The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
59
|
structure length |
59
|
Chain Sequence |
MEAIAKHDFSATADDELSFRKTQILKILNMEDDSNWYRAELDGKEGLIPSNYIEMKNHD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural Comparison of the Unstable drkN SH3 Domain and a Stable Mutant
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
SH2-SH3 adapter protein drk
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Drosophila melanogaster
|
| total genus |
6
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-09-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LZ6 B; 2NWM A; 2RF0 A; 3KFV A; 2LQW A; 3REA B; 2P4R A; 3EHQ A; 1WI7 A; 2CSQ A; 5ECA A; 1EFN A; 1WA7 A; 1NYG A; 1G83 A; 1W1F A; 1GFD A; 2AK5 A; 2VVK A; 2EGA A; 2XMF A; 4AG1 C; 1SRM A; 2CUB A; 1I07 A; 1U5S A; 2DA9 A; 2J6O A; 5IHI A; 2EYX A; 3M0U A; 2F2V A; 4Z8A A; 1AVZ C; 2EPD A; 1B3Q A; 2GQI A; 2GTO A; 3EG1 A; 4J9E A; 1WIE A; 4OMN A; 1UGV A; 2FPE A; 2SRC A; 2MOX A; 1X6G A; 1ZUK A; 2HSP A; 1W70 A; 2L2P A; 2M51 A; 2DMO A; 1M3A A; 1MV3 A; 2EKH A; 4IIM A; 4HCK A; 2A08 A; 2JTE A; 3NGP A; 5FW9 A; 2GBQ A; 1GCP A; 1HJD A; 1H8K A; 4J9H A; 4FSS A; 2L3Q A; 2KYB A; 3EGU A; 4Z89 A; 3NPF A; 2G6F X; 1Z9Z A; 2DL8 A; 1KIK A; 3EHR A; 2KR3 A; 2DLP A; 2X3X D; 4J9G A; 4JZ3 A; 2C0O A; 1AD5 A; 2D1X A; 3UF4 A; 1X43 A; 4WCI A; 4JJD A; 3EG2 A; 5GJV B; 2ABL A; 4GBQ A; 1KFZ A; 1UFF A; 1YN8 A; 3REB B; 1YWP A; 3ZL7 C; 1PRM C; 1M3C A; 1PRL C; 2AZV A; 4JPB W; 1ARK A; 1RUW A; 1B07 A; 1PHT A; 1HSQ A; 2J06 A; 5IHN A; 4J9B A; 3THK A; 1JXM A; 2DJQ A; 4DEX A; 2RQU A; 1E6G A; 2IIM A; 4CC2 A; 2SEM A; 1CKA A; 2M0Y A; 2O88 A; 2HEQ A; 2LP5 A; 1OPL A; 1T0H A; 1BK2 A; 4F17 A; 2DBK A; 5I11 A; 1QWF A; 2CRE A; 4RTU A; 2B86 A; 4JJB A; 3M0P A; 1N5Z A; 2ED0 A; 2O9S A; 2RQW A; 3QWX X; 2A37 A; 2K6D A; 4OML A; 3GBQ A; 1VYT