The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
79
|
structure length |
79
|
Chain Sequence |
GSSGSSGPLPNPEGLDSDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRESYIPGICVARVSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of the human SRC-like adopter protein (SLAP)
rcsb |
| molecule keywords |
SRC-like-adapter
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
10
|
| structure length |
79
|
| sequence length |
79
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4RUG A; 4JJC A; 4F17 A; 2LX7 A; 3VS4 A; 1VYU A; 2CT4 A; 1WX6 A; 1UEC A; 2ECZ A; 4J9B A; 4ESR A; 1E6H A; 1GFC A; 3EHQ A; 4RTZ A; 1CKA A; 2JXB A; 1YWP A; 1CKB A; 2M0Y A; 3NGP A; 3M0T A; 1UJY A; 1X43 A; 2DRK A; 3M0P A; 4J9D A; 1PRL C; 3TVT A; 1GBR A; 1K4U S; 2K3B A; 1E7O A; 1WI7 A; 1I0C A; 1H8K A; 2BTT A; 1GRI A; 2EYX A; 2LJ3 A; 1SSH A; 1ZX6 A; 2CRE A; 2L0A A; 1XOV A; 2JTE A; 2BZY A; 1AWW A; 3IQL A; 2ESW A; 2YDL A; 1TUD A; 4J9I A; 2O9S A; 4A63 B; 1X6G A; 1OPL A; 1UHF A; 2LQW A; 2KEA A; 1FYN A; 2HSP A; 4GLM A; 4HVW A; 4HVU A; 4EIK A; 3RNJ A; 2CH4 W; 4LNP A; 2RQU A; 1G83 A; 1UJ0 A; 2ABL A; 1SHF A; 1OEB A; 1W6X A; 4AFS C; 4R0K A; 5IXF A; 2O9V A; 4AG1 C; 2F2X A; 2X3W D; 3SHW A; 2DL4 A; 4AFU C; 1OPK A; 2AZS A; 2JM9 A; 1FMK A; 2A37 A; 4LE9 A; 5IHN A; 2LZ6 B; 3R6N A; 4J9C A; 2MOX A; 2SRC A; 1EFN A; 1X27 A; 4OMN A; 5ECA A; 1M8M A; 1ARK A; 2L2P A; 1QLY A; 5I11 A; 1RI9 A; 4IIO A; 1M3C A; 4Z8A A; 2J05 A; 1AVZ C; 2RF0 A; 1GCQ C; 3QWX X; 5IHK A; 1SRM A; 2LQN A; 2YSQ A; 5FWC A; 3TSZ A; 1ZUY A; 2H8H A; 2IIM A; 2J6K A; 1X6B A; 1UFF A; 2GBQ A; 2KBT A; 4J9G A; 2NWM A; 4RTY A; 4CC7 A; 2DX1 A; 4RTV A; 2JM8 A; 4X1V A; 1H3H A; 2JS2 A; 1M27 C; 2EPD A; 2K9G A; 2FPF A; 2RN8 A; 2YUQ A; 2W10 A; 4ZNX A; 2PZ1 A; 2FRW A; 3M0Q A; 2OI3 A; 2EGC A; 3M0R A; 3H0F A; 1JU5 C; 1WYX A; 1MV3 A; 5FW9 A; 2A28 A; 2OAW A; 4J9H A; 2C0T A; 2KXC A; 2CDT A; 1WFW A; 2DL3 A; 1S1N A; 3UA6 A; 2JT4 A; 2RMO A; 2NUZ A; 4QT7 A; 1JQQ A; 1PWT A; 2G6F X; 3VS0 A; 1QKX A; 2GTJ A; 3PVL A; 2ED0 A; 3VS6 A; 2KR3 A; 2AKL A; 2LMJ A; 4D8D A; 1RLP C; 3UF4 A; 2L3Q A; 1GFD A; 1NYG A; 1OV3 A; 1IO6 A; 2DBM A; 3VS7 A; 3O5Z A; 1TUC A; 1AD5 A; 1QWE A; 2YT6 