The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
59
|
structure length |
59
|
Chain Sequence |
MTEEVIVIAKWDYTAQQDQELDIKKNERLWLLDDSKTWWRVRNAANRTGYVPSNYVERK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the first SRC homology 3 domain of human nck2
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Cytoplasmic protein NCK2
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
5
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-10-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ECZ A; 4GLM A; 3EG1 A; 2PZ1 A; 2KYM A; 1X43 A; 1BBZ A; 2P4R A; 2LMJ A; 1YWP A; 1TUC A; 1MUZ A; 1GCQ A; 2K2M A; 1ZLM A; 2CT4 A; 2YT6 A; 2K6D A; 1MV0 B; 2DA9 A; 2YUO A; 1WXU A; 1SPK A; 2I0N A; 2DL4 A; 1HJD A; 2J06 A; 1K0X A; 3H0F A; 2DJQ A; 4LN2 A; 5FWC A; 3EGU A; 5IHI A; 2A36 A; 2DRK A; 1UDL A; 2LX7 A; 4J9C A; 1H8K A; 5IXF A; 2FRW A; 1AWW A; 1M27 C; 3M0R A; 1X27 A; 1K76 A; 3QWY A; 3GBQ A; 3UA7 A; 2CT3 A; 2J7I A; 2C0I A; 1H3H A; 1GRI A; 2YUP A; 3UA6 A; 4HXJ A; 2GNC A; 3EG0 A; 4CC7 A; 1WXB A; 4AFU C; 4FSS A; 4WCI A; 2NWM A; 1B07 A; 1JXM A; 2FRY A; 2PNI A; 4HVW A; 1AEY A; 4AG1 C; 4F17 A; 2JMC A; 2MIO A; 1K1Z A; 2SRC A; 1RLP C; 1UJY A; 1VYU A; 4JZ4 A; 4LE9 A; 2VKN A; 2OJ2 A; 1YNZ A; 2RMO A; 5FW9 A; 3EG3 A; 2RPN A; 4JJB A; 3I5R A; 2BTT A; 2CUB A; 2DL7 A; 4K11 A; 4RTY A; 4A63 B; 1G2B A; 2KRS A; 2RN8 A; 1AZE A; 2GBQ A; 3UAT A; 1PHT A; 1V1C A; 1ZUU A; 2DNU A; 4GBQ A; 1M8M A; 2VVK A; 2X3X D; 1SEM A; 2G6F X; 2EGA A; 1OOT A; 1FYN A; 4HVV A; 4AFZ C; 2K7A A; 3RNJ A; 2JS0 A; 4OML A; 1YCS B; 1QCF A; 3C0C A; 4JJD A; 1S1N A; 3VS0 A; 2J6O A; 4RTW A; 1PKS A; 1GFC A; 1M3C A; 1E6G A; 1SRM A; 2DRM A; 1TG0 A; 3PE0 A; 4J9E A; 3ZL7 C; 4F14 A; 1W6X A; 2BZ8 A; 4OMM A; 1X6B A; 1JXO A; 3M0U A; 3H0I A; 4CC2 A; 2K9G A; 2OI3 A; 4Z8A A; 4HCK A; 1KSW A; 3R6N