The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
77
|
structure length |
77
|
Chain Sequence |
GSSGSSGQYFVALFDYQARTAEDLSFRAGDKLQVLDTSHEGWWLARHLEKKGTGLGQQLQGYIPSNYVAEDSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of Fyn-related kinase
rcsb |
| molecule keywords |
fyn-related kinase
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
7
|
| structure length |
77
|
| sequence length |
77
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2005-12-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CT3 A; 4RTZ A; 2YT6 A; 2KNB B; 4F17 A; 2AK5 A; 1J3T A; 2J06 A; 1U3O A; 1PKS A; 3EG0 A; 3NPF A; 4CC7 A; 2VKN A; 3EHQ A; 4OMO A; 2LMJ A; 1OPL A; 4FSS A; 2A37 A; 1JU5 C; 2FPF A; 4OMN A; 2DRK A; 3H0H A; 1HJD A; 2DL5 A; 2KRO A; 5IXB A; 4RTV A; 1OV3 A; 2F2W A; 1TG0 A; 1HSQ A; 1VYU A; 2FO0 A; 1E6G A; 2KXC A; 1X6B A; 2RQW A; 1GCQ C; 2DLP A; 1UUE A; 1PWT A; 2KYB A; 1VYV A; 2L3P A; 2DVJ A; 1UHC A; 1VA7 A; 1OEB A; 3VS5 A; 1M30 A; 1AD5 A; 1UFF A; 1KJW A; 2LCS A; 2K9G A; 1YWO A; 1JO8 A; 2O9V A; 1H8K A; 4J9I A; 2YSQ A; 1MUZ A; 2GTO A; 5I11 A; 1GFC A; 3RNJ A; 1T3L A; 1ABQ A; 2RMO A; 1NG2 A; 2ABL A; 4OMP A; 4K11 A; 2CH4 W; 1WYX A; 3H0F A; 1WIE A; 1WLP B; 1ZBJ A; 2FG0 A; 2QDL A; 5GJV B; 3M0Q A; 1VYT A; 2OJ2 A; 2DIL A; 2PNI A; 2DL4 A; 2F2X A; 4JJD A; 2DM1 A; 1WA7 A; 1ZUU A; 1Z9Z A; 2SRC A; 2BTT A; 2KGT A; 2K6D A; 3H0I A; 2G6F X; 4RTT A; 2EYX A; 4DEY A; 1GCP A; 3LH5 A; 4J9B A; 3UA7 A; 1YN8 A; 3M0S A; 4RTU A; 1E6H A; 4JZ4 A; 2CT4 A; 1U06 A; 2O9S A; 1JEG A; 2JXB A; 4RUG A; 3ULR B; 1I0C A; 1NLP C; 1WI7 A; 1QCF A; 1NLO C; 2RF0 A; 1OPK A; 2JM8 A; 3R6N A; 2DRM A; 2FRW A; 1TUD A; 5IHK A; 1T0J A; 4J9F A; 1JXM A; 4D8K A; 4JZ3 A; 3QWY A; 5FWC A; 2DL3 A; 2YUN A; 4LN2 A; 5ECA A; 2CUD A; 1HD3 A; 2J6F A; 2EQI A; 3NGP A; 4JPB W; 1GRI A; 1PKT A; 3FJ5 