The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
71
|
structure length |
71
|
Chain Sequence |
GSSGSSGLLARALYDNCPDCSDELAFSRGDILTILEQHVPESEGWWKCLLHGRQGLAPANRLQILSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-036, an SH3 domain from human cDNA
rcsb |
| molecule keywords |
HEF-like protein
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
7
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| structure length |
71
|
| sequence length |
71
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1AVZ C; 1Y0M A; 2KXC A; 2JMC A; 3TSW A; 1KIK A; 3VRY A; 2K6D A; 1MV0 B; 1X2Q A; 1UGV A; 2FPD A; 1B07 A; 1UG1 A; 4KRT A; 4WCI A; 3VS0 A; 2DRM A; 4RTY A; 2VVK A; 1UFF A; 2LJ0 A; 1NM7 A; 2EGA A; 4X1V A; 4DEX A; 2ABL A; 4QT7 A; 1NLO C; 5GJV B; 1PKT A; 2MIO A; 5IHN A; 1U06 A; 2FG0 A; 1ABO A; 2J06 A; 2DL8 A; 3I35 A; 4Y92 A; 4CC2 A; 4JZ4 A; 2JS2 A; 2BZY A; 2PTK A; 1WA7 A; 2QDL A; 3VS2 A; 4RTW A; 1LCK A; 4ZNX A; 3VS3 A; 3VS4 A; 2RQR A; 4CC4 B; 3QWY A; 1OV3 A; 3H0I A; 2KYB A; 4AG1 C; 2JW4 A; 2CDT A; 2EVR A; 2X3X D; 1PRM C; 3VS1 A; 1B3Q A; 2P4R A; 1YNZ A; 4HVW A; 2V1Q A; 4AFQ C; 2L3P A; 3VS7 A; 1I1J A; 3TSZ A; 1U3O A; 2SEM A; 5IXF A; 4RTU A; 2K7A A; 2V1R A; 1UJY A; 2YT6 A; 2E5K A; 2KGT A; 3LH5 A; 3R6N A; 3EG0 A; 1WXU A; 1PNJ A; 2DL3 A; 2KE9 A; 2W10 A; 2RMO A; 4E6R A; 1JU5 C; 3UA6 A; 1CKB A; 2KEA A; 2BTT A; 3I5R A; 2JXB A; 3UA7 A; 1I0C A; 2LJ1 A; 1XOV A; 2J6K A; 1V1C A; 2K79 A; 4LNP A; 2DIL A; 1UTI A; 1QCF A; 1M3C A; 3I5S A; 1K4U S; 2A28 A; 2FRW A; 2D0N A; 4RTT A; 2L2P A; 4RTX A; 3U23 A; 2ED1 A; 1GCQ C; 2LX7 A; 2NUZ A; 3PVL A; 2RPN A; 2C0O A; 3UF4 A; 3REA B; 2O9V A; 4Z8A A; 2SRC A; 1PKS A; 1M27 C; 1QLY A; 2A36 A; 1QWF A; 2GTO A; 2LJ3 A; 2LQN A; 1YWP A; 3EHQ A; 2FEI A; 1Y57 A; 4Z88 A; 2DJQ A; 2OAW A; 2M0Y A; 3CQT A; 3EGU A; 1T3S