A; 4QT7 A; 1SPK A; 1X69 A; 2J6F A; 1H3H A; 2FEI A; 2RNA A; 4CC3 A; 1S1N A; 2J05 A; 1BU1 A; 2KRO A; 1ZUU A; 2JT4 A; 2KYM A; 4HXJ A; 3VS4 A; 1YNZ A; 1YP5 A; 4J9D A; 1SHF A; 3FJ5 A; 2F2W A; 2EW3 A; 1K0X A; 1X27 A; 3PVQ A; 2DX1 A; 1HD3 A; 2I0N A; 1LCK A; 1IO6 A; 1ZLM A; 1U3O A; 2FRW A; 3C0C A; 2KXC A; 1I1J A; 2D0N A; 4J9C A; 3SHW A; 1UUE A; 5GJW B; 2EYZ A; 2KRN A; 3VS0 A; 4KRT A; 2JXB A; 1WXU A; 1AOJ A; 4CC4 B; 4DEY A; 2L0A A; 3VS3 A; 4LN2 A; 1ZX6 A; 1SSH A; 1YWO A; 1OEB A; 3JV3 A; 1BB9 A; 4ZNX A; 1UHC A; 2F2X A; 2O2O A; 3SEM A; 2AKL A; 1NM7 A; 3VRZ A; 4JZ4 A; 1J3T A; 1Z9Q A; 1XOV A; 2LJ0 A; 2CH4 W; 2KGT A; 1SEM A; 1UTI A; 2JM8 A; 2ED1 A; 1GCQ A; 1MV0 B; 4JJC A; 3H0H A; 3ULR B; 2CT3 A; 1M8M A; 4RTV A; 2DM1 A; 4OMP A; 3R6N A; 2KXD A; 1NEB A; 2FG0 A; 1JU5 C; 1M3B A; 1KSW A; 4D8K A; 3IQL A; 1FYN A; 1NLO C; 4EIK A; 4J9I A; 2E5K A; 1QWE A; 3M0Q A; 4R0K A; 3UA7 A; 2J7I A; 2RPN A; 1AWJ A; 2D8J A; 4LE9 A; 1RLP C; 2KRS A; 4HVU A; 1UG1 A; 2DL5 A; 2CH4 A; 1V1C A; 4RTW A; 4CC7 A; 2HBW A; 4J9F A; 2EBP A; 3M0T A; 2DRM A; 4RTY A; 1VA7 A; 1AEY A; 1GL5 A; 2GGR A; 1CKB A; 2VWF A; 1QCF A; 3CQT A; 3VRY A; 3TSW A; 4OMO A; 3H0I A; 2MCN A; 1QKW A; 2K7A A; 2YUP A; 1GBQ A; 2O31 A; 4M4Z A; 2O9V A; 2ENM A; 1SRL A; 1PKT A; 3LH5 A; 2RQV A; 1K4U S; 1YCS B; 1JQQ A; 2OI3 A; 1T0J A; 1AWX A; 2DIL A; 2OJ2 A; 5IXB A; 4ORZ A; 1OOT A; 2YSQ A; 2FPD A; 2BZX A; 3M0R A; 3VS6 A; 2CT4 A; 2W10 A; 2EGE A; 2MIO A; 1A0N B; 1SHG A; 2KEA A; 2H8H A; 2JW4 A; 1NEG A; 3O5Z A; 2DNU A; 1JEG A; 2JMA A; 5HCK A; 3I5R A; 3VS1 A; 1UE9 A; 4RUG A; 1BBZ A; 4AFU C; 1MUZ A; 2DF6 A; 1OPK A; 3RNJ A; 2X3W D; 1WYX A; 3PVL A; 1ZSG A; 3I9Q A; 2RN8 A; 2KT1 A; 2PZ1 A; 1H92 A; 4AFZ C; 1UEC A; 2DE0 X; 5I22 A; 2LCS A; 1RI9 A; 1TG0 A; 4X1V A; 2BTT A; 2EGC A; 1UHF A; 4GLM A; 1NLP C; 5IXF A; 2QDL A; 2FO0 A; 3TVT A; 