A; 2KRO A; 1UDL A; 4K11 A; 2EYY A; 5IXB A; 1ABQ A; 1K76 A; 4OMM A; 2KT1 A; 1Y57 A; 2D0N A; 4JZ3 A; 4E6R A; 4FSS A; 2O2O A; 3VS5 A; 1YN8 A; 4D8K A; 3QWY A; 2FO0 A; 2VKN A; 2KGT A; 3ULR B; 2P4R A; 1QCF A; 4J9E A; 1VA7 A; 1NM7 A; 5GJW B; 2CSI A; 4HVV A; 1W70 A; 3VS3 A; 4DEX A; 3JV3 A; 1B07 A; 2DMO A; 2SEM A; 2O31 A; 1NYF A; 1NEB A; 1ABO A; 1QKW A; 3EHR A; 1Y0M A; 4Y92 A; 1PHT A; 2V1R A; 1PKS A; 2B86 A; 3C0C A; 1UHC A; 4AFZ C; 2AK5 A; 4RTW A; 1X2Q A; 4JJD A; 1NLO C; 3H0I A; 5IH2 A; 2D8J A; 1SHG A; 2CUD A; 2KNB B; 5GJV B; 4HXJ A; 2O88 A; 1SEM A; 1KIK A; 1K1Z A; 2GTO A; 4AFQ C; 2D8H A; 1KJW A; 2I0N A; 3FJ5 A; 1WXT A; 3EG3 A; 3NHN A; 1MV0 B; 1UGV A; 3NPF A; 4LUE A; 2A08 A; 2RQR A; 2LJ1 A; 2E5K A; 2DL7 A; 2VVK A; 4KRT A; 2J6F A; 2DNU A; 1PRM C; 1M3A A; 2F2V A; 2OJ2 A; 2AKK A; 2KE9 A; 1JEG A; 3PE0 A; 2EQI A; 1ZBJ A; 2K2M A; 3THK A; 4CC4 B; 1I07 A; 3PVQ A; 4LN2 A; 2C0O A; 2GGR A; 2DE0 X; 2KYB A; 2KRN A; 1YCS B; 4Z88 A; 1HD3 A; 3U23 A; 2RQV A; 1VYV A; 2LNH B; 2FG0 A; 4F14 A; 2ENM A; 2HCK A; 1J3T A; 3M0U A; 3I5S A; 5HCK A; 3CQT A; 4WCI A; 1OOT A; 5FWB A; 4JJB A; 1YWO A; 1U06 A; 1WXU A; 2J6O A; 2AZV A; 2RQW A; 2KRM A; 2L3S A; 2FRY A; 3RBB B; 5L23 A; 2D1X A; 1WDX A; 1WLP B; 1BB9 A; 3SEM A; 4CC3 A; 2EGE A; 4HCK A; 4RTU A; 2EBP A; 1TG0 A; 1U5S A; 3ZL7 C; 2A36 A; 1NG2 A; 4M4Z A; 1BK2 A; 1B3Q A; 3EG2 A; 2RNA A; 2DJQ A; 2MCN A; 2J06 A; 1W1F A; 2YUN A; 1E6G A; 1WA7 A; 4RTT A; 4F16 A; 4OMP A; 1M30 A; 2ROT A; 2HEQ A; 1GL5 A; 5EC7 A; 2K6D A; 2JMA A; 2F2W A; 4ORZ A; 4OML A; 1UG1 A; 1U3O A; 2GNC A; 1A0N B; 1M3B A; 1ZSG A; 1BBZ A; 3TSW A; 3LH5 A; 2DL5 A; 5IHI A; 2DRM A; 2HBW A; 1BU1 A; 2LJ0 A; 1CSK A; 2KYM A; 1JXM A; 3EGU A; 3M0S A; 2FPD A; 1AWX A; 2K7A A; 4GBQ A; 2FPE A; 2X3X D; 2LP5 A; 2DBK A; 1KSW A; 1UUE A; 1G2B A; 3VS2 A; 1GCQ A; 1HSQ A; 1ZLM A; 3UA7 A; 4RTX A; 1AOJ A; 2DVJ A; 1RUW A; 2JMC A; 1NLP C; 3H0H A; 1JO8 A; 1NEG A; 3NMZ C; 1GBQ A; 2RPN A; 1GCP A; 2LCS A; 3REB B; 1UTI A; 2HDA A; 4JPB W; 4LUD A; 2J7I A; 2EYZ A; 4J9F A; 2PTK A; 2W0Z A; 1AWO A; 2CH4 A; 2JW4 A; 1KFZ A; 1T0J A; 1MUZ A; 2RQT A; 3H41 A; 1K0S A; 3I5R A; 2CUB A; 2XMF A; 4DEY A; 2MIO A; 2BZ8 A; 1AEY A; 1LCK A; 3GBQ A; 