A; 1RUW A; 3REB B; 3M0T A; 1TUD A; 1X2K A; 2LQW A; 4LNP A; 1NEG A; 1JO8 A; 3SHW A; 3I35 A; 3FJ5 A; 2LJ0 A; 2HEQ A; 2HCK A; 4R0K A; 3TSW A; 2DF6 A; 1GCP A; 2KBT A; 2DYB A; 5L23 A; 2IIM A; 1KJW A; 1LCK A; 3SEM A; 1BU1 A; 2EBP A; 2X3W D; 2D1X A; 1PRM C; 2J6K A; 2MOX A; 1GBR A; 2O9V A; 1GFD A; 2E5K A; 2AK5 A; 2KRM A; 1JEG A; 2RQT A; 2SEM A; 4AFS C; 3VRZ A; 2VWF A; 4M4Z A; 3ULR B; 2KEA A; 2RQR A; 1WA7 A; 4IIO A; 2LNH B; 1H92 A; 3REA B; 1HD3 A; 4Y92 A; 2YUN A; 1WFW A; 2BZY A; 1Z9Q A; 1NM7 A; 4JZ3 A; 2JW4 A; 2AZV A; 4ZNX A; 4J9D A; 2JMA A; 2EYZ A; 4LUD A; 1AOJ A; 1W70 A; 1K0S A; 1X6G A; 2DLP A; 5IHK A; 1B3Q A; 4OMP A; 2AZS A; 3RBB B; 2JTE A; 4KRT A; 1VYV A; 1NEB A; 2ED0 A; 1A0N B; 4D8D A; 1VYT A; 1W1F A; 2LZ6 B; 2O2O A; 4LUE A; 5EC7 A; 2FO0 A; 1PNJ A; 2O31 A; 2ESW A; 4AFQ C; 2BZX A; 1JQQ A; 2DX1 A; 3I9Q A; 1HSQ A; 3NMZ C; 2ROL A; 4RTU A; 1KIK A; 4E6R A; 3VS5 A; 2FG0 A; 3NGP A; 3QWX X; 1BB9 A; 2MCN A; 2L3P A; 1T3S A; 5I11 A; 1ABQ A; 1GL5 A; 2KE9 A; 1WDX A; 4CC3 A; 2L3S A; 4J9G A; 2CH4 W; 2O9S A; 1T0J A; 5IXB A; 1I0C A; 2YSQ A; 1X2Q A; 2K79 A; 2D8J A; 4Z89 A; 2D8H A; 2KYB A; 1WLP B; 2A37 A; 1AWO A; 1U3O A; 2AKK A; 2DBM A; 4D8K A; 2EPD A; 2LCS A; 3VS3 A; 1I07 A; 1U5S A; 2A08 A; 1ARK A; 1AD5 A; 1FMK A; 1ZUY A; 3THK A; 1PRL C; 2B86 A; 2CDT A; 2V1R A; 1ZBJ A; 1ZSG A; 2D0N A; 1ZUK A; 2DM1 A; 1JU5 C; 4IIM A; 3CQT A; 4JJC A; 2EVR A; 2HDA A; 5GJW B; 2KGT A; 2CRE A; 2CUD A; 1WYX A; 3TSZ A; 2QDL A; 3TVT A; 3EG2 A; 4RTX A; 2FPE A; 4RTT A; 4RTZ A; 2JXB A; 3H41 A; 5I22 A; 1K9A A; 2KRN A; 2EGE A; 1E6H A; 5IHN A; 1UEC A; 2V1Q A; 3VS6 A; 1SSH A; 1BK2 A; 2LQN A; 1NYG A; 1CKA A; 2J05 A; 5HCK A; 2DBK A; 1XOV A; 4OMO A; 2DL5 A; 1CSK A; 1UJ0 A; 2DMO A; 4OMN A; 3KFV A; 2NUZ A; 1PKT A; 1YN8 A; 3A98 A; 2A28 A; 2KXD A; 2LJ3 A; 2AKL A; 2M0Y A; 2H8H A; 3PVL