1K1Z A; 1TUC A; 2RMO A; 1ABQ A; 1JXO A; 4LNP A; 1PWT A; 2FRY A; 2AZS A; 1VYU A; 1OV3 A; 2NUZ A; 1JO8 A; 1AZE A; 3A98 A; 1PKS A; 1GCQ C; 4F16 A; 1GBR A; 1E7O A; 2AKK A; 2BZY A; 3VS2 A; 4K11 A; 3QWY A; 4D8D A; 1QKX A; 2C0I A; 1Y57 A; 4OMQ A; 2DVJ A; 1WX6 A; 1NG2 A; 1UJY A; 3VS5 A; 2RQT A; 2V1Q A; 2ROL A; 3NMZ C; 5FWC A; 4LUD A; 1NYF A; 1WXT A; 4RTT A; 3H41 A; 4A63 B; 2JM9 A; 1KJW A; 2LJ3 A; 1W6X A; 1RLQ C; 2KBT A; 1AZG B; 1T3L A; 2EQI A; 1GRI A; 2LX7 A; 2ROT A; 2C0T A; 2PNI A; 2LJ1 A; 1X2Q A; 4AG2 C; 3EG0 A; 2DL4 A; 1GFC A; 2K2M A; 3PE0 A; 2DL7 A; 1UDL A; 1K0S A; 4ESR A; 2K79 A; 2EYW A; 1QLY A; 1I0C A; 1K9A A; 2CDT A; 1E6H A; 2K3B A; 2ESW A; 3U23 A; 4F14 A; 1WFW A; 1WDX A; 2CUD A; 1M27 C; 3UA6 A; 4HVV A; 2CSI A; 2KRM A; 2OAW A; 2JS0 A; 5EC7 A; 2DYB A; 2RQR A; 2LNH B; 2A28 A; 2L3S A; 4HVW A; 5IHK A; 1ZBJ A; 2DBM A; 1UJ0 A; 4OMM A; 4RTZ A; 3H0F A; 4RTX A; 3I35 A; 3VS7 A; 3EG3 A; 2PTK A; 1FMK A; 2KE9 A; 2YT6 A; 1ABO A; 4LUE A; 2D8H A; 3NHN A; 1WXB A; 2GNC A; 3M0S A; 2GTJ A; 1U06 A; 2HDA A; 4Y92 A; 2FPF A; 3TSZ A; 2YDL A; 2J6K A; 2KT8 A; 2W0Z A; 4Z88 A; 2EVR A; 3UAT A; 4E6R A; 4AFQ C; 1K76 A; 2BZ8 A; 1VYV A; 1TUD A; 1T3S A; 1Y0M A; 3RBB B; 1PNJ A; 2VKN A; 2L3P A; 1ZUY A; 4IIO A; 2A36 A; 2YUN A; 2JMC A; 1M30 A; 3I5S A; 2K9G A; 2JS2 A; 5IH2 A; 2HCK A; 2YUQ A; 2YUO A; 1G2B A; 2EYY A; 1X6B A; 2KNB B; 2DL3 A; 2LQN A; 1WLP B; 2V1R A; 5FWB A; 2DRK A; 1AWO A; 1AWW A; 2LMJ A; 1X2K A; 4AFS C; 1CSK A; 5L23 A; 2ECZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2LX9 A; 3OW2 P; 3TU4 K; 1G83 A; 2AK5 A; 1EZZ B; 2RJE A; 2E12 A; 3M59 A; 2J6O A; 3CCQ T; 4NL3 A; 4M77 G; 1LPL A; 1D0X A; 2DPP B; 3NTH A; 3CCV A; 2GQI A; 4M78 F; 3VUZ A; 3PMT A; 2L8D A; 3CCM T; 2FPE A; 4L59 A; 4XU1 A; 5KYW A; 3FDR A; 4C92 G; 3RKW A; 2L2P A; 1NZ9 A; 3RKX A; 2XG8 D; 4Q5W A; 