWP A; 4Z88 A; 4PJO C; 3EAE A; 3JCM g; 4M78 A; 4DOW A; 4JS4 A; 3H0H A; 2ED1 A; 3EGX A; 2L5Q A; 3G7Z A; 4QKU A; 3CC7 Q; 3A1P A; 3JB9 D; 5KCO A; 3OYI A; 3RBB B; 4M75 A; 1AEY A; 1K8A R; 2I2L A; 4QQD A; 3MKD A; 4EMK A; 2FEI A; 4JPB W; 1RAD B; 3ER0 A; 3M0U A; 5DY9 A; 4PFO A; 4C92 A; 3PT9 A; 2NUP A; 2KDS A; 1VQ4 Q; 2KR3 A; 1XQH A; 4O6J A; 1QVG S; 5KYY A; 4B6M A; 1W4S A; 1HXD A; 1NPR A; 1OEB A; 3CCR A; 1UTI A; 3TCJ A; 3CC2 T; 2ENM A; 2OAU A; 1YIT Q; 2E5K A; 2NUZ A; 2L0A A; 1QKW A; 3AT1 B; 3H8Z A; 3OYJ A; 4PLI A; 2W0Z A; 2YRD A; 3CXC A; 3GNF B; 4GLK A; 2F1L A; 1PWT A; 4LXC A; 3Q1J A; 1WHL A; 2X3X D; 2IPO B; 5KYU A; 5HY6 A; 1RAI B; 5AT1 B; 4AT1 B; 4OB2 B; 1WQ7 A; 2HNI A; 3QHS A; 1NLO C; 1YNZ A; 2HBW A; 4ZGD B; 4XTZ A; 3QSU A; 3OYK A; 5LJ3 d; 1RLP C; 2RHZ A; 5GAO n; 1QCN A; 5I22 A; 1N9S A; 2LNH B; 5LJ3 e; 1BI3 A; 1YI2 A; 1HK9 A; 2DIG A; 5L23 A; 4BDY A; 3NFC A; 3MJX A; 2COZ A; 4FYY B; 3MET A; 1NM7 A; 1AWO A; 3OS2 A; 1X6B A; 4RTY A; 2QQ9 A; 1PNJ A; 1AT1 B; 4PK4 A; 3V8J A; 4VUB A; 5CKB A; 2VYT A; 5IH2 A; 2LCS A; 1QWF A; 1KD1 R; 1VQO Q; 5EC7 A; 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