A; 4AFZ C; 4A63 B; 2JMC A; 3UAT A; 4F16 A; 2HCK A; 4CC3 A; 2J6K A; 2L3Q A; 3NHN A; 1AZE A; 2W10 A; 1U5S A; 2GBQ A; 1UGV A; 2KRM A; 1SSH A; 2LNH B; 2GTJ A; 1AEY A; 3IQL A; 4GLM A; 1K0S A; 2I0N A; 4ORZ A; 1CKA A; 4JJC A; 4E6R A; 2EGA A; 4J9C A; 2JT4 A; 2MCN A; 1JXO A; 4D8D A; 3M0P A; 4LNP A; 1N5Z A; 2AZS A; 2EW3 A; 1QWE A; 1NYF A; 2X3W D; 4AG1 C; 1AZG B; 2ROT A; 3GBQ A; 1SEM A; 1QLY A; 3VS0 A; 1B3Q A; 1NEG A; 1GCQ A; 2DYB A; 1WXB A; 1V1C A; 2C0T A; 2A28 A; 3C0C A; 4WCI A; 1AOJ A; 3TVT A; 2L3S A; 1AWJ A; 4JJB A; 1BB9 A; 2EBP A; 1RLP C; 4J9G A; 1W1F A; 2DE0 X; 1LCK A; 1QKX A; 1B07 A; 2RQV A; 1GFD A; 3VS2 A; 4HCK A; 2O31 A; 1KSW A; 1TUC A; 1RLQ C; 1PNJ A; 3NMZ C; 1Y57 A; 4J9D A; 1M3A A; 2M51 A; 2OAW A; 2KT1 A; 1WXU A; 3VS3 A; 1M3C A; 1M27 C; 2LQW A; 4J9E A; 3CQT A; 3VS4 A; 1YCS B; 4F14 A; 1RUW A; 1M8M A; 1XOV A; 2JTE A; 2YUP A; 2BZ8 A; 1K76 A; 2RNA A; 3ZL7 C; 2RQU A; 2C0O A; 4GBQ A; 2CSI A; 2EYW A; 3PVL A; 2VWF A; 2F2V A; 1ZSG A; 2BZY A; 4Z88 A; 2HEQ A; 2RQT A; 3M0R A; 2EGE A; 4AFS C; 1BK2 A; 3THK A; 5EC7 A; 3I35 A; 5IXF A; 2EGC A; 2VVK A; 1K9A A; 1AWX A; 2FPD A; 1MV0 B; 2A08 A; 1CKB A; 1WFW A; 2EVR A; 2DL8 A; 3A98 A; 1WX6 A; 3KFV A; 2MOX A; 4CC4 B; 1QKW A; 1X2Q A; 1NM7 A; 3UF4 A; 2A36 A; 4LUE A; 1SHF A; 2V1Q A; 3EG3 A; 1I1J A; 2DA9 A; 2YDL A; 1G83 A; 1S1N A; 1X27 A; 3I5S A; 2AZV A; 1Y0M A; 2DJQ A; 1YP5 A; 1ZUK A; 1W70 A; 2AKK A; 1OOT A; 1YWP A; 1M3B A; 2K7A A; 1E7O A; 1UJ0 A; 1X2K A; 3TSW A; 1AVZ C; 3VRZ A; 5FWB A; 1ARK A; 1I07 A; 2LQN A; 4RTX A; 1SRM A; 2CDT A; 4DEX A; 3TSZ A; 1MV3 A; 2OI3 A; 1PHT A; 1G2B A; 1SPK A; 4HVW A; 1WDX A; 5HCK A; 2BZX A; 3EG1 A; 1WXT A; 2YUO A; 5IHI A; 2J6O A; 2DMO A; 1W6X A; 2SEM A; 2O88 A; 2HDA A; 3REB B; 2LX7 A; 2C0I A; 2DL7 A; 2H8H A; 2LJ1 A; 2LZ6 B; 4Y92 A; 1SHG A; 2MIO A; 1EFN A; 2NWM A; 1ABO