The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
88
|
structure length |
88
|
Chain Sequence |
GSSGSSGPLPSTQNGPVFAKAIQKRVPCAYDKTALALEVGDIVKVTRMNINGQWEGEVNGRKGLFPFTHVKIFDPQNPDENESGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structures of the SH3 domain of human Crk-like protein
rcsb |
| molecule keywords |
Crk-like protein
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
5
|
| structure length |
88
|
| sequence length |
88
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-12-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3TSW A; 4LN2 A; 1SHG A; 1GCQ C; 2FO0 A; 3I9Q A; 1M30 A; 1MV3 A; 2O88 A; 1GCP A; 4K11 A; 2EW3 A; 1GBQ A; 2RNA A; 1UFF A; 5IHK A; 2BTT A; 1QKX A; 3LH5 A; 3SHW A; 2GNC A; 2KT1 A; 3M0T A; 3QWX X; 5IHN A; 2W10 A; 1T0J A; 4CC7 A; 5I22 A; 2KXD A; 2L2P A; 2ECZ A; 4J9H A; 1RUW A; 1ZUK A; 1WFW A; 2ABL A; 4D8K A; 2DLP A; 2HSP A; 2AK5 A; 2DRM A; 1HJD A; 1BB9 A; 2O31 A; 3VS4 A; 2KRO A; 2CH4 W; 2O9V A; 1PKS A; 2DBK A; 2JTE A; 2RQT A; 2C0O A; 3RNJ A; 1UE9 A; 3EG3 A; 3VS2 A; 1KJW A; 3REA B; 1G83 A; 3I5R A; 3VS7 A; 1BBZ A; 4FSS A; 1M27 C; 2IIM A; 2ROL A; 3VS0 A; 3EHQ A; 1OEB A; 2CDT A; 1UHF A; 2ESW A; 2KYB A; 2D8J A; 2EVR A; 1K4U S; 2KE9 A; 4JJC A; 2FPE A; 2FRW A; 1Z9Q A; 2JW4 A; 1I07 A; 4Y92 A; 5EC7 A; 4D8D A; 1SRL A; 2CH4 A; 2GTJ A; 2YUQ A; 4LUD A; 1SPK A; 1VYT A; 1YWP A; 2A37 A; 4RTX A; 2VWF A; 2RPN A; 3VS5 A; 2DRK A; 1YN8 A; 1UHC A; 4OMM A; 4WCI A; 4AFS C; 2DM1 A; 2M0Y A; 1X2Q A; 1FYN A; 2DX1 A; 2EQI A; 1OPK A; 1OPL A; 1K0X A; 1ZUU A; 2CUD A; 2G6F X; 2B86 A; 4J9B A; 5IH2 A; 4J9D A; 2CRE A; 2L0A A; 1SHF A; 2V1R A; 1AZE A; 1MV0 B; 2K79 A; 1PHT A; 1S1N A; 2HEQ A; 3NGP A; 2YUO A; 2BZX A; 4RTZ A; 1PRL C; 2DMO A; 1WI7 A; 2KYM A; 2DIL A; 2ED0 A; 2O9S A; 1M3C A; 1NG2 A; 1T3L A; 2DE0 X; 1Y0M A; 5I11 A; 