The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
70
|
structure length |
70
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Chain Sequence |
GSSGSSGTPYRAMYQYRPQNEDELELREGDRVDVMQQCDDGWFVGVSRRTQKFGTFPGNYVAPVSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Solution Structure of the SH3 domain of the Vinexin protein
rcsb |
| molecule keywords |
Vinexin
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| total genus |
8
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| structure length |
70
|
| sequence length |
70
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3NPF A; 3VS4 A; 2CDT A; 2DRM A; 1SHF A; 4LNP A; 2AK5 A; 2RQW A; 2CH4 A; 4J9G A; 4J9D A; 1Z9Q A; 1YN8 A; 2G6F X; 1VA7 A; 3H0F A; 1K1Z A; 1U5S A; 2A36 A; 1M30 A; 2DBM A; 4F16 A; 2QDL A; 2L3S A; 2E5K A; 4RTT A; 5FWC A; 3O5Z A; 2DL8 A; 2F2X A; 1GBR A; 1K4U S; 4AFZ C; 1GRI A; 2D8H A; 1NLP C; 1T0H A; 1UG1 A; 2KXC A; 1NEB A; 1ABO A; 1QWF A; 2ENM A; 2J6K A; 4HCK A; 2KR3 A; 3GBQ A; 2EKH A; 4RTU A; 2P4R A; 2C0O A; 4F14 A; 1QLY A; 3M0S A; 1ARK A; 5IXF A; 1K9A A; 1RLP C; 3EG1 A; 4IIM A; 2ABL A; 1JQQ A; 4OML A; 3C0C A; 2ESW A; 2HBW A; 1YCS B; 3U23 A; 2AKK A; 1E6G A; 4ZNX A; 4ESR A; 1ZX6 A; 3H41 A; 4DEY A; 2GTJ A; 2B86 A; 2DYB A; 2J6O A; 4J9B A; 1I1J A; 3EG0 A; 1RUW A; 1FYN A; 2F2V A; 2LP5 A; 2JM8 A; 4OMN A; 2GBQ A; 2EGE A; 1E6H A; 2RPN A; 2I0N A; 2KGT A; 1NG2 A; 5IHN A; 4RTX A; 4D8D A; 1W1F A; 1GFD A; 1YNZ A; 3QWY A; 1V1C A; 1WXU A; 1BBZ A; 2FRY A; 4CC7 A; 1TUC A; 2KRM A; 4HVV A; 1UEC A; 2LQW A; 1UUE A; 3M0T A; 3VS3 A; 2JXB A; 1ZUY A; 4A63 B; 2DRK A; 1X27 A; 2JM9 A; 5I22 A; 4WCI A; 2KXD A; 4GBQ A; 2JS0 A; 2ROT A; 1Y57 A; 2KEA A; 2MIO A; 1UE9 A; 3UAT A; 2K79 A; 2X3W D; 3JV3 A; 1IO6 A; 1B3Q A; 1GCQ A; 2D1X A; 2VVK A; 1K0S A; 3NGP A; 2SEM A; 4R0K A; 4CC2 A; 4HXJ A; 2DNU A; 2DL4 A; 3NHN A; 3PVQ A; 1M27 C; 2L0A A; 1X6G A; 1JO8 A; 1NYF A; 1SRL A; 2ED0 A; 2GNC A; 4ORZ A; 3THK A; 2KRS A; 1ZBJ A; 2O88 A; 1VYT A; 1S1N A; 1K0X A; 2L2P