1JXO A; 1PKT A; 3EG0 A; 1K0X A; 3VRZ A; 2EVR A; 2C0I A; 1X2K A; 2V1Q A; 2CSQ A; 2CT3 A; 2DIL A; 3REA B; 1T0H A; 2FEI A; 1H92 A; 1I1J A; 2KXD A; 2BZX A; 2DL8 A; 2DA9 A; 1HJD A; 2KT8 A; 5I22 A; 3KFV A; 4OMO A; 4IIM A; 3VS1 A; 1N5Z A; 4Z89 A; 1K9A A; 1AWJ A; 2PNI A; 2EYW A; 1PNJ A; 1AZE A; 2DM1 A; 1X69 A; 2DYB A; 1SPK A; 1RLQ C; 1WXB A; 1Z9Q A; 3I9Q A; 2M51 A; 4AG2 C; 2DF6 A; 1V1C A; 2GQI A; 2EW3 A; 1Z9Z A; 2YUP A; 2YUO A; 1QWF A; 1YP5 A; 1WIE A; 4JZ4 A; 1SRL A; 2EKH A; 1VYT A; 1T3L A; 1ZUU A; 2K79 A; 1ZUK A; 1YNZ A; 1T3S A; 1UE9 A; 2EGA A; 2L3P A; 2QDL A; 4CC2 A; 3EG1 A; 3A98 A; 3I35 A; 2ROL A; 2JS0 A; 4OMQ A; 3VRY A; 2KRS A; 2ED1 A; 1AZG B; 3UAT A; 2VWF A; 2DLP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1K73 U; 1D09 B; 4JJC A; 1KG1 A; 4KUL A; 2LX7 A; 3X25 B; 3VS4 A; 5C6S A; 1VQ9 T; 1VYU A; 4M7D E; 1WX6 A; 1FXX A; 1W2B P; 1IGQ A; 1IGU A; 1VQ4 T; 1Q81 U; 4M77 B; 4QVD A; 3OBW A; 4PFZ A; 3QHS A; 1K4U S; 1WJR A; 3UDC A; 2K3B A; 1JBM A; 1VQO A; 3G6E T; 4OGC A; 1I0C A; 1H8K A; 1YJN A; 1QVF A; 3NTK A; 2YRC A; 3GP8 A; 2L0A A; 2CZ1 B; 4J8O A; 3G1J A; 1TUD A; 1HYO A; 3CC4 A; 4A63 B; 2WSF E; 1X75 C; 4M77 G; 2M16 A; 1KK7 A; 3JAM E; 2C06 A; 1VQK A; 3SWN A; 2KEA A; 3OYI A; 1R0C B; 4EIK A; 3I56 A; 4BE2 A; 2LT1 A; 2JVV A; 1W6X A; 1ACM B; 2F2X A; 4MZT A; 4AFU C; 3CXC A; 1YJ9 T; 2HD0 A; 2A37 A; 3CPF A; 2LCL A; 5IHN A; 4OMF B; 2QYZ A; 2MOX A; 1N9R A; 1SG5 A; 2CKK A; 3C4S A; 2EKO A; 3L42 A; 1NPR A; 5GAO m; 3S3O A; 3BY7 A; 3ME9 A; 2MI6 A; 3QWX X; 4XAX B; 2LQN A; 2QG9 B; 2H8H A; 2VXE A; 2J6K A; 1C1A A; 1X6B A; 2KY9 A; 4HT8 A; 2V8K A; 1UFF A; 4RTY A; 4FT2 A; 4X1V A; 5GMK m; 4BE1 A; 2CYZ B; 2DVE A; 2K5I A; 3PGG A; 1KQS S; 3I55 Q; 1Q81 R; 2RN8 A; 2W10 A; 4M75 C; 5A2Q E; 4ZNX A; 5KCO A; 3BW1 A; 4C92 D; 1JU5 C; 1WYX A; 3MJX A; 4PLL A; 3J7A F; 1MV3 A; 3INZ A; 5FW9 A; 3OYE A; 2C0T A; 2EJ9 A; 2DL3 A; 5GAN e; 3QKJ A; 2RMO A; 3HSB A; 1KC8 U; 5GAN h; 1Q7Y U; 1QVG A; 3VS6 A; 3QUI A; 2KR3 A; 1VQ6 T; 3CMA A; 5GAM e; 2YLC A; 4D8D A; 2BUD A; 4QKU A; 2E64 A; 3M53 A; 5GAM h; 2F1L A; 3VS7 A; 3JSC A; 3RUX A; 2MYS A; 1TUC A; 5J26 A; 3FJP A; 1D0X A; 2D0Q B; 4L59 A; 3QXE B; 3JCM V; 4K11 A; 2K5L A; 