1EFN A; 1Z9Z A; 3EGU A; 1T0H A; 1W70 A; 1ABO A; 2RQR A; 5HCK A; 2K6D A; 1GCQ A; 5IXF A; 1X69 A; 4RTY A; 2D0N A; 2A36 A; 1PNJ A; 2EPD A; 4Z89 A; 2KEA A; 1FMK A; 1PRM C; 2K2M A; 1TG0 A; 4DEY A; 3H0H A; 1ARK A; 2AZV A; 3NPF A; 4RTW A; 4EIK A; 1RLP C; 2AKK A; 1AVZ C; 2W0Z A; 2CSI A; 3I35 A; 4LNP A; 2EYZ A; 3TVT A; 2JMC A; 3VS3 A; 1BK2 A; 4HVU A; 4AG2 C; 1NEB A; 1VYU A; 1XOV A; 2DL7 A; 1U5S A; 2ROT A; 4CC3 A; 3M0R A; 1H3H A; 1X6B A; 2ED1 A; 5IHI A; 3U23 A; 1IO6 A; 1ZUY A; 1A0N B; 2GBQ A; 3PVQ A; 4AFQ C; 4OMQ A; 2F2W A; 1N5Z A; 2BZY A; 4J9G A; 1GFC A; 2DVJ A; 3QWY A; 3VS6 A; 1GFD A; 1NLP C; 2LMJ A; 3I5S A; 4RUG A; 1X6G A; 1HSQ A; 4IIO A; 1AZG B; 2BZ8 A; 1UEC A; 1X43 A; 2LCS A; 2CUB A; 2OI3 A; 2DNU A; 4J9E A; 4JJB A; 2MCN A; 1CKA A; 3EG2 A; 3UAT A; 2HCK A; 2KGT A; 4RTU A; 1UUE A; 4OMP A; 2O2O A; 5L23 A; 3EG0 A; 5GJW B; 1QKW A; 2FG0 A; 2HDA A; 2JM8 A; 3UF4 A; 4CC2 A; 4Z8A A; 1JU5 C; 4HXJ A; 2K3B A; 4J9C A; 2CT3 A; 1E7O A; 1AWX A; 1YP5 A; 2MIO A; 4F14 A; 1NYG A; 4R0K A; 1TUD A; 1AOJ A; 4QT7 A; 2K9G A; 2AZS A; 1QWF A; 2JXB A; 1JXO A; 2F2X A; 2JM9 A; 4RTV A; 3R6N A; 2H8H A; 2KRN A; 1ZX6 A; 2J05 A; 1H8K A; 4JJD A; 1HD3 A; 2X3X D; 1JXM A; 2LP5 A; 1RI9 A; 2PNI A; 1SSH A; 2DL3 A; 4J9I A; 1NLO C; 2EBP A; 2KRS A; 1U3O A; 2LZ6 B; 4F16 A; 2J6O A; 3M0Q A; 1J3T A; 1GBR A; 4ORZ A; 4E6R A; 1ZLM A; 4F17 A; 1WXT A; 3RBB B; 1K9A A; 1UG1 A; 2KRM A; 1MUZ A; 2EKH A; 1KFZ A; 1WYX A; 2J6K A; 2YUP A; 2OJ2 A; 1JO8 A; 3ULR B; 2C0T A; 1KSW A; 2MOX A; 1Y57 A; 2A08 A; 3CQT A; 4IIM A; 3VRZ A; 1K1Z A; 4RTT A; 3JV3 A; 1UGV A; 3UA6 A; 2F2V A; 2RQW A; 4ESR A; 2FEI A; 1M3B A; 1NM7 A; 2LQW A; 2ENM A; 3VS1 A; 1UDL A; 3M0S A; 1VYV A; 2FPD A; 2P4R A; 1QCF A; 2KBT A; 2FRY A; 1I1J A; 3GBQ A; 1AWW A; 2KT8 A; 1B07 A; 1X27 A; 4GBQ A; 4JPB W; 1YNZ A; 3UA7 A; 2RQV A; 2NWM A; 3PVL A; 