A; 2CH4 W; 4JJB A; 2BZY A; 2EVR A; 4JJC A; 2H8H A; 1TG0 A; 1OPK A; 4HVW A; 1WYX A; 2JS2 A; 1U3O A; 2KRO A; 1CKB A; 2YUO A; 3EGU A; 1X2Q A; 3H0I A; 1H3H A; 1SSH A; 2KRN A; 2V1R A; 1AWX A; 2HDA A; 1MUZ A; 4Z89 A; 1X6B A; 3I5R A; 4DEX A; 2OAW A; 2LJ3 A; 2HEQ A; 2LQN A; 1M3B A; 2A28 A; 3EG2 A; 2NUZ A; 2DMO A; 2J6F A; 4HVU A; 1YP5 A; 2LMJ A; 2J05 A; 2EYZ A; 2K9G A; 2KE9 A; 3R6N A; 2K6D A; 1W6X A; 1I0C A; 2DVJ A; 1ZLM A; 2ROL A; 2RQR A; 1YWO A; 3RBB B; 1B07 A; 1ZUU A; 2DL3 A; 1AZE A; 2SRC A; 1AWJ A; 4GLM A; 2EYW A; 4J9H A; 1AD5 A; 2FPE A; 1E7O A; 1T3S A; 2DF6 A; 2CSQ A; 4Z88 A; 1ZUK A; 4OMQ A; 5IH2 A; 3REA B; 1EFN A; 1NYG A; 2GGR A; 1AWO A; 2DBK A; 3VS2 A; 2YUP A; 4EIK A; 3SHW A; 2BTT A; 1NM7 A; 2AZV A; 4FSS A; 1JXM A; 5FW9 A; 3UA6 A; 1H92 A; 4E6R A; 3EHQ A; 5GJV B; 3A98 A; 2M0Y A; 2RQU A; 4OMM A; 1SPK A; 4JJD A; 1KSW A; 3H0H A; 2EQI A; 2YSQ A; 1J3T A; 1Y0M A; 1UHC A; 5L23 A; 1K76 A; 1NLO C; 2MCN A; 2AZS A; 2DL7 A; 1XOV A; 2EBP A; 1UDL A; 5IHK A; 1SRM A; 3EHR A; 5IHI A; 1G83 A; 3I35 A; 2VWF A; 2L3Q A; 4KRT A; 1X69 A; 1AOJ A; 1MV0 B; 1MV3 A; 1BB9 A; 1A0N B; 2LJ1 A; 1WIE A; 2O9S A; 2V1Q A; 4RTV A; 4M4Z A; 2FG0 A; 2KYB A; 2JTE A; 1PHT A; 1PWT A; 4F17 A; 1UJY A; 3VRY A; 3CQT A; 4AG2 C; 1CKA A; 1M3A A; 1T3L A; 5EC7 A; 2YT6 A; 5FWB A; 3VRZ A; 2J06 A; 1AEY A; 2FPD A; 2DX1 A; 2LCS A; 2EW3 A; 1PRL C; 1PKS A; 1SHG A; 1AWW A; 1UJ0 A; 1PRM C; 1I07 A; 1FMK A; 2DL5 A; 1BK2 A; 4JZ4 A; 2FPF A; 3ULR B; 1M8M A; 1AVZ C; 2RNA A; 2RMO A; 4LE9 A; 4LN2 A; 2LJ0 A; 2DJQ A; 2RQV A; 2OI3 A; 2JMA A; 1X2K A; 1HJD A; 1WLP B; 4Z8A A; 4RTW A; 4CC3 A; 3VS7 A; 2O31 A; 2OJ2 A; 4AG1 C; 1WA7 A; 3FJ5 A; 2A08 A; 1UHF A; 4IIO A; 4LUD A; 2D0N A; 2PNI A; 2KNB B; 2FEI A; 3M0P A; 2MOX A; 1ZSG A; 4CC4 B; 2NWM A; 4QT7 A; 4AFQ C; 3EG3 A; 2KT1 A; 3UF4 A; 2DE0 X; 2YUN A; 1NEG A; 4X1V A; 1GCP A; 1WI7 A; 2K2M A; 4RTZ A; 2O2O A; 3VS6 A; 2IIM A; 3IQL A; 2DM1 A; 2D8J A; 3M0U A; 4J9C A; 2PTK A; 2EYX A; 5GJW B; 2RQT A; 4LUE A; 2W10 A; 1LCK A; 2PZ1 A; 1KIK A; 