A; 2KRS A; 5IH2 A; 4RTW A; 1X69 A; 3EHR A; 1YNZ A; 1GL5 A; 1H92 A; 4OMM A; 3UA6 A; 1IO6 A; 2CSQ A; 4CC2 A; 2IIM A; 2O2O A; 3REA B; 1ZX6 A; 1UJY A; 1A0N B; 2ECZ A; 1H3H A; 2HBW A; 3U23 A; 1K0X A; 3H41 A; 2FEI A; 2CUB A; 2DX1 A; 2PTK A; 1RI9 A; 1NYG A; 2JS0 A; 1GBQ A; 4ESR A; 3PVQ A; 1K4U S; 2HSP A; 1AWW A; 2KEA A; 1ZLM A; 1K1Z A; 3QWX X; 2JS2 A; 1BU1 A; 2XMF A; 2P4R A; 4KRT A; 2KRN A; 2J7I A; 2K2M A; 4Z89 A; 2KT8 A; 2ED1 A; 4EIK A; 3SHW A; 4AFU C; 4LE9 A; 1ZUY A; 2D8J A; 4RTY A; 4Z8A A; 2J05 A; 2KXD A; 3PE0 A; 4IIO A; 2ESW A; 2KBT A; 2AKL A; 1AWO A; 2D8H A; 3VRY A; 1NEB A; 4OML A; 2DBK A; 4ZNX A; 2DNU A; 5L23 A; 2DBM A; 4QT7 A; 2D0N A; 5IHN A; 4AG2 C; 4HVV A; 2DF6 A; 4IIM A; 1UG1 A; 3SEM A; 4HVU A; 1X43 A; 2ENM A; 1PRL C; 2L2P A; 1FMK A; 4M4Z A; 1X6G A; 2CRE A; 2JM9 A; 1FYN A; 2E5K A; 3O5Z A; 2ROL A; 2CH4 A; 1GBR A; 1CSK A; 2EPD A; 2FRY A; 2LJ3 A; 2EYZ A; 4HXJ A; 3VS6 A; 2K3B A; 1T0H A; 1T3S A; 5FW9 A; 1KFZ A; 1UE9 A; 3VS1 A; 2JMA A; 2W0Z A; 1SRL A; 2B86 A; 3I9Q A; 2ED0 A; 1UTI A; 3VS7 A; 3M0T A; 4J9H A; 2LP5 A; 3JV3 A; 1PRM C; 2GGR A; 2D1X A; 2RN8 A; 4X1V A; 3M0U A; 2EKH A; 3EG2 A; 2GNC A; 5GJW B; 1Z9Q A; 2V1R A; 3EGU A; 1KIK A; 1QWF A; 2FPE A; 3I5R A; 1UDL A; 2M0Y A; 1UHF A; 2RPN A; 3RBB B; 5I22 A; 2LJ0 A; 2KE9 A; 2K79 A; 2YUQ A; 2GQI A; 1BBZ A; 1UEC A; 2X3X D; 4LUD A; 1JQQ A; 4OMQ A; 2PZ1 A; 4R0K A; 2NUZ A; 2JW4 A; 2EYY A; 2KYM A; 2L0A A; 2KR3 A; 2RQR A; 4AFQ C; #chains in the Genus database with same CATH topology 4EMG A; 5J26 A; 5D6W A; 1G3T A; 5KYX A; 2D6F A; 2AK5 A; 1RAB B; 3CME A; 1VQ4 A; 2VKN A; 4M78 E; 1K9M R; 4E7S A; 1OPL A; 4FSS A; 2CP3 A; 2FPF A; 3OYN A; 3QSU A; 2DRK A; 4XAX B; 3H0H A; 1Y7X A; 3MHX A; 1OV3 A; 3CCL T; 4BE2 A; 2Y4X A; 4C5H A; 2DXU A; 1HSQ A; 5CKB A; 1E6G A; 1UGQ B; 3OYG A; 4PJO E; 3LGL A; 4DBR A; 