A; 2AKL A; 4AFU C; 1YP5 A; 1J3T A; 1BK2 A; 4OML A; 1HSQ A; 1X27 A; 2PNI A; 2EKH A; 2RF0 A; 5IH2 A; 1IO6 A; 2DNU A; 4OMQ A; 1BU1 A; 3SEM A; 2KT1 A; 1QKX A; 2D1X A; 2CUB A; 2C0T A; 3THK A; 4ESR A; 2DX1 A; 3M0U A; 2D8J A; 1S1N A; 2HCK A; 1G83 A; 1OOT A; 1Z9Q A; 2JT4 A; 1JXM A; 2AZS A; 1RLQ C; 1E6H A; 1I07 A; 2B86 A; 2DBK A; 3REB B; 1OEB A; 5HCK A; 2FPF A; 2RQW A; 4AFZ C; 4OMM A; 3PE0 A; 3EHR A; 2MOX A; 4HVV A; 2EW3 A; 1AWX A; 1ZUK A; 3H0F A; 2KRM A; 2ED0 A; 1SRL A; 3EG2 A; 1SSH A; 2F2W A; 1X43 A; 2DA9 A; 2PZ1 A; 1E7O A; 1T3L A; 1GCQ A; 4JZ3 A; 2JTE A; 1RI9 A; 1WDX A; 5L23 A; 2DF6 A; 5IHI A; 4J9H A; 2CRE A; 2YUO A; 1KSW A; 1PWT A; 3M0S A; 1AEY A; 4F17 A; 2F2V A; 3VS6 A; 1ARK A; 1GBR A; 2H8H A; 2ESW A; 2HDA A; 2J6F A; 2DLP A; 1X6B A; 4OMO A; 4D8D A; 5EC7 A; 4J9F A; 2NWM A; 2ROL A; 3KFV A; 3VS5 A; 2LCS A; 1M3B A; 2HEQ A; 4F16 A; 3JV3 A; 1SHF A; 2JM8 A; 1ZX6 A; 2J05 A; 2J6O A; 2LP5 A; 2OI3 A; 1H92 A; 3M0T A; 2YUQ A; 4RTZ A; 2HBW A; 3I9Q A; 1W1F A; 2LZ6 B; 1NLP C; 4JJB A; 3PVQ A; 2IIM A; 1MUZ A; 1GFC A; 1UJ0 A; 2KBT A; 3UAT A; 4DEY A; 2CT4 A; 2FPE A; 2XMF A; 2EGE A; 2K2M A; 2AKK A; 1ZBJ A; 1M3A A; 1SRM A; 2BZ8 A; 2MCN A; 3ULR B; 2KR3 A; 3IQL A; 1Z9Z A; 2C0I A; 2J7I A; 2EPD A; 1KJW A; 1VYV A; 1X2K A; 4RTV A; 2ECZ A; 4R0K A; 5IXB A; 1G2B A; 2L3S A; 1K9A A; 2YDL A; 3M0P A; 4JJD A; 1CKA A; 1KFZ A; 4OMN A; 3M0Q A; 2GBQ A; 2KNB B; 1AZE A; 1RUW A; 4HXJ A; 1UEC A; 1YCS B; 2DL7 A; 2YUP A; 4J9E A; 1NEG A; 2AZV A; 1VYT A; 1UE9 A; 1PRL C; 2ENM A; 2O2O A; 1AZG B; 1E6G A; 1YN8 A; 1UHC A; 3RBB B; 1U5S A; 1ZLM A; 4HCK A; 1ABQ A; 1WI7 A; 2CUD A; 2KT8 A; 4CC7 A; 2EYZ A; 3FJ5 A; 3H41 A; 1NYF A; 1AOJ A; 1PHT A; 1RLP C; 1VA7 A; 4J9D A; 2EYW A; 4JJC A; 3TVT A; 1ZUU A; 2JMA A; 1WLP B; 3C0C A; 4J9B A; 4LUD A; 3A98 A; 2K3B A; 2GNC A; 1AD5 A; 1QKW A; 4J9G