3RNJ A; 2M51 A; 2C0T A; 2EGC A; 1PKT A; 2GQI A; 1YWP A; 1TUD A; 2CUB A; 2RN8 A; 3ZL7 C; 1WXT A; 3QWX X; 2JW4 A; 2BZ8 A; 2FO0 A; 2VKN A; 1VYU A; 2CT3 A; 4J9F A; 3SEM A; 4D8K A; 1RLQ C; 2JT4 A; 1GBQ A; 4Y92 A; 4RTY A; 4AFS C; 1JEG A; 1OEB A; 1OOT A; 2ECZ A; 2LZ6 B; 4K11 A; 3I9Q A; 2EPD A; 1SEM A; 1KFZ A; 1ABQ A; 2DIL A; 3M0Q A; 1BU1 A; 1UGV A; 2YUQ A; 1WXB A; 2JMC A; 1QWE A; 1UFF A; 1T0J A; 1OPL A; 4RUG A; 2HCK A; 2CRE A; 2YDL A; 2KBT A; 1VYV A; 3UA7 A; 1CSK A; 1M3C A; 5ECA A; 3TSW A; 2DA9 A; 1U06 A; 2ED1 A; 3PE0 A; 4J9E A; 3NMZ C; 2CT4 A; 2FRW A; 4J9I A; 5IXB A; 1WDX A; 1QKX A; 2KYM A; 1RI9 A; 2C0I A; 1QCF A; 4AFU C; 2LNH B; 2K3B A; 2RF0 A; 1AZG B; 4JZ3 A; 1OV3 A; 2GTO A; 2AKL A; 3VS1 A; 3TSZ A; 2KT8 A; 2LX7 A; 2K7A A; 1X43 A; 1JXO A; 2CUD A; 2HSP A; 2W0Z A; 2F2W A; 5I11 A; 1GFC A; 1JU5 C; 1WFW A; 1N5Z A; 2XMF A; 2J7I A; 3I5S A; 1G2B A; 1QKW A; 1WX6 A; 1UTI A; 3VS0 A; 1PNJ A; 3TVT A; 2O9V A; 3LH5 A; 1HD3 A; 5HCK A; 2EGA A; 2A37 A; 2BZX A; 1GCQ C; 3KFV A; 3M0R A; 3REB B; 1Z9Z A; 4OMP A; 1GL5 A; 2EYY A; 2X3X D; 1H8K A; 1W70 A; 4OMO A; 3PVL A; 4JPB W; 2CSI A; 2DLP A; 1KJW A; 1HSQ A; 3VS5 A; 2L3P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2CZ7 B; 1IHV A; 1M9S A; 2E3I A; 2BE9 B; 4FCY A; 2RQW A; 2KK4 A; 3L42 A; 4E7L A; 4J9G A; 3WVE B; 3QO3 A; 2E65 A; 4JRP A; 1VA7 A; 4FYY B; 3TCJ A; 2A36 A; 3QJY A; 2XDD A; 2ZPB B; 2QDL A; 2L3S A; 1PC0 A; 1P92 A; 4RTT A; 5FWC A; 5HKC A; 1LOJ A; 2DL8 A; 4C92 E; 3MET A; 4C92 F; 3OYE A; 4AFZ C; 1UG1 A; 3D7S B; 1PD0 A; 3CCR A; 1PG5 B; 5CKF A; 1VQ7 T; 2VUB A; 1NEB A; 1QWF A; 1VQ5 T; 2KR3 A; 5CIU A; 3X28 B; 1YJW T; 3PMI A; 2CP7 A; 1ARK A; 3JCM V; 4IIM A; 4OML A; 3CD6 T; 3E9F A; 1Q82 U; 3M54 A; 2HBW A; 1SSF A; 2RI3 A; 3S3N A; 3HRS A; 4ESR A; 2EQK A; 2JJ9 A; 4JRI A; 3UWN A; 3N5B B; 2DET A; 2COW A; 5CAI A; 2R57 A; 3EG0 A; 1RUW A; 2F2V A; 2LP5 A; 2GBQ A; 1M1K C; 1PSE A; 2RPN A; 4M7A B; 2KGT A; 3CCS Q; 7AT1 B; 4EDU A; 4F7U B; 2P0K A; 3S3M A; 1YIJ T; 1BBZ A; 3FLG A; 4ZN3 A; 