1M5Q 1; 2RQW A; 2ATC B; 5GAN 6; 2KYB A; 2LTO A; 2JUF A; 3QDR B; 5FU6 C; 1UHC A; 1VQL T; 1VQ5 T; 1W4S A; 1KJW A; 1H8K A; 1VQK T; 1C6V X; 5GAO l; 3VUZ A; 3WXM B; 1ABQ A; 3PFS A; 4UC4 A; 1NG2 A; 4OMP A; 1YJN A; 4BE0 A; 5FU7 C; 3H9N A; 1VQN T; 4E7Z A; 2HQE A; 5GJV B; 5GMK e; 2DTO A; 2F2X A; 3L2Z A; 4JJD A; 2DM1 A; 3CC2 A; 2BTT A; 2KGT A; 4EMK A; 2EAY A; 4BDZ A; 2EYX A; 4DEY A; 4RMO A; 4M7D B; 1GCP A; 3HL8 A; 3CC7 T; 3I55 A; 3G1J A; 1NPR A; 1KHI A; 3M0S A; 4RTU A; 3EGX B; 3O8V A; 1M90 U; 2O9S A; 1X75 C; 3QYG B; 3ULR B; 1I0C A; 1U8R A; 4DBH A; 2XHC A; 2RHU A; 1NLO C; 4PJJ A; 2DRM A; 2FRW A; 5GAO r; 1TUD A; 2DTH A; 4DA4 A; 3OA6 A; 3OSS C; 4KUL A; 4LN2 A; 2RI5 A; 5ECA A; 2CUD A; 2LCC A; 2YLB A; 4WF2 A; 3OYE A; 2KQW A; 3C4S A; 3HP9 A; 3NGP A; 4FYY B; 3FLG A; 2CP0 A; 3FJ5 A; 2E4H A; 2OAU A; 4A63 B; 3OW2 A; 1M1G A; 1KK7 A; 4CC3 A; 2VXF A; 1VIF A; 5GAM d; 4ZGE B; 1MMN A; 2QGG A; 1S72 T; 1SSH A; 1FXX A; 2Y90 A; 3IQL A; 2BKD N; 2I0N A; 2EGA A; 2DJZ A; 4JDS A; 4VUB A; 4N0A A; 1XTD A; 4JS4 A; 2AZS A; 2EW3 A; 4ZTJ A; 5D7U A; 4B9W A; 3LW5 E; 2P0K A; 1AZG B; 3LX7 A; 2R5M A; 1YJW Q; 2ROT A; 2DPP B; 3M9Q A; 3CD6 A; 2KK4 A; 3FIF A; 3OYY A; 4JRI A; 1NEG A; 3HSB A; 2C0T A; 3G71 T; 1WHK A; 2QDY B; 2EQU A; 4JJB A; 1Q82 C; 2XIC A; 3MEW A; 2F69 A; 1B07 A; 1YHQ Q; 2VC8 A; 1GFD A; 1WHM A; 5CKD A; 3SWN C; 3VS2 A; 3I56 A; 1Y57 A; 1LPL A; 2WSE E; 1IZ6 A; 2NLU A; 2OAW A; 3JB9 G; 2KT1 A; 1B7T A; 2LQW A; 3A1P A; 4J9E A; 2PVG B; 3A8M B; 2HD0 A; 4F14 A; 2GCX A; 1YIT T; 3L2W A; 5GAO m; 3QG1 A; 1M8M A; 5I2M A; 2JTE A; 4M7A B; 2BZ8 A; 4F7U E; 3CCR T; 4PKC C; 2RNA A; 1HK9 A; 2C0O A; 1G8X A; 2CSI A; 4GBQ A; 1G3S A; 2EYW A; 3PVL A; 2VWF A; 1ZSG A; 2LQ8 A; 2BZY A; 3OW2 S; 2ZPH B; 2MF2 A; 4ZGD B; 4C8Q E; 3SFM A; 4AFS C; 5IXF A; 3L2V A; 2EGC A; 2VGN A; 4C92 C; 2HQX A; 