The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
59
|
structure length |
59
|
Chain Sequence |
MEAIAKHDFSATADDELSFRKTQILKILNMEDDSNWYRAELDGKEGLIPSNYIEMKNHD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural Comparison of the Unstable drkN SH3 Domain and a Stable Mutant
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
SH2-SH3 adapter protein drk
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Drosophila melanogaster
|
| total genus |
6
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-09-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KEA A; 2ROL A; 2DBM A; 4AFZ C; 2V1Q A; 2F2V A; 3ZL7 C; 2XMF A; 2B86 A; 1X43 A; 4JZ4 A; 2A08 A; 3C0C A; 2EYY A; 2BTT A; 1EFN A; 3H0F A; 4Z8A A; 4HVV A; 3R6N A; 1U3O A; 2A36 A; 2EYX A; 3RBB B; 2DVJ A; 1Z9Q A; 1GFC A; 1G83 A; 3EHR A; 1E6H A; 4LN2 A; 1NEB A; 1K0S A; 2D8H A; 1X2Q A; 1JEG A; 1AZG B; 2FPE A; 2LX7 A; 4AG2 C; 2LP5 A; 2DL3 A; 4OMO A; 3UF4 A; 1RLQ C; 3EG1 A; 3VS0 A; 1UJ0 A; 1X6B A; 4JJB A; 3LH5 A; 3EG2 A; 1YNZ A; 2BZX A; 1WLP B; 2SRC A; 2C0O A; 4HVW A; 4IIM A; 2JS2 A; 1S1N A; 3VS4 A; 2W10 A; 4JJD A; 2OI3 A; 2PZ1 A; 2DL8 A; 4J9D A; 2KBT A; 2CT4 A; 1JU5 C; 3PVL A; 2DMO A; 4J9I A; 1JXM A; 3RNJ A; 2X3X D; 4JPB W; 2PTK A; 4F16 A; 1H8K A; 1PRL C; 1KJW A; 1AWW A; 2JXB A; 1UG1 A; 1OV3 A; 3NHN A; 4OMM A; 4RTT A; 4CC7 A; 3I5S A; 1ZSG A; 1UTI A; 3O5Z A; 2P4R A; 1K0X A; 2AKL A; 1AWX A; 1UGV A; 1X27 A; 2KRM A; 4J9H A; 4OML A; 3M0T A; 1LCK A; 1QKX A; 2CUD A; 1ARK A; 1M27 C; 5HCK A; 2VWF A; 2NUZ A; 2I0N A; 2ED0 A; 4LNP A; 2LQW A; 2O9V A; 3REA B; 4D8D A; 2D0N A; 1AZE A; 2EGC A; 2CH4 W; 2M0Y A; 2ESW A; 1IO6 A; 1HD3 A; 1T0H A; 4CC4 B; 2KE9 A; 1VA7 A; 2YDL A; 3TSZ A; 2J6O A; 1MV0 B; 2J06 A; 4Z89 A; 1UHC A; 3THK A; 2LJ3 A; 2VVK A; 1PKT A; 2DL7 A; 1HSQ A; 2O88 A; 2K79 A; 2RNA A; 3VS1 A; 