A; 1UHC A; 2HBW A; 2JM8 A; 1QKX A; 2GTO A; 3I5S A; 5FWB A; 5IH2 A; 1QLY A; 2EYY A; 4DEX A; 2DIL A; 1GBQ A; 2F2V A; 2W0Z A; 1AWJ A; 1SRL A; 2ED1 A; 2RNA A; 4X1V A; 1M3B A; 2LJ1 A; 3M0P A; 1GCQ C; 2PTK A; 2KR3 A; 1WX6 A; 1M3A A; 1T3L A; 2EW3 A; 3LH5 A; 2EYW A; 4J9B A; 2F2X A; 1QKW A; 4AG2 C; 1E7O A; 2FPD A; 1I1J A; 1UGV A; 1RLQ C; 4J9I A; 4J9F A; 2JM9 A; 5GJV B; 1RI9 A; 1OPL A; 1QWE A; 1IO6 A; 2RQW A; 2OAW A; 3H0H A; 1AVZ C; 1YWO A; 1ZX6 A; 2DL3 A; 2RF0 A; 3U23 A; 1SHG A; 2ENM A; 4ESR A; 2RQV A; 2O88 A; 2K3B A; 2KNB B; 3NHN A; 1NG2 A; 1NYF A; 2EQI A; 1OV3 A; 1UG1 A; 3VRY A; 2CSQ A; 2HSP A; 1ABO A; 1CKB A; 3PVQ A; 3JV3 A; 2L2P A; 2L3Q A; 2EKH A; 4EIK A; 1YP5 A; 1Z9Z A; 2JT4 A; 3VS2 A; 2KXC A; 1PWT A; 1G83 A; 2GTJ A; 4QT7 A; 1UFF A; 1EFN A; 2C0O A; 3VS1 A; 3VS7 A; 2YDL A; 1OPK A; 4OMQ A; 2JS2 A; 1Y0M A; 1SHF A; 1NLO C; 2W10 A; 1N5Z A; 1MV3 A; 2L0A A; 4JPB W; 4DEY A; 2F2W A; 1J3T A; 2YUQ A; 1U06 A; 1UHF A; 1VA7 A; 3M0S A; 1OEB A; 2C0T A; 2GQI A; 1UUE A; 1WXT A; 2EYX A; 2XMF A; 2ABL A; 3UF4 A; 1NLP C; 2CH4 A; 2KT8 A; 5ECA A; 1AWX A; 2J6F A; 3NPF A; 3M0Q A; 1WIE A; 2GGR A; 3VS4 A; 4ORZ A; 1Y57 A; 2LP5 A; 4CC4 B; 1KFZ A; 2EGC A; 1UE9 A; 2DVJ A; 4HVU A; 4Z88 A; 2CSI A; 2ROT A; 4RUG A; 1UTI A; 2M51 A; 2KRO A; 2FEI A; 1X69 A; 2DE0 X; 1K4U S; 1QWF A; 4J9H A; 2RQU A; 3EHR A; 2KT1 A; 1T0H A; 3EHQ A; 1M30 A; 3IQL A; 2DL8 A; 4RTV A; 1WI7 A; 1AZG B; 2FPF A; 4F16 A; 3O5Z A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DZC A; 2PZ1 A; 5LJ5 e; 1X43 A; 3C4S A; 4PJL A; 4FIB A; 2LCC A; 5FU7 C; 3RMQ A; 4J6Y A; 5GAO p; 2K2M A; 4JS5 A; 4MMK A; 1PD1 A; 2M02 A; 3QDF A; 2DXT A; 2KMT A; 2DA9 A; 2YUO A; 1WXU A; 2XK0 A; 4FYW B; 5KCO A; 3JCM W; 4M7A D; 1SPK A; 2EIF A; 3CCU A; 3QHS A; 2J06 A; 3EGD A; 3EGU A; 1S72 Q; 4C92 E; 1BI1 A; 1ZA2 B; 3MP8 A; 