1U06 A; 2AKL A; 4X1V A; 4DEX A; 2EGE A; 1PWT A; 3FJ5 A; 4CC4 B; 2A28 A; 1M8M A; 3TSZ A; 4A63 B; 1WDX A; 2X3W D; 3ZL7 C; 1WX6 A; 1YCS B; 2JS2 A; 2SRC A; 4ZNX A; 2KNB B; 2DA9 A; 2LJ3 A; 5FWB A; 2LX7 A; 2L3Q A; 2EYW A; 2J06 A; 2KR3 A; 2GGR A; 4J9F A; 2NUZ A; 3H0F A; 3SEM A; 4HVW A; 2FPF A; 4OML A; 4LUE A; 2VKN A; 1QLY A; 1AWJ A; 1AWO A; 1PKT A; 2RN8 A; 1AD5 A; 4AFU C; 1K0S A; 2LJ1 A; 4M4Z A; 1VA7 A; 1X2K A; 1ABQ A; 1QWE A; 2YSQ A; 1W6X A; 2DYB A; 1GL5 A; 2HBW A; 2CSQ A; 1AEY A; 2J7I A; 2LNH B; 2RF0 A; 1G2B A; 2KXC A; 3O5Z A; 2DL8 A; 2PZ1 A; 2J6F A; 2SEM A; 1UJ0 A; 2D1X A; 2D8H A; 2RMO A; 5FW9 A; 1JEG A; 1SEM A; 1SRM A; 3VRY A; 1CKB A; 1UTI A; 1H92 A; 3REB B; 2EYX A; 2GQI A; 2V1Q A; 1NEG A; 1KIK A; 4HVV A; 3NMZ C; 4JZ3 A; 1UJY A; 2LJ0 A; 2PTK A; 2JMA A; 3M0U A; 2EGC A; 2XMF A; 1WXU A; 1WA7 A; 2VVK A; 1I0C A; 1NYF A; 1RLQ C; 1BU1 A; 1TUC A; 1E6G A; 2C0I A; 4AFZ C; 1OV3 A; 3THK A; 2OAW A; 3KFV A; 2DL5 A; 4HCK A; 5IXB A; 2RQU A; 1B3Q A; 3IQL A; 1LCK A; 1YWO A; 2QDL A; 3C0C A; 3H0I A; 2YT6 A; 1ZSG A; 3EG1 A; 4LE9 A; 5GJV B; 1GRI A; 2M51 A; 4OMO A; 1K76 A; 3NHN A; 2LQN A; 2DJQ A; 3EHR A; 4AG1 C; 2EGA A; 2GTO A; 4JZ4 A; 4OMN A; 3H41 A; 5ECA A; 1WLP B; 2DL4 A; 4KRT A; 1V1C A; 2DBM A; 3A98 A; 1WXB A; 5FWC A; 3PE0 A; 2I0N A; 2CT4 A; 2JS0 A; 4Z88 A; 4GLM A; 2EYY A; 1M3A A; 1T3S A; 2JT4 A; 2YDL A; 1E6H A; 1OOT A; 2L3S A; 1W1F A; 1ZBJ A; 1WIE A; 2YUN A; 3M0P A; 1CSK A; 2L3P A; 2E5K A; 2K7A A; 2DF6 A; 1JQQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2ZCF B; 1GCQ C; 2ZPH B; 1M1K U; 2K3X A; 4N4H A; 4Q5W A; 3GNF B; 1GBQ A; 1D0X A; 1UFF A; 5IHK A; 1QKX A; 1PM3 A; 3LH5 A; 1H64 1; 5DLO A; 1Q86 U; 2KT1 A; 2PVD B; 1K73 U; 1M1K C; 3QWX X; 5D6W A; 4EMK C; 1SKU B; 2EJF A; 3JCM P; 1Q7Y C; 4L5G A; 4PLL A; 4F7U G; 4OGC A; 5I22 A; 3DKM A; 2ECZ A; 4C8Q E; 