A; 5I11 A; 1TUD A; 1SEM A; 2L3Q A; 1WXT A; 2L0A A; 2OJ2 A; 2CH4 A; 2GGR A; 2RQT A; 1K0X A; 1A0N B; 2O31 A; 2EQI A; 1NG2 A; 1EFN A; 1UUE A; 1CSK A; 2DMO A; 2EYX A; 4J9C A; 1GBQ A; 1OPK A; 1X6G A; 4LUE A; 1JXO A; 3O5Z A; 4D8K A; 5ECA A; 3NGP A; 1MV3 A; 3VRZ A; 3M0R A; 2LNH B; 5FWC A; 3NMZ C; 4AG2 C; 2FO0 A; 1M30 A; 1NYG A; 1W6X A; 3NPF A; 1AWW A; 2F2X A; 1JO8 A; 1NEB A; 2AK5 A; 1SHG A; 3H0H A; 3GBQ A; 1JQQ A; 1K76 A; 2KYM A; 2D8H A; 3EG1 A; 3RNJ A; 2ROT A; 1W70 A; 3NHN A; 2I0N A; 2JM9 A; 2A37 A; 5FW9 A; 2EYY A; 4IIM A; 1OPL A; 2JS0 A; 5FWB A; 1WYX A; 2KRS A; 5GJW B; 2G6F X; 1GL5 A; 4RUG A; 2LMJ A; 1GCP A; 1K1Z A; 1ZUY A; 2CSQ A; 2KXD A; 2YUN A; 4HVU A; 2KRN A; 4FSS A; 4ORZ A; 1X69 A; 5I22 A; 2FRY A; 2LQW A; 2YSQ A; 1YWO A; 2DL5 A; 3ZL7 C; 2O88 A; 1M8M A; 2RQV A; 2EGC A; 4J9I A; 1BB9 A; 1GFD A; 1WIE A; 2EBP A; 2CT3 A; 1WXB A; 3QWX X; 2VKN A; 1T0J A; 2K9G A; 4EIK A; 1FMK A; 1HD3 A; 4OMP A; 2RN8 A; 4A63 B; 2DBM A; 4LN2 A; 2DE0 X; 1HJD A; 1WFW A; 3EG3 A; 2GQI A; 4JPB W; 3SHW A; 4F14 A; 2X3W D; 2DRK A; 4AFS C; 2CH4 W; 2DVJ A; 1VYU A; 1SPK A; 1H3H A; 2KRO A; 2CSI A; 2A08 A; 2VWF A; 1UDL A; 4GBQ A; 1JEG A; 1H8K A; 1TG0 A; 2RQU A; 4CC3 A; 4Z89 A; 2O9S A; 1GRI A; 2RNA A; 1AWO A; 5IHK A; 1QWE A; 4LE9 A; 1TUC A; 1BBZ A; 1N5Z A; 4IIO A; 1ZSG A; 2BZX A; 2GTJ A; 2DM1 A; 2DYB A; 1UHF A; 2W0Z A; 1K0S A; 1AWJ A; 2DL4 A; 4K11 A; 1WX6 A; 1T0H A; 2HSP A; 4GLM A; 4M4Z A; 2M51 A; 1FYN A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3BY7 A; 2KXC A; 3S3M A; 1VQL A; 3VRY A; 5GAM d; 1MV0 B; 1X2Q A; 1G3W A; 4M75 A; 4OVA A; 4M7A F; 4QQ6 A; 1B07 A; 4KRT A; 2O4X A; 1N8R U; 3VS0 A; 4RTY A; 2XKO C; 4ZTF A; 2ZZD A; 4WF2 A; 2GF7 A; 3OW2 P; 2CP6 A; 3LGL A; 4FU6 A; 4FYX B; 1VQN T; 4E7I A; 4C5G A; 1BI3 A; 5CKB A; 1NLO C; 5GJV B; 1PKT A; 2MIO A; 4IUP A; 3CME