5LJ5 h; 3V8J A; 2MYS A; 3OS5 A; 4B9X A; 4PFO A; 5GAO l; 1K76 A; 2J7I A; 3JB9 H; 2YUP A; 3OYK A; 1K9M U; 2R5A A; 4CC7 A; 1WXB A; 4AFU C; 4FCY A; 2PUO B; 3BE3 A; 2A7Y A; 2PQW A; 2KAF A; 4LDV A; 4E7J A; 2LQK A; 1R0C B; 4QQ6 A; 4AG1 C; 2JMC A; 2F5K A; 3CCE Q; 2RA2 A; 4LE9 A; 2DTH A; 1VQM A; 1Y96 A; 4B9W A; 3EG3 A; 1M9S A; 1KD1 C; 4B6M A; 2BTT A; 2CUB A; 3JB9 I; 4N4G A; 3OYD A; 4A63 B; 3LYI A; 1WHK A; 3FEO A; 4KGZ B; 4C5H A; 4XU0 A; 1W2B A; 2K3X A; 2YHT A; 1M90 R; 1VQ4 A; 5J26 A; 1UGP B; 5A0G A; 3M54 A; 2DNU A; 1KK7 A; 1TXQ A; 4FW1 A; 2NUP B; 4C8Q B; 3ZFJ A; 1N6A A; 2DXB A; 1SEM A; 1C1A A; 2CZ6 B; 1FYN A; 4M7A E; 4FU6 A; 2E64 A; 3RNJ A; 4KGX B; 1C6V X; 1YCS B; 3C0C A; 4JJD A; 4RTW A; 2E3H A; 2X9H A; 2Y90 A; 1K8A C; 1M3C A; 3CXC A; 1TS9 A; 2DRM A; 1TG0 A; 3OS0 A; 4OMF B; 1W6X A; 3X28 B; 3BW1 A; 1JXO A; 1HXD A; 1UGQ B; 3H0I A; 1RAC B; 1R8O B; 2DEU A; 3QII A; 3R6N A; 1RUW A; 3M0T A; 1X2K A; 2XDP A; 3SHW A; 4IUU A; 1JB0 E; 2E41 A; 3CCL Q; 2HCK A; 3A8M B; 1IXD A; 3G4S Q; 4IUV A; 1GCP A; 2KBT A; 5KYY A; 1QCO A; 3HPW A; 1KQ1 A; 3QUI A; 3JRZ A; 4C92 F; 2X3W D; 3DLM A; 2VGN A; 2QTV A; 1SSF A; 1I5O B; 2H3J A; 3QYG B; 2O9V A; 2EJ9 A; 3QXE B; 5GAM j; 3I56 T; 5L8R E; 3VRZ A; 5LL6 S; 1EIF A; 2KEA A; 2RQR A; 4IIO A; 2LNH B; 4V2S A; 4E47 A; 4PJO G; 3X24 B; 1YJN Q; 1M8V A; 3GOX A; 3RKX A; 1W2B S; 3HFN A; 4JS4 A; 1QP3 A; 4JZ3 A; 1TH7 A; 2DD5 A; 3QBY A; 4F04 B; 4N0A C; 5CQY A; 1YIJ A; 1YBY A; 2YLC A; 1K0S A; 1KHI A; 2QQB A; 2DLP A; 3E1S A; 5IHK A; 3H9N A; 5KYW B; 2XDB A; 5LJ3 j; 2L5Q A; 3CCJ Q; 2QEX Q; 2DER A; 1VQ7 A; 1VQK Q; 4KRT A; 3OSV A; 2GQV A; 2VC8 A; 1Q7Y U; 5LJ5 d; 2KI7 A; 4D8D A; 1MMG A; 2O2O A; 4M7A F; 3OBW A; 3CXC S; 2P0P A; 2O31 A; 3AT1 B; 4AFQ C; 1VQ9 T; 3V7R A; 2DX1 A; 2LDM A; 2B8A A; 4FL6 A; 1ACM B; 3I9Q A; 1U1S A; 4P5N A; 5KCH A; 