2ABL A; 3QSU A; 1Q86 C; 1K73 C; 1HJD A; 3CCS T; 1Q82 R; 1I81 A; 3JCM X; 2KRO A; 2CH4 W; 2O9V A; 2COW A; 3OYY A; 5FRM A; 2X4Y A; 5AYF A; 2C0O A; 3EFO B; 5LJ5 d; 1RL2 A; 2A3L A; 3CBP A; 1KJW A; 3REA B; 2DFU A; 4D6W A; 3I5R A; 4ZN1 A; 1VQL T; 2M9U A; 1W2B P; 3EHQ A; 3X28 B; 1UHF A; 5KE3 A; 2EVR A; 1K4U S; 2K5L A; 1VQN T; 5GAN d; 2FPE A; 1Z9Q A; 4Y92 A; 4LD6 A; 1VQP T; 1RAG B; 2FL7 A; 2GTJ A; 2K5I A; 2LCC A; 3M4Y A; 3CME T; 2KI7 A; 1KC8 C; 1YJ9 A; 1M1F A; 2NUT A; 1G8X A; 2A37 A; 5CVI A; 2CP2 A; 2CP3 A; 2ZPB B; 3G71 A; 4PKC C; 2YHT A; 3CMA T; 1UHC A; 5J39 A; 1TU0 B; 2M0Y A; 2MI6 A; 3JCM g; 2DX1 A; 3X20 B; 5GAN 4; 1M2O A; 2VB6 A; 2QQR A; 3GPL A; 3KBG A; 3EFS A; 2OTL Q; 1K0X A; 4NOY A; 4YTL A; 1HK9 A; 2DVE A; 1FXX A; 3AHU A; 3HRT A; 2AHJ B; 1MV0 B; 3V8J A; 2QG9 B; 2HEQ A; 3NGP A; 3JCM e; 2BZX A; 1BI2 A; 3OSV A; 1O75 A; 2HD0 A; 1LJO A; 4O6J A; 4E7L A; 1Y0M A; 1M9S A; 2RO0 A; 1Z9Z A; 3EGU A; 5GAN 5; 5FU7 B; 1ABO A; 4LDY A; 5HCK A; 2QXF A; 1KQS P; 3CXC A; 1GCQ A; 4LDX A; 3M57 A; 1X69 A; 2DD4 A; 2RJC A; 2D0N A; 4XU0 A; 2A36 A; 2EPD A; 1YHQ A; 1Q82 U; 4Z89 A; 3MET A; 1PRM C; 2PVG B; 3H0H A; 1QCN A; 4EMK A; 2YLB A; 5CQY A; 2DD5 A; 1JJ2 S; 4EIK A; 2AKK A; 4JRK A; 1AVZ C; 3V8K A; 2DAQ A; 1PCX A; 3JB9 I; 4EMH A; 1G5V A; 4XTY A; 4AG2 C; 2Z0W A; 2D6F A; 3JB9 J; 1HXD A; 1XOV A; 2RD1 A; 1U5S A; 3JRZ A; 4KT0 E; 5GMK h; 4V2S A; 1X6B A; 2A0F B; 4BI4 A; 3U23 A; 5GAO m; 1VQ5 A; 1VQ6 T; 4XTU A; 2NUT B; 4X9D A; 4CI0 C; 2BZY A; 3OS1 A; 2DVJ A; 3QWY A; 4KUI A; 1FWZ A; 2LMJ A; 4XU2 A; 3FRN A; 4IIO A; 5D6Y A; 2BZ8 A; 3TCJ A; 4A53 A; 4B6M A; 2CUB A; 2DNU A; 4JJB A; 3EG2 A; 4RTU A; 1UUE A; 2O2O A; 4VUB A; 1ZHI A; 1D3B A; 5GMK i; 2YRD A; 5KYX B; 4M77 D; 2HDA A; 2X51 A; 4BAC A; 4Z8A A; 2K57 A; 2VV5 A; 2DER A; 5GAM h; 4HXJ A; 2D0Q B; 2CT3 A; 3CCJ Q; 4EPC A; 3CD6 