1K76 A; 5M9O A; 2D0N A; 1RI0 A; 4E6R A; 2ZPB B; 2DPP B; 3VS5 A; 1YN8 A; 3M58 A; 3F70 A; 2NUT B; 1M8V A; 4XU3 A; 2L89 A; 1VQO T; 3MEU A; 1QCF A; 1OYX A; 1NM7 A; 5GJW B; 1FWZ A; 2CSI A; 5CKF A; 1W70 A; 1YJN T; 1VQ5 A; 5GAN 6; 1TWB A; 3PIO A; 5D6X A; 4Z02 A; 2DMO A; 3OYJ A; 2QQR A; 3HFO A; 4BY6 B; 1NYF A; 1ABO A; 1D1B A; 3MP1 A; 2V1R A; 4EMH A; 3G71 A; 4II1 A; 3CC4 T; 2VC8 A; 2AK5 A; 4RTW A; 4JJD A; 1VQK T; 3NTI A; 1SHG A; 4PJO B; 1X6O A; 3I56 T; 5GJV B; 2HKN A; 2O88 A; 3TQ7 P; 4C8Q B; 2GTO A; 2M02 A; 1XJW B; 2QDY B; 4DBH A; 1D0Y A; 2LT4 A; 4AFQ C; 5GMK i; 3OYF A; 3FJ5 A; 4BI3 A; 5LJ3 f; 2DER A; 4LUE A; 1ZSZ C; 2RQR A; 2NYS A; 4PJO G; 1Q95 G; 4BDY A; 2CP3 A; 4PNO A; 2OJ2 A; 4F7U B; 2AKK A; 4C8Q G; 3OYN A; 2VUB A; 1RAA B; 2EQI A; 2K2M A; 1I07 A; 4IUQ A; 2DE0 X; 1SKU B; 1YCS B; 4Z88 A; 1HD3 A; 2VV5 A; 2DTH A; 4BE0 A; 2XG8 D; 3QZ9 B; 3JCM b; 2XI9 A; 3M0U A; 1I8F A; 4ZGJ B; 4F7U G; 1VQN Q; 4WCI A; 4RMO A; 3RMS A; 4ELZ C; 3CBO A; 1U06 A; 1WXU A; 2E12 A; 2X51 A; 4QVZ A; 2AZV A; 5GAN d; 4EPC A; 2JZ2 A; 2D1X A; 4J7F A; 2PUO B; 1C0M A; 1H3Z A; 4CC3 A; 3UWN A; 4RTU A; 4IUP A; 2ZCF B; 2EBP A; 2L5Q A; 5GAM d; 2PUK B; 3CMA T; 2A36 A; 1NG2 A; 4XU2 A; 2RNA A; 4IKF A; 4RCB A; 4M7A B; 2MCN A; 1IXD A; 1B7T A; 2VGM A; 3P8D A; 2ROT A; 1M1K C; 2XIC A; 3OYG A; 2PVG B; 2JMA A; 4ORZ A; 3HKS A; 4M77 D; 2RK1 A; 3QPH A; 3JB9 G; 2LVM A; 4M7A G; 3V7S A; 1VQ5 T; 2HBW A; 5KH6 A; 4OB0 B; 1JXM A; 1D3B B; 1DJ7 B; 1JJ2 S; 1AWX A; 2K7A A; 1QP3 A; 4A4E A; 2FPE A; 2DXT A; 3G71 T; 3AT1 B; 3AHU A; 1UUE A; 3MEA A; 1HSQ A; 3UA7 A; 3A1P A; 3RMQ A; 3CPW S; 2O01 E; 1VQ7 Q; 3JCM X; 3H0H A; 5IT9 E; 5HK0 A; 5KYW A; 1I4K 1; 3LW5 E; 4J9F A; 2PTK A; 4BI4 A; 1AWO A; 4M75 A; 3C95 A; 2JW4 A; 2GFA A; 1UEB A; 2CP7 A; 3TRE A; 1YCY A; 2RQT A; 3H41 A; 2FZC B; 4DEY A; 2BZ8 A; 4X34 A; 3CCR Q; 1G3T A; 2FL7 A; 2COW A; 2CSQ A; 4KBM B; 1T0H A; 3REA B; 5GAN 2; 3CBM A; 2FEI A; 1H92 A; 2DXU A; 2BZX A; 2DL8 A; 2NUP B; 1I5O B; 1HJD A; 4M75 F; 2ZAE A; 5I2S A; 2I2L A; 4GLK A; 2FZK B; 4EMG A; 2EQJ A; 2EYW A; 2DM1 A; 1VIE A; 2DYB A; 5CK9 A; 2M51 A; 4AG2 C; 1R77 A; 2GQI A; 2DIG A; 2EW3 A; 1Q82 R; 1KQS P; 3JCM P; 1M5Q 1; 2XDP A; 5GAN 7; 2EJG