4C0G A; 3OYJ A; 2EKH A; 4HCK A; 2A08 A; 2HQE A; 2E10 A; 2M1H A; 2L3Q A; 3EGU A; 4Z89 A; 3OYN A; 3H6Z A; 2C06 A; 4M77 A; 1OI1 A; 2DL8 A; 3JAM E; 2RH2 A; 2KR3 A; 2DLP A; 4PJO F; 2COW A; 4LDX A; 5GAO m; 2NUT B; 1AD5 A; 3OSS C; 3UF4 A; 4WCI A; 2L3R A; 4JJD A; 1YJN A; 4B9X A; 2H3J A; 1KFZ A; 4C92 A; 1YN8 A; 4X9D A; 1Q7Y C; 1VQ5 A; 3EFR A; 1M3C A; 1HXD A; 3X20 B; 2VAS A; 3I55 A; 1QVF P; 1D1A A; 2WSF E; 4J9B A; 5AYF A; 2RHX A; 3BW1 A; 2BE9 B; 2ZPG B; 2F5T X; 5KE2 A; 1WHL A; 1YI2 T; 2XU8 A; 4OB2 B; 2RHI A; 4ATO A; 2D6F A; 5GAN f; 2IIM A; 1VQ7 T; 1BCO A; 3S6W A; 1CKA A; 2CZ0 B; 5HY6 A; 2DKG A; 2DBK A; 1YJW Q; 4A54 A; 1UGP B; 2CRE A; 1X01 A; 3EH1 A; 2XD0 A; 4M7A G; 3WVE B; 3M0P A; 5HKC A; 3JCM b; 3QWX X; 3JCM g; 3NFC A; 4M78 A; 4OML A; 4ZGJ B; 1UGR B; 4O6J A; 1SPK A; 5GAN 7; 1X69 A; 2VYT A; 1LOJ A; 1H3H A; 5GAN 6; 2FEI A; 3EGD A; 2RNA A; 1UEB A; 5FRM A; 2DVE A; 4CC3 A; 2KRO A; 3LWH A; 4FCY A; 2QQ9 A; 3SWN A; 3VS4 A; 3X25 B; 1SG5 A; 1YNZ A; 3P8H A; 4J9D A; 1SHF A; 2F2W A; 3CC2 A; 2WAC A; 5GAM e; 1X27 A; 3CBO A; 1Q82 R; 1IO6 A; 1U3O A; 2FRW A; 3C0C A; 4J6X A; 2KXC A; 3CCV Q; 3EAE A; 5LJ5 h; 2M9U A; 2BIV A; 3DLM A; 5GAO l; 3FEO A; 4M7A A; 2F1L A; 2KRN A; 2QGG A; 3SD4 A; 2JOY A; 4KRT A; 2JXB A; 4IUP A; 4CC4 B; 4DEY A; 1BIA A; 1XNI A; 4C92 B; 1YWO A; 1OEB A; 4QVC A; 4JRK A; 4ZNX A; 2F2X A; 2O2O A; 2AKL A; 3PIP A; 1J3T A; 2G3R A; 1YHQ T; 5GAN d; 1YIT T; 4ELZ C; 1FXX A; 4KGX B; 3JCM Q; 4ZN3 A; 4JRQ A; 3OYD A; 2CH4 W; 1SEM A; 1UTI A; 5C6S A; 2ED1 A; 2P0Q A; 5IAY A; 2YXY A; 3LGF A; 4C92 D; 1YJN Q; 1VQK T; 4HT8 A; 4QVZ A; 1C6V X; 3IQL A; 2R58 A; 4BD3 A; 2AIR B; 4XU0 A; 1VQ5 Q; 1MMD A; 2E5K A; 1QWE A; 4FIB A; 2K2V A; 2J7I A; 3FJP A; 4AMC A; 1BIB A; 1Q86 U; 4PLL A; 2DZ9 A; 4M78 B; 2QI2 A; 2A0F B; 3I55 Q; 1W2B P; 2RB6 A; 3F70 A; 3EFS A; 4HVU A; 3SFM A; 