Q; 2K9G A; 2DTI A; 2DPP B; 3V7R A; 2AZS A; 5FU6 B; 3OMG A; 1YIJ T; 2EIF A; 1ZX6 A; 3BDU A; 1KG1 A; 2VXE A; 1IZ6 A; 2J05 A; 4M75 D; 3HL8 A; 1HD3 A; 3M59 A; 5CIU A; 2X3X D; 3J7A F; 3BY7 A; 4FU6 A; 1RAE B; 3CC4 T; 4EMK B; 2EYQ A; 3CCS A; 4OP0 A; 1X01 A; 4J9I A; 3CPW P; 2EBP A; 2QK0 A; 3HRS A; 4XU3 A; 2LZ6 B; 1J3T A; 1V29 B; 3M56 A; 2DZ9 A; 1K8A C; 2RJE A; 3HKS A; 1K9A A; 2KRM A; 4MMK A; 2J6K A; 2YUP A; 1VQL A; 1JO8 A; 3L2Z A; 1Y7X A; 1KSW A; 4HT8 A; 2A08 A; 3CQT A; 4IIM A; 2E6Z A; 4RTT A; 3JV3 A; 1UGV A; 3M58 A; 3E1S A; 2O01 E; 2ZGW A; 1UDL A; 3QUI A; 3VS1 A; 1VQP A; 3M55 A; 4DA4 A; 3CME A; 1QCF A; 3PTA A; 2FRY A; 1AWW A; 2RHX A; 5GMK e; 3UA7 A; 3FEO A; 4Y28 E; 3CMA A; 4BDZ A; 3A5Z B; 4N4I A; 2NWM A; 5CKB A; 4KH1 B; 4X1V A; 2EGE A; 3FIF A; 5GAN 8; 1F1B B; 3OBW A; 2CZ7 B; 1WDX A; 3RDV A; 1D3B B; 5GAM g; 5J3B A; 1N8R R; 3FJP A; 4PJM A; 2XG8 D; 2J06 A; 2JJ9 A; 2FPF A; 2VKN A; 4XAX B; 3E9G A; 1LNX A; 2RJF A; 2E12 A; 4M4Z A; 1VA7 A; 1BYM A; 1GL5 A; 2CSQ A; 1AEY A; 5GAM e; 2KAF A; 2KXC A; 2DL8 A; 5KCO A; 2D8H A; 4FM4 B; 4KUL A; 4C8Q C; 3REB B; 4QQD A; 2JZ2 A; 3GP8 A; 4O5V A; 3FB9 A; 2XI9 A; 3OS5 A; 1NEG A; 3OYK A; 1KHI A; 3EG9 A; 3NMZ C; 2LJ0 A; 4M7D C; 1MMA A; 2EGC A; 1OX8 A; 3DB4 A; 3H8Z A; 3CCR Q; 1YBY A; 3X24 B; 4E7H A; 4RCB A; 1OV3 A; 2VXF A; 2CP7 A; 1M5Q 1; 3KFV A; 2HAX A; 4OB3 B; 3E9F A; 4HCK A; 2DZC A; 4ZGE B; 2JOY A; 3CC2 Q; 3S6W A; 3MJX A; 2YT6 A; 1VQ6 A; 1ZSG A; 1YJ9 Q; 2C06 A; 2OAU A; 3M4G A; 5GJV B; 3KXT A; 2QTX A; 1M2V A; 3N5B B; 2LQN A; 3VUZ A; 3S3N A; 2DJQ A; 4OMN A; 2DL4 A; 1V1C A; 3HTR A; 1YJW T; 2DBM A; 3I56 T; 2JS0 A; 6AT1 B; 1W2B A; 1YI2 T; 2JT4 A; 1E6H A; 2QQ9 A; 1D0Z A; 1N6A A; 2L3S A; 4OVA A; 4XTV A; 1WIE A; 1QVG A; 3M0P A; 4C8Q F; 2DF6 A; 3GF5 A; 1JQQ A; 1X6O A; 3TSW A; 4PJL A; 3UPU A; 4LN2 A; 1R0C B; 1TSF A; 4M78 