1FYN A; 4FSS A; 2CUB A; 4IIO A; 2DL5 A; 3UAT A; 2J6K A; 4JZ3 A; 2LJ1 A; 4GBQ A; 1YP5 A; 1PHT A; 1BU1 A; 2PNI A; 2RQR A; 1QLY A; 2DL4 A; 2G6F X; 3FJ5 A; 4M4Z A; 2EQI A; 2FPF A; 3I35 A; 1CKA A; 1SEM A; 2KRS A; 1GRI A; 3H41 A; 1ZBJ A; 4LUD A; 4R0K A; 4F17 A; 4OMP A; 4RTU A; 1QWE A; 1E7O A; 1Z9Z A; 1UUE A; 2OAW A; 5IXF A; 2KXD A; 4CC3 A; 2HSP A; 5FWB A; 4RTX A; 3GBQ A; 3QWY A; 1QWF A; 1WXB A; 1WXU A; 1WYX A; 2ED1 A; 1A0N B; 1GBQ A; 1M30 A; 3JV3 A; 2YUO A; 2KYB A; 2D8J A; 1GCQ A; 1AVZ C; 3SEM A; 4AG1 C; 1UJY A; 1X69 A; 2O31 A; 5GJW B; 1HJD A; 1JXO A; 1I07 A; 2DRK A; 2D1X A; 4RTZ A; 1WI7 A; 1W6X A; 1TG0 A; 2YSQ A; 1WXT A; 2LQN A; 2V1R A; 2X3W D; 2JS0 A; 4F14 A; 1B3Q A; 1NYG A; 2DBK A; 2GBQ A; 2J05 A; 5FWC A; 3NMZ C; 4GLM A; 5IXB A; 2LJ0 A; 2RMO A; 2LCS A; 1K1Z A; 1WA7 A; 1YWP A; 3EG3 A; 1Y0M A; 1H92 A; 1M8M A; 4OMQ A; 2FRY A; 4RTV A; 5I22 A; 3CQT A; 3IQL A; 3VS3 A; 3M0R A; 1TUD A; 2L3S A; 2W0Z A; 1V1C A; 1Y57 A; 4RTW A; 1X2K A; 2KT8 A; 1SHF A; 1GL5 A; 2ABL A; 1M3B A; 4E6R A; 4X1V A; 4CC2 A; 2FG0 A; 1AEY A; 2E5K A; 1GCQ C; 1OOT A; 2A37 A; 1NLP C; 4J9B A; 1MV3 A; 3REB B; 1KFZ A; 1PRM C; 2EW3 A; 2L2P A; 3U23 A; 1KIK A; 1NG2 A; 3H0H A; 1ZLM A; 4ZNX A; 1ABO A; 3UA7 A; 3QWX X; 4K11 A; 2MOX A; 1XOV A; 3NGP A; 2KR3 A; 2J7I A; 2KXC A; 2LMJ A; 2KGT A; 4OMN A; 2YUQ A; 2DLP A; 3VS5 A; 1AD5 A; 1WDX A; 4Y92 A; 2EBP A; 2CDT A; 4ORZ A; 1G2B A; 2BZ8 A; 1SPK A; 2GQI A; 1BBZ A; 2FRW A; 1OPK A; 2LNH B; 2GGR A; 4ESR A; 4AFS C; 1GCP A; 1QKW A; 3EGU A; 1NYF A; 2C0I A; 2AKK A; 1RUW A; 1YCS B; 2DE0 X; 2EGE A; 1SRM A; 2ECZ A; 2YT6 A; 2JMA A; 3ULR B; 4DEY A; 2KRO A; 1ABQ A; 5EC7 A; 3VS7 A; 1H3H A; 2JMC A; 1WIE A; 2CH4 A; 1MUZ A; 4AFQ C; 2K3B A; 4J9E A; 4J9G A; 2GTJ A; 2CRE A; 2JM8 A; 4RTY A; 2F2X A; 3UA6 A; 2EVR A; 3H0I A; 3I9Q A; 3I5R A; 3NPF A; 2F2W A; 1B07 A; 