T; 2RJE A; 3OYH A; 4CC2 A; 2DYI A; 3H6Z A; 1KC8 U; 4KGX B; 5D7U A; 1BYM A; 2PTK A; 2QDL A; 4A4E A; 3VS2 A; 5GMK l; 4RTW A; 3LWH A; 4PJO G; 1OQK A; 5KYX A; 4OP0 A; 3H0I A; 4ANJ A; 1VQ5 T; 1QMC A; 1SKU B; 5IT9 E; 5KYU B; 2ATC B; 3CPW S; 1YNZ A; 2RA2 A; 3JAM E; 4MDX A; 2V1Q A; 3VS7 A; 1UGQ B; 3QYG B; 5DLO A; 1VQ4 A; 1QVG A; 2QQS A; 1ZA2 B; 2SEM A; 1OX9 A; 4B9W A; 3QDR B; 3L2V A; 2YT6 A; 2E5K A; 2ZGW A; 5HK0 A; 1ZSZ C; 3PIP A; 4FCY A; 3MP8 A; 4B6M A; 3I55 T; 2RMO A; 3RMQ A; 4PL6 A; 1K9M U; 3E9G A; 3CCS Q; 2BTT A; 3SFM A; 3C12 A; 1MHN A; 2JTM A; 3G6E T; 2DIQ A; 3MEV A; 5GAN 7; 3OYD A; 4Y91 A; 1V1C A; 4LNP A; 2DIL A; 1UTI A; 3FJP A; 1QVF P; 3QII A; 2GCX A; 2A28 A; 2D0N A; 3U23 A; 5AT1 B; 2DK3 A; 2LX7 A; 2DXT A; 2D6F A; 3PVL A; 4LDY A; 3UT1 A; 1U1T A; 3EGD A; 4D6W A; 3UF4 A; 4EMK B; 1C0M A; 1YIT T; 1OZ2 A; 2A36 A; 1QWF A; 3MEU A; 2C06 A; 2LJ3 A; 2X9H A; 3I56 Q; 1WJR A; 3CCE Q; 1W2B A; 1Y57 A; 4DOV A; 5A0L A; 8ATC B; 1XJW B; 2AKL A; 4AFU C; 2JZ2 A; 1YP5 A; 1HSQ A; 2PNI A; 3QBY A; 3CMA Q; 2QEX T; 1N27 A; 2FYK A; 3I55 A; 3LWI A; 1Q7Y U; 5KYY A; 4XTZ A; 3AHU A; 2KT1 A; 1QKX A; 1R0C B; 4KGV B; 2E12 A; 1IZ6 A; 2C0T A; 4ESR A; 3M0U A; 1ZSZ A; 1S72 Q; 2JT4 A; 1G3T A; 2AZS A; 2QG9 B; 1KK7 A; 1I5O B; 4OMF B; 2RQW A; 3EH1 A; 4OMM A; 2EWN A; 2KRM A; 3NTI A; 4E7K A; 2M9U A; 2PZ1 A; 1T3L A; 2E6N A; 2Y4X A; 4EDU A; 2RI2 A; 4C5E A; 2CRE A; 1RI0 A; 1DJ7 B; 2I2L A; 2JN0 A; 3OYK A; 3EGX B; 3A8G B; 2DEQ A; 1GBR A; 2E65 A; 2HDA A; 2J6F A; 3OSS C; 4D8D A; 1PD1 A; 4M7D D; 4IUT A; 4J9F A; 4HKE A; 2CP2 A; 2DJZ A; 1M1K C; 3HPW A; 4ELZ C; 3JB9 D; 1JJ2 A; 5IAY A; 4N4G A; 3OYL A; 4EMK C; 2J6O A; 1H92 A; 2LCC A; 2HBW A; 3HL8 A; 1W1F A; 2MPX C; 3QXE B; 4F7U A; 3QJ6 A; 1NBE B; 2MYS A; 1X6O A; 4XTU A; 3PVQ A; 2JJ9 A; 5GMK e; 3CCJ T; 3RKW A; 2LNV A; 4DEY A; 3UPU