2ROL A; 4QQD A; 2FG0 A; 4M77 E; 4OP0 A; 3OW2 S; 3X25 B; 4ZN1 A; 1IZ6 A; 1LJO A; 4M7A C; 2WSE E; 2X4W A; 1XNI A; 3PMI A; 1YJ9 T; 4ME7 A; 3WVE B; 7AT1 B; 2L3S A; 5GMK i; 4C8Q A; 1YJW A; 4DBR A; 2YSQ A; 1X2Q A; 2D8J A; 1QVG A; 3JCM e; 2XG8 D; 5CKB A; 3QPH A; 5GAN 3; 1U3O A; 2LCS A; 2GFA A; 1U5S A; 1BIB A; 5DY9 A; 3ZEH A; 2DPP B; 4EMK B; 4VUB A; 5I2M A; 3OYY A; 2G3R A; 2FZK B; 2AIR B; 3DLL A; 3L1A A; 1YHQ Q; 3CC2 A; 3AHU A; 3G6E T; 3KUF A; 4KUI A; 1JU5 C; 3CCS Q; 4JJC A; 5GAN 4; 2HDA A; 5GJW B; 2ZGW A; 3QJY A; 2RHU A; 4PJN A; 3I55 T; 3JCM h; 4LD6 A; 5KH6 A; 2MWO A; 1O9S A; 1OUL A; 2QDL A; 3TVT A; 3JAM E; 5DM7 R; 4QVC A; 3FIF A; 2DZ9 A; 2KRN A; 1PSE A; 3DB3 A; 4N0A A; 3S3N A; 3JB9 D; 1IGU A; 5IHN A; 1SSH A; 3PIP A; 1JJ2 A; 4AMC A; 2E4H A; 4E7H A; 1K73 U; 3OYA A; 1Q86 R; 3HSB A; 3CCV Q; 2DL5 A; 4RG2 A; 3M4G A; 4OMN A; 1BI2 A; 1VQM Q; 1VQO A; 2K57 A; 1ZSZ A; 2KXD A; 2LJ3 A; 1BCM A; 1VQN Q; 4C0G A; 1Q95 G; 1UHC A; 1KQS A; 2JM8 A; 2RJC A; 2RD1 A; 3D7S B; 5FWB A; 3I5S A; 4M7D G; 1TUG B; 1QLY A; 2HZY A; 2EYY A; 1OI1 A; 4DEX A; 2LRQ A; 2F2V A; 1YI2 A; 2PTK A; 4II1 A; 1D1C A; 2EW3 A; 5HY6 A; 2AHJ B; 1VIE A; 1FWZ A; 4NS5 A; 2GFU A; 1QVG S; 5KYW A; 1OX8 A; 4J9I A; 4J9F A; 1Y07 A; 5AYF A; 4M78 G; 1RI9 A; 1OPL A; 1IO6 A; 3C95 A; 2OAW A; 1S72 A; 1AVZ C; 4MML A; 1ZX6 A; 1D0X A; 3M56 A; 1QW1 A; 4ESR A; 2RQV A; 2K3B A; 2KNB B; 2CS7 A; 3NHN A; 1NYF A; 1UG1 A; 3VRY A; 5GAN 6; 2A3L A; 2HD0 A; 2LC4 A; 2Y4Y A; 1NJI R; 2L3Q A; 2VUB A; 5CAI A; 1U1T A; 2JJ9 A; 1Z9Z A; 2JT4 A; 4OB0 B; 3JCM J; 1B7T A; 1FMW A; 1X6O A; 3TQ7 P; 1PWT A; 1G83 A; 4M78 D; 4QT7 A; 1QVP A; 3CCE A; 3VS1 A; 3QZ9 B; 1SHF A; 3A1P A; 1N5Z A; 5DLO A; 1J3T A; 2F2W A; 5FU6 B; 1VA7 A; 1JJ2 S; 3M0S A; 3CCL T; 1OEB A; 2C0T A; 3FDR A; 2XMF A; 1WXT A; 2DJZ A; 2MK5 A; 3G4S T; 2ABL A; 3MET