G; 2FO0 A; 1PSF A; 1N8R C; 4M7D F; 2EFI A; 4A4H A; 5KYY A; 3OSS C; 3EGD A; 5A0G A; 1N27 A; 2RH2 A; 3M0T A; 3CCM T; 1YIJ A; 2HMA A; 2W10 A; 3VKI A; 1T0J A; 3D7S B; 3HRU A; 2CP5 A; 2E70 A; 3MHX A; 4MZM A; 3X25 B; 1ZUK A; 2AK5 A; 1BB9 A; 3CC4 A; 2CS7 A; 4OB2 B; 3EG9 B; 5CKE A; 4M7A D; 2EQU A; 2MAM A; 3R6O A; 4C0D C; 3G4S Q; 3EG3 A; 1PD0 A; 1G83 A; 5IN1 A; 2HQX A; 4C8Q A; 2IIM A; 3CCU A; 2HQH A; 2ROL A; 3TEE A; 4DBR A; 3CCL T; 5LJ3 d; 2ESW A; 2KYB A; 1Y07 A; 2DEU A; 3QKJ A; 4FYV B; 4M7D A; 3CC7 Q; 3M53 A; 2EAY A; 3LLR A; 4PFZ A; 1M2V B; 2ZPI B; 1JB0 E; 1ZA2 B; 3OMC A; 1QVP A; 2XK0 A; 2E41 A; 4C92 G; 3VS5 A; 2RPN A; 2X4J A; 4WCI A; 2MPX C; 1X2Q A; 1UGP B; 4KUD K; 4HCZ A; 5A0D A; 1OPL A; 3CCE T; 1OX9 A; 1QP3 A; 1Q81 U; 2QAS A; 2QA4 Q; 5A0L A; 2G6F X; 2Y4Y A; 2KMT A; 1PHT A; 1S1N A; 3PIP A; 1VQ9 T; 1WHL A; 4J83 A; 2WSE E; 3QZ5 B; 5KYY B; 2RM4 A; 2KYM A; 4FYX B; 3EGD B; 1WHM A; 1UGQ B; 4JRP A; 1WHJ A; 2O9S A; 5I21 A; 1WGS A; 2CP0 A; 3GNG A; 2DE0 X; 1NPR A; 5I11 A; 4HKE A; 1EFN A; 4HCB A; 3Q1J A; 1D1C A; 4DBH A; 4RTY A; 1EZZ B; 4PJN A; 1FMK A; 1TG0 A; 3ASK A; 4DEY A; 2DXU A; 1ARK A; 3NPF A; 3BFM A; 3VYH B; 4OF1 A; 3LGL A; 1RAD B; 3GIB A; 1VQL Q; 4IUV A; 4C8Q B; 3S3O A; 4LNP A; 2EYZ A; 3TVT A; 2CYZ B; 1GXI E; 3PIO A; 2FZK B; 1FX7 A; 8ATC B; 2P0K A; 4BDY A; 1VQO Q; 1VYU A; 1OU8 A; 2EJG A; 2ROT A; 1VQ8 T; 4CC3 A; 5GAO l; 3FDR A; 4NL2 A; 4ZTF A; 5D7U A; 5FRO A; 1VQP Q; 1IO6 A; 1BI0 A; 2NYS A; 4M7D E; 2CGH A; 3CME Q; 4QVZ A; 3QDF A; 1A0N B; 2GBQ A; 1WZO A; 2IPO B; 2QEX Q; 1G3W A; 1RAH B; 4J9G A; 4XQ3 A; 3QXE B; 2HZY A; 2PVO B; 2K3Y A; 4JS5 A; 1VQM Q; 1OZ3 A; 4DBQ A; 4JS4 A; 3I5S A; 4RUG A; 1YJW A; 1HSQ A; 4P5N A; 2QYZ A; 1YIT T; 3I56 A; 4FYW B; 1X43 A; 2BKD N; 1YI2 A; 3OS0 A; 1PC0 A; 2LCL A; 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