3CC7 Q; 1WHK A; 4DA4 A; 1VQL A; 3NTI A; 2LQW A; 4HVV A; 4N0A A; 3M0T A; 5GAN 3; 1VQP T; 2D6F A; 2JNG A; 2X4X A; 2KXD A; 1JBM A; 2ZCF B; 2JS0 A; 3EGD A; 1TU0 B; 1O75 A; 2F5K A; 2VXF A; 3UAT A; 1EZZ B; 1GCQ A; 2CZ0 B; 2SEM A; 3OQ5 A; 1SG5 A; 3A5Z B; 3RMS A; 3VJP A; 2DNU A; 3C94 A; 4PJL A; 3NHN A; 1HYO A; 4C8Q A; 3KUF A; 2XIC A; 1Y71 A; 3NTK A; 3G6E A; 4BE0 A; 2O88 A; 4JJB A; 1VQO T; 3DB4 A; 3A1P A; 4BUG A; 1KC8 C; 4JRK A; 2JS2 A; 4FW2 A; 2KRO A; 2DTO A; 4RMO A; 1CKB A; 1K73 R; 1JJ2 P; 1C6V X; 4M77 E; 4M77 F; 1SSH A; 4M7A D; 2PVG B; 2E12 A; 4NL2 A; 4QQ6 A; 3OSV A; 4M7A G; 1WQW A; 2MMP A; 1NPP A; 3I5R A; 4DEX A; 4F7U G; 2DMO A; 2J6F A; 3OA6 A; 1D3B A; 4JLI A; 4M7A C; 2J05 A; 4HA8 A; 2X4W A; 4IUV A; 2ZPF B; 2O01 E; 3RR6 A; 3CCJ T; 3GIB A; 1MMN A; 4E7J A; 3J81 E; 2OTL A; 3GP8 A; 2EYW A; 2LT1 A; 4OP0 A; 2YXY A; 1E7O A; 4JRQ A; 3SWN B; 2L8D A; 2DEQ A; 4CI0 C; 4Z88 A; 1VQM T; 4OMQ A; 1ZA2 B; 1EFN A; 1TTH B; 1VQ8 T; 2ZPG B; 2DBK A; 4EIK A; 2YUP A; 1M8V A; 1VQ9 Q; 3EHQ A; 4A4G A; 3A98 A; 4M7D A; 1M1K U; 3I55 A; 4C8Q B; 3CMA T; 2YSQ A; 3V7C A; 1QQJ A; 3NFC A; 3BE3 A; 3HRU A; 3V7S A; 4OB1 B; 2DL7 A; 4C92 A; 2QA4 A; 1KD1 C; 2RHY A; 1G83 A; 4BD3 A; 3CCU T; 3M56 A; 2LCL A; 3EFS A; 3JSC A; 2DD5 A; 2HQE A; 1RL2 A; 4V2S A; 2LJ1 A; 4XTW A; 1KQS S; 2KYB A; 1UJY A; 3EH1 A; 4KUL A; 4MDW A; 4AG2 C; 1T3L A; 4XTY A; 1D3B B; 2DER A; 2DXB A; 2YHT A; 3OYG A; 2XDP A; 1OI1 A; 4XQ3 A; 2WAC A; 1VQ6 Q; 1KC8 U; 1I07 A; 2ZPH B; 4XTV A; 2V8K A; 1FMK A; 2GCX A; 1BK2 A; 2LC4 A; 3ULR B; 1M2O A; 4JLG A; 1YJ9 T; 5FRM A; 2K5I A; 4KUD K; 4C8Q D; 4JUV A; 3G71 Q; 2X51 A; 3MPU B; 4Q5W A; 4J5Y A; 2OI3 A; 2F1L A; 4C8Q G; 1HJD A; 2QEX A; 4KBM B; 4B9X A; 4RTW A; 4KT0 E; 3M58 A; 4C8Q C; 1VQ4 T; 4M7D B; 2DD4 A; 1FWZ A; 5HK0 A; 4LUD A; 5KYN A; 2D0N A; 2PNI A; 2FEI A; 2XID A; 4Y91 A; 2MOX A; 1ZSG A; 1K8A R; 5C6S A; 2NWM A; 3JB9 J; 4QT7 A; 1VQ7 Q; 3V7R A; 5I21 A; 3A8M B; 3QYH B; 3UF4 A; 1VQ5 Q; 2CP0 A; 2EFI A; 2O4X A; 1WI7 A; 2DO3 A; 4RTZ A; 1YJW Q; 