A; 3TEE A; 4C92 B; 1VYT A; 2K4Y A; 3VYG A; 2DIQ A; 1BI2 A; 2K79 A; 4XTY A; 4JRP A; 3JCM f; 2RA2 A; 2QGF B; 1PCX A; 1TTH B; 1OX9 A; 3VUZ A; 5IAY A; 3OA6 A; 1O75 A; 3MPU B; 3HRS A; 4J5Y A; 2CGH A; 3UAT A; 2CP0 A; 2DLP A; 2FHD A; 1ZBX A; 4RUG A; 2YLB A; 5CVI A; 4C92 G; 4BY6 C; 5CKB A; 1SSF A; 3JB9 I; 4J9B A; 1E6H A; 3EHQ A; 2JTM A; 3LWI A; 2HBP A; 5KYX B; 1ZSZ A; 4M78 B; 1YWP A; 1VQN A; 3M0T A; 1UJY A; 3M0P A; 4J9D A; 4PJO C; 1PRL C; 1GBR A; 4O6J A; 3X20 B; 4C8Q C; 3JCM Q; 1G8X A; 2BTT A; 3HL8 A; 5CKH A; 2EYX A; 3CCU Q; 1Y71 A; 4X9C A; 1F1B B; 2O4X B; 3QYG B; 3R6O A; 2CRE A; 2JTE A; 3CC2 Q; 2BZY A; 3TCJ A; 1AWW A; 4BD3 A; 4PJO D; 3LX7 A; 2O9S A; 2B8A A; 4M78 G; 4PFP A; 5FU7 B; 3PIP A; 1OPL A; 4C8Q D; 2LQW A; 2R58 A; 3EGD A; 2R5M A; 1FYN A; 4GLM A; 2BE9 B; 3Q1J A; 3CCE Q; 4HVW A; 2QQA A; 2RJD A; 3T9N A; 4RKU E; 1KHC A; 1WJS A; 3OW2 P; 2RH2 A; 3GPL A; 1SHF A; 4HA8 A; 4HT9 A; 5KYU B; 5IXF A; 2AZS A; 3VV0 A; 1YI2 Q; 1EFN A; 1X27 A; 4OMN A; 5FU6 C; 2L2P A; 4R56 A; 4M77 A; 5GAN 4; 4IIO A; 5L8R E; 4EMK C; 4PL6 A; 4DBQ A; 3WXM B; 3EH2 A; 1D1A A; 5IHK A; 1BYM A; 2VAS A; 5FWC A; 2KBT A; 4Y91 A; 1VQ7 A; 4J9G A; 2DX1 A; 4ZTJ A; 4RTV A; 2LNV A; 1H3H A; 1M27 C; 2YUQ A; 2ZPF B; 4JJN K; 4LDY A; 4M77 F; 2M1H A; 3OYY A; 4P5N A; 2ZZD A; 3SD4 A; 3H0F A; 2A28 A; 2QK0 A; 2YWW A; 2DTO A; 4J9H A; 2KXC A; 2CDT A; 2KDS A; 1WFW A; 1S1N A; 3E1S A; 1XNI A; 3JB9 D; 2NUZ A; 1PWT A; 3LGL A; 2EWN A; 2G6F X; 4FYX B; 3CCR A; 2GTJ A; 3PVL A; 4M7A D; 2ED0 A; 3FIF A; 2AKL A; 4M75 E; 2LMJ A; 1RLP C; 3UF4 A; 3G4S A; 2L3Q A; 1YIJ Q; 1NYG A; 1OV3 A; 2EAY A; 2DBM A; 2E6Z A; 2KAF A; 1AD5 A; 2VB6 A; 5LJ3 d; 3OS1 A; 4LD6 A; 1UDL A; 2LDM A; 1Y7X A; 6AT1 B; 4OMM A; 2KT1 A; 1NJI U; 1YBY A; 4JZ3 A; 3JCM c; 4FSS A; 1VQN T; 4D8K A; 3VYH B; 4JUV A; 5CIU A; 4C0D C; 4J9E A; 3CCM A; 1M2V B; 4ME7 A; 1VA7 A; 3GNG A; 4HVV A; 4FCY A; 1JB0 E; 2RB6 A; 3OBY A; 3EHR A; 2CP5 A; 4Y92 A; 1JJ2 P; 1PHT A; 1Q82 C; 1MNE A; 3C0C A; 1UHC A; 4E7K A; 1VQP Q; 1N6A A; 5D6W A; 5FRN A; 2ZPH B; 3KBG A; 3QJY A; 2LX9 A; 4N0A A; 3H0I A; 5IH2 A; 3MEV A; 1H64 1; 2F69 A; 3CPW P; 4PFO A; 5LJ5 j; 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