1V1C A; 1WJR A; 1R77 A; 2BE7 D; 2JNG A; 1N6A A; 2FZK B; 1JRI A; 5KE3 A; 2DET A; 1GL5 A; 2VWF A; 4M78 D; 1QCF A; 3CQT A; 3TSW A; 3VRY A; 3S3M A; 1KQ2 A; 2YRC A; 2MCN A; 1BI0 A; 2X4J A; 4XTV A; 4PJO B; 2O9V A; 2ENM A; 3LH5 A; 2RQV A; 1ZSZ B; 5IXB A; 3R6O A; 5KYY A; 1SF9 A; 3VYH B; 2BZX A; 3M0R A; 2OAU A; 2V8I A; 2MIO A; 3CC2 Q; 1K9M C; 1SHG A; 1PD0 A; 1D1C A; 4KUI A; 3RUX A; 2DNU A; 4BDZ A; 3WVD B; 2XDP A; 2DXC A; 4PJO D; 1MND A; 1MUZ A; 3X26 B; 4HA8 A; 4PJJ A; 2DF6 A; 1JJ2 S; 1MGQ A; 7AT1 B; 1VQ4 A; 1H92 A; 3L2Q A; 4J5Y A; 1UEC A; 5I22 A; 5LJ3 f; 1RI9 A; 3A8L B; 3I56 T; 2FB7 A; 5CO7 A; 5IXF A; 2QDL A; 5KYX B; 2LT1 A; 1KD1 C; 1ABQ A; 1JXO A; 4PFP A; 4LNP A; 1N8R C; 2AZS A; 1M2O A; 3C4S A; 1VYU A; 4XTX A; 3A98 A; 4F16 A; 3OYC A; 1GBR A; 1VQ6 A; 5GAO q; 3VS2 A; 3BDL A; 4K11 A; 4BAC A; 1M2V A; 2HL3 A; 2L89 A; 4D8D A; 5GAN 4; 1Y57 A; 2QEX T; 3CCL T; 1UJY A; 3HPW A; 4C5E A; 2RQT A; 1PD1 A; 3GP8 A; 1OQK A; 2A3L A; 5GAN g; 1VQL T; 3H41 A; 2CP6 A; 1D09 B; 1VQM A; 4PNO A; 1KJW A; 1XJW B; 1WZO A; 4A53 A; 3PMI A; 1I5L A; 4R55 A; 1Q95 G; 3QJY A; 2EQI A; 3DKM A; 4D6W A; 5KYY B; 3MP6 A; 2ROT A; 2E41 A; 3CC7 A; 3CCS A; 3HFN A; 2K5F A; 1C1A A; 2LC4 A; 4MZM A; 1RAG B; 9ATC B; 5CKB A; 5FU6 B; 5GMK j; 3G71 T; 5LJ3 d; 1WFW A; 3GF5 A; 2CUD A; 2VC8 A; 3UA6 A; 4M75 F; 2F69 A; 2HKN A; 2KRM A; 3OS5 A; 2JS0 A; 1V76 A; 4QQG A; 1RL2 A; 5L8R E; 4HVW A; 1OU9 A; 3LW5 E; 4F7U G; 5D6Y A; 5CKH A; 4M7D C; 2MI6 A; 2EAY A; 4C5I A; 2V26 A; 4RTZ A; 3P8D A; 3EG3 A; 1NBE B; 1M4Z A; 4BB7 A; 4CRI A; 1KC8 U; 3G4S A; 1WPY A; 2X51 A; 2CGH A; 3JCM P; 4NS5 A; 4J8O A; 4Y92 A; 2FPF A; 3QZ9 B; 2NYS A; 1VQ4 Q; 3UAT A; 4RCC A; 4E6R A; 3QYG B; 4F7U A; 1NJI C; 1VQN T; 2VXE A; 1LNX A; 1Y0M A; 4FW1 A; 3CCR T; 2DZC A; 3OMG A; 2VKN A; 3M5A A; 5GAO r; 2EFI A; 5EG2 A; 1AHJ B; 1OX9 A; 4FYX B; 1QW1 