3M53 A; 1AWX A; 1R8O B; 2VB6 A; 2A08 A; 2XG8 D; 3V7C A; 3G4S T; 3CCL Q; 4CC4 B; 2GFU A; 1U1T A; 3UF4 A; 5CK9 A; 3JCM W; 2DA9 A; 1B34 B; 1RI0 A; 1Y0M A; 1ZUK A; 3G6E T; 1OOT A; 1YWP A; 1LOJ A; 2P0P A; 1VQ6 T; 1VQ5 Q; 1SSF A; 5KYY B; 4ZTF A; 1I07 A; 1XNI A; 1UB4 A; 4RTX A; 1PD0 A; 2HZY A; 1SF9 A; 5J3B A; 1PHT A; 4LDW A; 1SPK A; 1WDX A; 3OYL A; 1BIA A; 3EG1 A; 2YUO A; 2O4X A; 1W6X A; 3X20 B; 2O88 A; 1VQN Q; 5A0D A; 3OS0 A; 2DER A; 5A2Q E; 4V2S A; 1EFN A; 5DM7 R; 2LT4 A; 3CPW S; 1X01 A; 1X69 A; 2FHD A; 3GF5 A; 3UA6 A; 1C1A A; 3MPU B; 4OF1 A; 2RH2 A; 1TXQ A; 4B6M A; 1ZX6 A; 1K73 C; 4M7D C; 2OTJ T; 4XTV A; 2ECZ A; 1Q7Y R; 2HBW A; 3S3M A; 4C8Q G; 2CUB A; 1QQJ A; 2PTK A; 4J6X A; 3JB9 I; 3VV0 A; 5LJ5 j; 1C0M A; 3HKS A; 1GBQ A; 1M1F A; 3PVQ A; 4ESR A; 2HSP A; 1AWW A; 2OTL T; 1VQP A; 1VUB A; 2JS2 A; 3M57 A; 2XMF A; 1UGS B; 4QQD A; 4J83 A; 3CPW P; 2PU9 B; 1PM3 A; 1SKU B; 5GAO p; 2KT8 A; 2ED1 A; 3SHW A; 2DZ9 A; 5CKH A; 1WJS A; 4CRI A; 1Q81 R; 3VYH B; 4OMF B; 4OML A; 4KBM B; 2KVQ G; 4Z02 A; 1JRI A; 2QQ9 A; 4QT7 A; 4AG2 C; 4IIM A; 1UG1 A; 4QVZ A; 1N9R A; 2RJE A; 1KD1 R; 1OI1 A; 4NOY A; 1JJ2 S; 4L59 A; 3JCM X; 2NYS A; 3V8J A; 2QA4 T; 3DB3 A; 3OYA A; 1FYN A; 2RK2 A; 3O5Z A; 2X51 A; 1GBR A; 1CSK A; 2V8J A; 2LJ3 A; 3VS6 A; 4M77 B; 3OYC A; 3PIO A; 1T0H A; 1WHJ A; 4FSX A; 3G71 Q; 5FW9 A; 4IUT A; 1UE9 A; 1Q82 U; 2JMA A; 2DK3 A; 2A7Y A; 3NTI A; 5KCH A; 1UTI A; 3M0T A; 4HCC A; 4J9H A; 2ZGW A; 4ZGJ B; 3PGG A; 4R55 A; 1VQ7 A; 5KYW B; 2A0F B; 3M0U A; 2LNV A; 5I2S A; 1G3Y A; 2WSF E; 5EG2 A; 2GNC A; 1IHW A; 1QVG A; 1QWF A; 3V8K A; 1VIE A; 5GAN d; 1UDL A; 2MAM A; 1UHF A; 3EGD B; 3CPF A; 2CP6 A; 1JJ2 P; 4D6W A; 1YIT Q; 4MMK A; 5FRN A; 4C5G A; 4OP0 A; 1JQQ A; 3E19 A; 2PZ1 A; 2JN0 A; 2EYY A; 3JB9 D; 1R0C B; 4BAC A; 2HAX A; 4AFQ C; 2CT3 A; 4RTZ A; 3MP6 A; 4M7A