2AZV A; 2DIL A; 2FEI A; 1CKB A; 2JM9 A; 2ROT A; 1AWO A; 3TVT A; 2HCK A; 1T3S A; 4WCI A; 2RN8 A; 3VS2 A; 2FO0 A; 1VYT A; 1WX6 A; 2HEQ A; 2M51 A; 1UEC A; 2CT3 A; 2HBW A; 3EG0 A; 1FMK A; 5L23 A; 1VYV A; 2O9S A; 2EKH A; 2K9G A; 1OPL A; 5IHN A; 2OJ2 A; 2L0A A; 4KRT A; 5IHI A; 1NM7 A; 1K9A A; 1T3L A; 2AK5 A; 2RPN A; 2DRM A; 1ZUY A; 3M0S A; 2EYZ A; 5IHK A; 2K6D A; 2K7A A; 1UDL A; 2KNB B; 4HVU A; 2KRN A; 2SEM A; 4HCK A; 5I11 A; 5GJV B; 2YUP A; 1NEG A; 4J9C A; 1M3A A; 1TUC A; 2KYM A; 2RF0 A; 1UHF A; 1E6G A; 3PE0 A; 2JTE A; 2MIO A; 1U06 A; 2CSI A; 2KT1 A; 2GNC A; 2RQW A; 1VYU A; 4QT7 A; 1OEB A; 1U5S A; 2FPD A; 1BK2 A; 2DX1 A; 1ZUU A; 1M3C A; 1X6G A; 1PNJ A; 2YUN A; 1PKS A; 1YN8 A; 1WFW A; 4J9F A; 4A63 B; 2IIM A; 1QCF A; 1UE9 A; 2LZ6 B; 4LUE A; 2JT4 A; 2K2M A; 4HXJ A; 5IH2 A; 3TSW A; 2DJQ A; 2NWM A; 3A98 A; 2L3Q A; 1SHG A; 1YWO A; 3VRY A; 2DF6 A; 2J6F A; 1GFD A; 4D8K A; 2DM1 A; 2MCN A; 1ZX6 A; 3VRZ A; 2RQU A; 1T0J A; 2EPD A; 2H8H A; 4DEX A; 2AZS A; 2C0T A; 1JO8 A; 2JW4 A; 2EYW A; 2DNU A; 4JJC A; 2VKN A; 1K76 A; 1ZUK A; 3KFV A; 5FW9 A; 3EHQ A; 1W1F A; 3M0Q A; 1GBR A; 4AFU C; 1AWJ A; 3M0P A; 3M0U A; 1PWT A; 2DA9 A; 3VS6 A; 2BZY A; 1RLP C; 1I0C A; 4EIK A; 2O2O A; 1W70 A; 1J3T A; 1NLO C; 2RQT A; 2RQV A; 1KSW A; 1I1J A; 1BB9 A; 2HDA A; 2DYB A; 2QDL A; 1JQQ A; 4LE9 A; 1CSK A; 1SSH A; 1K4U S; 1SRL A; 2GTO A; 3PVQ A; 2ENM A; 2A28 A; 3SHW A; 1N5Z A; 2L3P A; 1UFF A; 2CSQ A; 1RI9 A; 4Z88 A; 1AOJ A; 4RUG A; 2EGA A; 5ECA A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3ME9 A; 3P8B B; 2DXB A; 3OYB A; 4IUT A; 4JZ4 A; 2A08 A; 4N0A A; 3VKI A; 2QGF B; 4X9C A; 1MMD A; 4EMG A; 1K9M U; 1SG5 A; 2BTT A; 1VQ5 Q; 1RAF B; 4HVV A; 1U3O A; 4OB1 B; 1M1K R; 3RBB B; 3JB9 F; 1YIJ T; 1GFC A; 3OYG A; 3EHR A; 2XDP A; 3WVE B; 2G3R A; 1M2V B; 4M7A C; 3CPW A; 2ZCF B; 2D8H A; 