A; 4EMG A; 1M1K C; 1AWX A; 4ZTF A; 3M0Q A; 3SB2 A; 4E7I A; 1WIE A; 1Q86 C; 3MKD A; 2GGR A; 3M5A A; 1G3T A; 4EMK A; 2CSI A; 2ROT A; 4FYY B; 5KYU A; 3CC7 A; 1KC8 U; 2RQU A; 4XTY A; 1GXI E; 1EX4 A; 3OYI A; 2FPF A; 5LJ5 j; 3M53 A; 3O5Z A; 4M75 G; 2FB7 A; 2ECZ A; 3EG1 A; 1VQ5 T; 3OB9 A; 1QVF A; 3CBM A; 5FU6 C; 1VQ7 Q; 1LNX A; 5C6S A; 2CT4 A; 2E3I A; 3CC4 T; 1MV0 B; 3OMG A; 3HTR A; 2I0N A; 2QEX T; 3C94 A; 5FWC A; 1G5V A; 3CEY A; 1H8K A; 2M1H A; 2FRW A; 4J6W A; 1RAA B; 2QTX A; 1M27 C; 2QGF B; 4XQ3 A; 1X27 A; 3JB9 F; 2ZCF B; 2CT3 A; 2C0I A; 2NUT B; 1NJI C; 1Y7X A; 2R5M A; 1Q82 R; 1JXM A; 2PNI A; 3HRS A; 4HVW A; 5CCA A; 1IRX A; 4C8Q D; 2LCL A; 1RLP C; 4JZ4 A; 1YJN A; 2FHD A; 2VKN A; 2ZZD A; 4O5V A; 2RMO A; 1D0Z A; 4ZGE B; 2RPN A; 3I5R A; 4DOV A; 2R58 A; 2DL7 A; 2E65 A; 5D7U A; 2XDD A; 2HQE A; 1G2B A; 2KRS A; 4QVZ A; 4OVA A; 4KT0 E; 3UAT A; 3L2U A; 1PHT A; 4ELY C; 1ZUU A; 2PUK B; 4GBQ A; 4PJO A; 3CCJ A; 4M7D B; 3SWN B; 4UC4 A; 1VQK A; 1WPY A; 3H6Z A; 2G6F X; 2EGA A; 3HP9 A; 5CK9 A; 4BDY A; 4HVV A; 4JDS A; 3JB9 J; 3EAE A; 1ZHI A; 2D6F A; 1VOM A; 4BDZ A; 1S1N A; 2MPX C; 1PKS A; 3E19 A; 3CCU T; 1WGS A; 2CP0 A; 2RHZ A; 1QVF S; 2E10 A; 1K8A U; 4M78 B; 2BZ8 A; 4OMM A; 4E7S A; 4HCK A; 3SD4 A; 5KYY B; 3HL8 A; 1WHH A; 4C8Q E; 3CPW P; 4OF1 A; 3UPU A; 2RI3 A; 3I35 A; 3VV0 A; 4M78 F; 3OYJ A; 2HEQ A; 4R0K A; 1RAD B; 2KSS A; 5J3B A; 3MEV A; 1YI2 Q; 2HQX A; 1N8R R; 1LCK A; 3RUX A; 2D1X A; 5GAN g; 3VUZ A; 2J6K A; 3CBP A; 4D6W A; 2Y4X A; 1VQ4 T; 1YHQ A; 1GFD A; 4M78 C; 2AK5 A; 2MAM A; 1IB8 A; 4BY6 B; 3CCS A; 2SEM A; 2VWF A; 2XD0 A; 2IPO B; 2GF7 A; 1Z9Q A; 3QYH B; 5GAN 2; 3A8L B; 3HHT B; 2LT1 A; 2M16 A; 2HL3 A; 3E9G A; 3L42 A; 1B3Q A; 3X26 B; 4C0D B; 4OMP A; 3CCV A; 1V29 B; 2RHY A; 2V8J A; 3CD6 A; 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