A; 2CT4 A; 2XMF A; 1FMW A; 3OS5 A; 1M3A A; 1IRX A; 1OU9 A; 4JRI A; 3IQL A; 1Z9Z A; 4A4G A; 2C0I A; 2J7I A; 3JB9 I; 1H3Z A; 4J6W A; 4JJN K; 2EAY A; 1LOJ A; 3CCL T; 4BDY A; 1G2B A; 2L3S A; 2QI2 A; 3C94 A; 3QUI A; 5LJ3 e; 1CKA A; 3MET A; 1Q82 C; 3M0Q A; 4LDV A; 4M7D B; 4LDW A; 1AZE A; 4HXJ A; 2WAC A; 4J9E A; 3X25 B; 2AZV A; 2XID A; 2E4H A; 1TS9 A; 5CCA A; 1K73 U; 5GAM g; 1AZG B; 1WPY A; 1WQ7 A; 3VYH B; 4BAC A; 1BIB A; 4XTY A; 1QVG S; 1YN8 A; 1QVP A; 2RK2 A; 3RBB B; 4C0D C; 2YLB A; 4BE1 A; 2XK0 A; 1WI7 A; 5FU6 C; 4CC7 A; 5C6S A; 3FJ5 A; 4KH1 B; 5CO7 A; 3H41 A; 4C8Q D; 1Q7Y R; 1RLP C; 4AMC A; 4J9D A; 2EYW A; 3E1S A; 2VV5 A; 2MAM A; 2JMA A; 3CD6 Q; 5EG2 A; 3GP8 A; 3E19 A; 4C92 D; 4FM4 B; 5LL6 S; 2K3B A; 4J9G A; 2GFU A; 2RI3 A; 4HT9 A; 4XTW A; 1TUD A; 4EMK A; 2F5K A; 4DBF A; 1VQM A; 1YJ9 Q; 2QA4 T; 1PD0 A; 2L0A A; 3VV0 A; 2CH4 A; 2RQT A; 1VQ8 T; 4OB3 B; 1RAD B; 5GAN e; 4FYW B; 1UUE A; 2DMO A; 2EYX A; 4J9C A; 5CAI A; 4J7F A; 1YHQ A; 4XU0 A; 3V7R A; 2OTL A; 2DTO A; 2MMP A; 1B34 A; 1N9R A; 3JRZ A; 3OYM A; 4D8K A; 3O5Z A; 3HHT B; 4R56 A; 3VRZ A; 3GLX A; 1VQ6 T; 2LNH B; 1QP3 A; 3NMZ C; 2FO0 A; 1W2B S; 3CCM Q; 4OB1 B; 1W6X A; 3I56 A; 4PJJ A; 2HZY A; 2MWO A; 4C8Q B; 2E6Z A; 1NEB A; 3H0H A; 4QQD A; 2DD4 A; 3GBQ A; 2HQH A; 1VQP A; 5L8R E; 3JCM P; 2KY9 A; 1W70 A; 4C92 B; 1FX7 A; 2A37 A; 3OYE A; 5GAN 4; 5GJW B; 2G6F X; 4EPC A; 3DLL A; 3BDU A; 3OBY A; 2F69 A; 5M9O A; 1VQK T; 4JDS A; 3OMG A; 2CSQ A; 4HVU A; 4M78 G; 1B7T A; 4BI3 A; 5GAO r; 4M7D C; 3CCR Q; 1VQ8 A; 2RQV A; 4J9I A; 1KHC A; 1GFD A; 2CT3 A; 1VQ9 T; 1ZQ1 A; 3VUB A; 2XG8 D; 4C5I A; 4BE2 A; 4C92 F; 3HKS A; 1YJN T; 1TXQ A; 5FLX E; 1YJW A; 3CXC P; 3L2Z A; 3S6W A; 4LN2 A; 5I2M A; 2E64 A; 4C5H A; 3CC7 A; 3CCU T; 2KDS A; 4C0G A; 2EQM A; 1AT1 B; 3CBP A; 4HA8 A; 3VYG A; 5GAN 8; 4FT2 A; 3H9N