5GAM j; 2D8J A; 2KSS A; 2YRD A; 2QQB A; 2HL5 C; 3M0U A; 1K9M C; 2EYX A; 1WGS A; 3L2U A; 2VYT A; 1LPL A; 3DLM A; 5GJW B; 1Q82 R; 1C0M A; 1UGS B; 3L2Z A; 2CUB A; 1RAF B; 1D0Y A; 3ZL7 C; 4GY5 A; 2HQH A; 2VKN A; 3ER0 A; 3VYG A; 1VYU A; 3GPL A; 2CP3 A; 1GBQ A; 2FVU A; 4LDW A; 4AFS C; 1JEG A; 1OEB A; 1OOT A; 3PMT A; 2I2L A; 4PJO E; 4N4H A; 4PJO F; 2LDM A; 5CR2 A; 2X4Y A; 1BI0 A; 2DKG A; 2DIL A; 1YIJ Q; 3M0Q A; 1VQ7 A; 2JMC A; 1UFF A; 1T0J A; 4ZN1 A; 3OYB A; 3VUB A; 2YDL A; 2E10 A; 1QVF P; 1VQP Q; 4M7D D; 1O9S A; 5DM7 R; 2VC8 A; 4VUB A; 4M7D G; 4J6W A; 1U06 A; 3CD6 A; 2FRW A; 1X6O A; 4WTO B; 4M7D C; 1QKX A; 3FIF A; 2JTM A; 2QGF B; 1BI1 A; 1QCF A; 4JS5 A; 2LNH B; 1AZG B; 4JZ3 A; 1I8F A; 2AKL A; 3GLX A; 3VS1 A; 3S6W A; 5GAN 6; 3TSZ A; 3HPW A; 2KT8 A; 2LX7 A; 3H9N A; 2K7A A; 1M90 C; 5I11 A; 4M78 G; 1GFC A; 4CRI A; 2LT4 A; 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2FZG B; 3CCU Q; 3PNW C; 2NUP B; 3TU4 K; 2L3R A; 2HKQ B; 1OX9 A; 1BIB A; 5IHN A; 2IPO B; 1W1F A; 1GFD A; 2LCC A; 4KUI A; 1V1C A; 2K5F A; 1VQM A; 2Y4Y A; 3RER A; 2K2V A; 4CC7 A; 1VIF A; 2FZK B; 2DAQ A; 1UUE A; 2MYS A; 5CKE A; 1VQ8 A; 3EG9 B; 2PVO B; 2AT1 B; 4DBR A; 4A63 B; 2DRK A; 9ATC B; 5I22 A; 1M90 U; 5I2S A; 2K3X A; 2KEA A; 4J6X A; 1KG1 A; 1B3Q A; 1K0S A; 3LH0 A; 3NGP A; 4R0K A; 4CC2 A; 4HXJ A; 1WHL A; 3QDR B; 2VGM A; 1M1F A; 1M27 C; 2L0A A; 2V26 A; 3UPU A; 4ORZ A; 2QQS A; 2KRS A; 1YJ9 Q; 1ZBJ A; 3CC4 T; 2BKD N; 4ZGD B; 1VYT A; 4J83 A; 5FU6 B; 3QZ5 B; 2KQW A; 4BB7 A; 4E7S A; 1TG0 A; 4HVW A; 1U3O A; 2A3L A; 4LD9 K; 5CKB A; 3OYH A; 1UEB A; 1WHG A; 4X9D A; 2YUO A; 3FB9 A; 4BY6 B; 2HSE B; 1YIT A; 3H0I A; 3JCM X; 4F04 B; 2LRQ A; 3A8H B; 5FRO A; 1Q7Y U; 2HKN A; 1AWX A; 2Y4X A; 2HDA A; 2CYZ B; 1X6B A; 2ZPE B; 3I56 T; 2LJ3 A; 8AT1 B; 5KH6 A; 5KYY A; 3JB9 F; 2LQN A; 1M3B A; 1VUB A; 4HVU A; 2LMJ A; 1NJI C; 1K8A U; 2ZGW A; 3R6N A; 4XK8 E; 1W4S A; 1I0C A; 2DVJ A; 2ROL A; 2RQR A; 3KXT A; 3GOX A; 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