1AZG B; 5GAN 8; 3MHX A; 5CVI A; 2LP5 A; 3UF4 A; 2YRC A; 3EG1 A; 1Q86 C; 1Q95 G; 2E65 A; 1I8F A; 3EG2 A; 2BZX A; 1WLP B; 3JCM h; 1MMN A; 2KDS A; 2SRC A; 4PJO B; 4HVW A; 4M7D G; 2W10 A; 3TCJ A; 2HQX A; 2OI3 A; 3OYE A; 3L2U A; 2KBT A; 2DEU A; 1YFN A; 1YI2 A; 2DMO A; 3HSB A; 5LJ3 h; 4YTL A; 3ZFJ A; 2X4X A; 3RKX A; 4AMC A; 3OYM A; 3OS1 A; 2FYK A; 1H8K A; 3A8M B; 1OV3 A; 5KYY A; 1TTH B; 1V76 A; 3CXC P; 3EFO B; 4OMM A; 2E10 A; 3I5S A; 3JCM b; 2P4T A; 3O5Z A; 3SB2 A; 2P4R A; 1K0X A; 1AWX A; 1X27 A; 3QII A; 4J9H A; 4NL3 A; 2YXY A; 1U1S A; 2VGM A; 3CCV Q; 3OW2 A; 2DZ9 A; 3EFR A; 4XU3 A; 1TUG B; 2NUZ A; 1AZE A; 4D8D A; 2D0N A; 3JB9 G; 2E3H A; 1D0Z A; 4XTV A; 3VV0 A; 3EGD B; 1HD3 A; 4CC4 B; 2KAF A; 3JB9 J; 2CP7 A; 1V29 B; 2M9U A; 4MZT A; 2J6O A; 4Z89 A; 4V2S A; 4C92 D; 1Y71 A; 2MF2 A; 2LJ3 A; 2M16 A; 3ER0 A; 2R5M A; 3E2U A; 1VQO A; 4LD9 K; 1IHV A; 3VS1 A; 1ZQ1 A; 4FSS A; 1RAD B; 1QVF P; 1BKB A; 5GAO l; 4JZ3 A; 2RHI A; 3I56 A; 3CCR A; 1KQS S; 5LJ3 e; 4PFZ A; 1QLY A; 2DL4 A; 2G6F X; 4M4Z A; 2EQI A; 2DTI A; 4OB0 B; 2QQB A; 5GAN f; 3FC3 A; 2JTF A; 5I2S A; 3EGX A; 5EG2 A; 1WHJ A; 3MEA A; 3HRU A; 1QVG A; 3H9N A; 1WXU A; 1WJR A; 3FEO A; 3JV3 A; 2ZPH B; 4M7D B; 1PD0 A; 4X34 A; 4HA8 A; 4RG2 A; 4DBR A; 2KVQ G; 1TS9 A; 5GJW B; 1HJD A; 1JXO A; 3CCM Q; 3CCV T; 2XDD A; 1I07 A; 2D1X A; 4L6V 5; 5KE3 A; 4WF2 A; 5KH6 A; 2LQN A; 4M75 E; 1NYG A; 2BUD A; 3S6W A; 2GBQ A; 1KHC A; 3OMG A; 2OTJ A; 2OTL Q; 1JJ2 S; 1WA7 A; 1K1Z A; 1YWP A; 1UGS B; 1Y0M A; 2LT1 A; 1H92 A; 4IUP A; 2D6F A; 3IQL A; 3MJX A; 3VS3 A; 4ANJ A; 4M7A E; 2W0Z A; 1Y57 A; 4E2F B; 4N0A C; 4QW2 A; 2DIQ A; 2CP6 A; 3OYL A; 1Y96 A; 2EJG A; 3LH0 A; 3QBY A; 1GL5 A; 3CCQ Q; 3HL8 A; 2EFI A; 4HKE A; 1K8A U; 3L2R A; 2E5K A; 3MCA B; 2DAQ A; 3M56 A; 3KUF A; 2A37 A; 1NLP C; 2HD0 A; 5FU7 C; 4MDX A; 2IG0 A; 1ZA2 B; 