A; 2DXU A; 2K9G A; 5FU7 C; 3HP9 A; 2JVV A; 2AT1 B; 1VQ6 Q; 4BY6 B; 4PFO A; 2DRK A; 1AWO A; 1X2K A; 2CP3 A; 2FHD A; 2P4R A; 3CCE A; 1WI7 A; 1MMA A; 1WA7 A; 1NYG A; 3QJ6 A; 1H64 1; 5D6W A; 2DFU A; 3JB9 J; 1VQM Q; 2VVK A; 2EGA A; 4AG1 C; 4DQ2 A; 4MMK A; 2XID A; 3D7S B; 2DA9 A; 4FYW B; 3OYI A; 2EYX A; 3M0U A; 4XK8 E; 1UGS B; 4KUD K; 5A0G A; 2IG0 A; 2JTM A; 3EFO A; 3CCS Q; 2GTO A; 3CC7 Q; 1YFN A; 2GQV A; 1OU8 A; 1WIE A; 1UGV A; 2SRC A; 3JCM f; 2B8A A; 2MK5 A; 1VQO Q; 2E65 A; 1W70 A; 2M51 A; 1M3A A; 3E9F A; 1MV3 A; 3N5B B; 3NTK A; 2XDD A; 1CSK A; 1HJD A; 2E6Z A; 2K3Y A; 4C0D B; 1U1S A; 4J9G A; 1UB4 A; 3UDC A; 2C0O A; 4DBQ A; 3C94 A; 4ZGD B; 3EG2 A; 4PFZ A; 1D1B A; 4GBQ A; 1UFF A; 5LJ3 g; 2CP5 A; 1YWP A; 4M7D G; 3GLX A; 4JS4 A; 4BI3 A; 3OYH A; 3G4S Q; 3CPW S; 1RUW A; 1FMV A; 4X34 A; 4E7I A; 3DB4 A; 4GY5 A; 3OYB A; 4KBM B; 2EIF A; 4E7L A; 2J06 A; 1YJ9 A; 1M1K R; 1JJ2 A; 3V7C A; 4DEX A; 2NLU A; 1E6G A; 2DEU A; 4M77 F; 4FT2 A; 3JCM d; 2DTO A; 3A8G B; 3CD6 T; 4M75 B; 1YJW T; 4LXC A; 5I11 A; 5IT9 E; 4NOY A; 2B86 A; 4M7D A; 2QA4 A; 3EGX B; 3A5Z B; 2K6D A; 3JB9 G; 3GBQ A; 1VYT A; 4EMK C; 4QT7 A; 1Q82 U; 1WGS A; 2J6F A; 2KDS A; 1Y07 A; 3LWI A; 1Q81 U; 1S1N A; 1O9S A; 1ZUU A; 4C8Q E; 5KCH A; 3QDR B; 1BI2 A; 5LJ5 e; 1Y96 B; 2A7Y A; 4M75 D; 1M8V A; 2MMP A; 3PVQ A; 3LX7 A; 1HD3 A; 1LCK A; 5HK3 A; 1ZLM A; 2RK2 A; 2D0N A; 3G6E A; 2M16 A; 1UUE A; 5GAO n; 1AT1 B; 3DLL A; 1Q86 C; 2COY A; 4GLK A; 4MDX A; 2E1H A; 1WXU A; 1RAC B; 1QVP A; 4LN2 A; 1ZX6 A; 4ELY C; 5KCO A; 3E9G A; 1XOV A; 3JCM X; 5GAM j; 2ZCF B; 2LDM A; 4QQD A; 5GAO p; 2GFA A; 3BY7 A; 3J81 E; 1KQS S; 1G3W A; 4FT4 A; 1GCQ A; 1VIF A; 3MEV A; 2YLB A; 3ULR B; 1EIF A; 2M02 A; 4RTV A; 1QMC A; 3R6N A; 1YJN T; 2FG0 A; 4M7A F; 2IVW A; 2XIC A; 1FYN A; 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