C; 2KNB B; 1PCX A; 2QAS A; 1U3O A; 1VQP Q; 3EHQ A; 2RD1 A; 3S6W A; 3CCU A; 2XK0 A; 1JU5 C; 1EZZ B; 2R57 A; 2RJF A; 2WAC A; 1RAH B; 2EJG A; 2Z0W A; 1MHN A; 1HJD A; 2O01 E; 5GAN 3; 3G4S Q; 4RTV A; 4BB7 A; 1TG0 A; 4A4F A; 3C95 A; 1YJ9 T; 1YI2 A; 1IRX A; 5HK0 A; 3PTA A; 1X6B A; 1GCQ C; 1PWT A; 4XU0 A; 3G6E Q; 1D0Y A; 1VA7 A; 5GAM e; 1M30 A; 2BIV A; 1IXD A; 1M2V A; 1OUL A; 2O9V A; 4Y91 A; 5DY9 A; 3CMA T; 4BUG A; 2KY9 A; 1GFC A; 3CCJ T; 1T3L A; 3M58 A; 2RMO A; 4KT0 E; 2ABL A; 5CKF A; 1WQ7 A; 1QVG S; 1KQS S; 1H3Z A; 3QJ6 A; 2DIL A; 2PNI A; 2FB7 A; 5GAN h; 2RO0 A; 3INZ A; 1WA7 A; 4A4K A; 1ZUU A; 1Z9Z A; 2QQR A; 2ZZD A; 1P92 A; 3LLR A; 1F1B B; 2EKO A; 3EG9 A; 3LH5 A; 4J9B A; 5HY6 A; 3UA7 A; 2MWO A; 1VQM T; 1KHC A; 4YTL A; 1E6H A; 1QW1 A; 2JNG A; 2CT4 A; 1K73 U; 1U06 A; 1BI2 A; 4MDW A; 2JXB A; 1OYX A; 1NLP C; 8AT1 B; 5LJ5 f; 2XID A; 2RF0 A; 1OPK A; 2JM8 A; 4PNO A; 4XTX A; 3FC3 A; 5GAM g; 1KQS P; 1PSF A; 1T0J A; 4J9F A; 1IGU A; 4JLG A; 2FZG B; 4C8Q F; 5FWC A; 1QP2 A; 1YJN T; 3C12 A; 2OTL Q; 3CCU Q; 2VXE A; 2J6F A; 2EQI A; 3L42 A; 3CC4 T; 2E3I A; 2JMC A; 4C8Q D; 5GAN 5; 1ZSZ A; 2HCK A; 3NFC A; 2W10 A; 3H8Z A; 2MWP A; 2LC4 A; 1YI2 Q; 2LNH B; 1K0S A; 2E41 A; 4ORZ A; 4JJC A; 4OB2 B; 2XDB A; 1UGP B; 3ZBD A; 3M0P A; 1WJQ A; 1D3B B; 4FT2 A; 4A4G A; 1QWE A; 4RCB A; 1OX8 A; 4M7D E; 2X3W D; 3M55 A; 2YWW A; 1QLY A; 4MZT A; 4JLI A; 3VS0 A; 1V1C A; 4C92 G; 4FYX B; 2DD4 A; 3DLM A; 3P8H A; 4HCZ A; 4PJM A; 4O5V A; 3TVT A; 2L3S A; 1AWJ A; 4M77 A; 3JCM g; 4J9G A; 1W1F A; 4LD6 A; 4NL2 A; 1OZ2 A; 4FT4 A; 2DTI A; 2RQV A; 3CCS A; 4M77 C; 3LYI A; 1KSW A; 1TUC A; 3A8O B; 1YJW A; 4J9D A; 4AT1 B; 5LJ3 g; 5GAN 4; 5KYW A; 4HT8 A; 2COZ A; 4OB0 B; 1WXU A; 6AT1 B; 3VS4 A; 5D6X A; 1TOV A; 1ZA1 B; 2RB6 A; 5GMK j; 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