1Y07 A; 1NJI R; 1NG2 A; 5DM7 R; 4BE0 A; 3QWX X; 2QYZ A; 2MOX A; 4FM4 B; 2KR3 A; 2J7I A; 3VUZ A; 3C95 A; 4VUB A; 2YUQ A; 1XJW B; 2FZK B; 2DLP A; 3I55 Q; 5LJ3 d; 1O75 A; 2O4X B; 4C92 C; 4B9W A; 3VU3 C; 4LD6 A; 2A7Y A; 4M77 G; 2BZ8 A; 2PU9 B; 3CCU Q; 4OB2 B; 4FCY A; 3CXC A; 1KQ2 A; 1OPK A; 5C6S A; 5CKF A; 4XTW A; 4AFS C; 3EGU A; 3CCM T; 1NYF A; 3M9Q A; 3SD4 A; 3HFN A; 5J3B A; 2DE0 X; 2GF7 A; 1SRM A; 2ECZ A; 2JMA A; 4PL6 A; 3ULR B; 3GF5 A; 4DEY A; 1M1K U; 2RJF A; 3CBM A; 4HCB A; 5FU6 B; 1YJW Q; 2QQR A; 3GIB A; 1H3H A; 2JMC A; 2K57 A; 1WIE A; 2CH4 A; 4AFQ C; 4KBM B; 2F2X A; 5LJ3 j; 2F2W A; 1VQM Q; 1OX9 A; 3WVD B; 3OYF A; 4IKF A; 1AWO A; 3MEW A; 2R58 A; 3CCQ T; 3CD6 Q; 4PJM A; 2RN8 A; 3OB9 A; 1QVF A; 2KMT A; 2P0Q A; 2FO0 A; 3NFC A; 5IT9 E; 3MEV A; 1WX6 A; 3AT1 B; 5I21 A; 2HBW A; 1VYV A; 4BD3 A; 2YRD A; 3BDU A; 1VQ8 A; 3CCJ A; 5IHN A; 1RAG B; 3M53 A; 3PTA A; 2RPN A; 3TRE A; 2WSF E; 1BCM A; 1K9M R; 3OS0 A; 1JB0 E; 2EYZ A; 3I55 T; 2HKQ B; 3E9G A; 2DET A; 3CCS T; 1W2B S; 5GAO q; 4KGZ B; 1Q7Y U; 2SEM A; 5I11 A; 3CCE A; 1NEG A; 3HTR A; 2ZPB B; 1TUC A; 2KYM A; 3QZ9 B; 2RK2 A; 3E9F A; 4ZN3 A; 1UHF A; 3PE0 A; 4EDU A; 2MIO A; 1TXQ A; 1U06 A; 2CSI A; 2RQW A; 4QT7 A; 3V7C A; 1U5S A; 4DQ2 A; 1BK2 A; 3OSV A; 3CPF A; 1WZO A; 1YHQ A; 1M2O A; 2EAY A; 3JCM f; 1X6G A; 2YUN A; 4M77 B; 3P8D A; 1UB4 A; 4J9F A; 4A63 B; 2B8A A; 3M58 A; 1UE9 A; 4LUE A; 1R77 A; 2VXF A; 2JT4 A; 1VQP Q; 2K2M A; 2ZAE A; 3CME A; 1VQ7 A; 3A98 A; 4ELY C; 4C0G A; 4F04 B; 2L3Q A; 5LJ3 f; 4AT1 B; 1GFD A; 2QGG A; 2DO3 A; 3CCL Q; 1MMG A; 2EPD A; 2H8H A; 2RO0 A; 1Q81 C; 4CI0 C; 2C0T A; 1JO8 A; 4ATO A; 2DNU A; 3QPH A; 4FU6 A; 2COY A; 1K76 A; 1U1T A; 2Y4X A; 3EHQ A; 1X75 C; 4ELZ C; 2QA4 A; 3M0P A; 1PWT A; 2DA9 A; 1PD1 A; 2FB7 A; 3RMQ A; 5LJ5 f; 1NLO C; 3EFS A; 2RQV A; 1KSW A; 1BIA A; 3BFM A; 1TH7 