A; 1SPK A; 3J7A F; 3E2U A; 4X9C A; 1VQO T; 3QO3 A; 1JEG A; 4RG2 A; 1TG0 A; 1AWO A; 5IHK A; 1EZZ B; 1D1C A; 1QWE A; 3HTR A; 1I81 A; 1JJ2 S; 1TUC A; 1BBZ A; 4GY5 A; 4IIO A; 2NLU A; 3LX7 A; 1UHF A; 4K11 A; 1WX6 A; 5CKH A; 4M4Z A; 1ZHI A; 1M90 C; 5GAO p; 3OS2 A; 1K8A R; 1VQ5 Q; 3QDF A; 3RIR A; 2K6D A; 2HL5 C; 1RAH B; 1UGV A; 4PJO F; 1UG1 A; 4WCI A; 4C8Q C; 1IHW A; 2DVE A; 3MJX A; 4M7D A; 4DOW A; 2XU8 A; 4HCB A; 2LTO A; 3MCA B; 1VQN Q; 4FYV B; 2ABL A; 4QT7 A; 5IHN A; 2YXY A; 2FG0 A; 1ABO A; 2HMA A; 3A1P A; 4Y92 A; 3CME Q; 4XQ3 A; 5D6W A; 5DY9 A; 3OW2 A; 5CK9 A; 1WA7 A; 2Y90 A; 3L42 A; 4NL2 A; 3A8L B; 5D6Y A; 3VS3 A; 1FXX A; 3JCM e; 3Q1J A; 3QWY A; 1OV3 A; 2JNG A; 4UC4 A; 2KYB A; 2ZPH B; 3FIF A; 1U1S A; 1WHL A; 1KD1 R; 2COY A; 3UDC A; 2OTJ T; 5IN1 A; 4C92 E; 1B3Q A; 4HVW A; 4BI4 A; 2B8A A; 3LYI A; 3OYG A; 4M7A D; 2L5Q A; 3P8H A; 2PQW A; 1UJY A; 2VGN A; 3R6N A; 1VOM A; 2W10 A; 1M2O A; 3OY9 A; 4E6R A; 3HRT A; 4MZT A; 1CKB A; 4PKC C; 4A54 A; 3ZEH A; 3UA7 A; 2JXB A; 1IRE B; 1VQL T; 2EQU A; 1KQS A; 3G6E Q; 2A3L A; 1Q81 U; 2RI5 A; 3VUZ A; 4KT0 E; 5DLQ E; 1XNI A; 1K4U S; 2NUP A; 4RTT A; 4O5V A; 4C8Q A; 2L2P A; 2WSE E; 5KYN A; 6AT1 B; 4II1 A; 1M9S A; 3JSC A; 1D3B A; 1IGU A; 3EG9 A; 2O9V A; 4BD3 A; 2SRC A; 1QLY A; 1YIT Q; 3CCQ Q; 4M7A B; 4R55 A; 3G71 T; 3EAE A; 4PJO E; 1R8O B; 3OYN A; 1NJI R; 3EHQ A; 4N4I A; 2DJQ A; 2OAW A; 3QHS A; 2M0Y A; 3EGU A; 3V7C A; 3FRN A; 1BCM A; 3JB9 J; 3CPW P; 4C0Z A; 4TVR A; 4RMO A; 5KE2 A; 1X27 A; 2VXF A; 4KUI A; 2RF0 A; 1VQ4 T; 5IH2 A; 3JCM Q; 3VU3 C; 4OMQ A; 3SEM A; 2CUB A; 3M9Q A; 5GAM j; 1G3S A; 1VIE A; 2D8J A; 1WHG A; 2QDY B; 3CC4 Q; 3JCM W; 1LNX A; 1OOT A; 2M16 A; 3CCR A; 1JXM A; 4XTV A; 1Q82 U; 2CZ0 B; 4FT4 A; 2B86 A; 1O75 A; 1BCO A; 2QGF B; 1R77 A; 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