A; 1YJ9 A; 1BB9 A; 3V8J A; 5CIU A; 4KH0 B; 2QDL A; 1WHG A; 3OYK A; 3CC7 A; 3G4S A; 4C8Q A; 1SRL A; 2LRQ A; 2V8K A; 4PJO F; 2JNG A; 3D7S B; 5CAI A; 4Z88 A; 5IAY A; 1VQ9 T; 2EGA A; 3H8Z A; 4M75 F; 5ECA A; 4JRI A; 2OX7 A; 2ROL A; 2HKN A; 3PMT A; 2F2V A; 1X43 A; 4XK8 E; 3R6N A; 4J6X A; 2VB6 A; 1G3S A; 2PUO B; 1AT1 B; 3MP1 A; 2MPX C; 3G7Z A; 3G71 A; 1YI2 Q; 3CPW S; 3JCM P; 3RIR A; 2LX7 A; 4EMK A; 3TU4 K; 4AG2 C; 1VQP T; 2MWO A; 1K9M C; 2DL3 A; 4OMO A; 1RLQ C; 2BKD N; 5AYF A; 3VS0 A; 3LW5 E; 4L59 A; 2C0O A; 4C8Q D; 2QEX A; 4ZTJ A; 2JS2 A; 1G3Y A; 3VS4 A; 3CCL T; 1VQN T; 2JJ9 A; 2RHX A; 2RJE A; 4E7L A; 2CT4 A; 4OB3 B; 1JU5 C; 3PVL A; 4J9I A; 1BIB A; 4XTY A; 2CZ6 B; 2E5Q A; 4F16 A; 4LDY A; 2DJZ A; 1PRL C; 3NHN A; 1VQ4 A; 4RTT A; 2JTM A; 2AKL A; 1YIT A; 1VQO Q; 1UGV A; 1OZ2 A; 4OML A; 3M0T A; 1VQ6 T; 1LCK A; 4F7U A; 1OU8 A; 2VWF A; 4LNP A; 2I0N A; 2ED0 A; 3J80 E; 4C5I A; 1BI1 A; 3I56 Q; 3CCR Q; 4M7A G; 5GMK i; 2M0Y A; 2K5F A; 3PIP A; 1K8A R; 2ESW A; 4M78 C; 3L2W A; 1IO6 A; 1T0H A; 2HL3 A; 2KE9 A; 4E7I A; 2JUF A; 1IRE B; 2X4W A; 1MV0 B; 2J06 A; 5DY9 A; 1UHC A; 5GMK m; 3RER A; 2CP2 A; 1PKT A; 1TU0 B; 1HSQ A; 2DL7 A; 3OS2 A; 3X24 B; 4E7K A; 2RNA A; 1WQ7 A; 1YI2 T; 2CUB A; 2R57 A; 4M7D F; 3QYG B; 4IIO A; 2LQ8 A; 2J6K A; 4GBQ A; 1YP5 A; 1K73 U; 1IZ6 A; 1PHT A; 3A8G B; 4N4G A; 3M54 A; 1S72 A; 2P0P A; 1WNL A; 1GRI A; 1OYX A; 1WJS A; 1ZBJ A; 4LUD A; 3LGL A; 2QTV A; 1LNX A; 4EPC A; 4RTU A; 5AT1 B; 1O9S A; 2OAW A; 1QVG S; 2KXD A; 2HSP A; 4RTX A; 2OTJ Q; 1WHK A; 2F69 A; 2NUP A; 3N5B B; 1WYX A; 3L2V A; 3JCM V; 3JCM c; 1EZZ B; 2KYB A; 2PUK B; 2D8J A; 2HQH A; 4B6M A; 5GAM f; 4FW1 A; 3SEM A; 4AG1 C; 5D6W A; 2O31 A; 2CP5 A; 1VQL T; 1I5L A; 1OU9 A; 2DRK A; 4RTZ A; 1TG0 A; 2YSQ A; 1WXT A; 3CCR T; 1NPR A; 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